3MN7A

Structures of actin-bound wh2 domains of spire and the implication for filament nucleation
Total Genus 108
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
108
sequence length
371
structure length
359
Chain Sequence
VAALVVDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVSHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTEEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELKDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMEACGIHETTYNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Contractile protein/protein binding
molecule keywords Actin-5C
publication title Structures of actin-bound Wiskott-Aldrich syndrome protein homology 2 (WH2) domains of Spire and the implication for filament nucleation.
pubmed doi rcsb
source organism Drosophila melanogaster
total genus 108
structure length 359
sequence length 371
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-04-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3mn7A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3mn7A02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3mn7A03
3H3NO 5JLHA 4CZJA 2A42A 2P9PB 4CZFA 2A40A 4QS9A 2FSKA 4CJ7A 1NMDA 4FWQA 3L0QA 4JHDB 3R9PA 3VESA 2YCHA 3CJBA 1K8KB 1ATRA 3ID8A 4FL9A 2E1YA 5AQTA 3WXIA 3HZ6A 2HMPA 4BR4A 3FZLA 5EVZA 1KAYA 3VEYA 1HKCA 4BC4A 1HX1A 1LCUA 1RGIA 3JS6A 3VEVA 1YVNA 2YI1A 4BRNA 2EWSA 3H46O 4PKHA 2Q0UA 3CQXA 3DJCA 3EKUA 3KVGA 4CZIA 3UE5A 4XH5A 3MDQA 5EXWA 1C0FA 1TYQA 1GLLO 3MN7A 3CHWA 3HI0A 3QFPA 4ISGA 1KAZA 4EAHD 5AQYA 4ISFA 4C23A 4J8FA 5BRDA 3VF6A 5AQVA 4A61A 4A2BA 3VGMA 4FWSA 4PL8A 2QWOA 1KAXA 1SQKA 1YUWA 3D2EB 1XC3A 4H0YB 1HLUA 3ATUA 4M7YA 3VGKA 4H5WA 4A62A 2E88A 3JXUA 3OHRA 1NGGA 2P9UA 3LDLA 1XQSC 2E2OA 3FZHA 2E20A 4DQ8A 1ZXOA 2FSNA 4H0VB 1OKJA 4JD2A 3P4IA 4H0TB 3EL2A 4I6MA 4BR9A 5BPMA 2F9WA 2ITMA 4AM6A 3QMLA 4H5NA 5AQIA 5AZJA 4A2AA 3FZKA 4FWNA 4B1WB 1NGCA 2V7YA 4FSVA 4M63C 4WQ5C 4K41A 2HF4A 