3U8XA

Crystal structure of a chimera containing the n-terminal domain (residues 8-29) of drosophila ciboulot and the c-terminal domain (residues 18-44) of bovine thymosin-beta4, bound to g-actin-atp
Total Genus 112
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
112
sequence length
366
structure length
357
Chain Sequence
TALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title How a single residue in individual beta-thymosin/WH2 domains controls their functions in actin assembly
pubmed doi rcsb
molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
molecule tags Contractile protein, protein binding
source organism Drosophila melanogaster
total genus 112
structure length 357
sequence length 366
chains with identical sequence C
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-10-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3u8xA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3u8xA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3u8xA03
1EQYA 3IMXA 1Z05A 4H5TA 4FWLA 3VF2A 4GNIA 3AARA 4YDUA 3RSEA 5ADXA 3WXJA 2QWNA 4FWOA 2YJFA 4E1JA 1DGKN 3H1VX 3GDQA 1NGEA 3EZWA 3JS6A 2P9IB 4JNEA 4JD2A 3C7NA 3MN9A 2E2NA 2F9WA 4BRMA 5EVZA 1NGBA 1NBWA 3LDLA 2H3GX 3CJCA 3M1FA 4H03B 4FWKA 4A62A 3O80A 2GEMA 3LDOA 5AQQA 3QICA 1SQKA 4BRHA 4JN4A 3H6EA 4CD3A 2YI1A 4FOEA 4PKIA 1YAGA 4FWQA 3C0BA 3LDNA 3ENHA 2E2QA 3VGMA 4QS7A 3UKRB 3SMSA 2D0PA 2P9NB 1C0GA 2FF3B 4O5FA 3BP8A 3ZETB 2ZGZA 4H0XB 3BUZB 4DHYA 2D1KA 2P9IA 3DWLA 1IJJA 3CJ1A 5LJWA 4BRDA 4A2AA 4BR0A 4BRFA 3WEEA 4M63C 3FZKA 2GWKA 2FLOA 4NO7A 3B8AX 1G99A 3UB5A 1NGDA 3JXUA 3A5LC 5KQDA 4FWSA 4BRCA 3FE1A 3L6QA 4EHUA 1X3MA 1HKBA 5BPLA 2HF4A 2ZWHA 3DJCA 4IXCA 3SMPA 5LJVA 3MN5A 3UKRA 5AQGA 2P9NA 2A40A 1BO5O 1GLLO 2P9PB 3H45C 5AQPA 4CZJA 3ZETA 2IIRA 3EN9A 4JHDB 4M7XA 1XC3A 3A8YA 1BA1A 1HKGA 4ISEA 3IFRA 5BPNA 3R6MA 1DKGD 1CZAN 3U8XA 4FPAA 1BG3A 2Q1NA 4FO0A 5LY3A 2YCHA 4CZLA 3CQYA 3ENOA 1DEJA 4CBWA 2CGKA 4BGAA 1X9JA 4IZ9A 1NGGA 1HLUA 4BC5A 2CH6A 2UYTA 2ASMA 3QB0A 1TUYA 3WXIA 1ZC6A 3LDQA 4QS9A 3O4WA 4ISGA 2P9PA 2A5XA 2V52B 4JHDA 3CJBA 2A41A 4FL9A 2Q31A 3BEXA 1C0FA 1T44A 