3UKRB

Crystal structure of bos taurus arp2/3 complex with bound inhibitor ck-666
Total Genus 54
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
54
sequence length
193
structure length
193
Chain Sequence
GVVVDSGDGVTHICPVYEGFSLPHLTRRLDIAGRDITRYLIKLLLLRGYAFNHSADFETVRMIKEKLCYVGYNIEQEQKLALETTVLVESYTLPDGRIIKVGGERFEAPEALFQPHLINVEGVGVAELLFNTIQAADIDTRSEFYKHIVLSGGSTMYPGLPSRLERELKQLYLERVLKGDVEKLSKFKIRIED
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural characterization and computer-aided optimization of a small-molecule inhibitor of the Arp2/3 complex, a key regulator of the actin cytoskeleton.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Actin-related protein 3
molecule tags Structural protein
total genus 54
structure length 193
sequence length 193
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-11-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3ukrB01
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3ukrB02
4FWRA 4BRNA 3GOIA 2A3ZA 3EN9A 4DB3A 1DGKN 1TYQB 3L6QA 2FSKA 1GLFO 3O4WA 3VGKA 3F9MA 4K25A 2Q2RA 2P9IB 4GY2B 1E4GT 4BR7A 3B8AX 3DJCA 1ZC6A 2D1KA 3MMVA 2ZF5O 1NBWA 3HI0A 1BG3A 5KPRA 2V51B 1YXQA 4BRMA 4BQLA 4CBUA 5AQJA 4LC9B 3FZFA 4CJ7A 4BRAA 1BO5O 2IVNA 4M63C 1NGHA 4MLEA 3U9DA 4BR5A 5LY3A 3FZHA 4FWKA 4BRGA 4H0TB 4WQ5A 4K42A 3KHYA 2FF6A 4EFHA 4NB4A 4FWMA 3CJAA 3FZLA 2QWMA 1T6DA 3C0BA 1NGJA 2ZGZA 5AQUA 5LJVA 2J4RA 4H0OA 4CZEA 4XEIA 4BR0A 2P9SA 4FPAA 5BPNA 4IXCA 4JD2B 1JCFA 3UB5A 3U4LA 5AR0A 5KQ8A 4CBXA 3O5BA 4ISFA 5KPTA 2BUPA 4BRIA 4PKIA 3L0QA 3A8YA 4CZIA 2QXLA 1DEJA 1U2VB 5AQRA 1J6ZA 4BC5A 4M7YA 1JCEA 4BROA 2PAVA 3VERA 1EQYA 1KXPA 3G25A 4M7XA 5AZIB 1GLDG 3ZEUB 1XUPO 4K41A 4L3QA 3AAPA 2GELA 3GE1A 4DHYA 3VESA 4H5WA 2GTDA 1GLAG 5AQGA 3QFPA 4BC3A 3VGMA 5I9EB 1WUAA 2ASOA 4ISEA 3M6GA 3H1VX 3DXKA 2KHOA 3JXUA 5AQZA 4IZ9A 3UKUA 4A62A 4FWPA 3HTVA 5AQFA 1NGAA 4CZJA 4WQ4C 3VPZA 4CBWA 4FSVA 1TUUA 5AQWA 3VEWA 3MK6A 3GG4A 4BQZA 1GLBG 5LJWA 3FZKA 3FR0A 1GLCG 1NGIA 5FPMA 5FPNA 2HOEA 4JAXA 2VYPA 1NGFA 4QS7A 5AQPA 5JLFA 4Z94A 3A5MC 3QMLA 3VEZA 2V7ZA 2DPNA 4H0PA 3ENHA 1V4SA 2A40A 1SQKA 2QW9A 2P9SB 