3EKUA

Crystal structure of monomeric actin bound to cytochalasin d
Total Genus 123
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
123
sequence length
372
structure length
362
Chain Sequence
EVAALVVDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVSHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTEEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELKDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMEACGIHETTYNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structures of monomeric actin bound to cytochalasin D.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Actin-5C
molecule tags Contractile protein
source organism Drosophila melanogaster
total genus 123
structure length 362
sequence length 372
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-09-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3ekuA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3ekuA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3ekuA03
2P9UA 3HTVA 1TUYA 4BVOA 4LC9B 2YJEA 1BWFO 3O1BA 5ADXH 3GL1A 3GDQA 3QBXA 3VEOA 2GEMA 2P9IA 4CBXA 2QWPA 5FPMA 3UKRA 2KHOA 5EOYA 1DKGD 4A61A 1GLFO 3D2EA 2F9TA 3VPZA 4BC2A 4JD2B 1BU6O 3FZFA 2ASPA 1MWMA 1HUXA 4K25A 4CBWA 1V4SA 5LJWA 1LOTB 4IWVA 5AQIA 4BRCA 1NMDA 4ISEA 4BRPA 3UKUA 3TPQA 2P9KB 2FF6A 1RDWX 3H45C 2V52B 4FWMA 2CH5A 3FLCO 4GNIA 1HKGA 3U9ZA 2A3ZA 3MN9A 4NO7A 4BR0A 1GLBG 3DXMB 5JLHA 1HKBA 3ZETB 2IVNA 2Q97A 2HOEA 1GLLO 2E2PA 1HLUA 4PKIA 1OKJA 1RFQA 4BGBA 1NGAA 1BA1A 3CQXA 2Q0UA 1ATSA 3O6WA 4BREA 4CZKA 2DPNA 3JS6A 2P9PA 3O80A 3MCPA 3WXIA 4CZHA 3MN7A 1CZAN 1K8KA 3WT0A 5AQTA 4MLEA 5E26A 3HM8A 2HF4A 3ZX3A 4DCHA 3VF4A 3U4LA 1NBWA 2P9SA 3CQYA 4B9QA 5JICA 3D2FB 2P9LA 4FPBA 5F2RA 3R8EA 5KPZA 3H3NO 2Q36A 4QS9A 4BR5A 1E4GT 1MA9B 5AQGA 4PL7A 1QZ6A 1DEJA 4H5NA 4HTLA 4L3QA 4A62A 3SMSA 5BRDA 4BRGA 3DJCA 5BREA 4CZMA 1GLEG 3FGUA 2P9UB 3U9DA 2QWLA 2GWJA 3EL2A 2FSNA 4FL9A 3BF1A 3WEEA 4A2AA 3O5BA 2D0PA 1SQKA 3CETA 1BA0A 2P9IB 4EFHA 3UKRB 3A8YA 3MDQA 3ZEUA 3BP8A 3C7NA 1JCFA 1U2VB 3D2EB 4H5TA 3FE1A 3A0IX 4BRNA 1EQYA 4FWLA 3EN9A 5BRHA 3W0LA 4FOEA 3ULEA 4H0VB 4M7YA 5AFUH 1QQNA 4BR2A 