3MN7A

Structures of actin-bound wh2 domains of spire and the implication for filament nucleation
Total Genus 108
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
108
sequence length
371
structure length
359
Chain Sequence
VAALVVDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVSHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTEEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELKDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMEACGIHETTYNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structures of actin-bound Wiskott-Aldrich syndrome protein homology 2 (WH2) domains of Spire and the implication for filament nucleation.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Actin-5C
molecule tags Contractile protein/protein binding
source organism Drosophila melanogaster
total genus 108
structure length 359
sequence length 371
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-04-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3mn7A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3mn7A02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3mn7A03
1BG3A 1DKGD 1NGAA 1WUAA 3UKRA 4MO5A 3GL1A 3F9MA 2FF3B 3KZBA 4K41A 4A62A 4DHYA 2ASPA 3GE1A 4BR0A 5LY3A 4FWPA 3ZETB 3QICA 4NB4A 3UB5A 4MO4A 3MK6A 2WUSA 5AQZA 3BP8A 2DPNA 3C0BA 1HKGA 2FSNA 3A5MC 3LDNA 3O08A 2V7ZA 3IMXA 4BC5A 2PBDA 3D7EO 3ZEUA 2QWOA 1K8KB 4FSVA 3IUCA 1U2VA 1RDWX 2YCHA 1Q18A 4MLEA 4BRPA 3GG4A 3LM2A 4IO8A 4BR7A 2ASOA 4IZ9A 4O8KA 4CZFA 5JICA 2CGJA 5AZJA 2I7PA 2YHYA 3QMLA 2BUPA 5AZIB 2P9PB 4H0TB 4CZIA 1P8ZA 2GUPA 2P9LB 1QHAA 5FPEA 2E2OA 1BU6O 3O4WA 5AQKA 3WEEB 4H0YB 3A5NC 3CJ9A 5JLHA 3AAPA 3H1VX 2P9UA 4BGBA 4J8FA 3S41A 3VGKA 4Z94A 2P9KB 2ZGYA 2A5XA 5BR9A 4YDUA 5AQPA 3VETA 2UYTA 4RWTA 4A2BA 4BRHA 3DXKA 4WQ5A 1NMDA 4H5TA 4IJAA 4CZGA 3MN9A 3QDKA 1ESVA 1GLFO 2P9IA 4NO7A 3FZHA 2IVOA 1BO5O 5AQXA 4BC4A 4CZKA 5BN8A 5AQLA 1YAGA 4Y0WA 5BRFA 4AM6A 1XUPO 3BEXA 3U9ZA 3HI0A 3LL3A 3W0LA 4BR9A 1KAYA 4K25A 3I33A 4B1XB 1NGBA 3GDQA 4K42A 4BVOA 1KXPA 4FPBA 4BQZA 5FPDA 4ISEA 1KAZA 1E4FT 4ISGA 2QWPA 4B9QA 3MDQA 4QS7A 1DEJA 3CERA 3KVGA 1XC3A 4I6MA 1ATSA 3HTVA 2IVNA 3U8XA 4ISFA 