3UE5A

Ecp-cleaved actin in complex with spir domain d
Total Genus 121
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
121
sequence length
371
structure length
364
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Multiple Forms of Spire-Actin Complexes and their Functional Consequences.
pubmed doi rcsb
molecule tags Contractile protein/transport protein
source organism Drosophila melanogaster
molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
total genus 121
structure length 364
sequence length 371
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-10-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3ue5A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3ue5A02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3ue5A03
5F2RA 3FZKA 3CETA 1QQOA 3QFPA 1NGFA 4BRDA 4IWVA 5BRHA 1RFQA 1NM1A 3A8YA 2YCHA 3VEZA 3QBXA 1TUYA 2I7PA 3D2FA 2Q97A 4HWIA 4BR2A 2GUPA 4JAXA 1U2VA 5AQTA 3TU5A 3L0QA 3VESA 3JXUA 4BC2A 2E1YA 5AQHA 4H0PA 3ULEB 2IVNA 4H5RA 1CZAN 2D0PA 4DQ8A 2EWSA 4B1XB 1HUXA 4ISGA 3MDQA 1IJJA 4CZIA 3QFUA 4CJ7A 4FWLA 2BUPA 4FO0A 1S22A 2ASPA 4BQLA 2YHYA 1NGEA 4FWRA 4H5TA 1BU6O 1QQNA 3HZ6A 4O8KA 3ZETB 5AZIB 3H46O 5BRFA 2CGKA 2F9TA 4K41A 3DJCA 1MWMA 2QXLA 4FL9A 4IXCA 5LJVA 4NO7A 5LJWA 2VYPA 1V4SA 1ATSA 4M7YA 3ZEUA 5AQVA 4B1YB 3EN9A 4CZKA 1SQKA 3S41A 5EVZA 4B1UB 2VCPA 5AQXA 1X3MA 4H0TB 4MO4A 2GELA 3GDQA 3BF1A 4RTFD 3VGLA 2P9SB 1E4FT 3B8AX 2P9KA 3UKRB 1NGAA 1Q18A 3O1WA 3CJCA 4FWPA 1ZC6A 4FWOA 3ZETA 2ZWHA 5I9EB 5AZIA 3F9MA 1GLBG 4H03B 4K25A 3J8AA 2PAVA 3VEYA 3WEEA 3AY9A 3U8XA 3MN7A 5FPEA 3LM2A 5EXWA 1R59O 3KZBA 3FZMA 4BROA 1YUWA 3LL3A 4PKIA 5AZJA 4MLEA 2ZGZA 5E84A 4PKGA 3CQXA 2GWJA 3O08A 1NLVA 4F9OA 2QWLA 1E4GT 1NGCA 3UKRA 3VGMA 3DAWA 2A6AA 3DWLA 3WXKA 2QWPA 3IUCA 2KHOA 2AA4A 2Q36A 1HKGA 3UKUB 3L6QA 4B9QA 4EHTA 3EKSA 5AQGA 1XQSC 4B1WB 4BC5A 3DXMA 3R9PA 5BPMA 2CGLA 2FXUA 2CGJA 4WQ4C 5BPNA 1T6CA 4BRHA 4IJNA 4YDUC 4JD2A 2P9PB 3CJ1A 3LDOA 3ENOA 3QDKA 2P9IA 1BA1A 5AR0A 4PL7A 2PBDA 3FZFA 3GL1A 3H45C 2Q1NA 1HKCA 4WQ5C 4PKHA 4Z94A 4LC9B 1HJOA 1BOTO 3C7NA 4B1VA 