3UKUB

Structure of arp2/3 complex with bound inhibitor ck-869
Total Genus 46
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
46
sequence length
195
structure length
195
Chain Sequence
GVVVDSGDGVTHICPVYEGFSLPHLTRRLDIAGRDITRYLIKLLLLRGYAFNHSADFETVRMIKEKLCYVGYNIEQEQKLALETTVLVESYTLPDGRIIKVGGERFEAPEALFQPHLINVEGVGVAELLFNTIQAADIDTRSEFYKHIVLSGGSTMYPGLPSRLERELKQLYLERVLKGDVEKLSKFKIRIEDPP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structure of Arp2/3 complex with bound inhibitor CK-869
rcsb
molecule keywords ACTIN-LIKE PROTEIN 3
molecule tags Structural protein
total genus 46
structure length 195
sequence length 195
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-11-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3ukuB01
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3ukuB02
4CBXA 1LCUA 3OHRA 4L3QA 2NLXA 2E2NA 1GLEG 3U9DA 2PAVA 2FLOA 5E26A 2Q0RA 3P4IA 4QS8A 5E84A 5FPDA 2FF6A 2ASPA 2DPNA 2I7PA 3A5OC 4BRAA 4BRPA 3FR0A 4J8FA 3VGMA 1RDWX 2FF3B 2ZGYA 4JN4A 3L4IA 1HPMA 2KHOA 4B1ZA 5KQDA 4EIAA 2A42A 2P9NB 1HUXA 4MLHA 1DKGD 5LY3A 3MCPA 4IJAA 3D2EB 4I6MB 4MLEA 1ZC6A 3A5NC 3UKRB 4CBUA 2QW9A 3SLCA 1BG3A 2VCPA 3ULEA 3GE1A 4H5WA 4BGBA 2Q1NA 5AQRA 1XQSC 3H45C 2A40A 3IMXA 4H0PA 5AQNA 1DGKN 3LDLA 2D0OA 3H1QA 3JXUA 3EN9A 1S22A 4B1XB 3U8XA 4K42A 1J6ZA 4BRIA 3CJ1A 1D4XA 4H0VB 3FE1A 5LJVA 2OANA 2YHXA 4FWLA 1NGJA 3QB0A 3WXKA 4H5NA 1U2VA 3O1WA 3MK6A 3C0BA 2VWBA 2P9PB 2P9UA 4BR7A 1NMDA 4FWNA 4BRNA 3HI0A 3FZMA 3DXMA 3VETA 4FWPA 4BRLA 2YCHA 3GBTA 5AQUA 4BR2A 3JS6A 4PKIA 4BR4A 4KBOA 3ZEUB 2HMPA 4WQ5C 4RCHA 3CJ9A 4WYBA 5AQMA 3WQUA 1JCFA 5AZJB 2GWJA 2E88A 3O8MA 4EAHD 3O5BA 4HTLA 5FPEA 4H0YB 4BRMA 2D4WA 1RFQA 2P9IB 1ZBSA 2GUPA 3A5MC 3ID8A 3KVGA 3LDQA 2FSJA 2Q36A 3WQTA 1XUPO 2YJFA 3A0IX 1ATSA 3WUHA 1K8KB 4E1JA 4A2BA 4GNIA 2QM1A 3WXIA 3ZETB 4CD3A 3GG4A 2H3GX 2E2PA 3DXKB 1T6DA 2NZTA 4BVOA 3VESA 3CIPA 3EL2A 1Z05A 1Y64A 1NLVA 1YUWA 1QZ5A 2ASMA 3IFRA 3WEEB 3B8AX 4JHDB 1HKGA 4IO8A 4K43A 3S41A 2ZWHA 3MN9A 2P9LA 4ISGA 2HOEA 2P9KA 1LOTB 4IJNA 4BRKA 1BOTO 4NO7A 1NGBA 1GLDG 3ATVA 1XC3A 3FZKA 