3WEEB

Structure of the full-length yeast arp7-arp9 heterodimer
Total Genus 113
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
113
sequence length
465
structure length
409
Chain Sequence
NRKVVIHNGSHRTVAGFSNVELPQIIPSSYIKRTDEGGEAEFIFGTYNMIDAAAEKRNGDEVYTLVDSQGLPYNWDALEMQWRYLYDTQLKVSPEELPLVITMPATNGKPDMAILERYYELAFDKLNVPVFQIVIEPLAIALSMGKSSAFVIDIGASGCNVTPIIDGIVVKNAVVRSKFGGDFLDFQVHERLAPLIKEKRSTDVWYEASTWIQQFKSTMLQVSEKDLFELERYYKEQADIYAKQQTGSPNNPLVQKKNFLFKPLNKTLTLDLKEYQFAEYLFKPQLISDKFSPEDGLGPLMAKSVKKAGASINSMKANTSSPEQVYSLLLTNVIITGSTSLIEGMEQRIIKELSIRFPQYKLTTFANQVMMDRKIQGWLGALTMANLPSWSLGKWYSKEDYETLKRDRK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Structure of the full-length yeast Arp7-Arp9 heterodimer
doi rcsb
molecule keywords Actin-like protein ARP9
molecule tags Transcription regulator
source organism Saccharomyces cerevisiae
total genus 113
structure length 409
sequence length 465
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-07-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3weeB01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3weeB02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3weeB03
3RSEA 2IVNA 3M1FA 1U2VB 2V51B 1NGCA 4AM7A 5EXWA 3A5MC 3VEZA 5EOYA 3EN9A 1ZBSA 4FL9A 4ISEA 3VGKA 1X9JA 3GOIA 1ZXOA 4O5FA 3UKUB 5AQTA 1HUXA 2H3GX 3H3NO 1NGJA 1SAZA 2FLOA 1TUUA 1YXQA 4Y0WA 4F9OA 1Y64A 2P9NA 5FPDA 3O80A 1JCFA 3VF4A 2ZWHA 2YJFA 2W40A 3KHYA 4B1XB 4IJAA 1T6DA 4AM6A 3QICA 2A42A 4CZFA 4H5WA 1BG3A 3ZX0A 3HBTA 4XH1A 5JLFA 5TKYA 3BF1A 3BF3A 2FSKA 3FZLA 1MDUB 1GLLO 4KBOA 4PKHA 3WUHA 2BTFA 2F9WA 4XEIA 4BRLA 3U9ZA 4MLHA 4B1WB 4WQ4A 4EFHA 5KQDA 4H0OA 4DCHA 5E26A 1CZAN 1HKBA 3F9MA 1MWKA 5JLHA 4DHYA 3LL3A 5AZJB 1RFQA 1SZ2A 2YHWA 3SLCA 3ZX3A 3VF2A 3WXJA 3B8AX 3GL1A 2BUPA 1NLVA 3J8AA 1SQKA 3VEVA 1MWMA 1J6ZA 5CE3A 1QZ6A 4BGAA 3VENA 4H0TB 4B1ZA 5AZJA 2W41A 3CJ7A 2QWRA 2CGJA 3MK6A 1BA1A 1NM1A 1NGEA 3HTVA 4B1YB 3G25A 2V7YA 4FSVA 1ATNA 2P9PA 4FWRA 1RDWX 1NGFA 3LDQA 2E2QA 2F9TA 4FWKA 3VGMA 1NBWA 2YHXA 3GBTA 3H46O 2FF3B 3BUZB 4EHUA 5AQWA 3W3DA 5JICA 1XUPO 5KQ8A 3MDQA 3U4LA 3CIPA 3FLCO 2I7PA 1X3MA 3HZ6A 4I6MA 1GLEG 3R6MA 4K43A 4FOEA 2Q1NA 3JS6A 2P9KA 