3UE5A

Ecp-cleaved actin in complex with spir domain d
Total Genus 121
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
121
sequence length
371
structure length
364
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Multiple Forms of Spire-Actin Complexes and their Functional Consequences.
pubmed doi rcsb
molecule tags Contractile protein/transport protein
source organism Drosophila melanogaster
molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
total genus 121
structure length 364
sequence length 371
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-10-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3ue5A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3ue5A02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3ue5A03
4FWSA 5EOYA 5JICA 2Q0UA 3VETA 5AQYA 3MCPA 1S3XA 3SMSA 1MDUB 5FPDA 3H45C 3A5NC 1BG3A 2V7YA 3RSEB 1NM1A 1U6ZA 5AQZA 5BR9A 1DEJA 3DJCA 1CZAN 3FZLA 4K41A 5AQUA 2OANA 1YAGA 4H0VB 5BPNA 3C7NB 2Q36A 1WOQA 3VF2A 4K25A 3C0BA 1JCFA 2IVPA 1U2VA 3A5MC 2YJEA 4XEIA 4MO4A 3I33A 5AQIA 4BVOA 3OHRA 4WQ5C 4BRQA 5EY4A 3HM8A 3CJBA 3AAQA 1RDWX 2KHOA 4PL8A 5E26A 3IFRA 1GLDG 2A41A 2VYPA 2V7ZA 3ZX0A 4XH4A 5AZIA 3MN7A 1P8ZA 2FSNA 4YDUA 1ZXOA 3VEXA 3DXKA 2F9WA 4K43A 2A3ZA 4FWKA 4FPBA 4BC2A 5EVZA 3DXMA 3WEEA 4EHUA 2P9KB 4RTFD 5LJVA 1NGFA 3O6WA 4BRCA 5FPEA 3QBXA 2BUPA 3WXLA 3CERA 2FLOA 3GOIA 3J8AA 3GG4A 4H0XB 4CI6A 5BREA 4FWOA 4BRLA 4GNIA 2ZWHA 5JLHA 3CETA 4XH5A 1E4GT 3QFUA 1BO5O 1Q18A 4H5WA 3W3DA 2Q1NA 4FSVA 4F9OA 5AQPA 3CI5A 4IO8A 1NMDA 4A2BA 1NGBA 1HKCA 4WYBA 2FSJA 1NGAA 3R8EA 3ZX3A 2A5XA 3ID8A 4BRDA 1K8KB 4FOEA 1NGHA 4BQLA 2V52B 1Z05A 5KQ8A 1G99A 1NGCA 4BR0A 4BRKA 3FE1A 5EX5A 4B1XB 2QWNA 4H0PA 1S22A 1XC3A 1C0FA 4WQ5A 4M63C 1KAYA 2Q31A 3VF4A 4BC3A 5BN8A 1Z6RA 1MA9B 4LC9B 2P9KA 5B8HA 3I8BA 1QQOA 4BRGA 3TPQA 3ENOA 3A8YA 2Q97A 4MO5A 5KPZA 2I7PA 2YJFA 4BQZA 3FR0A 5AFUA 4BR2A 1DKGD 3ZETB 3MMVA 3O4WA 3VGLA 1QHAA 2QWPA 3UKRB 3GE1A 4H03B 4DB3A 1MWKA 2F9TA 1TYQA 4HTLA 4PKGA 3UB5A 3M1FA 5AQHA 4BROA 4BG8A 4I6MA 2E2QA 4H5VA 3KVGA 3LDQA 4CZEA 2P9UA 4EAHD 4BC4A 