4BRQA 3VEXA 4JNEA 5I9EB 3D7EO 4FO0A 3MN5A 3EKSA 3VGKA 1BA1A 4BGAA 3FZLA 4M7XA 1T44A 3L0QA 4FWRA 1DEJA 3HTVA 3VEOA 2P9SA 2QXLA 3FGUA 2AP1A 4BREA 4FL9A 4PKHA 3VEWA 3CQXA 3TU5A 1QQMA 4EHUA 3RSEB 3VEZA 3ENOA 3H3OB 4FPBA 4FOEA 3LDNA 4BC2A 5BRFA 3BUZB 4H5RA 3FZFA 4MO5A 2IVOA 5AQJA 1MWMA 4IZ9A 2ASOA 4BRHA 4CZKA 3O08A 2YHYA 1Z6RA 3AAPA 1TYQB 2Q97A 4PKGA 4H0TB 5BN8A 3AAQA 3SJHA 4BQZA 2J4RA 1QHAA 5B8HA 2CGKA 2CGLA 4BR5A 3U9ZA 3WXLA 4RWTA 3EO3A 1P8ZA 4BG9A 1HKBA 3D2FB 3VPZA 4QS9A 4LC9B 3C7NB 2A41A 1V4TA 3UKUB 4CZJA 1BUPA 2Q0UA 2AA4A 1E4FT 1NGHA 3QDKA 2E8AA 4BQLA 5BPLA 4K25A 4BR0A 2GWKA 4XH1A 4BROA 3WXJA 1WOQA 2QWLA 2A3ZA 4FWMA 4CD1A 4B9QA 4WQ5A 5BPMA 4FWOA 5JICA 3CJBA 4DHYA 3DAWA 2I7NA 4JAXA 3CETA 5AZIA 2Q31A 3IDHA 4HWIA 5AQKA 3ZX2A 4B1YB 1GLLO 3W0LA 2Q2RA 4YDUA 3ZX3A 5AQHA 1GLAG 5AQQA 5AQFA 5AFUH 5KPZA 1SQKA 2V7ZA 4Y0WA 3FZHA 3UE5A 5AQWA 4BC3A 4BRFA 1U6ZA 3VEYA 4JD2B 3GL1A 3CHWA 1ESVA 5JMVA 1TUUA 1WUAA 4YDUC 2IIRA 4NB4A 4M63C 5AQIA 1QQOA 4ISEA 3ATUA 4CI6A 3HM8A 4A61A 5KQ8A 2HF4A 3CI5A 1JCEA 3M6GA 3LM2A 4DCHA 2F9TA 3UB5A 4MO4A 3CJ7A 2UYTA 4CZLA 5AQXA 3GDQA 2P9NA 1S3XA 4H0OA 1X3MA 2YI1A 5AQGA 1TYQA 1EQYA 4QS7A 1NGAA 2BUPA 1GLBG 1ATNA 3D2EA 4I6MA 3GOIA 3UKRA 1R59O 3FLCO 1E4GT 4FWQA 3SMSA 4EFHA 1NGCA 3TPQA 4CZHA 3ULEB 2WUSA 1HKCA 1BWFO 3O4WA 4H03B 5F1XA 3VENA 3O6WA 5ADXH 1Q18A 5TKYA 3H3NO 1NBWA 1OKJA 2QWPA 5EY4A 4B1UB 3SMPA 4Z94A 3KHYA 3LDPA 3MN7A 3VF6A 2A5XA 4H5VA 1IJJA 2CH6A 4B1WB 1U2VB 3QICA 3H6EA 4CZIA 2P9PA 4H0XB 2P9UB 2ZF5O 2D1KA 1QZ6A 1GLJO 3LL3A 3BF1A 3R6MA 1H1VA 3DXMB 3FFKB 4ISFA 2QWMA 5KPTA 3VGLA 3IUCA 4A2AA 5F0XA 4B1VA 3AY9A 2W41A 3ZEUA 4DB3A 5LJWA 1X9JA 4BRCA 5AZJA 3DWLA 5EX5A 4CZEA 1KAXA 2BTFA 4WQ4C 3U4LA 3EZWA 2GELA 2P9IA 4IWVA 1QQNA 2W40A 1MWKA 3HBTA 4O8KA 1SAZA 2QWOA 5AQLA 4IXCA 5JLFA 4BC5A 4PL7A 3J8AA 3QBWA 3H46O 1NGGA 3VF2A 5FPMA 4EHTA 1K8KA 4K41A 3QBXA 3CQYA 1G99A 4PL8A 5ELZA 3ZETA 5BPNA 4XH4A 4O5FA 5AQPA 3DXKA 3G25A 3I8BA 3QFUA 1GLCG 4FSVA 4CZGA 3WEEA 4JHDA 4AM6A 1IG8A 1ATRA 2PBDA 5AR0A 4BR9A 3A5LC 3VF4A 3CJCA 4BVPA 2P9LB 2P9KB 3CERA 3A8YA 1HX1A 1NGIA 4RTFD 4CJ7A 2FSNA 