3MN6A

Structures of actin-bound wh2 domains of spire and the implication for filament nucleation
Total Genus 120
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
120
sequence length
371
structure length
360
Chain Sequence
VAALVVDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVSHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTEEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELKDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMEACGIHETTYNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Contractile protein/protein binding
source organism Drosophila melanogaster
publication title Structures of actin-bound Wiskott-Aldrich syndrome protein homology 2 (WH2) domains of Spire and the implication for filament nucleation.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Actin-5C
total genus 120
structure length 360
sequence length 371
chains with identical sequence F, K
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-04-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3mn6A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3mn6A02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3mn6A03
1GLEG 5EXWA 3A5LC 2CGLA 4BRGA 3MN6A 2BTFA 1Z6RA 3CHWA 5AQZA 3L4IA 3R6MA 4A2BA 5BR9A 3AARA 3H1VX 3VF4A 4PKHA 4A62A 2V52B 4H5WA 1NGDA 1JCEA 2NZTA 3IDHA 3QMLA 1NLVA 4PL8A 3QBWA 1NMDA 2YHYA 3ATVA 4FO0A 1HX1A 3BUZB 5AQSA 2YHWA 1SZ2A 5EOYA 3MCPA 5LJVA 3VGLA 3KHYA 5JLHA 3CI5A 2BUPA 3VEWA 4BRLA 3FZMA 4MLHA 3AAQA 5KQDA 5KPZA 3A8YA 4FWNA 1G99A 4O8KA 3HTVA 5KPRA 4F9OA 2FLOA 3EZWA 3B8AX 2GEMA 1GLLO 3H1QA 5AQGA 3W3DA 3O4WA 1XC3A 5EY4A 2YHXA 2QXLA 3DAWA 3UKUB 1GLDG 4BC3A 4BC4A 3UKUA 5FPNA 3MN7A 2W40A 2A6AA 4WQ5A 2E1YA 1JCGA 4CBUA 5AQJA 5LY3A 5AQNA 2F9TA 1QHAA 2F9WA 2J4RA 1H1VA 1WOQA 3KVGA 1SAZA 1X3NA 1BWFO 1ATNA 4HTLA 1NBWA 2E2NA 2KHOA 3SK3A 4XH1A 4BG9A 3M1FA 1V4TA 2DPNA 4BRPA 1OKJA 4BR9A 4KBOA 3HBTA 5LJWA 3MN9A 3O80A 3S41A 3MMVA 1KAZA 5AZIB 5BPLA 1J6ZA 5AZIA 1ZC6A 4EAHD 4ISEA 4CD1A 5FPMA 4BGAA 3HSCA 3HM8A 2FSNA 5AQMA 4CZKA 1HLUA 5KQ8A 4B9QA 2FXUA 2P9NB 2ZGZA 2QWLA 2P9NA 4CBWA 1NGGA 4BQLA 3FLCO 4PL7A 1HKGA 2E1ZA 3QICA 3LM2A 4BVOA 4HWIA 