3D2EB 3GBTA 1IG8A 1K8KA 3BF3A 4CZHA 5LY3A 3W0LA 4BRHA 4M7YA 3VGKA 4B1VA 1T6DA 1BDGA 3LL3A 4FOIA 3WXKA 5AQFA 2CGLA 3G25A 4B1WB 5KPRA 5AQWA 4DQ8A 1KAXA 3UKUB 2GTDA 3U9DA 5BPMA 3VF6A 2QWMA 1XUPO 4FO0A 2P9IA 3O08A 4H0OA 1D4XA 3ATVA 1SQKA 1BA0A 3KHYA 4H5NA 5ADXA 3JXUA 4NB4A 3WXIA 3FFKB 3VEWA 3H6EA 1TUUA 2J4RA 4CZFA 3O8MA 2E1ZA 5AQVA 1NGIA 2EWSA 4BVPA 3JS6A 3L4IA 2I7NA 3SMPA 1KXPA 3VOVA 3ZETA 4RWTA 3BUZB 4QS9A 3CJAA 1HLUA 5I9EB 1EQYA 3UKRA 2HF3A 4H0YB 2E88A 4B9QA 2ITMA 1ATNA 2E2PA 3HI0A 4PKIA 5JLFA 3H46O 2P9PB 2ASMA 3VEVA 3GL1A 3MN9A 2QWRA 1V4TA 1R59O 3EZWA 1GLCG 3CHWA 2D4WA 4L3QA 1GLFO 2W41A 1NGJA 3RSEA 3ATUA 3BF1A 2E1YA 4A2AA 3FZMA 3DWLA 4CBWA 3M3ZA 1QQNA 4CZIA 2CH5A 3FLCO 1QZ5A 2P9NB 2QWLA 4CZJA 3HZ6A 1HKBA 3C7NA 4IJAA 1LCUA 4CD3A 5AR0A 3EL2A 3WQTA 4CD1A 4IWVA 2NZTA 5BPLA 4WQ4C 1TUYA 1ESVA 4FPAA 2A6AA 2HOEA 4ISFA 3ZEUB 2E2OA 3UE5A 1V4SA 3VERA 2D1KA 4JD2B 1IJJA 3D7EO 2ASPA 4EFHA 4CBXA 3EKUA 4CZKA 1BWFO 2GUPA 3S41A 3QDKA 4BR5A 1QQMA 1YXQA 4BR7A 1YUWA 5EXWA 5KQDA 1JCGA 4K42A 4ISGA 1J6ZA 5AQXA 2QWOA 3P4IA 1KAZA 2VCPA 4BG9A 4IJNA 2CGKA 4FWPA 3LM9A 5AQJA 4GY2B 4H0TB 5ELZA 3IUCA 1HKGA 1MWMA 3CIPA 3O80A 2FXUA 3A5LC 4FWRA 1ATRA 1HJOA 2V51B 4BGAA 3H1VX 4A61A 2GWJA 3DAWA 5BRFA 4JNEA 3L6QA 1X3MA 2P9NA 4BRFA 2CH6A 2WUSA 1NBWA 3LDOA 4NO7A 2E8AA 4BREA 4MLEA 1T44A 4H5TA 2CGJA 4HWIA 3CJ9A 3IMXA 4E1JA 3U4LA 4BRIA 1H1VA 2D0PA 1LOTB 3D2FB 1Y64A 3CJ1A 2GWKA 1HX1A 3CJ7A 4Z94A 3MK6A 1OKJA 1GLAG 5AZIB 5BN9A 4BC5A 4PL7A 3FGUA 3CQYA 4JD2A 2W40A 4JAXA 1BUPA 1BOTO 1NGEA 3AAPA 3DXKB 3SK3A 1GLBG 3DXMB 5ADXH 4WQ4A 3ZX2A 4BRAA 4H5RA 4CZMA 5FPNA 2HMPA 2IVNA 2QXLA 3ENHA 4Y0WA 1DGKN 3ULEB 2D0OA 4JHDB 3VGMA 3CJCA 4JN4A 4BR4A 4QS8A 1GLJO 3L0QA 2HF4A 3HTVA 3FZFA 4B1ZA 3QMLA 2YHXA 2E20A 3QICA 4FWLA 3EKSA 4B1UB 4FWNA 1HUXA 5AZJB 3QBWA 4DCHA 3VEYA 4KBOA 3AARA 4BR9A 2FF3B 3MDQA 1T6CA 4FWQA 3HSCA 3O5BA 1NWKA 4AM6A 2Q0RA 5KPTA 3VEZA 3H3OB 3H3NO 3IDHA 4AM7A 1SAZA 1BU6O 1BA1A 1NGDA 3A0IX 5AQRA 2A42A 4O8KA 3SJHA 3D2FA 1RGIA 4EHTA 3D2EA 2QM1A 5AQNA 4DHYA 1ZBSA 2GELA 3WQUA 1ZC6A 2AP1A 4CBUA 5AQMA 4C23A 3EO3A 2NRHA 