3VF4A 1V4SA 4FPAA 5AQQA 1X3NA 1MWMA 5AQHA 2BTFA 5FPNA 1BA1A 3FR0A 3LL3A 1YXQA 3UKRA 3WXLA 2FXUA 3BP8A 4CBUA 1JCFA 2GUPA 1NLVA 5AR0A 3I33A 3VEWA 3CJ9A 5EX5A 3J8AA 5AFUA 3O4WA 1GLEG 4BQZA 1C0GA 3ZEUA 3BEXA 3DXKB 3MN5A 3H1VX 4FWRA 5BN9A 1HKGA 3G25A 3MK6A 4RTFD 3WXKA 5AQXA 2QW9A 1V4TA 1JCEA 5AZIA 2ASOA 4NO7A 4IZ9A 2A5XA 3SMSA 5AQRA 5ADXA 3M1FA 2GWKA 2P9NB 1X3MA 3ZETB 2QWRA 5KPRA 3O80A 3GL1A 2CH6A 4B1ZA 1YAGA 2PAVA 3WEEB 3LDOA 3FFKB 3L4IA 3GOIA 1E4GT 2E2QA 3H1QA 3L6QA 2VWBA 2P9KA 4BREA 5AQOA 4DHYA 1NGAA 4MLHA 4BRGA 1WUAA 1NM1A 3QBWA 4PL7A 4JNEA 4MLEA 3EKSA 4H03B 2YJFA 1EQYA 3DXMB 1TUYA 2Q97A 5JLFA 2E2NA 3EO3A 3A5OC 3ULEA 2F9TA 1HUXA 2P9SB 1J6ZA 3GBTA 5JMVA 5ELZA 4CZEA 1NGDA 5EOYA 2ZF5O 2P9IB 1MDUB 4BRIA 3AAQA 5BPLA 3LM9A 3QFUA 3A0IX 3O1BA 3CERA 1ESVA 5F1XA 1GLAG 3RSEB 3SLCA 1ATSA 4CZLA 2IVNA 1GLJO 4RCHA 3FZMA 5AQMA 3UKUA 3BF3A 5KPTA 5F0XA 2QM1A 3B8AX 4XEIA 3VOVA 3A5NC 2NZTA 5AQSA 5BRFA 1CZAN 3D2FB 4XH1A 3CQYA 3H6EA 1P8ZA 2D1KA 4IWVA 3WQUA 4Y0WA 3GE1A 3TPQA 3CI5A 3U9DA 4HWIA 4QS7A 4H0XB 3EN9A 5BN8A 5AFUH 1NGIA 3HM8A 4BR5A 2FLOA 3CETA 4E1JA 3MN9A 3GG4A 1T6DA 4DB3A 1RFQA 4KBOA 2A6AA 4H0PA 2ASPA 4EHTA 4WQ5A 3VERA 3C7NB 3LDPA 4IJAA 4K43A 5AQZA 2W41A 4FOEA 5ADXH 4O8KA 5E84A 1U2VB 4CZKA 4BRLA 2YHYA 5FPDA 4NB4A 5BR9A 2E8AA 3VEZA 2P9PA 1S22A 1SZ2A 4GNIA 2IVOA 1BU6O 4BGBA 4BRHA 4BQLA 3VENA 3W3DA 5FPMA 3VPZA 3IDHA 4JHDA 2QXLA 3H45C 3IFRA 1K8KA 1HKBA 4AM7A 4MO4A 3VGLA 3CJ7A 4GY2B 4BR2A 4EIAA 3SJHA 4BRMA 4BROA 2YHWA 2QWMA 4PKIA 4WQ4C 1DGKN 5TKYA 1GLDG 5AQLA 5KQDA 4B1VA 5BRHA 3WQTA 1IG8A 2AP1A 3LDNA 3U8XA 4H5TA 4FO0A 5AQNA 3O1WA 3DWLA 2GELA 4DCHA 2GTDA 1GLFO 4CD1A 2P9LB 3MN6A 1SAZA 1NBWA 4CBXA 2A3ZA 1MA9B 2V51B 4HTLA 2E1ZA 3D2EA 2D4WA 4XH4A 2CGKA 5KQ8A 1DKGD 2WUSA 3LM2A 3R8EA 1ATNA 1BA0A 3C0BA 3CJAA 3ENOA 4BRCA 1Q18A 4BR7A 2E2PA 1Y64A 1NGBA 3U4LA 5E26A 3A8YA 5F2RA 2I7PA 1T6CA 1TYQB 4BG8A 4B1UB 4YDUC 1QQMA 3AY9A 2W40A 3VEXA 1XUPO 3F9MA 4IXCA 4B1XB 3R6MA 