2FSJA 4BR4A 1BU6O 5FPEA 1HJOA 2E2QA 3CJ1A 1Y64A 5AQQA 5JICA 3J8AA 2ZWHA 3BF1A 4CD1A 3EZWA 2UYTA 3R9PA 1BDGA 4H5VA 4A2BA 3A5NC 5AFUA 2A41A 4IO8A 5ADXA 4BRKA 2I7PA 4FL9A 4EAHD 3GBTA 5KPZA 3QICA 4BGAA 3OHRA 1NMDA 4EIAA 3MDQA 4RTFD 3CJCA 5AQSA 5KQDA 1BA0A 4BR9A 3CJ7A 3DAWA 1R59O 4BREA 4QS8A 4EHTA 3DXKB 3WXJA 3DWLA 4C23A 1ZXOA 2ITMA 1YVNA 5AQLA 3UKUB 3IMXA 4PKGA 5BRHA 5F0XA 3LM2A 2Q1NA 4XH1A 3VGLA 1HLUA 3WXIA 2Q97A 2IIRA 1IG8A 4BRPA 2A6AA 3HSCA 4MO5A 3S41A 1YAGA 5AQVA 4HTLA 2QWPA 3QB0A 5BRFA 2HMPA 4BVOA 4BRHA 5F1XA 3CQYA 1QHAA 3LM9A 4PL8A 1D4XA 4IJNA 4K43A 2CGKA 3W3DA 3ID8A 1HPMA 4B1UB 2NZTA 1T44A 4NO7A 5AZJA 2YI1A 3A0IX 4CZLA 2Q31A 3DXMA 1C0FA 3M1FA 1CZAN 3WEEA 3A5LC 4PKHA 3WUHA 5BN9A 3CETA 5EX5A 1HKCA 2FF3B 3H3OB 2OANA 3EO3A 3CI5A 4YDUC 5AQYA 3TPQA 2ASPA 1K8KA 2D0PA 3VEXA 3MCPA 4MO4A 2A5XA 4DQ8A 3VETA 1QZ6A 3M3ZA 4FOIA 1NWKA 2E1YA 3AARA 5BN8A 1BWFO 1Z6RA 2P9UA 2NLXA 1HX1A 1H1VA 3TU5A 3O1BA 4HWIA 3VOVA 2YHXA 3FE1A 3ZETA 1ATSA 1E4FT 2HF3A 1MA9B 1MWKA 4XH5A 3IUCA 4WQ4A 1X3MA 2VCPA 4CZHA 4DCHA 4XH4A 3FGUA 1QQMA 4MLHA 2H3GX 1YUWA 4BRDA 1Q18A 4KBOA 1TUYA 2QWOA 4PL7A 1BA1A 1HKBA 3KVGA 2F9WA 5TKYA 2D4WA 2D0OA 5AQTA 5EXWA 4B1YB 1C0GA 4FWQA 2Q0UA 3SLCA 3VF4A 3ATUA 3R8EA 4BRFA 3O8MA 3MN9A 1GLEG 3JS6A 3FZMA 2CH6A 2AA4A 3VF2A 3BUZB 5AZJB 3VEVA 4H5TA 3DXMB 3KZBA 3BEXA 3WEEB 3WXKA 4RWTA 3W0LA 2Q0RA 1NGGA 5FPDA 3EL2A 2QWQA 2EWSA 3D2EA 4JN4A 3BF3A 4I6MA 3UE5A 1BOTO 1K8KB 3C7NA 5AQOA 3LDOA 3CQXA 2V52B 3D2FA 3H1QA 3QFUA 4FO0A 1NGCA 5BR9A 3RSEA 1HUXA 4BGBA 1MDUB 5AQKA 2E1ZA 3H3NO 2P9UB 4FWOA 4JNEA 2W41A 1SZ2A 1LOTB 5JLHA 3H46O 3ZX0A 2IVOA 2GUPA 4FWNA 3ZETB 2E2PA 2P9KA 4O5FA 3EKUA 4BRLA 3SJHA 4H03B 3LDNA 3O80A 4BRCA 3CJ9A 1GLJO 2E2OA 4JHDA 3HM8A 2WUSA 4BC4A 5ELZA 2CGJA 1JCGA 3MN6A 3QBWA 1RGIA 4ISGA 4A61A 2HF4A 5F2RA 3WXLA 2Q36A 4H0YB 2VWBA 4A2AA 1XC3A 3QDKA 1QQNA 2P9PA 1HKGA 3WQUA 1NGBA 3CIPA 4QS9A 1QQOA 3R6MA 5E26A 3VEYA 3U8XA 3UKRA 3ATVA 2PBDA 4CI6A 4F9OA 1KAZA 3VENA 2YHWA 5EY4A 1Z05A 4H5NA 2QM1A 1S3XA 4WQ5C 2P9NA 4GNIA 2V7YA 1MWMA 4AM6A 2CGLA 3BP8A 3H6EA 3P4IA 3LL3A 2FLOA 5CE3A 3D2EB 3MN5A 4YDUA 2P9LA 4I6MB 4IJAA 5E84A 4CD3A 4CZMA 