3U9ZA

Crystal structure between actin and a protein construct containing the first beta-thymosin domain of drosophila ciboulot (residues 2-58) with the three mutations n26d/q27k/d28s
Total Genus 119
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
119
sequence length
366
structure length
357
Chain Sequence
TALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title How a single residue in individual beta-thymosin/WH2 domains controls their functions in actin assembly
pubmed doi rcsb
molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
molecule tags Contractile protein, protein binding
source organism Drosophila melanogaster
total genus 119
structure length 357
sequence length 366
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-10-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3u9zA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3u9zA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3u9zA03
5AQKA 5AQLA 5F1XA 2Q1NA 5LJWA 5BN8A 4BC4A 3WXLA 2QWPA 4PL7A 5AQPA 1Z6RA 3VETA 2YJEA 4CZIA 3CHWA 4A2AA 4CZKA 4AM7A 2P9SB 2Q36A 3LDPA 3BF1A 3EKUA 4BRLA 2VCPA 2E2PA 1HPMA 3W0LA 4M7XA 4IJNA 4IO8A 5BRDA 3ATUA 2WUSA 3O4WA 4JHDA 2QWMA 1T44A 3A8YA 4PKIA 2PBDA 4A62A 3M6GA 3A5MC 1WUAA 3VENA 5JICA 4BRFA 2QW9A 3O6WA 5AFUA 2IVNA 3UKRA 4YDUC 4YDUA 3U9DA 1E4GT 4BVOA 3M1FA 3H45C 2P9NB 5FPDA 1U2VA 2E1ZA 3AAQA 1NGEA 4LC9B 4B1XB 3HBTA 3SK3A 4EFHA 2FF3B 1GLFO 2YJFA 3C7NA 4PL8A 3FGUA 2YHXA 1QZ5A 4GNIA 4K43A 2F9TA 1S3XA 4AM6A 1G99A 2FF6A 2QWQA 1YVNA 2FLOA 1JCFA 5E84A 3U4LA 5ADXH 2E2OA 1K8KB 3ZX3A 2BUPA 4FOIA 2HOEA 2FSJA 3RSEB 3SMPA 3C0BA 1V4SA 4CD3A 3ZEUB 4H5NA 2IVPA 4MLHA 2J4RA 1HLUA 4B9QA 2YI1A 4CI6A 1ZBSA 4H0PA 4FWLA 4IZ9A 1HX1A 3QBWA 4XH4A 3VERA 3M3ZA 2QWLA 4M63C 3H6EA 4FSVA 4FWQA 3VEVA 3HM8A 2Q31A 2E20A 3ENOA 1DEJA 2A41A 3JXUA 3W3DA 2Q0RA 4FL9A 1CZAN 2P9UA 2D0PA 4CZGA 4CZHA 2CGJA 3QB0A 3WXIA 4CZEA 3P4IA 3BEXA 3CJ1A 2P9KA 4CZLA 4EAHD 4FWMA 2Q0UA 3GL1A 2QWOA 4K41A 4PKHA 4QS9A 1TUYA 4FO0A 3L0QA 2NRHA 4BC2A 4JD2A 4JNEA 2ZWHA 3MMVA 5CE3A 2QWNA 4I6MA 3S41A 3JS6A 3CJ9A 1C0GA 1MWMA 5AR0A 5LJVA 4JHDB 1GLCG 4FPBA 