1BG3A 1T44A 1ZC6A 5AQUA 1BUPA 1HPMA 3A5LC 3UB5A 1E4FT 2ASMA 1NGFA 3O8MA 2GEMA 1QZ6A 4BRPA 2UYTA 1H1VA 2NLXA 4FWKA 2P9UB 2OANA 3FGUA 4CBWA 2AA4A 3VEOA 4JD2B 5KPZA 3MMVA 2Q36A 4I6MB 5I9EB 4CZMA 4F9OA 2HOEA 3VETA 1S3XA 5AZJB 4H0OA 2FSJA 3M6GA 3DXKA 4L3QA 3ENHA 3M3ZA 5CE3A 1Z05A 3HSCA 3AARA 4BRFA 2H3GX 2KHOA 2D0PA 4M7XA 2NRHA 4BRKA 3HBTA 4FWMA 2ZGYA 4FWPA 2P9LA 4JN4A 2QWPA 4BG9A 2ZGZA 1HJOA 2P9NA 4IJNA 3ZETA 4FWOA 1NGEA 3CJ1A 1QQOA 3UKRB 4B1YB 3O6WA 3LDQA 3WEEA 4O5FA 1D4XA 1GLCG 2IVPA 3ZX3A 5AQFA 5AQGA 1R59O 1LOTB 1TUUA 2FF6A 3ZEUB 2GWJA 3QB0A 3VF2A 1DEJA 2CGLA 2BUPA 2YJEA 1RDWX 3AAPA 1ZBSA 1BDGA 4WQ4A 4BVPA 2I7NA 4QS8A 1Z6RA 1GLBG 3DXMA 5AZIB 4BRAA 4MO5A 5JICA 3D7EO 4PKGA 2P9SA 4BC2A 2PBDA 2QWLA 1NGHA 4CI6A 3FLCO 1NWKA 1QHAA 4FWLA 2P9IA 5LY3A 2D0OA 3QICA 1G99A 5LJVA 2P9KB 4JAXA 4BR0A 3RSEA 3FE1A 2QWNA 4B9QA 4BRQA 3ZX0A 3EZWA 3I8BA 4BVOA 5BPNA 3IMXA 3S41A 3TU5A 2A41A 3HTVA 3DAWA 3WUHA 4IO8A 3SK3A 5AQWA 2YHXA 3ULEB 4WYBA 3QDKA 3D2FA 4YDUA 4K42A 3W0LA 2ZWHA 1MWKA 1KXPA 3ZX2A 5AQJA 5B8HA 3ATVA 3BUZB 5FPEA 3CIPA 4CD3A 1BWFO 4H5VA 2FF3B 3IUCA 3O08A 3H3OB 2HF3A 4K25A 3C7NA 4BC5A 3UKUB 4BC3A 1NGJA 1QQNA 2V7ZA 3CJCA 3FZFA 1BO5O 4Z94A 5AQKA 1WOQA 1U2VA 1IJJA 4FOIA 1QZ5A 1U6ZA 3SMPA 3WT0A 2CGJA 5LJWA 5AQPA 2VYPA 4ISEA 3KZBA 3BF1A 4LC9B 2Q1NA 4CZGA 4CZHA 4BGAA 2CH5A 4EFHA 2IIRA 3O5BA 3U9ZA 2J4RA 3A5MC 1X9JA 2V52B 4H5RA 2Q2RA 2QWQA 3QBXA 3MCPA 1BOTO 5BREA 5EY4A 3KHYA 2Q0RA 2DPNA 2Q31A 1JCGA 4BRDA 4EHUA 4RWTA 2VCPA 3WXJA 3GDQA 4FPBA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3H3NO 4ILJA 4DSFA 4FLWA 1XI1A 1MU2A 2A42A 1SL1A 2OTLN 2KW4A 4CZFA 2A40A 3AVHA 1YT3A 2FSKA 4FLZA 5JS1A 4FWQA 1N5YA 3CJBA 4FL9A 4U7BA 4DTOA 3K5NA 2BH1A 3FZLA 4CHOA 1JLFA 4HHTA 3HPOA 3V1RA 3AVFA 3TTFA 4JRQA 2PYJA 3JS6A 3VEVA 3P31A 1YTAA 2ETJA 3DI6A 3P1GA 1HMVA 4F4KA 3DJCA 3CQXA 3EKUA 2Z1JA 3ZT2A 1HRHA 4J2EA 3UE5A 3HPGA 3NDKA 3MDQA 4W5TA 1KD1O 1C0FA 2QEXN 1WSJA 3QINA 1RDAA 4LY7A 