3MN9A

Structures of actin-bound wh2 domains of spire and the implication for filament nucleation
Total Genus 119
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
119
sequence length
371
structure length
360
Chain Sequence
VAALVVDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVSHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTEEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELKDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMEACGIHETTYNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Contractile protein/protein binding
source organism Drosophila melanogaster
publication title Structures of actin-bound Wiskott-Aldrich syndrome protein homology 2 (WH2) domains of Spire and the implication for filament nucleation.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Actin-5C
total genus 119
structure length 360
sequence length 371
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-04-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3mn9A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3mn9A02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3mn9A03
5EXWA 5LY3A 4NO7A 2V7YA 2QW9A 1TUYA 3VPZA 1X3MA 4MLEA 3ZEUA 5KPRA 2YJEA 3MN5A 2IVPA 5BN9A 4FO0A 1V4SA 3UB5A 2V52B 3LM2A 3EZWA 3FZLA 5AQIA 3ATVA 2J4RA 2FF3B 3UE5A 1U6ZA 1GLBG 3L4IA 5FPMA 3ZETB 3VETA 2D0OA 4B1VA 3IFRA 2A41A 4FOIA 4BC5A 4FWMA 4BC4A 1NGDA 4BR4A 2ASOA 4A62A 3GL1A 3DAWA 2QWLA 4K43A 2V7ZA 3O1WA 4I6MB 1MA9B 2P9KA 1Z6RA 4HWIA 2P9LA 3O80A 1QZ6A 3CQYA 3GOIA 2EWSA 4K25A 2P9UA 3AY9A 2W41A 3C7NA 1ESVA 2CGLA 5JLFA 2F9TA 2YHXA 4WYBA 3VEOA 3MN9A 1ATRA 2CGJA 4BRGA 3VOVA 3W3DA 1HLUA 2ZGYA 4H0TB 2AP1A 4PKGA 4QS8A 3H46O 2NLXA 4JHDB 3B8AX 4BRIA 2E8AA 3EKSA 2P9PB 1ZBSA 5AQJA 3O6WA 5AQTA 4FOEA 4BVOA 2GELA 5BRHA 3RSEA 3HI0A 3WQTA 2E2NA 3S41A 4IO8A 3CIPA 2UYTA 1T6DA 5AZIB 4B1YB 4FWSA 1DEJA 4Y0WA 4PL8A 2PBDA 3QBXA 1Q18A 4KBOA 2E1YA 1HUXA 2FSKA 1HPMA 3EL2A 3DJCA 1TYQA 3JS6A 3WEEA 2IIRA 3CJ7A 3O08A 3VENA 3CHWA 4RTFD 3CJ9A 3ULEB 4WQ4A 2YI1A 4DQ8A 3F9MA 1BWFO 1KXPA 2NZTA 4FWLA 4XEIA 1J6ZA 4AM6A 3M1FA 4BR9A 3GG4A 3CJAA 1JCGA 3FE1A 2P9IB 4MLHA 1YAGA 3SJHA 3U9ZA 3D2FB 3G25A 4DCHA 