1YVNA 5LJWA 4ISEA 3QFPA 3UKUA 1JCEA 3ULEA 2QWQA 2FF6A 5F0XA 2YHYA 3FZHA 4JHDA 5AQLA 4BGBA 1ATSA 2P9SB 2ZGYA 4M7XA 5AQQA 2DPNA 3VENA 4CJ7A 5JMVA 3BEXA 3U8XA 2IVOA 3KZBA 5AQGA 3LDPA 2QW9A 1TYQB 3R9PA 4FWMA 3TU5A 5AZJA 3R6MA 2P9LB 4QS7A 4CZGA 2YHWA 4I6MB 3U9ZA 5CE3A 4IZ9A 3WXJA 1SZ2A 2IIRA 5BRDA 2UYTA 5FPMA 1NGGA 3VPZA 2A40A 2H3GX 1E4FT 2P9UB 3FZKA 4RCHA 2AA4A 2YCHA 4MLHA 1RFQA 2P9PA 5AQKA 3VEOA 4A62A 2NLXA 3A5OC 3CQXA 2E2NA 2ZGZA 2BTFA 5AFUH 5BRHA 3QB0A 4BRMA 5TKYA 1GLEG 1NLVA 2PAVA 3VESA 3BP8A 3LDNA 4B1YB 1U2VB 2P9IB 1XQSC 2Q2RA 4PKHA 3M6GA 2VWBA 3WT0A 4EIAA 4YDUC 4CZLA 5F1XA 3H1QA 3AY9A 4FL9A 5AQSA 2GEMA 3HBTA 1HPMA 5E84A 2FSKA 1X3NA 4O5FA 1GLLO 1QZ6A 4IXCA 1WUAA 3F9MA 3ZEUA 2P9SA 4BRNA 4BRPA 3O1WA 2ASOA 3O1BA 4J8FA 2ZF5O 2YI1A 5AQOA 5AQTA 3B8AX 2PBDA 3WUHA 1X9JA 3LDLA 3LM2A 3MN5A 5F2RA 3MN6A 3WEEB 3SLCA 1C0GA 3GDQA 4XH1A 2P9LA 3EN9A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3EE8A 5EOYA 3O9SA 5JICA 1D9FA 4M42A 4NCAA 4KH6A 1FW6A 2O8CA 1U48A 3V9ZA 2D5RA 4CK1A 3RSEB 4LF8K 3AA3A 2P1JA 2O8BB 1HQUA 4CEEA 1DEJA 4IOCL 3S9HA 4UY8O 4F8RA 4DMNA 4K41A 4OJRA 4X62K 3ENBA 1YAGA 4JK8A 4F2RA 2Q36A 1IKXA 3NH2A 3OS2A 3CXCM 2ZD1A 3HPHA 1XMQK 3DMJA 5AQIA 3OHRA 2ETJA 1LV5A 3HM8A 2KW4A 3CJBA 1NJZA 2ATQA 1YJWN 1VQMN 3NFAA 1OH7A 3SAFA 2YNHA 3KWIA 4OPAA 4KHNA 1GLDG 3LDSA 4Q0BA 1QS4A 3ZX0A 2XO7A 4O8UA 1ZXOA 3VEXA 2F9WA 2B4JA 1FKPA 3DXMA 2YKNA 3MEGA 3AGKA 4RTFD 3DLRA 3LWLA 3I55N 3LZJA 4BRCA 5FPEA 1ASWA 2RF2A 3CC2N 3DOKA 3J8AA 4CI6A 5KTQA 3PO4A 1T3VA 4GNIA 2ZWHA 4YORA 5JLHA 4LY7A 3J80O 1E4GT 2Q1NA 4YOVA 3AA4A 1NMDA 4A2BA 1HKCA 3HSTB 1I39A 4E72A 4FJNA 3AO2A 3HXMA 1S5JA 1CXUA 2NRWA 1EXQA 4BRDA 3PX0A 1S72N 4BQLA 4OGEA 3O9RA 2KKZA 3U6FA 2YKMA 4B1XB 1NOZA 2QWNA 3ASMA 3NGIA 3H08A 4CEAA 4U7BA 3ZSXA 1IKVA 4WQ5A 3HVRA 5D3GA 1BI4A 3QINA 4BC3A 5FRNA 5K14A 1VQ9N 4LC9B 3I8BA 4DTRA 4FW2A 4BRGA 1W7AA 2PY5A 1TL1A 3A8YA 4F3TA 2P5OA 1SL2A 4BQZA 3OYGA 4KTQA 2HHWA 4F3OA 3LPUA 3ZETB 3VGLA 3TAPA 3RMAA 1IBKK 2ZQBA 3OYLA 4YOYA 1TYQA 3EE9A 1RBVA 3M1FA 5AQHA 4ILJA 3SPZA 2FBTA 3OYHA 1YJNN 4H5VA 4X65K 4WFBL 