3U4LA

Cryocooled bovine profilin:actin crystal structure to 2.4 a
Total Genus 102
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
102
sequence length
370
structure length
353
Chain Sequence
AALVVDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGDSYVGDEAQSKRGIKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMDSGDGVTHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMESCGIHETTFNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural basis for profilin-mediated actin nucleotide exchange.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Actin, cytoplasmic 1
molecule tags Structural protein
total genus 102
structure length 353
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-10-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3u4lA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3u4lA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3u4lA03
2P9UA 4BR9A 1XQSC 1NGFA 2QWMA 4H0PA 4BQLA 4M7XA 2EWSA 4PKGA 5JLHA 1NMDA 1QQOA 4MO4A 3H46O 5ADXA 2E2NA 3O80A 2P9SA 5AQYA 1K8KB 1GLJO 3RSEB 5AZIA 1TYQB 3EL2A 4Y0WA 3W3DA 5EXWA 3EZWA 1Z6RA 2BUPA 1HLUA 2P9IB 1RFQA 1R59O 2IVNA 4FWSA 2ASPA 2GELA 4BC3A 4XEIA 3VF6A 2A40A 2VCPA 4H5WA 1BOTO 4FPBA 3O1WA 4H5VA 2CH6A 3VEZA 3DAWA 5AQTA 3A5MC 2NZTA 3ENOA 1IJJA 5BREA 1T6DA 3VETA 1V4SA 3D2FA 5ADXH 3GL1A 4PL7A 2QW9A 4CD3A 3C7NB 2PAVA 2P9LB 3JXUA 5AZJB 4B1ZA 3J8AA 1ZXOA 2Q0UA 2D1KA 4K41A 2Q1NA 1GLAG 2YI1A 4BRMA 4NB4A 3L4IA 4C23A 4B1YB 4AM7A 4H0TB 1HKGA 2E2OA 2V7ZA 3O4WA 4XH1A 4BC5A 1JCEA 4HWIA 4JNEA 1LCUA 1BU6O 3U8XA 1NGCA 3ZX3A 2CGJA 5F1XA 2HF3A 1HX1A 4NO7A 1QQMA 4F9OA 4WQ5A 4FO0A 4B9QA 2PBDA 3FE1A 3UE5A 4DHYA 4HTLA 4AM6A 2FSJA 4H5NA 5AQGA 5E26A 4J8FA 3SMPA 3FGUA 5LJWA 3GBTA 4FOIA 4DCHA 2I7NA 1MDUB 3QICA 5FPMA 1SZ2A 1GLDG 2V7YA 3CJ9A 4B1WB 2NLXA 5BPLA 1ATNA 2P9NB 2BTFA 1GLFO 3H45C 3I33A 1NWKA 2DPNA 1J6ZA 1QZ6A 2V52B 1GLEG 3VEVA 3GDQA 3DXMB 1QQNA 5LY3A 3FZHA 3W0LA 4CD1A 4IJAA 4BRIA 4IO8A 2YJEA 3VGLA 2FSNA 2YHXA 4Z94A 2GUPA 3U4LA 3WQTA 5FPNA 4H03B 2Q31A 3HI0A 4BC4A 4IJNA 2Q2RA 4QS8A 4BG8A 3LDQA 1BUPA 5AFUA 2CGKA 5EVZA 1BO5O 3BUZB 4CJ7A 4FL9A 