3U8XA

Crystal structure of a chimera containing the n-terminal domain (residues 8-29) of drosophila ciboulot and the c-terminal domain (residues 18-44) of bovine thymosin-beta4, bound to g-actin-atp
Total Genus 112
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
112
sequence length
366
structure length
357
Chain Sequence
TALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title How a single residue in individual beta-thymosin/WH2 domains controls their functions in actin assembly
pubmed doi rcsb
molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
molecule tags Contractile protein, protein binding
source organism Drosophila melanogaster
total genus 112
structure length 357
sequence length 366
chains with identical sequence C
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-10-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3u8xA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3u8xA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3u8xA03
4YDUA 3UKRA 2FSKA 4QS8A 2V52B 3OHRA 5AQHA 3U9DA 4C23A 1GLLO 5CE3A 3DXKA 3VEXA 3QBWA 3M3ZA 1GLDG 3EKSA 2A3ZA 4CBXA 2VWBA 1GLJO 4CZGA 3FFKB 4BVOA 4K42A 1E4FT 3I33A 3HBTA 1T6CA 2WUSA 4A2BA 4WQ5A 3L6QA 1NGFA 2CGJA 3UKRB 3O6WA 3CQYA 3AARA 3LDOA 4XEIA 4JAXA 3DXKB 2GTDA 3R9PA 3R8EA 4BRIA 5AQNA 2KHOA 4FWKA 2VCPA 3DXMA 1E4GT 3EKUA 4FPAA 3HTVA 2P9LB 4FWMA 5AQIA 3ENOA 5AQFA 4QS7A 4BC4A 3WXLA 3P4IA 3EO3A 3C7NA 4F9OA 3ZETA 2FF3B 3WQUA 3VENA 4IO8A 4B1XB 4B1YB 1Q18A 3GBTA 3MK6A 1GLCG 4HTLA 3WXKA 3CJ9A 4M7XA 4BROA 3CHWA 2BUPA 3DJCA 4H03B 4K43A 3GOIA 3KVGA 1NGCA 5FPDA 4CZIA 3RSEB 3HI0A 2FSJA 1U2VA 1SZ2A 3C7NB 3ZETB 3UB5A 3FLCO 3JS6A 3MDQA 5LJWA 1ATRA 4H0VB 4XH4A 5E84A 3QBXA 4ISFA 4BR9A 4CZMA 1U6ZA 3H3OB 4CZFA 2H3GX 5F2RA 4B1VA 4J8FA 3WUHA 3CETA 1LOTB 2CH6A 3QICA 2Q36A 1NGEA 3CJCA 3JXUA 1NGBA 3AY9A 4CI6A 5ADXA 3R6MA 4CD1A 3ATUA 2QWNA 1GLBG 4BC3A 5I9EB 4AM6A 5EY4A 4O5FA 4FWRA 1BOTO 2D4WA 3FGUA 3QFUA 4I6MB 2GELA 5BN9A 3MN6A 5AQVA 4MLHA 5ELZA 2GUPA 4K41A 3GG4A 4BC2A 2ASMA 3H6EA 4RTFD 3VERA 2DPNA 4Y0WA 3LDPA 5BRFA 2A40A 4BR7A 1P8ZA 4FWLA 3VOVA 1QQNA 3FZMA 1HX1A 1BG3A 1QZ5A 