3L4IA 3KHYA 4BRQA 4I6MB 1EQYA 1H1VA 3FZLA 4HTLA 2FSJA 5AQIA 4EHUA 3CIPA 3QB0A 3CJAA 2GWKA 3LDQA 1XUPO 1KAYA 3BP8A 3O6WA 4FSVA 3WXIA 1NWKA 3KVGA 2QW9A 1ESVA 3W3DA 1MDUB 1JCEA 2HOEA 2D0OA 2D4WA 2V51B 3M1FA 1DGKN 3UB5A 1NGBA 2P9PA 3A5OC 3UE5A 1BA0A 3O80A 1OKJA 1QQMA 3WXLA 3JS6A 4FWMA 3VF4A 4CD1A 2E2OA 4I6MA 3EZWA 1GLAG 1GLFO 4QS9A 4H5WA 4A62A 3CJBA 3QMLA 1U6ZA 2YJEA 4FWSA 4XEIA 3R8EA 3SMSA 5AQYA 3P4IA 3HBTA 3ATUA 1X9JA 1ZBSA 3IFRA 4H0VB 4JHDB 3VEOA 4BVOA 4CBUA 4CZEA 4EAHD 5BN9A 1WUAA 3HTVA 2AP1A 4BGAA 4CZHA 2BTFA 4M7XA 1RGIA 3LM9A 4BR0A 4K43A 3A5NC 5AQKA 2V7ZA 3SJHA 1NGGA 1NGIA 3VEVA 5LY3A 1P8ZA 5AQJA 4BR9A 2W40A 3OHRA 4FOEA 2E2NA 3M3ZA 4BRIA 2F9WA 3FE1A 1GLDG 1MWKA 1NGJA 3FZHA 4JHDA 3ULEA 5ELZA 1S3XA 3O1BA 1KAZA 5AFUA 4BREA 1Z05A 4CD3A 1HKBA 3FGUA 3WT0A 5EOYA 3VPZA 3MCPA 5AQZA 5KPZA 5FPDA 4B1ZA 4BG8A 5F1XA 3DXKB 3O5BA 4WQ4A 4BRKA 3O4WA 2FLOA 3EO3A 2CH5A 4YDUA 4H0OA 3LDPA 2VWBA 2HF4A 3MK6A 5AQWA 3CJ7A 2YI1A 4WQ5A 4BRMA 2DPNA 3FR0A 3HI0A 4O5FA 1BWFO 2CH6A 1D4XA 5KPRA 4M63C 3WQUA 2P9LB 3H1QA 4CZMA 5AQUA 1BO5O 2P9SA 3U9DA 4K42A 4BVPA 1ATNA 3MN9A 2E8AA 5FPNA 2FF3B 5CE3A 2OANA 2WUSA 5E26A 1V4TA 1RDWX 3DXKA 3CJ9A 4BC4A 3VEXA 5AQNA 4FPBA 2J4RA 3VETA 3MN5A 1MA9B 4BGBA 1G99A 1GLEG 3FLCO 3U4LA 4BC3A 1TYQB 2GTDA 3QBWA 2Q31A 3TPQA 3A5LC 4CI6A 4CBXA 2P9NB 1ZXOA 3SLCA 1KAXA 4BQZA 2UYTA 2H3GX 3BF3A 5B8HA 3WXJA 4A2BA 2YHXA 1T6DA 1YXQA 3UKUA 3ZX0A 2P9UB 1BDGA 5KPTA 4GY2B 1BG3A 2IIRA 2V7YA 5AFUH 1DKGD 1JCFA 3EKUA 1HPMA 4ISEA 5TKYA 5AQRA 3I8BA 4H0YB 5FPMA 1YVNA 2E2PA 1C0FA 1KXPA 3ENHA 4BRFA 3ZX3A 4BRLA 1J6ZA 2QWQA 1SZ2A 3A0IX 4DB3A 3D2EB 4C23A 5ADXA 4WYBA 3W0LA 2E2QA 2P9UA 2IVPA 5JMVA 3A5MC 2GEMA 1GLCG 4RCHA 1T44A 3CQYA 4FPAA 3GG4A 3BEXA 4Y0WA 5AQOA 4CZJA 4IJAA 4PL8A 3VEWA 4CZGA 4BR7A 4KBOA 4BRCA 4A2AA 5KQ8A 2NZTA 2QWMA 5AQSA 1NMDA 4BR5A 2D1KA 5JLFA 3D2EA 3AAPA 3H3OB 4DCHA 3GBTA 4CZLA 1C0GA 3EL2A 3ZEUB 5KQDA 4FWKA 2IVOA 3U9ZA 4AM7A 3VF2A 3G25A 5BREA 4J8FA 2W41A 3ATVA 2P9KB 1NBWA 4FWNA 3MN6A 3QICA 1XC3A 4FOIA 3MMVA 1GLJO 2ASOA 3ZX2A 2HMPA 2I7NA 2YJFA 3AARA 3M6GA 3WUHA 2E1ZA 1WOQA 2A40A 