5BRDA 4BROA 4JD2A 4H03B 3FR0A 2QWQA 4NB4A 3I8BA 4H0PA 5BR9A 3WXKA 5F1XA 3ZETA 3U8XA 2P9SB 3BF1A 3CERA 4BRQA 1BA0A 3QICA 1SQKA 2KHOA 4L3QA 3R9PA 1NGEA 4XH5A 3ZX3A 2BTFA 3SK3A 4BR5A 3D7EO 4BRLA 1DGKN 1NGJA 2GWJA 4IZ9A 1Z05A 2Q2RA 1K8KB 3LDPA 2QWOA 5EX5A 5JICA 3ATUA 3HBTA 4BRMA 1H1VA 3VESA 1NGIA 2Q0RA 5KQ8A 4JHDA 2AA4A 4FL9A 3J8AA 3LL3A 1JCFA 3WT0A 3KZBA 5CE3A 2ZF5O 4CZEA 4BVPA 1HX1A 2H3GX 3MN6A 2Q36A 3UKUA 3LM9A 2YCHA 4FPAA 4YDUC 5KPTA 2HOEA 4BC2A 4YDUA 3QFPA 4PKHA 4BC3A 1BO5O 1NGAA 3MCPA 1D4XA 2ITMA 4EIAA 3QB0A 4C23A 2CGKA 2HMPA 3O8MA 4FWNA 1HKGA 1LCUA 3H3OB 1MDUB 4JN4A 4F9OA 1DKGD 3ZX0A 1NGBA 4FWOA 1SAZA 4CZLA 2P9NA 4H0XB 2NRHA 2E88A 4CZGA 5EY4A 2GEMA 5F0XA 4B9QA 5JLHA 3O1BA 1MWMA 3M6GA 4IJAA 3ULEA 5JMVA 3M3ZA 3FFKB 5AQSA 5AQMA 4ISEA 2A42A 3SLCA 1OKJA 5AZJB 2QWRA 1T6CA 5AQXA 4BREA 5FPEA 5LJVA 4M63C 5E26A 2OANA 3A5NC 4CBXA 3FZKA 1XQSC 4CBWA 2YHWA 4GNIA 1S3XA 2A6AA 2IVNA 4XH4A 4CZJA 5BPNA 3WXIA 1ATSA 2P9SA 1GLLO 2ASMA 1NLVA 5AQQA 2GTDA 5BREA 4H5RA 3EN9A 4JNEA 3BP8A 1C0FA 5AQZA 1E4FT 3A5OC 4E1JA 3BF3A 3WUHA 2HF3A 2WUSA 4FWKA 2FSNA 4H5WA 3H6EA 1BA1A 2A3ZA 1BG3A 1E4GT 3ZEUB 2QXLA 3UKRA 1K8KA 5EOYA 3EO3A 2QWNA 1GLDG 4CZIA 3DWLA 2BUPA 5E84A 3ENOA 4BR7A 5F2RA 1NM1A 3DXMB 4QS9A 1R59O 5AQWA 3H3NO 1GLCG 5BRFA 3QDKA 1NBWA 1C0GA 1GLAG 5BPMA 2W40A 1RGIA 4BGAA 3MDQA 2I7NA 5AQUA 4A2BA 4FWQA 3MK6A 4BRAA 3WXJA 3O5BA 1BU6O 2F9WA 4K41A 3AAQA 3H1QA 1HKBA 3U4LA 4BG9A 2P9KB 3MMVA 3FLCO 3VEYA 3GBTA 4BRKA 3R8EA 4DB3A 5AQGA 2Q31A 4BRFA 2P9UB 3A8YA 1KAZA 1WOQA 1XC3A 4B1UB 3LDQA 3P4IA 3JXUA 4I6MA 3L6QA 1NWKA 5BN8A 2FF6A 2FSJA 1QZ5A 2PAVA 3AAPA 1LOTB 2YHYA 3IMXA 4PKIA 4GY2B 1U2VB 1P8ZA 1HKCA 3HSCA 1GLEG 4MO5A 3D2EB 3H45C 5ELZA 4EAHD 2A5XA 3FGUA 4ISGA 4JAXA 1MWKA 4BR0A 4Z94A 2P9PA 2Q1NA 3L0QA 4H0OA 3OHRA 4H0YB 2Q0UA 4O8KA 3TPQA 1CZAN 5AR0A 3LDOA 3C0BA 2A40A 1X3NA 4K42A 4H5VA 3VGKA 4RWTA 2QM1A 2QWPA 5AZIA 3HTVA 3WEEB 2VYPA 3KHYA 5AQOA 4LC9B 5ADXH 3IUCA 3QMLA 3DXKB 5AQLA 1QHAA 3HM8A 3FZFA 3FZHA 1RFQA 4BR2A 1GLFO 3VEVA 1HJOA 2I7PA 4CBUA 2D1KA 3DXMA 3CETA 4B1ZA 1X9JA 4JD2B 3TU5A 5FPNA 1ZC6A 4CZMA 4O5FA 5AQPA 1ZXOA 1KAXA 2P9IA 2Q97A 3SMPA 5FPDA 1NGHA 3D2FA 4CZHA 3GDQA 4IWVA 4AM7A 