4GNIA 3H45C 3LM2A 1QQMA 4IJAA 4FOIA 3W3DA 1V4TA 1ZC6A 4FWPA 2YJFA 1HPMA 4PKGA 3SJHA 4BGAA 4QS9A 4CJ7A 2E2OA 3F9MA 5LJVA 1GLEG 2QWQA 5AZJB 2QWLA 2NRHA 2E1ZA 4BG9A 2GWJA 5BPLA 4M63C 1KAZA 1ATSA 1MA9B 2FF6A 3B8AX 3L0QA 4WQ4C 3U8XA 1NGGA 5AFUA 4BRDA 3IDHA 4B1ZA 5AQTA 1QQOA 1YAGA 3VGMA 5E26A 4CD3A 2IIRA 1S3XA 2E2QA 5AQJA 5AQZA 2AP1A 3O08A 2E2PA 1IJJA 3H1VX 2FXUA 1YXQA 2QXLA 1XUPO 3IFRA 4FPBA 1HLUA 1JCFA 2YCHA 5AQUA 4BVPA 3LL3A 1TUUA 4BRKA 2V7ZA 5EVZA 4HWIA 4CBWA 1RFQA 5F1XA 2QW9A 2A5XA 4BRGA 5AZIA 3CIPA 4M7YA 2NZTA 3HSCA 2CGKA 1G99A 4FL9A 4FSVA 2V51B 3VEVA 3VEWA 3O80A 4RCHA 3H1QA 3FZFA 4H5NA 3BF1A 3A0IX 4PKIA 4YDUC 2F9WA 2A6AA 3AAPA 3EN9A 3KZBA 2IVPA 5BN8A 3MMVA 3D2EA 2D0PA 3CJBA 3ENHA 1TUYA 3EL2A 5AQWA 4XH1A 5AQKA 3GDQA 4O8KA 4BC5A 4B1UB 2Q2RA 2W41A 5FPNA 1X3NA 5AZIB 4BGBA 4B1WB 2W40A 1XC3A 2OANA 3DXMB 3O4WA 1JCEA 2P9PA 3ZEUA 2AA4A 5BPNA 5AQOA 5FPEA 2P9NA 2P9SA 4EFHA 4BR5A 4H0YB 5AQGA 4BRAA 4CZKA 4WYBA 2YI1A 3IMXA 1NGHA 3D2EB 3D2FA 2FSNA 3CI5A 1GLFO 4JNEA 3VGLA 4AM7A 4BR0A 2HMPA 1KAXA 4E1JA 1V4SA 2P9UA 3D7EO 2Q0RA 1OKJA 3MCPA 3LDNA 1DGKN 5AQPA 1SAZA 3ZEUB 4H5VA 2P9NB 2P9SB 3VF6A 1U2VB 4H0PA 3ID8A 1K8KA 1LCUA 5ADXH 1D4XA 1TYQA 3A5MC 3SK3A 3O8MA 2QWMA 4IXCA 2GEMA 5KQDA 3MN5A 3U9ZA 1IG8A 3VETA 2ZWHA 1DEJA 3FZLA 5AQXA 2PAVA 4FWNA 4IWVA 3J8AA 3ULEA 2PBDA 3DWLA 4K25A 1BUPA 3UKUA 5FPMA 1Z05A 4RWTA 3WQTA 4JHDA 4DQ8A 1ESVA 4CZJA 4FWSA 1HJOA 3LM9A 1NBWA 5EX5A 4BRMA 2YHYA 4CZLA 2Q1NA 1K8KB 2I7PA 2QWOA 4H5RA 4A62A 4BR2A 3BEXA 3A5LC 1R59O 3ZX3A 2Q31A 5JLHA 3CJ1A 3U4LA 5EXWA 2E88A 5JMVA 3AAQA 3BF3A 5BRHA 1KXPA 1BA1A 2D1KA 4FWOA 2IVNA 3FR0A 3CERA 3SMSA 4CZEA 3M6GA 5TKYA 2BTFA 1ATNA 3H46O 2YHXA 3VF4A 2IVOA 2ZGZA 3QMLA 5AFUH 3S41A 2ASPA 1NMDA 5BR9A 4ISGA 4PL7A 2E1YA 1HKGA 2VYPA 2V7YA 3VEYA 2E2NA 1NGJA 4BRQA 1CZAN 1NM1A 5AQLA 5BPMA 5AQMA 2Q97A 1NGAA 4PKHA 1BU6O 4FO0A 3CJ7A 1NGDA 2P9LA 4BRNA 1WOQA 1JCGA 3A5NC 4ISEA 4KBOA 4BG8A 2HF4A 3QB0A 3MN7A 3O5BA 3HZ6A 1DKGD 4LC9B 1EQYA 2D0OA 4BREA 4EIAA 4NB4A 4CZHA 3WEEA 3A5OC 5KPRA 3CJAA 2UYTA 5AQSA 2EWSA 2ASOA 4NO7A 1BO5O 1ZBSA 3HM8A 1C0FA 1GLAG 3VF2A 4BRFA 4B9QA 1H1VA 4BRLA 5BRDA 4H5WA 3ZX2A 3RSEA 3W0LA 