3M6GA

Crystal structure of actin in complex with lobophorolide
Total Genus 125
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
125
sequence length
366
structure length
353
Chain Sequence
TALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Structural protein
publication title Two molecules of lobophorolide cooperate to stabilize an actin dimer using both their "ring" and "tail" region.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
total genus 125
structure length 353
sequence length 366
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-03-15
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3m6gA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3m6gA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3m6gA03
2E20A 3ATUA 3EKSA 2P9UA 4BRAA 4BR0A 1TUUA 4JNEA 4M7XA 4BC4A 3CQYA 5FPMA 4CZEA 3KZBA 4FOIA 3J8AA 1LCUA 3U9DA 2FF3B 4QS8A 4CZGA 3EKUA 4BRCA 1ZC6A 4I6MA 5AQRA 3CHWA 1NGBA 5AQQA 4BQZA 5AQUA 3UB5A 2P9PB 3HBTA 5ADXA 1Q18A 3AAQA 5AQLA 3SMPA 4DB3A 4XEIA 4B1YB 5BPLA 4BRDA 5CE3A 3U8XA 3CERA 1ATRA 2FXUA 5TKYA 1HJOA 5B8HA 3QMLA 1QZ5A 3SLCA 3R9PA 2D1KA 3VOVA 4BVPA 1DKGD 1HLUA 1QZ6A 3IUCA 1K8KB 1NBWA 3CJCA 3FZKA 5AR0A 2HF3A 2PAVA 1U2VA 2VYPA 2GWKA 1RGIA 3D2FB 3ZEUA 4BRIA 4O8KA 2YCHA 2YJFA 3GBTA 5AQGA 2GUPA 2Q31A 3DXKA 1BA0A 4H0PA 5BRDA 3MCPA 2GWJA 3ZX2A 3WQUA 5F1XA 1WUAA 3LL3A 1X9JA 3VERA 3LM2A 3C7NA 3DXMB 2CGJA 4YDUA 4A2BA 5AQXA 4M63C 3H3OB 1BO5O 2DPNA 5AQKA 4Z94A 4B1UB 1NGDA 3O8MA 2ZGYA 4BRHA 3VEOA 5AQJA 3KHYA 3EL2A 4H5WA 3VENA 1S22A 2P9LB 1ZXOA 5BREA 2HMPA 4FWOA 4CJ7A 4CBUA 1BG3A 2FF6A 3GL1A 3DWLA 4FOEA 4GNIA 2P9UB 3A5MC 2P9IA 4BR5A 3MN9A 4EIAA 5BN8A 3MK6A 4WQ5A 3O1WA 4PKGA 5AQIA 3MDQA 2AA4A 2E2QA 3BF3A 2E2PA 2QWLA 