3CIPA 1P8ZA 3I8BA 4BR9A 2D0OA 2D4WA 4YDUC 5AQMA 2E88A 5AQSA 3LDNA 2Q2RA 4H03B 1SAZA 4J8FA 3WXLA 4IXCA 3CJ9A 5FPNA 3H6EA 5BPNA 3FZHA 3AY9A 3DAWA 1S22A 2QWRA 1RGIA 2GTDA 1ATRA 3SJHA 2E1ZA 1HKCA 4FPAA 3WQUA 5BRFA 2P9PB 4AM6A 2VYPA 5AQPA 3IUCA 1R59O 2ASOA 4DHYA 5AZIA 2BTFA 1BUPA 3A5LC 4XEIA 3CI5A 2P9NA 1K8KB 5FPDA 4CZGA 1J6ZA 3U8XA 4BRMA 2IIRA 2CGLA 4O5FA 3LM2A 2FXUA 5AQNA 3SMPA 4FWQA 4CZJA 3MMVA 5AR0A 3FZKA 3FZLA 5LY3A 1X3NA 3FFKB 2YCHA 4ISFA 3KHYA 4DB3A 2A40A 3GOIA 4H0XB 1NM1A 3EKUA 2E8AA 5AQXA 5BPMA 1GLDG 4XH4A 2ASMA 1QQOA 2IVPA 3SK3A 4QS7A 1ZBSA 5EVZA 2W40A 5F1XA 2V51B 3HSCA 3UE5A 1MWKA 3HBTA 3LDLA 5FPEA 4GY2B 4BR4A 4CBUA 5I9EB 1MDUB 3M6GA 4CZLA 1G99A 2EWSA 4PKHA 5AQUA 3VF6A 2YJFA 3VGKA 2GUPA 3J8AA 4FOIA 4CD3A 4BQLA 2OANA 5AQZA 5AQVA 1SZ2A 3QBWA 4BR7A 4B1UB 4WQ5A 3AAQA 1BDGA 4MO5A 5JLFA 4FWKA 4WQ4A 4FWSA 3LM9A 1QHAA 1Y64A 3VOVA 3GG4A 5AZJB 1BO5O 2Q0RA 2ITMA 2NRHA 2QM1A 4B1XB 1ESVA 2YHXA 3O8MA 2CGJA 3GBTA 4F9OA 2VWBA 3M3ZA 1GLJO 3FR0A 4AM7A 5KQDA 5BN8A 2E2NA 2CH6A 5AQJA 2F9WA 4BC3A 4B1ZA 2QWNA 3M1FA 4A2BA 1LCUA 5F0XA 4BRLA 1E4FT 4BGAA 1HPMA 4XH5A 1HJOA 1QZ5A 4H5VA 2E1YA 4JD2A 4BRDA 2QXLA 5KPRA 1NWKA 4IO8A 4RTFD 4FWOA 2GELA 1NGFA 2A6AA 3L4IA 5BPLA 2P9KA 2QW9A 3L0QA 5AQOA 3H3OB 4EAHD 4M63C 3LL3A 1ZC6A 3KVGA 2NZTA 3O4WA 3UKUB 1T6DA 2YHYA 1JCGA 1HX1A 2Q31A 5B8HA 3JXUA 2I7NA 4BG9A 4CZEA 3EKSA 5EXWA 3ZETA 1XC3A 1X9JA 3LDOA 4MO4A 4NB4A 2E20A 1NGHA 4IZ9A 4EHTA 2A41A 2UYTA 3VEXA 5CE3A 4RWTA 3D7EO 1NGCA 3L6QA 2AP1A 2GWKA 4FWRA 1YXQA 3ATVA 3CJAA 1NGBA 3R9PA 2H3GX 1Z05A 2QWMA 4CD1A 1NGDA 1YAGA 5BN9A 4FSVA 1JCEA 1Q18A 3RSEA 4KBOA 3WUHA 1TUUA 4BRFA 5E84A 5ADXA 4RCHA 1DGKN 3D2FA 5ELZA 1XUPO 4ISGA 4B1VA 4Z94A 3VF2A 2FF3B 2HF3A 2P9SB 3A5MC 5JMVA 2P9LB 1T6CA 3TU5A 2V7YA 2VCPA 4BRIA 3CJ7A 1YVNA 2A5XA 1ATNA 2J4RA 3O1WA 4M7XA 4WQ4C 3S41A 3DXKA 3LDPA 3VETA 3H1VX 3VGMA 4DQ8A 3LDQA 3WXJA 4I6MA 3CERA 4BQZA 5AQQA 3CHWA 2I7PA 3WEEB 5BR9A 1S3XA 4H5WA 2FSKA 2CGKA 4K43A 4JNEA 3VEVA 3W3DA 4BRKA 1U2VA 3ATUA 4EIAA 2FLOA 4CJ7A 4B1WB 3VERA 3A5OC 2YHWA 3B8AX 3OHRA 2ZGYA 3C7NB 3WQTA 3ZEUB 3QICA 5KPTA 1IJJA 1Z6RA 4Y0WA 4YDUA 3A5NC 3HZ6A 4H0YB 4MLHA 