3TU5A

Actin complex with gelsolin segment 1 fused to cobl segment
Total Genus 110
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
110
sequence length
370
structure length
370
Chain Sequence
ETTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural States and dynamics of the d-loop in actin.
pubmed doi rcsb
molecule tags Structural protein/actin-binding protein
source organism Homo sapiens
molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
total genus 110
structure length 370
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-09-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 3tu5A02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3tu5A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3tu5A03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3tu5A04
4I6MA 1HUXA 4IZ9A 4KBOA 3H3OB 4A62A 4FSVA 2EWSA 3A0IX 3H6EA 1BG3A 3VENA 4Z94A 2P9KB 4LC9B 5AR0A 4DQ8A 1HJOA 3IDHA 4BRPA 1HKGA 2FSKA 4MO5A 5BPMA 3VGMA 3SK3A 3D2EA 3DXMB 3VGLA 4BR5A 2V51B 4H0TB 5EVZA 2E2QA 3QDKA 3QFUA 5KQDA 3HI0A 2ASPA 1HLUA 3LDOA 1HPMA 1K8KA 5AQQA 3JS6A 4BGBA 2GUPA 2W40A 3H3NO 3L4IA 3CJCA 3CQYA 4BRLA 5F1XA 2Q2RA 3LM9A 3VOVA 2E2NA 3DJCA 3VGKA 1NGJA 3R9PA 3C7NB 2FF3B 4JD2A 1ZXOA 5E26A 3CERA 4MLEA 4GNIA 3OHRA 5AQWA 4DHYA 1ZBSA 1ATSA 3FLCO 4PKHA 4O8KA 4WQ5C 3KZBA 4IO8A 3ATVA 5BPLA 3VEZA 1GLLO 1BUPA 5AQOA 4IJNA 4CZGA 4HWIA 4BRAA 1BOTO 3I33A 4WYBA 3WXKA 4A2BA 2QWMA 1ZC6A 3IUCA 1RFQA 3UKRA 1JCGA 2ITMA 1QZ6A 4A2AA 4BR2A 1DEJA 1NGFA 3ENHA 4FWMA 2P9IA 3EKSA 3TPQA 3M3ZA 2CGLA 3H1VX 5AFUA 1T44A 2ZGZA 2ZGYA 2QWOA 4BG8A 4AM7A 2QWQA 5AQTA 2UYTA 1GLAG 2A40A 4FPBA 4I6MB 3WXIA 4BRQA 5AQRA 3WXLA 3LDLA 1TYQB 3HM8A 2QWRA 3VESA 4BC2A 1GLJO 5AQHA 1WOQA 1NM1A 2QWNA 3LDPA 3FR0A 5AQNA 4EHTA 3L0QA 1YXQA 4BRMA 4BRKA 3VEXA 4WQ4A 5JLHA 4CZHA 2ASOA 2H3GX 3WEEB 3FGUA 1YAGA 2D0PA 5AQVA 2A3ZA 2E88A 4QS7A 4XH5A 1IJJA 4WQ4C 4H0YB 2GTDA 4B1YB 2P9UA 5AQLA 1C0GA 4B1ZA 4B1WB 2Q97A 1D4XA 1K8KB 5TKYA 4PKGA 4FO0A 2A5XA 4M7YA 5AQJA 3U9ZA 1NBWA 3ULEB 3O1BA 3IMXA 1G99A 4EAHD 2D4WA 3UE5A 4CD3A 4PKIA 1NGCA 5JICA 3FZLA 1BWFO 