3FFKB

Crystal structure of human gelsolin domains g1-g3 bound to actin
Total Genus 112
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
112
sequence length
366
structure length
365
Chain Sequence
DETTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Ca2+ binding by domain 2 plays a critical role in the activation and stabilization of gelsolin.
pubmed doi rcsb
molecule keywords plasma gelsolin
molecule tags Structural protein
source organism Homo sapiens
total genus 112
structure length 365
sequence length 366
chains with identical sequence E
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-12-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 3ffkB02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3ffkB01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3ffkB03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3ffkB04
1BA1A 5FPNA 3UE5A 1E4GT 3EL2A 3VENA 3ENHA 3FZKA 1MDUB 3VGLA 5AFUA 4BRAA 1QQOA 5AR0A 3ZETA 3MCPA 4FPAA 2V7ZA 4LC9B 2W40A 3WEEA 2E1ZA 4H5NA 4FPBA 4B1VA 5AZJB 3EKUA 2QXLA 3EN9A 4PKGA 2OANA 3FGUA 3H3NO 3EKSA 2KHOA 5AQNA 5KPZA 1QQNA 3J8AA 2VCPA 3QFPA 2E2OA 4CBWA 1HJOA 4QS7A 5AQLA 3SMPA 5AQKA 2A42A 4H5TA 3H6EA 4EHUA 4BG9A 3KZBA 2ZGZA 4JAXA 3GL1A 5FPDA 3W0LA 1BOTO 2NZTA 1YUWA 2QWPA 4CZFA 3UKUA 4WQ4A 2A41A 4BROA 5AQXA 2PAVA 3JS6A 4NB4A 2HOEA 2A3ZA 3GOIA 2YJFA 1NGIA 1WOQA 3A8YA 3HI0A 1BDGA 3HBTA 5AQRA 4FWRA 1JCFA 2P9PA 3IDHA 4FSVA 4BRMA 4BRLA 3IMXA 3U8XA 3WQTA 1GLCG 2CGKA 3WUHA 5AQQA 1ZXOA 1JCGA 4FWLA 3L6QA 1BU6O 3CI5A 4BRIA 3H45C 1SQKA 1BO5O 4H0TB 4XH5A 2V52B 4CD1A 1KXPA 1NGHA 3U9ZA 1T6CA 2F9WA 4MO4A 3FZLA 3TPQA 2GEMA 5AQOA 2GTDA 5AQHA 3KHYA 1QZ5A 2E2PA 3WQUA 3ZX0A 4BRCA 2YCHA 3P4IA 2F9TA 3ULEA 2E1YA 4Z94A 2AP1A 3R9PA 2QWLA 3MN9A 3L4IA 1WUAA 2P9IB 5BREA 2GWJA 3OHRA 4IWVA 4J8FA 4A2BA 4CZIA 4RCHA 2HMPA 2ASMA 4M7YA 2QWRA 4FO0A 3C7NA 2P9SA 5LJWA 2P9KA 2Q2RA 2VWBA 4CI6A 3QBWA 3AAQA 3VESA 3ATUA 4MLEA 4BGAA 2WUSA 4A2AA 1BWFO 5AZJA 1Q18A 4FL9A 3VEWA 2DPNA 4CZMA 3CQYA 3LDQA 4FWMA 1Y64A 1T6DA 5BPMA 3S41A 2FXUA 3KVGA 3VPZA 1QHAA 5BR9A 3FR0A 5I9EB 1K8KA 2FF3B 4H0YB 