3U9ZA

Crystal structure between actin and a protein construct containing the first beta-thymosin domain of drosophila ciboulot (residues 2-58) with the three mutations n26d/q27k/d28s
Total Genus 119
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
119
sequence length
366
structure length
357
Chain Sequence
TALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title How a single residue in individual beta-thymosin/WH2 domains controls their functions in actin assembly
pubmed doi rcsb
molecule tags Contractile protein, protein binding
source organism Drosophila melanogaster
molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
total genus 119
structure length 357
sequence length 366
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-10-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3u9zA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3u9zA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3u9zA03
4MO4A 1G99A 3FZMA 1GLFO 2GTDA 3O5BA 3VEXA 3H3NO 3CJ1A 3UKRA 5KPZA 1J6ZA 5EXWA 1IJJA 4BRNA 4IZ9A 3MCPA 2P9PB 2PAVA 2Q1NA 4O5FA 4CZLA 1NGCA 4ISGA 4BROA 2Q0RA 1MWKA 3C7NA 4BRHA 3VGLA 4ISFA 3H1VX 2ZGZA 4H5RA 1KAYA 5JLHA 1NGHA 3QB0A 3WXLA 1NM1A 5JICA 1HKCA 3WXJA 2NRHA 1S3XA 3EZWA 1P8ZA 1HKGA 3SMSA 4XH4A 5BPLA 1ZBSA 4WQ4C 4PKGA 4M7YA 3AARA 1BWFO 4BRLA 2KHOA 2FSNA 3P4IA 4AM6A 1BUPA 2AP1A 3DWLA 3MDQA 4JHDB 3QFPA 3ZEUA 2A40A 4BRGA 2GELA 3JXUA 1BG3A 3CIPA 1SQKA 3R6MA 2GEMA 2D0OA 4RWTA 3W0LA 1QQNA 3DXKB 4FPBA 1WOQA 4H5WA 4K41A 1ATSA 5EX5A 5AQWA 3VF6A 4B1XB 2P9PA 3KHYA 4WYBA 1X9JA 5KQDA 3DAWA 3LDPA 4K25A 2HF4A 4L3QA 4BRDA 2P9SB 4FOEA 3BF1A 3MK6A 3ZX0A 2E2QA 5BN8A 4HTLA 4A2BA 5AQOA 4BR4A 1XC3A 4JNEA 2QWLA 1NGFA 5AZIA 1X3NA 4IWVA 4FWPA 3VF2A 3A5LC 3L4IA 4BR2A 3ENHA 1ZXOA 3BP8A 3ID8A 4A2AA 4CBXA 2W41A 4CZJA 4MO5A 4DHYA 5KQ8A 2PBDA 4IJNA 2QWRA 2A6AA 1E4FT 3CJ9A 3DXMA 5F0XA 3A5OC 3AAPA 2ASOA 1JCFA 4BREA 