3EKUA

Crystal structure of monomeric actin bound to cytochalasin d
Total Genus 123
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
123
sequence length
372
structure length
362
Chain Sequence
EVAALVVDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVSHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTEEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELKDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMEACGIHETTYNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structures of monomeric actin bound to cytochalasin D.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Actin-5C
molecule tags Contractile protein
source organism Drosophila melanogaster
total genus 123
structure length 362
sequence length 372
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-09-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3ekuA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3ekuA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3ekuA03
1BUPA 3DAWA 1D4XA 4BR5A 3FZLA 2ZGZA 5EXWA 4BRCA 4FWPA 4B1UB 3VEXA 4H0OA 5AQHA 1LOTB 3WT0A 4MLHA 2NLXA 3OHRA 3SMSA 4A2BA 3CJ1A 4EHTA 4CZKA 3H1VX 3UB5A 4YDUA 2DPNA 3ZETA 4H0TB 3O4WA 1BO5O 2A5XA 1BOTO 3HTVA 2Q31A 4BG8A 3JS6A 3G25A 5KPZA 4H0PA 3WEEB 5AQLA 3IFRA 5AQNA 2YI1A 4Y0WA 3ZX2A 5TKYA 2FSJA 4JHDB 4H0XB 1NGEA 4PKGA 4QS8A 4J8FA 4A2AA 1J6ZA 4MO4A 3A5LC 1K8KB 1OKJA 1BG3A 3WEEA 2VCPA 5EX5A 4RCHA 2HMPA 3ULEB 1RFQA 3O80A 2ASOA 3D2FA 4BGAA 3A5NC 1ATSA 2QXLA 4FWRA 5AQRA 4JHDA 3FZKA 1YAGA 5AQTA 1G99A 4EAHD 3VF2A 3UKRB 4NB4A 1GLAG 1V4TA 4C23A 2NZTA 3ZX3A 3L0QA 2ZWHA 3ULEA 4K42A 2V51B 2ASPA 3MMVA 2YHXA 1DEJA 2GELA 2QWLA 4BR9A 3A5OC 3C7NB 1MDUB 3M1FA 2KHOA 4B1VA 2IIRA 3UKRA 1KAXA 3ENOA 3VGKA 3JXUA 1NLVA 1BWFO 2CH6A 4CZJA 5LJWA 4LC9B 5EY4A 3U9DA 3CJ9A 4BRDA 1ATNA 4FL9A 3R8EA 2A3ZA 3O08A 4M63C 3C7NA 1HUXA 5FPDA 2YHYA 3BUZB 4DQ8A 3QFUA 4L3QA 4CI6A 1ZC6A 1NGCA 1TYQB 3FZMA 1R59O 4CZFA 2E1YA 4WQ4C 2A42A 4WQ5C 4BVOA 3DJCA 2YJEA 5AFUA 1BDGA 4H03B 1NBWA 4QS7A 5B8HA 4BRMA 2WUSA 1TYQA 4JNEA 1ZBSA 3WXIA 4BRIA 3EKSA 1QQOA 2Q0UA 2Q97A 2VYPA 1GLLO 3WQUA 4FSVA 2Q1NA 2P9IB 2ZGYA 3B8AX 4BR4A 