3ULEB

Structure of bos taurus arp2/3 complex with bound inhibitor ck-869 and atp
Total Genus 65
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
65
sequence length
351
structure length
236
Chain Sequence
CDNGTGFVLLTEPPMAIQAVLTLYAQGLLTGVVVDSGDGVTHICPVYEGFSLPHLTRRLDIAGRDITRYLIKLLLLRGYAFNHSADFETVRMIKEKLCYVGYNIEQEQKLALETTVLVESYTLPDGRIIKVGGERFEAPEALFQPHLINVEGVGVAELLFNTIQAADIDTRSEFYKHIVLSGGSTMYPGLPSRLERELKQLYLERVLKGDVEKLSKFKIRIEDPPRHMVFLGGAVL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structure of Bos taurus Arp2/3 complex with bound inhibitor CK-869 and ATP
rcsb
molecule keywords Actin-related protein 3
molecule tags Structural protein
total genus 65
structure length 236
sequence length 351
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-11-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3uleB01
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3uleB02
1JCGA 2FSKA 1E4GT 2E2PA 1DKGD 3VEOA 2J4RA 4M63C 2D4WA 3CQYA 4FOEA 1X3MA 2P9IA 3ULEB 2Q2RA 2P9NB 3U8XA 4I6MB 2ASMA 1XQSC 3WQTA 3R6MA 3DWLA 5KPZA 4FSVA 4H5WA 4BRKA 4BC3A 2YCHA 3R9PA 3MMVA 1TUYA 1BU6O 4FWLA 4FWNA 4F9OA 4QS8A 2E88A 5AQRA 5BREA 5I9EB 2YJFA 3L0QA 2CH5A 3A5NC 1KXPA 3IMXA 4QS7A 3ZX0A 3C7NA 3QDKA 4BRGA 1NLVA 3G25A 4J8FA 3S41A 2D0OA 2P9PB 5AQWA 2NLXA 3EN9A 4H0XB 5F0XA 3DXKA 3U9DA 4BRNA 1BDGA 1U2VB 3OHRA 3ZETA 3VOVA 4M7YA 3LM9A 3GG4A 5TKYA 2ZF5O 3VESA 3QBXA 3HM8A 2FF6A 2QWMA 3WQUA 4K25A 4PKHA 3BF3A 5BPNA 3QMLA 1BUPA 1SAZA 1XC3A 4BRPA 3O6WA 3WXJA 3CERA 2FSJA 4H5VA 5EX5A 1NGDA 1GLJO 2V52B 1RDWX 4A61A 4B1VA 3LM2A 4AM7A 1HUXA 1BO5O 2GELA 2E20A 3AAPA 4B1ZA 5KQ8A 3DXMA 1XUPO 3A5MC 5BPMA 1HJOA 2E2QA 4L3QA 4H03B 3LDLA 1IJJA 1Z05A 3TU5A 4IXCA 4PKGA 3VGLA 5FPNA 2D1KA 2W40A 2YI1A 4BRDA 1R59O 1QQNA 3WXIA 3UKRA 5AQQA 4K43A 3VF4A 3H1QA 3A5LC 3ZX3A 4BGBA 4BRFA 1BG3A 5AQIA 2NZTA 4BR0A 4FPBA 4ISGA 2V7ZA 4IWVA 2EWSA 2QM1A 2Q1NA 1CZAN 1X9JA 2PBDA 5F1XA 5AQPA 3WXKA 3WT0A 4BR7A 4RCHA 2A40A 1S3XA 3L4IA 4EIAA 5AQUA 1NGGA 1NM1A 2P9UA 1SQKA 3AY9A 3FE1A 4NB4A 3QB0A 2CH6A 4CBUA 5FPEA 1ATNA 1NGHA 3W0LA 1ESVA 3EL2A 3GDQA 4EHUA 3B8AX 2F9TA 4A2BA 