4YDUA 1GLBG 2QWQA 3J8AA 1DEJA 5FPEA 2D1KA 3FZKA 5AQIA 3O1WA 4H5TA 2VYPA 4K41A 2GWJA 3JS6A 4JN4A 3W0LA 3RSEB 4EFHA 3RSEA 1MDUB 2IVPA 1Z05A 4FWQA 3R8EA 4MO4A 3OHRA 3ID8A 4IZ9A 4DHYA 4CZGA 4BRNA 1BOTO 1NWKA 4BRKA 2ZWHA 1E4FT 1MWMA 2E8AA 2P9LB 2P9SB 5BPNA 2P9SA 4H5VA 4BRAA 4CZJA 3U8XA 3ULEB 3CJ9A 2FF3B 3ULEA 2ZGYA 3HZ6A 4BQZA 5ELZA 5AQWA 4WQ4C 1NGJA 2P9PB 3QB0A 5AQQA 3L0QA 4FPAA 4NB4A 2P9PA 4H0TB 1S3XA 1NGBA 1ZBSA 4H0XB 3WQUA 1TYQB 3QBXA 2QWRA 1TYQA 3LDLA 4XEIA 3EKUA 5FPDA 3A0IX 3G25A 4ISGA 1BUPA 5AQLA 4AM7A 1BDGA 3R9PA 4IXCA 1C0FA 4K42A 2CGJA 2Q36A 4LC9B 4FL9A 2IIRA 4FSVA 3GL1A 3VERA 1DKGD 5B8HA 1QQNA 3L6QA 3VEVA 5KPTA 2I7PA 4BC2A 3WUHA 1K8KB 4NO7A 1K8KA 4XH4A 3D7EO 4RTFD 1C0GA 3VEZA 4H0PA 3BP8A 4FWRA 3WXKA 3BF3A 4BRDA 2NRHA 3VOVA 1D4XA 4FOEA 2ZF5O 4FWSA 3FE1A 4BRQA 3WXJA 2QWNA 3EKSA 3CQYA 1U6ZA 5AQOA 4GY2B 4B1ZA 4EHUA 3CERA 3LDNA 2E2QA 3BEXA 2P9KB 2FSJA 4MLEA 2CH6A 1GLCG 4QS7A 5AZJB 1QZ6A 3SMSA 5AQYA 4L3QA 1V4SA 5AQHA 4B1XB 1RGIA 1R59O 4O5FA 3UE5A 3H45C 1BA1A 3M3ZA 2AP1A 4CZFA 1LCUA 3ENOA 3O5BA 5BN8A 2ASOA 2Q97A 4FWLA 3H46O 4WYBA 2QWMA 3EL2A 3GG4A 1RFQA 5BRDA 2QW9A 5AQPA 2UYTA 4K25A 4FWOA 2E2PA 2QM1A 3D2EB 3DJCA 3FZFA 3D2EA 1QQMA 2A42A 3FFKB 3FZLA 3GBTA 2Q0RA 3VF2A 1NM1A 2YCHA 4DCHA 2AA4A 2CGKA 3DXMB 4ISFA 3DXMA 4IJAA 5F1XA 1GLFO 4H03B 5CE3A 5JLFA 2D0OA 1U2VB 2E88A 5AQFA 1U2VA 1T6DA 3I33A 3SLCA 2HF4A 4J8FA 3WEEB 2V7YA 3MDQA 1CZAN 3H6EA 3UKRB 3WEEA 4FWKA 5AQTA 3UKRA 4JD2B 3WXLA 3ZETB 2H3GX 4JD2A 3QFPA 3CJ1A 3M6GA 3IMXA 3FGUA 1TUUA 3I8BA 1SQKA 3VETA 2YJFA 3VGKA 4WQ5C 1T6CA 3ZX0A 4BGBA 3CJCA 2D0PA 2Q1NA 3O1BA 2P9LA 3O8MA 3MN5A 3MK6A 4H0YB 4BRIA 4C23A 2IVOA 4IO8A 3LM9A 5BPMA 3U9DA 2PAVA 4JHDB 1BO5O 3VGMA 3LL3A 3EN9A 3A5NC 3BF1A 2VCPA 1YVNA 1E4GT 1ATSA 2V51B 3SJHA 4CBXA 2GWKA 4H5RA 3VEOA 1S22A 1HPMA 2P9UB 4B1YB 1GLJO 2P9UA 4FPBA 4BR0A 2I7NA 3O08A 4GNIA 1HKCA 3LDPA 3DXKB 3DXKA 5AR0A 3O6WA 3A5OC 3U4LA 1NGEA 2CH5A 1T44A 5AQVA 3F9MA 2VWBA 2FSKA 1BA0A 1LOTB 2IVNA 4M7XA 2HF3A 4MO5A 4QS8A 4BR5A 2V7ZA 4BR4A 3VF6A 4DQ8A 4DB3A 3GE1A 1JCFA 3ENHA 3CJ7A 1YAGA 4PKIA 1KXPA 3JXUA 3SMPA 4B1WB 4JNEA 1KAXA 3CJBA 3U9ZA 4BC5A 4H0OA 4JAXA 4YDUC 2E2OA 4RCHA 2NLXA 4BR2A 4AM6A 