2IVPA 1NGDA 2I7NA 2QWOA 2P9KB 3KVGA 3RSEB 5BR9A 2P9UB 1X9JA 4BR7A 5KPTA 3MN6A 4FPBA 2P9IA 1XC3A 1NGJA 3TU5A 3QDKA 3VENA 3MCPA 2V7ZA 4FWOA 2P9KA 3RSEA 4A62A 2P9UA 3WXKA 1U6ZA 3LDLA 1U2VB 3A5MC 3I8BA 4BRQA 4YDUC 5F2RA 4BRLA 3H3OB 4BROA 4BVPA 5EOYA 5AQQA 4RTFD 3GL1A 1GLJO 4BREA 5JICA 3VESA 4FWSA 4FWNA 4K43A 3ZEUA 1U2VA 4MLEA 1DGKN 1XQSC 5BN9A 3BF3A 4JAXA 3WXJA 4BQLA 1NGAA 1S22A 3QMLA 4JN4A 4XH1A 1C0FA 3R6MA 4BR0A 5AR0A 2V52B 2OANA 4HWIA 2E20A 2F9WA 4CZMA 4ISGA 1HPMA 3UE5A 2FXUA 3KZBA 3WQTA 1DKGD 2ZF5O 4FWLA 3LDPA 2A40A 3HBTA 1SQKA 3MK6A 4M7XA 1IG8A 1CZAN 2QWRA 4H5RA 2ITMA 2FF6A 4CZLA 2QM1A 3EKUA 1E4FT 2IVNA 3ATVA 3CETA 3QICA 2AP1A 5BPNA 3WUHA 1NGGA 3CQXA 3AAQA 1NM1A 4QS9A 4EIAA 2CGKA 3HI0A 3IUCA 5AQVA 4BRFA 1NGFA 1JCEA 5AQYA 4FWQA 2E2QA 2YCHA 3O5BA 2CGJA 4BQZA 5BREA 2CH5A 4BGBA 1MWKA 1K8KA 3O8MA 4FOEA 1RDWX 4JD2B 3MN7A 1E4GT 1X3MA 3MN9A 4PKHA 2H3GX 4ISFA 1GLBG 5BRHA 4BC5A 3FGUA 4B9QA 3QBXA 1TUYA 3ENHA 5AQJA 4JD2A 5CE3A 1BA1A 4AM7A 5BPMA 3D7EO 5KPRA 1BA0A 5LY3A 4CJ7A 3M3ZA 4MO5A 4BC2A 5AQGA 1GLEG 4PKIA 2I7PA 2GEMA 3CI5A 1IJJA 3FZHA 3EL2A 3SMPA 5E84A 2E2PA 2PBDA 1ZXOA 3CJCA 4FWKA 1GLDG 3MDQA 2GTDA 3VGLA 5ADXH 1YUWA 4CZHA 4K41A 3ZX0A 3LM9A 2EWSA 1YXQA 1NMDA 2D0PA 2E2OA 2E88A 4FOIA 2FSNA 5JMVA 3O1BA 2D4WA 3DXKB 5F1XA 5BN8A 3D2EB 2HF4A 4BR2A 4Z94A 3VPZA 5BRFA 2YJFA 2VWBA 4IJAA 3I33A 1MWMA 3VEZA 5AQUA 3VEVA 1T6CA 4BC4A 4BRGA 3H1QA 3DXKA 2P9NB 5AZJB 3VEYA 3D2EA 3VF6A 5AQXA 2E2NA 4IXCA 5LJVA 3AAPA 5AQSA 4B1YB 3IMXA 4H5VA 5FPEA 4GNIA 4PL7A 1KAYA 4CZIA 4M7YA 5FPMA 2P9NA 3O1WA 5AZJA 3CQYA 4CD1A 2W41A 4HTLA 4H5WA 4EFHA 3VETA 4WQ5A 3S41A 4B1ZA 4CBXA 3FE1A 3EO3A 4O8KA 5BPLA 3CJAA 4IJNA 1WOQA 1NGIA 1HKBA 1V4SA 2Q36A 2P9PB 1Z05A 3VEWA 2FSKA 5JLHA 1MA9B 3VGMA 4F9OA 5I9EB 3TPQA 1ESVA 3HM8A 4O5FA 1P8ZA 1HKGA 3U9ZA 1SZ2A 3HSCA 4DCHA 4FO0A 5AQWA 1RGIA 2BTFA 5AQMA 4BRAA 2A6AA 2P9LB 3W3DA 3H3NO 1TUUA 2E8AA 3UKUB 2QW9A 1H1VA 4B1WB 1S3XA 4XEIA 3ZETB 4DB3A 1HJOA 4RWTA 2QWPA 2QWQA 1QZ5A 1EQYA 3BP8A 4ISEA 2P9LA 2A41A 2W40A 4E1JA 3UKUA 4BRNA 3DWLA 1C0GA 4IZ9A 1ATRA 2E1ZA 4EHUA 3J8AA 3QB0A 4I6MB 4KBOA 5BRDA 3H6EA 4B1XB 4H5TA 4XH4A 5FPNA 3CIPA 