2CGLA 3CI5A 4FPAA 4CJ7A 5AQOA 2W41A 1NBWA 4IJAA 3VGMA 2P9IA 4QS7A 3UKRB 3GG4A 2F9WA 1T6DA 4B1YB 3UKUA 2V51B 2KHOA 1QQMA 3A0IX 5AQYA 3GDQA 1GLBG 2D0OA 4M7YA 4EHTA 4RTFD 3CQXA 4JAXA 5BPNA 3C7NB 3HZ6A 3J8AA 4CD1A 3KHYA 2FSKA 4C23A 2GEMA 5EVZA 5AQFA 3FZLA 4ISEA 3OHRA 5JMVA 3U8XA 2CGKA 2IVOA 4BR4A 3FZHA 4BRKA 2BTFA 4NB4A 1NGCA 3UE5A 4BR0A 1TYQA 4DCHA 4BRPA 2QM1A 5AQVA 3ATVA 4H03B 1X9JA 3EO3A 2GWJA 4BRDA 2QWRA 1TUUA 1SZ2A 3VEYA 2YCHA 4E1JA 3KVGA 3D2FA 3EKSA 3MN5A 2Q97A 3O08A 5AQJA 1BUPA 4H5RA 2I7PA 4MO4A 3ULEA 5AFUH 2P9PA 2Q2RA 4BRCA 3GOIA 4BRNA 1IG8A 4O5FA 2E8AA 2V7YA 5AQGA 5AQZA 3U9ZA 3WUHA 3TU5A 1RGIA 5AQXA 2ZF5O 3ZX0A 4K42A 3I8BA 1Q18A 3LDQA 1ATNA 1NGIA 1HKGA 1S22A 4XH5A 4FWRA 1Z05A 1NGDA 3CJAA 3KZBA 4FWKA 1X3NA 1QHAA 4CZJA 3TPQA 3MN6A 5AQRA 2GWKA 2P9KB 3QFPA 5LY3A 1MA9B 4FWSA 4BR9A 5KPTA 1H1VA 3CQYA 2CH6A 4BR2A 3VEOA 3DAWA 3D2EB 1NGBA 3DXKA 5AQQA 3L6QA 3IMXA 3O8MA 3VGLA 2E2NA 1BA0A 2P9LB 5JLFA 1JCGA 4H5TA 2NLXA 5F0XA 4B1WB 3CERA 3WEEA 2A5XA 3A5OC 1DKGD 2OANA 4H0OA 1LOTB 5FPEA 3H1VX 3MN7A 2EWSA 4BRQA 2V7ZA 2ASMA 3CIPA 3SMSA 2A42A 4DB3A 3ZETA 3VOVA 1NLVA 4H0XB 4BREA 2FSNA 1YXQA 5AQWA 4BGBA 2DPNA 2ZGYA 4K25A 3L4IA 5BN9A 4FWOA 2A40A 5AQHA 3VF2A 3WXKA 1U6ZA 3VGKA 4A61A 5BPLA 4BVPA 3FR0A 5EOYA 4FOEA 3VEWA 2PAVA 1GLDG 3WQUA 4QS8A 5BRHA 1HKBA 2GTDA 1NMDA 2E2QA 2QXLA 4BC5A 1NGHA 2W40A 1K8KA 1P8ZA 3DJCA 3FE1A 4BR5A 1TYQB 4JN4A 4WQ5C 3WT0A 2AP1A 4H5WA 4WQ5A 3LM2A 4BRHA 3RSEA 4BC3A 3CJBA 4WQ4C 1ESVA 4WQ4A 4BRMA 1HUXA 4MO5A 3D2FB 2GUPA 4CZMA 1ATSA 3CETA 1KAYA 3EL2A 1U2VB 1MDUB 4CBWA 2HF4A 3UB5A 3BP8A 5KQ8A 1BDGA 1BWFO 2ASOA 2I7NA 2ZGZA 1GLAG 3IFRA 2E1YA 4XEIA 3O1WA 1KAZA 3ENHA 1X3MA 3IUCA 4BR7A 2VYPA 4ISGA 5AZJA 3DXMA 2ASPA 3DXKB 3IDHA 1V4TA 4KBOA 4WYBA 3WXJA 4BROA 3VESA 1GLEG 3D7EO 4IWVA 3MDQA 3SLCA 3QICA 3H3OB 3FLCO 3LDNA 2AA4A 2ITMA 1D4XA 1ZXOA 3VF4A 3WEEB 1NGAA 5AZIA 5KQDA 3GE1A 3ZX2A 4H0YB 5BRFA 4BG8A 3MK6A 3O80A 1XUPO 1YUWA 3BF3A 5B8HA 3LL3A 3ZETB 2UYTA 1KAXA 2E88A 3LDLA 5FPNA 4BRGA 2VWBA 1SQKA 2P9UB 4J8FA 4B1ZA 4BRIA 5EY4A 1NWKA 4RCHA 4CBUA 3A5LC 3CJCA 1BA1A 1BG3A 1GLJO 3FFKB 4BRAA 3I33A 4H5VA 5AQSA 1QQOA 2HF3A 2V52B 