1NGBA 1U6ZA 2A6AA 5LY3A 3DXKA 4JD2B 3VF4A 4ISEA 4CZJA 3A8YA 1V4SA 1TUYA 4BROA 1V4TA 1GLDG 4FWNA 2Q0RA 3WQTA 3CJ9A 3D2FA 4XEIA 1NGHA 1QQMA 4A61A 1KAXA 4H0XB 3SJHA 2AP1A 4K41A 4BR9A 1S3XA 1U2VB 3O8MA 3ZEUB 1E4GT 3H46O 4K43A 1T6DA 3HBTA 2FXUA 2IVNA 2QM1A 3VEOA 3EKUA 3AAPA 3O1WA 4FPAA 3FZKA 3LL3A 4F9OA 4FOEA 4BRGA 1TUUA 4K25A 4MO4A 1ATNA 4H5TA 4CD1A 4FWSA 5I9EB 5AQKA 2YCHA 1ATRA 4RWTA 1DKGD 3F9MA 3BF1A 4YDUA 1ESVA 1DGKN 3VETA 1YUWA 3ZETA 2I7PA 5AQIA 1NLVA 3U4LA 4CZMA 3A5OC 5AQYA 4IJAA 3A5MC 3AY9A 1X3MA 2P9PA 4CI6A 1E4FT 4O5FA 4JHDA 1MDUB 4B9QA 3UKUA 3MMVA 4JN4A 1J6ZA 4J8FA 1LOTB 2J4RA 3I8BA 3ZX3A 3EN9A 3DAWA 4H0VB 5FPMA 5AQZA 3U9DA 4FWKA 3FFKB 3CIPA 1QHAA 3ZX0A 4EHUA 3UB5A 2F9WA 2VYPA 2FSJA 5AQMA 3BUZB 2E2PA 4H0OA 3ZX2A 2P9UB 1R59O 1BDGA 3O08A 2YHYA 2HMPA 3GL1A 2V52B 3AARA 2YJFA 4FL9A 1T6CA 3VERA 4XH1A 4FWRA 1WUAA 3A5LC 5LJWA 3H1QA 2P9LB 4FOIA 3GOIA 4L3QA 4AM6A 3CJ1A 3ATUA 3DXKB 3GBTA 5AQSA 2BTFA 5JMVA 2P9NA 3MDQA 2P9KA 2FLOA 4HTLA 3A5NC 1RDWX 4FWLA 1LCUA 4GY2B 2FSNA 3DXMA 3CJBA 1HX1A 2V7ZA 5BRDA 5FPEA 3D7EO 4Y0WA 3WQUA 4DB3A 2Q36A 3W3DA 4CBXA 2FF6A 3B8AX 3MN9A 2E1YA 2NRHA 3FZMA 3VEYA 5BRFA 4EFHA 1C0FA 1SZ2A 3D2EB 3W0LA 3HSCA 3VEVA 4BVPA 4FWOA 5AZIA 2GWJA 2E1ZA 1XC3A 2VWBA 4BC4A 4CZIA 2P9SA 3O4WA 3S41A 4CZLA 4H5VA 1JCFA 1NGDA 3QMLA 2QXLA 2A41A 3C7NA 3SMSA 3BP8A 5AFUH 3BF3A 3VF6A 1P8ZA 1XUPO 4CBUA 1NGIA 5EY4A 1OKJA 1KXPA 4MLHA 4BRCA 5AQFA 2QWPA 5FPDA 4IXCA 2YHWA 1KAZA 3VEWA 4H5NA 2P9PB 5BRHA 4CZFA 4BR0A 1BO5O 3R8EA 3MCPA 1X3NA 3M6GA 5AQUA 1BU6O 2CGKA 4BRDA 1Y64A 3U8XA 1GLEG 2HF3A 4BRHA 2CH5A 3EO3A 3KVGA 2PAVA 1NGGA 1Q18A 3M1FA 4BC5A 4DCHA 4PL8A 3WUHA 4CZEA 5BN9A 4CZKA 3CQXA 5KPRA 2E20A 3R6MA 3LM2A 4QS8A 4BVOA 5F2RA 4EIAA 5CE3A 4NO7A 2AA4A 3UKRB 2VCPA 4BC3A 2DPNA 3GDQA 3FE1A 4K42A 2BUPA 1QQNA 3P4IA 2P9IB 5AZJA 1JCEA 1NWKA 1TYQA 3O6WA 5AQXA 4E1JA 1MWKA 5KPTA 2ASMA 2QWLA 4BQLA 5KPZA 2YJEA 2P9NB 4IWVA 3L6QA 4B1XB 3CI5A 1XQSC 3RSEA 4H5RA 2V7YA 1NMDA 5LJVA 2IVPA 2GELA 4YDUC 1QZ5A 1GLCG 3QBWA 4QS9A 4BRIA 3WEEA 3AAQA 2NZTA 2PBDA 3ENOA 1MWMA 2GEMA 4CJ7A 3MN5A 1IG8A 3DWLA 3MN6A 3MN7A 3H45C 