3MN7A

Structures of actin-bound wh2 domains of spire and the implication for filament nucleation
Total Genus 108
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
108
sequence length
371
structure length
359
Chain Sequence
VAALVVDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVSHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTEEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELKDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMEACGIHETTYNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structures of actin-bound Wiskott-Aldrich syndrome protein homology 2 (WH2) domains of Spire and the implication for filament nucleation.
pubmed doi rcsb
molecule tags Contractile protein/protein binding
source organism Drosophila melanogaster
molecule keywords Actin-5C
total genus 108
structure length 359
sequence length 371
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-04-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3mn7A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3mn7A02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3mn7A03
4HTLA 4JN4A 3VOVA 2D4WA 5EOYA 4MO4A 1BUPA 3EKSA 4YDUA 2NLXA 2F9TA 1S22A 1QZ5A 3ZETB 5FPMA 4CZMA 2YCHA 2QWQA 3CJCA 2GUPA 4FWSA 3QFPA 3O1BA 4XH5A 1SQKA 1Z6RA 1NLVA 3FZMA 4B1WB 2FXUA 3CQXA 3U8XA 3LDLA 2W41A 3WQUA 2GWKA 4JNEA 4H5NA 4PL8A 1ESVA 2QW9A 3UKUB 4H5RA 5AQMA 3VEVA 4EIAA 4B9QA 3GDQA 3TU5A 2P9IB 1ZC6A 4WQ4C 4A2BA 5E84A 1EQYA 5JICA 4BC2A 4BVOA 4MLEA 2YHXA 5BREA 3WXIA 3H3NO 2D0OA 4BGBA 2A6AA 3FZHA 3WEEB 4DB3A 2Q31A 1NGJA 4BRHA 3SK3A 3DJCA 1X3MA 4IWVA 5AQZA 3H6EA 1MWKA 3P4IA 3AAPA 4KBOA 4B1ZA 1GLCG 2A42A 3HI0A 3VENA 3U9ZA 4AM7A 2V7YA 1YAGA 3C7NB 4WQ5A 3QBXA 3B8AX 5ELZA 4ISGA 1V4TA 4NO7A 2ASPA 4RCHA 4CBUA 5AQWA 3W3DA 4Z94A 2Q36A 3ZETA 1YXQA 3LDQA 2UYTA 1BA1A 1ATRA 3QMLA 5AQJA 4FWKA 1JCGA 4H0VB 3VEXA 4CI6A 4B1XB 2FSKA 1BO5O 2E1ZA 3MMVA 3AAQA 4K43A 4BR5A 1D4XA 4PKGA 2ZGZA 4BC5A 1KAYA 4CZKA 3IMXA 1LCUA 4B1UB 3UKUA 4FPBA 3O80A 5AQRA 4FO0A 3H1VX 2OANA 2P9IA 2FF3B 3VF4A 2NRHA 4PKIA 4FOIA 5AQHA 3AARA 4IJAA 5LJWA 2E20A 3EO3A 3MN6A 5FPNA 1G99A 5JMVA 4BRPA 2V51B 5I9EB 3EZWA 5AQXA 3ENOA 3D7EO 