3WEEB

Structure of the full-length yeast arp7-arp9 heterodimer
Total Genus 113
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
113
sequence length
465
structure length
409
Chain Sequence
NRKVVIHNGSHRTVAGFSNVELPQIIPSSYIKRTDEGGEAEFIFGTYNMIDAAAEKRNGDEVYTLVDSQGLPYNWDALEMQWRYLYDTQLKVSPEELPLVITMPATNGKPDMAILERYYELAFDKLNVPVFQIVIEPLAIALSMGKSSAFVIDIGASGCNVTPIIDGIVVKNAVVRSKFGGDFLDFQVHERLAPLIKEKRSTDVWYEASTWIQQFKSTMLQVSEKDLFELERYYKEQADIYAKQQTGSPNNPLVQKKNFLFKPLNKTLTLDLKEYQFAEYLFKPQLISDKFSPEDGLGPLMAKSVKKAGASINSMKANTSSPEQVYSLLLTNVIITGSTSLIEGMEQRIIKELSIRFPQYKLTTFANQVMMDRKIQGWLGALTMANLPSWSLGKWYSKEDYETLKRDRK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structure of the full-length yeast Arp7-Arp9 heterodimer
doi rcsb
molecule keywords Actin-like protein ARP9
molecule tags Transcription regulator
source organism Saccharomyces cerevisiae
total genus 113
structure length 409
sequence length 465
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-07-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3weeB01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3weeB02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3weeB03
3VEYA 4JD2B 1NGAA 3EL2A 4K25A 4CBWA 3WXJA 3LM2A 5AZIA 2YCHA 2AP1A 2P9SB 4K41A 3HTVA 3H3OB 4HWIA 3A0IX 3QB0A 2A5XA 2CGLA 4A2AA 1BO5O 4LC9B 2PBDA 4H5RA 4FWLA 4MLEA 2Q0RA 3A5NC 3VEWA 5KPRA 4XH1A 3MN6A 2I7NA 2W41A 4PL8A 4BR7A 2FSNA 5AQSA 4CZMA 4JD2A 2QWOA 1Y64A 3CJ1A 2VYPA 4FOEA 4E1JA 3DAWA 5BR9A 3ZX3A 2P9SA 3DXMB 3FR0A 1SAZA 3J8AA 1E4GT 3LDQA 4BG8A 4BRGA 2A40A 3UKUB 5BRDA 4EFHA 1HPMA 1MA9B 3M6GA 4BR4A 1NGCA 1HJOA 4Z94A 3U9ZA 3I33A 5JLFA 2AA4A 1X9JA 3HBTA 1ATRA 4PKHA 3ATVA 3GL1A 2HMPA 3VENA 2EWSA 4I6MA 3BF1A 1KAYA 1Z05A 2Q97A 4K42A 4A61A 3CQYA 2ZWHA 4JAXA 2E2QA 5JLHA 3OHRA 1HKGA 2CH6A 3UKUA 4AM6A 2CH5A 3QFPA 4A62A 3FZKA 4B1ZA 4B1WB 1KAZA 4FWNA 2GEMA 3CJCA 4EHUA 4PKIA 2E20A 1G99A 4H0OA 4FL9A 3FE1A 2QWMA 1OKJA 1ATSA 4BVPA 4J8FA 3ZX2A 3A5MC 1NGJA 1H1VA 2YHYA 4FPAA 4QS9A 2GWJA 3TU5A 1NGFA 1T6DA 3H45C 4CZKA 2NRHA 3JXUA 2Q0UA 3HI0A 3AAPA 3DWLA 3CHWA 4BROA 2UYTA 4BRCA 1QQMA 3W0LA 3UKRB 2FXUA 4L3QA 4F9OA 5AQFA 3VEZA 5BPMA 4B1UB 3CERA 1WUAA 3SLCA 3G25A 