3WEEA

Structure of the full-length yeast arp7-arp9 heterodimer
Total Genus 111
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
111
sequence length
462
structure length
425
Chain Sequence
QDSILIIYPRSQTTLVQFGLNEETFTVPELEIPTQIYRTTRQDGSYTYHSTNKDNKAELIKPIQNGEIIDISAFTQFLRLIFVSILSDRSNIPLLLITHHSWSQSDLEIITQYVFESLEINNLIQLPASLAATYSMISLQNCIIDVGTHHTDIIPIVDYAQLDHLVSSIPMGGQSINDSLKKLLPQWDDDQIESLKKSPIFEVLSDDAKKLSSFDFGDEGTLNVAEIITSGRNVKNSDLEFNTFWDEKGNEIKVGKQRFQGNNLIKNISNRVGLTLDNIDDINKAKAVWENIIIVGGTTSISGFKEALLGQLLKDHLIIEPEEEKSKREEEAKSVLPAATKKKSKFMTNSTAFVPTIEYVQPTVIKLAKYPDYFPEWKKSGYSEIIFLGAQIVSKQIFTHPKDTFYITREKYNMKGPAALWDVQF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structure of the full-length yeast Arp7-Arp9 heterodimer
doi rcsb
molecule keywords Actin-like protein ARP9
molecule tags Transcription regulator
source organism Saccharomyces cerevisiae
total genus 111
structure length 425
sequence length 462
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-07-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3weeA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3weeA01
3.90.640.60 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3weeA03
1YAGA 5JMVA 2W40A 4B1WB 3QDKA 2F9WA 2F9TA 4JD2B 1RFQA 2OANA 2QWQA 4BGBA 4H0YB 4EFHA 4FO0A 2E1ZA 3D2EB 1G99A 3DXMB 3H1QA 4KBOA 3SJHA 4IJAA 1NBWA 2P9NB 4MO4A 4BGAA 1QQNA 4XH5A 3VF2A 5AFUA 3CJBA 2FSKA 5EXWA 3VEYA 4BG9A 1OKJA 4WQ4C 1NGIA 4B1YB 3U9ZA 4WQ4A 2FSNA 4BVOA 2YHWA 1NGJA 3DJCA 1GLFO 4QS8A 5BPLA 4BC4A 5TKYA 5CE3A 2Q36A 4HTLA 4BQZA 4M63C 1WOQA 3KHYA 5LJVA 1BU6O 3ATUA 3H3OB 2IIRA 3H3NO 1V4TA 2FXUA 4Z94A 4CZIA 1QQMA 2P9IB 2P9UA 4FWSA 1LCUA 3CJCA 4GNIA 4DCHA 2GELA 4IZ9A 3I33A 3LDOA 3VGKA 2AP1A 4BRAA 1S22A 2YHYA 1DEJA 3MN9A 2A40A 5ELZA 4F9OA 2FLOA 1D4XA 2EWSA 2ZGZA 2ZF5O 4NO7A 3ZX2A 2GWJA 4FSVA 5AQTA 5AQFA 5BN8A 3M6GA 2P9NA 4BQLA 3J8AA 2P9PB 1IG8A 3MDQA 4C23A 1NM1A 3GDQA 2PAVA 5AQLA 4BRHA 2Q1NA 3LDNA 1C0GA 4CBWA 1ZC6A 5ADXA 1J6ZA 1KAXA 2CGLA 5FPEA 4ISEA 5AQWA 2ASPA 5BRDA 3MK6A 4ISFA 4IWVA 1LOTB 4BG8A 3A5OC 3U4LA 3B8AX 5AQIA 4K43A 3C0BA 2UYTA 2P9IA 3D2FB 1ATSA 1SAZA 3QFUA 4M7YA 3QMLA 4J8FA 3A8YA 3RSEA 2IVNA 4FWPA 3CJ7A 5BPMA 