3MN7A

Structures of actin-bound wh2 domains of spire and the implication for filament nucleation
Total Genus 108
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
108
sequence length
371
structure length
359
Chain Sequence
VAALVVDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVSHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTEEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELKDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMEACGIHETTYNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Structures of actin-bound Wiskott-Aldrich syndrome protein homology 2 (WH2) domains of Spire and the implication for filament nucleation.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Actin-5C
molecule tags Contractile protein/protein binding
source organism Drosophila melanogaster
total genus 108
structure length 359
sequence length 371
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-04-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3mn7A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3mn7A02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3mn7A03
3O4WA 1YAGA 1DGKN 4RCHA 3VGMA 5JMVA 2GUPA 4H5NA 3EL2A 4WQ4C 2FSKA 2HOEA 5AQRA 3D7EO 4BROA 4BRCA 3A5MC 2Q1NA 4EHTA 4FOIA 3H3OB 4IO8A 5KPTA 4RWTA 2ZGYA 2WUSA 1GLJO 5AQYA 1GLAG 2QXLA 4H0PA 3CI5A 5AR0A 1SAZA 4CZEA 3DJCA 3BF1A 3LDPA 3VEYA 3WQTA 4A2AA 5JICA 5AQTA 2QW9A 4JD2B 1NMDA 2DPNA 2P9NB 4H5WA 4H03B 4YDUC 3ENHA 2P9KB 2P9SB 2W40A 1NGIA 4Z94A 2F9TA 1XQSC 4B9QA 2E8AA 3QICA 5LJVA 3VF2A 3EKSA 5AQIA 1P8ZA 3D2EB 3D2FB 2OANA 5AFUH 1TUYA 1YXQA 5BPNA 3DXMA 3U8XA 3AAPA 4CZGA 2D0PA 3QBWA 2VYPA 5AQWA 4I6MA 1KAYA 3DWLA 2ASMA 3FZFA 3C7NB 5AQGA 3R9PA 4MO4A 4QS8A 2A3ZA 3G25A 4BR0A 5FPDA 3GE1A 2GTDA 2A40A 2CGKA 5I9EB 2CH6A 2I7NA 1X3NA 3MDQA 4BRFA 4BR5A 2YHWA 1V4TA 2V51B 2YHYA 3CQXA 4IWVA 4BRIA 1GLCG 3CJ1A 5E84A 3O08A 3FZHA 4H0OA 3ZEUA 1TYQA 4BRLA 5BREA 2H3GX 2IVOA 4RTFD 4B1WB 3H6EA 2ZWHA 3EN9A 3MN7A 4BRHA 2QWNA 2Q31A 3W0LA 1EQYA 1BUPA 1Y64A 3M6GA 2VCPA 1XC3A 5AQHA 3U4LA 3U9DA 5AQUA 4EIAA 4F9OA 1WUAA 4NB4A 1D4XA 1T44A 4BC2A 1SZ2A 2E2PA 4H0YB 4B1ZA 3ZX3A 5B8HA 1K8KA 4FWKA 4B1YB 1ATNA 