1QQMA 2PAVA 1NGGA 3ULEB 3VENA 2E2OA 3I33A 3MK6A 3MN6A 3ZX2A 2ZWHA 3QMLA 3CJBA 4WYBA 3KZBA 3CJ1A 3VEYA 4JHDA 1U6ZA 4FWPA 3VGLA 3FZMA 2QWQA 3F9MA 1KAYA 5AQYA 3UB5A 1C0GA 3AAPA 3H46O 1IG8A 5EY4A 5LJVA 2AA4A 1NGIA 1TYQA 3ENHA 3P4IA 1V4TA 3R6MA 3GE1A 5AZIB 3RSEB 4K42A 2P9NB 4H0TB 4H5RA 3QDKA 4BC4A 3WXKA 2W41A 4CZIA 4H0OA 3AARA 4QS8A 3QFUA 2NLXA 1XQSC 4FO0A 4CI6A 3G25A 1NGJA 2BUPA 1WUAA 4BRHA 3HI0A 3EO3A 1GLCG 3H1QA 3BF3A 2D1KA 3DXKB 2YI1A 4I6MB 4BRAA 2E2QA 5AFUA 1NGEA 1GLAG 4XH1A 3EZWA 4H0PA 1KAXA 1NLVA 1T44A 3BUZB 3DXMA 5TKYA 1C0FA 3DWLA 3ENOA 4IJNA 4JN4A 1ZXOA 3IMXA 5AQRA 3VEZA 4PKGA 2Q1NA 2QWOA 3SLCA 3IFRA 4BRQA 2ZGZA 2FSJA 4BC5A 3ZX0A 4JAXA 1BOTO 3CJCA 3O08A 1KAZA 1D4XA 3MN5A 1H1VA 5AQWA 1BG3A 4PL8A 3QB0A 5AQHA 4BVPA 2ZF5O 2HMPA 5AQFA 4FWNA 4B1YB 3QFPA 4C23A 2WUSA 5AZJA 3C0BA 5AQKA 4JHDB 3VESA 3VEWA 5KQ8A 4CZFA 1WOQA 4K41A 1YUWA 2A42A 4IJAA 2V7ZA 4E1JA 1KXPA 4HWIA 4O8KA 5AQLA 1X3MA 4WQ5C 4BG8A 2IVOA 3IDHA 3ID8A 3BEXA 5EX5A 4BROA 4EHUA 2PBDA 1TYQB
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5GINA 3J7AP 1ILYA 3CCQN 3VN5A 2VG5A 2WONA 2P9IA 4CBXA 1EX4A 2KHOA 5JS2A 1Q86O 1C1CA 1DKGD 4Z4CA 2HHXA 1GLFO 1I3AA 2F9TA 4J2AA 4BC2A 4JD2B 1BU6O 3FZFA 2ASPA 4K25A 4BDZA 4FW2A 3HJFA 1HNVA 1N6QA 1NMDA 3UKUA 2JWKA 3TPQA 3NH2A 4IG0A 2HHQA 4CECA 4OJRA 4DV7K 4JI5K 3V9XA 3NF9A 3OYBA 4RW8A 4CJVA 1YI2N 3KK1A 4W5RA 4M3YA 1HKBA 1XNQK 1NNEA 3PO4A 2HOEA 1UA0A 4KKOA 4HCBA 1OKJA 4DR3K 3AVFA 1WN7A 2DPNA 3V1QA 2P9PA 4KRFA 3CM6A 3J7YP 4JI7K 2NRWA 2G8IA 3ZSWA 4E7KA 4KH5A 1IKWA 3TAFA 3OYHA 5E26A 3HPGA 2HF4A 3JSMA 1RBVA 3VF4A 3ZSXA 4GKKK 4E19A 2OPQA 5JICA 5K14A 5IWAK 5LL6Z 1NJXA 4C1NK 4QAGA 4HUGA 2NRZA 1K6YA 3QESA 3ENBA 4KAZA 3OYGA 2QXFA 4KHWA 2VWKA 4CJTA 2KZZA 3FGUA 3MEEA 4AHTA 2E5LK 3WEEA 4A2AA 1XHXA 1KC8O 2YNIA 3M8RA 1SQKA 3NGYA 3CETA 5GAHP 4E1MA 3ZEUA 1VQMN 5CYQA 5HBMA 2X74A 2Z1GA 1J54A 2W6LA 4BRNA 4FWLA 5FRNA 4EZ6A 3H08A 5BRHA 1Z25A 4LH4A 4DQPA 1TVRA 1P8ZA 4DSKA 4LF6K 2D0OA 3KLIA 1C0MA 3LZJA 4OVLA 4DV5K 5FPNA 3LDSA 2D0CA 4CHQA 3NGZA 1ZYQA 2QWRA 1HKCA 4I2PA 3IUCA 3K2PA 2ASOA 4DHYA 3MWTA 4GMJB 2YX6A 3WNGA 4DTRA 3A5LC 4XEIA 3T7ZA 1JLCA 4CZGA 1J6ZA 