3D7EO 1BUPA 3L0QA 3VF2A 4BRNA 4BRDA 1KXPA 1BOTO 1V4TA 3C0BA 4IZ9A 1WOQA 4H0PA 4JHDB 3L6QA 4FWQA 3UKRA 2A41A 4H0XB 1S3XA 4BC4A 3AARA 1K8KB 2QXLA 1SQKA 4BRLA 3R9PA 3WQTA 2VWBA 4CZHA 5ADXH 2ZF5O 2FF6A 1NGGA 1YVNA 2ASMA 3GBTA 3KVGA 5AQIA 1X3NA 3MMVA 2Q31A 4BRPA 2WUSA 3MK6A 4CD1A 1JCFA 4MLHA 3A8YA 3O8MA 1D4XA 5AQHA 3EKUA 4JHDA 4DHYA 3H1QA 2A42A 3R8EA 5AQGA 3SK3A 1NBWA 1GLFO 3CETA 3SMPA 3CI5A 1K8KA 3VERA 4GNIA 3ULEB 3HZ6A 1GLAG 4CZIA 4EIAA 1YXQA 5AQQA 5FPNA 1QZ6A 2GUPA 2BUPA 3AY9A 3H6EA 3KHYA 1BDGA 5AQLA 1HKCA 4RCHA 4Y0WA 5EXWA 5AQUA 2OANA 4CJ7A 3QDKA 4H5WA 1S22A 3GE1A 4QS7A 2BTFA 2QWPA 4WQ5A 3BEXA 3ATUA 2QWLA 5FPMA 5EX5A 3QMLA 2P9UA 4O5FA 2I7PA 3ULEA 2H3GX 4FWMA 4XH4A 5AQZA 4XEIA 3GG4A 3GOIA 3LDNA 5EVZA 3SMSA 4WQ5C 2YI1A 3HSCA 3IUCA 4FWKA 4I6MB 5AQKA 4BRHA 2FSKA 3MN7A 3EO3A 4IXCA 2YJFA 1XUPO 4CZGA 3WEEA 2IIRA 4JNEA 5AR0A 4IO8A 3M1FA 5BPLA 4FWRA 4MO5A 4H03B 3CJ7A 4CBUA 1U2VB 5AQPA 1U6ZA 2E1ZA 2Q2RA 2NLXA 5I9EB 2GELA 4BGAA 4XH5A 1HUXA 1YUWA 1QQNA 1NWKA 4FO0A 4BR0A 2IVNA 3BP8A 4FWPA 2E2NA 2P9NB 3W3DA 1SZ2A 4NB4A 5BREA 3ZEUB 4BG9A 5KQDA 3C7NB 5E84A 5E26A 1E4FT 3F9MA 3EKSA 1U2VA 5LJWA 1GLBG 4BRMA 1P8ZA 2A3ZA 3WXKA 2D0OA 1GLLO 1X3MA 1MWKA 2ITMA 1BWFO 2HF4A 3UE5A 3VGLA 3CJ9A 4BR2A 5F2RA 2HF3A 2P9NA 3QBWA 1GLEG 3BF3A 3ZEUA 4B9QA 5CE3A 3C7NA 3FZMA 2DPNA 2QW9A 5TKYA 3ID8A 5EY4A 4JN4A 1NGEA 5AQJA 5B8HA 3FFKB 4O8KA 4FOIA 3CJAA 3FZFA 4BVOA 3H46O 1C0GA 2ASPA 3ENHA 4M63C 2YHXA 4M7YA 3EN9A 5FPEA 2P9IA 3CJBA 1LCUA 2HOEA 3A5LC 3LDPA 1JCEA 4CI6A 5ELZA 3O08A 1MWMA 4CZJA 3QFUA 3MN9A 4BRFA 3QICA 1HX1A 2F9TA 4YDUA 2ZGZA 3S41A 2KHOA 2NZTA 2VCPA 3VETA 1QQOA 1EQYA 1JCGA 1Q18A 2F9WA 3VOVA 2D0PA 3VGMA 2J4RA 3FZHA 3U8XA 3RSEA 4BC3A 4CZEA 3U9DA 3VESA 3ENOA 5EOYA 4GY2B 5BN9A 3DJCA 3LL3A 4AM7A 1HLUA 5AQVA 4QS8A 3VEXA 4RTFD 3QBXA 4BQLA 2P9UB 1BU6O 4NO7A 4DB3A 3WXIA 5BPNA 3LDLA 4K43A 3IDHA 1BG3A 5F1XA 5BRHA 1NGBA 2P9PB 2FF3B 4CZFA 3EZWA 4BRAA 3O6WA 2FLOA 3H1VX 1NGIA 4H5NA 1GLDG 1GLJO 5KPTA 3AAQA 3WEEB 3VGKA 2D1KA 3KZBA 3WUHA 3P4IA 2YHWA 1BA1A 4KBOA 2PAVA 1IJJA 4WYBA 1NMDA 2E2OA 1J6ZA 5AQTA 4HTLA 5AQXA 5AQOA 3O1WA 1ZXOA 1IG8A 2P9PA 4ISGA 1MDUB 1YAGA 1TUUA 5AQRA 3VEVA 4WQ4A 4BQZA 3MDQA 3WT0A 3MCPA 