3TPQA

Crystal structure of wild-type mal rpel domain in complex with five g-actins
Total Genus 120
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
120
sequence length
371
structure length
346
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVVGDEAQSKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Sensing actin dynamics: structural basis for G-actin-sensitive nuclear import of MAL
pubmed doi rcsb
molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
molecule tags Contractile protein/transcription
source organism Mus musculus
total genus 120
structure length 346
sequence length 371
chains with identical sequence B, C, D, E
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-09-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3tpqA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3tpqA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3tpqA03
4BC3A 3CHWA 4B1UB 3H3OB 3CQXA 2NLXA 2NZTA 5AQMA 3VEYA 3BUZB 4DQ8A 3UKRA 3WEEA 5AQLA 1J6ZA 3UKUB 3MMVA 3HZ6A 4FWNA 3O6WA 3A0IX 2FF3B 3DWLA 4O5FA 3O1WA 3IFRA 1X9JA 1QQNA 4I6MA 5KQDA 3MDQA 4H0XB 4GY2B 3RSEA 4BRKA 4XEIA 2FXUA 1DGKN 1DKGD 1TUUA 4MO4A 3SK3A 3ZEUB 2QWNA 4A2AA 4FSVA 3VF2A 1TUYA 2KHOA 4EAHD 2P9SB 5AZJB 2YHWA 1E4GT 3B8AX 3HBTA 3LDQA 5JLFA 3CJBA 4MLHA 2P9IA 4BQLA 3C7NB 3SMPA 3D2FB 3R8EA 4BR5A 5AQRA 2Q2RA 2E2NA 5FPDA 3I33A 3JS6A 4BRLA 3BF1A 1IJJA 2E1YA 3CERA 1XQSC 3EL2A 4L3QA 3VGLA 4K43A 4BRHA 3DXMB 1ATSA 3FZFA 4PKGA 3LM2A 1ZXOA 2QWMA 1QHAA 1E4FT 3VF6A 3H45C 1JCFA 3AAPA 1JCEA 4BRPA 2FSJA 1C0GA 1JCGA 3H3NO 4FWRA 5E84A 2GWJA 3SLCA 4H5TA 2YJFA 4BG9A 3GL1A 1NGFA 1XUPO 5AQWA 2NRHA 3VEZA 1HKBA 1IG8A 2HF3A 1BU6O 3O80A 2P9LA 2YCHA 2P9IB 3FR0A 4JNEA 2I7PA 3ZX2A 1Z6RA 1HPMA 3VEOA 3LM9A 3CJ7A 5F0XA 3QFPA 4K41A 4BRAA 3FZMA 3VEWA 4CBWA 4BROA 1CZAN 3JXUA 1S3XA 2GELA 3O5BA 4EFHA 4DB3A 3HTVA 1YUWA 2PAVA 3MN7A 5AQPA 1KAYA 4BC2A 3EKUA 4BG8A 1HJOA 5BPLA 2HMPA 3H46O 1HKGA 5ADXH 2IVPA 3H1VX 1MWMA 5AQJA 2IVNA 2A42A 4CZHA 4E1JA 2D4WA 4B1ZA 2QWQA 3KVGA 3LDNA 1ZBSA 2D0PA 4MLEA 4BC4A 1HX1A 1NGJA 2W41A 4PL7A 1NWKA 1BA1A 5AQSA 4PL8A 4Z94A 4BR9A 5JLHA 