3FFKB

Crystal structure of human gelsolin domains g1-g3 bound to actin
Total Genus 112
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
112
sequence length
366
structure length
365
Chain Sequence
DETTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Ca2+ binding by domain 2 plays a critical role in the activation and stabilization of gelsolin.
pubmed doi rcsb
molecule keywords plasma gelsolin
molecule tags Structural protein
source organism Homo sapiens
total genus 112
structure length 365
sequence length 366
chains with identical sequence E
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-12-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 3ffkB02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3ffkB01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3ffkB03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3ffkB04
4JNEA 3L0QA 1T44A 3GOIA 4PKGA 4BR2A 2E2OA 3VEOA 2E1YA 4BGBA 3FZLA 3P4IA 1XUPO 2AP1A 5KQDA 3WQTA 3EZWA 3HI0A 3SLCA 4BC2A 3J8AA 2GELA 2A3ZA 2E1ZA 2P9PB 3ZETA 4BRCA 2FLOA 5BN8A 3VEZA 3BUZB 2E2PA 1GLAG 3D2EB 2Q31A 4CJ7A 3WUHA 1NGIA 2GTDA 5KPTA 1CZAN 3ATVA 4GY2B 3WXKA 5LJWA 1JCGA 4QS9A 1MA9B 4BG9A 4CI6A 4H0VB 3CJBA 5AQLA 4K43A 5EXWA 1E4GT 3BF1A 3CJCA 3VEYA 4FO0A 1G99A 2P9SB 2W41A 5AZIA 4EIAA 2ZF5O 5AQHA 4QS7A 1ATRA 3UE5A 1S22A 1LCUA 1HKGA 4CZFA 3DXKA 3KHYA 2ASMA 2P9LB 3H46O 4MO5A 4BRNA 1JCEA 5EVZA 2HMPA 5BREA 3HZ6A 3O80A 5I9EB 3QDKA 2YHYA 2ASOA 1D4XA 3JS6A 3O5BA 3WQUA 3ATUA 2Q2RA 3QMLA 2D0OA 2HF4A 4BR0A 1K8KB 4XH5A 1JCFA 4FWOA 5KPZA 3EL2A 3IFRA 3WT0A 4CBXA 5EOYA 1TUUA 2P9PA 4KBOA 2YJEA 3HBTA 4AM6A 2NZTA 3ULEB 4E1JA 3QFUA 3H1QA 2FSNA 3B8AX 1GLDG 3EKSA 3O8MA 4O8KA 3D2EA 4FOIA 1HKCA 1GLEG 3U9DA 3O1WA 5F2RA 3ENHA 2UYTA 3QBWA 3ZEUB 3WEEB 4H5VA 4A61A 3ID8A 4FWKA 4BRGA 2QXLA 4PL8A 3VENA 4BRHA 1C0FA 4FPBA 3AAQA 4H03B 3VOVA 3VPZA 2P9SA 1X3NA 3MN7A 4K41A 4FWLA 4I6MB 1DKGD 4M7XA 4B1UB 5JLHA 5KPRA 1BG3A 1Q18A 4A62A 2QWQA 3IMXA 2FSKA 4GNIA 1BDGA 4JD2B 5EY4A 3LM2A 3U4LA 5JICA 4H5RA 3TPQA 3VEXA 2E88A 2FF6A 1BA0A 2P9LA 3EKUA 4PL7A 3CI5A 1E4FT 2BTFA 1H1VA 1WOQA 3O08A 