3CQXA 1XC3A 4JD2A 4EHTA 3A5LC 3AARA 4DCHA 3FR0A 4XH4A 2HF4A 3A8YA 3ENHA 4MLHA 1GLLO 5AQNA 1GLJO 2GELA 1Z6RA 2P9KB 3UKUB 4BRQA 1OKJA 3QFPA 3HSCA 4BR9A 2D4WA 3VF2A 5LY3A 2VCPA 5AQOA 1E4FT 4K43A 2IVNA 3WT0A 4H0OA 3BF1A 2V7YA 4DQ8A 2ASOA 2IIRA 4FWRA 4MO4A 3U9ZA 1U2VB 4NO7A 2QWQA 4A62A 1HKCA 3RSEA 2A5XA 1BOTO 2D0PA 4NB4A 4WQ4A 2ASPA 4AM6A 1U6ZA 3CJ9A 3GE1A 1RFQA 1NGJA 1H1VA 3LDPA 4FO0A 2Q97A 5AZJB 4C23A 1QQMA 3CJAA 3ULEA 3MN6A 3ID8A 5BRFA 2AP1A 3I33A 3M1FA 1NGHA 2QXLA 1X3MA 3UKRA 4CZLA 2FSNA 3QDKA 3BP8A 5F2RA 4M7YA 2GTDA 3H1QA 4BR4A 1YVNA 5JLFA 2CGKA 3FFKB 3VGLA 1E4GT 2EWSA 4EHUA 1NGCA 3CJ7A 4JHDA 2KHOA 4CD3A 4H5NA 4A61A 2A6AA 5KPTA 5ELZA 3WQTA 3MN7A 3H3NO 3ZX0A 3HM8A 2A41A 4H0YB 5F0XA 2W40A 3GOIA 2WUSA 3FLCO 3LDQA 3QBXA 5KPRA 4FWNA 4BRPA 3H46O 1JCGA 3JXUA 3VEZA 1QHAA 4QS9A 4PL7A 3CI5A 1J6ZA 4J8FA 4BG8A 1YAGA 2NRHA 4B9QA 2UYTA 4FWMA 1IG8A 4PL8A 3QB0A 5AZIB 3GG4A 5EVZA 1GLCG 4FWPA 4ISGA 2FSKA 3B8AX 1SAZA 1BA1A 3L6QA 2I7NA 1X3NA 4CBWA 4DHYA 5FPEA 5AQYA 4BC2A 5AQFA 2P9NA 4IZ9A 3D2EA 3U4LA 1QQOA 5KPZA 3O08A 4CI6A 2A3ZA 1R59O 2F9TA 5KQDA 4AM7A 1TYQA 2Q0RA 3IFRA 4KBOA 5BN9A 3O4WA 3TU5A 3ZETA 2FLOA 4CZIA 3WXLA 3SJHA 3WEEA 3MN5A 4BGBA 1ZBSA 2ZF5O 2E8AA 3A5OC 1NM1A 3O1BA 4FSVA 3I8BA 5AQMA 4BRMA 3WUHA 3GDQA 4JN4A 3EN9A 3UKRB 1HKBA 3HI0A 4I6MB 4EFHA 2QM1A 1SZ2A 2P9PA 2YHYA 3HZ6A 1NWKA 4K41A 3LM9A 5FPNA 1RDWX 2YJEA 3FE1A 2YHXA 5AQSA 1TUYA 2BTFA 2QWOA 3H45C 2QWRA 4FWSA 5AQPA 3WXKA 1SQKA 2Q0UA 5AQZA 4H03B 1Y64A 1K8KA 3O80A 4BC5A 1BUPA 3MMVA 1MDUB 3VEWA 3D2FA 3C0BA 3VPZA 4EAHD 2Q2RA 3VEYA 3ZEUB 1HPMA 3DXKB 1GLAG 2NLXA 3G25A 1JCEA 3M6GA 3SMSA 2V52B 1C0GA 3OHRA 1GLEG 4CZJA 3CJ1A 2D0OA 4BR2A 4L3QA 4PKIA 3DXMA 4IO8A 1KAZA 4ISEA 3C7NB 4H5TA 5E26A 2YI1A 