3GBTA 1DKGD 1BA0A 4H0OA 4A62A 4CZFA 4B9QA 3ZX3A 3VEXA 4H0VB 4H5WA 4BR5A 3LDLA 3ZEUA 1RGIA 2A42A 3UKRA 3A5LC 1BOTO 3GE1A 4FOEA 4BRGA 5BR9A 3HZ6A 4IJNA 4ISGA 3EKSA 2BTFA 5JLFA 4CBUA 2V52B 1MWKA 3WXJA 4XH4A 4B1VA 5BPNA 1BUPA 3P4IA 1BWFO 3SLCA 4K25A 3VEVA 1U2VA 2P9PA 2Q0RA 5FPNA 3M3ZA 3WEEB 3CIPA 1X9JA 2GUPA 4DQ8A 1HUXA 3R9PA 4I6MA 5AQQA 2E8AA 2J4RA 2FSJA 1CZAN 3DXKB 3ID8A 3LDPA 2NZTA 4BRMA 3GOIA 4BRIA 4FWNA 3W0LA 5AQNA 4BRLA 4FWRA 4K41A 3IFRA 1BDGA 5AQHA 3FFKB 4FWKA 4BROA 4BR7A 5F1XA 1HLUA 2GTDA 3CQYA 2IVOA 5BRHA 1GLDG 2CGKA 2P9KB 3A0IX 4CZKA 3FZFA 3VEZA 1GLEG 2E2PA 1NGBA 3GG4A 3O8MA 5AQSA 1K8KA 1BA1A 3HM8A 4FPBA 4O5FA 3O5BA 3G25A 1ESVA 4PL7A 1SQKA 1ZBSA 3D7EO 3FZLA 3L4IA 3L6QA 1GLBG 2GWKA 2VWBA 3S41A 3W3DA 1YUWA 5BREA 3UKUB 4PKGA 3WEEA 4BRFA 2ZWHA 3ZETA 1QHAA 1T6DA 4H5NA 1T6CA 1HKGA 3ENOA 3FLCO 4FWOA 1RDWX 3CJ9A 5EVZA 5EY4A 4BC5A 2IVPA 3MN6A 4JD2A 3VENA 3WXKA 3O1WA 5LJWA 5F2RA 4A2AA 2VYPA 3D2EA 3DXMA 4B1XB 1GLAG 1BO5O 4BRKA 5JICA 4BRPA 3IUCA 4FWMA 1ZXOA 3FZHA 3BEXA 1U6ZA 5AR0A 3OHRA 3U9DA 3H46O 2A3ZA 4JAXA 3WXIA 1GLJO 4BRQA 1V4SA 1TYQB 1XUPO 3QBXA 1KAYA 5E84A 2H3GX 2HF3A 4H5RA 2P9LB 3WXLA 5LY3A 4JNEA 4BREA 3VERA 1MA9B 4LC9B 5F0XA 5AZIB 3UKUA 3CQXA 3F9MA 4BRNA 4BVPA 4CBXA 4YDUC 3DAWA 2E2NA 2GEMA 5AQZA 4FPAA 4PKHA 1QZ5A 3H45C 3IMXA 1NGDA 3I8BA 3QFPA 1BG3A 1EQYA 1GLCG 2HMPA 3QICA 2YCHA 3BUZB 4CD3A 2YHXA 2V7ZA 4CZEA 1H1VA 2ASOA 4CZGA 2D4WA 5B8HA 5KPZA 3VF6A 3FR0A 3MCPA 3QBWA 3CHWA 5AZJB 4M7XA 1C0FA 3SMSA 2DPNA 4BR0A 3MN7A 1T44A 4H0TB 2A5XA 3ATVA 1TUYA 4BC3A 3EL2A 2QW9A 3TU5A 3AAPA 4CJ7A 4EHUA 4EAHD 1MWMA 2E2QA 3VOVA 1R59O 5EX5A 3C7NB 1NGFA 1NWKA 3FZKA 1DGKN 4RCHA 2AA4A 3CI5A 4H0XB 2YJEA 1X3NA 2WUSA 2QWLA 3JS6A 4IO8A 1SZ2A 2CH6A 2Q97A 1HJOA 1QQOA 4XH1A 5AQGA 3VETA 4DHYA 2ITMA 4MLEA 3EKUA 3IDHA 4XEIA 3JXUA 5AZIA 4MLHA 5KQDA 3SK3A 3VF4A 4WQ5C 3O4WA 4BC2A 4RWTA 4WQ5A 3D2FA 2YJFA 1ATNA 3VGLA 2E2OA 3H6EA 4E1JA 2FF6A 4B1ZA 2V51B 5KPTA 3WQTA 4B1UB 3QB0A 5AQKA 5BN9A 3M1FA 1Z05A 2KHOA 2E20A 1KXPA 3UE5A 3HSCA 2QM1A 2P9SB 4AM6A 5AZJA 2W41A 4WYBA 3CERA 4AM7A 2E1YA 1HKCA 3ULEB 4H5VA 2FF3B 3AAQA 1NGAA 4BRCA 2NLXA 4JHDB 3O1BA 2D0PA 3WT0A 3DWLA 3MMVA 4QS7A 4IXCA 3TPQA 2D1KA 3LL3A 