3TU5A 3RSEB 4RTFD 5CE3A 5F0XA 3BP8A 2YHYA 4C23A 4HTLA 5LY3A 3ZEUA 1NMDA 1SAZA 2IIRA 4BRNA 1HKGA 5FPEA 4B1UB 3ULEB 3SK3A 3A5NC 4CZKA 4YDUC 3VF4A 2Q97A 1DKGD 3AY9A 1G99A 1OKJA 2P9NA 3LDNA 1GLBG 4CBXA 2V7YA 4EHTA 4B1WB 1NGDA 5AQWA 3D2FA 3I8BA 3BF3A 5E84A 2QM1A 3C7NB 2P9SB 5AQTA 2P9KB 3UB5A 4PKIA 1HPMA 1MWMA 1ATNA 3QBXA 3MMVA 1ZC6A 2BTFA 2ASOA 3WXKA 4BRDA 3JXUA 1V4TA 5LJVA 5F2RA 4IJNA 4BC2A 4XEIA 3H3OB 1S22A 4H03B 4QS8A 3LL3A 2YHWA 2YI1A 3VERA 1K8KB 1XQSC 5BRHA 1HKBA 2E2NA 5E26A 4A62A 3BEXA 2CGJA 3MDQA 2P9IA 2UYTA 3MN7A 3U4LA 3WT0A 4ISGA 5EOYA 2YHXA 1GLFO 3ZEUB 1LCUA 2FF6A 4EAHD 3CIPA 2FSNA 3FZFA 3VEXA 1BA0A 3M6GA 5EX5A 2QWMA 5KPTA 2I7PA 3EO3A 5AQIA 4IZ9A 4HWIA 4K41A 3CERA 3O80A 4BREA 1RDWX 2P9NB 5AQMA 3QFUA 3HSCA 3VEZA 2HF3A 2W41A 1U6ZA 3D2FB 4H0VB 3GE1A 4WQ5C 3ATVA 3WXIA 1NGCA 3H1QA 4XH4A 4JHDB 5BRDA 1GLDG 3RSEA 1Z05A 2VYPA 1ATSA 1D4XA 2QWQA 2ZGYA 2FSJA 5ELZA 4MO5A 3DXKA 4NO7A 3SJHA 4CZGA 3VEOA 2HF4A 5EXWA 3O4WA 4KBOA 3FLCO 4B9QA 3ZX3A 4F9OA 4FOIA 2CH6A 2EWSA 2IVOA 1ZBSA 1E4FT 3HZ6A 1SZ2A 3LDPA 2ASPA 4BC5A 5BPLA 3U9DA 3FE1A 5BPNA 2NRHA 3VEYA 3CJ1A 4BC3A 5ADXH 4QS9A 5KQDA 5AQSA 3GG4A 4FOEA 4DB3A 3IFRA 4BC4A 3UKRB 5BN8A 3MK6A 4BVPA 3EZWA 4M63C 4BRQA 3O1BA 1KAXA 5TKYA 4JN4A 3A5LC 4IJAA 2CH5A 1CZAN 4IO8A 1DEJA 1NGGA 2ITMA 4BR7A 3L0QA 4O5FA 2Q1NA 3VF6A 3DXKB 4H0XB 1C0GA 3IUCA 3QB0A 3AARA 2V51B 3GDQA 4JD2B 1NBWA 5JICA 3HTVA 4BR5A 2E20A 1P8ZA 4E1JA 4FWOA 2Q36A 1ATRA 4H5RA 4JNEA 3O1WA 4FWQA 5AQJA 4BR4A 1KAYA 3WXJA 5B8HA 2FLOA 4BR0A 1GLEG 5JLFA 3CJBA 4ISEA 5AFUH 2J4RA 3CHWA 5JMVA 3DAWA 3FZHA 4JHDA 1XC3A 4WYBA 1NGEA 3CJ7A 2Q0RA 4BR9A 1U2VA 4BRKA 4WQ5A 3VGKA 2AA4A 1GLLO 1X9JA 4ISFA 3LM2A 4DQ8A 3SLCA 1HUXA 4I6MB 4BR2A 4PKHA 2BUPA 3O5BA 3LDOA 3D7EO 1YVNA 5FPMA 4BRPA 1TUUA 3H1VX 3CJAA 4MLHA 4K43A 4B1YB 3QDKA 3O8MA 4BG8A 1IJJA 1J6ZA 2A40A 2P9LA 3CJCA 2D0PA 2Q31A 2H3GX 5AZIB 4BRGA 3DXMA 2I7NA 3FFKB 2PBDA 3UKRA 1NGJA 2QWOA 3F9MA 3LDLA 4AM6A 3MN6A 1HX1A 4XH1A 3AAPA 1MA9B 4H0OA 5KPRA 1C0FA 4BQLA 3FZMA 1TYQA 3G25A 3W3DA 3ID8A 4EIAA 4RWTA 1MWKA 4FWPA 4H0PA 2D0OA 1NGFA 5KQ8A 5AQPA 2GUPA 2NLXA 4BQZA 3BF1A 5AQGA 