3MN9A

Structures of actin-bound wh2 domains of spire and the implication for filament nucleation
Total Genus 119
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
119
sequence length
371
structure length
360
Chain Sequence
VAALVVDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVSHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTEEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELKDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMEACGIHETTYNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Contractile protein/protein binding
source organism Drosophila melanogaster
publication title Structures of actin-bound Wiskott-Aldrich syndrome protein homology 2 (WH2) domains of Spire and the implication for filament nucleation.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Actin-5C
total genus 119
structure length 360
sequence length 371
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-04-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3mn9A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3mn9A02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3mn9A03
2V52B 3GG4A 3ATVA 4XH4A 2E8AA 3L0QA 3LDNA 5AQVA 4B9QA 3DXKA 2CH6A 4K42A 1T44A 4BR5A 2E88A 4BR9A 3GBTA 3CIPA 3C7NB 3ENHA 4FPBA 1QHAA 3HZ6A 2A5XA 4IWVA 3UKUB 4MO5A 1NGBA 2ZGYA 3IFRA 3ZEUA 3H45C 2WUSA 1NGGA 4RCHA 5AQYA 3O1WA 2P9NB 2ASOA 1RDWX 5AQNA 4BQLA 4WQ4A 4ISEA 3VEYA 1MWKA 5AQTA 3VGMA 2GELA 4ISGA 3AARA 3WQUA 5AQZA 2W41A 1V4TA 2IVOA 3HTVA 1CZAN 3SMSA 4XEIA 5KQ8A 5BPNA 4LC9B 1EQYA 1V4SA 4JD2A 1LOTB 3VGLA 2F9WA 1C0GA 5ELZA 1MA9B 3MMVA 3BEXA 2QWQA 3CJCA 1QQMA 1ZBSA 3A8YA 3QDKA 3WXIA 3DWLA 3DXMB 3MK6A 4IJAA 3O08A 4QS7A 5BR9A 2FF6A 4BC2A 3JXUA 2A40A 3O1BA 1E4FT 3VEWA 3SK3A 4IJNA 3VERA 4FSVA 5AQRA 4F9OA 4BRIA 4PKIA 1ATSA 2IIRA 5AQOA 3ZX0A 4HTLA 2Q97A 2VCPA 4FWLA 4H5RA 3DJCA 4DQ8A 5BN8A 4E1JA 4MO4A 1NGAA 1E4GT 3H3OB 3LM9A 4A2AA 3VEXA 2QWPA 4FOIA 2GEMA 3A5NC 3EKUA 3S41A 4ISFA 4O5FA 3UE5A 3HI0A 3BUZB 3CETA 2YHXA 3G25A 5FPMA 1KAZA 4K41A 5AZIA 4XH5A 1TYQB 1ZXOA 1MDUB 4BRQA 2ASPA 3FZKA 3W3DA 1BUPA 5ADXA 4JHDA 4M63C 4A2BA 2UYTA 4H0VB 1U2VA 5EX5A 2QW9A 2Q31A 2ITMA 4CZHA 5EY4A 