3DXKA 1BOTO 2FF6A 1NGGA 4MO5A 1U2VA 3A5NC 4K42A 5AZIA 4GNIA 3A5LC 4QS7A 3M1FA 4CBXA 2A6AA 2E2OA 4RTFD 3ENHA 1V4SA 3M6GA 3QBWA 4H0TB 3UB5A 3FLCO 3KZBA 4HTLA 5BPNA 2E88A 4QS9A 4EHTA 2W40A 2A40A 4B1XB 3CETA 2Q31A 2ASMA 2CGKA 3ULEA 3U9ZA 4CD1A 2QXLA 2GWKA 4FOEA 1QZ5A 4IJNA 5AQHA 1BUPA 3DJCA 5TKYA 4BGBA 4BR0A 1NMDA 4B1VA 4EIAA 3SJHA 5F2RA 3ZETA 4AM7A 4EHUA 4BRNA 4M63C 4XH4A 4BQZA 2QWLA 2ASPA 3P4IA 2E8AA 3R9PA 4IO8A 1BG3A 1NM1A 4HWIA 5JICA 3CQYA 3VGMA 2V7YA 2GTDA 3DXKB 2A3ZA 4H5NA 5EX5A 4BRFA 5AQTA 2QW9A 2I7NA 3ATUA 4RCHA 4BR2A 4CD3A 4IJAA 2A5XA 3WXKA 3UKRB 3TU5A 3WEEB 3VEVA 2Q0UA 3EO3A 4RWTA 4FWOA 3VEXA 4BR7A 3FZKA 1TYQA 4I6MB 3RSEB 5AQKA 2P9UA 4WQ4A 1X3NA 3MN5A 2YHYA 4H0YB 4C23A 1NGEA 5F1XA 3LDOA 3L6QA 3HM8A 1GLBG 2E2QA 4JHDA 4B1YB 4LC9B 3ULEB 4CZEA 5FPEA 3O08A 3WQUA 3FZLA 3AY9A 3EN9A 3FE1A 5FPNA 2VWBA 2P9PA 5EVZA 4NO7A 4WQ4C 1EQYA 2E2PA 2DPNA 3WXJA 3G25A 2A41A 3QMLA 1NGCA 3ZX3A 2IIRA 1LCUA 3ID8A 3F9MA 4CZMA 3VENA 2AP1A 3MK6A 1GLAG 1ZC6A 3GG4A 1QQMA 3CJAA 1U6ZA 3D2EA 2Q97A 5BPMA 1S22A 4YDUA 4JD2A 3IDHA 4FWLA 1GLJO 1HLUA 2P9KA 2AA4A 1GLEG 4FWMA 3U8XA 3J8AA 1X3MA 4FPAA 4QS8A 3VESA 1GLDG 3C0BA 4FWKA 4BRDA 2PBDA 2OANA 2WUSA 1Z05A 2P9UB 4H5VA 3CI5A 3IUCA 5JMVA 2GUPA 3U9DA 4YDUC 4BRCA 4AM6A 1HKCA 3UKUA 3MN9A 3DAWA 1KAXA 3FZHA 3VERA 2P9LB 5LY3A 2YI1A 3ATVA 5BRDA 3KHYA 5KPTA 3VPZA 3LDLA 2QWOA 2V52B 3ZEUA 5AQVA 1T6DA 2F9WA 1BWFO 4CZFA 1RDWX 4BRIA 3LL3A 5ELZA 5AQYA 5AZJA 2HOEA 3QICA 3QBXA 1XC3A 3L0QA 3D2EB 4IWVA 1P8ZA 3VOVA 2VCPA 3SMSA 1MA9B 3C7NA 3O1BA 2P9KB 1H1VA 5CE3A 2BUPA 2HF4A 5AQIA 4BREA 4FOIA 2FSNA 1NGAA 3ENOA 1QZ6A 3M3ZA 1MWKA 2UYTA 3DXMA 2F9TA 2CH6A 3L4IA 5KPZA 1BO5O 1YXQA 4BRMA 4BVOA 4K25A 4PKIA 5AQFA 5AQQA 3VETA 1HUXA 5AFUH 4BRQA 1BDGA 1SAZA 3QB0A 3LDPA 5LJVA 2Q1NA 3R6MA 5AFUA 3I8BA 2YJEA 4B9QA 3D7EO 1NLVA 4H5WA 5BRFA 1D4XA 3A8YA 1RGIA 5E26A 2EWSA 2QWRA 3A5OC 4BC5A 1U2VB 4CBUA 3WUHA 3WT0A 4H03B 2H3GX 5AZIB 4BGAA 4CI6A 4NB4A 4KBOA 5BR9A 1QQOA 1YAGA 5EY4A 3CJCA 5KQ8A 2BTFA 1MDUB 1SZ2A 2D1KA 4CZJA 1SQKA 2E20A 2ZGZA 2J4RA 1LOTB 1NBWA 3QFUA 3AAQA 3UE5A 5AR0A 3CJ9A 3O8MA 4WYBA 4FWSA 3W0LA 4DHYA 2V51B 