3VESA 4BR0A 5E84A 3MN7A 3H1VX 4IWVA 1K8KB 3L6QA 4M63C 4BC3A 5EY4A 3VPZA 3WXLA 3BP8A 5FPMA 1NGDA 1HPMA 5AFUH 1LCUA 3AARA 4WQ5C 4BRGA 1LOTB 2P9SB 2A40A 1KAYA 4FOIA 2HOEA 4FWOA 1E4FT 4A2AA 5F2RA 4JNEA 3RSEB 1K8KA 4Z94A 1JCEA 2GWJA 2Q36A 2EWSA 4H5TA 3LM9A 3WXIA 1S3XA 3DXKA 4MO5A 1GLDG 3ATVA 3FGUA 1KAXA 5AQMA 3D2EB 3LDNA 4BR9A 5AR0A 4CD1A 5KPTA 3QFPA 3LM2A 4BGBA 2CGLA 5EX5A 3WXKA 4BRFA 5FPEA 4A61A 3I8BA 1U6ZA 1BUPA 3CJAA 5BPLA 5BN8A 1OKJA 3FZFA 2E8AA 3D2EA 1XQSC 2D0OA 1ATRA 2ZGYA 3FFKB 4XH5A 1BWFO 4ISGA 2VCPA 2GWKA 1BDGA 4YDUC 3SMSA 4BROA 3O4WA 4K25A 1XC3A 3OHRA 5AFUA 4QS7A 1YAGA 2QWLA 3QBXA 3H3OB 4CI6A 1IJJA 4NB4A 2ZF5O 2E1ZA 1R59O 3CJCA 3CJBA 4FWLA 3CERA 4H5NA 1KAZA 5F0XA 1Z6RA 2E2NA 5AQVA 4PKGA 3MN5A 5LJVA 3A8YA 1V4TA 4H0XB 4HTLA 2YJEA 2FF6A 4B9QA 5AQYA 2FSJA 1GLBG 2A5XA 2P9UA 3ATUA 3D2FA 3ZETA 5B8HA 4NO7A 5ELZA 1HX1A 2P9LB 2D1KA 2Q0RA 4EHTA 2ASMA 3L0QA 1NMDA 2IVPA 1E4GT 3H45C 3ID8A 3CQYA 2P9PB 4BVPA 3CETA 4JN4A 3ULEA 3AAPA 2J4RA 3U8XA 4JAXA 5AZIB 3KZBA 4BG8A 1ESVA 5AQUA 4B1UB 4L3QA 2FXUA 4IO8A 2P9LA 4K41A 1Z05A 2QW9A 2CGKA 4M7XA 4BR2A 4CZMA 2QWPA 4BQZA 3IDHA 4CBXA 2ASOA 4I6MB 4K42A 2DPNA 3FZHA 1DEJA 1C0GA 3AY9A 1MA9B 1T6CA 2IIRA 5KPRA 2E88A 4GY2B 2P9KB 3VERA 3WEEA 4MLEA 4E1JA 5AZIA 2CH5A 1YVNA 2D0PA 4XH4A 4RTFD 3I33A 3VGLA 5AQIA 1G99A 1NGGA 2AA4A 4IJNA 4JD2B 2NRHA 3QBWA 1RGIA 4LC9B 3VF6A 1QZ5A 4BRNA 4CBUA 3UB5A 3BEXA 4FWPA 4CZEA 3O5BA 3HSCA 3LDOA 3R8EA 1Q18A 5FPNA 1X3NA 3GG4A 4WYBA 3VEXA 2CH6A 4H5RA 3DAWA 3O1BA 5F1XA 3DXMA 1HKCA 3A5OC 4QS8A 2GTDA 4FWNA 4JD2A 2QWNA 4HWIA 5AQKA 4B1VA 3A5NC 3DXKB 4BRQA 4FWQA 2QWMA 1JCGA 4H5VA 5AQFA 4QS9A 4BRPA 3SMPA 5JMVA 2Q0UA 3CI5A 2OANA 4FWSA 3L4IA 3VOVA 1QHAA 3KVGA 2YCHA 5BN9A 2A41A 3O1WA 2HMPA 3VEYA 4CZJA 4H0YB 4WQ4C 5AQJA 4CD3A 5BRDA 3CHWA 1D4XA 2KHOA 1GLCG 1QQMA 1V4SA 2GEMA 3JXUA 3MN6A 4BRKA 4BREA 3CQXA 4BR4A 4JHDB 4RWTA 2P9IA 2PAVA 4MO4A 5ADXA 2VYPA 3MMVA 2WUSA 4DB3A 3FZKA 1WUAA 5AQHA 3QFUA 5AQXA 5AQQA 1S22A 4RCHA 5BREA 1H1VA 3VETA 4C23A 2QM1A 1QQOA 2GUPA 5AQLA 4JHDA 4A62A 2YHYA 3TPQA 4BRHA 3WQTA 3D7EO 3DWLA 3QB0A 3W0LA 2ZGZA 3HM8A 4FWMA 3D2FB 2P9UB 3ZETB 2E2OA 5BPNA 1NGBA 4PKIA 3QDKA 3EO3A 4GNIA 3M3ZA 1NWKA 4FO0A 2FSNA 