3HBTA

The structure of native g-actin
Total Genus 113
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
113
sequence length
371
structure length
359
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Contractile protein
publication title The structure of native G-actin
pubmed doi rcsb
molecule keywords Actin
total genus 113
structure length 359
sequence length 371
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-05-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3hbtA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3hbtA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3hbtA03
1DEJA 4HTLA 3ZEUB 3O08A 4QS7A 5AZIA 4MLEA 1NM1A 4K43A 4JD2B 3D2EB 3B8AX 4H03B 3SJHA 3U4LA 1QZ6A 5FPMA 1U2VB 3UKUA 3A5OC 5ADXH 3VEYA 3HBTA 3VGLA 1HX1A 1ESVA 2YJFA 3HZ6A 4GY2B 4LC9B 4B1WB 1E4GT 1MWMA 5EOYA 3FFKB 5KQ8A 3L6QA 3MK6A 4FWQA 2AA4A 2D0PA 3I8BA 3LL3A 1GLFO 5KQDA 4BRDA 5KPZA 2P9SA 5TKYA 5AQMA 5JMVA 3VETA 5BN9A 2QM1A 3ZX3A 4XH4A 2YHXA 5LY3A 5AQNA 1BDGA 3C7NA 3R9PA 3VF6A 4IWVA 3DXKB 4H0YB 3IUCA 5EY4A 3BUZB 1BWFO 3VESA 5AQFA 3DAWA 4H5NA 3O4WA 4CJ7A 4DHYA 1C0FA 3L4IA 2P9NA 4BROA 3I33A 1GLBG 2P9PA 3AARA 5JICA 2A42A 1K8KB 1CZAN 4FWOA 2I7PA 1NGIA 3DXMA 5AQZA 1QQMA 2FF3B 1BOTO 2V7ZA 3R8EA 3HSCA 4H0XB 1V4TA 2E2OA 4F9OA 1IG8A 1GLCG 1T6DA 3ZETB 3O1BA 4O8KA 4B1ZA 4FPAA 3JS6A 4FOEA 4CBXA 4FSVA 5AQWA 4BR7A 1YUWA 3BF3A 4H0VB 5AQYA 2FSKA 4RCHA 4E1JA 3ATUA 2ASOA 3WT0A 4BC3A 5AQJA 2CH6A 3GBTA 5BN8A 2QWOA 3ENOA 3QB0A 4MO4A 5AQLA 3U9ZA 1C0GA 3ZEUA 3BP8A 4I6MB 3RSEB 2IIRA 2QWRA 1GLEG 1NGHA 4A2BA 1GLJO 3LM9A 4JD2A 2BUPA 5JLHA 1HLUA 4B1YB 3DJCA 1BG3A 1U2VA 3ID8A 1TYQA 3AAQA 1NGCA 4CZKA 2OANA 3EL2A 3U9DA 2NLXA 2P9NB 1S3XA 1GLDG 4A2AA 4BR5A 4PL7A 5FPNA 4MLHA 3AY9A 1QZ5A 4H5RA 4KBOA 5BR9A 3KHYA 4AM7A 5AQGA 5AQRA 2ZGZA 2HF4A 1NGEA 3H46O 3MDQA 4BC2A 1G99A 3W0LA 1RDWX 4BR0A 4EHUA 2ASPA 1X3NA 3VOVA 4JN4A 3WEEA 4PKIA 2QWQA 3WQTA 3FZMA 1ATSA 4FO0A 1RGIA 1XQSC 3KZBA 3CJBA 3LDNA 4WYBA 2EWSA 3FGUA 3MN6A 5AQSA 5BPMA 2A41A 3AAPA 4J8FA 1K8KA 3ULEA 4B1UB 3O1WA 