4Y0WA 4B1VA 4PKGA 3FZHA 2EWSA 1NGCA 2GTDA 3CQXA 5AQRA 1TUYA 4E1JA 5JICA 4EIAA 2A5XA 2A40A 1DGKN 4BVPA 4FWPA 1EQYA 5AQKA 4BR7A 2YJEA 3D2FB 3IFRA 3D2FA 4CZHA 1NGHA 2P9KA 5I9EB 5E84A 5AZJA 3WXIA 3TU5A 2W41A 4BRMA 3IUCA 1QZ5A 3FR0A 1NGIA 3DWLA 1ESVA 3WQTA 1NGAA 4BG8A 1ZXOA 4CZEA 2ASMA 3GOIA 4Z94A 5AFUH 1BG3A 2HOEA 1BU6O 5F2RA 4CD3A 3GDQA 2Q2RA 5AFUA 5BRFA 5BN9A 2D4WA 4BRHA 5BREA 2OANA 3H3NO 5E26A 1RDWX 2ITMA 4BRCA 1QQOA 2PBDA 4M7YA 5JMVA 4BROA 2GELA 2WUSA 4WQ4A 5ADXH 4I6MB 3EO3A 1XUPO 4K43A 4I6MA 1YXQA 2QWPA 4CI6A 5ADXA 2Q0UA 2GUPA 1P8ZA 3LDQA 3VPZA 3LDOA 1MWKA 3H3OB 3P4IA 4BREA 3VEXA 1HJOA 3C0BA 1MA9B 3AAPA 1IG8A 4EHTA 4IWVA 1YUWA 3TPQA 3UB5A 1WUAA 4CJ7A 4XH5A 3ZETA 3A5MC 3HI0A 3ZEUB 4CZMA 1Q18A 1X3MA 4H5NA 3ZEUA 4QS9A 3ZX2A 2QWOA 5BRHA 4RWTA 3VENA 4A2AA 4FOIA 3ATUA 5AQXA 2HMPA 3KZBA 2E20A 3CETA 5EX5A 1ATRA 1XQSC 5F0XA 5EVZA 2YI1A 1HKBA 3VESA 4CZLA 1X9JA 3AY9A 1IJJA 1HUXA 3VEYA 4JHDA 3QFUA 1NGFA 2A3ZA 2ASPA 4IJNA 4M63C 2FF6A 4CZIA 3CIPA 4BRFA 4A61A 1Y64A 2A41A 2Q31A 3WT0A 2P9IB 4FWMA 5TKYA 3ZX3A 2P9IA 4H0VB 3QDKA 1GLAG 1KAYA 3CJAA 4B1UB 3C7NB 5AQUA 3C7NA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5EXWA 3A5LC 3ASMA 3K57A 4PHTX 4BRGA 3MN6A 2BTFA 4DWIA 5C2FA 1LWEA 3L4IA 3R6MA 4A2BA 4IFYA 3AARA 1SUQA 3H1VX 4A62A 3AO3A 4H5WA 4ILHA 1NK8A 3QNNA 3AVBA 1NLVA 5GAHP 4O8UA 2YHYA 2G8UA 1HX1A 3BUZB 4JKGA 1C1CA 4J2BA 5EOYA 3MCPA 4LY7A 3VGLA 5T7BA 5I42A 4BE1A 1JL1A 2HBLA 3S5TA 3VEWA 1DT9A 1WAJA 3BGRA 1G99A 1T3VA 2QXFA 4JI7K 2IC3A 4JKAA 2RF2A 4OLBA 1RDBA 2FLOA 5K14A 5FLXO 2C1IA 3QEXA 1XC3A 5EY4A 3V9SA 1BCMA 1GLDG 4LSNA 2WOMA 3WNHA 5FPNA 1S5JA 1J9AA 3MWPA 2E1YA 4Y1CA 1NK7A 1JCGA 4RG8A 4CBUA 1WBBA 4CJVA 1FKOA 5LY3A 3NVMA 5AQNA 1YJWN 2F9WA 1H1VA 3L2VA 3TTFA 1X3NA 4QOZB 1BWFO 3O9RA 1NBWA 4E7KA 2KHOA 4BG9A 5JVHL 3MAQA 1UA1A 4B3RK 1V4TA 4BRPA 3ZT2A 4BR9A 4KBOA 4CESA 1A5WA 3CCVN 5LJWA 4JS5A 2E5LK 4DMNA 5AZIB 2Z1JA 3KK3A 4FJXA 1BGXT 4WFAL 4AH9A 3AVCA 1ZBIA 3HM8A 1VQLN 3P5JA 1NK0A 2DFFA 3HOSA 2FXUA 2O8BB 4DTNA 3CC4N 1QS4A 4CIFA 4JKHA 1RNHA 4KFBA 3RMAA 4B9TA 4EZ9A 1WSJA 2B5JA 4BVOA 4FJ7A 5FPEA 3KLGA 5AQIA 2VYPA 4FK4A 1QHTA 4PQUA 2OPPA 2IVPA 4FWQA 1CZBA 4MO4A 4DHYA 