3ULEA

Structure of bos taurus arp2/3 complex with bound inhibitor ck-869 and atp
Total Genus 129
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
129
sequence length
415
structure length
400
Chain Sequence
AGRLPACVVDCGTGYTKLGYAGNTEPQFIIPSCIAIKEVMKGVDDLDFFIGDEAIEKPTYATKWPIRHGIVEDWDLMERFMEQVIFKYLRAEPEDHYFLLTEPPLNTPENREYTAEIMFESFNVPGLYIAVQAVLALAASWTSRQVGERTLTGTVIDSGDGVTHVIPVAEGYVIGSCIKHIPIAGRDITYFIQQLLRDREVGIPPEQSLETAKAVKERYSYVCPDLVKEFNKYDTDGSKWIKQYTGINAISKKEFSIDVGYERFLGPEIFFHPEFANPDFTQPISEVVDEVIQNCPIDVRRPLYKNIVLSGGSTMFRDFGRRLQRDLKRTVDARLKLSEELSKPKPIDVQVITHHMQRYAVWFGGSMLASTPEFYQVCHTKKDYEEIGPSICRHNPVFGV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structure of Bos taurus Arp2/3 complex with bound inhibitor CK-869 and ATP
rcsb
molecule keywords Actin-related protein 3
molecule tags Structural protein
total genus 129
structure length 400
sequence length 415
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-11-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 3uleA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3uleA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3uleA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3uleA04
4FWSA 3MMVA 4YDUA 3VEWA 2CH5A 4FWKA 5BPMA 3WEEA 1KAZA 3FZMA 2CGJA 1DKGD 5AQGA 1R59O 2NLXA 4FO0A 3FZFA 4IXCA 3WXKA 3WT0A 3H3OB 3L6QA 4BQLA 1X9JA 4F9OA 5BRHA 4YDUC 3A5NC 5AZIB 3EL2A 3HSCA 3VENA 1XQSC 1GLEG 3EN9A 4B1ZA 2ASMA 4M7XA 3UKUB 1KAXA 3QFUA 4JHDB 2VWBA 4HTLA 3SK3A 4EFHA 2QWRA 3A5MC 1ATSA 2WUSA 5KQ8A 1GLFO 2W40A 4B9QA 4JD2A 4H0OA 2E20A 5FPEA 3IUCA 4QS9A 4BQZA 2CGLA 4FWQA 1ZC6A 5EX5A 1NGAA 4AM6A 2EWSA 3SMSA 4A2BA 1P8ZA 2QWNA 4FWOA 4ISFA 3VEXA 5JLHA 1GLBG 1C0FA 3H3NO 2FSKA 4BRNA 5ADXH 3FZKA 3I33A 4FWNA 4ISEA 5AQSA 3CJ7A 5BPNA 1DGKN 1HKBA 5AZIA 1H1VA 2P9KB 3A5LC 3D7EO 1YUWA 4FWRA 5FPMA 2ZF5O 3UKUA 1LCUA 4JHDA 4JN4A 2V7YA 3VGLA 5AQPA 1WOQA 5LJWA 3O6WA 4BRFA 5JICA 4MO5A 5BPLA 2GWKA 3H1QA 3A0IX 3CIPA 4XH4A 3ID8A 2CGKA 3CJAA 4H0VB 4M7YA 3WXJA 5EXWA 1YXQA 3AY9A 3RSEB 3C0BA 4B1WB 2YJFA 3VF6A 3ZX0A 1QQMA 3DJCA 1U2VB 3VF4A 3B8AX 5KPZA 5AQMA 4BRKA 3QICA 1NGIA 5AQQA 3A8YA 5AQXA 4CZGA 3WXLA 3BP8A 3P4IA 3I8BA 1GLAG 3M1FA 1MWMA 