1C0FA 4ISEA 2VYPA 1R59O 3A5MC 3H6EA 5AQNA 3EZWA 5BN8A 1NGIA 3BEXA 3ZETB 4A61A 3O4WA 3FGUA 4JN4A 3AARA 3WXLA 5LJWA 1Q18A 4BRGA 1K8KA 5AQOA 2ITMA 2P9NA 1Y64A 4A2BA 4WQ5A 2Q0RA 2ZGYA 4PKHA 4FL9A 3IMXA 3WXIA 3MN6A 2CGJA 4CZKA 3CJ1A 4BR4A 5BRHA 1GLCG 2CH5A 2V7ZA 1WOQA 4JAXA 1YVNA 1T44A 4Y0WA 3HSCA 3ZX0A 3TPQA 5KPRA 1NGHA 4WQ5C 4H0OA 3VF4A 1TYQB 3FFKB 3W3DA 4FWQA 2QM1A 4IXCA 4IZ9A 2IVOA 2YHXA 3HI0A 1NGDA 4CJ7A 3H1QA 2ZWHA 2CGLA 1GLLO 4JHDB 3GOIA 2FSKA 3S41A 3GDQA 2ZF5O 5BN9A 3QDKA 4F9OA 1RFQA 4XH1A 2FLOA 4ISFA 2GEMA 2P9PB 4FO0A 4O8KA 2ASOA 3BF3A 3OHRA 1ESVA 1ATNA 2E1ZA 1GLFO 4M7YA 3CIPA 5EOYA 4CZGA 2Q36A 1K8KB 1DEJA 2P9NB 1WUAA 1ATRA 1OKJA 2QWPA 4FPBA 3WQTA 1KXPA 4CZIA 4XH5A 2P9SA 4FWPA 5B8HA 5BREA 5AQUA 4H5RA 5ADXA 4J8FA 4M7XA 5EXWA 5I9EB 1T6CA 4A62A 1G99A 3MCPA 3BP8A 4ISGA 3GBTA 1NGBA 5AQZA 4B1WB 4JD2B 3D2FA 3GE1A 4H0PA 3VGKA 4BVPA 1V4TA 5AQGA 1KAZA 4CZLA 5AQXA 4DCHA 1BA0A 4H0VB 3EKSA 5FPMA 2D0OA 3U4LA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4NYNA 2W42A 1XHXA 3O4QA 1KCFA 5AQMA 3OS0A 3EZ5A 3NMUA 3V81A 1J9AA 5AQLA 3CCEN 1ASUA 4FWNA 2QKKA 3DWLA 3ULDA 1N8RO 1X9JA 3SCXA 1N36K 5M1OA 5HRPA 5C2DA 1NKCA 3SK3A 3ZEUB 4BEBA 2C1GA 4KB1A 2QWNA 3PSFA 3VF2A 4DQIA 2KHOA 5JVGL 2YHAA 3HVRA 1KRPA 4JK7A 2WONA 5JLFA 1DTQA 4DTUA 4NXNK 4OPJA 1C1BA 1TL1A 1WBBA 4DWIA 4QCLA 1HR0K 3SMPA 2EX3A 3P38A 1VSJA 1K73O 5FPDA 3RRGA 4RW6A 2P51A 2YNGA 4A59A 1IJJA 4C8MA 3OVNA 3LWMA 2UUBK 3CERA 1NK5A 3NE6A 1XQSC 4X65K 3AO4A 4K43A 4BRHA 4LF6K 3AVHA 4JKBA 2D0CA 3LM2A 2ZM6K 4KB0A 1Q8IA 4KAZA 3AO2A 1KTQA 4IBNA 2FSJA 4I9QA 2O4GA 5FLXO 5E84A 1BQNA 4H5TA 2YJFA 5JVHL 5I42A 2RE2A 3P39A 1HKBA 1I3AA 4F4KA 1KLMA 4JKAA 4FJHA 4KTZA 3JYTA 1VQ6N 3F9KA 3VQ4A 1HYVA 3THWB 4MDBA 4LFBK 1Z6RA 1N33K 4CVNE 3QO9A 4DU4A 5CYQA 3DRRA 2W6KA 4F3TA 3L2UA 2HBLA 3QETA 1CZAN 4FJ5A 3BDPA 4EFHA 4DB3A 1NNEA 3D45A 3HTVA 1YUWA 3MXJA 4DR6K 1FKOA 4BC2A 4ELUA 4IFYA 3S3OA 3ZSOA 4X62K 4GKJK 1BL3A 1HQUA 1U45A 5BPLA 2NRWA 4KH6A 2HMPA 4YFUA 5AQJA 1MWMA 1KLNA 4E1JA 2FBVA 3G0ZA 2D0PA 4MLEA 4BC4A 4H8KA 1BQMA 3K5MA 1RTIA 1C1AA 3K59A 1SKSA 1BA1A 2KFNA 4KO0A 4KHWA 3CPEA 1ZYQA 4B08A 