5CE3A 4QS8A 1SAZA 2HF4A 2YJEA 2P9UA 3FR0A 3U9ZA 4BC5A 2P9SB 2PBDA 3D2EA 1GLJO 3JS6A 2P9KA 2CGJA 1BWFO 4JN4A 4AM6A 4CZEA 4IZ9A 3D2FA 4PL8A 3CERA 4BRPA 5AZJA 3H3NO 1Y64A 1IJJA 2A3ZA 1SQKA 3EO3A 4B1UB 3IUCA 1G99A 3BF1A 1T6CA 4BVPA 5AQHA 1C0FA 4EIAA 4BR4A 1NGHA 2AA4A 4BR7A 4Z94A 2QWRA 5F0XA 5BRDA 2FLOA 2F9TA 1DKGD 5AQLA 4BRNA 2QWNA 1NGJA 4WQ4C 3UKRB 1NGIA 2GWKA 4BRFA 3FZMA 3VPZA 3A5MC 4B1ZA 3B8AX 3GL1A 4B1XB 3EN9A 1JCGA 3R9PA 3HBTA 2Q0RA 2P9NA 2E2NA 1NM1A 2E20A 4BREA 1Z6RA 1HLUA 1HKGA 2A41A 4H5VA 1IG8A 2CGLA 3GE1A 4NO7A 3HM8A 3WT0A 1HKBA 4RTFD 2NRHA 3H46O 2NZTA 5AQFA 3WXJA 2FXUA 3SJHA 3RSEB 3ULEB 3MN5A 3O8MA 4IO8A 2YI1A 1GLBG 3SMPA 4K43A 4FWMA 2NLXA 5FPDA 4BG9A 4C23A 1HKCA 1BG3A 3DXKB 2BUPA 3FGUA 4EHTA 3C0BA 3UB5A 4CZLA 1GLFO 1SZ2A 4JAXA 3SLCA 2V51B 1NLVA 5FPNA 2V7ZA 2GWJA 1U6ZA 3ENOA 4FWSA 3LM2A 1NBWA 4KBOA 3ZEUB 3EZWA 5EXWA 5LJVA 2ZWHA 3QICA 4DCHA 5FPEA 3KZBA 3WEEB 4FWKA 5TKYA 1NWKA 5BN9A 3VEOA 5AQPA 3W0LA 2Q1NA 3GDQA 4BC3A 3D7EO 4CZGA 1KAXA 3R6MA 3CJ7A 3M3ZA 1YVNA 5AQUA 3VEZA 5AQJA 4FWOA 1TUYA 4WQ5A 3VETA 2I7PA 3H1QA 4EAHD 2AP1A 4JD2B 4K25A 2D0PA 4H5TA 2ASMA 1GLCG 3AAPA 3BP8A 3I8BA 4H03B 4FL9A 3A0IX 3VF6A 2EWSA 3MCPA 2P9PA 4PL7A 1DGKN 1QZ6A 4I6MA 3MN9A 3AY9A 2VYPA 2GUPA 3IMXA 4BRGA 3LL3A 3CJ1A 1Z05A 4WYBA 2HOEA 4MLEA 4CBWA 5JMVA 2E1ZA 3M6GA 2QXLA 3IDHA 1BO5O 3AAQA 2E2PA 2YJFA 1ESVA 3GOIA 3QB0A 2P9SA 2FSKA 1K8KA 1XUPO 4CZJA 3ZETA 4BC4A 3F9MA 1KXPA 3H6EA 5B8HA 3I33A 1NGDA 3BF3A 5KPZA 2KHOA 4BG8A 2ZGZA 3A5OC 1HPMA 3MN6A 4BRHA 1HUXA 3M1FA 1GLDG 3WXKA 4AM7A 3QBWA 3U4LA 3CJBA 1X3NA 3O4WA 3VENA 2YHWA 5AZIB 2P9IB 3ZX2A 4Y0WA 3WXLA 4CZIA 2P9LB 4H5NA 4B1YB 1BDGA 2Q2RA 1NGCA 1KAYA 5AR0A 3C7NA 5KQDA 4JHDB 1DEJA 2GTDA 2H3GX 3P4IA 1RGIA 2QWOA 4BRMA 5JICA 1WOQA 4J8FA 3UKUA 4CI6A 4H0YB 3FZLA 5E84A 2P9UB 4RWTA 5AQSA 3VGKA 2I7NA 3D2EB 4BQZA 4BVOA 3FZHA 4PKHA 1JCEA 2P9KB 4CZKA 4GNIA 2D1KA 4A61A 3RSEA 5BRFA 4H5WA 3H1VX 3DAWA 3D2FB 1S3XA 1NGFA 1ATRA 5AZJB 2BTFA 5BPMA 3ZX3A 4YDUA 3CQYA 3L4IA 5AQIA 3EL2A 4MLHA 3VOVA 2PAVA 3CI5A 3KVGA 1HJOA 1R59O 1GLEG 3FE1A 1BU6O 3A5LC 4IXCA 2E2QA 3DXMA 1TUUA 4CZFA 4O8KA 4BROA 4WQ5C 3WQTA 2CH5A 4M7YA 1D4XA 5JLHA 4FOEA 2QWMA 4FWNA 4CBXA 