3UE5A

Ecp-cleaved actin in complex with spir domain d
Total Genus 121
50100150200250300350020406080100120
Genus TraceResidueGenus

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
121
sequence length
371
structure length
364
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKCF
5010015020025030035035030025020015010050
020406080100120Genus Matrix

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
EMPTYS1 (8-12)S8 (75-76)3H1 (62-64)TIV1 (13-16)TVIII1 (27-30)S2 (16-21)TII1 (21-24)AH1 (55-61)S3 (29-32)TIV2 (38-41)TVIII2 (69-72)S4 (35-38)S6 (65-68)S9 (103-107)AH3 (113-126)S7 (71-72)3H2 (98-100)AH13 (359-365)TII2 (108-111)3H8 (350-352)S10 (131-136)TIV5 (156-159)TIV6 (165-168)S13 (169-170)S11 (150-155)S12 (160-166)AH5 (182-195)S14 (176-178)S15 (238-241)AH7 (223-232)3H6 (302-304)AH6 (203-216)TVIII4 (220-223)TI2 (242-245)TI1 (234-237)S16 (247-250)AH8 (252-259)3H4 (260-262)AH11 (309-320)AH9 (274-284)AH10 (287-295)S17 (297-300)TI4 (332-335)3H7 (335-337)TI5 (352-355)S19 (357-358)TI6 (353-356)S18 (329-330)S5 (53-54)TIV3 (71-74)TIV4 (76-79)AH2 (79-93)TVIII3 (129-132)AH4 (137-145)3H3 (172-174)3H5 (264-267)TI3 (322-325)TII3 (306-309)AH12 (338-348)TIV7 (195-198)Updating...
connected with : NaN
molecule tags Contractile protein/transport protein
source organism Drosophila melanogaster
publication title Multiple Forms of Spire-Actin Complexes and their Functional Consequences.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
total genus 121
structure length 364
sequence length 371
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-10-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3ue5A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3ue5A02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3ue5A03
3A0IX 3ATUA 3EKSA 4DB3A 3LDPA 5F1XA 5JMVA 1NGFA 5LJVA 3ZEUB 1T44A 3H46O 3CQXA 3L4IA 1EQYA 2I7PA 5BN8A 3LDQA 5BRDA 2E20A 1ATSA 3IDHA 4CZJA 2QM1A 1TYQA 3WQTA 3VGLA 2YCHA 3O5BA 4H5WA 3D7EO 1RFQA 4IXCA 4CBWA 1GLJO 3H45C 3A5LC 2VYPA 3UB5A 5AQFA 3GDQA 1RGIA 3DWLA 4O8KA 2CH6A 4IWVA 3ZX2A 4JD2A 1DEJA 4FWLA 4JD2B 1KAZA 3VEVA 2E88A 5AQTA 5AQKA 2V52B 2ZF5O 3BEXA 4H0TB 4GNIA 5KPTA 5BREA 2YHWA 5AQVA 3EZWA 1NGJA 2E1YA 2ZGZA 3FZHA 3HZ6A 3WEEB 3SMPA 5EY4A 2QWOA 5EX5A 1TUUA 4HWIA 4H0PA 3FZLA 4FWMA 1NM1A 1E4FT 4IO8A 3QFUA 1JCGA 