1BWFO 4H5VA 4CZGA 3H46O 3WEEA 4IO8A 5BR9A 1ZBSA 2Q97A 1U6ZA 1KXPA 4M7YA 5AQVA 4B1VA 2ASMA 3AY9A 5AQIA 3VGKA 4CZJA 1HPMA 2P9LB 5BRDA 4BROA 3VESA 3C7NA 1E4GT 3O5BA 3CHWA 3LM9A 2I7NA 3TPQA 3U4LA 1S3XA 4B1YB 4BR2A 5JLHA 4CJ7A 1QQOA 5BPMA 1TUUA 3LDPA 1LOTB 3GBTA 3QICA 1Q18A 2GWJA 4ISEA 5FPDA 1YVNA 5BPNA 3FGUA 2A5XA 2HF4A 2NZTA 4BRFA 3A8YA 2P9UB 3S41A 1V4SA 4BRGA 1NWKA 3BF1A 1NGHA 3ULEB 4F9OA 2YJFA 1MDUB 3GE1A 3R8EA 1JCEA 3DXKB 4BR0A 2Q0RA 4O8KA 1GLAG 4RWTA 3MN5A 4EAHD 4M63C 1HJOA 1KAXA 5ADXH 1DKGD 3R9PA 4FPAA 2QWLA 2P9NB 3FZFA 5AQOA 5AZJB 3QB0A 3HZ6A 1P8ZA 1GLFO 1OKJA 3A5OC 1BOTO 3WXLA 5AFUH 3ATUA 3HBTA 4K42A 5BPLA 2Q0UA 3GG4A 2E2QA 3H1QA 5EXWA 1C0GA 2A41A 1NM1A 1Z05A 3LL3A 2IVPA 1XUPO 3CJ9A 4MLHA 2E2PA 1J6ZA 2E8AA 5LJVA 3VF2A 2BTFA 1ATNA 2CGJA 1K8KB 3HSCA 3J8AA 2E1YA 5FPEA 1NGIA 4H0YB 3VERA 4BQZA 5AQPA 3WXJA 2GEMA 5F0XA 3FLCO 2I7PA 2P9LA 3EL2A 3M3ZA 2P9KB 2V52B 1KAZA 3ZX2A 2ITMA 3FE1A 1T6DA 1Y64A 4FWLA 4FWQA 1GLEG 1NGAA 1BDGA 4MO5A 4WYBA 3VGMA 1SZ2A 4BREA 2QM1A 3D2EB 2AP1A 2PAVA 1C0FA 5ADXA 5AQQA 1GLDG 1X3NA 3CIPA 4GNIA 2F9WA 2FLOA 4FWPA 3KHYA 2P9UA 3CETA 3CJ1A 3EKUA 3QBWA 4AM6A 2VYPA 2E2NA 4WQ4A 5AFUA 3ULEA 3ENHA 1QHAA 4A2AA 4L3QA 3A5NC 3MK6A 4BC3A 1NGGA 4BQLA 5E26A 3DXKA 4DCHA 4JHDB 1R59O 4BGAA 2QWOA 2QWPA 5AQFA 2BUPA 3I33A 3UKRB 4NB4A 3FFKB 1NMDA 1WUAA 2V7ZA 4XEIA 2W40A 2P9NA 1HX1A 5AZJA 3L4IA 2FSJA 3O6WA 1SAZA 4CZIA 3O8MA 4RTFD 4DHYA 4BRLA 1DEJA 1JCFA 5AQNA 4K41A 1GLJO 3BEXA 3MDQA 2FF6A 3SLCA 3FZKA 1K8KA 1QQNA 3OHRA 4LC9B 4BRNA 2QWRA 5KQDA 4BRCA 2QWMA 3KVGA 3VETA 4YDUC 1HKGA 2A3ZA 2P9PB 5KPZA 3VEZA 2YHYA 1NGBA 4BRMA 3M1FA 4H5TA 1XQSC 2P9KA 2D0PA 4QS9A 4PL7A 2CGLA 2QWNA 4ISFA 2IVOA 3SMSA 1NGCA 3D2EA 1TYQB 3U9DA 4BR7A 3SJHA 4HWIA 2GELA 3BF3A 3A5MC 5AQTA 4EHTA 3DXMB 4BR9A 4J8FA 2CGKA 2VCPA 3VEYA 2QXLA 1NGEA 4A62A 1HKCA 2YHWA 4JHDA 4CBWA 5AQKA 5AQSA 3UKRA 4CD3A 4E1JA 4CZFA 3LM2A 4O5FA 3VEOA 1E4FT 5EY4A 4FWMA 2Q1NA 4CD1A 3ZX0A 4BRIA 4FWNA 4QS8A 1TUYA 4K25A 1RFQA 2IIRA 3CJAA 4BRQA 2P9SB 4H0TB 3ZEUB 1CZAN 4A61A 5AZIB 3D2FB 4FSVA 3MN9A 4WQ5C 3VF6A 2ZGYA 3IUCA 2AA4A 3VGLA 3DAWA 4CZHA 3L6QA 4JD2B 3CJ7A 3LDNA 2P9PA 2E2OA 2J4RA 3CQYA 1DGKN 2VWBA 1BG3A 