3U9DA

Crystal structure of a chimera containing the n-terminal domain (residues 8-24) of drosophila ciboulot and the c-terminal domain (residues 13-44) of bovine thymosin-beta4, bound to g-actin-atp
Total Genus 107
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
107
sequence length
366
structure length
357
Chain Sequence
TALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title How a single residue in individual beta-thymosin/WH2 domains controls their functions in actin assembly.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
molecule tags Contractile protein, protein binding
source organism Drosophila melanogaster
total genus 107
structure length 357
sequence length 366
chains with identical sequence C
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-10-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3u9dA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3u9dA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3u9dA03
3CJCA 2ZF5O 4H03B 3RSEA 3GBTA 3GDQA 5FPEA 4H5TA 4IJNA 2P9PA 2YHYA 2NRHA 3CQXA 3VEOA 5AFUH 2GWJA 2IVOA 3LL3A 3OHRA 3J8AA 3ATUA 4FWQA 1XQSC 1GLBG 3GOIA 2W41A 1SZ2A 3MMVA 2NLXA 2FSJA 4PKIA 4Y0WA 4FOEA 1XUPO 3GL1A 4FPAA 4BR7A 2GWKA 3DXMA 2J4RA 3VGLA 4BGBA 4BQLA 4DQ8A 3VETA 4CJ7A 3D2EB 1BDGA 3C7NB 3U9DA 2YI1A 4BR9A 4WQ5A 3EZWA 2QWNA 3FLCO 4BR4A 3AAQA 2Q97A 2CH5A 3LDQA 1BWFO 4BVOA 3UE5A 1T44A 2A3ZA 4WQ4A 1OKJA 4CBUA 4BROA 2AP1A 3AAPA 1HKBA 1S22A 4FOIA 4ISEA 5AQXA 3ZETB 4FSVA 4NO7A 4BRNA 5EX5A 1ZBSA 1E4FT 1Y64A 2P9SA 4PKHA 1TUYA 1ZXOA 4M7YA 4BRPA 4BRMA 4FPBA 2BTFA 4JNEA 5TKYA 4A62A 4H5RA 2IIRA 5AZJA 3WXKA 1BO5O 2ASOA 4DHYA 1NGIA 4RTFD 4FWSA 1MWKA 1TYQA 1C0GA 5EXWA 3I33A 4BRLA 4M63C 3UKRA 4A61A 1NGFA 3AARA 5E26A 4H5NA 4IWVA 3O6WA 4BRHA 1RDWX 4EFHA 3ZEUA 2HF4A 1NGCA 1T6DA 4BRDA 4B1VA 5BRDA 5JMVA 4BG8A 1RFQA 5FPNA 4K42A 4FO0A 3QDKA 3FGUA 3QFUA 3RSEB 5JLHA 3EKUA 5ADXA 3O1BA 2P9PB 3DJCA 1E4GT 1K8KA 2ASPA 4CBXA 1QZ5A 5AQVA 5KQDA 3ULEB 3IMXA 2BUPA 5AZIA 5AQIA 4AM6A 3QBXA 3F9MA 2YCHA 1EQYA 2GEMA 3H1QA 3WT0A 2QXLA 2FSKA 2E8AA 3SMPA 3M6GA 3MN5A 1V4SA 3DXMB 4JD2B 3BUZB 4CZFA 4CZKA 3CJAA 