1YAGA 4GY2B 3SMSA 2Q36A 4BR5A 3KHYA 1NGCA 3MK6A 5BPLA 5AQSA 3WXKA 3R9PA 4RCHA 3VGMA 3CQYA 3C7NB 2GTDA 1P8ZA 5FPMA 2PBDA 1U6ZA 5I9EB 3M1FA 2Q0RA 2PAVA 4XH1A 3P4IA 3QMLA 4C23A 3VOVA 4CZLA 4BG9A 4BR2A 2FXUA 4JN4A 4NB4A 5BN9A 4H5NA 4BRAA 2FSKA 3QICA 1DGKN 4BRKA 4JHDA 4B1XB 2BUPA 4FSVA 3ULEA 1NBWA 2D0OA 2ASMA 1NGEA 3F9MA 4FWKA 4H0OA 3ENHA 4JHDB 5AQPA 2FF6A 4EIAA 2E2OA 3O08A 3AAPA 1QZ6A 4BRIA 5LJWA 1E4GT 4FPAA 3WXIA 2FSNA 2OANA 1Z05A 3U9ZA 1RDWX 2GEMA 3O6WA 2FSJA 4PKHA 5AFUA 3MDQA 5FPEA 5CE3A 1R59O 5B8HA 5BRFA 2QW9A 4WQ5C 4ISFA 3W3DA 4FWSA 1XQSC 3RSEA 4A2AA 2E2PA 2VCPA 1ESVA 3MN9A 4A62A 3RSEB 3WXJA 3FLCO 4BR4A 3FGUA 3BUZB 4FPBA 4B9QA 1QHAA 4BR0A 2CGLA 1WUAA 3QBXA 4CZKA 3M6GA 4K41A 1MWKA 5BRHA 1JCEA 3LDOA 1G99A 5AQZA 2F9TA 4FOEA 4CZGA 2E1ZA 5AQHA 3FZKA 1LOTB 5AQWA 3LM2A 3BF1A 3LM9A 1TUYA 5ELZA 1MA9B 5JLFA 3H1QA 3SJHA 4MLEA 4BC5A 2D0PA 3QB0A 3FR0A 1C0GA 3KVGA 2QWQA 3R8EA 5F0XA 4CZEA 2QWLA 2HOEA 3ZEUA 1BO5O 3L0QA 4BREA 4AM6A 4DCHA 2ZGYA 5JICA 3BF3A 1BG3A 4IZ9A 4Y0WA 4BRCA 4QS7A 1QZ5A 5AFUH 2QXLA 2D4WA 4L3QA 1D4XA 4BQZA 1MDUB 3A8YA 2IVPA 3MN5A 5BR9A 4WQ4A 1BUPA 3ZETA 3J8AA 3VF4A 4BRMA 3KZBA 3ZETB 4ISGA 2A40A 5AQXA 3GG4A 4H5VA 1Y64A 2IVOA 3CJBA 1WOQA 2HF4A 3H1VX 1BA0A 1KXPA 4BRFA 4RWTA 1J6ZA 3JS6A 4QS9A 2P9IA 3ATVA 4FWPA 3I8BA 2HMPA 2P9PB 2EWSA 2P9IB 3ID8A 3WEEA 3A5MC 1H1VA 4YDUA 2DPNA 1YUWA 3UKRA 1HJOA 4EHUA 3O80A 3UKRB 3I33A 3HM8A 2NRHA 4PL8A 2GELA 2W40A 2W41A 3BP8A 1XC3A 2YJFA 3IFRA 4E1JA 3C7NA 3D2FB 1T6CA 3D2EB 4JNEA 3DAWA 1NGBA 4IJAA 5AQQA 4BRQA 3H6EA 5LY3A 2QWRA 1HX1A 2QWMA 3VETA 4FWQA 3IMXA 3UKUA 3VGKA 4ISEA 3UKUB 1NGGA 4CZMA 4BC4A 4BRGA 3VEXA 3AARA 5AZIA 4B1VA 5BPMA 1X3MA 2P9NA 2D1KA 2V7ZA 5AZIB 2GWKA 1QQNA 5EOYA 3CJAA 2P9NB 3EKUA 3MMVA 5AQOA 4PL7A 4BG8A 4MO5A 2A5XA 3O1BA 5ADXA 3AAQA 5TKYA 2E2NA 2YHYA 1IJJA 5AQNA 4A2BA 5E84A 1NGDA 1OKJA 1ZBSA 5JLHA 3QDKA 2Q97A 1ATRA 3OHRA 2GWJA 3O8MA 3H3OB 4MO4A 1S22A 3O4WA 4RTFD 4Z94A 1SQKA 1SZ2A 3HBTA 3EO3A 4K25A 3CIPA 4EFHA 2NLXA 5E26A 2P9UA 1YXQA 1S3XA 2Q31A 3S41A 3VEZA 4KBOA 2P9UB 4CD1A 1QQMA 3M3ZA 2UYTA 1X9JA 5AZJA 3FZFA 4FO0A 3VEOA 4BRPA 4BRLA 5AZJB 1ZC6A 4BC3A 4FOIA 1KAYA 1Q18A 2A42A 2A41A 4XEIA 2P9LA 5AQLA 1V4TA 1ZXOA 4IJNA 4BVOA 2V51B 4EHTA 3AY9A 3CJCA 2P9LB 3MN6A 4I6MA 1GLBG 3QBWA 3R6MA 2YHXA 4XH4A 1NGHA 2CGKA 4I6MB 1GLLO 5AQUA 1K8KA 3VENA 5AQIA 4BQLA 4FL9A 3U9DA 1K8KB 3DXMA 5ADXH 