3EL2A

Crystal structure of monomeric actin bound to ca-atp
Total Genus 118
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
118
sequence length
372
structure length
362
Chain Sequence
EVAALVVDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVSHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTEEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELKDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMEACGIHETTYNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structures of monomeric actin bound to cytochalasin D.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Actin-5C
molecule tags Contractile protein
source organism Drosophila melanogaster
total genus 118
structure length 362
sequence length 372
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-09-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3el2A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3el2A02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3el2A03
4B1ZA 2A6AA 2VCPA 4K42A 2IIRA 1WUAA 3VF2A 4FWMA 5AQHA 4PL7A 5KQ8A 3AARA 4RCHA 3UKUA 3IMXA 3MK6A 4I6MB 3DXMA 3KHYA 2GWKA 3ZX3A 1T44A 4H0PA 1NGIA 2YJEA 3EKSA 5AR0A 5F0XA 4H0OA 3O4WA 3IDHA 4FWLA 3EO3A 5BRDA 1SQKA 3A0IX 4IO8A 4IWVA 3O5BA 4FO0A 3A5NC 3LDPA 3HTVA 1KAZA 3EN9A 2CH6A 2A40A 4H5RA 4CZGA 4BR4A 4H5TA 1NM1A 2E2PA 2FSJA 4CZIA 3SMPA 3LM2A 3WQUA 4BRMA 4FL9A 2J4RA 1GLBG 5AZIA 3UKUB 4M7XA 3WXJA 4PKGA 5JMVA 4K25A 4F9OA 4H0TB 1JCEA 4K43A 4WYBA 4Y0WA 5AQIA 4BREA 4GY2B 3UB5A 1RDWX 3AAQA 3JS6A 2KHOA 3H3OB 5B8HA 2QWPA 3R8EA 5KPZA 4Z94A 1HKBA 4AM7A 2GTDA 4PL8A 5EXWA 4JD2A 4RWTA 1BG3A 2AA4A 2VYPA 3FGUA 1ESVA 4XH5A 1YVNA 3UKRA 1C0GA 3M1FA 2ZGZA 4MO5A 4BRNA 3A5LC 3A5MC 4IJNA 5AZIB 1BUPA 3CJ7A 1KXPA 3LDLA 3H46O 3QBWA 4C23A 3FLCO 1KAYA 1BO5O 3P4IA 5JLHA 4JNEA 2FSKA 2YJFA 4XH1A 3FFKB 1YAGA 2I7NA 1E4FT 2E1YA 3FZLA 3LDQA 4WQ5A 1NLVA 2F9WA 2P9UA 1MA9B 4BG9A 4BQZA 4JD2B 4QS7A 2NZTA 4BVOA 3F9MA 2P9LB 2QWLA 4BR9A 3TPQA 4BRIA 1RGIA 2W40A 3MMVA 1GLAG 3UKRB 3DXKB 2D1KA 4BRGA 3CJBA 4DB3A 4BGAA 3QB0A 1ZXOA 5AQRA 2CGLA 1HKGA 4FOIA 1LCUA 3VEXA 3CQXA 3H1QA 1X3NA 3ZX0A 4CBWA 2ZF5O 5AQKA 3FZFA 