3VEXA 1QHAA 3D2FB 2PBDA 4IZ9A 5AQPA 2GEMA 3H45C 4QS9A 3WUHA 3QICA 1TUYA 2W41A 4XH1A 1BU6O 2UYTA 3ZETA 1TYQB 2VCPA 3UKRB 4BC4A 3TPQA 4BRKA 2Q36A 3CJAA 5AQXA 3LDLA 1BO5O 4BGAA 4B9QA 1NWKA 4WQ5C 4CZGA 4FL9A 5AR0A 2QWPA 4PKHA 5AQVA 4BR4A 2ZWHA 4PL8A 5AQUA 4WQ5A 3VF4A 3BEXA 1MA9B 3IDHA 2H3GX 3A5LC 1GLAG 4EIAA 4I6MA 4ISGA 5FPEA 3RSEA 4NO7A 3O8MA 2YCHA 2ASMA 1J6ZA 1KAXA 3D7EO 4IJAA 1R59O 3MMVA 3WEEB 4Y0WA 2AP1A 4B1XB 1X3MA 1Z05A 1NGAA 4JAXA 1ZC6A 2FXUA 4RWTA 3CJCA 3CIPA 2Q2RA 4RTFD 3UB5A 1DGKN 3C0BA 3O5BA 3ULEB 4BQZA 3HI0A 3QBWA 2A5XA 2CH5A 4FWPA 2FF6A 3FZLA 3LDPA 1HJOA 4BRAA 4FWKA 4FWMA 2KHOA 1NGFA 3S41A 3VEZA 5AQOA 5F1XA 4CZJA 2GTDA 4A62A 2V51B 2QW9A 4CZIA 1GLLO 4CZHA 4CZEA 3SMSA 2BTFA 4M63C 1HKBA 1JCFA 5E26A 1Y64A 5AQQA 4CZFA 1EQYA 1HPMA 1NGBA 3VEVA 4PKGA 3HTVA 2GWJA 3MN7A 4Z94A 1LCUA 1NMDA 3QDKA 3CQYA 4CD1A 5F0XA 2YJEA 3D2FA 4BVPA 1NGJA 3G25A 5ELZA 4H0OA 1NGDA 1V4SA 4NB4A 1HKCA 2CGJA 4JHDB 2FSNA 3UKRA 4DQ8A 4BVOA 3H3NO 2YI1A 4BR2A 5FPDA 3MN9A 5AFUA 1KXPA 2E2QA 3CETA 3SK3A 1JCGA 1MDUB 1S22A 1SZ2A 2ITMA 2YHYA 3MCPA 2FSJA 2D1KA 2W40A 3FZKA 3H1VX 3VF2A 2P9KB 2DPNA 3GG4A 4BG9A 1XUPO 3CQXA 1OKJA 4YDUC 5AZJA 4FWSA 4FOIA 4H0PA 2QWNA 1Z6RA 3EO3A 2QXLA 4M7YA 4YDUA 3LM2A 3EN9A 4BRNA 4EAHD 4K25A 2E88A 3R6MA 1T6CA 3ATVA 3VEWA 1H1VA 2E20A 4QS8A 1ZBSA 2P9IB 1NBWA 4IXCA 4BRCA 5KPTA 1YVNA 3GDQA 2Q1NA 1YXQA 4IO8A 1KAZA 3GE1A 3QBXA 3ZX2A 2P9LB 3H1QA 1YAGA 3O80A 2GELA 2D0OA 1X9JA 2WUSA 3CERA 4CBUA 2V7YA 4ISEA 3EKUA 4BRPA 5F2RA 1BA0A 5AQTA 1QQOA 3J8AA 1ZXOA 2A3ZA 2A40A 3VENA 3ZX0A 3LDOA 4H0TB 3BF1A 3FZFA 2HMPA 3CHWA 1WOQA 4XEIA 3WXIA 3QMLA 2QWMA 2GUPA 5LJWA 3CJ9A 2HF3A 5EX5A 5AZJB 3M6GA 5AQIA 1QQNA 3CI5A 3EKSA 3KVGA 3A5MC 2QWLA 2PAVA 3M1FA 3VGMA 3L0QA 4BRIA 4BRHA 2Q31A 4IJNA 2IVPA 4BREA 4JHDA 2FLOA 4M7XA 4L3QA 4DB3A 1XC3A 2F9WA 1NGGA 4BRGA 2P9UB 3FZHA 1RFQA 4WQ4C 5ADXA 1NLVA 5BPLA 2P9KA 3DWLA 3QFPA 3WXJA 1WUAA 4WQ4A 5BRFA 4HWIA 1ATNA 3TU5A 3ENHA 2Q97A 4H5TA 1U6ZA 4ISFA 2Q0RA 3OHRA 1DKGD 1BA1A 2HOEA 2E2NA 2P9IA 3VGKA 4BC5A 3HM8A 5AZIB 2E1YA 2J4RA 2YHWA 