1NGCA 5I9EB 3CERA 3G25A 4BR5A 3VEVA 5BN8A 2P9KA 1ATNA 2FF6A 4H0TB 2GELA 1XUPO 2Q2RA 3R8EA 3ZEUB 1HPMA 1QQOA 2E2OA 3CQYA 4NO7A 4CBWA 2ZGYA 3O8MA 4FOIA 3QDKA 3JS6A 4WQ5A 4QS7A 4B1UB 1NGDA 4BR7A 4BVPA 4A61A 2V7ZA 2E2QA 3DXKB 2PAVA 2P9PB 3RSEA 5FPNA 3ATVA 3H45C 4ISGA 5CE3A 3CJ1A 3FGUA 4K41A 1U2VA 5LY3A 3LM2A 4BRCA 3F9MA 2E1YA 3KHYA 4WQ5C 4RWTA 3UB5A 1BO5O 2I7NA 2GWJA 2P9SB 5FPDA 1MA9B 1TYQB 5EY4A 5BN9A 1X3NA 3IDHA 4BC4A 3LM9A 3ZETB 1NGFA 4CBXA 4WQ4A 5JMVA 1D4XA 1BWFO 3SJHA 2H3GX 1E4GT 1S22A 3ZX3A 2FSJA 4B1YB 3FZHA 3ZEUA 4E1JA 4BC2A 5EOYA 3A5OC 2QWLA 5AQYA 1BUPA 1QHAA 4BRAA 1HKGA 4BG9A 4H5RA 2A42A 5AQZA 4BRPA 3ENOA 1T6CA 4WQ4C 4M63C 5AQUA 2D0PA 3O1WA 2AP1A 5KPTA 5E84A 3DAWA 2Q97A 3DXKA 4CZKA 2P9PA 4BRMA 4CZIA 5BREA 5AQTA 3OHRA 1V4TA 3GDQA 1K8KB 1NGGA 4KBOA 4BRGA 2P9IB 3EKSA 1XC3A 3EKUA 2YJEA 3C7NB 2P9SA 4A62A 1TYQA 1NWKA 2NRHA 1NGJA 4IZ9A 2ASPA 3ZETA 4FL9A 2GUPA 2ZWHA 2P9UB 4BGAA 3BF3A 3GBTA 4H0XB 1BG3A 5AQWA 3HTVA 4RCHA 1TUUA 5TKYA 1T44A 1JCFA 2E2NA 1ZBSA 3CETA 3CJ9A 4HWIA 4H5NA 2QWOA 2BUPA 4MO4A 2BTFA 5AQNA 3ATUA 4A2AA 3TU5A 4DHYA 3ENHA 4BRLA 3U9DA 4I6MB 4NB4A 4XH5A 2QW9A 2E8AA 5ADXA 3GG4A 5AFUH 1TUYA 4BC3A 2Q36A 4PL7A 2FLOA 4CZJA 4IO8A 3TPQA 2ASOA 4XEIA 1NMDA 5AQHA 5AQFA 3S41A 3BEXA 1WUAA 3DWLA 2HOEA 2VCPA 4CD1A 5F0XA 1MWKA 1KXPA 1K8KA 3O5BA 5AQJA 2A40A 4O8KA 2P9IA 3M3ZA 1SZ2A 3C7NA 4H5WA 3EO3A 3GL1A 2UYTA 4CZEA 3ULEB 4H5TA 4BGBA 2OANA 4Y0WA 3CHWA 2P9UA 4RTFD 3WXIA 3CJCA 3H1VX 1RDWX 3EZWA 1QZ5A 2P9LB 3ZX2A 4MLEA 1U6ZA 2KHOA 2QWMA 3IMXA 3L0QA 4DQ8A 5AQOA 3VPZA 4CJ7A 1MDUB 3O4WA 4H03B 1T6DA 4I6MA 1EQYA 2YCHA 3WUHA 2P9NB 4PKHA 4CZLA 1C0GA 3H46O 2GEMA 3SMPA 3LDPA 5E26A 1NGEA 1OKJA 3UE5A 5KPRA 2F9WA 4IWVA 2YHWA 1Y64A 1CZAN 1NGHA 1GLJO 2IVNA 3MN6A 1J6ZA 2ZGZA 1HJOA 4BREA 3ULEA 4PKIA 1Z05A 3GOIA 4H0YB 3VEOA 4J8FA 1NM1A 2DPNA 3VF2A 3SLCA 2QM1A 1X3MA 2HF3A 2P9LA 2QWPA 3U8XA 3R6MA 3BUZB 3WQUA 4PKGA 4EHTA 5ELZA 2YHXA 3U9ZA 2E1ZA 3QMLA 4K25A 3O80A 4EIAA 1GLLO 4FWPA 3VEZA 1QZ6A 2P9NA 3AAPA 1E4FT 4BR4A 3KZBA 4BRIA 2FSNA 4BC5A 2I7PA 1KAYA 4BR0A 1JCGA 4CZHA 3DXMB 5AR0A 1LOTB 4B1VA 3W3DA 2IVPA 4QS8A 2CH6A 3VGMA 3QBWA 3VERA 2W41A 1HKCA 1NLVA 5BRDA 2NZTA 4AM7A 2E88A 2D4WA 1G99A 4BG8A 