3VOVA 2WUSA 3R8EA 1CZAN 3ZETA 3UKRB 3QBXA 4EHUA 4JHDB 2ZGYA 1KAYA 3CJAA 3QBWA 1HKBA 3VGKA 3BEXA 4PL8A 2GEMA 3ZEUB 1DKGD 3L0QA 1U6ZA 3TU5A 4CZLA 3MCPA 3O8MA 4BGBA 3VF2A 5AQWA 4K43A 4BRGA 4BVOA 4I6MB 3ZX0A 4BVPA 2P9UB 4K25A 3M6GA 4WYBA 3H3OB 2W41A 4CZFA 1SQKA 3R6MA 5I9EB 2YJFA 5AQSA 3IDHA 3SK3A 2Q97A 5AQUA 4FWMA 5AFUH 5KPRA 2P9SB 2QWNA 3VPZA 5AZIB 3DXKA 5FPDA 3OHRA 1ZBSA 2ASOA 3VENA 2F9WA 3CQXA 3QDKA 4CZIA 2QWRA 2GWJA 2QWPA 1SAZA 1NGIA 1G99A 4BRQA 3ATUA 4BGAA 1YUWA 3U9DA 2E2QA 4FWOA 3WXJA 3WXLA 5AQIA 4CI6A 2E2PA 1QHAA 1K8KA 3WXIA 2P9PA 3RSEA 1TYQA 3O6WA 3FZFA 5F0XA 2OANA 3O08A 3UKUA 3ULEA 2I7PA 2E88A 2VWBA 1MWMA 1WUAA 3M3ZA 5AQXA 3IFRA 4BRPA 3L6QA 3QMLA 2D0OA 5AQQA 1JCGA 4LC9B 2D0PA 1XUPO 2E8AA 5AQRA 1DGKN 3ID8A 4BR7A 3A8YA 3D2EA 2QWOA 3EKSA 3EO3A 1JCFA 5LJVA 1NGBA 5BN9A 5BPMA 1GLLO 3U9ZA 2KHOA 2ZF5O 3LM9A 4H0YB 1ESVA 1NGAA 1BWFO 4M63C 2ITMA 4CBXA 4E1JA 4B1VA 1P8ZA 3VEWA 4BRDA 1NBWA 2P9LA 5KQ8A 1XC3A 4CBUA 1ATRA 1NGEA 4RTFD 3VERA 4H0OA 2A42A 1GLCG 3FZKA 3LDPA 2QWLA 3AARA 3CETA 4BR4A 1C0FA 4BG9A 2E20A 3CERA 3H1QA 4BRCA 5EY4A 3AAQA 1TUYA 3VF4A 3KVGA 3HTVA 4FWLA 1NGGA 3R9PA 4CZJA 3FFKB 4QS7A 4WQ5C 4H0VB 3EKUA 3H3NO 2E1YA 4MLHA 1HKCA 1ATSA 2YHWA 3CJBA 3FLCO 3P4IA 2ZGZA 4JD2B 2FF6A 2V51B 5JLFA 3CJ1A 5AQNA 4WQ4A 4GY2B 3WEEA 1NLVA 3LM2A 4CZGA 1T44A 3LDOA 4WQ4C 5JMVA 3CIPA 3EN9A 2AA4A 4QS9A 5AQKA 1Y64A 2P9NA 2QWQA 3F9MA 4PKHA 4BRAA 3H1VX 3CJ7A 5AQFA 5TKYA 4ISGA 3LL3A 5KPZA 2P9KB 3WUHA 2FSKA 2HOEA 2AP1A 1X3NA 3ZETB 4BROA 1YXQA 2HMPA 4FWQA 1Q18A 1OKJA 3BP8A 4FPAA 4A62A 4BRLA 3FZLA 4CZHA 5KQDA 3GOIA 3CI5A 1KAZA 1NGDA 1S22A 3TPQA 5FPEA 1KXPA 2CGLA 3HSCA 5AQHA 4BREA 2IVOA 3UKRA 1U2VA 5B8HA 5BN8A 1BDGA 1RDWX 2H3GX 3KHYA 2F9TA 3G25A 4H5TA 1IG8A 4A61A 4FSVA 2W40A 3ZX2A 2QM1A 3ATVA 4KBOA 3ENHA 2YCHA 4O5FA 4H5RA 4IWVA 3DXKB 4K42A 4ISEA 4H0XB 3DWLA 4BR5A 4FOEA 3CJCA 1S3XA 5BR9A 3FR0A 3H6EA 3KZBA 5AQVA 2Q36A 5AR0A 4FWNA 3A5NC 1E4GT 4FWRA 3S41A 3JS6A 2FXUA 2P9PB 3MN5A 1ZC6A 3WT0A 2VYPA 1D4XA 3UKUB 4IZ9A 3ULEB 5BRFA 4BQZA 2HF4A 4EAHD 4BC2A 2E1ZA 3MMVA 3D2FB 4RWTA 4BRNA 5KPTA 2P9IA 4A2BA 3MK6A 4CZEA 4L3QA 3D2EB 2UYTA 2FLOA 