3A5OC 4CBWA 3CIPA 3CJ9A 1C0FA 3RSEA 4XH4A 5BR9A 2A5XA 3D2EA 1ATSA 3F9MA 5AQXA 1SZ2A 3KVGA 4H5TA 4I6MA 4CZHA 4CZIA 1QZ5A 3A0IX 3KHYA 2IVOA 3J8AA 3HTVA 2IVNA 1ZXOA 3FFKB 3SMPA 4EAHD 3UKUA 4LC9B 5AZIA 3BF1A 1WOQA 3JS6A 1MWKA 3BEXA 4JD2B 1YXQA 1KAYA 1K8KB 3W3DA 3CHWA 1GLFO 2P9KB 5AQSA 2QWNA 4HTLA 4BRHA 2ZWHA 2P9LA 3HBTA 2YHXA 4NO7A 5LJWA 2ZGYA 3WEEB 4C23A 5EVZA 2QWQA 3ENHA 2NRHA 4H0PA 3HSCA 5BRFA 3O1BA 3CJ1A 1ATRA 3H46O 5KPTA 3HI0A 3AAQA 4PL8A 1NWKA 1YAGA 3VERA 1OKJA 2E1ZA 1U6ZA 3ATVA 4GNIA 2QWPA 2E2OA 3FZKA 3BP8A 4MLHA 3LDPA 3QFUA 4CZJA 4PKIA 1T6CA 1KAZA 5BRHA 5AQTA 5AFUA 5AQHA 1G99A 4A62A 3MN5A 3CJBA 3M3ZA 5AQGA 2GEMA 2CGLA 2P9SA 1C0GA 1JCEA 5FPDA 3MN9A 3JXUA 5FPMA 3ZEUA 4BC5A 2CGJA 3U4LA 3CJAA 4H5NA 3SJHA 5KQDA 4BRLA 5KPRA 3C7NB 4BRMA 5EXWA 2ITMA 5AQYA 1NGEA 1GLAG 4BQZA 2A3ZA 3ZX2A 1J6ZA 2BUPA 1DGKN 4BRCA 3O08A 1MDUB 3EO3A 1BOTO 4H5RA 4A2AA 2V7YA 2WUSA 1Q18A 2D0PA 1IG8A 5LY3A 3LDOA 2GWKA 2GTDA 5AFUH 3DXKB 3IUCA 3CJCA 1YUWA 1V4TA 3FZLA 4WYBA 3H6EA 3VGMA 2A6AA 4MO5A 3VF6A 5ELZA 4BR5A 4B1XB 4BRIA 1MWMA 2YHYA 4K41A 4JHDA 2UYTA 4FWOA 2I7NA 2Q97A 4KBOA 4JAXA 4YDUA 2VWBA 3ENOA 1NMDA 3QICA 2ASOA 1HX1A 1E4FT 2H3GX 2QXLA 3I33A 5AZJA 3D2FB 2AP1A 5E26A 1HLUA 1BA0A 5EY4A 2FLOA 1TYQA 4B1UB 4AM6A 3M6GA 4IO8A 2FXUA 4O8KA 1GLBG 4Y0WA 1QQMA 4BC2A 1T44A 3DXMB 5BN8A 5AQJA 3EKUA 1MA9B 2OANA 1QHAA 4CJ7A 4B9QA 3ULEA 4JD2A 4WQ4C 3WXLA 1HPMA 2P9NA 4CZGA 4CBXA 1NGCA 3UKRB 2Q31A 4Z94A 5B8HA 4RWTA 3MDQA 1NGBA 1T6DA 3WUHA 5ADXH 4CZFA 3P4IA 4BVOA 1H1VA 1KAXA 2E8AA 4IZ9A 4WQ4A 1X3NA 4CI6A 4H0YB 3FZHA 4M7XA 4DQ8A 1QQOA 5AQOA 5LJVA 2E1YA 2YHWA 2GUPA 2P9PA 3HZ6A 3R8EA 4B1WB 4DHYA 2IIRA 3L6QA 4FOIA 1LCUA 3UB5A 3FR0A 2P9UB 4XH5A 4RTFD 1BWFO 2YJEA 5JLHA 1GLEG 3VEXA 5BPLA 1U2VA 3FLCO 2KHOA 3FGUA 1NGJA 3RSEB 3D7EO 2PAVA 4FWQA 1S22A 3CJ7A 3D2EB 1NGIA 4CZEA 4BC4A 2A42A 3ATUA 3VEWA 4BQLA 3QBWA 3QFPA 5AQZA 1GLCG 4H0OA 4BG9A 4O5FA 4BR2A 3FZMA 5E84A 3UKUB 3SMSA 1BA1A 3GE1A 5AZIB 3VENA 4BVPA 5JLFA 1D4XA 3LL3A 4EHTA 1YVNA 2P9IB 3VGKA 4IJNA 1HKBA 2F9WA 2DPNA 2BTFA 4BR4A 3H45C 3O5BA 4E1JA 3DAWA 5CE3A 1Y64A 2P9LB 4BRAA 1NGAA 4XEIA 3KZBA 3VPZA 