3QICA 4CZMA 2A40A 4PL7A 5LJVA 3WQTA 4FWMA 4BG9A 4BRGA 2CH6A 2QWMA 3JS6A 3VF4A 2GELA 5BPNA 3BP8A 2GUPA 4FWKA 3KZBA 1HKCA 1YAGA 4I6MA 4MO4A 4MLHA 1GLAG 5KQ8A 3A5MC 4H5WA 4BR5A 4J8FA 2A41A 2KHOA 3MCPA 2QW9A 4K41A 5AQSA 3TU5A 5LJWA 1NBWA 2FSNA 2W40A 3H3OB 3CQYA 2P9SB 3I8BA 3BEXA 4BRKA 4BVPA 2Q0UA 3DXKA 5AZJB 5ADXH 3IFRA 2YJFA 2P9KA 4JHDA 2GTDA 5FPDA 1JCGA 3MK6A 2ZGYA 2YHWA 2V51B 1SQKA 4YDUC 5AQZA 4B1ZA 1TYQB 5AQUA 4H0OA 1BOTO 4FWRA 3M1FA 1SAZA 4PKGA 1NGDA 3UKRB 1ATRA 4CZLA 3GE1A 3LDPA 2E88A 3A5OC 4AM7A 3DWLA 1TUUA 3ZEUB 3VPZA 3O1WA 4H0YB 2ITMA 1ATSA 3A0IX 2VWBA 1IJJA 4H0PA 2AA4A 2UYTA 4FWPA 1X3NA 2WUSA 5LY3A 4A2BA 3LDLA 2EWSA 1HLUA 1JCEA 1BU6O 3CETA 4XEIA 2P9NA 4CZHA 2E2QA 3JXUA 1K8KB 4HWIA 2FF6A 4O5FA 3O8MA 3BF3A 3HZ6A 4FWLA 4DB3A 5BRFA 3VESA 2A5XA 1JCFA 3M3ZA 4M7XA 5AZIB 3O5BA 3UKUA 4IZ9A 5AQGA 2HF3A 2E2PA 4H0TB 4XH4A 3P4IA 4BC5A 2OANA 1IG8A 2HMPA 3CIPA 4B1UB 3AY9A 3WEEA 3KVGA 4WQ5C 4WYBA 3VEWA 3SLCA 5CE3A 3GG4A 3H6EA 1NGGA 4DCHA 4IO8A 3O80A 3HI0A 3U4LA 4BC4A 3VEXA 3B8AX 3FR0A 2E2NA 4H0XB 1NGHA 1U2VA 1T6CA 4RCHA 1NGBA 2QM1A 2QWLA 3HM8A 1KAZA 1GLCG 3EN9A 1NGAA 4BREA 3CI5A 1D4XA 4L3QA 4EHTA 3UB5A 2I7NA 5KPZA 1C0FA 1MA9B 2HOEA 3S41A 1NLVA 2V52B 3LDNA 3H3NO 3ZX2A 3FZMA 5JLFA 1YXQA 2Q2RA 1X3MA 2PAVA 5BPMA 3DXKB 1Z05A 1P8ZA 2P9KB 4JHDB 4BC2A 5AQJA 3TPQA 3U9ZA 3WXLA 4C23A 2QWOA 2V7ZA 5AQRA 5KPRA 4Z94A 1NGEA 3WXIA 2ASMA 5AQKA 3BF1A 4B1XB 3U8XA 3A8YA 3CJBA 3CERA 2YHXA 5AQMA 1Q18A 5F0XA 4QS7A 2P9UA 1GLJO 1GLLO 3VGKA 5AQNA 5F1XA 3FZKA 2NZTA 1NM1A 4XH5A 3SJHA 4CZIA 1LCUA 1QQMA 5AQQA 3FFKB 1KAXA 3CHWA 2P9NB 3G25A 5BPLA 2ZGZA 1V4TA 3IUCA 5AQWA 3ID8A 1GLDG 3EKSA 1DGKN 4JAXA 1HX1A 3WQUA 3UKUB 3R6MA 3DAWA 1G99A 4ISFA 3ENHA 3HSCA 2H3GX 3FZLA 3HTVA 4CD3A 4RWTA 3WEEB 2VCPA 3L0QA 4B1YB 2P9LA 3WUHA 2D4WA 3LM2A 1Z6RA 4HTLA 3ULEA 1BA0A 5JICA 3L6QA 3QB0A 4KBOA 4H0VB 2A6AA 3MN6A 2Q36A 4BRIA 2FF3B 3QFPA 4BRQA 3VOVA 3MN7A 4NB4A 1U2VB 2E1YA 2I7PA 3FZHA 3QBWA 3EO3A 3VF6A 1YVNA 1DEJA 4JD2A 5AQPA 3D2FA 2E2OA 5FPMA 4H5VA 3H45C 5AQFA 1BG3A 5BN8A 2ZWHA 3W3DA 3CJ9A 2P9IA 4CZGA 3QMLA 4IXCA 2DPNA 3A5NC 4BR2A 3EL2A 2QWRA 1GLEG 3ATVA 5EOYA 2YJEA 4MO5A 