4ICLA 4LH4A 4CZEA 3AA5X 3P39A 4IG3A 4NCBA 1VK0A 3W0LA 4ID1A 4IKFA 4FOIA 3LL3A 2CGLA 4AHCA 1VSJA 5AQWA 4KV8A 3K5OA 5BPMA 1XUPO 4H0OA 4CF9A 3ATVA 4N76A 5ADXA 1T05A 3JXUA 3KJVA 2G8WA 2OZMA 4CZFA 3O8MA 1NGIA 1NG9A 3CCRN 4EP4A 3SMPA 1KXPA 4RWTA 3BUZB 3K0SA 4QS9A 1XHZA 2QI2A 3UKRA 4FLUA 3V1QA 4B9QA 1RT1A 1ATNA 1RTJA 3OJUA 3KLEA 2ASMA 4EP5A 3VA0A 3PY8A 4Z4HA 1R59O 3EZWA 2D4WA 2O8EA 4L3QA 3ATUA 4A2AA 4NLCA 2ZJPL 4YOTA 1GOBA 1VQKN 4JS5A 5SZTA 3WXMB 3M3ZA 1QQNA 4CZIA 3DLHA 2CH5A 2P9NB 3HZ6A 4IJAA 3PX4A 2UXDK 5M1PA 4Y1CA 5BPLA 4MQ3A 4CF1A 1HYVA 2Q3SA 3NE6A 1BIZA 3VQ5A 3HM9A 4EZ9A 4ISFA 4GV3A 1D5AA 2HNZA 1V4SA 2NRZA 1NK4A 1KVAA 4JD2B 3I8DA 3D7EO 2DFHA 4EFHA 3V9XA 3EKUA 5JS1A 1BWFO 2GUPA 4C8MA 1YXQA 5LL6Z 4BR7A 1YUWA 2WOMA 1VSDA 4K42A 2DY4A 3THYB 4JK9A 1J6ZA 2UUBK 3S5TA 2VCPA 4IJNA 2F8TA 5I42A 4IFEA 1WSJA 1WSHA 4B3RK 4DG1A 1YTUA 1VQ6N 1FK9A 3SUPA 3M8SA 3A5LC 4FWRA 1ATRA 4BGAA 5EU7A 3KK3A 4GV6A 2GWJA 3DAWA 3T3FA 2PYJA 1SV5A 3LDOA 4YOXA 4LF9K 1BGXT 4H5TA 3L3VA 2CGJA 2D0AA 3AA2A 1H1VA 2D0PA 1LOTB 4CFBA 3OS0A 3RMCA 1M90O 1S1TA 2GWKA 4Z94A 3FFIA 3C94A 5AZIB 4CK2A 4BC5A 5CYQA 5DM7L 1BIUA 2XY6A 3THWB 2W40A 2YNGA 4JAXA 1BUPA 1BOTO 3AAPA 2DTUA 2IGIA 4GVMA 4GKJK 4DTMA 3ZX2A 4CZMA 2HMPA 2IVNA 3ENHA 4Y0WA 3O3FA 1DGKN 5SWMA 2HB5A 2D0OA 3N4QA 4JHDB 3AVFA 3CJCA 4GV9A 1K6YA 3TABA 4DR2K 2HW3A 1TKXA 3HYFA 2HVHA 4DFPA 3HTVA 3F9KA 3QMLA 4WE1A 3OY9A 4FJ7A 4MDAA 4DS4A 1KLMA 4DV1K 3MWTA 5AZJB 4ILGB 2QA4N 1ITGA 4BR9A 1Q86O 3CFPA 4FWQA 3HSCA 1HMVA 4DQRA 1TGOA 5HRRA 4OLBA 3AVNA 3SQ1A 4DV2K 1D8YA 1F21A 4YOWA 3K5LA 2RHKA 1JLCA 5AQNA 1RT4A 4DHYA 4KPYA 2GELA 2KQ2A 2WONA 3E01A 1ZC6A 4CJWA 5HROA 4DQSA 4CFDA 2OA8A 1JLEA 2FF6A 2W6LA 3HP6A 3FZHA 5AQLA 3HPOA 2ZGYA 3LP0A 3S3MA 3NDKA 3VENA 2JWLA 4DV4K 4CJ7A 1VAZA 5JMVA 1HNWK 2IVOA 5KI6A 1RDAA 3KTQA 1L3UA 4LH5A 4FWMA 3TU5A 2P9LB 1DTQA 4I6MB 4IZ9A 3WXJA 4DTSA 3WNEA 3CMEN 1SZ2A 2IIRA 3VPZA 2A40A 3FZKA 1E4FT 2O8FA 4RCHA 3CG7A 4DKWA 4MLHA 5AQKA 3TSUA 1REVA 3RRHA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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