1WOQA 5LJVA 1CZAN 1V4TA 1P8ZA 5EY4A 3W0LA 3VEXA 1G99A 3QICA 4H0VB 3DAWA 3L0QA 1NGFA 4K42A 3JS6A 2F9WA 1KAXA 4CD1A 2E2OA 2P9LA 3WXJA 2ZGZA 3EO3A 2HOEA 4FWKA 4IJNA 4H0TB 3VGKA 3QFUA 3WEEB 1MWKA 4B1VA 4B1XB 3FZLA 3H1VX 2ITMA 3CETA 4HWIA 2P9IB 4BRGA 1NGGA 4E1JA 2IVOA 5BPMA 4FPBA 4WQ5C 2BUPA 4XH5A 3W3DA 4BG9A 2A42A 4BRKA 4MLEA 1C0FA 4JAXA 4CZKA 1NMDA 2QWPA 2QWMA 3QBWA 5ADXH 5AFUH 4B1WB 4JD2B 1BWFO 4BREA 5AFUA 5E84A 1ESVA 1ATNA 4CZMA 4BRLA 2P9KA 3UKUA 3A5NC 5BPNA 1NGEA 3VEVA 4H5RA 3VGMA 5LJWA 3F9MA 4XH1A 3O5BA 2NZTA 2V7ZA 1LOTB 5JMVA 2E1YA 1Z05A 2Q1NA 4K25A 2GEMA 1D4XA 3D7EO 4FWQA 2YHWA 4ISFA 4BGAA 2FSJA 1GLBG 2P9SA 2IVPA 4RCHA 3L4IA 1EQYA 3LDLA 3CIPA 5AQWA 4QS7A 5EX5A 3RSEB 2CH6A 4IWVA 1KXPA 4WQ4C 1YUWA 1ATSA 5BRHA 4FPAA 3VF4A 4FL9A 4BRNA 3CJBA 3R6MA 2PBDA 1GLFO 1V4SA 4BC3A 1NLVA 3BUZB 3ZX3A 5FPDA 5AZJA 2E88A 3VF6A 5AQTA 3VETA 3ENOA 2ASMA 3ULEB 1BDGA 3TPQA 2E1ZA 4PKHA 5AQVA 3EZWA 4GY2B 1DEJA 1NGIA 3UE5A 1HKGA 3HTVA 4BR7A 2CGLA 2J4RA 1XUPO 1DGKN 1MWMA 4MO5A 5BR9A 1YXQA 5EOYA 4CZHA 4BVOA 1KAYA 5EXWA 3BEXA 4JHDB 2A40A 4IXCA 5KQ8A 3AY9A 1HUXA 3VESA 1T44A 4BRFA 3IMXA 1T6CA 4RTFD 2Q36A 2QW9A 3DJCA 4H5VA 1QQNA 2V51B 1MA9B 4CZFA 1JCFA 3M3ZA 4LC9B 4F9OA 4BQLA 2CH5A 2W41A 2OANA 3SK3A 3KVGA 3FZHA 4BROA 5AZIA 4A2AA 5I9EB 4Y0WA 4CBXA 1S3XA 4B1ZA 1T6DA 5JICA 1XQSC 3FZFA 2QWNA 1GLDG 4HTLA 4IJAA 1NGAA 2E2NA 3ATVA 2P9NB 2I7PA 3LDNA 4YDUC 4O5FA 3D2EB 3R8EA 3S41A 4H0XB 1BU6O 3A0IX 2P9SB 4WYBA 1HX1A 4RWTA 3H6EA 2VWBA 1TYQB 3AAPA 3FZMA 4FWLA 3ZETB 5AQHA 3P4IA 5JLHA 3WXIA 2H3GX 3O6WA 2ZWHA 3LDOA 1IJJA 3FGUA 3IDHA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2KZMA 3ATUA 5E41A 4WE1A 4BRAA 1G15A 3CC2N 4JNEA 3J7ZO 1HYSA 1LCUA 1EWQA 2FF3B 4QS8A 4DV5K 1SL2A 1D9FA 