5EX5A 3ULEA 5AZIB 1SQKA 3QBXA 4BQZA 1NGAA 3BEXA 2CGJA 3KHYA 2P9SB 2GWKA 5F0XA 5KQ8A 4PL7A 3ID8A 3O80A 5ELZA 1RGIA 4WQ5A 5BN8A 1MA9B 1NGEA 3CJAA 3CJ7A 2ZF5O 3CHWA 3WT0A 5AQPA 3GG4A 3LDQA 4NB4A 5AQGA 2F9TA 3QB0A 3EL2A 4B1UB 5BPNA 3QICA 4ISFA 1BA1A 1GLFO 4BGAA 5BREA 3VPZA 1KAYA 1U2VA 3CETA 4H5WA 1QQOA 4M7XA 3ZEUA 1Z05A 2HF4A 4RTFD 5ADXA 2I7NA 1Z6RA 4ISGA 3D2FB 3IFRA 5E84A 1H1VA 2HOEA 2E2OA 2QW9A 2CH6A 5FPNA 3HZ6A 4BR7A 4JNEA 3QFPA 4H03B 3WXJA 4C23A 2YI1A 2IIRA 4BREA 1BA0A 2Q1NA 1GLBG 1YVNA 3GE1A 2WUSA 4FWPA 4BR4A 5B8HA 5AZJB 2IVOA 2D0OA 4RCHA 3LDNA 1EQYA 4FWQA 3J8AA 3EZWA 3SLCA 1X9JA 3ZETB 5BR9A 4BRFA 1SAZA 3JXUA 3RSEB 4CBWA 5ADXH 3TU5A 4XH4A 3HTVA 3O5BA 5JLFA 3C0BA 1S22A 5EXWA 4JHDB 3UKUB 2ZWHA 3SMPA 4JAXA 2D1KA 2W41A 3FZHA 2OANA 3VF2A 5EOYA 4BG9A 3MK6A 2KHOA 4B1VA 4H0PA 4BRNA 2Q31A 1CZAN 3G25A 1HKBA 1HKCA 2Q0UA 2E8AA 2A42A 2P9LA 2YHXA 2NLXA 3FZFA 4M63C
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3ALYA 3K2PA 2KTQA 4KBOA 4CJEA 1ASWA 5DM7L 2E6LA 1KLMA 1I3AA 1NU0A 3SQ0A 1VQ4N 1WAJA 2EWSA 2B4JA 4DFPA 4HCCA 3T1AA 4FJ7A 4M3XA 2P9KB 5AR0A 5KRSA 2HHXA 1RCHA 2HHWA 3VGMA 3D2EA 1HYSA 1NJYA 4JRPA 2HBKA 3QFUA 1NKCA 1S6QA 3HI0A 3OA9A 3LDOA 1K8KA 2GUPA 3MEDA 4B9VA 3L4IA 4C1NK 3LM9A 3TAGA 3HOTA 5J1EA 1NGJA 3R9PA 1HNVA 4JEPA 1IH7A 2YV0X 3J7YP 4JYAK 4GVMA 5M1NA 3TAPA 1TKTA 3OYLA 3L3VA 4KFBA 5HL7L 5CHIA 4O8KA 2QXFA 3RWUA 1RTJA 1QVFM 3KZBA 1TGOA 4Y1CA 5AQOA 1FK9A 4HWIA 4I9QA 4UQGA 5JVGL 2O8DA 3I33A 5C2DA 4WYBA 1UA0A 1WN7A 2QWMA 3NF9A 3B6OA 3UKRA 4KH4A 4WFNL 4A2AA 1HNZK 3K5MA 1C0UA 3EKSA 4FJKA 3HPGA 3DMJA 2CGLA 1TAUA 2ZGYA 1EWRA 3VQ4A 1CXUA 5LL6Z 3SI6A 3VA3A 1O13A 4I6MB 3OBWA 4BRQA 3WXLA 3L8BA 4CFCA 2Z1IA 4BC2A 1GLJO 1Z26A 4B9UA 4KI4A 4YY3K 4DV0K 4ELTA 3FR0A 1HNWK 4EHTA 4KRFA 4I2QA 4R5PA 4X62K 3ZT1A 2H3GX 2ZJRL 3WNEA 1NK0A 3QESA 4FJNA 5CZ2A 2JWKA 2OPPA 2E6MA 3AVGA 3AVCA 1IJJA 1VQKN 3RRHA 4CJVA 4B1WB 3K57A 2Q97A 1ASUA 3EEQA 3OS2A 1F21A 4K8XA 3BGRA 4FJMA 4FO0A 1BL3A 2A5XA 1Q7YO 3ULEB 4EZ6A 1U47A 3E66A 1NGCA 3Q7CA 4IBNA 4YOWA 1RT2A 1BWFO 4DV7K 2FBTA 3DXKA 3VF4A 3A8YA 3AA5X 1TUYA 4F8RA 