3C7NA 3FE1A 5AQOA 2A6AA 4CZMA 4RTFD 5FPMA 4K42A 2D0OA 4A2BA 1Z6RA 1ATRA 2V7YA 3KZBA 3AARA 3CJ1A 4Y0WA 2Q31A 2VCPA 4DB3A 3VESA 4L3QA 3ZX0A 3DXKA 1NGGA 1HX1A 3HBTA 2I7NA 3CJAA 2PBDA 3O6WA 3HTVA 5I9EB 2E88A 5AFUH 1QZ6A 4BR9A 3U8XA 1KAZA 1WUAA 4PL8A 1MDUB 1XQSC 1XC3A 3ENHA 2Q0UA 3LM9A 3RSEB 1JCFA 3O08A 4EHTA 3VEOA 4EIAA 2P9KA 1NGCA 2CH5A 3AY9A 2ASMA 4MO5A 3BF3A 5AQJA 4BRDA 5E26A 1E4FT 3SMPA 2P9SA 4CI6A 3HI0A 1NMDA 3ZEUB 4H5TA 1YVNA 4CZJA 3UKRB 1NLVA 1P8ZA 1IJJA 4FWQA 3ULEA 3LM2A 3FZMA 2QXLA 1HPMA 1GLLO 3VPZA 3KVGA 4JHDA 5AQXA 3CETA 1U2VB 3H1VX 1NGHA 3EZWA 1TUUA 2I7PA 4YDUA 4GY2B 5AQUA 2HOEA 5KQ8A 2CGJA 4I6MB 4H0PA 2A41A 3A5NC 1JCGA 4FOIA 4NB4A 4BR4A 5JLHA 3LDQA 3R6MA 5AQRA 3WQUA 2ZGYA 4CZLA 3GL1A 3EN9A 2NRHA 5AQMA 3VEWA 2QWNA 3BF1A 3A5MC 4H03B 1Y64A 4BR2A 1S3XA 2YI1A 5ADXH 3FGUA 1X3MA 3WUHA 3BP8A 5EOYA 1TYQA 1NGEA 4FL9A 2QWMA 3R8EA 1YXQA 2P9LA 2Q2RA 1K8KB 3MN5A 4FWLA 3UB5A 5FPDA 2QWPA 4O8KA 5AQYA 3L0QA 4QS9A 2HF4A 1E4GT 5BRFA 5AQVA 2QWRA 1HKBA 4JN4A 3ZETB 1Q18A 2P9UB 4A61A 5KPRA 2BUPA 2QWOA 3EO3A 4HWIA 4CD1A 3O80A 4PKIA 4CZHA 3VGMA 5AQPA 1JCEA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4FVUA 2WC9A 2QWQA 1UOCA 2Z1JA 4FW1A 4FO0A 3THXB 3D2EB 3H1QA 4CGIA 4DU1A 5GIOA 1NMNA 4BGAA 3SUNA 1Z25A 4BDYA 3CJBA 3TABA 4DTMA 1KVCA 5EXWA 2NNWA 1HMVA 4IFYA 1OKJA 3O3FA 3L3VA 4CESA 4CGJA 4BE1A 1W97L 5DMRA 3ID6A 3VN5A 1GLFO 3NH1A 4YOUA 3OJSA 1NNEA 3E9OA 5TKYA 2Q36A 4HTLA 4WFNL 5FRMA 4IEEA 3H3OB 2IIRA 2FXUA 3OS1A 4Z94A 1QQMA 4F8RA 1RBSA 2GBZA 2G8UA 2VWKA 1HQEA 3V9UA 4N41A 4OPJA 2GELA 3ZSRA 3AA2A 1BQNA 3NAEA 2AP1A 4DSJA 4JKFA 1VQON 3O9UA 3OA9A 4DLGA 1KCFA 3KD1E 5ELZA 1B9FA 4AHVA 2FLOA 4W5NA 3OYMA 4FJ7A 1J9AA 1VQ4N 4OGCA 4RW9A 4FZXC 5BN8A 3M6GA 4JI2K 5I42A 3DRRA 1IG8A 3L2RA 4C23A 1S1TA 2OPRA 3BZCA 2Q1NA 4CBWA 3OYCA 1ZC6A 3MAQA 3OYFA 5D3GA 5EU7A 3NDKA 3MK6A 3NF8A 4CJQA 1LOTB 3PX6A 4BG8A 4IO9L 4DSLA 4IEIA 2EX3A 2GX9A 4JKHA 1VSDA 5AQIA 1NJXA 2UYTA 4FZYA 4J2EA 1ITGA 1U47A 1SAZA 4BECA 3CCVN 1I94K 3T69A 4E19A 3RSEA 3S3OA 3TTDA 1BA0A 1EETA 4A62A 3SYZA 1BI4A 3L2VA 4IOXA 3ZX3A 4BR5A 5KRSA 3A5LC 4NYNA 4BRGA 4ISGA 1DLOA 4C8KA 2ITGA 4CGHA 3DLKA 4XH4A 1EWRA 4OLBA 5BPNA 1BUPA 4CE9A 3SLCA 4DQIA 3T7ZA 