2VG6A 4FZYA 3PX0A 2O4GA 5ADXA 1Q18A 5M1OA 2D0CA 5HL7L 1ITGA 3TAPA 1EWRA 4G9ZA 2O8DB 1ATRA 3CC7N 1QQCA 1HJOA 4CEFA 1RCHA 5EU7A 3VOVA 2YNGA 4ELUA 1HLUA 1QZ6A 1B9FA 2E6MA 1NKBA 3IUCA 3CQ8A 1K8KB 1U2VA 3R3LA 2VYPA 2C1IA 1RT1A 1Y97A 2GWKA 3D2FB 4O8KA 1KRPA 3G4SN 3TTCA 2GUPA 3DXKA 4C8NA 2NRRA 4WCEL 2F8SA 4F4KA 3ZX2A 4DLGA 1NJYA 4CK3A 2PZSA 1WUAA 4M3RA 1VRUA 3C6HA 4CEOA 1ZBUA 3ZT1A 2HHSA 1U45A 4JS5A 4YORA 4HCBA 4YDUA 1HNIA 4FZZA 4DR2K 4B9SA 5AQKA 4Z94A 1N6QA 1KVAA 3MEDA 3DOLA 4KHPK 4CJWA 1ZXOA 3VQDA 4DQQA 4CJ7A 4CBUA 4FJMA 1JLQA 2FF6A 3GL1A 1RBSA 4DTRA 3VTHA 3SQ2A 1JXBA 3MDQA 2AA4A 2E2QA 4E7KA 4JK8A 3NGIA 2E2PA 3CF5L 1XNQK 1JLAA 4DCHA 3ISNC 4B3MK 3FR0A 4XH4A 4NXNK 2HF4A 1YIJN 1OVQA 4J2BA 1VAZA 1GLJO 3S3MA 3PLAA 2D4WA 5LY3A 3KWGA 2HHQA 4DQRA 3HYFA 5I3UA 4Z4GA 3DLBA 2IIRA 3QERA 3ZCMA 3U9ZA 2UXDK 2QWQA 1JXEA 4M3YA 1LWFA 3K0SA 3OBYA 5DM6L 3K5MA 4AM6A 4YY3K 3P39A 1KFSA 3ASMA 4FCYA 3CJAA 3OYEA 1RDUA 3RMCA 5FROA 4CFCA 1YI2N 4FJKA 4JV5K 2ZD1A 4JRPA 1NNEA 2AP1A 3WNGA 3PX6A 1S72N 1ZBFA 1Q7YO 2QXLA 5IWAK 2NRWA 1DT9A 4B3OA 1BIZA 5F2RA 1TKTA 2CGKA 4O0JA 1IKXA 3FFKB 5KRSA 2EWSA 3SCXA 1VSDA 1NGCA 4ZTFA 4Z4IA 2UUAK 2O4IA 3G6EN 4FLVA 4DTMA 5F0XA 2W40A 3GOIA 3LDQA 5CHIA 2KTQA 2YHBA 4Y1DA 1YT3A 4KB0A 3QNOA 2Y1IA 1O1WA 5C12A 3CG7A 1E3MA 2W00A 3OW2M 1IG8A 1W0HA 4PL8A 4DR3K 4YOYA 1OH5A 4CBWA 3OY9A 4FW1A 4BC2A 4G1QA 1ASVA 2P9NA 4DSEA 5LMNK 3D2EA 4DKWA 3U4LA 1L3SA 1RT5A 1HMVA 1YJWN 2HBKA 2A3ZA 3E9LA 4CCHA 3E9PA 3SQ1A 1TYQA 2Q0RA 4KBOA 3ZETA 4E1MA 3CM6A 2FLOA 4CZIA 1IH7A 3LWMA 1S6QA 2ZF5O 1NM1A 1RBVA 2X6SA 4CHOA 1VQPN 1T3VA 3PIOL 3SYZA 3P31A 3V1RA 4A57A 1JLGA 4F8RA 2XY5A 4KH6A 4DV2K 1VSEA 3CMAN 3GDQA 4JN4A 3EN9A 1C0TA 4IO9L 4EFHA 4E3SA 2P9PA 5IT9O 1NWKA 1VQ6N 3VQBA 