3QFUA 1X3MA 3WEEA 4H0XB 5AQQA 4EFHA 5AQKA 5EOYA 4BRLA 4FPAA 4BR0A 5F1XA 4CD3A 4HWIA 1QQNA 4CJ7A 1NMDA 3HSCA 3TU5A 2A6AA 3U8XA 2YCHA 5LY3A 4CZMA 2VWBA 3LDLA 3LDOA 5AQMA 4B1WB 3VEVA 2IVPA 2Q36A 4NB4A 1J6ZA 2OANA 2W40A 3R8EA 5BREA 3TPQA 4A62A 1NGEA 2J4RA 4M7XA 3VF4A 3WUHA 4EHUA 2CGKA 1RFQA 3MDQA 4FWQA 5ADXH 2QM1A 4BRDA 5LJWA 2HMPA 1QQOA 1TYQA 5AFUH 3VESA 3U9DA 3J8AA 4CD1A 3FFKB 4XH1A 4BRAA 1JCFA 1YXQA 4QS9A 4PKGA 5EVZA 3MN7A 2D0OA 5AQWA 3ID8A 5F2RA 4H0PA 2DPNA 1S22A 1YAGA 1ZC6A 2D4WA 2FSNA 2E2OA 1OKJA 1GLLO 1WUAA 2V7YA 1XC3A 3O80A 4BRCA 4BRKA 1QZ5A 2FSJA 4H0OA 3CJ9A 3L6QA 2HF3A 3O6WA 1YUWA 4GY2B 1LCUA 4FWPA 2P9PB 5I9EB 4BGBA 4I6MB 2P9IA 3CHWA 1XQSC 1BOTO 4DB3A 2FF3B 1H1VA 2P9LA 3ATUA 3LDQA 5KPRA 1BA1A 5BRHA 3KHYA 4H0TB 1ATNA 2ZF5O 3UKRA 3VF2A 5E26A 5BPLA 5AFUA 2QWLA 3EKSA 4BR2A 4JNEA 4YDUC 3FLCO 2IVNA 1GLAG 3LDPA 5JLFA 3O5BA 1P8ZA 1K8KB 3OHRA 1U2VB 3ZETB 4FO0A 1T6DA 1MWMA 4BGAA 2Q0UA 1BA0A 4L3QA 3CJAA 3QBXA 3CQXA 3FZFA 5KPTA 3QMLA 5AQGA 1Q18A 2E1YA 4DHYA 4FWRA 3ULEA 4B1VA 3QFPA 5AQXA 4CBUA 1HX1A 2YHYA 1X9JA 2A42A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2G8KA 2G8IA 5AQVA 3PO5A 3K59A 4FVUA 3L2UA 2E88A 3QLHA 1QHAA 3THWA 3C6TA 1KLMA 2A5XA 3UKUB 4MO5A 2ZGYA 4DFKA 3DOLA 1IG9A 2WUSA 5CZ1A 3OS1A 2ASOA 4I2QA 3RMAA 5AQTA 3VGMA 1VHXA 1DTQA 3D45A 3S3NA 2OCEA 1M90O 4DSJA 1C0MA 4DSKA 1L3SA 5BPNA 4LC9B 1W2BM 3K5MA 4JD2A 3VGLA 3TARA 1MA9B 1NKCA 1NK7A 3BEXA 1Q9YA 2KTQA 3IRXA 4IJAA 4RW4A 3SAHA 3ZT4A 2FF6A 4BC2A 3LWLA 1XHXA 4DF8A 4CEEA 3VERA 3B6OA 3SAGA 1TL3A 4FSVA 3CCQN 4DFJA 4F9OA 1ATSA 2IIRA 1KQSM 4JKGB 3ZX0A 3D0PA 1RBUA 2HNYA 1RT4A 1NGAA 3H3OB 4E1JA 4CHNA 5HRSA 1NK8A 3EE9A 3LPTA 1WSGA 2UUBK 1HNWK 4FOIA 4IFEA 2YNGA 1NK5A 4JI8K 4QCLA 3AO5A 4O0IA 4M42A 3T69A 3NH0A 3HI0A 4M3WA 3BUZB 3O9QA 4LSLA 4BY9C 1QVFM 3M5RA 1KAZA 1NKBA 3EY1A 1WLJA 3A2FA 4KH6A 1IBKK 3B6PA 3FZKA 1JL2A 1BUPA 2XY8A 5KI6A 5ADXA 4M63C 3SQ0A 4DTMA 4B8AB 1EETA 4NCAA 5HRNA 2QW9A 3AO1A 2ITMA 4CZHA 4GV3A 4QS8A 1SAZA 1BGXT 3AVKA 3AVMA 4FJ9A 4G9ZA 2PBDA 4DTUA 2E4LA 2PYLA 4KH5A 3CD6N 4JN4A 3ZSXA 2BANA 1SV5A 4CZEA 3D2FA 4PL8A 3HPGA 3NE6A 1SQKA 3CCJN 3IUCA 2Z1JA 4KB0A 4CJQA 3PIOL 1TK5A 1NKEA 4Z94A 5F0XA 