1RDAA 1VSEA 1IO2A 2Q0RA 4M3TA 4QOZB 4OJRA 4EZ6A 3IRXA 1HUXA 3HPGA 3R9PA 3LWMA 3VQPA 3NE6A 3K59A 5AQQA 4FLXA 3NGYA 3C6AA 1CZAN 3DLGA 3ID8A 4E1MA 3PX4A 3UIQA 3GOIA 4BRIA 2Z1GA 3E9PA 2HHXA 3CYMA 1NK4A 3IFRA 3QERA 4EP4A 3NVMA 4JYAK 3NF6A 2QXFA 1SKWA 3KIOA 5FLXO 2IVOA 4AF1A 3L2UA 5BRHA 4IOCL 4C8LA 3DLEA 4BACA 2ZJQL 3OBWA 3FZFA 2E2PA 4F2SA 4CGFA 2YKMA 1NGBA 5FDLA 5AQSA 1BA1A 4FPBA 3RMDA 1YITN 1T03A 2XY8A 3G25A 1ESVA 3V81A 3D7EO 1ZBSA 4HUEA 4DQRA 4DS5A 3U3GA 4WCEL 1HPZA 3DRPA 4YOYA 4BRFA 2P5GA 2ZJRL 1Q82O 3ZETA 4H5NA 1EKEA 1T6CA 3ENOA 3PO5A 4FWOA 5CZ1A 3P5JA 4OX9K 4I2QA 4BC5A 2IOCA 4KI4A 3CM5A 4JD2A 3O1WA 4CGGA 3NHGA 1NK8A 1N6QA 1QS4A 5LJWA 3LP3A 1BO5O 2JWKA 2XHBA 3SJJA 3S3MA 5HRRA 4BRPA 4FWMA 3PX0A 3VQ7A 1MU2A 3BEXA 3OYDA 1RNHA 4CEQA 3QEPA 1N5YA 2QTDA 4BRQA 4CEBA 1V4SA 1TYQB 3QBXA 1J53A 2H3GX 2HF3A 4DSEA 4LFCK 2P9LB 4CJVA 4CJWA 1U04A 3T1HK 1MA9B 4LC9B 3RMBA 4OKKA 1WSHA 1P90A 1YJNN 2RHKA 3PO4A 1WAFA 4YDUC 4X64K 4IKFA 1N36K 1LAVA 4FPAA 4JLHA 3EE8A 3H45C 3RR7A 3IKMA 2NRWA 3CCJN 1VQLN 2W00A 3KWGA 1VQNN 2YHXA 2V7ZA 3OYAA 5HOOA 3WNFA 3QBWA 3IAYA 3SBGA 1C0FA 2HHHK 1IV0A 3ZSZA 4BR0A 1T44A 4DTPA 4H0TB 1VSHA 3HM9A 3TR8A 3AGKA 2UXBK 3SUPA 2P51A 3EL2A 2YNFA 3F5TA 3TU5A 5IT9O 2BGGA 2YNIA 4KHSA 1O13A 1MWMA 3VOVA 4B9LA 3VQ5A 4X66K 4Q5VA 1QVFM 1DGKN 4DV1K 4RCHA 3CI5A 4H0XB 2ZQBA 1W9HA 3JS6A 4CHZA 1NK9A 4DUYK 4MLEA 3IDHA 1HNVA 5AZIA 3DOKA 4WQ5C 3O4WA 3CFRA 2RN2A 3HYFA 4DFMA 4JV5K 4WQ5A 1S1WA 1ZYQA 3D2FA 2KFNA 4LD0A 1A5VA 1HJRA 3AA4A 2HVHA 1LW2A 4O5BA 2V51B 3RMAA 4DS4A 1N32K 2DFEA 3DMJA 3M1FA 3V6DA 3UE5A 1KXPA 3PV8A 3HSCA 3ISNC 4I9QA 3HO1A 2P9SB 5AZJA 3O9TA 3RVCA 2KZMA 1HKCA 4FVMA 3ULEB 4H5VA 3ALYA 3TSUA 3OYNA 3K9KA 1NGAA 4JKGB 3NVKA 2D0PA 4TSXA 3TPQA 3FE1A 4B9SA 1NJWA 2A6AA 4RTFD 5FPMA 4K42A 3KZBA 3J7ZO 2Q31A 3NFAA 1IKWA 4DV4K 2ZD1A 1XHXA 3SAHA 3AVBA 1Q86O 5AFUH 1QZ6A 2KTQA 1WUAA 4DTRA 1XQSC 3LM9A 3KK1A 2E4LA 3RSEB 1OH7A 4DTOA 4EIAA 2QKBA 2ASMA 4KAZA 4HCBA 5E26A 1TL3A 1A5XA 4CF1A 4DR2K 4CI6A 1CXUA 1P8ZA 4FWQA 1YI2N 3FZMA 4M45A 1GLLO 4DFJA 1FW6A 4E3SA 4CHNA 1X9WA 3H08A 2YV0X 3VQDA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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