5BRDA 4CGIA 4A61A 1IKWA 3HPHA 1S1WA 3IAYA 1TK8A 1XC3A 1HLUA 3ATUA 3VQBA 5J2PA 1S6PA 2G8WA 2IOCA 3JXUA 4FVMA 3HOTA 2E5LK 2E20A 4DQ8A 1ZXOA 4H0VB 4JD2A 4H0TB 1WBDA 2NRWA 4IDKA 4OKJA 5BPMA 3SAHA 4BDZA 2ITMA 4J2DA 4M3RA 3FZKA 1OH8A 4FJ5A 1T7PA 2HMIA 3TABA 1Z26A 4FJXA 1HNIA 3RRHA 2RPIA 4PA1A 5C0YA 3PIOL 4FPAA 3HP6A 1OH7A 1KVBA 1MWMA 3ZT4A 3LALA 1JCFA 1NLVA 3PX4A 1VQ7N 3VEWA 3CJ9A 3J8AA 3O4WA 5KGWA 3T19A 1N34K 2ZD1A 2FBVA 4FWRA 1HNWK 2AJQA 3PSFA 3WXKA 2ITGA 5AQXA 3SNNA 5AZIA 4B9NA 4NO7A 2A5XA 2OPQA 4KHUA 2GWKA 2QWRA 4CF1A 1XC9A 3AA2A 4B1ZA 2PAVA 3VQQA 5GAHP 2HBKA 3QNNA 4EZ6A 2IDOA 4BE0A 4DTSA 3MCAB 3SZ2A 3H1QA 4O5BA 3SUOA 1NGAA 3KD5E 4JKBA 1S1UA 4KHPK 3EKSA 4DR7K 2YJFA 4X64K 3TAGA 3DXMB 4KHNA 1TUYA 4R79A 4KHYA 4NCBA 2F96A 2YKNA 2F9TA 3PLAA 1J6ZA 5FROA 3KKRA 5EOYA 2P9IB 1WLJA 3ITHA 3QFUA 5SWMA 1NJXA 3AVAA 4H4OA 4CFCA 3O9QA 4OX9K 2O8BA 3K5MA 5C10A 3MWPA 2QKKA 5KPTA 1N32K 1DTQA 4IEEA 4BY9C 3B8AX 4XEIA 3IRXA 3LANA 3A5NC 4CF9A 2NZTA 4B9VA 5AQSA 3HP9A 4AHUA 4DLEA 1DTTA 3CQYA 2D1KA 1XMQK 3CPEA 1C1AA 3U9DA 4CJLA 1HJRA 4H0XB 3EN9A 5BN8A 1NG9A 2FLOA 4E1JA 1BL3A 4KTWA 1T6DA 3ENBA 3NE6A 3KJVA 4JI5K 2Y1JA 2F4VK 1K8AO 4BECA 4IJAA 4Z4EA 4IKFA 5ADXH 4O8KA 2O8CB 4CZKA 4BE1A 5C2FA 4NXMK 4FM1A 1S1XA 2XHBA 3G0ZA 4E72A 5DK5A 4NCGA 4JEPA 4O4GA 3PO4A 4BRHA 3CC2N 3TTCA 4XJXA 4CGHA 1NKBA 3W3DA 4KPYA 3AVMA 3MWTA 4JHDA 2QXLA 3H45C 3KK7A 2HSTA 4AM7A 4MO4A 3VGLA 4YNQA 4DQIA 2WC9A 3SJHA 4CJWA 3OJSA 4E3SA 3BZKA 4BROA 3NF8A 1YF5L 2IGIA 4WQ4C 4NXNK 4YOWA 1HQUA 3DOLA 3QEVA 3LP3A 3U8XA 4H5TA 3MEDA 5AQNA 4DQSA 4B08A 4O44A 2GELA 2WBNA 2RKIA 4CD1A 1EWRA 5HROA 3KK1A 1NK4A 2A3ZA 4IFYA 4JKDA 3D2EA 3HL8A 3AO5A 1NU0A 2WUSA 4JKEA 2NRRA 1ATNA 1SKSA 2PFUA 5CY4A 5CYQA 1IKVA 4DV4K 4BR7A 2E2PA 5JENA 5F2RA 1E3MA 3TSUA 1T6CA 2VWJA 4BG8A 4FVUA 3M8QA 3VEXA 3BGRA 2HNYA 1WSFA 4B1XB 3ALYA 4FK2A 2KQ2A 2YHAA 3PX0A 1T44A 1BUPA 4F3TA 3SBGA 4OLAA 2C1GA 4BRPA 1RTIA 4JS4A 4UY8O 2NLXA 1UOCA 2OANA 3VEOA 4U67L 