3MMVA

Structures of actin-bound wh2 domains of spire and the implication for filament nucleation
Total Genus 106
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
106
sequence length
371
structure length
360
Chain Sequence
VAALVVDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVSHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTEEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELKDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMEACGIHETTYNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Contractile protein/protein binding
molecule keywords Actin-5C
publication title Structures of actin-bound Wiskott-Aldrich syndrome protein homology 2 (WH2) domains of Spire and the implication for filament nucleation.
pubmed doi rcsb
source organism Drosophila melanogaster
total genus 106
structure length 360
sequence length 371
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-04-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3mmvA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3mmvA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3mmvA03
1BU6O 1HLUA 3UB5A 3DWLA 2J4RA 1TYQB 4CBUA 5EVZA 3AY9A 2Q0UA 1QQMA 4FWPA 3BF3A 1BA1A 3MN6A 4J8FA 3ZEUA 4CD3A 2P9LA 3FLCO 1Q18A 4CBXA 3ULEB 1NGDA 3EL2A 3WUHA 3R6MA 5JMVA 1GLJO 1C0GA 2ZGYA 5BRHA 5FPNA 3QBWA 4FWMA 5BRFA 2D4WA 2V7YA 1JCEA 1EQYA 1BG3A 3EZWA 3OHRA 4WQ4C 3KVGA 2CGLA 3G25A 1P8ZA 5LY3A 3MK6A 5AQMA 4H0TB 4IXCA 5E26A 4FWOA 4BRKA 3ZETB 2YHWA 2ZGZA 2IVNA 3H1VX 5F2RA 1QQOA 4O5FA 3EKUA 1HJOA 4IWVA 1ZBSA 2QM1A 1X9JA 3D2FA 1LOTB 1LCUA 2P9NA 4AM7A 3ZX2A 2PAVA 4B9QA 2ZWHA 4BRLA 5EX5A 4BC5A 2NLXA 1OKJA 5JICA 2I7NA 4M7XA 3L6QA 2Q31A 4B1YB 3ATVA 4CD1A 4CZHA 1NM1A 1KAZA 1MWKA 4FWSA 2IVOA 4CI6A 3VGKA 1YUWA 4BRAA 2P9PA 3CHWA 3UKRA 1XQSC 2A6AA 2CH5A 3C7NA 3WEEB 4FL9A 3HSCA 1GLBG 2A5XA 5KQ8A 2PBDA 3H46O 3RSEB 4CZMA 2A3ZA 4RTFD 3LL3A 1ATNA 1NGAA 5AQWA 4NO7A 3BEXA 3VF4A 3W0LA 2E2OA 3VOVA 3VETA 3LDNA 3CETA 1NGHA 2EWSA 4BQZA 3VF6A 3MCPA 4FPAA 4BC4A 2QWOA 4CZIA 3ID8A 1NBWA 1NGIA 2GTDA 2E1YA 4JN4A 2P9KA 3O4WA 3IMXA 3U9ZA 5BPMA 3UKUB 1GLLO 2QWQA 3VF2A 2Q1NA 3KZBA 2P9SB 4XH1A 2E2NA 2QWNA 2FF6A 