1NGHA 3MN7A 3ZX3A 4CJ7A 2QWPA 4AM7A 4BC2A 1YXQA 1TYQB 1MWMA 3ATVA 3O1WA 3VEOA 4B1XB 3R8EA 4BRPA 3WUHA 3WT0A 3HSCA 1HPMA 4PL7A 3FZLA 4K41A 4CZHA 3FZFA 3ZEUA 4KBOA 4BVPA 4MO4A 1U6ZA 3LL3A 1P8ZA 4DCHA 3HZ6A 5TKYA 4BRGA 4BC3A 3M3ZA 2HF3A 2P9SB 2AA4A 2V7ZA 3EL2A 5AQZA 3DXMB 1WUAA 1QZ6A 2CH5A 2CGLA 2QXLA 1TYQA 4WQ5C 4BC4A 3WQTA 1HKCA 4ISFA 2E2OA 4PKGA 3VOVA 5KPTA 3A5MC 3ZX2A 3CJ9A 3GBTA 4EFHA 1QQOA 3VEZA 3VGKA 1RFQA 4M7YA 5ADXH 1RDWX 1NMDA 3QBWA 2ITMA 2FSKA 4IWVA 1X3NA 1MA9B 4A2BA 3O5BA 3ZX0A 5BRHA 5BREA 5AFUA 2E1ZA 5AZIB 4BG9A 2Q0UA 5AQUA 1ATSA 2I7PA 2P9SA 3VGLA 4CBXA 3MCPA 4RCHA 3DXMA 4H5WA 2WUSA 2NZTA 3DAWA 1V4TA 1GLJO 3D2FB 4H0TB 2D4WA 4B1UB 2V7YA 4WQ5A 4H5RA 4L3QA 3SK3A 3LM9A 1E4FT 1RGIA 1WOQA 2HMPA 5KQ8A 1JCGA 3G25A 5AQHA 3LDPA 4CZFA 1E4GT 2KHOA 3AY9A 4Z94A 4K43A 4BQZA 1R59O 5AZJB 1ZBSA 5AQWA 1QQNA 3UKUB 3QFPA 4BRNA 4BR2A 4CZMA 3HM8A 2A3ZA 3QFUA 1YUWA 3MMVA 3VF4A 3D2EB 1NGIA 5AR0A 1D4XA 2GELA 2QW9A 3VEYA 5BPMA 5AZIA 4J8FA 1T6CA 5E84A 1NGCA 3VEXA 3D2FA 3LM2A 4XEIA 5AQNA 5BRDA 3O1BA 2ASOA 2NLXA 3MK6A 3IDHA 3OHRA 1SAZA 2FXUA 1J6ZA 4XH1A 3VPZA 5AQVA 5ELZA 4FPBA 4QS8A 5AZJA 4MLHA 2W41A 4EHTA 1NLVA 3UKUA 1KXPA 3QMLA 4RWTA 5AQFA 4CZIA 3VEVA 3ID8A 3P4IA 5AQTA 3D2EA 3W3DA 2Q36A 2ASPA 2VWBA 4HTLA 1Y64A 3AAPA 3J8AA 4BR9A 1BUPA 4IJAA 2VYPA 5FPMA 2D0OA 2FF6A 3I8BA 2P9UB 4BR7A 2J4RA 1BU6O 3CHWA 3FZHA 4AM6A 4H0YB 3R9PA 1GLDG 3CQXA 3M6GA 5AQJA 2PAVA 3I33A 5AQMA 2DPNA 3CI5A 3GE1A 5AQSA 3CIPA 3WXKA 1LOTB 5BRFA 5KPZA 3CJ7A 3VETA 3HI0A 1NGJA 1SZ2A 3GG4A 3A5NC 4BQLA 1IG8A 2FSNA 3QDKA 4EAHD 2GUPA 3KVGA 3AAQA 4FWPA 3VERA 1S22A 4BG8A 2PBDA 4CBUA 4H0OA 2P9UA 1KAYA 4I6MB 1GLBG 1Z6RA 3H46O 3U9DA 3O08A 5FPNA 1GLAG 3A5OC 3CJAA 4FOIA 3H3OB 4A61A 5KPRA 4BRAA 3D7EO 3C7NB 1V4SA 4CZGA 4H5VA 5F1XA 1HJOA 1LCUA 1GLEG 2YHWA 2E20A 4FSVA 3BF1A 4JAXA 1MDUB 2P9LB 4HWIA 4F9OA 5AQOA 5FPEA 3W0LA 1Q18A 3FGUA 5EXWA 5BR9A 4BRIA 3QBXA 4B1YB 4DB3A 1ATNA 3FR0A 5AQIA 3SLCA 1NM1A 3KZBA 4I6MA 3TPQA 2E1YA 2YJEA 3HBTA 3CETA 4O8KA 5I9EB 4Y0WA 5E26A 2ZGYA 4IO8A 3BF3A 5AQRA 4PL8A 2IVOA 4CZKA 1JCFA 3WEEB 2GWJA 2Q97A 1BA0A 2VCPA 1GLCG 3DXKB 3VEWA 5BN8A 5AFUH 4WQ4C 4B1ZA 2QWMA 2CGJA 