4DCHA 5AFUH 3P4IA 3WXLA 2A6AA 1KAYA 3UKUB 2IVOA 2P9LA 1P8ZA 2CGLA 5AQHA 2D4WA 3FE1A 4CZMA 4K42A 2VWBA 4O5FA 3WQUA 4FPBA 4BG8A 2GWKA 5BRHA 3CJ7A 3SLCA 3LDQA 4JNEA 3UE5A 3GOIA 3QFUA 3IFRA 5EVZA 3U8XA 2P9SB 1LOTB 2ZGYA 4H5VA 5E84A 4CZLA 1Q18A 1JCEA 3EZWA 3W3DA 3M3ZA 1IJJA 4K41A 3D2EA 1SAZA 3C7NB 2E2PA 5BPNA 1BUPA 4H5WA 4EFHA 4CD3A 2NRHA 3A8YA 2I7NA 3A5NC 2NZTA 5B8HA 4BRQA 3F9MA 2IVNA 2V52B 3IMXA 4C23A 1ATRA 1D4XA 4BRFA 2F9TA 2P9PB 4XH5A 4B1VA 5EXWA 1E4FT 4FWRA 4BGBA 5JLFA 5LJVA 2VYPA 1HKGA 5BREA 3DXMB 4BQLA 2P9UA 2CGKA 5CE3A 4FWLA 5KPRA 4MO5A 4CBWA 5BRDA 4A61A 3A0IX 3CJ1A 1TUUA 1HUXA 4CI6A 3DXKA 2ZF5O 4BRLA 5AQKA 3FLCO 3JXUA 3MN5A 3VPZA 5I9EB 4GNIA 1T44A 4BR9A 4FWNA 3SMPA 1MWKA 2E1ZA 1SQKA 3VERA 3WXKA 2Q0UA 2E8AA 3GL1A 3O6WA 3VEOA 4BRMA 3H3OB 3H6EA 4EHTA 4AM6A 3FR0A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1KRPA 4EZ6A 1UWBA 4QS7A 1NM1A 3LAMA 4BACA 1D9FA 4L8RB 3T1YK 4GV6A 3V4IA 3HPOA 2VG7A 1QZ6A 1U2VB 3UKUA 4K0KK 1IKYA 3A5OC 4LY7A 4IBNA 1HX1A 3MWTA 1U4BA 3TANA 4CGIA 4FWQA 1RT1A 3AA4A 3LL3A 3F2KA 4FLXA 1NJIO 4XH4A 1HNVA 3MEEA 4FZYA 3C7NA 3R9PA 3VF6A 1W2BM 5FRMA 4A5AA 2HNZA 2YKNA 3VESA 1Y97A 4ELTA 3DRSA 2P9NA 2NRRA 3I33A 4KTZA 2P9PA 1JLFA 4JV5K 5JICA 3SZ2A 2HHIA 4KB0A 3OYGA 3NCIA 3TSUA 5I42A 3DXMA 5AQZA 4OLBA 2FF3B 4CJ5A 3CPEA 4CERA 4QAGA 1KCFA 3PY8A 2KZMA 1GLCG 5GAHP 3O1BA 3ZYYX 4Z4GA 3JS6A 2D0BA 3SUOA 4H0VB 1L3UA 5FDLA 1JLBA 5C2FA 4EP4A 2O8BA 1W7AA 4Z4FA 1YVUA 3K2PA 2QWOA 3ENOA 3I8DA 2Z1IA 1L3TA 4I6MB 3RSEB 2IIRA 1NGHA 4A2BA 2EHGA 3LM9A 3TAMA 3LP3A 1U2VA 3D6RA 1IH7A 3ID8A 1TYQA 5FROA 3EL2A 1X1PA 1SL1A 4CHNA 2YKMA 1GLDG 4FW1A 2G8WA 3P1GA 3L3UA 1N8RO 1YI2N 3PX6A 1TV6A 3J81O 4JKCA 2OPSA 3PSIA 4B9VA 3KK3A 4IKFA 4ZHRA 4CHPA 3R1XA 2VQEK 3KLGA 3MDQA 3W0LA 2ASPA 3RR7A 4Z4IA 4OKJA 5GINA 3WQTA 3MECA 4HTUA 5HROA 1ATSA 3PX0A 4GVMA 3SAGA 3SUPA 1RGIA 1XQSC 4ELVA 1S9GA 4GV9A 1VQKN 4Z0UA 1DLOA 4ILJA 4DUYK 4E7IA 2IGIA 3AAPA 1NOZA 4CEBA 3ULEA 1YJNN 1K8AO 1KD1O 3NF9A 4IZ9A 1L5UA 2BH1A 1TUYA 2W41A 4XH1A 4DLGA 2ZM6K 3M8SA 3RMCA 3UKRB 1W9HA 