1HKBA 3JXUA 1BOTO 3GE1A 5AQRA 3D2EA 2P9IA 1DKGD 4BROA 4BRHA 3VEZA 3VPZA 5BRDA 4FWLA 4H5RA 2IIRA 4FPBA 1TUUA 2DPNA 2FSNA 2QWMA 3ZX0A 1QZ5A 2CH6A 3O1WA 5BN8A 5AFUH 5LJVA 1NGEA 4GY2B 4K41A 4BR5A 4BRQA 3O08A 1Z6RA 2W41A 1GLEG 5EOYA 1SZ2A 2HF4A 3IUCA 2YJEA 2H3GX 5KQDA 3VERA 4BQLA 4H5TA 2E2QA 3U4LA 5AQOA 5AQYA 1V4SA 4DCHA 4C23A 5LJWA 5BREA 3J8AA 4Z94A 2OANA 4A2BA 3DXKB 4H0XB 4WQ5A 5AZIA 5F0XA 1S22A 2VCPA 4GNIA 5AQTA 3BUZB 1K8KA 5AZJB 1S3XA 3D7EO 2BTFA 3LDOA 4MO4A 3M1FA 5AQJA 2P9UA 3A5LC 3CJAA 4DHYA 5BR9A 1NGJA 4BGBA 5FPEA 3R8EA 2CGJA 2VWBA 3ATUA 2V52B 2FF3B 1G99A 1C0FA 3VGMA 5BN9A 4BRIA 1YXQA 4DQ8A 2A40A 2I7PA 3WQUA 2IVPA 1KAXA 3ENOA 4WQ5C 3TPQA 3HBTA 4FSVA 5EY4A 1MWMA 2VYPA 1HX1A 4IJNA 1ATRA 1WOQA 3EO3A 4F9OA 4PKGA 1JCFA 3VEXA 4K43A 3B8AX 3L0QA 3ZEUB 4EIAA 1NWKA 2Q2RA 3MDQA 2P9LB 1BUPA 3FGUA 3CJ9A 3GBTA 4K25A 4QS7A 3LM9A 4XEIA 4IO8A 4BRDA 4XH4A 4BR7A 4CBWA 1KAYA 4JHDB 5ELZA 3HZ6A 2HF3A 4YDUA 5E84A 1E4GT 2GWKA 3MN7A 3O6WA 4LC9B 4RWTA 1GLFO 1YAGA 1QZ6A 5AQLA 3R9PA 3BP8A 3QICA 1SQKA 3WXJA 1XC3A 1HKCA 5JLHA 3AAPA 1RGIA 1BO5O 3DXMA 3O80A 3O5BA 5F1XA 3CJ7A 4K42A 4H5VA 4I6MB 4M7YA 2NZTA 3LDPA 3D2FB 3FFKB 2UYTA 1NGCA 2P9NB 3CERA 1RFQA 2E88A 2YCHA 4CJ7A 4FO0A 4A61A 2YI1A 3VEOA 4FWNA 4B1WB 3CI5A 4FWKA 5KPTA 4JD2A 1D4XA 4A2AA 2FSJA 3FR0A 3DJCA 3BF1A 2P9PB 3VEVA 4O8KA 3SLCA 3UKUA 4BRCA 3C7NB 4FWQA 3VEWA 1NGFA 1BDGA 4PKIA 1QQNA 1DGKN 4KBOA 1KXPA 1H1VA 3DAWA 4JNEA 2D0OA 4B1VA 2GWJA 4EFHA 1ZXOA 1U2VA 5ADXH 5AQFA 3O8MA 3QDKA 4L3QA 2E1ZA 4H0PA 4H5NA 1IG8A 5I9EB 3IDHA 2NRHA 2QWRA 3VGLA 4B1ZA 2AP1A 4ISFA 2F9TA 3A5NC 3SK3A 4E1JA 2E20A 4RCHA 1X3NA 5JLFA 4H03B 5KPZA 2BUPA 4PL7A 2A42A 3H3NO 4MO5A 2W40A 1HUXA 3W3DA 3CJBA 1T6CA 3WXIA 4CZLA 2P9KB 3H6EA 2YHXA 1NGGA 2ASOA 1TYQA 3FZFA 1Z05A 1V4TA 4CZGA 2D0PA 3WXLA 4BREA 3D2EB 2P9IB 4BRMA 1NGBA 2HMPA 3M3ZA 4PL8A 4BRFA 3GOIA 4CZJA 3A8YA 3GDQA 3L4IA 2E8AA 3FZKA 3ULEA 3GL1A 4PKHA 4H5WA 3AARA 5AQVA 1BA0A 1IJJA 5AFUA 1MDUB 4B1UB 2CGKA 5AQZA 3VENA 1HKGA 1YVNA 4AM6A 3QFUA 3TU5A 5AQUA 2FLOA 3A0IX 1GLAG 2D1KA 4A62A 4WQ4A 1WUAA 3ZETA 4H0VB 3U9DA 1JCGA 5AZIB 4BG8A 3SJHA 5EXWA 1K8KB 5AQPA 3CQXA 1T6DA 5AQHA 5AQQA 2FXUA 1TUYA 4BRPA 2P9UB 1SAZA 