4DU1A 2WFBA 4FJ9A 3KLFA 3AO3A 4DTUA 5AZJB 2FSJA 2PYLA 3BDPA 3DMJA 2X74A 1Q82O 3HSCA 1LW0A 1VK0A 4M7XA 1X1PA 4CF2A 3RRGA 4FWMA 3NH0A 3CCJN 3O9SA 1TK0A 2QWPA 2P9NA 3ZETA 2I5JA 3T1HK 3CJ1A 1QQOA 3UKRB 4B1YB 4CJRA 4B8CA 3LPUA 3N4QA 4DS4A 1TAUA 1K73O 5AQGA 2FF6A 3ZEUB 3LPTA 3TSPA 2GWJA 2P1JA 1DEJA 1T8EA 2XY6A 2BUPA 4BVPA 4PY5A 1N6QA 3J7ZO 5J2NA 4C8LA 4EP4A 4LFCK 1HQEA 4J2BA 3LP0A 3M8PA 3P39A 5FLXO 2PBDA 3SUNA 4CI6A 5J1EA 5GIOA 1RDUA 3AO1A 5DM7L 1G99A 3HK2A 4BR0A 3KLEA 1OVQA 4OGEA 4B9QA 1VHXA 3EZWA 1RILA 5BPNA 3S41A 3TU5A 1GOBA 3PO5A 4KTQA 4Q0BA 2YHXA 3TARA 3NH2A 1RCHA 4WYBA 4DTPA 4JI2K 2O8FA 1C1CA 3D2FA 1QS4A 3ZSRA 1TKXA 4CGGA 3W0LA 2ZWHA 2E6MA 1KXPA 5KRTA 4YOVA 2RF2A 2NRVA 5HOOA 4FJ8A 2O4IA 3C94A 4LD0A 4DUYK 3LP1A 3IUCA 3Q7CA 4LFBK 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 1QHA A;  1BHL A;  2O4G A;  4CIG A;  4I9L A;  5LY3 A;  2D0O A;  4DSK A;  3EYZ A;  2JLE A;  3RSE A;  2YNH A;  3Q7B A;  4BRQ A;  3QES A;  4E7J A;  3OYD A;  3I8B A;  4ID1 A;  3MEE A;  4H4M A;  4BVO A;  1D8Y A;  1TGO A;  3HTV A;  1RT4 A;  4JKC A;  2VGM A;  4MDB A;  1HNX K;  5E41 A;  3KWI A;  4YDU A;  3THX B;  1IV0 A;  1MWK A;  4DR2 K;  3VQP A;  5JVH L;  3S3N A;  3AA5 X;  4FLY A;  3OVN A;  2G8I A;  3H08 A;  2FF3 B;  1L3S A;  3K9K A;  2HHX A;  1RDB A;  3O08 A;  2HF3 A;  3C7N A;  3LWM A;  3UKU B;  1S1T A;  1VQ6 N;  1NGJ A;  1QQN A;  2X6N A;  3CJC A;  3TTD A;  3L2V A;  4Z94 A;  4N5S A;  1HPZ A;  3K5L A;  3BZC A;  3HM9 A;  1VQP N;  5BR8 K;  3THW A;  3RMD A;  1VSL A;  2ZQB A;  2D0A A;  4JS5 A;  2CGJ A;  5LJW A;  3V9X A;  2VYP A;  2JGU A;  4ISE A;  4CZH A;  4BGA A;  4EFH A;  1BI4 A;  2ZE2 A;  2HHH K;  3A5M C;  4HCC A;  4DQP A;  2HBJ A;  3QIO A;  2FC0 A;  3PV8 A;  4FJI A;  3S9H A;  3OW2 M;  1BIU A;  3LAK A;  4BRD A;  4LF6 K;  2KKZ A;  2VCP A;  4B9S A;  1C0U A;  4FPB A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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