3MN6A 2HF3A 1MA9B 2E20A 3L6QA 3I33A 4BC4A 2A6AA 4DQ8A 1CZAN 2CGJA 5BN9A 5AFUA 1C0FA 3SK3A 1ZXOA 2CH5A 3BF3A 3CJAA 5EOYA 1YXQA 5BRHA 4M7YA 3W3DA 2YJEA 5BR9A 2V51B 4GY2B 2F9WA 1SZ2A 3VERA 4CZFA 1BA0A 3QFPA 2P9SB 2QWNA 1KAZA 5BREA 4AM7A 3QMLA 4FOIA 1YAGA 2D0PA 2QWQA 1HLUA 2FSKA 2E2OA 2GEMA 5FPNA 3R8EA 1YVNA 3MDQA 3RSEA 4BG8A 2QWRA 4FPAA 3H1VX 1KXPA 2E1ZA 2NRHA 3O1BA 3O80A 5AQVA 3EKUA 1NGDA 4XH5A 4F9OA 2VYPA 4C23A 2E2QA 4CBWA 3HSCA 5EXWA 5F2RA 3M1FA 4CZMA 3LM9A 5KPRA 4FWKA 2E1YA 2EWSA 4H5TA 5AQOA 2YHWA 4FWSA 1X3NA 5AQZA 1BO5O 1TUYA 5ADXA 3D2FA 1RGIA 3C7NA 2ZGZA 1KAYA 5AQYA 3UKUA 1HJOA 1NGEA 4BRDA 3ZX0A 1BDGA 2ITMA 5AQSA 5CE3A 2IVNA 2GTDA 3F9MA 1NWKA 1NGFA 2IVPA 3VOVA 3DJCA 3BEXA 1BU6O 1C0GA 3BP8A 2V7YA 3AARA 3M3ZA 3ENHA 5AZIB 4WQ4A 1NM1A 4XEIA 3R9PA 5BRDA 1T6CA 1JCGA 1V4SA 2V52B 5EVZA 3KZBA 1MDUB 5AQTA 2FXUA 3WT0A 5JLHA 4A62A 4BRGA 1GLFO 3HZ6A 3LDOA 3MMVA 3VEVA 4JD2A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4JK7A 2E5LK 1SS6A 1GLEG 1XHZA 3G4SN 3CM6A 4BE1A 3RVCA 2IS3A 2I7PA 4BRAA 1C1BA 1HJRA 3R3LA 4JN4A 2XY5A 2G8WA 5KQDA 4CHZA 4GKKK 4EIAA 3V9WA 2P9NB 4MLHA 2VGNA 1DKGD 4DSKA 4HVJA 2PFUA 2NRWA 3MCPA 1S1WA 3DI6A 1N36K 3D2EB 4MLEA 4LF4K 1ZC6A 3A5NC 2VCPA 3OY9A 1NOYA 3NF7A 1XC9A 4H5WA 1U4BA 2HHWA 1IH7A 1EX4A 3IMXA 2Y1JA 4B1XB 1S22A 3I0RA 1J6ZA 3CJ1A 5LJVA 2YHXA 3I55N 4KI4A 4FJHA 2KKZA 4FVUA 1KFSA 4M3YA 3AVCA 2P9PB 4I2QA 1Q7YO 3MX5A 3O9SA 4BRNA 5M1PA 3FZMA 3DXMA 4FWPA 4BRLA 1TK5A 4DQIA 1ASUA 3GBTA 3Q7CA 5AQUA 4X65K 4BR2A 2YKMA 2HMPA 3CJ9A 4FXDA 2GWJA 3AO5A 1RBTA 4C8MA 2HBJA 1RNHA 1ZBSA 2KQ2A 3IAYA 5DK5A 3ID8A 1A5VA 1S1VA 1FKPA 2FSJA 2OPRA 4KTQA 2D0BA 1XUPO 4JLHA 2OPSA 3OYAA 3TARA 4E1JA 4A2BA 3WXIA 2W00A 2W6LA 4KTWA 2H3GX 2E2PA 3CIPA 4DQPA 1Z05A 1XNQK 1NLVA 3EE9A 4CF2A 3JSMA 2W42A 3IFRA 5KGXA 3RMDA 4KB0A 3B8AX 3BDPA 3N4QA 4K43A 1FXXA 4LSLA 4B3MK 5C42A 4F8RA 2BH1A 2VQEK 4LF5K 2P9LA 2YX6A 3KD5E 1VSDA 4IJNA 3MXJA 4CEAA 1QSYA 1SL0A 1GLDG 2Z1JA 3OYCA 3F9KA 3TAQA 4KTZA 1BL3A 3PX4A 3VMFB 3VEXA 4JNEA 5I9EB 4CHYA 1G15A 3I8DA 2ZM6K 3TAGA 3EKSA 3VGKA 4LD0A 3HOSA 4M7XA 1T44A 3L0QA 1DEJA 1JL2A 