5CYMA 4DTXA 3CM5A 3EEQA 3V9XA 1MWMA 2P9SB 3K5MA 4NLBA 5M1NA 4YOUA 4UQGA 3KKSA 3DYAA 1QSSA 1JL2A 3L3VA 1KSPA 3HVTA 4DG1A 1TVRA 4CF2A 5C12A 1RBTA 1XNQK 3K5NA 5AQQA 2HHQA 4H0TB 1KFSA 1ZBSA 4H0XB 2YNFA 3L8BA 3OY9A 1KRPA 3WNGA 1RBSA 5M1KA 4DFPA 4XEIA 4CJLA 3EKUA 2FBYA 4ZTJA 3AA2A 4A5BA 4ISGA 4YOXA 2QKBA 3C95A 1ZBFA 4CFDA 4FZZA 3AVIA 5CHIA 2Q36A 1M90O 1C1BA 4W5OA 4M3ZA 1DKGD 3L6QA 3NVKA 3L2UA 3O3HA 3G6EN 2DFHA 3OYDA 1ZBUA 4B3OA 3V1RA 1C0GA 3IG1A 4HCCA 3LP0A 4DFMA 4H0PA 3BF3A 1M1KO 4OLAA 3SAHA 3FE1A 4IOAL 3WXJA 2QWNA 2YV0X 1K9MO 4GY2B 4EHUA 5DMRA 4FLYA 4OX9K 3CCEN 5CR4A 4BEBA 4CHYA 2P9KB 3NFAA 4MLEA 5M1QA 4QS7A 5AZJB 2G8HA 4FJHA 2ZD1A 1V4SA 3O9SA 3QEVA 1R59O 4FJ5A 2JGUA 3UE5A 2G8WA 1BA1A 4DV5K 2F8SA 1LCUA 1NMNA 1BQNA 4OPJA 1IKWA 4KHNA 1IKVA 4ELVA 3EL2A 1RFQA 1KTQA 5AQPA 5J2PA 2OPQA 3VTHA 1OH5A 1C1AA 3JAMO 3ZYYX 4K25A 4FWOA 1YTUA 2NRXA 4BE7B 1RDAA 3HYFA 2A42A 3ZT0A 4GV6A 4E7JA 3QEWA 1NM1A 3NGIA 2YCHA 1W2BM 4ELTA 4EZ6A 1IBLK 4KHSA 4IJAA 5F1XA 2VQFK 3CXCM 2QEXN 4CVNE 2E88A 4DQRA 4CJTA 3TAGA 1KQSM 3SQ2A 4ELUA 3CCUN 4JD2B 4R5PA 1D5AA 1RBRA 1YJ9N 5KI6A 1OH8A 2HHIA 4CFCA 3VTIA 4R79A 1SQKA 2YJFA 3VGKA 1TKZA 4BGBA 3G71N 3CJCA 4CK3A 4KH5A 3OBYA 1ZYQA 1JLBA 3O1BA 4YFUA 1VRTA 3OVNA 3LPTA 3U9DA 4WE1A 2PAVA 1ZBHA 3QNOA 4Z4IA 3A5NC 4C8LA 1YVNA 2ITGA 4CBXA 1Q86O 1RT4A 3OYLA 2ATQA 4JRQA 4JEPA 2P9UB 1XMQK 4L8RB 1GLJO 4JK7A 1KC8O 4BR0A 4GNIA 3O08A 4DR3K 3ZSOA 3CG7A 4CE9A 3O6WA 1NGEA 2CH5A 3DM2A 2VWBA 2FSKA 4QS8A 1BA0A 2IVNA 2HF3A 4MO5A 4BR4A 3RRGA 3CJ7A 1YAGA 4PKIA 4Z4GA 3JXUA 1ILYA 4ICLA 3OS1A 3AVFA 4HCBA 1Q8IA 2NLXA 4DTMA 4BR2A 4FYDA 4AM6A 1UA0A 1W97L 4C8NA 4OPKA 2GTDA 3CQXA 1TUYA 4E1JA 1EWRA 3G0ZA 4IBNA 4BVPA 1NK9A 2VGMA 4FWPA 1EQYA 4MFBA 4A5AA 4BR7A 4DU3A 1HQUA 2YJEA 3CCQN 3OYCA 4WF9L 1L3VA 5E84A 2IDOA 1NKCA 1ASWA 3TU5A 3CCSN 2DY4A 1VSHA 3JYTA 1BCOA 2W6KA 3ZT4A 4LF9K 3FR0A 3DWLA 1HNVA 4DS5A 1NJIO 3OYNA 4BACA 2ASMA 3VQDA 4BDZA 3HT3A 4C8KA 4CD3A 3T19A 2QKKA 1QTMA 2D4WA 2OANA 2UUAK 1EKEA 5C2DA 2PFUA 4BRCA 1BHLA 1QQOA 2BANA 4BROA 3QIOA 5ADXH 4WFBL 3EO3A 4K43A 4I6MA 3CC7N 1JLGA 2RKIA 3T69A 2Q0UA 1BI4B 2GUPA 4JS4A 3LDOA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 