3CETA 4JAXA 1Y64A 5F0XA 3ZX3A 3GBTA 4MLHA 1K8KA 4PKHA 2EWSA 2ITMA 4CBWA 3OHRA 1QZ6A 4BQLA 4IO8A 4BRMA 1KAXA 1V4TA 3VF6A 5FPDA 3VF4A 3CHWA 2A40A 1HJOA 2VYPA 2D4WA 1LOTB 3ULEA 4K42A 4B9QA 4CD1A 2WUSA 3A5LC 4FPAA 2F9WA 2QW9A 3FLCO 4CZEA 1GLCG 4LC9B 2QWRA 3I8BA 2DPNA 3ZEUA 1NM1A 3WEEA 4BRDA 2Q1NA 4BRKA 4BRPA 5ADXH 4H5NA 1IJJA 1NGEA 5AR0A 5AQVA 2ZGZA 4EAHD 4RCHA 5TKYA 1ZXOA 2Q0UA 1S3XA 4I6MA 1BOTO 4YDUC 4B1ZA 1RFQA 1ATSA 4FWNA 5BPLA 3FZFA 3SMPA 4JD2A 3MK6A 3FZMA 3VGLA 4BC3A 5AQKA 3HSCA 3LL3A 3C7NB 3O6WA 3CJ7A 2GWKA 1YXQA 3A8YA 3MCPA 1MWMA 2I7PA 4RTFD 3M1FA 2A41A 2PAVA 3AAPA 3D2FB 1GLBG 1TYQB 1YVNA 3M3ZA 5AQZA 5AZJB 3VGMA 1SZ2A 2E8AA 1ZC6A 4L3QA 3UKUB 4FWQA 1QQOA 1HKBA 4BVOA 3VESA 4A2AA 2Q36A 1U6ZA 1ZBSA 3FR0A 4JN4A 4BC5A 5FPEA 5JMVA 4WQ5A 2P9KB 2AA4A 2GUPA 4F9OA 2V52B 2CGKA 1BO5O 4O5FA 2VWBA 4IXCA 5AFUA 3DJCA 3LDLA 5AQRA 1HPMA 4EHUA 3MN9A 2NLXA 4BRFA 2QWMA 3A5NC 3UB5A 5AQFA 1C0GA 5JLFA 4B1VA 1U2VB 2P9IB 4MLEA 3SK3A 3FGUA 4CD3A 4IJNA 1MWKA 5CE3A 4EHTA 3LDNA 5AQPA 4CZGA 1GLLO 2YCHA 2CGLA 5BRHA 1HX1A 3CERA 4BR7A 2A5XA 3AY9A 5B8HA 3RSEB 3ENOA 3QB0A 3O1BA 3H45C 1QHAA 4BR4A 5AQSA 4H0YB 5FPMA 4DB3A 3C7NA 4WQ4A 2QM1A 3L4IA 3H1VX 4WQ5C 4BRLA 4B1XB 3D2FA 1TYQA 4H0OA 3F9MA 5AZJA 4K25A 4CBUA 4CZJA 5AQMA 4PKIA 3UKUA 3W3DA 1NGJA 4YDUA 4BVPA 4HTLA 4CZMA 2HF3A 2YJFA 2QWPA 1KXPA 2P9KA 3C0BA 4H5WA 2CGJA 1KAYA 4QS8A 1HUXA 4BRIA 1ATNA 3VETA 1NGHA 3DXMB 1QQMA 1NWKA 2QWOA 4FWRA 2IIRA 1BUPA 4IJAA 3KZBA 1RDWX 3SMSA 4JHDB 3CIPA 4M7YA 2YHWA 1J6ZA 2W40A 1U2VA 3FZKA 4BQZA 2P9IA 2E2QA 3A0IX 1DEJA 3MMVA 4B1WB 5AQYA 5F1XA 3EN9A 1IG8A 3EO3A 1YAGA 3U9ZA 3VF2A 2IVPA 3QBXA 4H0XB 1NGFA 4RWTA 2FF3B 4BRAA 1KAZA 3M6GA 3UKRB 4NO7A 4BG8A 4DHYA 4WQ4C 2E2NA 2V7ZA 3RSEA 5AFUH 1ESVA 3CJAA 5LY3A 1T6DA 2A6AA 5AQIA 4XEIA 3CJ1A 5AQTA 3G25A 5AQJA 4BR5A 4CZIA 3FE1A 5ELZA 4B1YB 2YHXA 4BR9A 1NBWA 1NGAA 5AQQA 3H6EA 3I33A 4FWMA 4ISFA 4M63C 4Y0WA 3WXLA 5KQ8A 4BRQA 2ZWHA 1X9JA 3O4WA 4FOEA 1MDUB 2Q0RA 4XH1A 5BPNA 1SAZA 2IVNA 1RGIA 3A5OC 3GDQA 3U8XA 2YI1A 3R8EA 3VGKA 3LDOA 4A2BA 1XQSC 2QWLA 1SQKA 3L6QA 2H3GX 5AQXA 3WXIA 5LJVA 4DQ8A 3DXMA 3GG4A 3TU5A 