1BWFO 4BC2A 3WUHA 2FLOA 3CJ7A 3CI5A 3DXMB 5KQ8A 3L6QA 2IVNA 1C0FA 3WQUA 3B8AX 4B1UB 1T6DA 3GL1A 1GLDG 1HKCA 3WXLA 3GE1A 1BA1A 1ATNA 4CZHA 2CH5A 4CJ7A 3EN9A 3U4LA 4NO7A 2IIRA 3DXKA 2P9PA 2HF3A 5BPNA 1KAXA 3VESA 2A3ZA 1NGAA 4CI6A 1MWMA 3DXKB 4DQ8A 5F2RA 5AQGA 4CZIA 4K42A 4QS8A 1TYQB 4O5FA 4BR7A 4WQ5A 3HSCA 2ASPA 2J4RA 2ASOA 4H5RA 4H0YB 4B1YB 3TU5A 4B1ZA 4BR9A 3QFPA 4K43A 3VF2A 3HI0A 1V4SA 3D2FA 3DJCA 3LDLA 3D2EA 1HKBA 2FF3B 1DKGD 3GBTA 2QWNA 5AR0A 2AA4A 4FWOA 2P9SA 2KHOA 1LCUA 2P9SB 2H3GX 1BOTO 3GOIA 3MCPA 5FPDA 3A5OC 2Q1NA 3FFKB 2WUSA 3TPQA 1Z6RA 2P9KA 5AQJA 4AM7A 4H03B 4EAHD 4H5TA 3LDNA 2P9KB 2NZTA 4F9OA 3C0BA 4M7YA 4CZFA 2CGJA 2ITMA 3CERA 1NLVA 1CZAN 2Q2RA 3SK3A 3ZX0A 2YJEA 4FWNA 1NWKA 4CBXA 3JXUA 3ZX3A 2A6AA 4BROA 2I7NA 4HTLA 2VWBA 4PKIA 2AP1A 5EVZA 5AQYA 5KQDA 5EXWA 4WQ4C 1IG8A 4J8FA 5AQRA 2ZWHA 4B1WB 3MN7A 3HTVA 5KPRA 1GLAG 4DHYA 3ULEB 1X3NA 3O1WA 3LL3A 3A5NC 1HLUA 3EL2A 3IUCA 2E8AA 2V7YA 2E2QA 4BGAA 3VF6A 1XUPO 3CETA 3WT0A 5FPNA 3VEWA 4LC9B 3VPZA 1HPMA 1U2VA 4A61A 4YDUC 4M63C 3ENOA 4BRDA 1U2VB 1GLFO 1GLCG 3G25A 3SLCA 1BDGA 3VERA 4CBUA 3CJ9A 3H3NO 2GUPA 1QQOA 1HKGA 4BRNA 1HUXA 4FWRA 4MLHA 1JCFA 1YVNA 4CD3A 3CHWA 1NMDA 4PKGA 5AQMA 4M7XA 5KPZA 4JAXA 4BVPA 4H0VB 3VEYA 2F9WA 4WYBA 4XH5A 1BU6O 3FE1A 4BGBA 1SAZA 2YI1A 4H0XB 2BTFA 1GLEG 3W0LA 4BRHA 3UE5A 3CJ1A 2QWPA 2Q0UA 3U8XA 1NGIA 3FZMA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3O3HA 3EKSA 3ATUA 4DU3A 1D8YA 4DB3A 5F1XA 3TAPA 3MXMA 3U3GA 3O9UA 3PO5A 2D0BA 3SUNA 4GVMA 1TL3A 1LW0A 1BCMA 1RBTA 4H5WA 4FJ7A 4FJLA 3V1QA 4PUOA 2RE2A 3C6HA 4CW7B 3DWLA 4O8KA 4IWVA 1WAFA 2DY4A 3DYAA 1EKEA 5IWAK 1D9FA 4KHWA 1RT1A 3ISNC 5AQKA 3T1YK 4CESA 1XHXA 1VQPN 4GNIA 3QEVA 4N41A 2X74A 5AQVA 4Z4FA 3C95A 4FZZA 3LPUA 2W6KA 3HZ6A 3CQ8A 4LF7K 3KLGA 4HWIA 1FKOA 4H0PA 3FZLA 1NM1A 3EEQA 4KPYA 1HNZK 1JCGA 1I94K 4FK2A 2Q36A 1NGCA 3WXKA 3VGMA 3T7ZA 3AO4A 2PBDA 3OYFA 3HPOA 2HBKA 4A59A 3T1AA 4C23A 4W5OA 2NRWA 3VOVA 1BI4A 4JN4A 2YNFA 1KRPA 1OVQA 4BRAA 2FSKA 2FBTA 3O9QA 4JHDA 3CCQN 4Z4CA 1WLJA 1T03A 2D0OA 2ASMA 3F9MA 4FWKA 2F4VK 5FDLA 3RMCA 1K8AO 1U48A 3K5NA 3ITHA 2PYJA 3WXIA 2NRZA 1LWFA 3TANA 4CGGA 3CC4N 1ILYA 2FSJA 3OYBA 1R59O 3VQBA 1RT6A 2G8UA 1REVA 2E2PA 1KSPA 1NK7A 4GKJK 4DV0K 3AVHA 3WXJA 4C8LA 1TGOA 4B9QA 1XMOK 4BDZA 4PA1A 2NRTA 4CZKA 1NKEA 2VQFK 4BE7B 4M41A 5CZ1A 1G99A 4BE0A 2W42A 3IS9A 