1GLLO 4DQ8A 3DWLA 3GOIA 2HF3A 2KHOA 1QQMA 5AQGA 2CH5A 2HOEA 3A0IX 4FOEA 4I6MB 5AQLA 1NGDA 1MWMA 1BU6O 1NGFA 3RSEB 1TYQA 4H5WA 4IJNA 2A40A 3WXKA 2YI1A 3FR0A 3C0BA 3IFRA 1U2VB 3QFUA 3FZLA 1QZ6A 3GL1A 3DXMA 4C23A 1HKBA 4CBXA 1BA0A 1IJJA 4FWRA 5TKYA 1XC3A 4JAXA 4BC4A 3VPZA 5BRHA 3JS6A 3M6GA 4H0PA 5LY3A 3F9MA 5KPTA 2DPNA 3WUHA 4BRAA 5B8HA 3HM8A 3EN9A 2FSNA 4FWOA 3LDOA 5BRFA 5BN8A 1ZXOA 2CH6A 2ZWHA 3WT0A 5KPRA 2EWSA 4GY2B 3WQTA 3KZBA 1NBWA 2P9SA 4CZEA 3ZEUA 4M7XA 4Y0WA 3UB5A 5AZIA 4EFHA 3D2FA 2Q2RA 4BRKA 3H45C 3ID8A 5F1XA 4XH1A 1GLBG 4BRDA 5EVZA 3BUZB 3MCPA 3MN7A 5BN9A 4CZLA 1RGIA 5JLFA 3A5LC 4IXCA 3ZX3A 4JD2A 2YJEA 3CJBA 5AR0A 1HUXA 1T44A 4H0OA 3SMPA 1MA9B 3G25A 3IDHA 4H0XB 1HLUA 3ATVA 3BP8A 3CI5A 1RDWX 5EX5A 4I6MA 2ZF5O 3RSEA 4EHUA 3O1WA 4IZ9A 3O08A 1H1VA 3W0LA 1WOQA 4XH4A 1ATSA 1YUWA 2ASOA 1U2VA 3QDKA 5AQYA 4FL9A 3R6MA 2IVNA 4QS7A 5F2RA 4PKHA 1T6CA 4BG8A 4BVPA 3CERA 4BG9A 5KQ8A 2PBDA 3O4WA 5AQUA 4H03B 2H3GX 3L0QA 2GTDA 3I8BA 4BR4A 2WUSA 1IG8A 3HTVA 2HMPA 3H3OB 2E88A 3VEWA 1X9JA 2D1KA 5CE3A 3JXUA 3UE5A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4JYAK 4JN4A 1N32K 5KTQA 4MO4A 1BUPA 3AVJA 2A1RA 3K9KA 1YT3A 3V9UA 1S22A 4N76A 2QWQA 1X9WA 4M3RA 4E0DA 4XH5A 3O1BA 1RTJA 1SQKA 3TAGA 1W0HA 5SWMA 1Z6RA 3FZMA 4B1WB 3HVRA 3F73A 3VQ9A 2W41A 1TKZA 1XNRK 3MEEA 4H5NA 5EU7A 1ESVA 1WAJA 3CCLN 5CZ2A 4EIAA 1RDDA 3TU5A 4B9QA 4KRFA 1ZC6A 2HNYA 4OGEA 1EQYA 2GUIA 4H8KA 3ALYA 3J7YP 3J81O 3O4QA 1NKEA 4DR7K 3U3GA 2NNWA 3QEVA 2NRWA 3OYBA 3S5TA 1J53A 3WXIA 2D0OA 3VQPA 2OTLN 3WEEB 1VQ7N 1EWQA 4AH9A 4C1NI 1ASWA 1NGJA 1SUQA 4BRHA 4CJEA 5AQZA 3H6EA 4DTUA 4KBOA 4B1ZA 3WNHA 3CQ8A 4FZZA 3VENA 3SCXA 4DFPA 1FKOA 3C65A 4AM7A 1IO2A 2V7YA 1YAGA 3C7NB 4I2PA 3TAPA 3L4QA 1BI4A 4B9VA 4ISGA 3TSQA 4RCHA 3DLHA 3PIOL 3TAQA 4I7FA 2Q36A 5CR4A 1D5AA 4FJMA 3D6RA 4MDBA 3HT3A 4B1XB 2O8EB 4KHYA 3QETA 1JXEA 1KVCA 1IH7A 3MMVA 4K43A 4PKGA 2ZGZA 1FW6A 1T8EA 4CZKA 1WSGA 3O3HA 3G4SN 3OYDA 3AGKA 5AQRA 3PX4A 1IV0A 5HP1A 4QAGA 4FW2A 2P9IA 1JJ2M 2NRHA 4F3OA 3OYCA 3AARA 4AHUA 3V1QA 4AHRA 5LJWA 1Q86O 3QERA 2XRIA 3MN6A 5JMVA 4BRPA 3LPUA 4CJ5A 3ZLJA 4CZGA 4H5VA 1L3UA 4RW4A 4KI4A 3OJSA 1VQ5N 2VGNA 4M42A 3HOTA 