5BRFA 2FF6A 3RSEB 4JHDA 4PL8A 4BR0A 1KXPA 2AA4A 2VYPA 5FPNA 5TKYA 3KZBA 3IUCA 5BR9A 3A5MC 3GDQA 3H3OB 3EL2A 1Z05A 3CETA 3R9PA 1BA1A 2CH5A 3VEYA 1JCGA 2E2PA 3DXKA 5CE3A 5BN9A 4Z94A 4CD1A 4BR7A 1Q18A 2BTFA 1HKBA 4CZFA 1IG8A 2P9SA 2D1KA 1QQOA 1TYQB 1XUPO 2E2OA 2NLXA 4RCHA 4BRMA 4F9OA 3IDHA 3HM8A 4KBOA 1QQMA 1YUWA 3MN6A 1D4XA 4FWSA 3D7EO 3U4LA 2W40A 4FWNA 1DKGD 2QWPA 3J8AA 3FGUA 1GLAG 1NWKA 5EY4A 1RFQA 3VESA 2GWJA 3TU5A 3C0BA 4BC2A 4B1YB 2QWQA 3RSEA 1NGJA 4H0YB 4FWRA 1HJOA 4BG8A 1BOTO 2H3GX 4H5VA 1HLUA 5AFUA 3CI5A 4BRIA 2QWMA 5AQRA 3BEXA 4I6MB 1ESVA 1T6CA 3CQXA 3U8XA 4CBUA 2ASMA 4FWMA 4H0OA 1U2VB 5AQLA 3JS6A 3H45C 3CJAA 3GE1A 1U6ZA 3O8MA 2I7NA 1QHAA 4FWQA 3ZX3A 4EAHD 2CH6A 1TYQA 3R8EA 3IFRA 4BG9A 3CJBA 3D2EB 1ATNA 1GLJO 1QZ6A 4PL7A 2EWSA 3QBXA 3FLCO 3CJ7A 4BR9A 1RGIA 3LDQA 4HWIA 1NGBA 4DQ8A 3U9DA 2YHWA 4LC9B 3ULEB 3G25A 4XH1A 2IIRA 3GG4A 2P9KA 1HPMA 2P9UB 4H5NA 5LY3A 5EVZA 5AZJB 4WQ5A 1DGKN 2P9LB 5AQKA 1SZ2A 2VCPA 5JLFA 1NGAA 4EIAA 3MMVA 4BC3A 4M7XA 2QWOA 3I33A 3TPQA 5ADXA 1T44A 3M6GA 3LL3A 1TUUA 3EO3A 4IXCA 3SK3A 3EKUA 1HX1A 3HSCA 4XH5A 3B8AX 1C0FA 1V4SA 3QFUA 3WXIA 4I6MA 2BUPA 3O1BA 4FO0A 4YDUA 4BC5A 2E1YA 1SAZA 3H6EA 3GL1A 3QBWA 3VENA 1ZC6A 5AQJA 1E4GT 5AQZA 4BRCA 2YI1A 1TUYA 1NGDA 1U2VA 3UE5A 3UB5A 2F9WA 3S41A 3CQYA 4FL9A 1C0GA 4FSVA 3WXKA 5LJWA 3ZETB 3ATVA 2QXLA 3OHRA 4CZEA 1WUAA 3GBTA 4JD2B 3D2EA 4CZIA 3O1WA 4FPAA 5KPTA 3U9ZA 1KAZA 2VWBA 4QS7A 3HBTA 3ULEA 5ELZA 4DB3A 3AY9A 5FPDA 4XEIA 1MA9B 1NGEA 3FZHA 3UKUB 3FZFA 3VEZA 4C23A 2P9LA 4E1JA 3WQUA 2YJEA 1K8KB 1V4TA 3LDLA 4QS9A 1NGGA 3L0QA 2GWKA 2WUSA 2YCHA 3GOIA 5AQHA 2Q36A 2A3ZA 3DJCA 4GNIA 1GLEG 4CZHA 1LOTB 3VEWA 4CBWA 2FXUA 1T6DA 5AQVA 4BRPA 3LM9A 4NB4A 4BRFA 2FF3B 3FFKB 4CI6A 5AQIA 2HOEA 5AQNA 2IVOA 2ZGYA 5AFUH 1YXQA 1BU6O 4A61A 4B1WB 5FPMA 4RTFD 3VGMA 3C7NB 4BRAA 3VETA 4BR5A 2A41A 3QDKA 3ZETA 3W3DA 3KVGA 4BVOA 4JD2A 2FSKA 2ITMA 1RDWX 4O8KA 4J8FA 1MDUB 1NLVA 