4WYBA 3LL3A 4FWMA 3R9PA 1QQNA 1BDGA 1ATRA 3VEYA 3AARA 4FWLA 1S3XA 3QFPA 1SQKA 4BRHA 4BRDA 3HM8A 3UKRB 5F1XA 4EHUA 3J8AA 3MDQA 4BRQA 4FPBA 4B1XB 1YAGA 3HZ6A 2HMPA 3D2FB 2QWQA 1IG8A 4K43A 2E2PA 3VGKA 4CZMA 4CZFA 3D2EB 2GTDA 2AA4A 3MCPA 5AQKA 1IJJA 3LDQA 4EAHD 2Q31A 3HBTA 4GY2B 3DXMA 5AQIA 1Q18A 1BA1A 3LDLA 2J4RA 3CJBA 5B8HA 4H0PA 3O08A 4BVOA 4CD3A 3LDOA 2HF4A 2IIRA 4JNEA 1NGBA 2A3ZA 3GE1A 4BR2A 4C23A 3CI5A 3W0LA 2QXLA 3L4IA 2Q1NA 4O5FA 1ESVA 4FOEA 3MN7A 4LC9B 3VETA 3KVGA 4XH1A 3VOVA 5AFUA 2PBDA 2FF3B 4PL8A 4CBUA 3MN5A 2VYPA 3UKRA 2A5XA 2F9TA 2V51B 4IJNA 3U4LA 5AZJB 2V52B 4MLHA 4BROA 5AQVA 1YVNA 4DCHA 5LJVA 1GLCG 3IFRA 1BU6O 3FE1A 1HLUA 3D2FA 1GLDG 4JAXA 4DB3A 1NBWA 3WEEB 1ZXOA 3D2EA 3FZLA 4FSVA 4CI6A 3O1BA 5KQDA 5BRFA 5EVZA 2YI1A 1RFQA 2IVOA 1DEJA 2FXUA 4Z94A 4IJAA 1BOTO 4K42A 3H6EA 1JCEA 2YHYA 1HX1A 1HUXA 1Z6RA 2Q0RA 5AQRA 1RGIA 3FFKB 3HI0A 1SAZA 3QBXA 3CQXA 2ITMA 4FPAA 2D1KA 3BF1A 1BA0A 2D0OA 5JLFA 2Q0UA 3JXUA 3QB0A 2A41A 3AAQA 3FR0A 3VESA 4L3QA 4JD2B 3M6GA 5AQLA 3MN9A 4BR9A 4GNIA 5BR9A 3FLCO 5AZJA 3LDNA 1V4SA 3WQTA 2A6AA 5F2RA 4H5VA 3MK6A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1Q7YO 5BPMA 1KAZA 3RR7A 4E72A 5AQGA 4DV2K 1QVGM 3OYBA 2NLXA 1WSHA 2F7TA 3L3UA 3VTIA 3WXKA 3PV8A 3WT0A 1SS6A 2QKKA 5AZIB 3EL2A 3VENA 4XJXA 3EN9A 3UKUB 4A5AA 1KAXA 3QFUA 4JHDB 3SK3A 1X9WA 4JI6K 2UXBK 3O3FA 4DR6K 4RW6A 4N56A 1GLFO 1C0UA 1WSFA 1XI1A 4H0OA 4DMNA 5FPEA 4BQZA 1YJWN 3SQ4A 1ZC6A 3MEEA 5JS1A 3PO4A 3PSFA 4JS5A 2EWSA 1P8ZA 4ISFA 1GLBG 5FRNA 1C0FA 3AVGA 4BWMA 1C0MA 3FZKA 3I33A 1NOZA 4BEBA 4B3RK 5BPNA 1DGKN 2Z1HA 3OYCA 5AZIA 1TGOA 2FBYA 3HM9A 3D7EO 4FWRA 5FPMA 1YUWA 2ZF5O 3UKUA 1VQ4N 3AVJA 4JHDA 3LP2A 3S5TA 1MU2A 2WOMA 2YNFA 1SL1A 3DRSA 1UA0A 4OKJA 2HHVA 3OA9A 2YV0X 2OPSA 3ID8A 4O44A 1S1XA 2CGKA 4BE1A 5I3UA 3CJAA 4H0VB 3O3HA 3J81O 4F3OA 4KREA 3HL8A 1HR0K 3DLHA 5EXWA 1YXQA 3AY9A 1ZYQA 4B1WB 3ALYA 1U2VB 4CJPA 4FM2A 4BRKA 4FJXA 1Q82O 5AQQA 1ITGA 3V9SA 4Z4CA 3KLGA 2IAJA 1KLMA 3P39A 5LMUK 2QXFA 1GLAG 5KRTA 4DTJA 3LWLA 3LPTA 3CYMA 4CESA 5I9EB 1YTUA 3CERA 1ZBIA 3ZLJA 2VGNA 4CK1A 1XWLA 1XUPO 3HP9A 1EO1A 3OYGA 1YVUA 4NO7A 1BL3A 3TABA 2C1GA 4O8UA 4GVEA 4J2EA 1A5WA 2DTUA 4FJGA 3CM5A 