2P9UB 1U2VB 4B1ZA 4A61A 1LOTB 5AQYA 3DJCA 1KAZA 4JD2A 4PL8A 4BRHA 1HLUA 3VEVA 3VF2A 1V4SA 4Y0WA 2A6AA 1NWKA 5AQZA 1XUPO 4EFHA 2GWKA 3A5OC 4DCHA 2ZF5O 1RGIA 3VETA 3ZETB 1X3MA 3M1FA 3O08A 1Z6RA 5BN9A 4PL7A 3LM9A 3D2EA 4L3QA 3WXLA 3WEEB 4CZHA 4FWKA 5BRFA 4CJ7A 2ZWHA 1T44A 3C0BA 1EQYA 1TUYA 2YJEA 3GBTA 2P9LB 1RFQA 4YDUA 2QWNA 2FSKA 1DGKN 4IXCA 3H46O 5AQFA 3B8AX 3DXMB 3I33A 3CETA 5AQUA 3ZX2A 1NGAA 2E8AA 3M3ZA 5AQVA 4WQ4C 1YXQA 3VGMA 3SMSA 4FWSA 1TYQB 4CZJA 2CGLA 5EVZA 5EY4A 2IVNA 5ADXA 3DWLA 4I6MA 4FWNA 2D1KA 3HM8A 4B1XB 3UKUB 3QICA 2E88A 1NGBA 1S3XA 1ESVA 1BG3A 4BGBA 3R8EA 3CJ9A 1GLJO 5JLHA 3CQXA 1H1VA 2P9PB 4BVOA 3O6WA 2E2QA 4GY2B 4O8KA 3R6MA 3BUZB 2IVPA 1R59O 5AZIA 3MN5A 4K25A 4K42A 4CD3A 4CZLA 4BRFA 2A5XA 3A0IX 2GELA 1QZ6A 1QQMA 1JCEA 1HKCA 3D2EB 4GNIA 4DHYA 1GLAG 4H5VA 4H5WA 3QMLA 1NM1A 3VOVA 4CZEA 1NLVA 4AM7A 2Q0UA 1IG8A 3ENOA 2P9UA 1X3NA 1BUPA 2QW9A 3A5MC 1YAGA 4CBUA 2D4WA 5F1XA 4M7XA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4DLEA 3NGZA 1E4GT 3NF9A 3ENHA 3QNOA 3J80O 4F2RA 3ZETA 4LC9B 4NLCA 3QO9A 2E1ZA 1S1TA 4DF8A 1NG9A 3LZIA 4PKGA 4CW7B 2VGNA 1FJGK 2NRZA 3RR7A 1RDCA 1T03A 2E2OA 3NFAA 2JWKA 3HJFA 2DY4A 2A42A 2F96A 2YNIA 3KZBA 4B3OA 2ZJRL 2ZGZA 3VQ5A 3M8RA 3GL1A 1U45A 3D0PA 5FPDA 4LF4K 2NZTA 3UKUA 2ZM6K 4E1NA 5AQXA 3UIQA 3JS6A 1MU2A 4DTRA 2YJFA 3CM6A 3A8YA 1BDGA 5JVHL 3IMXA 1GLCG 4OX9K 1X9SA 1ZXOA 4FWLA 4CEZA 4GVMA 3CI5A 4BRIA 4CJ3A 3H45C 1XNQK 4ELVA 4LSLA 4H0TB 4DQIA 1KXPA 3QEPA 1NGHA 2O4GA 4M3TA 3M8SA 2HHUA 1T6CA 2F9WA 3QEVA 1YF5L 5AQOA 4FLTA 3KHYA 4H4MA 3AVGA 3WQUA 2WONA 4R5PA 3KK3A 2EHGA 1QSYA 2AP1A 1Z26A 4IOAL 1ZBFA 3L4IA 1JJ2M 1WUAA 4Q0BA 3OHRA 2VWJA 4BACA 3DRSA 4H4OA 2ASMA 1RTHA 3SUQA 4CJ5A 1BI4B 2VQFK 3VESA 4FJKA 1J5OA 1BWFO 3DRRA 4HCCA 5AZJA 1Q18A 1YHQN 5HL7L 4AH9A 3VEWA 2DPNA 1C0MA 1WSIA 5BR8K 4KV8A 4JV5K 2QK9A 2D0CA 3VN5A 3QESA 4H0YB 2ATQA 5FRMA 1W0HA 1HR0K 4RTFD 4B9UA 3CCEN 2OPRA 2IDOA 1RDDA 2DFHA 2O8CA 3ZEUA 4JI4K 1EXQA 1JL1A 4GMJB 3DLEA 1Q7YO 4YDUC 3OYIA 4AHVA 3AY9A 4KO0A 3LDNA 4AHCA 1GLBG 4OGEA 3G10A 3ZSXA 1EETA 1K6YA 1D9FA 3SBTA 4M3WA 3M5RA 3ZSOA 5CYMA 5AQTA 3G71N 