1WOQA 1Z05A 4BRFA 3QFUA 5EOYA 5AQLA 1NM1A 4PKIA 3A5OC 1MWKA 4BR2A 4O8KA 4BRHA 3C7NA 1BA0A 2IVPA 5AQOA 5AZJA 4MO5A 3SMSA 3VESA 3MN7A 2J4RA 4CZKA 3FZMA 4EIAA 4BR0A 3DJCA 4RCHA 1QZ5A 3HBTA 4B1XB 5BRDA 2CH5A 3O5BA 5EX5A 3GE1A 1HPMA 2FF3B 4M7YA 3I8BA 2D4WA 5E84A 1HUXA 3BF3A 4B1UB 3WQUA 2GWKA 1E4FT 5AQPA 1C0GA 1GLBG 4JAXA 4CZMA 3A5LC 3IMXA 4MLEA 3IUCA 5F2RA 2A5XA 3AY9A 3VEYA 1HJOA 3VEOA 4JN4A 2Q0RA 4YDUA 1TUUA 5JICA 4ISFA 3WEEB 1YVNA 3VGMA 4EHTA 1LOTB 1X9JA 5AQZA 3GG4A 3M1FA 5AQJA 2QXLA 3D7EO 4YDUC 3A0IX 3HM8A 4XH4A 3MN6A 4JD2A 3C0BA 3CQYA 2A6AA 3VEXA 2A41A 2IIRA 3LDNA 5CE3A 1V4TA 5BRHA 3DXMA 5ELZA 2ZWHA 4BRKA 3QFPA 4XH5A 3UB5A 3LDLA 1X3MA 5AQMA 1NGHA 4GNIA 2YHYA 1YAGA 4FWPA 4A2AA 1KAXA 2ASMA 1BG3A 1DEJA 2GTDA 3MDQA 4EFHA 3SLCA 1RGIA 2P9KA 3MN9A 4DQ8A 1NGJA 3BF1A 3O1BA 1H1VA 3HZ6A 4JHDA 2NRHA 1U2VB 4IXCA 1EQYA 3CHWA 3ZEUA 3WXKA 3AAPA 4FWKA 1BA1A 2A3ZA 1MA9B 3QB0A 4I6MA 4CBWA 5BPNA 3SJHA 1T6CA 4DB3A 3B8AX
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4BR9A 1NGFA 2QWMA 3NHGA 3OBYA 4LH4A 1SL0A 1KLMA 1GLJO 5AZIA 1TYQB 3EL2A 3W3DA 4CFAA 3ZSOA 5EXWA 3EZWA 5C2FA 3HSTB 2PZSA 4FWSA 1KFSA 4DU1A 2IOCA 3BZKA 4XEIA 2A40A 4BC3A 3O4NA 1IKWA 4BE7B 1BIUA 1K6YA 2OYQA 3O9RA 1JLEA 2UUAK 2HHVA 3A5MC 4GKKK 3ENOA 4YOYA 2O8DA 1WLJA 5ADXH 4PL7A 3GL1A 1J9AA 3M8SA 2PAVA 2ZE2A 1S6PA 2QKKA 4IFVA 3IS9A 2Q1NA 1GLAG 3ITHA 1XNQK 3L4IA 4C23A 4DR7K 5SWMA 4JI5K 2O8CA 4H0TB 2LSNA 3NMUA 2E2OA 4BC5A 4HWIA 1LCUA 1KLNA 1WSGA 2VGNA 4N5SA 1ITGA 4KHSA 2KZZA 4LF7K 3C6UA 4KFBA 1M1KO 3SV4A 2HF3A 4PQUA 4FM2A 4DR4K 1QQMA 4AHVA 1RNHA 4OPAA 3FE1A 3OVNA 1UA1A 4MDBA 3PLAA 2FSJA 4BE1A 3TAPA 5E26A 2YKNA 3SMPA 3FGUA 5I42A 4YOWA 3P38A 2X74A 1MDUB 3OYDA 3CJ9A 1EXQA 3H45C 3I33A 1NWKA 1XNRK 4YOUA 2O8FA 1QZ6A 4DQPA 3VEVA 5LMNK 3FZHA 3W0LA 4CD1A 4IJAA 3AVMA 3QEIA 3VGLA 2FSNA 3PIPL 4Z94A 2GUPA 4KH6A 3U4LA 5FPNA 2HHXA 4CGHA 4E7JA 2XY8A 5J2QA 3LDQA 1N32K 1KRPA 4FL9A 4DSLA 3VOVA 4NXMK 1OVQA 3AVKA 4KO0A 3QBXA 1U45A 1S5JA 4JHDB 4GKJK 1YITN 1KAYA 3QBWA 1HKBA 5HP1A 3VGKA 3BEXA 4F3TA 4PL8A 4DQQA 2HHTA 1DKGD 3TU5A 4CZLA 3G0ZA 2RF2A 3O8MA 4LF9K 3O4QA 2OTJN 3OBWA 