3MN9A

Structures of actin-bound wh2 domains of spire and the implication for filament nucleation
Total Genus 119
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
119
sequence length
371
structure length
360
Chain Sequence
VAALVVDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVSHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTEEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELKDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMEACGIHETTYNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structures of actin-bound Wiskott-Aldrich syndrome protein homology 2 (WH2) domains of Spire and the implication for filament nucleation.
pubmed doi rcsb
molecule tags Contractile protein/protein binding
source organism Drosophila melanogaster
molecule keywords Actin-5C
total genus 119
structure length 360
sequence length 371
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-04-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3mn9A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3mn9A02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3mn9A03
3BF1A 2H3GX 2YCHA 2D4WA 4BRFA 1HKCA 2P9PA 3SMSA 1XC3A 1T6CA 4H03B 3FLCO 2FSNA 5AQQA 3C0BA 5AQUA 1D4XA 1SZ2A 4IWVA 3S41A 3I33A 1E4GT 3O1BA 3A5OC 4B1YB 4BGAA 3GBTA 4BREA 5BPLA 1V4TA 3ATUA 3TPQA 3H6EA 4BRHA 1GLDG 3KZBA 4BRDA 3CQXA 1Y64A 3GG4A 5AQMA 5AQTA 2QWRA 3DJCA 2E1YA 3MK6A 1RDWX 3QB0A 5AQZA 3SMPA 2Q0RA 5EVZA 4FL9A 4ISFA 2QWOA 3AAQA 3VEXA 3MN7A 1BU6O 3I8BA 4JNEA 4CZFA 2ZGZA 4ISGA 1TUUA 1BO5O 2A3ZA 1V4SA 3W3DA 5AQOA 2Q2RA 3FE1A 1SAZA 3QFPA 2BTFA 3VGKA 3CJBA 2YHYA 3IDHA 3LDLA 1Z6RA 1JCGA 2V51B 3ZX3A 5F2RA 2P9LA 1GLCG 3HI0A 5EXWA 2YHWA 1XUPO 2GELA 3WXJA 1K8KA 4BRKA 2A41A 2YJEA 1KAXA 1EQYA 3FZHA 4JHDB 5FPDA 3H3NO 3IFRA 4HWIA 3A0IX 4FWQA 4BQLA 2P9UA 3VEYA 4CZHA 3ZEUA 1BA1A 5AQXA 3O1WA 4CZJA 1X9JA 3O08A 3LM2A 3WT0A 4BRCA 2VYPA 1DKGD 1YUWA 1BWFO 4O5FA 4H0YB 3A5LC 5AQYA 2VWBA 4CD1A 1KAZA 1BA0A 1KXPA 2P9IB 4CBUA 1WOQA 4MO5A 5AQSA 3ID8A 1HUXA 1K8KB 3WQUA 3J8AA 1ATNA 3LL3A 2DPNA 4BC5A 2ZWHA 3VOVA 2YJFA 1U2VA 2GTDA 3F9MA 3JXUA 4EAHD 3CHWA 2P9UB 4LC9B 3SJHA 5KPTA 1BUPA 5AQFA 1DEJA 4CZEA 3A8YA 1OKJA 2E8AA 4PKIA 5F1XA 3UKRA 4BRQA 3MN9A 4DB3A 2CGJA 1CZAN 3SK3A 1QQNA 2A40A 2V52B 3EN9A 4NO7A 4H0OA 4O8KA 2E2QA 2W41A 1HLUA 3H3OB 4EFHA 2IVOA 1NM1A 3M6GA 2E2OA 4E1JA 2F9WA 3EL2A 4M7YA 4H0XB 1JCFA 1GLJO 2E1ZA 3HBTA 1WUAA 2HF4A 2QW9A 3UKRB 4BRNA 5F0XA 2E88A 2D0OA 1NGAA 2QWMA 2F9TA 1GLAG 1MDUB 1YAGA 4MLHA 4BR0A 3H46O 4H5VA 1YXQA 4PL7A 3HZ6A 1NGHA 4BR7A 5EOYA 2Q97A 3O6WA 5EY4A 5FPEA 1MWMA 3O8MA 4WQ4A 4PKGA 4QS8A 1LOTB 1ZXOA 4HTLA 5AQLA 4A62A 1GLFO 2NLXA 4WYBA 3UKUB 4FWLA 5B8HA 3UE5A 1MA9B 3FZLA 1BOTO 3VF2A 4BQZA 2CGKA 1NGGA 5AQHA 4M7XA 4FWRA 3FZKA 3QFUA 2HF3A 3IUCA 4B1WB 4EHTA 2I7NA 2QWPA 