1RTDA 2VQEK 4BVPA 4IEIA 2V7ZA 2E2QA 2FBVA 3OYHA 3DXKB 1CXUA 2P9PB 5FPNA 1RT4A 5CE3A 1U2VA 3AVIA 4LF7K 3Q7CA 3MX5A 4CEEA 4YOWA 4RWTA 1BO5O 3VQ4A 1TYQB 2UXCK 4CFDA 4E7LA 2FBTA 1OH6A 4CHOA 4JRPA 1D4XA 2NNWA 4YOXA 4IFEA 3CFPA 3OW2M 5CY4A 4JS4A 3VA0A 1WB9A 2HHWA 3LP3A 4ILJA 3ZX3A 4WCEL 4NYNA 4JI7K 4FVUA 3A5OC 4DU1A 3S3MA 1BUPA 4BRAA 1XNQK 3QEPA 2A42A 4CGGA 3CCJN 4M63C 2O8FB 3DAWA 4A5BA 3DXKA 4U7BA 3D6RA 1S1UA 1IKXA 2P9PA 4HUGA 2KZMA 3EEQA 2GX9A 1GOAA 5HRRA 4CEQA 1HJRA 3VQ7A 4CECA 5BREA 2QKBA 4H4MA 3OHRA 1K8KB 4FJJA 4E7IA 3BGRA 1LWEA 4Z4FA 1TYQA 1VSEA 2IDOA 4IZ9A 1VQ5N 2HHIA 2GUPA 1IBLK 3SQ0A 1S1VA 4W5RA 4DR3K 5AQWA 3HTVA 4RCHA 5TKYA 1VQ7N 1T44A 1JCFA 1LWCA 4DTOA 1ZBSA 4DTSA 4E0DA 4HWIA 4FJ9A 4DQQA 5AQNA 3ATUA 3ENHA 4DS5A 4LH5A 5HRNA 4I6MB 4NB4A 1T05A 3NE6A 2E8AA 5ADXA 5HP1A 2O8FA 3T1YK 1KD1O 4N41A 4CZJA 4DR5K 4IO8A 4A59A 4XEIA 3ITHA 3S41A 3VQBA 4JYAK 3CD6N 3KLFA 2HHUA 4OPAA 1KFSA 1T7PA 1K8KA 4G9ZA 3O5BA 4AH9A 4IDHA 3M3ZA 3ZT0A 2AJQA 4YOVA 2PY5A 2O8DB 1DT9A 3EO3A 3V1OA 4BGBA 3SBGA 4DFPA 1XMOK 2G8UA 1DTQA 4CEDA 3EZWA 3VQ5A 1QZ5A 3QEVA 2P9LB 1JXBA 1O1WA 1TAUA 1NJIO 4JI4K 4I6MA 2XHBA 5J2PA 2YCHA 1OVQA 1C0GA 2B6AA 3H46O 4KTWA 3T7ZA 2GEMA 3SMPA 3LDPA 4FLYA 1QTMA 3MWTA 3O9SA 5E26A 4B08A 4EP5A 1TKZA 1SKWA 3MCAB 5KPRA 3UE5A 4FCYA 4CIGA 1U04A 1G15A 4DUZK 4C8LA 1GLJO 4GV6A 3V1RA 1RBSA 1VQ6N 1FJGK 2O8DA 2B5JA 1O13A 3C6UA 3TTDA 1K6YA 1WSGA 3G6EN 3OYAA 4KV8A 1NM1A 2OPQA 3LAMA 3SLCA 2QM1A 4DUYK 2P9LA 2QWPA 3QO9A 2WTUA 5C10A 1OVYA 4EHTA 3PX6A 4F4KA 5GIOA 4NXNK 2E1ZA 1U45A 4DKWA 4K25A 2P5GA 1VRTA 4KI6A 4FWPA 3T3FA 1E4FT 2OPPA 1VSFA 4BR4A 3TR8A 3OYIA 2NRZA 1KAYA 4K0KK 1S5JA 5AR0A 3OYNA 1K9MO 2G8HA 2IVPA 1UA1A 1J54A 4DV5K 4NCBA 3VGMA 1VSIA 3VQPA 4ILHA 2W41A 1HKCA 1FKPA 1NLVA 3WNEA 4AM7A 4BE2A 2D4WA 4Q5VA 1JLQA 2HNDA 5I42A 1BDGA 4LD0A 1JLCA 3V4IA 2YHAA 4X64K 3QFPA 4FLTA 4B3MK 4PY5A 4LF8K 5KGWA 3B6PA 3MDQA 4LFCK 4FPBA 1EP4A 4B1XB 3BDPA 1W9HA 2HMPA 5HRPA 4K43A 4HUFA 3G71N 5AQKA 1NKEA 1QSSA 2Q31A 4GV9A 4EZ9A 3HBTA 4RW8A 5DMRA 4KHYA 2VG7A 4OKKA 1J5EK 1VQ8N 1BA1A 4X66K 4IBNA 4PWDA 5FRMA 4Z4EA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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