2ITMA 3VEOA 3DAWA 4QS9A 5EX5A 2ZF5O 2AP1A 2E2PA 3ULEA 3EKSA 1EQYA 3FZFA 2D4WA 4BR2A 3LDPA 1QQNA 2ZGZA 4CZLA 1T6CA 5ADXA 1QQOA 2HF3A 5BPMA 3HBTA 3CJCA 3ZX0A 1TUYA 1HKBA 1H1VA 1BUPA 2E88A 3CJAA 1GLEG 3CJBA 1J6ZA 4CZHA 4BRQA 2HMPA 2P9SB 3W3DA 4HWIA 3MN6A 3VPZA 1MDUB 5B8HA 4H0PA 2EWSA 3VERA 4YDUC 2W41A 4BRMA 3HZ6A 4WQ5C 5KQDA 3CIPA 3TU5A 4PL8A 5E26A 5F2RA 1Z05A 3D2FA 4JD2B 1SQKA 4JN4A 4JAXA 1NGDA 3O6WA 3BF3A 2FLOA 4KBOA 5AFUH 3BUZB 5I9EB 3RSEA 4DB3A 1LOTB 3VENA 3WXJA 1OKJA 1BOTO 3TPQA 3MN5A 3LDOA 5E84A 2W40A 5AQTA 1Z6RA 4DCHA 3IFRA 3A8YA 2QWQA 1X3MA 4XEIA 2YHWA 5AQSA 4AM7A 1IJJA 3CJ1A 3VESA 5F0XA 3ATVA 2OANA 2YJFA 3EO3A 2J4RA 1Y64A 4FWQA 4CBXA 2V52B 4DQ8A 4WYBA 1GLLO 2E8AA 4BG9A 1NGIA 4BRIA 1D4XA 2A6AA 2V51B 3IDHA 3EL2A 3L0QA 1HLUA 3FE1A 5AQUA 4BRGA 3C7NB 3VF4A 4EHUA 4GNIA 5AQFA 5KPZA 4CZEA 2YJEA 2IVPA 3M1FA 3VOVA 4CZMA 3FFKB 1X9JA 1XQSC 4H5NA 1S22A 2E2QA 2QWLA 5F1XA 4EIAA 2Q0UA 4E1JA 5BRDA 4BRAA 4H5RA 1NGEA 4FPAA 3BF1A 2E1ZA 5EXWA 2FF6A 5ELZA 2FXUA 3AAQA 3DXMA 3LDLA 3QBXA 4BRKA 4F9OA 5BPNA 3EN9A 3HSCA 2CH6A 2V7YA 2Q2RA 1NGFA 2P9NB 5LJVA 1RGIA 4CJ7A 3AARA 3UE5A 4CD3A 4EHTA 3HM8A 1R59O 3VF6A 5KQ8A 3UKUA 3MMVA 1V4SA 3U9DA 3DWLA 3UKRB 5AQNA 3GBTA 3O5BA 2AA4A 3RSEB 2FSJA 2Q36A 2KHOA 1JCEA 4K43A 3ENOA 4XH5A 3H3OB 5CE3A 3FZKA 3JXUA 2I7NA 3ZX3A 2F9TA 1NLVA 1HJOA 3ID8A 2VCPA 2D0OA 4H0VB 3VEXA 1BA1A 4BGAA 1ATNA 3LM9A 3FLCO 3ZEUB 3I8BA 4B1YB 1NGCA 1X3NA 1U2VB 4CD1A 4H03B 1YXQA 2E1YA 1SZ2A 2IIRA 3CJ7A 4FWLA 5AZIA 4BC3A 1NBWA 1ATRA 3L6QA 5AZJB 4B1ZA 3QB0A 2P9LA 5FPNA 4MLHA 4B1WB 1ZXOA 4H0OA 1QZ6A 4FWNA 3SK3A 3WEEA 3WXKA 4WQ4A 4BRFA 3ZX2A 1CZAN 1T6DA 1V4TA 3VEVA 3ATUA 3H6EA 4JNEA 2P9KA 2CH5A 4FWMA 2P9UB 3A5LC 4L3QA 4A61A 4LC9B 3GOIA 3U4LA 3WXLA 5TKYA 4FWKA 4IWVA 4CBUA 4GY2B 1C0FA 4IXCA 3CQYA 3DXKB 5BN9A 2A3ZA 4EFHA 2QWMA 2NLXA 5AQJA 2P9IB 3A0IX 4PKHA 5LJWA 3G25A 1NM1A 5AR0A 2BTFA 3WQUA 5BREA 1RFQA 1HUXA 1NWKA 4EAHD 1JCFA 2QW9A 4C23A 3VEYA 2E2NA 4XH4A 3M6GA 3UKUB 4BROA 1JCGA 3JS6A 3VEWA 4XH1A 2CGLA 3FR0A 1ZC6A 3SJHA 3O8MA 2ASMA 3SMPA 4M7YA 3LDQA 2VWBA 1YUWA 2QWNA 1S3XA 1LCUA 1WOQA 4I6MB 4FOEA 3O1BA 5EY4A 5KPTA 1NGGA 1E4GT 3J8AA 4JHDA 4H5WA 1C0GA 1IG8A 5AQGA 3VGLA 3WUHA 