1JLBA 1VQON 2YJEA 2WC9A 3EY1A 1TUYA 2QWOA 2IGIA 1BCMA 3P83D 5M1FA 4WF9L 3DRPA 4KTZA 1Q86O 3V4IA 1JJ2M 3CCLN 3OYJA 1WSJA 1S9EA 4N5SA 3SAFA 3QEWA 4BC5A 1MDUB 3V1QA 3C0BA 4I9LA 3JAMO 3G25A 3SMSA 2V52B 1U4BA 3EYZA 3A2FA 3EEQA 4L3QA 3ZSRA 3DXMA 4H5TA 4CHQA 3OS2A 2VGMA 4CJFA 3V9SA 1P8ZA 5EY4A 1G99A 3KLFA 3LP3A 1T7PA 3DLKA 1U49A 1NGFA 4K42A 3JS6A 1VSLA 2HHHK 4OVLA 2HHWA 1ZBIA 5KRTA 3O9UA 4IJNA 1VSIA 3WEEB 4B1VA 1KQSM 4DSKA 3C95A 4CGIA 4Z4EA 2OZSA 3CETA 4E1JA 2P9IB 1KVBA 4FJNA 2IVOA 4B9UA 2EX3A 1OH6A 4FVUA 1KLNA 2BUPA 4CJPA 3CCSN 3W3DA 4BG9A 3CYGA 4JAXA 2HHXA 5AFUH 4B1WB 3TWHA 4LF9K 4JRQA 4B8CA 4OPAA 4CESA 1BHLA 3VQQA 4CZMA 4BRLA 3UKUA 4FW2A 4B8AB 3A5NC 5BPNA 5JVGL 2G8FA 3QNNA 1TKXA 4DR1K 3O5BA 4M3XA 4E89A 1HRHA 1VQ4N 4K25A 3DOKA 4DUZK 3V9XA 3VQEA 2YHWA 5HRNA 2O8BA 3K5OA 4CJEA 4BACA 4DSJA 3O4QA 3PV8A 4KHSA 4DTXA 4LFBK 3L4IA 4QS7A 1SKSA 4IWVA 2FBXA 3DRRA 4WQ4C 1YUWA 5C10A 3THVA 4OLAA 4FPAA 1V4SA 1LV5A 1VHXA 5FPDA 5AZJA 2KFNA 1C1CA 4AHVA 2E1ZA 5CZ1A 2E4LA 4GY2B 4F3TA 1DEJA 3T19A 4UY8O 4OPJA 3K59A 2UXBK 1NGIA 4M3TA 1HQUA 1WBDA 1HKGA 3VN5A 4BR7A 2W42A 3TAQA 4CERA 2J4RA 3DI6A 3H08A 4CK1A 4CECA 5EXWA 2GBZA 3DM2A 2A40A 3B6OA 1C0UA 4LH5A 3AY9A 2BGGA 4JKGB 1IBLK 3MX5A 4YFUA 1T6CA 2QW9A 2NRXA 2WBNA 5J2PA 1RTHA 5CYMA 3TARA 2C1GA 1N32K 4KHUA 4F9OA 4BQLA 4YOXA 4HUGA 2W41A 4U7BA 4E7HA 1QSYA 4BROA 3ZSQA 2UU9K 1WN7A 3CCVN 4JKAA 4DLEA 3NF8A 5CZ2A 4CJQA 4NLBA 4BY9C 4MQ3A 1VQ8N 4J2EA 4BWMA 2E2NA 3ATVA 3LDNA 4YDUC 3K9JA 3RWUA 1BU6O 3LP1A 1VQKN 4WYBA 3D0PA 2P5OA 3N4QA 2VWBA 5GADP 1EO1A 2FC0A 3P4IA 3WXIA 5SZTA 1HNWK 2H3GX 2ZWHA 3LDOA 5KI6A 3VQ5A 4YOUA 3ENBA 3IDHA 4JI4K 2P9UA 3PUFA 4RW9A 4M7XA 4JS4A 1N8RO 3JSMA 5FPMA 1S6PA 4CZEA 1SKWA 3KZBA 4FOIA 3THYB 2OPPA 4M3WA 