2HF4A 4HWIA 3EZWA 2AA4A 3O4WA 4FWRA 3VETA 1NGFA 3FZFA 2QWOA 3MK6A 3O1WA 3VEVA 5AR0A 1GLLO 1HKGA 1JCFA 1TUUA 5EOYA 3M1FA 5AQLA 4CZMA 5AQNA 1LOTB 3GOIA 4CZKA 4YDUC 3EKSA 4FWKA 3D2FA 5AQFA 3ZETB 4BG8A 1EQYA 3H3OB 4JNEA 3VF2A 4QS9A 4GY2B 3A8YA 2ZGZA 2V51B 3ID8A 2VCPA 2P9SB 2QWLA 3MN7A 3VEYA 3UE5A 1ZC6A 3DJCA 2HMPA 2QW9A 4PL7A 5AQVA 5ADXA 2VYPA 3O80A 3ZEUB 4CD1A 4BGAA 4BR9A 3VEZA 3MCPA 2ASPA 5F2RA 4DCHA 4FO0A 4FWSA 5BRDA 2QWRA 2W41A 1NBWA 3LDNA 1GLDG 5JICA 4ISFA 3IFRA 4K42A 3H3NO 4WQ5C 4XH1A 1RFQA 1DEJA 2E2NA 2GWJA 1Z6RA 3I8BA 3BUZB 3LDQA 4B1YB 3IDHA 5AQKA 1QZ6A 3TPQA 4BRQA 4WQ5A 2HOEA 1K8KA 1RGIA 1P8ZA 2FSNA 3H1VX 2P9KA 4CD3A 4CZLA 1HKCA 2A41A 2Q36A 3CI5A 4FWMA 4ISEA 5JMVA 4MLEA 2IVPA 4JHDB 3O8MA 4DB3A 3SK3A 5BN9A 4FL9A 2CGKA 3CQXA 4JN4A 3MN6A 1V4SA 3GBTA 3WEEA 3GL1A 3CETA 4FPAA 5AZJB 4FWPA 4H0TB 3SLCA 4H0VB 2I7PA 4MO4A 1TYQB 2FF3B 3AARA 3C0BA 2Q0RA 4IJAA 5AQMA 4EFHA 2Q0UA 1ZBSA 2HF3A 1WUAA 4BROA 3U9ZA 4BREA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3ZSVA 3CCJN 3KK1A 1RBVA 3OW2M 1DKGD 3N4QA 3V6DA 2NNWA 2P9IA 3ULEB 1WSHA 2B5JA 3EE9A 2RN2A 3WQTA 3R6MA 2YHAA 1Q81O 1TKZA 3CCSN 3MMVA 1U48A 1BU6O 3CPWM 3TSPA 4IEEA 2ETJA 5I9EB 3Q7BA 1KVAA 3A5NC 3IMXA 4LY7A 3OS2A 3ZX0A 1YITN 3H08A 4BRGA 4WE1A 4CGDA 3OYHA 2P9PB 1SL0A 1KCFA 2NLXA 3VTHA 4E72A 3SQ4A 1W9HA 4GV6A 1DTTA 3VQQA 4RG8A 2W00A 4O0JA 3GG4A 4FZZA 1IKVA 2ZF5O 2F4VK 1RDCA 3J80O 2O8DB 3KWGA 1JLGA 5HL7L 3VQ5A 3AGRA 4PKHA 3BF3A 4DV1K 3ISNC 4JLHA 3QIPA 4C8NA 3QMLA 1SAZA 1XC3A 3CM5A 1O13A 1KQSM 2FSJA 4X62K 1NGDA 3NBPA 4M3UA 1KVBA 2UXCK 1FK9A 4A61A 1BI4B 1GOAA 2DY4A 3P31A 1BO5O 3SNNA 4B1ZA 3PIOL 3DOKA 3ZSWA 1NOZA 3O9RA 1A5VA 2W6LA 4BDYA 3QLHA 2YI1A 4LFAK 4GVEA 4F2SA 1TL3A 1QQNA 2A1SA 5AQQA 3NHGA 4BRFA 4BGBA 1BG3A 2O8CB 2X74A 5MLCQ 5C2DA 2EWSA 2QM1A 1NK7A 5F1XA 3HPGA 3HP9A 3WXKA 1ASVA 4YOTA 3NVKA 4DSEA 4RCHA 1IG9A 3C6TA 3S9HA 2RF2A 2OTJN 1BL3A 5AQUA 1NGGA 2P9UA 3RMAA 4KHWA 3DI6A 3FE1A 5FPEA 2CH6A 3E66A 1R0AA 1ATNA 1ESVA 1VSJA 2DFHA 3QNOA 3QESA 4NXNK 5M1OA 3CIPA 4CJLA 5HRRA 2A5XA 1ATSA 3F9MA 5AQXA 4B3MK 3KVGA 4CK1A 1VQKN 1K73O 5CYMA 3J8AA 4F8RA 1ZXOA 3FFKB 