3VQDA 4BROA 5KGXA 5FROA 3QETA 1GLDG 2Q0RA 3CJ9A 4WCEL 3OVNA 4A61A 1KAXA 3PY8A 3AA2A 3DRSA 1YIJN 2AP1A 3DLKA 3I56N 1SV5A 5J2MA 4CIEA 1U2VB 3O8MA 2QA4N 4NXMK 4CEDA 2G8IA 1T6DA 4AQYK 3HBTA 3C6AA 2FXUA 2P1JA 3ITHA 4CJWA 1BCOA 4WFBL 1JLCA 3MWPA 1VQLN 3U3YA 3BF1A 4YDUA 1BIUA 1YUWA 3ZETA 3LAKA 3TAEA 4LF5K 3A5OC 3KD1E 3NAEA 4JI2K 5SWMA 1RT7A 4CI6A 3CC2N 3PX6A 3O3GA 1IKWA 4O5FA 3CCQN 4B9QA 3UKUA 3MMVA 1J6ZA 3C94A 4E19A 2ZQBA 2RHKA 3THWB 4WF9L 3DAWA 3SPZA 4FWKA 5GAGP 3QEWA 1JLAA 3VQ8A 3C6HA 2NRTA 2F9WA 1OH6A 1EWQA 1C0TA 1WSJA 3ZX2A 4N76A 2P9UB 4FM0A 1R59O 1RDBA 3O08A 4OPJA 3RR7A 5FRNA 4CEZA 1XC9A 2YJFA 4FL9A 3TANA 4XH1A 4FWRA 2F8TA 1YJNN 1ILYA 4B8AB 2G8KA 3A5LC 3SV4A 5TKWA 3K5NA 2NRRA 3HM9A 1XNRK 2P9KA 1RBSA 4HTLA 3ZLJA 4DLEA 1RDWX 4FJJA 4DFKA 1LCUA 4C8KA 3ZSWA 4FW1A 1HNXK 1N6QA 4BDYA 4OLAA 2Q36A 3CPEA 3MN9A 4X64K 4E0DA 4MDAA 1EXQA 4FWOA 2GWJA 4CESA 4CZIA 3MXIA 3O4WA 2DFHA 4CZLA 4H5VA 4JKFA 3HK2A 3CMAN 2W00A 4OVLA 4G1QA 1XUPO 5EY4A 1KXPA 1HRHA 2WFBA 4W5QA 4KI6A 3LANA 4CGGA 1OVYA 3AO3A 4IXCA 2KFNA 3R8EA 2QEXN 5AQUA 2CGKA 1NK5A 4BRDA 1L3UA 1RBRA 3OTOK 3V4IA 3HL8A 2CH5A 1BCMA 3M1FA 1Q18A 3CMEN 2X78A 1VSIA 4CF2A 3OYFA 3CQXA 4OGCA 4Y1DA 3KWIA 3LM2A 4QS8A 4DSJA 4LF7K 4FVUA 1R0AA 4CJFA 2VGNA 5HOOA 1N32K 2AA4A 2VCPA 4KHQA 3FE1A 3G71N 3P4IA 1JCEA 3NGIA 5AQXA 3E01A 4E1JA 2XY6A 3OYKA 4CJ4A 4B9MA 2YKNA 3L6QA 4CJSA 3CI5A 4H5RA 3ID6A 1NMDA 5LJVA 4YDUC 1GLCG 3NGZA 4QS9A 4FZYA 1QVGM 4M3TA 4GMJB 2GEMA 3MN5A 3DWLA 1LWCA 3MN7A 4B08A 3OYJA 1WLJA 3I0SA 3ULEA 3QBXA 4OKEA 4DR7K 3BEXA 4FLYA 3TTFA 2P9SB 2G8UA 3KK2A 3ID8A 2ZJQL 1NMNA 1NK4A 5ELZA 5BN8A 4E72A 3CJ7A 3ZSVA 5AQPA 3LDQA 4NB4A 4B9NA 4FLZA 1TK8A 5KRTA 3T19A 5J2PA 4DSKA 5C15A 1K8AO 4ISFA 1GLFO 4BGAA 2UXCK 1U2VA 3CETA 3L2VA 5HRRA 1LW2A 1Z05A 4RTFD 1Z6RA 3T7ZA 1RBUA 4NCGA 3VQEA 4LF6K 3N4QA 3P31A 3KIOA 4J2EA 1M1KO 2O8BB 3U6FA 1SKSA 5FPNA 3T3FA 3QFPA 4JRQA 2A1SA 5FLXO 2YI1A 5C12A 1GLBG 2WUSA 4W5TA 5EU7A 2YNHA 1VQON 2IVOA 4LF4K 2D0OA 3LP1A 1YTAA 1EQYA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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