5AQLA 5JLFA 1NWKA 2IVNA 4CD1A 4BVOA 1K8KB 2P9LA 4PKHA 4XH5A 4MLEA 5F0XA 1HX1A 3EKUA 2QWRA 3GOIA 3WQUA 5JMVA 3A0IX 1KAZA 4FWNA 3WXLA 2QWOA 4MO5A 1S3XA 4DQ8A 1ZXOA 4CI6A 1T6DA 3VENA 1YVNA 5EOYA 1TUUA 4IJNA 1QQMA 3ATUA 3U9ZA 4H0VB 1XQSC 4BROA 2E88A 3DXKA 4FWMA 4WQ4A 3H3NO 2OANA 4H5NA 1ATRA 1K8KA 3FLCO 4B1WB 3VF6A 3KHYA 1BOTO 5EX5A 3MN6A 1HUXA 2BUPA 4LC9B 1JCEA 3CERA 5EY4A 1NGFA 1MWKA 4BGBA 4K42A 4FWRA 1U2VB 2ZF5O 1H1VA 2QM1A 4BRQA 1ESVA 2YHXA 3IUCA 3ULEB 2QWQA 3S41A 5F2RA 3FFKB 3U4LA 4BREA 2EWSA 2NRHA 5AQKA 2YHYA 4BR5A 2FSJA 2F9TA 3H1QA 5JLHA 3F9MA 2V51B 2IVPA 2E2PA 3EKSA 4WYBA 3GL1A 2E8AA 4GY2B 3EO3A 2P9KB 5AQYA 4B1VA 3O8MA 3ZEUB 2A42A 4BR4A 1U2VA 4H0PA 2BTFA 2I7NA 5AQXA 3L0QA 1KAXA 2GTDA 3L4IA 1XUPO 3ULEA 4K25A 4XH4A 3FZMA 4B9QA 2Q0RA 3O6WA 4BRKA 1BWFO 1OKJA 5B8HA 2A6AA 3RSEB 5CE3A 4YDUC 2QWLA 3TU5A 3VESA 4RTFD 4BRLA 5FPDA 5JICA 3HTVA 1QZ5A 2W40A 4JD2B 1BDGA 2P9KA 1NGAA 1QHAA 2AP1A 1GLFO 4NB4A 4C23A 2Q2RA 4CZEA 3UE5A 3MDQA 5BN9A 4EIAA 3SJHA 2HOEA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1RBRA 3ENBA 4CJRA 2VQEK 1TL1A 1EQYA 1EKEA 1EWRA 4JYAK 3O9RA 4O0JA 1TK8A 4RW9A 5JS1A 3QEPA 4OPAA 2O8FB 3CCUN 1KSPA 1NGEA 3EZWA 4EZ9A 2P9IB 3MWPA 3DRRA 4JNEA 4CEEA 3MN9A 2E2NA 4QAGA 3CJCA 4C8OA 1XWLA 4FWKA 3ULDA 3ZT2A 1K73O 1S1XA 3T7ZA 4N5SA 3HRGA 3PX0A 4OO1J 4FWQA 3RMCA 4FLVA 4CGGA 4GV3A 4YOYA 1YT3A 1D9FA 3LDNA 3HL8A 4CGDA 3LPUA 3VGMA 4DR1K 1VSMA 4DQRA 3SMSA 1Q7YO 3ZETB 4OKEA 1QHTA 1L5UA 3M8PA 2D1KA 3HVRA 1ASUA 2NUBA 4A2AA 4X65K 1N8RO 4YFUA 1IG9A 2HW3A 4NO7A 4BACA 1NOZA 1G99A 2E4LA 4CJUA 1NKCA 5KQDA 4KV8A 5FRNA 3RWUA 3L6QA 3S3OA 2ZWHA 1IV0A 5LJVA 3LPTA 1NJZA 4IO9L 4DUYK 2HNDA 3UKRA 4I2PA 3THWB 1KRPA 2P9PB 4JHDB 2GV9A 3A8YA 1RTIA 4JRQA 4FLUA 5I42A 2QKBA 3G6EN 3HVTA 4FPAA 3JYTA 1FK9A 3OYIA 4U67L 2YCHA 1KVAA 1Q86O 1DEJA 4IEIA 4CBWA 2NNWA 4GVEA 1S1VA 1NGGA 1IBMK 4BC5A 2CH6A 4DU3A 1XNRK 1TUYA 1TKZA 4NXNK 1RBUA 4F2RA 3SQ0A 4QS9A 3O4WA 3IS9A 3TI0A 3CJBA 3BEXA 1C0FA 3QINA 1SL1A 1N33K 3CMEN 3ZX3A 2B5JA 1TYQB 5LMNK 4N41A 3SQ1A 4B1XB 4IDHA 1SUQA 2EHGA 1HNWK 2HBJA 3J81O 4CJSA 4CIEA 4Z4FA 3E9PA 3BY5A 4CJLA 3V1RA 4FVUA 1U4BA 4A5AA 3DLEA 