4DQ8A 1TUUA 2E1YA 4Y0WA 3MN5A 1RFQA 1HKBA 3I8BA 4JHDA 3DXKA 4L3QA 1HKGA 2QWMA 3FZMA 4BC5A 2F9WA 1NBWA 1KAZA 2P9UA 3CJCA 3WXLA 4FWNA 5BRDA 1LOTB 1GLEG 5EY4A 3CJ9A 3AY9A 3LL3A 3EZWA 3JS6A 4CZMA 3VEWA 3IFRA 1KAXA 3CERA 2EWSA 5KPZA 4H5TA 4MO5A 3WUHA 1BDGA 1GLFO 3S41A 4BGBA 3WXJA 4IJNA 1GLBG 2CGLA 4B1XB 3GOIA 4CZKA 4IJAA 3IDHA 3O1WA 4J8FA 1ZXOA 1QHAA 4BRPA 4DCHA 3MMVA 4BRGA 2ZGZA 1BU6O 4JNEA 2YJEA 3O1BA 5FPNA 5AQQA 5AQMA 3SMPA 2I7PA 2J4RA 4LC9B 5F2RA 4A62A 4KBOA 3UKRB 3HM8A 3ATVA 5BN8A 3FR0A 1ATSA 2YCHA 2UYTA 4BR9A 1T6CA 4K42A 3A5LC 3CJ7A 3U9ZA 1HPMA 1NWKA 3LM2A 3HBTA 2NRHA 3JXUA 1NGBA 3UKUA 1Q18A 2YHXA 3A5OC 5AQLA 4FWRA 3H3NO 4FWPA 3ULEA 4EHUA 1U6ZA 2W41A 4O8KA 5AQSA 3WQUA 4DB3A 1X3MA 4GNIA 4XEIA 4A61A 1JCEA 2V7YA 2VWBA 5E26A 2QWQA 3MCPA 3VEOA 3VENA 5EVZA 1HUXA 3A5NC 3H46O 5JLHA 2GEMA 3WT0A 2AA4A 3UKUB 4BVPA 5AZJA 4XH1A 2YJFA 2IIRA 1DKGD 4WQ5A 2P9PA 4MLHA 5BPMA 3L0QA 3RSEA 1U2VA 1MWKA 1JCGA 1YVNA 4BRQA 3VPZA 3LDQA 3UE5A 1HJOA 3VGKA 4A2BA 4BG9A 1BWFO 1NGFA 3DXMB 3FZKA 3VESA 5ADXA 1BO5O 1BOTO 5CE3A 4I6MB 4FWSA 4K43A 1GLDG 5JLFA 4BGAA 5BR9A 1C0GA 3A8YA 3SK3A 3BEXA 4FWQA 4NO7A 4FOEA 3M1FA 4M7XA 4HWIA 3MN9A 5F1XA 2P9LA 2FF6A 5KQDA 2Q97A 3LDLA 3KVGA 1E4FT 4CZJA 1GLLO 2FXUA 3H1QA 4CZFA 2GELA 5F0XA 2HMPA 5FPMA 3IUCA 2IVPA 4WQ5C 2Q36A 4CI6A 3SJHA 2NLXA 4FWMA 3SMSA 3ZEUB 2ASOA 4EAHD 1TYQB 5AQKA 1Z05A 2D4WA 1IG8A 1DEJA 2HF3A 4XH5A 2P9LB 4CZIA 2HF4A 5AZIA 3ZX0A 5EX5A 1NLVA 4K25A 2V7ZA 5AQFA 2E20A 5AQOA 2P9IA 1K8KB 3M3ZA 1RGIA 1BA1A 2QWRA 3ENOA 4BRKA 2E2QA 4K41A 3QDKA 2ASPA 2Q0RA 4JHDB 3QB0A 1MDUB 3DXKB 3LDOA 3ZETA 1R59O 4CD3A 3DAWA 2P9UB 3AARA 1V4SA 4PKIA 3EKUA 1NGCA 1RDWX 2FSNA 1KXPA 4O5FA 2D1KA 1QQNA 4PKHA 2QWPA 1ATRA 1CZAN 3QFUA 4FWOA 1NM1A 4BC4A 1JCFA 4B1VA 4DHYA 4GY2B 5TKYA 3ATUA 3VGLA 3ZX2A 3HTVA 1NGDA 3GBTA 4YDUA 3VEXA 2A41A 4PL8A 1BG3A 5BPLA 1LCUA 5AQNA 3TU5A 1X9JA 3R8EA 1OKJA 3OHRA 4BRMA 1SQKA 4PL7A 3CJBA 4ISGA 4JD2A 1MWMA 4FPBA 5KPRA 2P9NA 1HKCA 3MN6A 4FSVA 5BRFA 2IVNA 2P9KA 2P9SA 1NGAA 3O5BA 3AAQA 3P4IA 3CIPA 1HX1A 1WOQA 4HTLA 3VETA 3F9MA 3FE1A 3D2EA 3D2FA 1NGJA 3H45C 2A42A 3WXKA 1S22A 3VEVA 4CD1A 4AM7A 2GWKA 1T6DA 3C7NA 3ULEB 3O8MA 5EXWA 4MLEA 5ADXH 4BR7A 