1RTJA 2UXCK 4K42A 5AZIA 2OYQA 4QS7A 2ZJPL 2VG5A 3M1FA 4RTFD 1V4SA 4CJQA 3FLCO 3NGIA 1NK0A 4HCBA 3PSIA 4MFBA 4IOCL 4CJKA 3K57A 5IT9O 4AQYK 2PYLA 4EHTA 3NCIA 2W40A 3U9ZA 2QXLA 2GWKA 1BUPA 5TKYA 3QINA 3T19A 1NMDA 4B1VA 5F2RA 1IBMK 1RTDA 3ZETA 1GOBA 2E8AA 3PO5A 3CC2N 1EWRA 3CQYA 2DTUA 3SNNA 2UU9K 3P5JA 2QW9A 3VQDA 3ATUA 4BR2A 4IJAA 4DSLA 1MU2A 3MCAB 3WXKA 3UKRB 4LF5K 4LF4K 5C42A 2Z1IA 4RWTA 4U7BA 3U3GA 1VQLN 4DSJA 3KD5E 4OKKA 5AQKA 1X3NA 4Y1DA 2OCEA 4JS4A 3LDOA 3HM8A 1GLBG 1S6QA 1RDDA 5FPEA 5MLCQ 1NG9A 1S9GA 2F7TA 1S1UA 3CXCM 4JS5A 4PY5A 3OA9A 4NO7A 3F5TA 2DPNA 1D9DA 1A5VA 4RG8A 3G25A 3DLLL 1LCUA 4CZMA 4IFEA 4JI3K 1QQMA 3CJAA 1U6ZA 3PX0A 3D2EA 3L3UA 3T1AA 4YDUA 4O4GA 4Q0BA 2P9KA 2AA4A 3KLHA 1X3MA 3SAFA 1GLDG 2ZE2A 3C0BA 4A5BA 4BRDA 1A5WA 2UUAK 2B5JA 3CI5A 3DM2A 4YOWA 4OGCA 4JLHA 3ZSXA 3V1QA 1HKCA 3E9LA 4K8ZA 4IKFA 3ENBA 3T1HK 1SV5A 5AJ3K 4DMNA 3V9SA 1RT4A 1O13A 4LFAK 3SQ0A 3T69A 4NXMK 4X64K 4CZFA 4CK1A 3SPZA 4UY8O 1RBRA 3VQ9A 4BRIA 3LL3A 5AZJA 4WCEL 3PV8A 4BECA 4DFPA 1JLAA 3DLGA 3D0PA 3D2EB 4WF9L 2VCPA 2O8EA 3PIPL 1VRUA 4OPKA 1XMQK 2P9KB 1LAWA 3ID6A 4IEEA 4B9NA 4BREA 1JLEA 4DLGA 3VQCA 1M90O 1Q9YA 2HHVA 4PA1A 1MWKA 5HBMA 3DXMA 2GBZA 5JS2A 4JKCA 1VQMN 5KPZA 1BO5O 3HOSA 3VTHA 3K5OA 2OTLN 4DR4K 5AQFA 3F73A 3MWTA 1BDGA 3AVMA 4FXDA 1SAZA 3QB0A 1RDUA 3LDPA 5LJVA 3DYAA 3R6MA 3D7EO 4DV6K 4FW2A 2DFFA 3CD6N 1D4XA 4JI1K 3QLHA 4K8XA 4JK9A 4BC5A 4JRPA 4CBUA 3ZT4A 4CGHA 2OTJN 4OKJA 4BGAA 4M3RA 3WXMB 1S5JA 3LP1A 1QQOA 1TV6A 5CZ2A 1N32K 1YAGA 3CM5A 3ZT1A 2D1KA 3AV9A 4DF8A 3LALA 5CHIA 2XY8A 2UXDK 3UE5A 4CJ4A 5AR0A 2O8BA 3C95A 4WYBA 1CZBA 1ZBLA 4DHYA 4ISEA 2VYPA 5BN8A 1NGIA 4F2RA 4I2PA 4DSFA 3O4WA 1NMNA 3NDKA 4FJXA 1Y64A 1W0HA 5LMUK 2BDPA 2G8IA 1N5YA 4LFCK 4BE0A 3BZCA 3DOLA 3CFRA 1VHXA 4Z4HA 3NAEA 1GOCA 4CZKA 4BR4A 3QNNA 3AVGA 1JXBA 4JAXA 1T44A 1WNSA 5KRTA 3HSCA 5KPRA 4DLEA 4WQ5C 3RR7A 4NCAA 4JI8K 3OYNA 2BGGA 4DS4A 3VF4A 4AHCA 4FJNA 4FWQA 5HLFA 1TKTA 1Z26A 2QM1A 4IXCA 2YHXA 3RR8A 1C1CA 1VQKN 4CJ7A 3H1QA 1GLLO 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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