4QS9A 1NGJA 3MN9A 4LC9B 2FLOA 3C0BA 4PL8A 4BRAA 1ATNA 3ZX0A 3VEVA 3H1VX 5AR0A 1WUAA 1QQOA 2F9WA 3W0LA 1BUPA 2IVPA 4WQ4C 2Q31A 4CBWA 4GNIA 4CZEA 3R8EA 1LOTB 1ESVA 5AQTA 1H1VA 2Q0RA 3VGMA 4CI6A 1HJOA 2P9UB 3A5LC 4I6MB 3CJ7A 4BRFA 1XC3A 4MLEA 4BRCA 4XH1A 1R59O 2CGLA 4BGAA 3D2EA 5BR9A 4FL9A 1QHAA 4FWNA 3WXJA 3C7NA 1YUWA 1GLFO 1KXPA 2CGJA 1BA1A 1CZAN 2QWQA 4CD1A 1HKGA 1MDUB 2PBDA 1DKGD 1ZC6A 4F9OA 5BREA 3SMSA 2V7YA 3VENA 5F2RA 4B9QA 3CJ1A 3LM9A 2D0PA 5AFUA 3D7EO 3MDQA 3HBTA 4B1WB 1RGIA 4QS8A 5AQYA 4EAHD 3KHYA 4EHUA 4IJAA 1HPMA 1QQNA 3ZETA 5B8HA 2E20A 2QWPA 5EVZA 3SK3A 5BRHA 5ELZA 4JN4A 2P9LB 5EY4A 2F9TA 3O08A 4K43A 1KAYA 2A42A 1HUXA 4CZJA 3L4IA 4E1JA 4EIAA 2CGKA 4K25A 3VF2A 2IVNA 3IDHA 1NMDA 1NWKA 3FE1A 4BC3A 3ZX3A 1X9JA 4ISGA 1MWMA 2D1KA 5I9EB 3FZFA 3ENOA 4GY2B 3D2FB 3LDOA 3VEYA 4YDUA 1WOQA 5AQHA 5AQOA 5AQLA 2Q1NA 1U6ZA 1J6ZA 3H46O 3VERA 4BQZA 2P9IB 4FWOA 4O8KA 2E1ZA 2FXUA 1QZ6A 3O4WA 5KPTA 3VEZA 2VYPA 5E84A 5BN9A 4A2AA 4BR0A 3R9PA 2D0OA 1S3XA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4CF8A 3DMJA 3CJCA 4HTUA 1IKVA 1TAQA 3OS1A 2YHYA 4DR5K 1TK0A 3HO1A 4FWQA 3H08A 3GOIA 3THXB 3OJUA 2O4IA 2IOCA 2BE2A 4AHTA 2OPSA 1SKWA 2GWKA 4KH4A 1WSFA 3J7ZO 2F8TA 3AGKA 4CJ7A 1BDGA 1HYVA 3C7NB 2JGUA 5KI6A 4ZTFA 2FC0A 5HRNA 3K0SA 4KHUA 3SCXA 2QWNA 3FLCO 4BR4A 5M1QA 5IT9O 3LDQA 1BWFO 4BVOA 3OYCA 1T44A 1OVYA 3TTDA 2A3ZA 3HJFA 4WQ4A 2B4JA 2AP1A 1VQNN 4H4OA 4Z4GA 4O0IA 1NK0A 4BWJA 2G8WA 4ISEA 4NLCA 1RT7A 4JRPA 4FVMA 1IBMK 1ZBSA 1E4FT 2P9SA 1LV5A 1NMNA 3VA0A 1UA0A 3DRRA 4E89A 4HUFA 3PO5A 4KV8A 2W6KA 4A62A 1E3MA 2IIRA 3V1OA 4O4GA 1KLNA 1NGIA 3D45A 2BGGA 2UUBK 1VSKA 3I33A 4CESA 4FJKA 3DLRA 3PLAA 4A61A 1NGFA 3TTFA 2KZZA 2FBTA 4EFHA 1RDWX 4NCBA 2HF4A 4FJ5A 4B8AB 3M5RA 4BG8A 1RFQA 1XMQK 2W00A 4FW2A 3KLFA 1IO2A 5FROA 3FGUA 5JLHA 1Q81O 4B3RK 1ZBIA 4M3RA 2UXCK 4CBXA 1QZ5A 3SPZA 3KLIA 3ULDA 2P5OA 1XWLA 2QXLA 1VSMA 2FSKA 3MN5A 4HHTA 3THVA 4DFMA 4JD2B 1KVBA 1BHLA 3AVHA 3CMEN 1Z25A 3HPOA 3CJAA 2YNHA 2A40A 4PL7A 3I56N 1IKXA 3HRGA 4BG9A 3JS6A 4JKGA 1X9SA 4W5QA 1K73O 4FWKA 3KZBA 3LP1A 3K59A 4MO4A 2HBJA 4F3TA 1GLAG 2HW3A 5KQ8A 4RG8A 5FDLA 3ENBA 4DV6K 