2A41A 2V7ZA 3FE1A 5EX5A 1HX1A 5AZJB 3WXKA 4CI6A 2CGKA 2Q31A 3EKUA 2V7YA 1V4SA 4EIAA 2E2NA 3EL2A 2NLXA 4IZ9A 1SAZA 3VEYA 5AQSA 2P9UB 5JLFA 4BC5A 3ID8A 4CZJA 4BRQA 2ITMA 3WXIA 1QHAA 1T6DA 3I8BA 4H0XB 3BF3A 1V4TA 1G99A 2FLOA 1Z05A 2GUPA 3IFRA 3QICA 2Q97A 1NGHA 3WEEA 2P9PA 5ADXH 3CJCA 3VENA 4DQ8A 3BUZB 4EHTA 5LY3A 3WQTA 4BROA 1IG8A 4JAXA 3D7EO 5AQPA 4FOEA 5JICA 1QQOA 2D0OA 1CZAN 3ULEA 1NGCA 4ISEA 3MN7A 1NWKA 5EOYA 1GLEG 3IUCA 5AQQA 3M6GA 5AQGA 3CQYA 3FZMA 4HTLA 2UYTA 3H1VX 1YUWA 1GLFO 4FWPA 4LC9B 2E8AA 1HUXA 2QWRA 3O80A 4M7YA 1HLUA 4EAHD 2V52B 4NB4A 2ASMA 1BU6O 5AQNA 1P8ZA 3U8XA 3SMSA 5BPNA 4WQ4C 4PKIA 5TKYA 2ASOA 3QFPA 5EY4A 2BTFA 3L4IA 2IVOA 5BREA 4CZEA 1BOTO 3VERA 4FWOA 4A61A 2D0PA 4MLEA 3VEOA 4BC3A 3WEEB 2P9PB 2FF3B 1K8KA 2P9NA 3J8AA 3MN6A 3O6WA 3ATVA 2FSNA 4J8FA 2EWSA 4RTFD 4NO7A 1NGDA 3ULEB 1TUYA 3R9PA 3QDKA 5FPEA 5BN8A 2A5XA 3ENHA 3S41A 5KPRA 4YDUA 5BN9A 5KQDA 5AQOA 3SK3A 3CJAA 2W41A 4QS9A 3WUHA 3HM8A 3DJCA 1E4GT 5BRHA 5AQYA 1BA0A 2P9LA 2FXUA 1XC3A 3MN9A 5F2RA 2P9SB 2PBDA 1R59O 3FZHA 4CD1A 2HF4A 5AQXA 3QFUA 3SLCA 4BRKA 3DXKA 2YCHA 4B1YB 1HKCA 4DHYA 4E1JA 2E20A 4FSVA 4FPAA 4B1WB 3ENOA 1QZ6A 2A42A 3VF4A 5KPTA 3W3DA 2QWOA 1NGEA 1GLCG 3O8MA 4HWIA 4BRHA 4KBOA 3GBTA 4MLHA 3D2FA 1JCGA 1MDUB 4MO4A 3MCPA 3BP8A 2CGJA 3QMLA 5ELZA 3VETA 1K8KB 2P9NB 2CH5A 4ISGA 5E26A 4FWQA 1HJOA 5AZJA 3HZ6A 5AQZA 4CZHA 1U2VA 3G25A 2I7PA 1MWKA 1NGFA 3D2EA 1YXQA 2IVPA 3BF1A 3FZKA 3W0LA 4CZLA 3MDQA 2YI1A 4BVPA 1T6CA 1NMDA 3HBTA 4FWSA 2GWJA 4CZKA 5ADXA 2E88A 4CJ7A 5BPLA 3VOVA 4XEIA 5AQWA 2ASPA 2QWQA 2P9IB 1NGGA 3VGLA 3ATUA 3RSEB 2Q36A 5F1XA 3D2FB 3VESA 1IJJA 2QWNA 2YHWA 3GE1A 4BRCA 3DWLA 2PAVA 3ZEUA 3TU5A 2DPNA 2FF6A 3VF6A 5CE3A 1X3MA 3ZETA 1Z6RA 4FWRA 1ZC6A 4GNIA 1U2VB 3CI5A 4BRLA 2V51B 3BEXA 1DGKN 4XH4A 3VEVA 3CJ1A 4BC4A 1GLLO 3D2EB 2E2QA 4FWNA 2QWMA 4K41A 3C0BA 1Q18A 3KZBA 4H03B 3U4LA 3WXLA 5FPMA 4B1VA 5AQLA 1ATSA 2HMPA 3WT0A 4PKHA 1NBWA 2P9KA 1C0FA 3A5OC 1J6ZA 1BDGA 1SZ2A 1H1VA 2E1ZA 3QBXA 1EQYA 3U9DA 5LJWA 4FPBA 1S22A 4BQLA 4BRDA 3ZEUB 2QXLA 1ATRA 3SJHA 5AFUH 3ZETB 3VPZA 5AQJA 4BRAA 1OKJA 2P9SA 4AM6A 3C7NA 5LJVA 3O1BA 1X9JA 4BGBA 1U6ZA 1NGJA 