1QTMA 2XY7A 4DTSA 2HHTA 2HHWA 3LP0A 1JXBA 5FDLA 3U6FA 3VQDA 4CIEA 3MWPA 2RPIA 5LJVA 2G8KA 1ILYA 1NKEA 4H03B 3VQBA 1OVYA 1CXUA 5BRHA 3QIOA 4E7JA 1HKBA 4FJ8A 4A62A 3TWHA 2XHBA 1NK4A 1JLBA 1XHXA 1L3TA 2YHXA 4X66K 4WE1A 1LCUA 1TKZA 4CEDA 4OGCA 1BA0A 1WAFA 5KPTA 4LF5K 4CFAA 3ENBA 4HWIA 2D0AA 4QOZB 4Y1DA 3HSCA 1M90O 2HF3A 4JK8A 1W2BM 3RRGA 3GE1A 4WQ5C 3RTVA 3ATVA 4XIUA 3WXIA 1NGCA 1NU0A 1JLFA 3E9LA 1Z05A 1S1XA 1D4XA 2QWQA 4GW6A 4DV1K 3AA2A 3O3GA 1VSIA 2HF4A 3SZ2A 1U48A 4CF9A 3CG7A 3ZX3A 4AF1A 4WFBL 4DR4K 3HVRA 1RT1A 4FJ7A 3CCUN 3TABA 5BPLA 3U9DA 1DTTA 3NGIA 4NYNA 3TTFA 3SCXA 4M3YA 1KLMA 3AVBA 3CFPA 2P1JA 3CCMN 2IGIA 1KC8O 1TK8A 4OLBA 1UOCA 1Q82O 4DB3A 3LP2A 4L8RB 4N56A 3TANA 3FFIA 5HRSA 5BN8A 3MK6A 3V4IA 4BVPA 4F3OA 1Y97A 4M63C 5TKYA 4JN4A 4EP4A 4O5BA 2VG7A 4IO8A 1QHTA 4DV5K 3L0QA 5C2DA 1CZ9A 1B9FA 1J54A 3LWMA 4K8ZA 4YOWA 2G8IA 1VSDA 1XNRK 3TTDA 3M8QA 3OYBA 3AARA 4JD2B 3GDQA 1N36K 1NBWA 5JICA 3HTVA 4BR5A 1KCFA 4W5RA 4FWOA 3CC7N 3SQ1A 4IFEA 5GAEP 3AA3A 2KZZA 3O1WA 5AJ3K 1VSKA 2ZD1A 3T1YK 5AQJA 4BR4A 3HRGA 4LF7K 4AHUA 2P5GA 4JKEA 1GOCA 1HPZA 5JLFA 4DSLA 4LFAK 3R1XA 4I2PA 3F5TA 4JRQA 4BE1A 3DAWA 4JHDA 3ZCMA 4DV0K 3HXMA 2Q0RA 5HOOA 4BRKA 3QINA 3CCSN 3VGKA 4FYDA 1RT6A 2X78A 1GLLO 5LMNK 1X9JA 3DLKA 1HNXK 1HUXA 3HYFA 5M1PA 4DFPA 4DSFA 3V9XA 4MDAA 2F7TA 3MX5A 4BG8A 4JI5K 1LV5A 5C0YA 1IJJA 2A40A 3KLHA 4OLAA 4XJXA 1KLNA 2H3GX 2IAJA 3SQ0A 4CJTA 2AJQA 2O8FA 3UKRA 2QWOA 1HX1A 2HBLA 1MA9B 2XO7A 2E6MA 5C42A 1J9AA 1C0FA 4BQLA 1TYQA 4IEIA 3ID8A 2FC0A 4EIAA 2UXDK 1MWKA 2WFBA 4H0PA 5C24A 3AA4A 5AQPA 1HMVA 1FXXA 2GUPA 3T7ZA 2P9UB 1YJ9N 1U2VB 1NJWA 1HNZK 3OBWA 1OH5A 2JWLA 4DV7K 3C6AA 4CK2A 4CEBA 1HLUA 3KJVA 1REVA 4DV3K 4RW6A 5HRRA 4KI4A 2ZF5O 1RGIA 3I55N 1XMOK 3M1FA 3SAFA 2DTUA 1QQCA 1Z6RA 3O08A 4PL7A 3AO2A 2HHSA 4L3QA 4C8MA 3WEEB 3WXLA 2WTUA 3MECA 1TKTA 2OYQA 1EQYA 2NNWA 4JKFA 4YDUA 4DKWA 2FSKA 1EX4A 3VQPA 3H46O 5AQFA 3DXMB 4CIGA 3I33A 2UU9K 4DWIA 5AQUA 4FVUA 3CFOA 4ILJA 4AHSA 2OA8A 1SL2A 2E8AA 2X6SA 3VGMA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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