4BC3A 2AP1A 3HZ6A 1IJJA 2E88A 4FWLA 1BA0A 5AQJA 4CZHA 3CQYA 2KHOA 3VF6A 1MA9B 1S3XA 1YUWA 5AQZA 2FSJA 4JAXA 4ISEA 1ZBSA 2D0OA 4FPAA 4CBUA 4FO0A 3LM9A 4FL9A 4BQZA 5AZJB 1NGGA 1XUPO 4H5VA 3KZBA 4H5RA 4XH4A 3VOVA 5AQXA 1C0FA 2P9PB 5AFUA 3GL1A 5FPEA 3RSEB 4C23A 1U2VB 1ZC6A 2Q0UA 4IZ9A 2E2OA 5LJWA 3BP8A 2QM1A 3FGUA 3R6MA 2ITMA 1QQOA 3FLCO 3IMXA 3EO3A 3LDNA 3HSCA 4ISFA 3KHYA 4IXCA 4WYBA 3CJAA 3CETA 5EOYA 5BN9A 4CZLA 4B1UB 4M7YA 1QZ6A 3H1VX 3WXIA 1NGEA 4CJ7A 2BTFA 3WEEA 2Q2RA 5LY3A 4BRAA 1HLUA 3ID8A 4BVOA 2E2NA 3HI0A 5AQVA 4M63C 1NGHA 3VEZA 4QS7A 2BUPA 2PAVA 4BREA 2QWOA 4JN4A 4BR2A 1H1VA 2ZF5O 3WEEB 3L6QA 4PKGA 2A5XA 5AZIB 1J6ZA 4QS9A 4H0VB 4BQLA 3FFKB 4WQ4A 4H0XB 1QQMA 3O6WA 3O80A 5AQPA 1ESVA 4BG8A 5KQ8A 3B8AX 2QWLA 3GDQA 2NZTA 3MK6A 2E1ZA 2V52B 3L4IA 2P9IB 3CHWA 3FZLA 3SLCA 1Z6RA 3BUZB 1E4GT 1G99A 1QZ5A 3J8AA 4E1JA 3BF3A 4AM6A 2CH5A 2GWJA 3I33A 3QMLA 4CBXA 5ELZA 3UKRA 4BRDA 3ZETB 3UB5A 3TPQA 2FLOA 2YI1A 4H0TB 3QBXA 2A6AA 4BR4A 3C0BA 3A0IX 3QFPA 3W3DA 3GG4A 2PBDA 3VERA 4BRNA 4CBWA 2CGJA 2FF3B 4EFHA 3VF4A 5BRHA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2GV9A 2G8WA 4Z0UA 4H5NA 3EL2A 3CCRN 1VHXA 2FSKA 5AQRA 4DTNA 1DTQA 4E3SA 4BRCA 3O9UA 3VQ7A 3KLEA 4FOIA 4IO8A 5KPTA 2XHBA 1LAWA 2QXLA 1Q7YO 3CI5A 1Q8IA 5JICA 5AQTA 4O5BA 1Y97A 4Z4HA 2HBJA 4H03B 3ENHA 4YDUC 4CHYA 1RBRA 1XHZA 3QESA 5M1OA 3WNGA 3S3OA 5LJVA 3CCMN 2UUBK 1VRUA 4DV6K 4AILC 4JI8K 3NH0A 2W42A 5AFUH 1YXQA 5BPNA 5C15A 3AAPA 3ULDA 3RWUA 1KAYA 3CC2N 2ASMA 3E01A 5AQGA 1TKDA 4QS8A 1W9HA 1T03A 3G25A 3OBYA 4BR0A 4E7JA 4CEZA 2GTDA 3MX5A 3PIOL 4NYFA 3I0SA 2I7NA 2VQEK 2IC3A 3PSFA 4OKEA 4DLGA 2YHWA 4J2AA 4CIGA 3PO4A 1GLCG 5E84A 4CF9A 4H0OA 3C94A 3L2QA 3ZEUA 2E6LA 1TYQA 3ZSXA 4CJPA 3KK3A 3LAKA 3EN9A 1VSJA 3W0LA 3ZT0A 4J2EA 1EQYA 1BUPA 4KO0A 4BWJA 3SQ2A 3VQ5A 1XC3A 5AQHA 3TTDA 3U4LA 3U9DA 4EIAA 4CF0A 4F9OA 3OYEA 2O8DB 4E72A 1D4XA 3S3NA 1S1XA 4H0YB 3TAGA 1NKBA 1ZYQA 3QETA 1ATNA 2E1YA 3SAGA 3KJVA 1RFQA 2E6MA 3KLGA 3DXKA 4OPJA 2B6AA 2BE2A 3K5LA 1LOTB 2NRVA 5EY4A 3NFAA 2IOCA 2ETJA 3LL3A 1GOCA 3CFRA 4Z4FA 2UUAK 2DFEA 2ZM6K 3RRHA 2G8KA 3KK7A 2VQFK 4DR6K 4MO5A 1GLFO 4BGBA 4H8KA 2ITGA 4IJNA 3C6AA 4FK0A 3O9QA 