5C2DA 3DM2A 4BWJA 3SMPA 2O8BA 1U47A 3AA3A 4BECA 3T1YK 1VSFA 1SL0A 4YOWA 1VQKN 3MMVA 4JK8A 5AR0A 4DQRA 5LY3A 2RKIA 4X65K 1X3NA 4OPHA 3KHYA 4DB3A 1JXEA 2A40A 3CPEA 2HHVA 3EKUA 3T19A 1Q9YA 3THXB 1WAJA 4GV6A 4Y1CA 4BE0A 5EVZA 3G0ZA 2W40A 1I39A 1MWKA 3HBTA 4G1QA 5I42A 2NRTA 4CBUA 5I9EB 4FJXA 2O8DB 5AQUA 3HOTA 1NKEA 3IAYA 4CHZA 2IGIA 2YJFA 2O8CB 4LD0A 4CD3A 3OYEA 3NHGA 4H8KA 5AQVA 4BR7A 1D9FA 2OZMA 4B1UB 4WQ5A 1HNIA 4MO5A 2HVIA 3WNEA 4AHSA 1QHAA 1C6VA 4LH5A 3CCSN 4FVMA 5T7BA 1EXQA 3AO4A 1ESVA 4B1XB 4BDPA 2YHXA 4Z4GA 2CGJA 4OO1J 3M3ZA 3CF5L 1GLJO 3L3UA 5CZ2A 5KQDA 3CCRN 4FK0A 4IFEA 5BN8A 2E2NA 1RDDA 4ID1A 4BC3A 4FLXA 2F4VK 1RBTA 2QWNA 3HVRA 3M1FA 4CESA 1N33K 5BR8K 4OLAA 4NXNK 4HCCA 5F0XA 1SV5A 4OGCA 3G71N 2BE2A 1HPMA 3LP1A 1HJOA 4JI8K 4JD2A 2E1YA 2QXLA 1OH6A 4B9SA 4N41A 2A6AA 2HHUA 5BPLA 2KLAA 5M1KA 4M63C 3N4PA 3MEGA 5J2MA 1U48A 1T6DA 3CFOA 4CFAA 3VQBA 3JXUA 3EKSA 4FJ5A 3VQCA 3ZT0A 1JJ2M 4RG8A 3LWMA 1XC3A 4MO4A 1NGHA 3OYAA 3OW2M 4Z4EA 4BE1A 3VEXA 4CW7B 1VQLN 3CCEN 3D7EO 4CHYA 3L6QA 2AP1A 1NJWA 3CC2N 3C95A 3R9PA 5TKWA 2NRXA 1OVQA 3TTDA 1WB9A 4DU4A 1JCEA 3RSEA 4KBOA 3WUHA 4JS4A 2HMIA 1IBLK 4DLGA 4BRFA 3HM9A 1DGKN 3BZCA 4JI2K 4CGIA 2RF2A 4B1VA 4I9LA 1XMQK 4LSNA 2HF3A 5JMVA 2P9LB 2V7YA 4FW1A 3L8BA 2A5XA 1ZBHA 4M7XA 4FJIA 4HTUA 4E3SA 1WSFA 1O1WA 1S72N 2VQFK 3VGMA 1RBSA 1IO2A 2GBZA 1WNSA 3NVMA 4BQZA 5CY4A 5HLFA 5AQQA 4CJRA 2HBMA 3P1GA 3RTVA 4LFBK 3T3FA 4NCBA 3AVLA 4K43A 2YNGA 2QK9A 4DG1A 4B1WB 1UWBA 3F73A 3S5TA 3B8AX 3WQTA 5KPTA 1IJJA 4O0JA 1QSLA 3KKRA 3P83D 2PY5A 1FKOA 5J2PA 3ULEB 4JV5K 5M1FA 4KI4A 3MK6A 4DTXA 2ZWHA 2PYJA 4G9ZA 3RMAA 3SQ1A 3PIPL 4FJ8A 3VEYA 1B92A 3RR8A 3L2QA 2YKNA 5JVGL 2ATQA 4RW4A 2PZSA 3VGLA 3J7ZO 3FZMA 2VWJA 1YT3A 3VQQA 5M1QA 2E6LA 5DMRA 1IG8A 3C6TA 4KHPK 4K8ZA 4E72A 1TK8A 2AA4A 2ZD1A 3P4IA 3HVTA 4FLYA 5M1OA 1K73O 3EYZA 2YV0X 4Z0UA 2IDOA 4MDBA 3HP6A 4DU1A 4FJGA 3HO1A 1XC9A 3P39A 3L2RA 2JLEA 1T03A 2BANA 3OYKA 2W41A 1KLMA 1RDBA 1NK9A 4BDYA 4QS8A 4QCLA 2XY7A 1S9EA 3MXJA 4IEEA 4CIGA 2QTDA 3K5MA 4DTSA 2OZSA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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