3GE1A 5AQYA 1T6DA 5LY3A 3QDKA 3WT0A 3DAWA 4WQ5C 4Z94A 3A8YA 4H5TA 2E20A 3M1FA 3WXJA 4BR4A 3WEEB 4DB3A 2P9IA 1MDUB 3O1BA 3VESA 1S22A 2P9KA 2YJEA 4EHTA 3H3NO 5AQQA 4FOEA 4JD2A 3VEOA 4A2AA 2QWRA 2QWPA 3EZWA 1RGIA 2ITMA 3G25A 4BRHA 2P9PB 2ZGYA 3SMPA 5JICA 3VEZA 3TPQA 2E8AA 3ZX0A 2NLXA 1WUAA 3GL1A 4FWQA 4GY2B 1NWKA 4I6MA 1MWMA 2A41A 1X3MA 4DCHA 1YUWA 1J6ZA 3BUZB 2P9IB 4EHUA 5AR0A 1Y64A 2P9KB 3D2FB 2QM1A 3QFPA 5BREA 1Z6RA 2Q0UA 4MLEA 1QHAA 5KPZA 3C0BA 4JD2B 3UE5A 2HOEA 4A61A 1BA0A 1KAYA 2P9UB 1ZXOA 5AQRA 1QZ6A 2YHWA 3O1WA 2J4RA 3MN9A 4XH5A 3VPZA 1HKBA 1MWKA 4WQ4A 5B8HA 5KQ8A 1C0GA 1X9JA 4CBUA 1RDWX 2ZF5O 3L4IA 3FZKA 4EAHD 3WXIA 3TU5A 1TYQB 3VGKA 3BP8A 3IUCA 2GWKA 4DHYA 5AZJA 2CGLA 3ULEB 1HUXA 3LDLA 4L3QA 2F9TA 5F0XA 2A42A 1NLVA 5JLFA 4MO4A 3UKUB 3CQXA 4H0XB 1NGIA 4JHDB 4H0TB 4BRCA 4MO5A 5EOYA 4IZ9A 4PL8A 4BRPA 1XQSC 2FLOA 3I8BA 3SLCA 3FZHA 3KHYA 5KPTA 1BWFO 1SQKA 3ATVA 2I7NA 3FE1A 1YVNA 4H0OA 4IJNA 4JN4A 4BQZA 2HF3A 1HKCA 3LDQA 2CH5A 1T44A 4BQLA 1BDGA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5FRNA 3O4QA 5HOOA 4PA1A 1VQ8N 4C23A 1GLLO 3DXKA 3C95A 3E9LA 3ZT1A 4CF2A 3VEXA 3QBWA 3OYJA 4DU4A 3CD6N 2RKIA 3TSPA 3TSUA 4JRPA 3HVTA 2KKZA 4BVOA 2QEXN 3NF7A 3K58A 3LP3A 1RT3A 3LZJA 4QCLA 2CGJA 3UKRB 4FJ9A 2HHWA 3T1YK 4F3OA 4DR4K 1C0UA 3VQ4A 4BRIA 3O3GA 3NAEA 4JS5A 3CMAN 2KHOA 2VGNA 4FWKA 3OJUA 1E4GT 4CJRA 4FPAA 3HTVA 4FW1A 5AQFA 4X66K 3P4IA 3ZCMA 4NLBA 2X6NA 3C7NA 3ZETA 4X65K 2IDOA 2FF3B 1CXUA 2WONA 4IOCL 3DYAA 3AO1A 3VENA 1SKRA 1IKVA 4B1XB 1BCMA 1GLCG 1VQNN 3DRPA 5FRMA 4KHWA 2QKBA 3CJ9A 1YJ9N 3CXCM 1KQSM 1ILYA 1TV6A 2Z1IA 1VQ6N 3DJCA 4H03B 3V9WA 3PSFA 4DQIA 3GOIA 3NVKA 3HI0A 2FSJA 1SZ2A 5TKWA 5LJWA 3VQ9A 4DKWA 3G0ZA 3DOLA 1NKCA 1U6ZA 2JGUA 4M3XA 5F2RA 4B1VA 4Y1DA 4J8FA 5DMRA 4KHNA 2Q36A 3SQ2A 2UUBK 4CJQA 3M8RA 1VQ7N 4H4OA 3F73A 3K5LA 1O13A 3AY9A 3NGYA 3VQ7A 5KGWA 3R6MA 3AVBA 4JK7A 1GLBG 4BC3A 1CZBA 3K9KA 4BDZA 1U47A 4FWRA 3O9SA 1RT1A 3LP1A 5BN9A 3S3MA 4OKKA 4K41A 2WTUA 3KK3A 2ASMA 1RTDA 4JLHA 3SQ1A 4EP4A 4IO9L 1BG3A 4GNIA 4KTWA 1QQMA 4O0IA 4FWPA 1VHXA 4CJ7A 2HNYA 4DTSA 3TAGA 1OH7A 3F9MA 3AVLA 3C6HA 1UA1A 2NRHA 4CW7B 3VA0A 