2VCPA 2E20A 1DGKN 4DCHA 3LDPA 4XH4A 3DWLA 4JHDA 5BN9A 2CH5A 4IZ9A 3DAWA 2ASPA 4FL9A 2BUPA 5EX5A 1BA1A 2F9TA 1NGGA 4ISGA 2CH6A 3IUCA 4BGAA 3MDQA 3VERA 2V7YA 3HTVA 1T6CA 3MN5A 3W0LA 2P9NB 2Q97A 3GE1A 2HOEA 4Z94A 1QZ5A 1TUYA 1NLVA 5AQNA 3UKRA 5AQOA 3CQXA 1XC3A 3D7EO 4MO4A 3GL1A 3S41A 3ZX0A 3VEWA 2FXUA 4IWVA 2IVOA 3ZX2A 5FPNA 5ADXA 2J4RA 4C23A 3LM9A 2QWNA 5BPMA 1X3MA 4H0PA 3QICA 4J8FA 2I7NA 2P9UB 3SJHA 5E84A 1NGBA 2D0PA 1BU6O 1NGDA 3FZHA 3AARA 4HWIA 2OANA 1GLFO 1HLUA 2NRHA 2V51B 3LDQA 2PBDA 3KVGA 3CQYA 3H3NO 1QQNA 4BROA 3R6MA 1V4SA 2ZGYA 4BREA 4CZKA 1R59O 4FWPA 1BWFO 1P8ZA 4H0TB 4AM7A 4ISEA 5AQGA 2FSJA 4BC4A 4EFHA 3ZETB 2KHOA 4WYBA 2GWJA 5BRFA 4NB4A 2GEMA 3FFKB 5BR9A 3VEVA 5AQWA 2A42A 5BRDA 1YUWA 3A5MC 1GLJO 2P9NA 1OKJA 4CZLA 1NGCA 3BP8A 5AZIB 1Z05A 3R9PA 3H3OB 4FWSA 3QFPA 3WXJA 1NMDA 3BF3A 3JXUA 3MN6A 5E26A 4CZHA 3HM8A 3DXKB 4FSVA 5AQUA 3IDHA 1EQYA 2P9UA 2D1KA 1WUAA 4H5TA 1Z6RA 3CJ9A 3BEXA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3IG1A 4IG3A 1RDAA 2A1RA 3CF5L 3PX4A 3C65A 3HI0A 4PQUA 3M8QA 4CJFA 3ZLJA 1LW0A 2GELA 3K57A 5FROA 1HNWK 2FLOA 5BN8A 5CZ2A 3DRPA 3OYKA 1GLAG 3D2EB 2Q31A 4ICLA 3WUHA 4DV0K 3O3GA 1NJXA 1CZAN 3ATVA 2HBJA 3DLEA 1D5AA 4AHSA 4CI6A 4KHUA 4IFVA 1X9WA 1F21A 2JGUA 5FDLA 4K43A 1VSFA 4DQIA 3L2RA 2P9SB 1NK7A 2E4LA 2ZF5O 3THYB 5AQHA 2HNDA 2X78A 3UE5A 4CEZA 1T05A 1LCUA 2YHBA 3SUQA 3KHYA 2P9LB 1J5OA 1NMNA 3SV3A 2ZM6K 1VK0A 5DM7L 1UA1A 3WNGA 2KTQA 2ASOA 4JI6K 3V9WA 3OW2M 4OX9K 2EHGA 2Q2RA 5CY4A 3K9JA 1K8KB 3I8DA 4Z4GA 4UQGA 1JCFA 3AO1A 3EL2A 3WT0A 3TWHA 4Z4FA 1IH7A 4CBXA 2O4IA 1JLBA 3KLGA 3HPOA 4JKAA 1VQ9N 4KBOA 3L2VA 1UAXA 1NJZA 1HQEA 4AM6A 3LZIA 4BE0A 4ID5A 3H1QA 4DTPA 1GLDG 3JAMO 3D2EA 4HUGA 4DSKA 3U9DA 3O1WA 2X6NA 3CM5A 3ZEUB 1VQ4N 2BE2A 3LALA 3WEEB 3OS1A 4OGEA 4GKKK 1C0FA 3K5LA 2NNWA 2P9SA 4E7LA 3VTHA 4K41A 1TKXA 4B1UB 1NKBA 1Q18A 4A62A 4KHNA 4TSXA 4GNIA 3C6UA 1TKZA 5JICA 2E88A 1BA0A 2P9LA 3FFIA 4AHTA 4FLUA 2OA8A 4IEIA 1WOQA 3O08A 3PY8A 1BQNA 4C8LA 1VSKA 3MWPA 3GBTA 2HHTA 2O4GA 1K8KA 3DOKA 3SCXA 4PKHA 2ITMA 4CBWA 4K8XA 4FJNA 3D45A 1TKDA 3LP0A 4IO8A 5HRRA 1KAXA 1JLCA 1V4TA 