1YUWA 4A61A 4WQ5C 3O4WA 3VEZA 5AQKA 4WQ5A 4BRNA 2FLOA 4BRPA 2CH5A 4J8FA 1QQOA 3ZX2A 1NGCA 3CJ1A 4CD3A 3ENHA 3VF6A 4BG8A 2GUPA 5AFUA 4BRHA 2D0PA 4IJNA 3ID8A 3A5MC 4DHYA 2D4WA 2E2QA 3CJCA 3H1VX 3CQXA 3HZ6A 2GWKA 1U2VA 3VEWA 4BQLA 3LDLA 1JCEA 1V4TA 4BGBA 5EVZA 1TUUA 5LJWA 5AQVA 3A5LC 3D2EA 3UKUB 3CJBA 3MN7A 1NGFA 2ASPA 4FWRA 2ZGZA 3BEXA 4FSVA 1NMDA 5AFUH 5AQYA 2CH6A 4EFHA 4BQZA 3BUZB 2E1ZA 3QFUA 3I33A 4H5NA 4PL7A 5BPLA 3VGLA 5B8HA 3VF2A 1KAYA 1IG8A 4IXCA 4M7YA 3R6MA 1YXQA 5AQHA 2P9NB 2VWBA 2YJFA 3A0IX 5AQNA 1RDWX 2P9LB 5AQFA 4WQ4C 3VGMA 4QS7A 4CZFA 4M7XA 4FPBA 3DXKA 4EHTA 4CZKA 3U9DA 4CJ7A 3IDHA 3C7NB 1QQNA 5KPZA 1T44A 1EQYA 2E20A 5KQDA 1BUPA 4ISFA 2E2OA 4EHUA 3GE1A 4H5TA 1NGGA 4FWPA 3SMSA 1IJJA 3W0LA 4HTLA 1BDGA 1QQMA 3VF4A 4RCHA 1SZ2A 2E2PA 3WXLA 3WQUA 5AZJA 3VEXA 1G99A 3LDNA 4B1WB 3QBWA 2HF4A 5TKYA 3RSEB 4A2AA 1XUPO 3VERA 2DPNA 1S22A 4BRDA 5ADXA 1ATNA 4XH1A 5I9EB 2FXUA 1BOTO 1YVNA 1Y64A 3CI5A 4CD1A 3AARA 3KVGA 3EKUA 5AQRA 4MO4A 4B1XB 1GLJO 1WUAA 2IVOA 4BRCA 2QWMA 4H0VB 4CI6A 3UKRB 2ZWHA 2V51B 3FZMA 2VCPA 1TYQB
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4KPYA 3ZSWA 3ID6A 3VPZA 1YTUA 4DF8A 3SQ4A 1IKWA 4MLEA 5KPRA 1EX4A 2YJEA 2P5GA 4LH4A 3SUOA 1B92A 3MN5A 2OZSA 2IVPA 4A57A 3BGRA 4WE1A 3FZLA 2QKBA 2ZQBA 3O9QA 3KLHA 1S9GA 3UE5A 5FLXO 1GLBG 3VETA 4Z0UA 2A41A 4E1NA 4BC5A 4IEIA 2RHKA 3LPUA 4GW6A 4FWMA 1NGDA 4BR4A 2ASOA 2O8DB 2QWLA 3OS2A 3SV3A 1MA9B 4LSLA 2P9LA 1QZ6A 5EU7A 3IKMA 3RMDA 1VSEA 5J2NA 3CCLN 3AY9A 1ESVA 2F9TA 4WYBA 3C6HA 3QO9A 1HLUA 2ZGYA 2AP1A 3VA3A 4CK1A 1VQON 4AHUA 1JLGA 5JS2A 2HBJA 3TWHA 2LSNA 2E8AA 3EKSA 4BRIA 4JI2K 3MX2A 4CJ5A 5AQTA 4FOEA 2VQEK 4I2QA 5HBMA 1GOAA 5BRHA 3RSEA 3WQTA 3T7ZA 1W7AA 2E2NA 4IO8A 3ZLJA 4N47A 4B1YB 4OPKA 2XRIA 4Y0WA 1XI1A 5CZ1A 2HBKA 1Q18A 1RDBA 3EE9A 4IOAL 3T1YK 1HPMA 3OYJA 1XMQK 3EL2A 4LFCK 3CJ7A 2HHHK 3KWGA 3VENA 5KI6A 4RTFD 4CGHA 3SQ0A 2D0AA 2YI1A 1Q82O 3ASMA 3S3MA 4C1NK 1BWFO 1C6VA 1KXPA 2NZTA 3OYCA 1L3UA 3TI0A 4FWLA 2HHVA 3AO2A 4CJPA 3NVKA 4JKCA 4KTWA 4AM6A 4B3OA 1JCGA 3FE1A 4MLHA 3SJHA 4DCHA 3FR0A 4H4OA 4ILGB 3I8BA 5BR9A 5F1XA 4FJ5A 3ZETA 3QLHA 2OCEA 4MDBA 3LDSA 1SQKA 2KHOA 3K5MA 4KHYA 3KWIA 4E19A 2Z1HA 