4KO0A 1MA9B 2KFZA 3OYCA 3B8AX 3L0QA 5AFUA 3E1YA 5AQTA 1QQOA 1YAGA 2WFBA 3VGMA 4CD3A 3CFRA 1N32K 3SPYA 5AQJA 5AQZA 4AHUA 4AQYK 5I42A 4PY5A 4YOUA 2E2PA 1XWLA 3MECA 1YXQA 2W6LA 3A2FA 4CJWA 4FPBA 2XY5A 1HLUA 1JCFA 5AQUA 3HVRA 2V7ZA 4JKDA 4FCYA 3T19A 4FM2A 5F1XA 3VQEA 1JL2A 1VSHA 1ZBFA 2QW9A 2F4VK 2ZM6K 3CIPA 1T05A 2NZTA 1NOZA 5CR4A 3VEWA 4FSVA 1HMVA 4H5NA 3ITHA 1R0AA 4FZZA 4FLYA 1RBRA 1VQMN 4HUFA 3EN9A 4HVJA 1OH6A 3D2EA 3CJBA 1TUYA 3CCRN 1CXQA 5AQKA 4B1UB 5HBMA 2Q2RA 5FPNA 3NF6A 3RRGA 3MWPA 2OANA 3Q7CA 4OPJA 1JCEA 5C24A 4CFDA 5BPNA 4UQGA 3L2QA 4BR5A 4BRAA 1S6QA 4CZKA 1RDUA 4WYBA 3CPWM 1J9AA 5HRNA 5GIPA 3TARA 1NK9A 1VSIA 3D2FA 2DTUA 3UIQA 3VGLA 4LFAK 2P9UA 1L3TA 2Q0RA 1DGKN 5AQPA 1SAZA 3KLEA 4CE9A 4H5VA 2WC9A 3VF6A 4B08A 4DTPA 3ID8A 1LCUA 4DV1K 2X74A 4DFPA 3O8MA 1WSJA 4FM0A 1QVFM 3VETA 1IG8A 3PIOL 4LY7A 5AQXA 4CF0A 4IFEA 2A1RA 3MAQA 3B6PA 3DWLA 2B6AA 4RWTA 2KZZA 4JHDA 4DQ8A 3SNNA 1HJOA 2BANA 1LV5A 4NYFA 1LW2A 1NBWA 3P38A 2E6MA 3PY8A 4CZLA 1NG9A 4FZXC 1WSHA 4CJUA 4B3SK 1K8KB 1LWEA 2QWOA 2W6KA 4DU1A 4A62A 1RDCA 5CYQA 4BR2A 3OBYA 1R59O 1BGXT 3ZX3A 3E66A 1NKEA 5EXWA 3LANA 1YITN 2E88A 1ZBHA 3AAQA 1W97L 3J7YP 3FR0A 5HRSA 4JKEA 3WXMB 1ATNA 1YJNN 4U67L 3CFPA 2HHUA 3H46O 3HP9A 1YVUA 3SQ0A 2RN2A 4KH6A 1U49A 4PL7A 2E1YA 1NU0A 2XHBA 3L8BA 3CCVN 3NCIA 4I2QA 2WOMA 4K0KK 4BRQA 3U3GA 4N56A 4KHSA 5AQLA 2W00A 5AQMA 3QESA 2BH1A 3TR8A 4PKHA 1RBSA 5C15A 4EZ9A 1JXEA 3KKRA 2P9LA 3HRGA 4LH5A 3V9XA 3AVCA 3C65A 1FKOA 3QEWA 4BRNA 4KBOA 4ISEA 5C0YA 2HF4A 2O8CA 3HZ6A 4DSJA 4NB4A 4CZHA 3A5OC 3CJAA 2HHQA 2O8DA 5AQSA 1ZBSA 4KH4A 4PHTX 1BCOA 5BR8K 3CM6A 1VQ4N 1H1VA 1SUQA 3KLFA 4H5WA 4RW7A 3C6TA 1Y97A 3RSEA 1P90A 1VQKN 3GE1A 4B9NA 5AQYA 3F5TA 1DLOA 3OY9A 1TKDA 2BGGA 1GOAA 1MU2A 4FW2A 4JKCA 4FM1A 4HUEA 1C1CA 4DFJA 4KI4A 4H5TA 3ALYA 2E20A 4DB3A 3WXJA 3KD1E 3DRRA 3T7ZA 1MDUB 3O1BA 1L5UA 3J7AP 1S22A 4X64K 1QHTA 1Z25A 3L2RA 5AQQA 4FOEA 4CHOA 4JD2A 1EWRA 3EZWA 3O4NA 3RMDA 1RGIA 4OX9K 3V1QA 5HRPA 4BRHA 2P9PB 4OLBA 4B3TK 4BECA 3DLKA 2E8AA 3L2VA 1EP4A 1O1WA 4GY2B 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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