1NK8A 1C1CA 2WOMA 3NH0A 2KHOA 4K41A 5LJWA 3VTIA 1KTQA 3I8BA 1RT2A 3BEXA 4BRKA 1VSDA 1I3AA 1VSLA 3NF9A 5AZJB 5ADXH 2GTDA 4DTNA 1BGXT 3SBGA 1SQKA 4DSIA 4JI5K 1JLBA 3CG7A 4IFVA 4FWRA 3M1FA 3WNHA 5CZ2A 2XY5A 3QEWA 3UKRB 5GAHP 4IFEA 3PSIA 2E88A 3VPZA 4H0YB 2ITMA 2W6LA 4NCGA 3PSFA 4E7IA 5M1OA 4DU3A 2F7TA 1RTHA 3E1YA 2OPRA 1EWQA 4KB1A 3AO2A 3CETA 4B9SA 1YTAA 2P9NA 4CZHA 2E2QA 3CXCM 2FF6A 3SUNA 3G0ZA 4FWLA 1JCFA 4LY7A 1QVGM 1JLCA 4M7XA 5AZIB 2QA4N 3T19A 1IBKK 4KAZA 5CR4A 3CCRN 4BC5A 2OANA 1IG8A 3CPWM 3B6OA 2HMPA 4C8NA 4EP4A 4IBNA 4DTJA 4IO8A 1JLQA 2PFUA 1BI4B 2YKMA 3VQ8A 1IV0A 2VG5A 3E9PA 3SBTA 3PV8A 3PUFA 3HM8A 4CJ3A 4FLTA 4JKHA 1O1WA 3EN9A 1NGAA 4MFBA 4CJUA 1D4XA 2JWKA 1VQ5N 3JAMO 4M3ZA 3UB5A 1WN7A 4UQGA 3HK2A 1FW6A 4F2SA 1NJIO 2V52B 3Q7BA 3H3NO 3ZX2A 2AJQA 4LD0A 2Z1HA 3FZMA 1CZBA 5JLFA 2Q2RA 1X3MA 5BPMA 3DXKB 1T8EA 2LSNA 3TPQA 1RT3A 4C23A 1S6PA 4H4MA 4Z94A 4I2QA 4DTXA 3ZT4A 3AVGA 4CHPA 4YNQA 5AQMA 2YHXA 1Q18A 4B9NA 1RNHA 1TKXA 4LFAK 2GV9A 4CHQA 3TARA 4IKFA 2P9UA 1D9DA 1GLJO 4XH5A 2A1RA 1LCUA 1QQMA 1VQ7N 4M3WA 3SUOA 4EP5A 4BDPA 3G25A 3IUCA 3EKSA 1QE1A 1KC8O 3UKUB 4PA1A 3KIOA 4PHTX 1KSPA 3LP0A 3L3VA 3O4QA 4ISFA 3ENHA 5T7BA 3PO4A 4CD3A 4O44A 1D8YA 3DLEA 3WNEA 4XIUA 3L0QA 2FBVA 2P9LA 3WUHA 1Z6RA 1BA0A 3I0RA 5JICA 4B3TK 4H0VB 3ZSRA 2KZMA 5KRSA 5J1EA 1ASUA 5M1PA 4X62K 3QBWA 1VSFA 3EO3A 3CCEN 3OYKA 4JD2A 4W5TA 4H5VA 3VQPA 5K14A 2HNDA 2ZWHA 3KWGA 2QK9A 3W3DA 3R3LA 4IXCA 4I7FA 5C12A 1CZ9A 3NFAA 1GLEG 3CC7N 3M8SA 4FLWA 1WNSA 2NUBA 3T1YK 1K6YA 4MO5A 4QS9A 3AO5A 5M1KA 3FFIA 3MN9A 4LC9B 5HBMA 3LAMA 2BANA 3OBWA 4BRAA 4KFBA 4BACA 1BCMA 4DQIA 4QCLA 4IEIA 4CGGA 1WUAA 2O8DA 5DK5A 4JKDA 4CJFA 3R8EA 4CEQA 3KJVA 1B9FA 1HYZA 5AQTA 2Q0RA 4AHRA 4CJEA 4I6MB 2IAJA 3CJ7A 4BRFA 4OLAA 4B9UA 1HQEA 1Z26A 4FZYA 4XH1A 2VG6A 3MWTA 5C10A 3D2EA 4CK3A 4FL9A 4FWNA 4EZ6A 3WXJA 1KXPA 1CZAN 4CD1A 1NJYA 3AV9A 1DKGD 3A2FA 4F9OA 3LM9A 4BDZA 2FBXA 1S9EA 2IDOA 1U48A 3K5MA 3HBTA 2O8BA 3VMFB 1VQKN 4CJSA 3L8BA 1S1TA 3DLBA 2HHWA 1HPMA 2Z1IA 3LAKA 3CCLN 4ELUA 4JKAA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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