2QWPA 2ASPA 5FPMA 4CZFA 4EHTA 3LDLA 2Q36A 4BR9A 4CZKA 3F9MA 2FSKA 3P4IA 3ENHA 5AQXA 4IJAA 3WQTA 4JHDA 1HPMA 4FOIA 3JS6A 3FZLA 4MLHA 4NB4A 3FE1A 3KHYA 4DB3A 1GLDG 3S41A 5BPLA 3CIPA 4Y0WA 4BGAA 2QWLA 3WEEA 4FWRA 5AQNA 3RSEA 1BWFO 4I6MA 2QW9A 3H3OB 1CZAN 1GLCG 2V51B 5AQSA 4JAXA 4ISGA 3LM2A 3LDQA 2WUSA 5AQKA 4BR0A 4IZ9A 3WT0A 4YDUC 3M6GA 3I8BA 3QFPA 4WYBA 5B8HA 2Q0RA 5KPRA 5AQIA 3HI0A 5AR0A 4EAHD 1J6ZA 1NMDA 3U8XA 3SMPA 4EHUA 4XH5A 2HOEA 1X3MA 2E2PA 3EKSA 2AA4A 1XUPO 3UKRB 3VESA 1MA9B 3ZX3A 2V7ZA 2ZF5O 3DXMB 3CJCA 2ASMA 2P9SA 4HTLA 4BVPA 3I33A 3MN5A 3WXKA 1RDWX 4ISEA 4H0OA 5TKYA 3FZMA 1R59O 4BG9A 4BRNA 2F9WA 4H0YB 5FPDA 3HTVA 1DEJA 1Y64A 4MLEA 3GG4A 4JD2B 4BC2A 3IFRA 4BR2A 2YHYA 3EN9A 3A5MC 1QHAA 1ZC6A 4FOEA 5CE3A 3A5OC 1T44A 3MMVA 4CZEA 4BRGA 5BPNA 1ESVA 3FZHA 2A41A 4HWIA 1U2VB 1U6ZA 1NLVA 2Q97A 3QB0A 3C0BA 3CQYA 3QBXA 3MN9A 5ADXA 4QS9A 4QS8A 3DXKA 3O1BA 3VEYA 3HM8A 2QXLA 5AZJA 2GELA 3SMSA 1ATSA 3H1QA 3QMLA 3UE5A 2GEMA 3CJ1A 2GUPA 2ITMA 2YJFA 4BVOA 3H45C 3AAQA 4BC3A 2KHOA 4M63C 1E4FT 4B1XB 4BR4A 5AQGA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1BU6O 3TAFA 3RR7A 5C10A 3P38A 2J4RA 4CBUA 1EO1A 2Q0UA 2YV0X 4FWPA 4AHCA 1BA1A 3MN6A 1NK8A 4J2EA 1BGXT 5J2PA 1Q86O 1Q18A 4FJMA 4DQRA 2ATQA 4CHOA 3CFRA 3C65A 1XI1A 5BRHA 5CZ1A 5BRFA 1UAXA 1BG3A 3EZWA 4WQ4C 1S9EA 2CGLA 3G25A 1FJGK 4CF8A 3OS2A 5AQMA 3LWLA 3D45A 1KLMA 3DRRA 5E26A 4BRKA 4JEPA 3TAMA 1A5WA 2ZGZA 4CJ5A 5F2RA 4BEBA 4O5FA 2KZMA 2YHBA 3AO3A 3EKUA 1TL3A 1ZBLA 1TGOA 3ZT0A 4RW8A 2XY6A 1X9SA 2E6LA 3E01A 2PAVA 1HR0K 4MDBA 5EX5A 3SAHA 2O8DB 4IO9L 5JICA 3ATVA 1JLFA 2P5OA 1MWKA 3O3GA 3NH1A 1TKDA 2HNZA 5GADP 4FL9A 1GLBG 2A5XA 3RSEB 2OPPA 4HTUA 3RTVA 1L3SA 4YOYA 4DTMA 4DUYK 2OZMA 4BE0A 3T3FA 3S3OA 2E2OA 4F8RA 3J7ZO 3VETA 2EWSA 4KB1A 3VF6A 4FZXC 4BC4A 2G8FA 4CHQA 1C1AA 2P51A 3CYMA 2Y1IA 3HPGA 3O4WA 4QCLA 3IMXA 5BPMA 1S1XA 4KTQA 2Q1NA 3KZBA 5HRSA 2XO7A 4DLEA 3TSUA 1S9GA 1ITGA 4XH1A 2E2NA 4CHNA 5IWAK 2XY5A 3J7YP 2DFHA 4FWLA 4IEIA 2QWMA 1TAQA 3THYB 4DR4K 1NKEA 4B9LA 5J2QA 1TAUA 1NGEA 1TL1A 4GY2B 4K41A 2HHHK 5C12A 1Z6RA 3S3MA 5EOYA 3ZSOA 2H3GX 5KQDA 1DTTA 1FW6A 1S5JA 3VQBA 4B9TA 2KW4A 4CJEA 4CEOA 3CCJN 4DS4A 