3ID6A 1HNZK 3CCRN 4BREA 4B9SA 3ZT4A 3RWUA 3HK2A 3TU5A 3H08A 3HT3A 2UUCK 3T3FA 1QQMA 4K8XA 4JRPA 4L8RB 3RSEB 3VEZA 3ENOA 4FPBA 3VQ8A 1VQ7N 4DQRA 4B9UA 1LAWA 4BC2A 3CF5L 3L2QA 2EHGA 2ASOA 4BRHA 4CZKA 3O08A 2KLAA 2YHYA 1TYQB 1L3VA 3THWB 1NJXA 3SJHA 1M1KO 4JYAK 4W5QA 5B8HA 5GAEP 2CGKA 4BR5A 2WTUA 4DQQA 4IOXA 1QVFM 3HPOA 3TSPA 4W5RA 2A41A 4FM1A 1V4TA 3OJUA 3UKUB 4DV7K 4CZJA 1BUPA 1LW0A 3PX6A 1EXQA 3NCIA 3DMJA 3E9LA 4K25A 2GWKA 4FJLA 4BROA 2QWLA 2A3ZA 4DS4A 1HNWK 3CCMN 1VSMA 3DRRA 1VSLA 4KREA 1ZBHA 3L2UA 4HWIA 5AQKA 4OLBA 4CK3A 1I3AA 4BECA 4KH6A 2YNHA 4BC3A 3C95A 3SV3A 3TSQA 4JD2B 4DV6K 3SCXA 3CHWA 3HPGA 1TUUA 4YDUC 1J54A 4PHTX 4E72A 4B9TA 1ILYA 5M1KA 3P83D 4JKDA 1BCOA 4A61A 5KQ8A 1JCEA 1RBUA 3LM2A 2UUBK 4W5TA 1VQPN 1VQLN 5AQXA 4CEFA 4CJRA 2P9NA 2F4VK 2NNWA 1NGAA 4YOTA 5JENA 1QQCA 2Q3SA 4KHSA 4O4GA 1ATNA 3DOKA 3D2EA 1O13A 3LDSA 2VWKA 4B3RK 4CEDA 1E4GT 3SMSA 3S3MA 3RTVA 3ULEB 4CCHA 4LFAK 2WUSA 4CHPA 1NBWA 5HRPA 3SQ1A 3QEPA 4B1UB 4CIFA 3L2VA 3HJFA 1J9AA 3P5JA 3T1YK 4B1WB 1U2VB 1SKSA 4C8NA 1IO2A 2P9PA 2ZF5O 1QS4A 4OKJA 3D6RA 3VQAA 3R6MA 2QEXN 3FFKB 2YNIA 1KVBA 4X62K 1HR0K 4B1VA 3AY9A 2W41A 5JVGL 3TAPA 4IEIA 4DB3A 5CYMA 3EY1A 1HQEA 1MU2A 3DWLA 5SWMA 3CQ8A 3I56N 2GELA 4IWVA 4KB1A 1HMVA 3IKMA 2G8VA 4CEQA 1SAZA 5AQLA 4IXCA 3KLHA 4E7KA 5CZ2A 1YI2N 4Q0BA 5KTQA 3H46O 3DLRA 5LMUK 1VSEA 3CYMA 1JLGA 1Q8IA 3EE8A 3B6OA 5AQPA 1HYZA 4CZGA 4HUGA 4JS5A 3MEGA 4BR9A 3VQDA 1HYSA 3PSIA 3CCSN 4DF4A 3RRHA 4KAZA 1XMOK 2JLEA 3A8YA 1TAUA 1JLQA 1N34K 2NRTA 4RTFD 2ZJQL 3QERA 2HF3A 1MA9B 4BC4A 3ZT2A 5AFUA 1M90O 3SK3A 4N47A 1VQ8N 1ZXOA 3CJAA 4NCGA 3W3DA 2YJEA 1KSPA 3NDKA 3JAMO 4YOVA 3CD6N 3QFPA 2G8IA 5BREA 4AM7A 1YAGA 4DV0K 2QWQA 5K14A 2FSKA 2GEMA 2IC3A 3R8EA 1YVNA 3QINA 3MDQA 3RSEA 1W97L 1HQUA 3O1BA 5AQVA 1NGDA 4EZ6A 4UQGA 3LANA 4LY7A 4XH5A 4F9OA 1TL3A 5FLXO 1EO1A 3TSUA 3KJVA 2XY6A 3M1FA 3THWA 1RDBA 4FWKA 2EWSA 4DWIA 4YOWA 4FJKA 2YHWA 1W9HA 4E3SA 2XY7A 4RG8A 5ADXA 4DTMA 1RGIA 2ETJA 2ZGZA 1KAYA 3UKUA 3AVGA 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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