3R6MA 3EN9A 3SJHA 4MLEA 1T6CA 1RFQA 4XH1A 2H3GX 3QDKA 5ADXA 2P9SA 3EZWA 2FXUA 2YHYA 5EX5A 3VEZA 4JD2B 1NGGA 1OKJA 1JCEA 4Y0WA 4I6MB 5E26A 1BO5O 1XQSC 4Z94A 1ATRA 3VEXA 3G25A 4IXCA 1HKCA 3HI0A 1BU6O 2GELA 5AQUA 2A3ZA 3O5BA 4GY2B 3LM9A 5EXWA 5ELZA 1NGJA 3HSCA 1Y64A 2NZTA 1RDWX 2CH5A 2P9IB 5JLHA 4A2BA 5BREA 3B8AX 1SAZA 2D4WA 3UKUB 1NGFA 3VPZA 4RWTA 3H1QA 4PKGA 3BUZB 2P9NA 4H0TB 3MCPA 4BGAA 4NO7A 3R9PA 4DHYA 1LCUA 1WOQA 5F2RA 1HJOA 3CJ7A 5AQIA 3ID8A 3MN9A 3H46O 1QZ6A 3FZFA 2HMPA 3WQTA 4HWIA 3HTVA 3DWLA 5KPRA 2A6AA 5BR9A 3VF6A 5TKYA 3QBXA 4H0VB 3FZMA 1R59O 4DQ8A 1NM1A 1J6ZA 4HTLA 3O1BA 1E4FT 1QQNA 3AAPA 5AQTA 3ZEUA 4FWNA 5AZJB 3DXMB 4BQZA 2IIRA 5I9EB 3D2EA 3QMLA 3FZKA 1BOTO 4O8KA 4F9OA 1EQYA 3AARA 1KXPA 4FWPA 3ULEB 5AQMA 2D1KA 1C0FA 2P9LA 2YHWA 5AQNA 5FPMA 2P9PB 3H3NO 4B1UB 1MWKA 3QFUA 4BG9A 5AZIB 3F9MA 1XC3A 1DGKN 4CZFA 3R8EA 4BQLA 1ZC6A 4EIAA 4ISFA 5KPZA 4L3QA 4CBXA 3AY9A 1YAGA 1GLLO 3GBTA 4B1VA 3LDOA 1IJJA 5BPMA 3A5NC 4EHUA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1KVAA 2HNDA 2Q1NA 4H4OA 3CMAN 4PL7A 3OTOK 2W6KA 1Z6RA 2YJEA 4UY8O 3JSMA 4FZZA 4A2AA 1EX4A 5HRRA 4JKEA 4LSNA 4C1NK 3LWMA 4KHNA 2P5GA 4LF7K 5JS1A 1W7AA 4IJNA 1L3UA 3FFIA 3CCUN 3OYKA 4B9TA 4PQUA 4IO8A 3V1OA 1WN7A 3O4WA 5AJ3K 3NF9A 4JHDA 2QWMA 4KKOA 3VN5A 1VSEA 3VENA 4CEOA 3MX5A 3OYMA 4BRFA 4YDUC 4JI3K 4FJXA 2ZQBA 1Q86O 3K5LA 3M1FA 3PLAA 1GOAA 1U2VA 3AAQA 4B1XB 4LC9B 4DS5A 1JLAA 3SK3A 4PL8A 1GLFO 1LWFA 2HHVA 4KTWA 2OTLN 4H4MA 1QZ5A 3AVLA 4IFYA 3ISNC 2HHSA 4AM6A 1G99A 4UQGA 1JJ2M 2FLOA 5E84A 1JCFA 3OYLA 1IKXA 2JGUA 2XY7A 2VWJA 4W5QA 1Q9XA 4E3SA 3K57A 2BUPA 3IG1A 4FOIA 4KO0A 1C0UA 4BDYA 2FSJA 3VQEA 1KLNA 1BI4A 4XJXA 3ZEUB 5LMUK 4NCGA 3CQ8A 4IDKA 4FWLA 3NMUA 3AVJA 4XH4A 5M1NA 1C1BA 4YNQA 5MLCQ 2NRXA 4AHVA 1EP4A 2OCEA 4LSLA 2HMIA 3ENOA 3L2QA 4A57A 4DV2K 4OPKA 2A41A 3AVGA 2D0PA 4CERA 4CZGA 5HLFA 3QB0A 3P4IA 1YHQN 2HHTA 3PSIA 4FWMA 3GL1A 3E01A 3TSUA 3I55N 1R0AA 1IKVA 3VQ6A 4DSFA 1LWCA 2F7TA 3EY1A 3QNOA 3P1GA 1RT6A 3LAKA 3CJ9A 1MWMA 3TAEA 2OA8A 4FPBA 4JKCA 3LP2A 4HUEA 4FPAA 3T3FA 4B9SA 3M8RA 4FVMA 2HB5A 3QLHA 3VGMA 3THVA 5CHIA 1HR0K 5I42A 4ILHA 