2G8KA 5C42A 2OPQA 3OS0A 3OJUA 2YHAA 4O0JA 4CHOA 1CLQA 1HNXK 2QA4N 4CHYA 4CZJA 4KI6A 3JYTA 3CHWA 3TPQA 2OPRA 4BR2A 1TVRA 3NH0A 4B3MK 4NLCA 3KK1A 5HRSA 3MXMA 4KH5A 5FPDA 4N41A 5BPNA 3S41A 3BZKA 4BRGA 4JEPA 3PX6A 4C8MA 2KZMA 3R8EA 1N36K 2VG7A 2VWJA 4RWTA 3MN5A 2UXDK 4DTNA 4M63C 2NUBA 1DKGD 4DS5A 3ZSRA 3TAEA 2HBLA 2P9NB 4JRQA 3QB0A 3HZ6A 3A5OC 2HHXA 4ILJA 4BWMA 3WXLA 2Y1IA 1NK4A 2Q0UA 4C8KA 1RT4A 1VQPN 5EXWA 1C0GA 2YNGA 1RBRA 3LL3A 2IVPA 2O8FB 4MLHA 2E2PA 3T1HK 4KHWA 2E8AA 5C10A 3VF2A 4DSFA 1ATNA 2CGJA 2QKBA 3HSCA 2EX3A 3QNOA 1L3VA 3HL8A 5IT9O 4B8CA 4FJHA 4H0YB 2F8TA 3ZSVA 1KVBA 4CJRA 2GEMA 3LP3A 1OVQA 2P9LA 2B5JA 3EL2A 2P9KB 3HPOA 3L2VA 1QE1A 5C2FA 4R79A 2XY5A 4FWQA 4YY3K 4LF9K 4MO5A 3VGMA 4K8XA 3LZIA 1SZ2A 3OYHA 2AP1A 1C0FA 1VQKN 5AQQA 3O9QA 4J2DA 4DR2K 4FWPA 3CJ1A 4WQ4A 2E2NA 4FLYA 1QHAA 3CFPA 2E6MA 2ITGA 3A5NC 1VSJA 3KIOA 3DXKA 5E26A 4BQLA 3VQBA 3HM9A 2QWOA 4DV3K 2BUPA 2YV0X 4FZXC 2HMIA 1BL3A 4XEIA 3PV8A 2X74A 4CFDA 4OO1J 3O6WA 3NCIA 1J5OA 3N4QA 4OLBA 3O8MA 3K59A 4C8LA 1VSMA 4K41A 3KWGA 2P51A 4JS4A 4E1MA 5M1KA 4V19S 4W5RA 4B9NA 4BECA 1EX4A 1NMNA 3FZKA 1QQNA 3T69A 4E7HA 1RT1A 2QWMA 3RMCA 4OLAA 4IEIA 1D9FA 3MWTA 4KB1A 1HKGA 1S1VA 2P9PB 2YHYA 1NGBA 4BRMA 4QOZB 4DFKA 3TR8A 5CHIA 2UU9K 4KPYA 5CY4A 4QS9A 5HOOA 3AVIA 1RBUA 3DLLL 1GOAA 3M8RA 4ISFA 4M3WA 4BR7A 3VQEA 4FJ9A 1S9EA 5C2DA 2NRXA 4RW8A 4NCBA 3VTHA 3CCVN 3HJFA 4FK0A 2CGKA 3ULDA 1OVYA 1NJYA 4WFAL 4YOWA 1HKCA 1W9HA 5CYMA 3NDKA 3L2QA 1YI2N 4ZHRA 3IRXA 4E1JA 1WN7A 3O9UA 4FJ8A 3OS2A 4JLHA 3QEPA 1W2BM 1UA1A 1NKCA 2VGMA 4O44A 4JI1K 2ZJPL 3EEQA 2OZMA 2LSNA 1TUYA 5JENA 3ZT3A 1RFQA 1BCOA 4F4KA 3F5TA 1VQ9N 2P9SB 4FLZA 1QVFM 5AZIB 4DR1K 3QLHA 4B8AB 3PO4A 3DAWA 1VQON 1FXXA 4E7IA 3T1AA 1BCMA 4ILHA 3K9JA 2E2OA 2J4RA 1BG3A 1GLLO 4DQ8A 3OYEA 3DWLA 1VSHA 5J2NA 4GV9A 2KHOA 2O4IA 3OA9A 4FOEA 3KKRA 3S3NA 1MWMA 1BU6O 1NGFA 3B6OA 1TYQA 3O9RA 4H5WA 1IKYA 2A40A 2VWKA 4DSEA 4BACA 1U2VB 1TKXA 4KH6A 3FZLA 3DXMA 2G8FA 1HRHA 3CMAN 1IJJA 1K9MO 5TKYA 1XC3A 3K5OA 3OBYA 5IWAK 1UA0A 3VQDA 4Q0BA 4BC4A 4CF1A 1Z25A 2DPNA 4BRAA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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