3C0BA 3CHWA 2E88A 2QWRA 4NB4A 2NLXA 4GNIA 3WEEB 5BRDA 4ISFA 4FWQA 1HX1A 4QS7A 5AQMA 3I33A 2Q0UA 2HF3A 5JLHA 4XH1A 2ZF5O 5JICA 5AZJB 1QZ5A 1ATRA 5AQFA 1TUUA 1DEJA 3HM8A 1Z6RA 2FSKA 3H1VX 3RSEB 2A3ZA 5AQLA 3H6EA 1QZ6A 1YAGA 5ADXH 2Q0RA 3HSCA 3CERA 5EY4A 3FFKB 3LDNA 3LDLA 4IZ9A 3SMPA 5BN8A 4BRNA 1X3NA 2YHWA 3H3NO 1HLUA 5AQPA 2QWNA 3DXMB 2ASMA 2V52B 2QM1A 5F0XA 1Y64A 2A41A 2E20A 4DHYA 4IO8A 2ZGYA 4JN4A 4L3QA 3VOVA 3ID8A 4JD2B 4JNEA 1BUPA 4MLHA 3BUZB 4AM6A 4XH5A 2P9IB 1LOTB 3WQTA 2A42A 2QWOA 4E1JA 4CBWA 1IG8A 3RSEA 2A5XA 4RWTA 2NRHA 3C7NB 1K8KB 4CZFA 1SAZA 3R6MA 2P9LA 3IDHA 3IMXA 3SK3A 4BG9A 1LCUA 3VGKA 2Q2RA 4EFHA 1NGDA 4BR4A 3GOIA 4H5NA 1JCGA 3VF6A 1QHAA 3O8MA 4QS8A 3VERA 1GLLO 4BRPA 3VENA 4H0XB 3D7EO 4A61A 4BRGA 5BR9A 1TYQA 3CI5A 1K8KA 2FF6A 3D2FB 3AAQA 3GE1A 2P9NA 4BRAA 2ITMA 4H5VA 5EX5A 1U2VB 5AQQA 1NGHA 4EIAA 2FSNA 5BPLA 4XH4A 4MO5A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3KLGA 3KK7A 3VQ6A 3SQ4A 1X9MA 4BRDA 3ZSQA 1EWQA 1IKYA 3A8YA 1JJ2M 1Q9XA 2YCHA 2DY4A 1TUYA 1X9WA 4HWIA 4CJWA 4JKBA 4BR2A 4KHWA 4JI2K 3NDKA 1IBKK 3TSUA 3L0QA 1DTQA 5GIPA 2D0CA 3T19A 4DR3K 3VESA 2O4GA 4Z4EA 3QESA 3ULEB 5KTQA 2YKNA 4H5RA 4EZ9A 4KREA 2W6LA 1YITN 4ISGA 1IV0A 3DOKA 3QFUA 4HUGA 1KFSA 4CJ7A 1NGEA 4CW7B 1VSFA 3BZCA 1S1VA 1BU6O 5AZIB 5BRFA 2F9TA 4K41A 4FL9A 1V4SA 4O4GA 3AVMA 1VQ6N 5LL6Z 3S41A 5EVZA 3B6PA 4B1UB 4DUZK 3SQ2A 1X3MA 1LAWA 1NOZA 4RTFD 2HVHA 1WSHA 3UKRB 3TTFA 1ZC6A 4H4MA 4FWOA 3J80O 3M8PA 3B6OA 4FW1A 3F9MA 3VEYA 3WEEA 3SI6A 3AO2A 5EXWA 3HPOA 3LAKA 2HNYA 1YUWA 3T69A 5CY4A 1VAZA 5E84A 5SZTA 4FZZA 1VQ9N 4DR1K 1WLJA 3DRSA 4OVLA 4B9SA 1NGCA 4B9TA 1TAQA 3KK1A 2F7TA 3DWLA 4GVMA 4AQYK 3WXKA 1KCFA 1G15A 3L6QA 4JS5A 4B9QA 4EHTA 2BGGA 1L3VA 4DV7K 4AHCA 2ZD1A 5KGWA 3PX4A 4J2DA 3OYFA 3CYMA 4IJNA 4YDUC 4CJLA 4B3RK 1XNQK 3PIOL 4PL7A 3N4PA 4WQ5C 1HKCA 3V9UA 4CJ4A 4Z94A 3OS1A 2F96A 4Y1DA 4IFEA 3J81O 5AQIA 4EHUA 3CIPA 3TAEA 4YOWA 2GWKA 1VQON 3VQ5A 2NRWA 4JKCA 2QW9A 4XJXA 3LP0A 3THWB 3AVAA 1RT1A 2D4WA 2V51B 4W5QA 4JS4A 1HMVA 3ZSXA 1NJWA 2ZE2A 3UE5A 3O80A 5KRSA 1QQMA 4NCBA 1N36K 1J5OA 