3GOIA 3TTFA 4CFCA 4FM2A 4J8FA 1ZXOA 4DS5A 2WC9A 3AVCA 1A5WA 3F5TA 3NF9A 1BU6O 4BEBA 3O1BA 1NKEA 5AQMA 2I7PA 2J4RA 3QEWA 3OY9A 3T19A 4CFAA 3NF8A 3UKRB 1VSEA 3RVCA 4LH4A 5HL7L 1ATSA 3MXJA 3RR7A 2YV0X 2OTLN 1NWKA 1N8RO 1C1BA 3CD6N 3JXUA 5J2MA 2YHXA 3A5OC 4FLXA 1DTTA 2W41A 1VQ8N 4O8KA 4EZ9A 3PY8A 1X3MA 4GNIA 4XEIA 4A61A 4JKEA 2VWBA 5GADP 2QWQA 4E7LA 4CEFA 1HUXA 1NK6A 2AA4A 3L3UA 4RW6A 3TAQA 4DV0K 4JKGA 3OYDA 1IBMK 2F96A 5DMRA 3QIPA 3BZKA 2P9PA 3QEVA 4DR4K 4E7HA 4BRQA 1BISA 1VQON 4FYDA 5C0YA 3ZSYA 4BG9A 1FKOA 4CGFA 3VESA 3DXMB 3TI0A 1HNXK 3OYJA 2G8FA 1TVRA 4BGAA 3SK3A 3BEXA 3LWLA 2HNZA 2OZSA 3M1FA 4M3WA 3V1QA 4HWIA 4JKDA 1WNSA 1YT3A 3WXMB 2F7TA 4A5BA 4HUEA 3LDLA 4DTRA 2O8EA 4LFCK 1GLLO 1Q9YA 3ZSVA 4FJ5A 4CZFA 2GELA 4ID5A 5F0XA 3P1GA 5FPMA 2JWKA 2Y1JA 4CHOA 4FWMA 1JLAA 1HYZA 4EP5A 3AVAA 5I42A 4DUZK 1S9EA 2HF3A 5GAEP 1J5EK 4AHRA 1IV0A 3CFOA 3OYFA 4K25A 3MEDA 4CEEA 1QSSA 1S1WA 2YNGA 5AQFA 2E20A 3HRGA 2X74A 3CC7N 3MX2A 5AQOA 3MEEA 3M8RA 3AO2A 1RTDA 2ZD1A 3EEQA 4HVJA 4CF1A 2WONA 4BRKA 4GKKK 1OH6A 2Q0RA 4JHDB 4CFDA 1MDUB 3DAWA 2VWKA 3RR8A 2YKNA 2FSNA 1KXPA 3SV3A 3SQ0A 4O5FA 2PZSA 4KI4A 2QWPA 3P5JA 3E1YA 4K8XA 1TK0A 4DV3K 1NM1A 4M3XA 3ZX2A 3HTVA 4DUYK 2YKMA 4YDUA 4BWMA 3VEXA 3AVLA 4Y1CA 2ZJPL 1LCUA 3TU5A 1IH7A 1KCFA 5CYQA 2OYQA 2NNWA 1A5VA 3HT3A 4PL7A 1Q9XA 3AA3A 1O1WA 1I94K 3CMEN 3L3VA 3TWHA 3HOTA 1L5UA 1HRHA 3ID6A 1K9MO 3O5BA 1N34K 4IOAL 3AAQA 2KKZA 3M8QA 5H1SQ 4FZXC 4CEQA 3ZSRA 2UXDK 4B9SA 1LV5A 4HTLA 3VETA 1TK5A 4B9MA 3FE1A 3NVMA 1NGJA 2A42A 2Y1IA 3WXKA 4CGDA 2QXFA 2B5JA 3HJFA 3SQ4A 2BH1A 1T6DA 3NCIA 2HHWA 5EXWA 5ADXH 1W97L 4O55A 4FWLA 1BA0A 1C1CA 5AQJA 4KAZA 4OLAA 3VF6A 1YUWA 1CXQA 1I39A 1Q81O 2FSJA 2GUIA 4Q0BA 1NK9A 5BR8K 1WB9A 4FO0A 4KHPK 5AZJB 5K14A 4ELUA 1BQNA 5AQXA 1J54A 1C0FA 4EP4A 1C0UA 3GL1A 3RSEB 4C23A 2WBNA 2NRTA 4CJTA 4JKFA 2OZMA 2Q0UA 3THWA 4OKJA 4IZ9A 2QI2A 3OYMA 2QM1A 1SL0A 4K0KK 3IMXA 1LWCA 3EO3A 2O8DA 3HSCA 1KRPA 4IXCA 1HQUA 1Z26A 4WYBA 1RTJA 5J1EA 3SAFA 3G71N 1YTUA 5HOOA 5BN9A 3TAFA 4DR1K 3VQ4A 4E1MA 2XY8A 1RBUA 1XHXA 2HHIA 4CJFA 2G8IA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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