5BRDA 3G6EN 3OYJA 3OA9A 4FLWA 4MQ3A 2GWKA 4BRFA 3OYGA 4CK2A 2PYJA 3AO4A 4MDAA 3ZSOA 4X66K 5AJ3K 3GL1A 1LW0A 4CW7B 1JCGA 4E0DA 3WNEA 5M1PA 2E20A 1RBVA 3MEDA 2A41A 4FJMA 4H5VA 2CGLA 3WT0A 3HM8A 2QKKA 4R79A 3DLGA 1T3VA 3EE8A 3H46O 3L2VA 4X62K 5AQFA 3L2WA 1DTTA 3ULEB 1C1CA 3HRGA 1GLBG 5FPDA 1VSDA 1FXXA 2OTLN 4ID5A 1LV5A 4JI0K 4C23A 3SBTA 1HKCA 3L3UA 4DSEA 3DXKB 3SJJA 1LWEA 3MX2A 4LF4K 1GLFO 1SZ2A 3HOTA 3MX5A 3QEXA 4BDPA 1RDAA 1BI4B 1U6ZA 4OLAA 4KBOA 3ZEUB 2VG5A 1LWFA 3T1HK 3V1OA 4KTQA 4F3OA 3WEEB 3W0LA 1NWKA 4OJRA 2Q1NA 2HHTA 3AA2A 4W5QA 4AILC 3K9JA 3VEZA 4FWOA 4FZYA 4V19S 2B5JA 3VQCA 2I7PA 5D3GA 3ZSYA 4C8OA 1LWCA 2O4IA 3BP8A 3TWHA 2HHHK 4FL9A 3NDKA 1I94K 3S5TA 1VSKA 3MCPA 1HYSA 3D6RA 4PL7A 1DGKN 4ILJA 4N47A 4H8KA 1UA1A 2GX9A 2GUPA 4KH4A 4K0KK 4BACA 3CF5L 3F2KA 3HL8A 2O8DA 4MDBA 1HNXK 3OW2M 4CJ5A 2QXLA 4F4KA 2YJFA 2RE2A 3TAMA 2O8CA 2KFNA 1KVAA 2XO7A 4FJLA 2FSKA 4CEQA 3JYTA 1K8KA 4CZJA 3ZETA 4JV5K 3OYHA 1KXPA 1EKEA 4C8NA 2VQEK 1CZ9A 4AHTA 5HRRA 2ZGZA 4NCGA 5HLFA 3TAQA 4LF9K 4DR3K 1A5XA 3MEEA 4QOZB 1N33K 2C1GA 2DFHA 1X3NA 2KLAA 3IS9A 4U67L 2O8FA 2YHWA 1T05A 2HVIA 1IH7A 2ZJPL 3H08A 4KHNA 3C94A 3OYAA 3LP0A 2ZJRL 3MECA 4YORA 3THXA 1BDGA 3K0SA 1KAYA 4FZXC 1DEJA 1EX4A 2QWOA 1HMVA 2C1IA 4IOXA 2HNDA 4BRMA 5JICA 2DTUA 1K9MO 4B9NA 3FZLA 5E84A 5GADP 3NH2A 2P9UB 3IKMA 4F2SA 2IGIA 3D2EB 2BH1A 5M1QA 1JCEA 4Z4IA 3CC2N 2D1KA 4A61A 1VQ6N 3C6AA 5BRFA 4H5WA 3H1VX 1S3XA 1UA0A 5C0YA 4A59A 4OO1J 4YDUA 3L4IA 3LPUA 1N5YA 3IG1A 3VA3A 2PAVA 4B3MK 5SZTA 4NXMK 3K57A 2HHXA 3ZLJA 1GLEG 1BU6O 4LSNA 3A5LC 4W5OA 2YNFA 4BE2A 3K9KA 5KGWA 4WQ5C 2CH5A 2HBMA 4LH4A 4BWMA 1OH8A 3QFUA 1X3MA 3WEEA 4EFHA 4DU3A 4BEBA 4BRLA 3ENBA 1TK8A 3O9SA 4CD3A 2X74A 1QQNA 2HBJA 4CJ7A 3U8XA 3TI0A 2NUBA 3HT3A 4Z4CA 2YCHA 5J2MA 4JI2K 1Z25A 3VQ6A 3LDLA 4JEPA 4E89A 4B1WB 1HR0K 3P1GA 4NB4A 4DR4K 1JL1A 1JXEA 3R8EA 4A62A 1D5AA 4AHRA 4EHUA 2FBTA 1T7PA 4B9VA 3G4SN 4M45A 1S6PA 5ADXH 2QM1A 2G8HA 1QQOA 5C25A 3VQ8A 3U9DA 3QEIA 4F8RA 4CD1A 2Z1IA 3PLAA 5HOOA 5GAHP 4KB1A 5EVZA 5F2RA 5AQWA 3ID8A 1OVYA 1L3TA 2HHIA 3QETA 4B3OA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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