1WAJA 1WBBA 4BRCA 1ZC6A 3MX2A 3G71N 4DSLA 4LF5K 3CHWA 1J5OA 2OCEA 1WAFA 4JKEA 5H1SQ 3UB5A 2P1JA 2NRZA 5AQLA 3HO1A 3SMPA 2YNIA 3JYTA 4Z4FA 2G8IA 4XIUA 1JL2A 3E1YA 5TKYA 3CCEN 1J53A 3OYMA 3AA3A 1RBTA 1ZBLA 1LW0A 1WNSA 3CC4N 2HHTA 5AR0A 2PAVA 1RGIA 4DR5K 4QOZB 3ZEUA 4BRIA 1F21A 3J7YP 2YJFA 3GBTA 1RTDA 3UIQA 3SQ0A 4FVMA 1D5AA 3KJVA 5F1XA 2NRVA 2F8TA 1X9JA 3LM2A 1BGXT 3OYKA 1C6VA 4YHHK 5HRSA 1FK9A 3OTOK 3QIPA 2UUBK 1XHXA 2B4JA 5JS1A 3RR8A 1NGDA 3VQ9A 1RBUA 5M1QA 2HW3A 3KHYA 4F3OA 1ASWA 4X65K 1S22A 2P9LB 2PFUA 3OYCA 3TSQA 2GUIA 5BREA 4W5RA 2WONA 1IG9A 4FWOA 2KW4A 3AVKA 1QS4A 1YTAA 3MN9A 4EIAA 5BN8A 1Q9YA 4J2AA 4DTNA 5M1NA 1WLJA 3WNEA 3KLGA 2QWLA 2B6AA 1S1XA 4LFAK 3AARA 2KFZA 4MLHA 4C1NI 1GLLO 1Z6RA 2P9KB 1OKJA 4NXMK 1KD1O 3CD6N 4BR9A 4CHNA 3OVNA 5J2NA 4CGGA 5AQOA 2O8CB 4BEBA 3DYAA 3PY8A 3HM9A 4H0OA 4DSIA 1WB9A 3P1GA 2ASOA 2F4VK 4FWRA 1U2VB 3KKRA 2Z1GA 4LF4K 2A1SA 2OPRA 4NO7A 4JYAK 1NOZA 2RHKA 4JEPA 3RSEA 3LALA 3TR8A 2A5XA 3LAKA 1Q9XA 4WQ4A 4M3UA 2ASPA 3CJ9A 5GINA 3T1AA 1KTQA 3LDSA 2ZJPL 1J5EK 1QQMA 3ITHA 4E19A 3ID8A 4FJLA 3RMDA 2HHUA 3ZSVA 3OYFA 2VG5A 1X3MA 5J2QA 4CZLA 3BP8A 5C42A 1N5YA 1NJWA 3L2WA 2RKIA 1YVNA 1XHZA 3PO4A 1VQMN 4C8LA 4IFEA 4EHUA 1RBRA 2YNHA 3CJ7A 3EE8A 3KD5E 1NJXA 4A61A 5ELZA 3MN7A 3HM8A 3OA9A 1Q8IA 1K6YA 2A41A 3OYAA 2W6KA 3QBXA 2WUSA 1LAWA 1BI4B 4DU3A 3KLEA 4RW8A 3TTFA 3VEZA 4QS9A 4PL7A 3OJSA 3M8QA 4BG8A 1YAGA 2NRHA 4CJLA 2ITGA 3QB0A 3HXMA 5JVHL 3T3FA 4FWPA 4CEBA 3F2KA 4F2RA 1SAZA 3KD1E 2I7NA 1X3NA 3HPHA 4DFMA 3F73A 3E01A 4FJ7A 4IOXA 1ZYQA 3MAQA 1REVA 3CCMN 2G8WA 5KPZA 3DMJA 3O08A 4B9MA 4CI6A 1DTQA 3OYIA 1XWLA 2R7YA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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