4IKFA 1CXUA 3OYIA 1HQEA 3LWLA 4AHUA 1TK0A 1BHLA 4DTPA 1MWKA 3R1XA 4E7KA 4LFBK 3W3DA 4FYDA 5AQSA 3M8PA 2ZWHA 2P9LA 3HBTA 3KJVA 4YOXA 3HSTB 3E9LA 5AJ3K 1KLMA 2ZGYA 3WEEB 2QEXN 2PYLA 4PHTX 2QWQA 4U7BA 4H0PA 3LP0A 4CHQA 3HSCA 2RPIA 3O1BA 1HNVA 1E3MA 1S9EA 1NWKA 1OKJA 2O4IA 2E2OA 3FZKA 4MLHA 2YX6A 4DTOA 4JKHA 4DV2K 4FW1A 4DSFA 1KAZA 4M3RA 5AQHA 1NKBA 4WFBL 4EZ6A 1KVCA 3SPZA 4M3WA 1BI4A 4AH9A 3M3ZA 4G9ZA 3CFRA 4OPJA 4KREA 4FJMA 1NJYA 4A59A 4I9LA 3PX6A 1RCHA 4MDAA 1IKXA 1TGOA 4BC5A 3B6PA 3U4LA 1DLOA 3CJAA 4H5NA 4LF5K 3AVKA 1C1AA 1ZBFA 4BRLA 4FJLA 3B6OA 5J2NA 3CFPA 2HNDA 4G1QA 4JI8K 3C7NB 2W6KA 1HJRA 4BRMA 1XC9A 2A3ZA 4CK2A 3J7AP 1DGKN 3EO3A 4H5RA 4A2AA 2D0PA 1YUWA 2FBYA 3FZLA 5DM6L 4DU4A 3SUOA 1KFSA 2VG5A 4OKEA 1QE1A 3VF6A 4BR5A 4CHNA 3L2VA 2YHYA 3JAMO 2I7NA 1N34K 4DV0K 3ENBA 4JAXA 3C94A 4KBOA 3L2UA 3ENOA 3ALYA 5CYQA 2QXLA 1WSGA 5AZJA 5C0YA 1REVA 3TTDA 2O8EA 3DLBA 3TR8A 5EY4A 2FLOA 4AM6A 3CCLN 3ULDA 3LAMA 4JI5K 4IO8A 4O8KA 4DSJA 1T44A 3EKUA 3SAFA 1RDDA 2OANA 4CIFA 1KSPA 5GINA 1WSIA 4WQ4C 1GOCA 3CFOA 3ITHA 2G8KA 3OY9A 3UKRB 4IOAL 3MDQA 3WUHA 4EZ9A 1C1CA 1VRTA 4BVOA 2D0AA 4FVMA 1NK5A 4KHYA 1VQPN 4WQ4A 2E6LA 2HNYA 4Z4EA 3FZHA 1EETA 4DQ8A 4JI4K 3MEGA 4DR3K 4NCAA 4YFUA 1BIUA 3VQEA 3VQ7A 4OPKA 3L6QA 2HHTA 4RTFD 4ZTJA 1BWFO 1FKPA 1GLEG 3VEXA 4F3TA 4CGJA 2Z1JA 4IEIA 4PA1A 1NJWA 5FROA 3RSEB 3D7EO 4DS4A 3TTFA 2UUCK 3MX5A 2A42A 3ATUA 4J2EA 1SUQA 3BGRA 5HROA 3LWMA 3QFPA 1J53A 4O5FA 2F8TA 3UKUB 3V9ZA 3GE1A 4CEEA 4KTZA 5AZIB 2ZM6K 2F96A 3LL3A 4B9NA 1IKWA 1WLJA 1YJWN 1LAWA 1HKBA 3EEQA 2UXDK 4C8MA 1MU2A 3DAWA 3NGYA 4BWMA 4KTQA 2PYJA 2FBVA 4ZHRA 3VPZA 2HF4A 4HWIA 3EZWA 2Q3SA 2AA4A 4O5BA 1NGFA 1L3VA 3MWTA 3VEVA 4X66K 3K5MA 5AR0A 4JKGA 4UY8O 1NJXA 4V19S 5AQLA 3QNNA 3M1FA 4DR1K 2VG7A 4E89A 4DR5K 5AQNA 1LV5A 3GOIA 3AVNA 4BG8A 3EKSA 3ZETB 2NRRA 4RW7A 3H3OB 4JS5A 1NJIO 3VF2A 4W5OA 1XWLA 3A8YA 1RBUA 2V51B 3ID8A 2VCPA 2P9SB 1OH7A 3EE8A 4B9MA 5LL6Z 3UE5A 4OKJA 2VYPA 3ZEUB 4W5QA 3E9OA 2ASPA 2JLEA 2A1RA 3JYTA 5JICA 1SKWA 4JK7A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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