2ZWHA 4YDUC 1TUUA 2H3GX 3LDOA 5BR9A 3B8AX 1LOTB 3LM9A 4ISFA 3UE5A 4EFHA 1NGAA 1KAXA 4M63C 3GL1A 2P9KB 4CZMA 5AQTA 3AY9A 3CERA 4CZFA 2Q0UA 3MN5A 4H0YB 3VGKA 3O1WA 1QQMA 4B1UB 3DXMB 4BR5A 4CBXA 3AAPA 5I9EB 3CHWA 4JN4A 1MWMA 5AQUA 3CIPA 2WUSA 3A8YA 1ZBSA 2P9IA 3C7NB 4BRPA 3R6MA 3M3ZA 4WQ5C 3RSEA 1Y64A 2HOEA 5EVZA 1TYQA 4BR7A 2A3ZA 4WQ4A 4BRFA 1DEJA 2OANA 3ZX2A 5FPDA 4JHDA 4O5FA 3HI0A 1WOQA 2YHXA 2F9TA 4H5VA 5AQFA 1D4XA 1HPMA 1GLJO 3HSCA 3H6EA 5AQMA 5AQVA 1QQNA 2ZGYA 3H45C 2QM1A 1DKGD 4BG8A 1QZ5A 3O08A 4IXCA 3DAWA 4H5NA 1NGBA 4A2AA 3VEZA 1BA1A 2Q2RA 4B1XB 3GOIA 3JXUA 2Q1NA 4BC2A 1RFQA 3CJ9A 3GDQA 4FWKA 4H5WA 4EHUA 2QW9A 3KVGA 1XUPO 3I33A 1XQSC 1BWFO 3VGMA 3L6QA 4O8KA 2Q0RA 2GELA 1TYQB 3GG4A 4B9QA 4BR2A 3CETA 2GEMA 1JCFA 3FR0A 3U9ZA 4JHDB 4IJAA 3OHRA 4I6MA 3EZWA 5AFUA 4CBUA 3LDNA 2NRHA 3H3NO 4QS8A 3VEWA 2IVNA 2AP1A 4BR0A 2YHYA 5BPMA 4A2BA 2BUPA 4A62A 5FPNA 4L3QA 4CD3A 2D4WA 1ATNA 5E84A 4H0VB 5BRFA 1GLDG 4DCHA 2HF3A 2VWBA 2E2OA 3L0QA 3LL3A 1S3XA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4DSKA 3T7ZA 4O5BA 2IIRA 3AGRA 1WUAA 1CLQA 1HQEA 3K5LA 4CJQA 4JKCA 3UKUA 1RT1A 3DXMA 2XO7A 4BY9C 3ZX3A 2YJEA 2R7YA 3TARA 2FBTA 3K59A 3WNGA 4IO8A 2RKIA 1RBVA 3NGZA 4FJIA 3AVIA 3O5BA 4DQIA 4DV0K 1RT7A 1C0TA 3S3MA 2D0CA 1WLJA 4H5RA 4KH4A 2NUBA 1LAVA 1HYSA 2E2PA 2FSJA 4OLAA 3SMPA 4BRMA 3OA9A 3WXMB 4DS5A 3CCQN 3AVMA 4QCLA 2HHWA 4PKGA 3O3HA 4CGFA 4E1NA 4E7HA 1ZBIA 3WNHA 1TGOA 3DOKA 4WYBA 1NKEA 3LAKA 2VG6A 3N4PA 4FW2A 1T7PA 1GOAA 3HL8A 3KLIA 3H08A 3L8BA 4JS5A 3R8EA 5KPZA 4Z94A 4AM7A 5C12A 3G6EN 4Z4EA 4RWTA 3RMBA 1S9EA 1JLAA 4XH5A 3D6RA 4BE2A 4KREA 4N5SA 4MO5A 4DTSA 3A5LC 1IKWA 1HNWK 4DR7K 1VAZA 4AHCA 1OVQA 1KXPA 3QBWA 3SAGA 4RG8A 5A2QO 4DTMA 4DLEA 3F73A 4CJFA 4KO0A 4BE7B 3LDQA 3ZSXA 2P9UA 1MA9B 3MX5A 4O0JA 4CF1A 3HVRA 3J7AP 4JD2B 4A57A 4BVOA 3EE8A 3F9MA 5I42A 1NK9A 4AHRA 3PO5A 1WNSA 2W40A 3KK7A 3NFAA 1GLAG 3LPUA 3MXIA 1KD1O 1U45A 3SUPA 1YITN 3QB0A 1SL2A 1ZXOA 4KB0A 4JYAK 4CCHA 4DTUA 3H1QA 3K58A 4DV1K 1U47A 4W5NA 3FZFA 3TWHA 2WTUA 1I94K 1HX1A 2HBMA 3RMAA 4JLHA 1IBMK 3K2PA 1O13A 5JLFA 4M3YA 1NJWA 2XRIA 4AHUA 1HYZA 4H0XB 1V4TA 1G99A 3BF3A 