1GLFO 2ITMA 4BRIA 3H1QA 5AQZA 3O8MA 3MN9A 3EL2A 2HF4A 3IFRA 3ULEB 1U2VA 1NGIA 2E2PA 4IXCA 1IG8A 5BR9A 4PL8A 4EIAA 3ZX2A 3AAQA 4WQ5A 3UKUA 4CZLA 2GELA 3IUCA 4M7YA 1DKGD 2A3ZA 3SJHA 1GLJO 2NLXA 1BU6O 2AP1A 3WEEB 4EAHD 3A5LC 1DGKN 2PBDA 1T44A 2QWOA 3IMXA 1HJOA 3R9PA 3CJ1A 5KPZA 3U9DA 4BRDA 3UKRB 1KXPA 4BC5A 3C0BA 3ENOA 3O08A 3P4IA 3EZWA 3TU5A 4CZHA 3ENHA 1BO5O 4CBWA 4FPAA 4H0PA 5BRFA 1TUYA 3M6GA 1BOTO 2HF3A 2V52B 1P8ZA 4BQLA 3DXMB 3VEWA 1TYQB 1HLUA 2NZTA 3UKRA 1WOQA 1YUWA 4CZKA 2Q97A 4FPBA 3FR0A 3ZEUB 5ADXH 5I9EB 4ISFA 3HI0A 2Q2RA 4YDUA 4BRAA 1BA0A 2UYTA 3GDQA 1C0FA 3DJCA 4BRMA 4BC4A 5BRHA 1TYQA 3LDLA 3QMLA 4H03B 3VEOA 5LJWA 2YI1A 2E20A 3C7NB 3EKUA 3SK3A 3ZEUA 3WQUA 4BRCA 4CJ7A 3H6EA 1GLAG 4A2BA 1HKGA 4J8FA 5AQRA 2QXLA 3LDPA 5AQSA 4BR7A 2P9IB 4PL7A 4CZGA 1ATSA 3MCPA 2Q31A 3C7NA 1ZC6A 1NGHA 4H0VB 3S41A 4BG9A 5LY3A 4BC2A 2VWBA 3FZMA 4DQ8A 4BR5A 2E1YA 2A6AA 3O6WA 2V7ZA 3WT0A 3EKSA 5AQPA 5EVZA 3CJ9A 1NGAA 2D4WA 5AQOA 3GE1A 5BPMA 1QQNA 3A0IX 1EQYA 4BVOA 5AQNA 2ASPA 4CZIA 3UE5A 2P9SA 2IVOA 3FE1A 4IZ9A 2QWQA 4O8KA 2I7NA 5AQGA 2P9NB
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2FC0A 3HXMA 4WCEL 3M1FA 5M1KA 1U2VB 3ZT0A 4AM7A 4JI8K 5EXWA 3VEZA 4Z4CA 3OYFA 1RILA 2QEXN 4M3YA 3VGKA 4GKJK 3UKUB 2H3GX 3H3NO 2FLOA 4M3WA 1Y64A 4B3TK 4CK1A 3T69A 1JCFA 4B1XB 1C0TA 1YJ9N 4DV2K 4NLBA 1Q9YA 4K0KK 3AVJA 4F2RA 2VGMA 1W0HA 2NRRA 2FSKA 1MDUB 2KTQA 4PKHA 2BTFA 2F9WA 5GIPA 3U9ZA 4MLHA 4B1WB 4LF5K 5KQDA 4H0OA 4B3OA 3F9MA 4IFVA 4DHYA 5AJ3K 2YHWA 3SLCA 3WXJA 3L2QA 4AHVA 3L2WA 4X66K 4FJ8A 3VQBA 5LL6Z 2YNHA 1OH7A 4BGAA 4NYFA 3M8RA 1HNVA 4I9LA 4H0TB 5AZJA 3CJ7A 2DY4A 2OPQA 3NF7A 3KLIA 3O3HA 1NGFA 3LDQA 4N5SA 3VGMA 4FWKA 3QEWA 1RTJA 4E1NA 5AQWA 3IS9A 3CC2N 2OA8A 4FVUA 2E5LK 3HP6A 4E89A 3MDQA 2HHUA 1HJRA 3FLCO 2I7PA 1KLMA 3PX0A 4MDAA 3HZ6A 4A5BA 2XY8A 3QINA 4ICLA 2LSNA 3V4IA 5C25A 3VESA 1WB9A 3HSTB 1XMQK 1TK5A 3MN7A 4PUOA 1K8KB 4M63C 4CGDA 1SL1A 4BC3A 4KH4A 3WXLA 4E0DA 3ZSQA 1NGDA 4KI6A 4JK9A 1S5JA 1LCUA 4Z4EA 4YOYA 3O9RA 3MXIA 3ZSRA 1VK0A 2BE2A 2A40A 2NRWA 3PY8A 5T7BA 1BI4B 1HPZA 1E4FT 3RSEB 2B5JA 3E1YA 1N33K 4DR3K 2GWJA 4CF2A 2Q36A 2PYLA 4H5TA 1YF5L 3LWLA 4O44A 2Z1HA 3WXIA 3CCEN 4MO5A 