4FW2A 1W97L 4LF9K 4CJ3A 1TKDA 1VQ8N 4FOEA 1TKTA 1IKWA 1QSYA 4OLAA 1LOTB 5JENA 1K9MO 3EE8A 4CJ4A 1HYSA 3O4NA 2YX6A 4JKGA 1MA9B 5ELZA 1E3MA 3DM2A 2D0PA 3NE6A 1C0GA 2QWQA 4CZEA 4CVNE 2G8KA 2QWLA 4BREA 4AM6A 3ZSYA 2XY7A 3THVA 3BF3A 2RHKA 3K0SA 4DSFA 4OKJA 5AFUH 3OW2M 3BDPA 2QXLA 3D45A 1RT2A 4BQZA 1MDUB 3A8YA 2IVPA 5SWMA 3ID6A 4WQ4A 4JI2K 2BDPA 3L4QA 3M8SA 1RDUA 4QAGA 3OS0A 4ISGA 5FLXO 2A40A 4HUGA 3CJBA 1OH6A 3H1VX 2G8HA 1KC8O 1BA0A 4YOYA 4OKKA 4BRFA 4RWTA 3RTVA 2GV9A 4OVLA 3LP2A 4C1NK 4M3UA 4KHNA 1WB9A 4JRPA 1NK8A 4CHNA 4DV3K 1CLQA 2HHIA 3J81O 3HM8A 2X6SA 2GELA 2W40A 3F5TA 2W41A 3BP8A 5I42A 3TARA 4F8RA 1XC3A 2A1SA 3C7NA 1BQMA 4EZ9A 3D2EB 3S3OA 1HNVA 3CFPA 4GMJB 3DAWA 4N5SA 4E72A 4IOCL 1QVGM 1HYZA 5C25A 1ZBIA 4F3TA 1HX1A 2D0CA 3VETA 2B5JA 3IMXA 4X62K 4Q5VA 1WSHA 3UKUB 4BC4A 1VQ4N 4BRGA 2D1KA 1TAQA 4F3OA 4DV4K 5AZIB 1VAZA 4CEQA 2P9NB 4LF8K 4BG8A 4MO5A 1S6PA 4CF1A 1KVBA 2A5XA 4K8ZA 5TKYA 2E2NA 4FK4A 5M1OA 1TL1A 2UU9K 1Q7YO 3SBGA 3OHRA 3AO3A 4BE2A 4CJSA 4MO4A 1S22A 1SQKA 1RT7A 3O3FA 2OTLN 4K25A 3C6UA 3L2VA 2P9UA 1YXQA 4FM0A 2Q31A 1C1BA 4JK9A 4DV6K 2OA8A 2IOCA 4PY5A 4JV5K 4E1NA 1I3AA 4OGEA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3O3H A;  3EKS A;  3ATU A;  4DU3 A;  1D8Y A;  4DB3 A;  5F1X A;  3TAP A;  3MXM A;  3U3G A;  3O9U A;  3PO5 A;  2D0B A;  3SUN A;  4GVM A;  1TL3 A;  1LW0 A;  1BCM A;  1RBT A;  4H5W A;  4FJ7 A;  4FJL A;  3V1Q A;  4PUO A;  2RE2 A;  3C6H A;  4CW7 B;  3DWL A;  4O8K A;  4IWV A;  1WAF A;  2DY4 A;  3DYA A;  1EKE A;  5IWA K;  1D9F A;  4KHW A;  1RT1 A;  3ISN C;  5AQK A;  3T1Y K;  4CES A;  1XHX A;  1VQP N;  4GNI A;  3QEV A;  4N41 A;  2X74 A;  5AQV A;  4Z4F A;  3C95 A;  4FZZ A;  3LPU A;  2W6K A;  3HZ6 A;  3CQ8 A;  4LF7 K;  3KLG A;  4HWI A;  1FKO A;  4H0P A;  3FZL A;  1NM1 A;  3EEQ A;  4KPY A;  1HNZ K;  1JCG A;  1I94 K;  4FK2 A;  2Q36 A;  1NGC A;  3WXK A;  3VGM A;  3T7Z A;  3AO4 A;  2PBD A;  3OYF A;  3HPO A;  2HBK A;  4A59 A;  3T1A A;  4C23 A;  4W5O A;  2NRW A;  3VOV A;  1BI4 A;  4JN4 A;  2YNF A;  1KRP A;  1OVQ A;  4BRA A;  2FSK A;  2FBT A;  3O9Q A;  4JHD A;  3CCQ N;  4Z4C A;  1WLJ A;  1T03 A;  2D0O A;  2ASM A;  3F9M A;  4FWK A;  2F4V K;  5FDL A;  3RMC A;  1K8A O;  1U48 A;  3K5N A;  3ITH A;  2PYJ A;  3WXI A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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