3SBT A;  3F73 A;  4DQI A;  4HUG A;  3IMX A;  4DSI A;  4DUZ K;  1TK5 A;  4KPY A;  4WQ5 C;  1IBK K;  2HNZ A;  2D0P A;  5C25 A;  3OYG A;  4TSX A;  3MN5 A;  3ID6 A;  4C23 A;  4BRI A;  3NCI A;  3LM9 A;  1NNE A;  3VQ6 A;  5BPM A;  4JHD B;  1BO5 O;  3VGM A;  3LL3 A;  3O4Q A;  3SV3 A;  4B9S A;  1E4G T;  2XY8 A;  3ZSQ A;  3SJH A;  3P83 D;  4H5R A;  1HPM A;  2OZM A;  1U4B A;  1WAF A;  3VA0 A;  1TK8 A;  2I7N A;  3Q7C A;  1HKC A;  3DXK B;  1UOC A;  4K0K K;  4DLG A;  3U4L A;  3RR8 A;  2YKM A;  5AQV A;  4NLC A;  1LOT B;  4DQ8 A;  4FLW A;  1JCF A;  3E9P A;  1TKD A;  1Y97 A;  3ENH A;  3J7Z O;  4B1W B;  4CEA A;  1JXE A;  1KAX A;  3DOL A;  2YNI A;  4X64 K;  3CJB A;  3ITH A;  4H0O A;  3FFI A;  4JAX A;  3V81 A;  2E2O A;  2VG6 A;  3C6T A;  1BIU A;  4CEO A;  1I3A A;  2HHV A;  2EWS A;  4BE2 A;  4OKE A;  4FZY A;  4W5R A;  1VSD A;  1O1W A;  1RTJ A;  4FK2 A;  2VG5 A;  1DGK N;  1RDD A;  4RW8 A;  2HBJ A;  2HHW A;  3RMD A;  4DSL A;  3K9J A;  2WFB A;  3D2F B;  2O4G A;  1NGH A;  4NCB A;  2P9K A;  5AZJ A;  4FJ8 A;  2W41 A;  3LAN A;  2QA4 N;  2KLA A;  3IUC A;  4DSF A;  1NGI A;  1VSK A;  4KTW A;  3O4N A;  1NGA A;  4JI0 K;  3V9U A;  4JI4 K;  5AFU H;  1BG3 A;  3M8S A;  3PIO L;  2HMI A;  3GDQ A;  5BRF A;  5GAE P;  5BN9 A;  5IT9 O;  4E3S A;  5BRE A;  5JVG L;  3AO5 A;  2PY5 A;  2ITM A;  4CHO A;  4E0D A;  3MCA B;  5TKW A;  4BEC A;  3J81 O;  3HPO A;  2VWJ A;  1LAV A;  1YXQ A;  2YHA A;  3VQP A;  2QWP A;  4O5B A;  5ADX A;  1P8Z A;  3LDQ A;  3CFR A;  1WSI A;  5C42 A;  3VEX A;  3TPQ A;  3UB5 A;  1WUA A;  1J5E K;  1TAU A;  4FCY A;  4CJ5 A;  3ZEU B;  1Q18 A;  4H5N A;  1LAW A;  5BRH A;  3DI6 A;  1EO1 A;  4FOI A;  1EET A;  1KCF A;  1ATR A;  4ID5 A;  5F0X A;  1D8Y A;  3VES A;  4JI1 K;  4EP5 A;  4DV1 K;  3QO9 A;  4HUF A;  4H8K A;  3AY9 A;  3KD1 E;  4BWJ A;  4IG3 A;  3TAR A;  4E7I A;  4FW1 A;  1NGF A;  4M63 C;  3E66 A;  4BRF A;  5GIO A;  4JLH A;  3WT0 A;  2Q31 A;  4GKK K;  4IKF A;  4FWM A;  2JWK A;  2P9I A;  4W5Q A;  4H0V B;  2G8F A;  1Q81 O;  4H4O A;  1KD1 O;  5I3U A;  5AQU A;  2XO7 A;  3C7N A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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