2ZGYA 4FPBA 4O8KA 2NRHA 3HZ6A 4AM7A 3HBTA 3C7NB 3D2FB 3H45C 1NGDA 1S22A 1X9JA 1XQSC 3RSEB 3QBXA 2I7NA 3ENOA 5BPLA 4WYBA 1SAZA 2QWLA 4B9QA 3ULEA 1KAYA 2BTFA 3IFRA 1ZBSA 2ASMA 4BG9A 2E8AA 2P9KB 3WT0A 5B8HA 4B1WB 3WQTA 3SMSA 3ZX2A 1DKGD 2W40A 4CZGA 3U9ZA 3O6WA 2YJEA 4JHDB 1TYQA 5AFUH 1NGEA 4B1ZA 4CZKA 5ADXH 3FLCO 1X3NA 3A5OC 1RDWX 4H0XB 2P9IA 3CERA 3LDLA 4RCHA 2IVPA 4BRQA 5BREA 3I8BA 2AP1A 4IWVA 3GDQA 1IJJA 2FSNA 2QWNA 5AQNA 4CZFA 2P9PB 2CH5A 3O1WA 3VF6A 3GL1A 4BC2A 1T6CA 3MN7A 1U6ZA 3CJBA 4Y0WA 2F9TA 3EKSA 4H0VB 3UKRB 1OKJA 2E88A 3SMPA 2YJFA 3I33A 1GLLO 2P9NB 4FWLA 1P8ZA 4BVPA 1ATRA 4FOEA 2E20A 3IDHA 3SK3A 5JMVA 3FFKB 2YCHA 5AQHA 5BPMA 2GWJA 3VEOA 4B1XB 5AQXA 3D7EO 2FXUA 1LCUA 5EVZA 2P9LB 4B1VA 3CHWA 1KAXA 3ZX3A 5BRDA 3AY9A 4JD2A 1QZ5A 1BUPA 4BG8A 5EOYA 2E2NA 3L4IA 4BR2A 1NLVA 4EHUA 3LDQA 3LDPA 3O08A 2GWKA 1G99A 1ESVA 1U2VA 2GEMA 3ULEB 1WOQA 3AAQA 1RFQA 4FWSA 5AQMA 5AZIA 1V4TA 5AQIA 3ZEUA 1NM1A 1ATNA 2QWRA 2YHYA 4H5RA 4E1JA 2A42A 4J8FA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3PSIA 4BRNA 1U4BA 2ZJPL 1KD1O 2HHSA 5HROA 4DB3A 4DU4A 1TYQB 3T3FA 3CMAN 2Q2RA 1VRTA 3NAEA 1HNVA 1E4GT 5KTQA 4B3OA 3DJCA 2Y1IA 2D1KA 3OJUA 1NBWA 1BG3A 4LF8K 1KFSA 4DSKA 3PX6A 3FFIA 3HP9A 4JKEA 1BO5O 2IVNA 3OYLA 3D0PA 4KPYA 1WB9A 1ZBIA 4H0TB 3V9UA 4K42A 2G8HA 4M3UA 3C6TA 4NB4A 4FWMA 2NRZA 3CJAA 2OTJN 1VSIA 2QWMA 1IKWA 5LJVA 1ZBLA 3EE9A 4JS5A 3F9KA 2IOCA 4BR0A 4I9LA 4FLWA 4IXCA 1JCFA 3HOTA 5AR0A 5KQ8A 3O5BA 1TKXA 5KPTA 3AA5X 4BRIA 1VQ7N 4PKIA 3MX5A 3MEGA 3L0QA 4CZIA 3NH1A 1I94K 3ZT0A 1J6ZA 3DYAA 1EQYA 1RDDA 5AZIB 4PHTX 2HNYA 4K41A 4DHYA 1IH7A 4DSIA 4F2SA 4BC3A 3HPGA 4KFBA 3S9HA 1C1CA 3OA9A 2OZMA 4DS4A 2YV0X 3H1VX 3HVRA 4A59A 4JS4A 3JXUA 2XRIA 5GAEP 2BANA 3UKUA 3P83D 4CZJA 1K6YA 3DLKA 4MQ3A 4W5TA 4DTMA 2ETJA 1TUUA 5AQWA 3TABA 4ZTJA 3VEWA 3MK6A 4BQZA 4CHQA 3CCLN 3EYZA 3AO3A 3VQ5A 4WCEL 3OYFA 5GAHP 1IKVA 1GOAA 3TAGA 4ILHA 2HHHK 4RW9A 4E7LA 2B4JA 4JAXA 2VYPA 4E7HA 1HQEA 3L2QA 2F4VK 4M3YA 4DV6K 4DU1A 1YITN 2RKIA 2V7ZA 4H0PA 1JLQA 3D45A 2A40A 4OPJA 5SWMA 4FLVA 1WSHA 3LWLA 4DTUA 2FSJA 3SBGA 1WSEA 2E2QA 1Y64A 5JICA 5JS2A 4AHCA 2HBLA 2ZWHA 3BF1A 