2ZJQL 3HZ6A 3M3ZA 1KVCA 5GINA 3L4QA 4M3XA 4KRFA 1RILA 2VG6A 3TABA 1QZ6A 2CH5A 2CGLA 3ZSYA 2QXLA 4DSEA 4ILJA 4BC4A 4KHPK 3WQTA 4PKGA 3VOVA 5KPTA 2OPSA 1QQOA 2D0CA 1VQ5N 1RFQA 4UQGA 4W5RA 4J2EA 1BQNA 1C1BA 4I9QA 1MA9B 3THYB 3AVKA 2ZE2A 3O5BA 4KTQA 4LSLA 4BG9A 1ATSA 2P9SA 2A1RA 4CBXA 2KFNA 1L3TA 5DM6L 1TK0A 1HYZA 1V4TA 3D2FB 4WQ5A 3LM9A 3LP0A 5AQHA 1E4GT 3AY9A 4Z94A 5FRMA 1NNEA 1VQ9N 1IKYA 4DSFA 1R59O 4BEBA 5AZJB 5AQWA 3ZT1A 5M1PA 3IG1A 3K9JA 3HM8A 3QFUA 3QIOA 1NK6A 1NGIA 3SV4A 3OY9A 5BPMA 5AZIA 2YNGA 1NGCA 4IDKA 1HNZK 3O1BA 5LMUK 3PIPL 1FKOA 3OHRA 3D45A 1RBSA 1BHLA 2HVHA 1W9HA 3ISNC 5AQVA 4QS8A 2GX9A 4ELUA 4JI7K 3QMLA 4CJVA 4IOAL 5AQFA 2HSTA 1RDUA 5AQTA 3W3DA 1NU0A 4HTLA 1BL3A 3TSUA 4CE9A 3J8AA 3NF7A 1HJRA 5DMRA 1BUPA 1RT3A 4IJAA 2D0OA 3BZKA 4FW2A 2P9UB 4BR7A 4BDPA 3SCXA 1BU6O 1WAJA 4DTUA 1XHZA 1QSYA 3R9PA 3DLGA 5M1NA 1NKBA 3M6GA 4CF9A 1ITGA 3PV8A 1YF5L 5H1SQ 4GVMA 3G4SN 3GE1A 5AQSA 4LF9K 2RHKA 4KHWA 3KD1E 3RRHA 3AVAA 3HOTA 4LY7A 3GG4A 1HNXK 5JENA 4DV2K 2EX3A 2FSNA 4EAHD 3KVGA 3OYEA 1GOAA 2PBDA 4H0OA 3PSIA 3TANA 4I6MB 1KAYA 4CGJA 3CCQN 1GLBG 4LH5A 3VQ7A 5DM7L 3OJSA 3O08A 4M3ZA 3A5OC 3DOKA 3SUPA 3H3OB 2HB5A 5D3GA 3C7NB 4H5VA 3ZSRA 3C6HA 3AVCA 1SKSA 4FSVA 2ITGA 2X6NA 4E7HA 1U04A 3DYAA 4L8RB 4HWIA 1NJXA 4F8RA 1VSIA 4F9OA 3C95A 3K5OA 2PYJA 4B08A 3PO4A 3FGUA 5BR9A 4RW8A 4BRIA 3QBXA 4B1YB 4CEOA 3O9SA 5GIPA 3AVBA 3J7AP 5AQIA 3LP1A 3SLCA 3SJJA 3OYFA 2C1IA 1VQON 3HBTA 5I9EB 3F73A 4O0IA 4PA1A 2IVOA 4CZKA 1HPZA 1J5OA 1JCFA 2WBNA 2GWJA 2Q97A 4ICLA 2D5RA 2G8IA 4WQ4C 1J5EK 2QWMA 3CCSN 3LWMA 1WB9A 5JLFA 3CCJN 2IVNA 4BVOA 4FVMA 4FLTA 3CCMN 4Y1CA 4MLEA 4RG8A 3OYGA 3HT3A 3EKUA 3WQUA 4CJTA 5KGXA 3V4IA 4OLBA 1KAZA 3IRXA 2IOCA 4KH6A 2DY4A 2HHQA 4MO5A 1S3XA 4CI6A 3NDKA 3A2FA 1YHQN 4B9NA 4KH4A 4NXMK 1YVNA 3ALYA 3R1XA 1TUUA 3P38A 3PY8A 4IJNA 1QQMA 5M1FA 3MCAB 2PZSA 3ATUA 3AVHA 4NCBA 1QVFM 2HHTA 4KB1A 1ZBFA 5HP1A 3O9QA 3S3MA 4DR3K 4JS4A 5C25A 4YHHK 1HUXA 4LC9B 5EY4A 3CERA 1S1UA 4CJWA 4CK2A 4KI4A 3K5MA 4I2QA 4DQSA 3ZYYX 1Q81O 4ZHRA 1S5JA 1ESVA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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