4BVOA 4JI7K 4FXDA 4I6MB 1N33K 3HOTA 4OLBA 2BGGA 1GOCA 4K25A 4BY9C 1VK0A 3H3OB 2W41A 1SQKA 1CXUA 2YJFA 3SK3A 5AQUA 4FWMA 5AFUH 1RDBA 3CCSN 1FJGK 5FPDA 3VQAA 1LAVA 2ASOA 3HL8A 4CZIA 4YY3K 4FK4A 4ZTFA 3HOSA 4V19S 3QESA 2W42A 1EWQA 5HL7L 1W9HA 4X65K 2E2QA 2DFHA 4CI6A 1K8KA 2P9PA 1WSIA 3RMDA 5F0XA 2I7PA 2WBNA 1MWMA 2D0OA 1JCGA 4DWIA 4U67L 1B9DA 5AQRA 2WFBA 4CEEA 3PV8A 4DQSA 5LJVA 1N36K 2O4IA 4CGJA 1GLLO 3QETA 2ZF5O 3LM9A 4JKDA 1S1XA 4H0YB 2E4LA 5JVHL 4M63C 1P8ZA 3V1OA 4BRDA 4CEQA 1SV5A 4CJ4A 1HYVA 2EX3A 3V1RA 1XC3A 4F4KA 1ATRA 4HVJA 4PHTX 4M3ZA 1C0TA 3CCQN 1C6VA 3S3OA 4GMJB 2QWLA 1NMNA 4OVLA 1EO1A 1JLBA 4FJHA 4DTUA 3SAHA 3ID6A 3CERA 5EY4A 2QA4N 3AAQA 1TUYA 4FJ5A 4FWLA 1NGGA 1YJNN 4B3SK 4QS7A 2Y1IA 3QNNA 2I5JA 1ZYQA 1IKXA 2DFEA 1HMVA 1GOBA 3MWPA 2RKIA 4CK2A 2ZGZA 4JD2B 3OYBA 5JLFA 1E3MA 3MEDA 4W5OA 1LWCA 3TAEA 5M1KA 1NLVA 3T1YK 4PWDA 3VN5A 3SBTA 1RT4A 4WQ4C 1T8EA 1VQ6N 3BGRA 4FLTA 5KRSA 4IO9L 3CJ7A 5AQFA 5M1PA 4BDYA 4CJRA 2FBXA 2FSKA 5HRSA 2HOEA 3OS0A 1CZBA 1JLQA 3ZETB 1SKRA 1YXQA 2HMPA 4JLHA 4FWQA 3AVIA 4A62A 1QSLA 4B3TK 1JL1A 5KQDA 4W5TA 3GOIA 1ASVA 1D5AA 4ICLA 3OYAA 3T19A 3TR8A 3NH0A 3NGZA 1B9FA 1T7PA 4AHTA 5BN8A 4E7HA 1BDGA 1HR0K 3SAFA 3SQ4A 1HNWK 4M3TA 2BH1A 3DLRA 1T03A 1QQCA 3MEGA 4FSVA 3JYTA 4CHOA 5C15A 2YCHA 3K9KA 4IWVA 3DXKB 1YF5L 4K42A 4NCBA 1TKDA 4IEIA 3FR0A 5H1SQ 4DTNA 3H6EA 4KI6A 3KZBA 1NK5A 1E4GT 4FWRA 2B4JA 3MN5A 3DYAA 4Z4GA 1ZC6A 3WT0A 3ULEB 3HYFA 1ZBFA 4FJJA 2QEXN 4BRNA 3V4IA 2P9IA 4A2BA 4CZEA 1NK9A 1HNIA 2FLOA 3CCEN 5HRRA 5GIPA 3G10A 1X9WA 1HNXK 4FJ8A 1D8YA 4BR2A 3C7NA 3MXIA 3TTFA 3RTVA 3QNOA 2IVPA 3AA5X 4BWMA 3V81A 5M1OA 2J4RA 1SUQA 2XY6A 4LSNA 4I2QA 4FW2A 3HBTA 2CH5A 4F3OA 1HPMA 2HBLA 5T7BA 1Q9XA 3I8BA 4CJLA 1LW2A 3KK2A 1LV5A 5FRNA 3S5TA 1Q7YO 1UWBA 2DFFA 5GIOA 2ZD1A 3DRSA 2BE2A 4JK7A 4DUZK 3AY9A 3VEYA 1NK7A 2XHBA 1WN7A 1VQKN 4AHRA 3OJUA 3I0SA 3VQBA 1XMQK 3CD6N 1T3VA 4EHTA 1LOTB 3I56N 4PY5A 2O4GA 3D7EO 4DR5K 3VQQA 3VTHA 3HM8A 4XH4A 1TL1A 3C0BA 3VEXA 4B9NA 4CCHA 4IFEA 3DOKA 4BRKA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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