3HPHA 4BC4A 3TPQA 1C6VA 1D5AA 4FL9A 1S1VA 1NKEA 4PL8A 5AQUA 4Q5VA 3MXMA 3VF4A 4FJ9A 3A5LC 1GLAG 4I6MA 4J2EA 3RSEA 4E3SA 4NO7A 5M1PA 2YCHA 3S9HA 4IOAL 1KAXA 5C25A 3HP9A 1RNHA 4IJAA 3MMVA 4BY9C 1EETA 1R0AA 1NGAA 2RF2A 4B3TK 4IDKA 3U3YA 5K14A 3E66A 4YOUA 2PZSA 3UB5A 1YTAA 3O5BA 2DFFA 3THWA 3AA3A 3HI0A 4FWPA 4FJKA 2VGNA 4KHUA 2WTUA 3SUQA 4FJXA 4F3TA 2NRVA 1A5XA 1HQEA 1VSMA 1NGFA 5JS2A 5DMRA 4CEEA 3NGYA 1IKXA 4C8OA 4KO0A 1F21A 4CZJA 1VSFA 1T05A 4DSJA 1TVRA 2V51B 1YIJN 1WSFA 2QW9A 4CZIA 2DY4A 4CZEA 4M63C 4LF5K 3LDSA 3KTQA 1Y64A 1SV5A 5AQQA 4AHUA 2GWJA 2UXDK 2F4VK 3OA9A 1NMDA 3QDKA 1SL0A 3CQYA 2Y1IA 4DR7K 4DSEA 5J2NA 1S6QA 4I2PA 4BVPA 4R79A 4DFMA 3G25A 2O8EA 4H0OA 3AVNA 3E9PA 1HYZA 1QHTA 3UKRA 4CK1A 4BVOA 4KI6A 5FPDA 4FJLA 2Z1HA 3V1RA 1MDUB 3IRXA 4KHYA 2YHYA 2E4LA 3OYCA 1O1WA 3CMEN 2D1KA 3H1VX 3VQCA 3OY9A 4FJJA 1JLEA 3GG4A 1XUPO 3LPUA 3P39A 3Q7CA 1OKJA 4LFCK 3G6EN 4FWSA 2QWNA 4JI2K 4W5NA 3EN9A 4FJNA 1N36K 4EAHD 3R6MA 1L3SA 4CHZA 1C0MA 4O0JA 4B9UA 1J9AA 2ZJPL 4DTPA 5KPTA 1YVNA 2Q1NA 3RMAA 3QBXA 3V9XA 3L2RA 2D0AA 3VQPA 4CJ3A 1RCHA 2GELA 4FZZA 2D0OA 3TSQA 3OS2A 3CERA 4CBUA 2A1RA 5A2QO 3MEGA 3ULDA 5LMUK 1XHZA 2O4GA 4OPJA 2GUIA 3U6FA 4ICLA 2OA8A 2PY5A 4YOXA 1QQOA 3VENA 4CJRA 4DQQA 3AO1A 3LDOA 4BECA 2OTLN 3BF1A 3FZFA 1YHQN 4PUOA 4G1QA 3S3MA 2DFEA 2KLAA 4JRPA 1CZBA 4DV0K 2JLEA 2QWMA 5GIPA 2HSTA 3IG1A 1VQPN 1RDDA 3PUFA 3IKMA 3M6GA 5AQIA 4FLTA 1NK0A 3A5MC 2QWLA 3M1FA 1LWCA 1S1TA 4BRIA 4BRHA 3CC4N 2IVPA 4WFAL 2FLOA 5C0YA 4M7XA 4IOCL 2YNGA 4L3QA 4LF9K 4JKGB 4CW7B 4CJUA 2F9WA 4DU4A 4NCAA 4CF9A 4WQ4C 4KI4A 3VTHA 4LSLA 5ADXA 1RT6A 3MXJA 3LALA 3DWLA 1D9DA 4KH6A 4ZTFA 1NU0A 2ITGA 4WQ4A 5BRFA 3T1HK 3VTIA 1ATNA 4DSKA 3B6PA 2Q97A 1IV0A 2QA4N 3C95A 4CF8A 1S5JA 4ISFA 1FXXA 1RT3A 2Q0RA 4FVUA 3DI6A 3NHGA 2E1YA 2J4RA 4RG8A 3KIOA 2BGGA 3P4IA 1TAUA 2A6AA 3CG7A 5M1NA 1RBVA 4YORA 2IVOA 1P8ZA 2CGLA 1NK6A 3UIQA 2D4WA 3S3OA 2QI2A 4M3YA 4HCCA 5BRHA 3CPWM 2KZZA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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