4DTPA 1JXBA 5ADXH 3NF9A 5M1PA 5AQPA 4KV8A 3ZT3A 3SAFA 5JICA 4CJ4A 2IS3A 3UIQA 4WE1A 4FJXA 5EOYA 5AQQA 5AQGA 3EEQA 1L3VA 3FZMA 4HTLA 2E8AA 4M7YA 4FCYA 3DYAA 3S3NA 5AQNA 4GV3A 1P8ZA 2QKBA 2DY4A 4CEOA 5C0YA 4DFKA 3P83D 1QSSA 4A61A 1X9SA 4MLEA 1L3TA 3VQ5A 3WEEB 1UOCA 1K8KA 3KD5E 2OPSA 1C1AA 3J8AA 3O6WA 1IKYA 3D0PA 4U7BA 1GOCA 4LF7K 3LZIA 5CHIA 4CJUA 1NGDA 5FRMA 5FPEA 1WSJA 3NAEA 3SJJA 4I7FA 4JEPA 4AHTA 4QS9A 2YHAA 3HPHA 4B9LA 2FBXA 4X66K 1BA0A 2KKZA 3MN9A 4CD1A 4BRKA 4B1YB 3CPWM 3ZT4A 4G9ZA 1YT3A 4B1WB 4JKDA 5HROA 5KPTA 3O8MA 4HWIA 4E7IA 3GBTA 3MCPA 4FJ5A 3KLGA 1BHLA 2Z1GA 1XI1A 3KTQA 1YI2N 3VQ9A 2G8UA 3HZ6A 4J2BA 3PSFA 4IDHA 3TAEA 3D2EA 5H1SQ 2ZJPL 4C1NK 2HMIA 4FWSA 1TKZA 5M1QA 5BPLA 4CJ7A 3VOVA 1K8AO 4XEIA 2UXBK 2HNDA 2A1SA 3ATUA 3OYCA 4KHSA 4IOAL 4Q0BA 3HPOA 3PIOL 1YVUA 3O3GA 3NF8A 3S5TA 2KW4A 4CESA 4OPAA 2VQFK 1D9DA 1BIZA 1EO1A 4DS4A 2PAVA 1U04A 3O9UA 1RTHA 1Z26A 3VF6A 1X3MA 2YV0X 3M8RA 4GNIA 4CHOA 1U2VB 4CJRA 2Y1IA 4C1NI 1HNIA 1BCMA 3C0BA 1U48A 4LFBK 4J2EA 3O9SA 1S6QA 4B1VA 5JVHL 1WSHA 4CK2A 1J53A 1XMQK 3SCXA 4AHSA 1VQ5N 3LAMA 3F9KA 3QINA 4AHVA 1J6ZA 4BEBA 1H1VA 3VQAA 4HUGA 3QBXA 4KHQA 3U9DA 3ID6A 3J81O 4FPBA 4CFBA 5M1OA 4M3UA 3ZEUB 4HHTA 4BDYA 1JXEA 3ZETB 3VPZA 5AQJA 3ALYA 3HYFA 3RMCA 2HSTA 3V9WA 2C1GA 2B6AA 2BH1A 3JAMO 4BGBA 3ZT2A 2DFFA 1NGJA 4YDUC 3LDOA 3B8AX 3OYEA 1GOBA 4R5PA 4DFPA 4L8RB 3LM9A 2G8WA 4O8UA 1KAXA 3RMDA 4M63C 3M8QA 4CIEA 3P31A 4CEFA 4G1QA 1CXUA 1Y97A 2P9KB 1VQON 3AVJA 3ASMA 2EHGA 4IEIA 3TTCA 4EZ6A 3AAPA 5I9EB 1M90O 4KTQA 3E01A 2FBYA 3C7NB 3KWIA 3R6MA 4M3TA 3KK1A 4NCGA 3T3FA 2HOEA 1EXQA 2IDOA 2A3ZA 4FM1A 3BZCA 2O8FA 1BI4A 1QHTA 3D45A 4CEBA 5AQMA 4CHNA 1QQNA 1NJXA 4BG8A 2P5OA 4IXCA 4GKJK 5HL7L 4R79A 3VEZA 4CW7B 4B1XB 3KKSA 2YKMA 3ZSZA 3CJ9A 3RRGA 3GDQA 4UY8O 2PYLA 4H5WA 3L2QA 4AF1A 1YIJN 3SQ2A 3KVGA 1XUPO 2HHUA 1I3AA 4HTUA 1XQSC 4CE9A 4F2RA 3VGMA 4O4GA 4M3XA 2GEMA 3K57A 3MEEA 1JCFA 4OO1J 4NLBA 3U9ZA 1WAJA 4IJAA 3KIOA 4YNQA 3EZWA 4B9SA 3HRGA 3LDNA 1IBKK 2OPQA 3H3NO 3CCLN 3NGIA 4KTZA 3IRXA 4DSFA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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