5M1QA 3ATVA 2FBYA 4DV1K 3DLBA 4DR1K 2YNIA 1J53A 5C15A 1UA0A 4DV5K 4DTXA 3HPOA 5C24A 1WLJA 1LWFA 4A61A 3LP0A 1LW2A 1VRUA 3OYGA 2YX6A 4FLTA 1HNZK 2UUCK 2ZM6K 4YNQA 4KTZA 1IKWA 2X6NA 1BDGA 4IFYA 1BHLA 4BROA 4AHSA 3TI0A 2G8VA 1U04A 3SBGA 2O8FA 3O9TA 4KTWA 4LY7A 3LWMA 2HNYA 4CI6A 1QSYA 4O0IA 5CR4A 1R0AA 5HBMA 4FWLA 3QETA 1KAZA 5J2NA 5HRRA 3DLGA 3AVAA 3MN5A 3A8YA 4C1NI 4HTLA 4B9QA 5CYQA 1RBTA 2A5XA 3D2FA 1N5YA 4NO7A 4IOCL 1YTAA 2HMIA 2P9LB 1EXQA 1VSIA 4B3SK 1RDBA 3L0QA 4FJ9A 3TSQA 1L3UA 3HRGA 1HNWK 1E4GT 3H45C 2P9PB 4BVPA 3OYAA 3CETA 3CYMA 1S1UA 3ULEA 1FK9A 3SNNA 2WONA 4IO8A 2QA4N 3SQ2A 1XHZA 4K41A 4HUFA 4Z4IA 3TWHA 1VQ9N 4BR2A 4CZMA 1S6PA 2ASOA 3CM6A 1C0GA 5KPRA 1RDCA 1T6CA 5KI6A 2GBZA 2P9KB 4F8RA 4ELVA 4E1JA 2YKNA 4RTFD 3I33A 4YHHK 1T7PA 4B9MA 1G99A 2X78A 4OJRA 3IRXA 3HOTA 4JD2B 3NHGA 1WSIA 3AO3A 3UB5A 4CZEA 1TKTA 2UU9K 4W5RA 1TAUA 3GG4A 1NK0A 4ZTFA 1HKCA 3T1YK 4QS8A 3ALYA 2GTDA 5JVHL 2OZSA 2QWNA 4HWIA 1NJIO 3VQEA 3DOLA 3DXKB 3VQQA 2QWMA 3TSPA 1JCGA 4BRPA 2Q0UA 3SJJA 3RMBA 1FJGK 3BDPA 1IKYA 4OX9K 3VTHA 1QHAA 3VEYA 3O1WA 2HMPA 4CZJA 4DUYK 3CFPA 4LSNA 3KKRA 1YHQN 1QHTA 4DTMA 4B9NA 1GLCG 3HYFA 4LH4A 4FZZA 2P9IA 2PAVA 3I55N 1VSKA 5ADXA 3AVGA 2W42A 4DFJA 1WUAA 3V9XA 5KGXA 1QTMA 3EE9A 4C23A 1XC9A 4C8NA 1QQOA 1HMVA 3CG7A 4ILJA 4BE7B 3SUOA 3DWLA 4K8ZA 3EZ5A 1EKEA 2RPIA 3DMJA 3ZETB 2P9UB 4CGHA 3NF6A 3CCUN 2E6LA 3THXA 3EO3A 2OCEA 5MLCQ 1SKSA 4FO0A 1RNHA 1KQSM 2FSNA 4BRIA 3H08A 3VMFB 4OKKA 3IFRA 3ZSXA 1RBRA 3T1HK 1BIUA 4BWMA 1K8AO 5BR9A 4EIAA 3I0RA 1IV0A 4J2AA 4KREA 3U3YA 4FJMA 2NRTA 2GELA 1JLAA 4CHYA 3TAMA 3WEEB 4EAHD 2ETJA 3AA3A 3L8BA 1W2BM 2HBJA 1T44A 2YHAA 3IMXA 4W5OA 4DS5A 3G0ZA 1RCHA 3C0BA 4JKBA 4FK0A 3P4IA 3OW2M 1XNQK 3EZWA 4F4KA 4CBWA 3IG1A 2GV9A 4FM2A 2D0AA 1TUYA 2WFBA 3M6GA 4FLUA 1BOTO 3NDKA 1P8ZA 2NZTA 1YUWA 3KK3A 3P38A 1JLGA 2Q97A 1YI2N 3FR0A 5JENA 3S3MA 4CF0A 1NK6A 4DQQA 4G9ZA 2Q2RA 3K9JA 1U47A 2UYTA 4CJEA 1YVUA 1LV5A 3DJCA 4JKGA 4DF4A 1TYQA 1L3TA 4CIGA 3EKUA 4AHRA 3ZEUA 4B9VA 3CXCM 4B3RK 1WAJA 3ULDA 1HKGA 3DM2A 4J8FA 4FJ5A 4J2EA 3KWIA 3E9LA 4JKDA 3LDPA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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