3U4LA 4BRKA 2IVPA 4RWTA 1RDWX 1NGHA 4WQ4C 1DKGD 1BA0A 1T44A 1ZBSA 4IWVA 2E88A 1KAXA 2Q1NA 2E1YA 4CBXA 4EAHD 3TPQA 3L4IA 2GWKA 1XQSC 4A2BA 3WQUA 2A6AA 3HM8A 1Z6RA 1QZ5A 3O80A 1V4SA 3D2FB 4DQ8A 1ZC6A 1TUYA 3R6MA 4BRIA 3LDOA 2CGKA 1CZAN 3LM9A 4C23A 3IFRA 4IJAA 5AZJB 2GTDA 1ESVA 2CGJA 3DXMA 4MO4A 4H0TB 1RGIA 1QHAA 2D4WA 4CZLA 4BREA 5AFUA 2Q36A 2ASOA 4B1VA 3IMXA 4H5TA 2P9IB 2V52B 3FGUA 3VEOA 3WXLA 3D2FA 2P9LB 3B8AX 4PKGA 4FWOA 3CQXA 4BC5A 3SJHA 4H5VA 3ZETB 5JICA 5AZJA 3FZLA 1ATNA 1T6CA 1GLCG 4BR5A 2E2PA 2FSJA 1RFQA 5ADXA 3A5OC 4BC2A 2QWRA 3RSEB 1DGKN 5LY3A 4ISEA 3FLCO 3GDQA 5AQYA 3DXKB 1R59O 3BUZB 2V7ZA 3ZX0A 2P9LA 2W40A 5LJVA 1NM1A 4FPBA 3VPZA 5FPDA 2ZGYA 3ZETA 5AFUH 1NGDA 4PL7A 4BGBA 3D2EB 1C0FA 4B1XB 2IVOA 2E8AA 3JS6A 4DCHA 1DEJA 2QWNA 4H0VB 2V51B 2QM1A 4YDUC 5AQWA 5BN8A 2P9KB 4IJNA 5KQ8A 2V7YA 4CD3A 4FWSA 3DXKA 1TYQB 4B1YB 2QWQA 5AQNA 3I8BA 3O5BA 3VF4A 5JMVA 3CIPA 3D2EA 5AQMA 3H3NO 4M7XA 5BRFA 5AZIB 4BRQA 1NLVA 4FSVA 3M3ZA 4ISFA 5KPZA 3UB5A 5F0XA 1HKBA 2YJEA 3O4WA 2P9KA 3O1BA 3VF6A 3MN5A 1TYQA 1XC3A 4EHTA 4BR9A 1LOTB 4H0YB
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3RWUA 1W7AA 2O8FA 1BCOA 3OVNA 3NF9A 2X6NA 4FYDA 3EL2A 1KCFA 3SQ0A 3WNEA 1L3TA 3WXJA 5AZIA 4NCBA 2XRIA 3H3OB 2PBDA 4FZZA 2JWLA 3HP6A 2Q0RA 3A5NC 5KPRA 3MN6A 4AHSA 1WBBA 4BR7A 2E6LA 5GAGP 3N4QA 2HBMA 5AQSA 4AHUA 4JD2A 4CHNA 4GVEA 5AJ3K 3K9JA 1WSGA 4ZTJA 3LAMA 4E1JA 1RDAA 4BWMA 2FBYA 3ZX3A 3P39A 2P9SA 2HHHK 3F9KA 2QA4N 5HRNA 5IT9O 4JKBA 4E0DA 3UKUB 4CESA 1ZBFA 3VTIA 1HJOA 4DTNA 2HHWA 5JLFA 2JWKA 4ELUA 2VWJA 4YY3K 3O3HA 1X9JA 1FKPA 3MWTA 1RT3A 4JI0K 2P51A 5K14A 4YHHK 1Z05A 3CQYA 4JAXA 4N41A 5JLHA 3OHRA 3RVCA 1TL1A 3V1RA 1XWLA 3FZKA 3HPHA 1HR0K 2W6LA 4KTWA 2WC9A 1OKJA 4W5OA 1XHXA 3T1HK 1YJ9N 3CYGA 1HNIA 5GIPA 2PYJA 4FPAA 4QS9A 2O4GA 3TU5A 1RT5A 4ILGB 1T6DA 3H45C 3K59A 4DV2K 3SQ2A 1U47A 3PO5A 3W0LA 4YORA 4DQSA 5BPMA 4B1UB 3AVKA 3HL8A 3NVMA 1BUPA 2GX9A 1BQMA 3EYZA 1V4TA 3B6OA 3DLLL 5C0YA 4FK0A 2OTJN 1BGXT 2O8CA 1TAUA 3UKRA 4IOCL 1N6QA 2NNWA 1S3XA 2DFEA 3RRHA 3R9PA 3M8RA 2YHAA 2ZF5O 4JI2K 2FF6A 3V81A 4LF8K 1NGGA 4OLAA 2NRRA 1X3NA 3MMVA 3G6EN 4CD1A 4IKFA 4AHVA 5JVGL 4ILHA 3U6FA 1S5JA 5AQGA 3SK3A 