4JI7K 4FJHA 3R9PA 4EP4A 1A5VA 4RW4A 4ELUA 2VG7A 2FBXA 2XHBA 4A2BA 3THYB 1NJWA 1LWEA 2W6LA 3OYAA 1VSJA 1NMDA 3OHRA 4JKDA 3OYCA 3MDQA 4OLBA 3QEVA 3WNFA 4FJLA 3QINA 4BR9A 4KB1A 3NGZA 3OYBA 4QS8A 5M1FA 4CIGA 1IBLK 3WXJA 4I7FA 2LSNA 4C23A 5AQLA 2E6MA 4O0JA 5BRHA 4CJ5A 3ASMA 3LM2A 3VGLA 4KAZA 1HLUA 2KKZA 3C6HA 1MU2A 4BRPA 4I2PA 4X64K 3QLHA 1EWRA 4AHSA 4MO5A 2OPRA 3J7YP 1FKPA 5F1XA 4KRFA 1QHAA 4BDYA 3LZIA 1D4XA 1RT5A 2P5OA 3PLAA 5K14A 3W3DA 4LSLA 4DV1K 3ZSWA 3CC4N 4KTQA 3A0IX 2O4IA 3ZSQA 3LWMA 5KGWA 4RG8A 4B8CA 3ZSXA 4IOXA 2O8DA 3KTQA 4KHWA 4IKFA 3CETA 3ZT4A 3K5LA 2UXDK 4FW1A 4O5BA 3AVJA 3ZT1A 5AQYA 4J2BA 3QETA 3K57A 3HP6A 2ASPA 1K8KA 2VWKA 3MCPA 4BE0A 1BQNA 1BI4B 3TSUA 2UUAK 3P5JA 5E41A 2B6AA 3PO4A 1BWFO 4BDPA 1S1TA 3U3GA 2NLXA 1HX1A 3TU5A 3O1BA 2UU9K 4JYAK 1L3SA 2YHXA 1E4FT 1N36K 4DV5K 1MA9B 2BGGA 1X3MA 3BY5A 1Y97A 5FLXO 3FGUA 4CJKA 3HXMA 3NDKA 1BA1A 3CC7N 1RTIA 3VQ8A 5TKYA 5EXWA 4EP5A 4Z4HA 2XY7A 3CYMA 1W97L 3R8EA 4BRFA 4DR5K 3VN5A 4B9UA 3AVBA 2CH6A 4LF7K 5JVGL 3VEVA 5J2NA 2HHVA 4H5TA 4DSFA 3EEQA 2HVIA 4DTNA 3WEEB 1VQNN 4XIUA 1XHZA 3V1QA 4OO1J 1TL3A 5FPDA 5C2DA 3NVKA 3PX4A 1TKDA 3BF3A 4DQSA 4BY9C 1BOTO 4M3ZA 1HR0K 4GV6A 3OS0A 3H1QA 5BR9A 4CF1A 3O9TA 1QSLA 4HTUA 3NF6A 4CFDA 2P9UB 4J2DA 4FJNA 3LZJA 1TVRA 4CK2A 2W41A 1JL1A 5JLHA 1C1BA 4JV5K 3ZX0A 3ZETB 3HRGA 1VQLN 3SJHA 3LDNA 3O80A 1I39A 1RILA 4B8AB 4BRCA 4C8LA 1YF5L 4W5QA 3AA4A 2WUSA 3P31A 4C1NI 5ELZA 4AHUA 1S6PA 5F2RA 3KJVA 2VWBA 4C8OA 4BE7B 4CJWA 4A2AA 3QDKA 4DSEA 1HKGA 3WQUA 4CK1A 3TAEA 3J81O 3AA2A 5E26A 3ATVA 2ATQA 5J1EA 3VENA 3K5MA 2G8IA 1N33K 4RW8A 1S3XA 3IAYA 4ZTFA 4YOVA 1HNXK 1RT6A 2HHUA 2OYQA 4E7JA 3LL3A 1GOCA 2A1RA 5CE3A 1OVYA 2O4GA 4BEBA 4FLYA 1JKHA 4CIFA 3HBTA 1VSEA 4O8UA 1T7PA 3D2FB 4E7IA 4CHNA 2I7NA 3ENOA 1N32K 3LAMA 3ULDA 1LAWA 1KAYA 1ZBSA 2O8CB 2ASMA 4BG9A 2P9KB 4KV8A 3WT0A 4FW2A 5GIPA 2ZJRL 1DKGD 4CJ3A 3PSFA 4CZKA 3FLCO 2DFHA 3PO5A 1HNIA 4Z4IA 3CERA 4RCHA 2IVPA 1N8RO 2HHXA 2AP1A 2YKNA 3SBTA 3HM9A 3BZKA 1BL3A 4CZFA 2P9PB 1JLGA 3TI0A 2OPSA 1W9HA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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