4AHRA 1A5VA 4O8UA 2WC9A 4E7JA 1X9MA 2A40A 4KTWA 4B9QA 1KFDA 2NRVA 4JI2K 4CD1A 2O8DB 3A5LC 4QAGA 3RMDA 4JK8A 3ZEUA 2DPNA 1NM1A 3WEEA 4BRDA 2IOCA 3ISNC 1NGEA 5AQVA 3TSQA 3DLGA 4FK4A 1WSGA 4JYAK 5BPLA 3BY5A 3IRXA 2WOMA 1FK9A 1WAJA 4BC3A 4LF6K 3C7NB 3O6WA 3DRRA 4RTFD 1S1VA 1JL2A 3M1FA 1ILYA 2YNGA 3ZT1A 1L3TA 1WSFA 1KCFA 1TYQB 4B3RK 1VQNN 1K9MO 1WSHA 4BVOA 3VESA 5FPEA 2AA4A 1IV0A 2V52B 4M45A 5HLFA 2E6MA 2VWBA 4IXCA 5AFUA 5AQRA 4WFBL 2ZQBA 3MN9A 3LWMA 4BRFA 4DV6K 3JSMA 3UB5A 2O8DA 5JLFA 3TAPA 1TL1A 2P9IB 3SK3A 4KB1A 5CE3A 1N33K 4UY8O 2ZJQL 3KIOA 2XY6A 4CESA 1RBRA 2YCHA 2ETJA 1EX4A 1VSLA 4JS5A 2OPQA 3U3YA 1WSEA 4CJ4A 1IKVA 4Z0UA 1VSJA 3HOTA 1B92A 3ZT0A 3H45C 3SPZA 4H0YB 3SZ2A 3C7NA 1J53A 4WQ4A 1KVAA 2NRWA 3L4IA 4WQ5C 4BRLA 5GADP 1YTAA 2QKKA 1TYQA 2NUBA 3AO5A 4CEFA 5AQMA 1NGJA 4BVPA 3P5JA 3C0BA 3NFAA 2P1JA 1HUXA 3SBTA 2HHQA 3DXMB 3NAEA 1GOBA 3K5MA 4IKFA 5GIOA 1WSJA 3SBGA 4FWRA 4E19A 4DU1A 1J6ZA 3VTIA 2W40A 2O8BB 4BQZA 2P9IA 4C8KA 3ZCMA 3EN9A 4NYFA 4YHHK 3U9ZA 3KLFA 3QBXA 1NGFA 5HP1A 4FJJA 3MX5A 2G8UA 4BRAA 4J2BA 1KAZA 3M6GA 3UKRB 4NO7A 4BG8A 4DHYA 4DUZK 4CCHA 4DV2K 2ZJPL 1JKHA 4XEIA 1B9DA 5AQTA 1VQLN 3CPWM 2VQFK 1QVGM 4C8NA 3FE1A 5ELZA 3OYCA 5GAHP 4DKWA 3I33A 2OPSA 3KK3A 5KQ8A 4RW8A 4B9SA 3HO1A 2ZWHA 3VMFB 3HXMA 2YV0X 3SQ4A 3A5OC 1VQ6N 4JI3K 4FJKA 3SUNA 2F8TA 2OYQA 3WXIA 3CCLN 4DTMA 3EYZA 3DXMA 4YOWA 1OVYA 4PY5A 4CHQA 2YX6A 1U49A 3ULDA 4A57A 1TK0A 2ASPA 1TL3A 4CK3A 5EX5A 3WXMB 2O8BA 1NGGA 3KLIA 5M1QA 4FJMA 1DLOA 3OTOK 4FM2A 2G8KA 4B9TA 3MN5A 3P38A 3THWB 2Q97A 4DMNA 3GE1A 3HL8A 4ZTJA 4DS5A 4ID1A 1NLVA 5AQNA 1EKEA 3UKRA 3D7EO 4MO4A 1QSLA 1RNHA 3A2FA 5HROA 5I3UA 4JKHA 4J2DA 2IDOA 4FLWA 4C1NK 2GV9A 4CGIA 4DQSA 2P9UB 1ASVA 3EZ5A 1NGBA 2W00A 3AARA 4CEQA 4DF8A 1K73O 4CHOA 3TAGA 1HLUA 2NRHA 2NRTA 2V51B 2UUBK 4BROA 3K2PA 5SWMA 1RT2A 2ZGYA 3CC7N 4B9MA 2ZJRL 4CK1A 3C94A 1BWFO 3AVNA 4NCGA 4ISEA 4M3WA 2FSJA 4BC4A 4JRQA 1E3MA 3DM2A 4LH5A 4DV1K 4WYBA 5FRNA 2GWJA 3TAMA 1ZYQA 4NB4A 2B6AA 3AV9A 1W9HA 2ZD1A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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