1K8KA 2G8VA 4MDAA 1YXQA 4OKKA 3NBPA 3H6EA 4ZHRA 3V9WA 3ZYYX 4DTPA 3O4NA 2QKKA 4RW7A 2NRVA 3LWMA 3KLFA 2IOCA 4E1MA 4XH4A 2C1IA 3S5TA 4N5SA 3GOIA 3HP9A 3VQ5A 1HYZA 3O9TA 4KI4A 2G8UA 4FWKA 5AQKA 3WNFA 1RDDA 1NG9A 4C8KA 1YTUA 4LH4A 1VQ7N 3HVTA 5M1QA 1SL2A 1YHQN 3EO3A 4A59A 2O4IA 3KIOA 1U49A 1TAQA 4KH6A 4JNEA 4C8MA 3M1FA 4HTUA 4CEAA 4JKGB 3AVBA 4WFAL 3CJ7A 2NRXA 5AQPA 2E1ZA 1BQNA 1Q8IA 2Q2RA 4DSIA 4JKAA 2GELA 3NF7A 4BGAA 3CM6A 3L2RA 4OPJA 4DQPA 1QQNA 1JLBA 1NWKA 4ELTA 4FO0A 4IG3A 2I5JA 3BP8A 3L4QA 3W3DA 4NB4A 3PIPL 2ZJRL 4LFCK 3C94A 4ID5A 2KFNA 5LJWA 1GLBG 4BRMA 3EY1A 4E7LA 4B3RK 2A3ZA 2W00A 3WXKA 1EWQA 1BI4A 4JV5K 1C1BA 4UY8O 3CJ9A 4JI6K 3L2QA 5F2RA 3THXA 1A5WA 2HF3A 3LP1A 3T69A 2KLAA 5C24A 2P9NA 3LDSA 4M3XA 1T8EA 4IOAL 3BF3A 5CE3A 4X64K 1IV0A 3TAEA 3FZMA 4DTMA 5TKYA 4HCCA 4I9QA 5AQJA 4DF8A 2HMIA 2ETJA 3R1XA 4FOIA 4BVOA 2ASPA 3ENHA 1ZBUA 3EN9A 3F5TA 5FPEA 3A5LC 2HOEA 3LDPA 5A2QO 1JCEA 1O1WA 4JKHA 2P5GA 5ELZA 3O08A 4WF9L 3EZ5A 3QICA 4FJNA 2NZTA 3V6DA 2F8SA 4AHTA 4KB1A 3TSQA 2D0PA 2WTUA 3IKMA 1VQPN 3VESA 3ENOA 5AQVA 1C1AA 4YOTA 1K8AO 1BU6O 4DB3A 4XIUA 4OLBA 3P1GA 1YIJN 5BPNA 3ZSVA 1UOCA 3VQ9A 4CJEA 4UQGA 1QSLA 4IFVA 4X62K 2Y1JA 5F1XA 2OPSA 4CEQA 3OYEA 1NGBA 1OH8A 2P9PB 3AO2A 3CCVN 4DU1A 3G10A 4JLHA 2FLOA 3DOKA 1VAZA 2W6KA 4H5NA 1GLDG 1GLJO 2E6MA 3AAQA 1IBMK 3VGKA 1WSIA 2YHWA 4M41A 1S6QA 5MLCQ 1XC9A 2B5JA 1O13A 3O1WA 1ZXOA 3MECA 4CEFA 5GAEP 1QS4A 4AH9A 3K58A 2QI2A 1X9SA 3ZSZA 4DLGA 4QAGA 4O44A 1BHLA 1OH5A 4PUOA 3MXIA 4B3OA 3U3YA 1Q7YO 1HNVA 1DLOA 3AVAA 3I0SA 4WQ4C 1BIUA 3PX4A 4NLBA 3SUNA 4IWVA 4LF7K 4DSFA 4DR3K 1KAXA 2Q1NA 4CBXA 2GWKA 4CEBA 2VG5A 4KRFA 3S3OA 4CIFA 1C1CA 3D2FB 4LSNA 1WAFA 2CGKA 3SV4A 1CZAN 3IFRA 4IJAA 4PHTX 2GTDA 4IEEA 3G4SN 1TKXA 3HPOA 3SV3A 2CGJA 3DXMA 4MO4A 4BECA 2D4WA 3TAGA 1DTQA 3F73A 3IMXA 3MWPA 1S1TA 3V9UA 4B9NA 2KW4A 3CQXA 4FWOA 3QEVA 2Q3SA 1ATNA 1Z26A 4NLCA 3NAEA 2XY7A 3NH0A 4AHCA 1HPZA 3OW2M 2HBLA 1FKOA 3ID6A 4F3OA 3AVMA 1LWCA 1R59O 2V7ZA 2W40A 3RTVA 4E3SA 1C0UA 4IEIA 3HVRA 3NDKA 4DFPA 4E7IA 1XNRK 3K2PA 3OJSA 3VQ4A 1N8RO 4DMNA 4LF6K 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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