3THVA 1VQLN 5AQYA 4DCHA 3NGYA 2F96A 4C23A 1OH7A 3CC7N 4B9SA 4WQ5A 1S22A 2VCPA 5AZJB 5AQTA 4DV7K 3G71N 4MO4A 2O8CA 2P9UA 2IDOA 3Q7CA 2UUCK 4H4OA 2WFBA 3MWTA 1C1CA 4DFMA 4CGIA 3QNNA 1JLEA 3VGMA 5HROA 1YXQA 2W6LA 3MX2A 4CHZA 4IDKA 3VQ4A 3KK1A 1KAXA 4WQ5C 3HBTA 2JGUA 4W5QA 4IJNA 1WLJA 3KK3A 1WOQA 4PKGA 1JCFA 3ID6A 4B3OA 3AGRA 4ELTA 1NWKA 2Q2RA 3DLLL 1T7PA 3FGUA 1NK7A 4KHSA 2OA8A 1YHQN 1QTMA 4DF4A 3PSIA 4O44A 3FFIA 4CBWA 2ZD1A 5E84A 5C2FA 2GWKA 4RWTA 3OYLA 4KO0A 4IOAL 4CFAA 3BP8A 1S72N 1S6PA 4DV6K 2A1SA 3O5BA 4ZHRA 3L3UA 4N76A 4K42A 3OYJA 4H5VA 1LWEA 3D0PA 4OO1J 4M7YA 4ILHA 3FFKB 4AHTA 4DTOA 2E88A 1VQ5N 3OTOK 4A61A 3PX4A 1VRTA 3OY9A 4B9NA 1IBLK 4JD2A 1D4XA 5DM7L 2FSJA 3FR0A 4E7LA 3QEXA 3LPUA 3O4NA 4M3ZA 2P9PB 4CGGA 4CGJA 3WNEA 4O8KA 3OYKA 4FWQA 1BDGA 4CJFA 4DU4A 1RTDA 1ZXOA 5ADXH 5AQFA 4M45A 2G8HA 1VHXA 2E1ZA 1EETA 3DRSA 3VMFB 1VQ9N 3IDHA 2NRHA 5CZ2A 5HBMA 4DWIA 3AO5A 5KGWA 4CK3A 2JLEA 2B6AA 3HK2A 4GKJK 4FJ7A 4JS5A 4PL7A 4MO5A 4E3SA 2D0BA 3SUQA 3WXIA 2IGIA 4CZLA 1T3VA 2P9KB 3L4QA 1B9DA 3V1OA 5GINA 1TYQA 1Z05A 3THWA 1XC9A 4WCEL 4CZGA 3HYFA 3HVTA 1W0HA 2HMPA 2G8IA 4DQQA 4BRFA 2IC3A 3GOIA 3GDQA 4CJ3A 4FJ8A 4FLZA 4DSLA 4HUFA 3GL1A 2Z1GA 2HNYA 4H5WA 4PKHA 4J2BA 5AQVA 1BA0A 3SYZA 1NOZA 1SKRA 2HBKA 1RT5A 4DSKA 2F8TA 1O13A 4BE1A 1XMQK 3VQ6A 3R3LA 2FLOA 5A2QO 1GLAG 2D1KA 1ZBFA 1RT6A 3AA3A 3J80O 4OPAA 4RW4A 4KHQA 2UXDK 3ZETA 4H0VB 1JCGA 5HRRA 3PIOL 5AZIB 4BG8A 3SJHA 1RDCA 4DSJA 1T6DA 4YFUA 1TUYA 1VSLA 1OH8A 4CZFA 1GOAA 4JK9A 5JS2A 3HJFA 2QEXN 2FSKA 5AQXA 3VQ5A 3CG7A 3T1AA 2O4IA 4OVLA 4FOIA 4L8RB 3KHYA 4DTSA 4HCBA 4M3UA 1F21A 4E19A 1GLDG 3LP1A 3WEEA 2ZJPL 3HL8A 5AQNA 5C0YA 3ITHA 5CY4A 2FC0A 2UUAK 2VWJA 3LP3A 3H3OB 4BE7B 3ZSRA 4ISGA 3O9QA 1LWFA 1WBBA 4DQPA 4LSLA 3VQDA 4IZ9A 4E7HA 5T7BA 3WT0A 2HHSA 1NK0A 4LF7K 5B8HA 3OYIA 5KRSA 3AVKA 5AQIA 3PX6A 4F4KA 1J6ZA 1NMDA 3EY1A 1LAWA 3A2FA 1JLAA 3THXA 2HOEA 1MA9B 4E72A 4C1NI 2ZF5O 3G10A 4W5OA 3CJCA 4CJKA 3NVKA 3U3GA 3EZ5A 4ILGB 4LD0A 4CJ4A 3OBYA 3I33A 4CIGA 1J5EK 4CJQA 1IO2A 3ZSQA 1R59O 3AVGA 3E9PA 2EHGA 3HPHA 3P39A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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