4PKGA 3H3NO 3ULEB 1QZ5A 3A5OC 4B1VA 1TYQA 2NRHA 3D2EA 2YI1A 2NZTA 2Q0RA 3R9PA 1GLAG 1MA9B 3FGUA 3B8AX 2HOEA 2GWJA 3L4IA 4WQ4C 3AY9A 3SMSA 1GLCG 4FWRA 3DJCA 2P9SA 4PL7A 3M3ZA 3OHRA 5ADXH 3EZWA 3QBWA 4FWOA 1HPMA 2GELA 1GLBG 5AFUA 3QFUA 4HTLA 1BWFO 2YHXA 3CETA 3VEZA 2Q31A 4JD2A 3SLCA 3CI5A 3O80A 3WXIA 1SAZA 3D2FB 5AQMA 4BQLA 1KAXA 3H45C 1G99A 2A41A 3ZETA 5AQOA 5AQYA 2QXLA 4BRNA 4H5VA 2GTDA 4O5FA 5BRHA 1MWKA 5AQIA 3WQTA 1NGJA 5AQHA 1T44A 3CQXA 2Q1NA 4FO0A 4M7XA 4FOIA 2HF4A 2E20A 1K8KA 3MCPA 4B1UB 3EKUA 3QFPA 4RTFD 4CZJA 4BC2A 5AQRA 4BRLA 3CHWA 4BR4A 2F9WA 4BRDA 4H0XB 1HX1A 1HKCA 2P9PA 4BVPA 1U6ZA 3H1QA 2ZWHA 5AQVA 1TUUA 2CGKA 4A2AA 3FZLA 3C7NA 5EVZA 4JHDB 5EOYA 2D0PA 3ENHA 2QM1A 4QS8A 4BG8A 5AQQA 1BA0A 1TYQB 3D2EB 2D1KA 2QWRA 1MWMA 2Q97A 5JLFA 5FPMA 4CI6A 2PAVA 3R6MA 2VYPA 1GLDG 4BREA 1NGHA 4CBWA 4BR5A 1BDGA 3O1WA 2FSKA 3WT0A 3KHYA 5AQWA 4IJNA 3H46O 1DGKN 5KPRA 4RCHA 1GLJO 4FWSA 3VGMA 3DXMB 4M63C 4PKIA 2P9NA 4BRCA 1YVNA 2H3GX 1ZBSA 3FZMA 2A40A 5JMVA 3R8EA 2A42A 3P4IA 1QQMA 2GWKA 2GEMA 3VF2A 3MN7A 4FL9A 5BPLA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1K8AO 2P5GA 1IBMK 3KWIA 1WUAA 4GV6A 3UKRA 2FF3B 1UA1A 4A62A 1XWLA 4BR0A 4FWPA 4LSLA 3UB5A 4NCAA 4MO4A 3K59A 3IKMA 2BDPA 1N8RO 1S6QA 4DF8A 4KHPK 1BCOA 2UXBK 1XHZA 2FSNA 3LDNA 4DQQA 2XHBA 2NRWA 1SS6A 2PBDA 3D7EO 4FJJA 2IDOA 1RBSA 2QWOA 4JI3K 3PSIA 3OS0A 4FSVA 4KHUA 1RTHA 1U2VA 4IOXA 2NRRA 4MLEA 4TSXA 3SPZA 3TSPA 1EXQA 2O4IA 4IBNA 4M42A 4IZ9A 3VA3A 4QCLA 3CMEN 2HHQA 5AZJA 2I7PA 3O4NA 1OH6A 5AZIB 4H0TB 2PFUA 4WE1A 1P8ZA 4B08A 4J2AA 3TABA 2E2OA 3AAPA 4AILC 2P9KB 3O9UA 2A5XA 5LMNK 4A2BA 5HL7L 1WBBA 4H5TA 1NK6A 1D9DA 1HNZK 1GOAA 1GLFO 2P9IA 3WNEA 3L2WA 3FZHA 4CZKA 4FJNA 5BRFA 4AM6A 1VSIA 3BEXA 4LSNA 2O8DB 1J53A 1KAYA 1I94K 4K25A 3E9OA 1NGBA 4K42A 1FXXA 1QVGM 4AHUA 3D0PA 4FPBA 3EE8A 4HVJA 5FPDA 4B9VA 1X9WA 4JI5K 5I3UA 1ATSA 4DTOA 5KRTA 3ZYYX 4ISFA 3OJSA 4KTQA 4ILJA 4G9ZA 5EX5A 2AP1A 2E2PA 1JJ2M 1IKXA 4PUOA 2D4WA 3G71N 3L2VA 1QQNA 2ZGZA 4C1NI 2HF3A 5BPMA 4DLGA 3AO1A 3ZX0A 1HKBA 4OKKA 2X6NA 1H1VA 2HBJA 4CESA 2E88A 3CJAA 2OCEA 3RTVA 2ZD1A 2HMPA 4A59A 2LSNA 3L3VA 4HWIA 1NNEA 2QTDA 4YDUC 3CFOA 3V1QA 5HRPA 