2IVNA 1BO5O 3A8YA 5KPRA 3FR0A 3WEEB 3QMLA 4B9QA 4PKIA 1GLDG 4FWLA 2Q0UA 2Q31A 3UKUA 2HF3A 4BGAA 3O4WA 3I8BA 3LM2A 4EHUA 4K42A 1BA0A 3ZEUB 3VOVA 3FZKA 4H0PA 3EN9A 3IMXA 5AQMA 2ZF5O 5B8HA 2GUPA 2HMPA 2E88A 4BQZA 1HUXA 2CGJA 4DCHA 2I7PA 5BREA 3MN5A 4CJ7A 5ADXH 1DEJA 5AQGA 4CZMA 3M1FA 5AQYA 2D4WA 4QS8A 3HZ6A 4JN4A 1Y64A 4GY2B 4Y0WA 3WT0A 1GLLO 1BDGA 1NMDA 1CZAN 3QICA 5BPNA 2P9IB 5AQSA 2E20A 4M63C 5AZIB 3MN9A 3D2FB 3CJCA 3SLCA 3ZX2A 2Q97A 5EOYA 3BUZB 3WUHA 4CZGA 1S22A 2J4RA 3WEEA 2YHXA 3EKSA 4B1VA 3DXMB 4H5TA 3VGKA 4IO8A 4EFHA 1EQYA 2QWNA 1GLCG 4K43A 2FSJA 3A0IX 1YAGA 4FOIA 2QM1A 5AQXA 4JAXA 2E8AA 4H0VB 5JMVA 3ENOA 3H1QA 3SMPA 1YVNA 3VEVA 2P9NB 4NO7A 4AM7A 3MN7A 3FZLA 4BGBA 2NZTA 4BRQA 4CD3A 3L6QA 5AQTA 4MLEA 2FLOA 2V51B 2CGLA 5FPEA 3LDOA 3ATUA 3BF3A 1NGIA 3O6WA 4A62A 1R59O 4FWOA 5AQPA 5E26A 2A5XA 3H46O 1Z6RA 3VF4A 4EHTA 2P9UA 3VEOA 3O80A 4H0TB 3CHWA 2P9IA 5I9EB 5AZJA 3HI0A 5F2RA 5AQFA 1H1VA 3D2FA 5LJVA 2ZWHA 2CGKA 3SJHA 3M3ZA 4CZKA 3F9MA 2D0PA 3HTVA 2UYTA 4PKHA 1OKJA 4H03B 4ISEA 3AAQA 5AR0A 3FE1A 4FWKA 2YJFA 3CERA 2OANA 2Q2RA 2V52B 3UKRB 4BRKA 2DPNA 2P9NA 4WQ4A 2ASPA 4WQ5C 1ATRA 5AQUA 4B1ZA 1X3MA 3VERA 1MWMA 4BC4A 1XQSC 4BQLA 3WQTA 3A5NC 5E84A 5BPMA 3LDNA 2QW9A 4YDUC 1NBWA 4IJAA 3VPZA 1GLBG 5AQQA 5BRHA 4H0XB 2E1ZA 2V7ZA 3O08A 5F1XA 1LCUA 2IVPA 1K8KA 2YHYA 4BVPA 5BRDA 1JCEA 4B1UB 2A42A 1KAXA 2E2NA 2P9KB 1QZ5A 2V7YA 2F9TA 4MLHA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3L2VA 4DR4K 4M3YA 5HRNA 2R7YA 3O5BA 3H3NO 1BIZA 3Q7BA 2KFZA 3N4PA 3NVKA 1IJJA 3R1XA 4BRNA 4LFAK 3HSTB 2P9PB 1NGCA 4DV0K 1LV5A 2Q0RA 2F8SA 4CECA 2ZGZA 3CPEA 1K6YA 3BDPA 5EU7A 4CJ5A 5M1QA 1S3XA 4CEFA 2Y1IA 3EZWA 4A59A 1S1UA 2ZD1A 4XH4A 4WQ4C 4PKGA 1VQLN 3E9LA 2F7TA 4CF8A 3PX0A 4N41A 4KHYA 3F73A 4DSFA 4AM6A 4OJRA 3DWLA 4JRQA 3S3OA 3QFPA 2A40A 1ZBFA 2GELA 3JXUA 2YHAA 4CJQA 3CIPA 2HHSA 1SQKA 3D6RA 4E7JA 1WAFA 4HHTA 2HVIA 3TARA 5EX5A 4J2DA 