2FF3B 1Z6RA 3FZFA 3R9PA 3AY9A 1QZ6A 5KQDA 4I6MA 3D2FB 3SJHA 1HKCA 1LCUA 1NGHA 3LM2A 5AQIA 3VOVA 4CBWA 3L4IA 5AQPA 3DXMB 1JCFA 3U8XA 3H46O 3L6QA 2Q2RA 3H45C 5AQKA 1QQNA 3MN5A 3SLCA 3SK3A 3VEOA 3VERA 3CERA 1JCGA 1BU6O 3FLCO 3F9MA 3GE1A 5AFUH 1KAZA 5AQFA 2V7YA 3DXMA 1YVNA 3AARA 3EN9A 4XH5A 3BEXA 3KHYA 5AQZA 3HZ6A 3CHWA 4NO7A 4CZGA 3GDQA 2GWKA 3C0BA 1HLUA 4CBUA 5F0XA 3BF1A 1Y64A 2GUPA 4H0YB 1T6DA 5ELZA 4BC3A 3FR0A 5JLFA 5AZIB 2QWMA 5AQOA 4WYBA 2ASMA 4FWMA 1QHAA 4BRPA 2HOEA 4A61A 3ID8A 3CJ7A 1NGBA 1WUAA 2YHWA 3GBTA 3QFPA 3EZWA 2F9TA 4CZEA 5KQ8A 5AZIA 4IWVA 2P9SB 3P4IA 1XUPO 3O6WA 3ATUA 4BG9A 3M6GA 2PAVA 2J4RA 2HF3A 4DHYA 3LDQA 4AM6A 4H5NA 4CD3A 3LL3A 2GWJA 2Q0RA 2P9SA 3GOIA 2QWNA 2D1KA 4H0VB 3FFKB 3LDOA 2AA4A 2D0OA 3WXLA 1NWKA 2CGLA 4BRHA 5ADXA 1X3NA 3CJBA 5EVZA 2NRHA 2UYTA 3A0IX 4WQ4A 3LDNA 1HX1A 1T44A 1GLFO 3A8YA 1Q18A 1QQMA 2FLOA 4PL8A 4BRKA 4FPAA 3VF4A 3IDHA 5E26A 3ZEUB 4GY2B 3QBWA 2IVOA 3GG4A 2BUPA 1SAZA 3W0LA 4IO8A 3U4LA 4K25A 1KXPA 1GLCG 2P9PA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4CEZA 3DAWA 3NE6A 3SI6A 3TAMA 4FK2A 1WBDA 5JS2A 1JLGA 3THVA 1IH7A 1Y97A 2NRRA 4B1UB 3HVTA 2UUBK 5DMRA 5AQHA 4MLHA 1C1CA 3VMFB 5LMUK 4CJ5A 2BGGA 4AILC 1NJIO 3G10A 1VQON 3I8DA 3QNNA 3CJ1A 4FVMA 1RDDA 4GMJB 1BO5O 3NBPA 4CJLA 3AGKA 4HUFA 2VGNA 4BACA 3JS6A 4DV5K 1NK7A 2O8DA 5I3UA 2QTDA 2B6AA 3IFRA 4DV6K 5AQNA 3TABA 2YI1A 5HBMA 4E3SA 3DYAA 4LFCK 1TL1A 4QS8A 4J2BA 4A2AA 1J6ZA 3A5LC 4CHQA 4U7BA 2YNFA 3WEEA 3NFAA 3TI0A 1NKCA 1RFQA 4BGAA 3A5NC 1TK8A 4KI6A 2QXLA 4AHVA 4BE0A 4DS5A 1V4TA 3ZX3A 4CJ3A 2VQFK 1IKVA 2ZWHA 4I9LA 3G6EN 4FW2A 3QNOA 3SBTA 1RILA 2QWLA 4BR9A 3SPYA 2FBYA 3LAMA 3ZSWA 1BWFO 4JKHA 4DTOA 5LJWA 1S6QA 3U9DA 4KHWA 1ATNA 3R8EA 4E72A 3C7NA 1HUXA 3BUZB 5C2FA 4DQ8A 5AJ3K 1HYZA 1SV5A 4WQ4C 1C6VA 3AA3A 1JJ2M 2HHXA 3TSUA 1BIZA 3QIOA 3MECA 2X78A 1A5WA 2WUSA 1TYQA 3EY1A 3SUNA 3TAQA 4FJLA 4IOAL 4B08A 2Q97A 3WQUA 3VQCA 4FSVA 3I0RA 3NAEA 2P9IB 1QVFM 3CM5A 4LD0A 1W97L 2P9UB 4BR7A 1M1KO 1YHQN 1YJWN 4IG0A 3ENBA 3MWTA 3RSEA 2E5LK 3WXKA 2PZSA 4BRQA 5C12A 3H3OB 2D0AA 4BVPA 5EOYA 4OJRA 4AH9A 3ZEUA 3CG7A 2W00A 2GX9A 1DGKN 1NK8A 2F96A 3LALA 4BQLA 