4QOZB 5GINA 1ITGA 3HPOA 3QIOA 2XHBA 1SKWA 4B9LA 1QVGM 2GWJA 3NGZA 1Z05A 4OO1J 3KK3A 4C8NA 2Q2RA 3AVAA 3L3VA 1RT6A 3HBTA 3HXMA 1NGIA 2Q0RA 5KQ8A 4E7IA 5JVHL 3I55N 1JCFA 4FJ8A 5CE3A 2ZF5O 4DQSA 1VQKN 5C42A 3VA0A 4F3OA 3MN6A 4B8AB 2YCHA 2HOEA 4YOWA 4JRQA 2IAJA 3THXB 4YOVA 1NGAA 4EIAA 3QB0A 4IKFA 4JI8K 4JK9A 1N32K 2HMPA 3SQ1A 3RRHA 4ILJA 4EP5A 3JSMA 3H3OB 3M8PA 1RDUA 1MDUB 1TV6A 4JN4A 4F9OA 4BE1A 3MXIA 1DKGD 4DU1A 1N5YA 4LH5A 3NH0A 3OS0A 2VQFK 1ZBUA 3SUPA 3ITHA 3O1BA 3M6GA 3ZT0A 4IJAA 4CHOA 4K8XA 1I3AA 3M3ZA 3FFKB 4CESA 3K5OA 5AQMA 1IV0A 2A42A 1DT9A 1WSIA 4CF0A 1F21A 1HRHA 4GV3A 4FVUA 3B6PA 3A5NC 4M42A 4CBXA 5C12A 1EWRA 1SL1A 3CFRA 1X9MA 5CY4A 4CZJA 5BPNA 3WXIA 3J7AP 1GLLO 2ASMA 4IG0A 1EXQA 1LWEA 1VQ6N 4FJ7A 3K2PA 5BREA 3EN9A 5GADP 1SV5A 4FLTA 1E4FT 3A5OC 4E1JA 4E7KA 1Q81O 3HL8A 3NF7A 4DFMA 4FWKA 4I9QA 1S9EA 5LMUK 4CJ3A 3ZEUB 2ATQA 2RKIA 1SL2A 1IBMK 3IRXA 5EOYA 3G71N 1XWLA 2BUPA 5F2RA 4FJMA 4OGCA 3OBYA 1R59O 3DYAA 1JLAA 3H3NO 1NJXA 2UU9K 3QDKA 3AA3A 2VG5A 1GLAG 3CYGA 5KRTA 4Z4EA 3MK6A 4FW2A 5E41A 4LF6K 3MWPA 3O5BA 1RDAA 4FJIA 2FBTA 5FROA 2C1IA 4KI4A 3TAPA 4W5TA 2ZM6K 4IFEA 3MECA 1IKVA 3KK2A 3HPGA 4O8UA 4DB3A 4PA1A 4HCCA 4DQIA 1RTHA 1EKEA 4KH4A 1QZ5A 4B9TA 4KI6A 3KD1E 1NK4A 4LF8K 1LOTB 2YHYA 2UXCK 4GY2B 1U2VB 3NF9A 4ELVA 3H45C 4N56A 5ELZA 2HSTA 3HO1A 2XY5A 4CJSA 3QINA 5CZ2A 3FGUA 4JAXA 1MWKA 4F3TA 2Q1NA 1REVA 1A5XA 3M5RA 1KSPA 4O8KA 3TPQA 3LDOA 4OPJA 5CR4A 3SUNA 2QM1A 2X6SA 5BR8K 1LV5A 5AZIA 3HTVA 2VYPA 5AQOA 4LC9B 4NLBA 3RTVA 5ADXH 4CJVA 1SL0A 4AILC 2FC0A 1OH7A 4J2DA 3AO5A 4BR2A 4CBUA 3RWUA 4B1ZA 4JD2B 4JI6K 3TU5A 5FPNA 4DTUA 2Y1IA 5AQPA 2XO7A 2P9IA 2Q97A 4E72A 1NGHA 4NYFA 4CZHA 3GDQA 1QHTA 4IWVA 3I0SA 4DMNA 4J8FA 3ZX2A 1VK0A 1VSMA 3T1HK 2UXDK 3KK1A 2AJQA 1RBUA 4BRHA 2E4LA 3CFOA 1C1CA 4K0KK 3EZ5A 4BQLA 4BGBA 4Q5VA 3SAFA 3CJBA 4FSVA 1XC9A 1A5VA 3DOLA 3HOTA 2CH6A 4J2BA 5IT9O 3BUZB 4FLZA 4BE7B 1LW2A 3QFUA 2GV9A 4JKBA 4PL7A 4DQQA 1KFDA 1KAYA 4FXDA 4IXCA 1YXQA 3TTDA 4A5BA 4DLGA 2HBLA 2YJFA 5GAHP 3MEDA 1RTJA 3VGMA 3AGKA 4DSJA 3DXKA 4EHTA 4M3TA 2PY5A 3C7NB 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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