3V81A 3SYZA 4BY9C 3TTFA 4AHTA 1X9JA 1HNVA 3TR8A 5KQDA 3DAWA 4PHTX 4BRDA 2P9SB 1JLGA 1KRPA 2YX6A 4E72A 4A2BA 2OZSA 1S5JA 4BR4A 3NBPA 3SPZA 5C42A 4XJXA 1SV5A 1HNIA 3O4NA 3VF2A 3A5LC 3AVBA 3ENHA 3HO1A 2W41A 4DHYA 4CEDA 4PY5A 3DXMA 3AAPA 4NYFA 2ASOA 3BY5A 4BREA 4OPJA 3SQ1A 2FBTA 4BR0A 3D45A 3OYJA 2VYPA 3HRGA 5FPNA 3IUCA 2IAJA 3VQBA 3OS1A 4KTQA 1Z05A 4EP4A 2VG7A 1BA1A 4FLYA 3TTCA 3DXKA 5BN9A 2RE2A 2HBMA 5C25A 4FK0A 1HKBA 4CJFA 3SUQA 1QQOA 5DM7L 2E2OA 4BRMA 1VRUA 3KLGA 5HRSA 4LF4K 2WTUA 2VQEK 1QSYA 1Z26A 4R5PA 1TAQA 5A2QO 2E6MA 4X64K 3FGUA 2Z1HA 3CF5L 1OH7A 1WLJA 4CE9A 3RMDA 3QEXA 4HUFA 3SBGA 2QWQA 4PQUA 1NGJA 3CFRA 4FWRA 4J2BA 4DF8A 5AFUA 5AQRA 4C1NK 1WB9A 4LSLA 4I6MB 1ESVA 3F2KA 1NJIO 2ETJA 4ZHRA 3S3NA 2KLAA 1C1BA 5AQLA 3CJAA 2NRVA 4B3OA 2B4JA 4JK9A 1J53A 3K0SA 1QHAA 3M8QA 3DLBA 4FWQA 3ZX3A 3R8EA 4BG9A 1FXXA 3D2EB 1ATNA 4JLHA 3QBXA 4DQSA 2JWLA 1D5AA 3LDQA 3U9DA 2YHWA 3G25A 3K59A 5GAHP 1HPZA 4ILHA 3D0PA 1KVBA 5JLFA 2VCPA 1TL3A 3CXCM 4FJMA 4KRFA 4EIAA 2DFFA 3MMVA 4X66K 4CFCA 1RBSA 4IXCA 2JLEA 3B8AX 4B9SA 1HQUA 4FJJA 1MU2A 1DTTA 3O1BA 4CJ4A 3T19A 4OX9K 4ZTJA 2A1SA 2YI1A 2B5JA 1WSGA 3CCQN 4I7FA 5C24A 1L3TA 3UE5A 3UB5A 3CFPA 5JS1A 4W5RA 3VA0A 3WXKA 3ATVA 1VHXA 4GW6A 4J2AA 4DR5K 4CZIA 5AJ3K 3HVTA 3O1WA 4DMNA 2ZJPL 3RMCA 3AVJA 5KPTA 4CK3A 2UUCK 4FJLA 3OYLA 3IG1A 3AY9A 1MA9B 3ASMA 1CLQA 3AO2A 2O8BB 4DR6K 3VEZA 1C1AA 3WQUA 3LDLA 1K8KB 2YNFA 3ZT0A 3QERA 1T05A 4NYNA 4E3SA 2Z1IA 2HHTA 5AQHA 3NGZA 2Q36A 3K5OA 5HRPA 4GNIA 1LOTB 3VEWA 4A5BA 3KLIA 4M3WA 4DSIA 5M1KA 1SKRA 5AQIA 2HOEA 5AQNA 2IVOA 3SAHA 2ZGYA 3PIPL 5FPMA 1FKPA 2NRXA 4RTFD 4E1MA 3VA3A 1RNHA 1W0HA 1Q9YA 5T7BA 1N33K 3ZETA 4BVOA 1S6QA 3V1OA 1RDWX 4IEIA 4JKGB 3BZKA 3O9TA 1NLVA 5J2QA 2IVNA 5K14A 5KPRA 4BGAA 4F2RA 4MDBA 3VMFB 3I8BA 4DSKA 4EHUA 4K42A 3ZEUB 1K8AO 3EN9A 3NHGA 3FFIA 4CGIA 3V9UA 2XY8A 4NXMK 3TSQA 2KZMA 1HMVA 4QAGA 4B9MA 3PX6A 1BCMA 2Z1JA 1JJ2M 3P5JA 1RT6A 4M3UA 