4WQ5C 1KC8O 2Z1GA 4Y1DA 1L3SA 3BZCA 5E26A 1SL2A 3D2FA 4BE7B 1TKXA 5EU7A 3TSUA 4JN4A 3IS9A 1UOCA 1NGDA 3DRRA 3NBPA 2FLOA 3BUZB 5I9EB 3D45A 4KTZA 3ID6A 3CMAN 4B9LA 3DYAA 3K58A 1NJWA 1KVAA 3VMFB 1I39A 4RW6A 3SV3A 3LDOA 1RDCA 3PIOL 1Z6RA 1ZBLA 1FK9A 4N5SA 1TKDA 4XEIA 4AM7A 1IJJA 3VESA 1CXQA 1F21A 3O3FA 4DWIA 1YJ9N 1YITN 4DQ8A 5E41A 4CJRA 1NMNA 4BDZA 4DSEA 2W6LA 4WF9L 1WSHA 2A6AA 3L2RA 4DV3K 1W97L 3VQDA 4ZHRA 3VF4A 4E7KA 3EE9A 4GNIA 5AQFA 1JLQA 2UUBK 2R7YA 4CZMA 3FFKB 2D5RA 1XQSC 1S22A 3EZ5A 2E2QA 2IS3A 1TL1A 4AF1A 4LF8K 4E1JA 2HHWA 2W42A 4FPAA 5EXWA 3RWUA 5ELZA 3PLAA 4W5TA 2FXUA 1FW6A 4KHQA 1NK5A 4BRKA 4FJMA 3THVA 2V7YA 5GADP 2QXFA 2P9NB 4JI4K 3HPOA 4ID1A 3UE5A 3OY9A 4CD3A 3QETA 2OZSA 5KQ8A 3UKUA 3TAFA 1V4SA 3WNGA 4DV5K 3ALYA 3V9UA 1C0TA 3RSEB 2FSJA 2KHOA 3ENOA 3H3OB 5CE3A 5C0YA 4ELTA 3QNOA 2F9TA 3CCUN 1HJOA 3ID8A 2HHHK 2X74A 3OYAA 2P1JA 2D0OA 3VEXA 3PO5A 4YOXA 5IWAK 3AVBA 3CFRA 3PY8A 3AA2A 4JRQA 3OYNA 4CD1A 1YXQA 3AGKA 3KD1E 3TTDA 2IIRA 2WTUA 4DQRA 1ATRA 4AQYK 3NF9A 4EP5A 5FPNA 2EHGA 2YX6A 3CYMA 3S3NA 4MLHA 2UUCK 3SK3A 1S9EA 1IKWA 4YHHK 1V4TA 1IV0A 1S9GA 1KD1O 3AO3A 2O4GA 1VSLA 1IKYA 3A5LC 3U3YA 2WC9A 4EFHA 1RCHA 1KQSM 2NLXA 5AQJA 4AHSA 3G25A 4JV5K 1NM1A 4RW4A 3WQUA 5BREA 2JWLA 1S1XA 1KSPA 2GV9A 1JCFA 4CFAA 4J2EA 3M6GA 2O8EA 2IOCA 3VEWA 4NLBA 4XH1A 3SMPA 3DI6A 4B9NA 3O8MA 3ULDA 2VWBA 4K0KK 1YUWA 2QWNA 4YNQA 4JI8K 1WOQA 1M90O 4FOEA 3O1BA 1ZBUA 5EY4A 4FJKA 1YT3A 4RW7A 4E7HA 1KVBA 5C10A 2KTQA 1IKVA 2NUBA 3OYJA 3A5OC 2NRHA 3D2EA 1BISA 4CIFA 3OYMA 4K8XA 1HNVA 3V9WA 1GLAG 1VRUA 3V1RA 3L4IA 2HOEA 4FJIA 3SAFA 1HR0K 3M3ZA 3OHRA 3VQAA 2KW4A 3WXMB 1OVYA 3HP9A 1HPMA 2E6LA 2IAJA 1GLBG 2VQFK 4U7BA 2YHXA 3CETA 3CM6A 3ZT1A 3ZT0A 3SLCA 3O3GA 3O80A 4LF5K 3WXIA 1SAZA 1NK7A 1YTUA 3SZ2A 1HJRA 3OYCA 2F7TA 1Q9XA 3QO9A 4W5QA 1RBRA 2FBTA 2KKZA 3ISNC 3G10A 1S6PA 4O5FA 3L2UA 4EZ9A 1JLCA 3VQQA 3M8SA 3WQTA 4DSKA 4CJ5A 3CQ8A 4C8KA 1TK8A 3SQ2A 4LY7A 3VQ6A 2G8HA 4B1UB 3RMAA 3HVTA 4RTFD 4FZYA 4OGEA 3EYZA 3SCXA 5AQRA 1YHQN 1U4BA 3CHWA 2F9WA 1SKRA 4H0XB 4IO9L 2DY4A 5AQVA 4DV0K 1CLQA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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