3QMLA 3R6MA 4BDPA 4IG3A 1VQNN 3WXMB 4KPYA 4KHNA 1B9DA 1JKHA 4CZMA 4ISGA 1ASUA 2FXUA 3WQTA 3ZSQA 2ZF5O 3PX6A 2A40A 3KK2A 4H5RA 1S9EA 3S3NA 4IEEA 2QM1A 2IVNA 3CETA 1KSPA 1IV0A 3QICA 5BPNA 5KTQA 4CJVA 4DSIA 3KD5E 3PV8A 3CYGA 4QS9A 1FW6A 2CGKA 3LP1A 3QETA 4BRFA 4KH5A 4NCBA 5AQYA 4LH4A 2E2QA 3RMDA 1JLBA 2YCHA 4MQ3A 1NG9A 1SKWA 2FC0A 4JKCA 3V81A 5BR8K 1X3MA 1WSJA 2GV9A 4CJQA 1BCMA 1DLOA 1U48A 4ISFA 4CESA 3KLFA 5BRHA 4BC5A 4F2SA 1OH8A 4KB0A 3ZSOA 3TAPA 4JD2A 1S9GA 4CEDA 3CCJN 4CGGA 1KXPA 5BPMA 3CCQN 1I3AA 2HNYA 1YF5L 3KLGA 5LY3A 1HMVA 3ZSRA 3QEPA 4DTSA 2HHQA 2HHIA 4IOXA 3HXMA 1D9DA 4MO5A 1NK6A 4PKIA 1K8AO 4CEEA 1VQ5N 4FJKA 5FRNA 4PQUA 1GOBA 3FZHA 1QVGM 1NJWA 5E84A 1ZXOA 3SJJA 3Q7BA 1WSFA 5C10A 5H1SQ 3J80O 1YUWA 4LSLA 4CZHA 1KRPA 3VQBA 3CC4N 4DTRA 2EWSA 3RVCA 2E2OA 4OGCA 3KLEA 4DWIA 3THWA 1BI4A 2D4WA 2ZQBA 4GV9A 3E01A 2DTUA 2HF4A 4BR2A 1RT5A 4DSKA 4AF1A 2YJFA 4IJAA 3DXKA 3VEYA 3PX4A 3CFRA 3VF6A 3THYA 2YKMA 1ASWA 2E2NA 3ZT3A 3VN5A 2ZM6K 2P9NA 3O1WA 4IBNA 4KTZA 2W41A 1TVRA 4CBXA 3SQ2A 3AA4A 3K57A 4CF2A 3HJFA 3OA9A 1GOAA 4M3ZA 1ILYA 4RG8A 3VEWA 2FSKA 5EU7A 5JLHA 1MA9B 3VGMA 4CHOA 4X66K 4FZYA 1JLFA 2WTUA 3MXIA 3DLKA 5SZTA 4F4KA 4DR7K 4OLAA 1P8ZA 3U9ZA 4RW7A 1SZ2A 5J2MA 3VQPA 2ETJA 4JI1K 4BRAA 5GAGP 2FBVA 3H3NO 1RDAA 2NRWA 4W5QA 4B9UA 3HRGA 3SQ1A 4B1WB 3ZSZA 3JYTA 4DB3A 5E41A 2A41A 2W40A 4DTUA 2E6MA 4KTWA 1U45A 4LH5A 4DR5K 2E1ZA 2OYQA 1RDCA 4C8KA 3CXCM 3QB0A 5GINA 3I55N 1C0TA 3H6EA 3BZKA 3LDSA 3DMJA 2BH1A 3FZFA 1TV6A 1S72N 2Q3SA 3RR8A 1VQKN 1X1PA 4KB1A 1NGHA 1I94K 1JLQA 4CBWA 3DXMB 1NJXA 1VAZA 3SV3A 1IBMK 3MN5A 5C25A 4JI3K 1D8YA 1HRHA 2DFFA 2I5JA 3GE1A 3OYMA 3S9HA 2E6LA 1KAZA 3VTHA 4B3OA 2XHBA 3V1QA 5MLCQ 3RTVA 3BEXA 3AVFA 1YVUA 3KHYA 3SNNA 1VHXA 4YNQA 3C0BA 1HLUA 5KI6A 2O8EA 4Y1CA 5F0XA 4DTNA 1T7PA 1BHLA 4E7KA 4KTQA 1CZBA 1WSIA 4BC3A 3FR0A 4R79A 5JLFA 2KW4A 1W9HA 4ELUA 3TAGA 4K8XA 2ASMA 1QHAA 1YJNN 3ID8A 1NGBA 3AVHA 3EZWA 3IAYA 4KH6A 5KQ8A 4OPAA 1XC9A 4DTXA 1FK9A 3ATUA 1RT6A 2QKBA 4FLWA 1C1AA 3DLRA 5C24A 4DV7K 1T8EA 3CCLN 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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