3J7ZO 2YKNA 3MEEA 4QS8A 5IT9O 3SNNA 3NFAA 1GLLO 2NRTA 3TAPA 1NMDA 1CZAN 5C12A 5BPNA 5AQSA 3HM9A 1GOBA 3O3FA 3D2FB 1B9FA 4G1QA 3H08A 3ZX2A 1WSEA 1ASUA 3BUZB 5FDLA 4CZGA 4CJVA 3WEEA 2YHXA 3EKSA 3TABA 3CCVN 3HJFA 2PZSA 3S5TA 2QWNA 1GLCG 4RW9A 1P90A 1ZBIA 2WBNA 1TKZA 5JMVA 4YNQA 3ENOA 4RW6A 3SMPA 4CIFA 1XHXA 3MN7A 3FZLA 5KTQA 1HQEA 2GV9A 3IRXA 3OYMA 4CD3A 3THXA 3G6EN 2E6LA 5C2FA 2FLOA 2Q3SA 4AHUA 3LDOA 4KO0A 3RWUA 3BF3A 1NGIA 4AHSA 1IO2A 4FWOA 4J2EA 2A5XA 4M45A 1Z6RA 1TL1A 2HB5A 1FK9A 3O80A 3CHWA 3HI0A 5F2RA 3SV3A 4UY8O 5LJVA 2OTJN 5C0YA 4CJEA 3SJHA 3HTVA 4I9LA 3OYAA 4WE1A 1XNQK 2LSNA 4M3XA 1CXUA 3MCAB 4CIGA 2HMIA 4GV9A 1YT3A 4FWKA 3OJUA 2BANA 3I55N 2W6LA 4M3RA 3SBTA 2DPNA 4WQ4A 4IOCL 2QXFA 4DSEA 3TAFA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 1SL1 A;  3VEV A;  2P9N B;  3AVI A;  2NZT A;  1Q7Y O;  5CYQ A;  3TSU A;  1S1V A;  4BE2 A;  1VSI A;  2QKK A;  2UXD K;  4IDH A;  5FPE A;  4RW4 A;  1WN7 A;  1J9A A;  4LFC K;  1SS6 A;  2VG5 A;  3O6W A;  4A62 A;  4DUY K;  1KVA A;  2YKM A;  1ASV A;  3H46 O;  3VF4 A;  4DR2 K;  4H0T B;  1VQK N;  5I9E B;  3OTO K;  3D2F A;  3ZT4 A;  2ZM6 K;  3F9K A;  4JYA K;  1VQP N;  1JLE A;  4OPH A;  3K58 A;  4JI1 K;  5IWA K;  3V9Z A;  4H03 B;  4ISE A;  3AAQ A;  3HXM A;  3FE1 A;  4I2Q A;  2YJF A;  2Q2R A;  2OAN A;  3DOK A;  4KV8 A;  3VQA A;  4BRK A;  4KHN A;  4WF9 L;  4YOU A;  1BL3 A;  4CFD A;  4HCB A;  1X3M A;  1S1W A;  4A5A A;  4DQI A;  2GUI A;  3PX4 A;  3DOL A;  1VQ6 N;  1XQS C;  4FZX C;  1L5U A;  4FM2 A;  4N56 A;  5BPM A;  2XY5 A;  3O9U A;  2QW9 A;  2W42 A;  4GVE A;  2NRR A;  5BRH A;  1SUQ A;  5M1O A;  3HPO A;  4DV7 K;  5F1X A;  4DTR A;  4CHY A;  5MLC Q;  4B1U B;  1A5V A;  1I94 K;  3RTV A;  2VGN A;  1QZ5 A;  4CHN A;  1J5E K;  2V7Y A;  5M1F A;  4X62 K;  4C8N A;  4MLH A;  3SCX A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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