3PO5A 2BE2A 2PFUA 3C95A 4DTOA 4I6MA 2HMIA 4KB0A 4QS9A 1TKZA 2XO7A 4JK9A 4A62A 3C94A 3CJBA 3QMLA 2O8DB 2YJEA 4CJRA 1QTMA 4EAHD 4H0VB 1YTUA 1C1BA 3OTOK 5EU7A 2OPSA 2W6KA 4BGAA 3CCEN 4DKWA 3LM9A 2V7ZA 3VEVA 5J1EA 4BR9A 3VQPA 3QLHA 4JYAK 3LWLA 3OHRA 3L3UA 4BRIA 3HOSA 2WC9A 3FE1A 4DV0K 4B9UA 2F8TA 3OYCA 3OYBA 2HHQA 3ULEA 5ELZA 1S3XA 4CJUA 3P1GA 3M8SA 3FGUA 3VPZA 4B9VA 1Q9YA 4HCBA 5AQZA 2QI2A 5KPZA 1UA1A 5FPDA 5FRMA 2WBNA 1WSFA 4DR5K 1FW6A 4NCAA 5F1XA 3TARA 3O5BA 3O4WA 2FLOA 4CJKA 4CGDA 4DSKA 4H0OA 3LDPA 3RMBA 4B9NA 5C2DA 3MK6A 3K5MA 1IKXA 1Z25A 2YI1A 4CIGA 3FR0A 3HI0A 3ZSWA 2XY7A 1QE1A 2HB5A 5T7BA 1RDDA 1BO5O 4DV5K 4JK7A 1ATNA 1RTIA 2E8AA 3I55N 2WUSA 3N4QA 3AO1A 3AVKA 1W0HA 1C1CA 3CJ9A 1VRUA 4CJEA 4CF2A 3O9QA 2XY6A 4ZTJA 1YJ9N 1VQ8N 1FXXA 4AHVA 1KVCA 3S9HA 2I5JA 3U4LA 1GLEG 2O8BB 3OJUA 4BEBA 4CBXA 1B9DA 4L8RB 3SLCA 4BQZA 2UYTA 2H3GX 3NGIA 1ZYQA 3PV8A 4KHQA 4FZYA 1T6DA 1YXQA 4I9LA 5KPTA 3NE6A 3NHGA 2G8IA 3MXMA 4GY2B 1HNIA 4E1NA 1VQ5N 1U49A 3EKUA 1HPMA 3ASMA 4ISEA 5TKYA 3VQ9A 3I8BA 5FPMA 1YVNA 4DF8A 1C0FA 4K8XA 2Q3SA 4BRFA 4IDHA 4ILHA 1J6ZA 3A0IX 3C6HA 3HPHA 3CD6N 3V1OA 2P9UA 3OYIA 3CCUN 3VQQA 4RCHA 1T44A 1C0UA 1ASWA 4FPAA 4JI1K 3THWA 2G8KA 4KI6A 5AQOA 2EHGA 3OVNA 4YNQA 4BR7A 4BRCA 1WBDA 4OLBA 4OO1J 2P1JA 5M1NA 4LF9K 2QWMA 5AQSA 1NMDA 3TAPA 1YT3A 2KFZA 3D2EA 4DLEA 3WNHA 3AAPA 2OTJN 4AHSA 3LDSA 1Q82O 3AO5A 3HVTA 3O9SA 2HBMA 3QEWA 3G25A 4F3OA 1HNXK 4DSIA 4X62K 4C8NA 4DTPA 4CIFA 2O8FB 1VQKN 3T1YK 2YJFA 3M6GA 3TI0A 4B08A 4EZ6A 3PLAA 3C0BA 4OLAA 4W5RA 2NLXA 3QIPA 4GNIA 5BRDA 4ISFA 4RW7A 1BQNA 4WFNL 2ZF5O 3S3OA 5AZJB 1B9FA 1UWBA 4E7KA 1TUUA 1YTAA 3OYMA 3HM8A 2FSKA 4YFUA 5AQLA 4CEQA 1QSSA 3HSCA 5BN8A 4IZ9A 2E4LA 4JI7K 4FCYA 2O8CB 3PX6A 3AVIA 3DXMB 3F73A 2QM1A 1YVUA 2E20A 2ZJRL 2ZGYA 3RRHA 3ID8A 4JD2B 2P9IB 4XIUA 3ID6A 4KTQA 1CXQA 3AVCA 2NRHA 3C7NB 4CZFA 1TKDA 4RW8A 4BG9A 3LP1A 3DLHA 3PIPL 1S9GA 1JXBA 4Q0BA 4B3MK 1FKOA 4W5NA 4NXMK 1SKRA 3VGKA 4EFHA 3KWIA 4H5NA 4M3ZA 1MU2A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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