2JLEA 5KTQA 4J2DA 3UKUA 3NH2A 4CFCA 1K8AO 2QKBA 4KH6A 5AQYA 4DTOA 4M7YA 4EHTA 1I94K 5J2MA 3CCEN 3J8AA 4YOXA 4Q0BA 2FSKA 4C23A 3NE6A 2Y1JA 4K8ZA 5DM7L 3SAHA 5JMVA 4FJ5A 1JL2A 2CGKA 4JKAA 3OJUA 1SV5A 2YNFA 1S1UA 4NCBA 2BTFA 4B08A 1NK7A 1A5VA 2UXBK 1TYQA 1WB9A 4E7HA 2DY4A 3QERA 2KZZA 3ATVA 4DU3A 2HHIA 3OYHA 5C42A 4E1JA 3CCQN 3D2FA 2Q97A 5AQJA 1X9MA 4MO4A 2I7PA 3ULEA 4IOAL 1TAUA 2YV0X 4BRCA 3GOIA 1IG8A 5AQZA 4C8OA 3L8BA 2HBLA 1RGIA 3KLFA 4DR7K 4DLGA 4KV8A 1Q18A 1CZBA 1N33K 4XH5A 1U45A 4FWRA 1Q8IA 1TKDA 5SZTA 1NGDA 1M1KO 3ZT0A 4CHPA 3KD5E 2G8UA 1X3NA 4CZJA 2D0BA 3MN6A 5AQRA 5KRSA 4ICLA 4B8CA 4OPJA 4BR2A 4JRPA 1XHXA 3VEOA 2AJQA 3D2EB 4W5OA 3VQ8A 4M3ZA 3VTIA 1UWBA 1EO1A 2P9LB 4LFCK 3RMDA 3HVTA 1T03A 4OVLA 3VQPA 2NLXA 1BGXT 1P90A 3V6DA 4B1WB 3WEEA 3A5OC 2OANA 3LP1A 3CF5L 1LOTB 4Z4IA 1QE1A 3H1VX 3HP6A 2EWSA 4BRQA 3IKMA 4JI2K 3TTFA 2IC3A 3VQBA 2XY6A 3ZETA 3AGRA 2PZSA 4CEEA 1YJWN 4H0XB 4CHOA 4C8MA 1XHZA 5AQWA 1SL1A 5CR4A 3J7ZO 3DRRA 2Z1JA 3QEWA 2A40A 1TKXA 1CXUA 1RDBA 4CF2A 1NMNA 2D0CA 5BPLA 4QS8A 3QEVA 3KIOA 1VSLA 4BC5A 2X74A 4Z4FA 1JLBA 1VHXA 3DJCA 3LANA 2NUBA 3IRXA 3K5NA 4WQ5C 1D9DA 2AP1A 4DQIA 2YNHA 2NRZA 4BRHA 4BC3A 3J7AP 4FW2A 4WCEL 1HUXA 3CCMN 3ZSOA 1D9FA 3O9RA 3RR7A 1RDUA 4DFKA 2R7YA 4E1NA 1NU0A 4LH4A 1LW2A 5CZ1A 3L2WA 1NJWA 5EU7A 3N4QA 4K8XA 4KHSA 1BWFO 4MFBA 2PYJA 2O4GA 2NRRA 3T1YK 1GLAG 4KREA 3QETA 3O1WA 1KAZA 1X3MA 3IUCA 1HYZA 2NRWA 2IGIA 2WONA 2DFHA 3OYGA 1VQ4N 2HVHA 2IDOA 2UU9K 4RW7A 3DXMA 2ASPA 3IDHA 4KPYA 1BQNA 3ULDA 1RT2A 1V4TA 4IG0A 4FLYA 3NGYA 3S9HA 3VQAA 4J2AA 4CJQA 4N5SA 4HTUA 4B8AB 3H3OB 2ITMA 1ZXOA 3VF4A 5GAGP 3OS2A 4FCYA 2VG6A 3O80A 1XUPO 4NYNA 1YI2N 3AVCA 3TAQA 3LWLA 4CW7B 2PY5A 4CHNA 5FPNA 4OPHA 3DLLL 3NVKA 3SI6A 3BY5A 1J54A 4BRIA 2OPQA 5EY4A 4CK3A 4M3RA 3A5LC 3CJCA 1BA1A 1BG3A 2HNYA 2YHAA 4CBUA 4CJVA 3CPWM 4HUFA 4AHSA 3I33A 3NGIA 3AVMA 4KH5A 2UUBK 1VSMA 5C15A 1RFQA 1C1AA 1WSJA 3EZWA 2FXUA 4DSEA 5EX5A 4DFPA 1NGGA 1Q9YA 4C8LA 1XQSC 4Z94A 4BE2A 1YJNN 1A5XA 1TKZA 1HKCA 3HXMA 3EZ5A 5AQUA 3O5BA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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