2A5XA 3CETA 2E2NA 3LDPA 3SLCA 3ZETB 4JHDA 4C23A 3GL1A 4H5TA 3LDNA 3H1VX 5JLFA 2D0PA 4RTFD 4WQ4C 4H0VB 5JLHA 5LY3A 5BN9A 1S22A 4PKHA 1RFQA 1NGIA 4CBXA 4DHYA 2QWQA 4JAXA 3WXIA 2ITMA 5BRDA 2FF3B 4FWNA 5KPZA 4Y0WA 2FF6A 4BGBA 5AQRA 2ASMA 3UB5A 1LCUA 3FGUA 1GLLO 1NGFA 2FSKA 2P9IA 3KHYA 1NGEA 3L6QA 5AQKA 5EX5A 3O4WA 3R6MA 4FWPA 4MO4A 4DQ8A 4XEIA 4I6MB 2CH6A 4GNIA 3EO3A 3GOIA 3QBXA 1Z05A 4BR5A 2FLOA 1H1VA 2IVNA 3HTVA 2QWNA 5AQGA 2ASOA 5KQDA 2GUPA 3QMLA 3L4IA 4H5WA 3BP8A 2GEMA 5TKYA 3KVGA 3O5BA 4NB4A 1C0FA 2A6AA 3O80A 2FSJA 3TU5A 3ULEB 2ZF5O 1IG8A 3CQYA 2A42A 3GE1A 3ENHA 1GLEG 4BR2A 3U4LA 3WUHA 2GWKA 4BG9A 5BREA 4B9QA 4H5RA 3WXLA 3LDQA 5AQVA 1XQSC 4A61A 4WQ5A 4KBOA 2P9KB 4H0PA 4H5NA 1P8ZA 3P4IA 5LJWA 1X3NA 3VEWA 3M1FA 4A2BA 4CJ7A 4BG8A 1HKBA 3EZWA 1IJJA 1ZC6A 4CD3A 3VEOA 2I7PA 3HSCA 2Q1NA 4CZGA 1HX1A 1BG3A 3FFKB 4J8FA 1NGDA 3BEXA 2P9NA 5AQPA 3U9ZA 4QS9A 3UKUA 4BVOA 4PL8A 5BN8A 5AQWA 4FPBA 4BR9A 3CJ9A 2Q36A 3VETA 2D1KA 5CE3A 3D2EA 5BR9A 3VENA 3QBWA 3BF3A 4EIAA 3VGLA 4IXCA 1SQKA 4WQ5C 3VF4A 3D2FA 3R8EA 3U9DA 3HM8A 2WUSA 5LJVA 2QWLA 4GY2B 3AARA 3DXMB 3G25A 1QZ5A 5BRHA 1QQMA 5BPMA 1NLVA 2P9NB 5AZIB 1E4FT 3H45C 3ZETA 4MLEA 4BC3A 3VF6A 2YHXA 4FPAA 5E26A 5ADXH 5ADXA 1T44A 3A5NC 1HKGA 4CZIA 4XH1A 3D2EB 3QDKA 3WQTA 5JMVA 1KAYA 2W40A 4RWTA 3D2FB 1T6DA 2EWSA 4IO8A 4JN4A 1C0GA 4XH4A 3MMVA 2P9SB 2V7ZA 1ESVA 5AZJB 4FWOA 3ZX2A 3VPZA 1NGBA 5KQ8A 2QXLA 3B8AX 3D7EO 4I6MA 4B1XB 2PAVA 2AP1A 1NWKA 1ATRA 4BRAA 4BC4A 4BRPA 3U8XA 2P9PB 5E84A 4XH5A 1S3XA 3R9PA 4CBWA 1JCEA 4M63C 4JD2A 3LDOA 3IMXA 3CJCA 5BRFA 3BUZB 4FSVA 1TYQA 5I9EB 4BC2A 3EKUA 3ULEA 1ATSA 3WXKA 2NZTA 5JICA 1DGKN 4BRIA 4CZMA 2Q0UA 4BR4A 4YDUA 2YI1A 1QZ6A 3CJ7A 4B1ZA 1NMDA 3FZFA 4L3QA 3H1QA 4K41A 3VGMA 3L0QA 3VERA 4FO0A 2E20A 2P9KA 4FWKA 5KPRA 1QQOA 4IZ9A 4JD2B 4CI6A 4FWMA 5AQIA 3CJ1A 3ENOA 3WEEA 2HOEA 1HPMA 1TYQB 2KHOA 1HJOA 1BDGA 3ZX0A 4AM6A 2IVPA 3CI5A 4IJNA 2UYTA 2PBDA 2V7YA 2CGLA 3MN6A 3DAWA 3RSEA 2QM1A 2OANA 3EKSA 4FWSA 2FXUA 3C7NA 4Z94A 3AAPA 4CZKA 4DCHA 5AQJA 3MDQA 2Q31A 1TUYA 4YDUC 3DXKA 4K25A 1Q18A 2P9LB 3LM9A 4B1VA 2BUPA 1X3MA 4FOEA 5AFUH 5AFUA 1NGCA 1YVNA 3GDQA 5AQNA 2HMPA 3WEEB 4BVPA 4QS7A 2J4RA 3DWLA 4RCHA 2CH5A 2ASPA 3VEVA 1G99A 2VCPA 4K42A 3FZMA 3MCPA 4H0TB 3CJAA 1MWKA 3W0LA 4F9OA 1R59O 1QHAA 3DXMA 4BRMA 1ZBSA 3OHRA 3ZEUB 4ISEA 5AZIA 2NRHA 3RSEB 4B1UB 1U6ZA 3JS6A 3M3ZA 5BPNA 3C7NB 4IJAA 5ELZA 2AA4A 4EHUA 2IIRA 5FPMA 4BRLA 4BRGA 3ATVA 4BROA 3DXKB 4CZLA 2ZGYA 2E2PA 5AR0A 3CIPA 3QICA 1NBWA 3VESA 3AY9A 4AM7A 5FPNA 2P9SA 4FOIA 5AZJA 1U2VB 3MN5A 1NGJA 3CERA 3VEZA 2GWJA 3FR0A 1RGIA 3A5MC 1J6ZA 1GLBG 4K43A 4A2AA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3BF1A 1KD1O 2H3GX 4CJEA 1Z26A 4MDAA 4DTNA 1T6CA 3LP3A 1QSLA 4DSLA 4H03B 1W97L 3FLCO 2FSNA 4TSXA 3KLFA 3DI6A 1D4XA 4IWVA 3M8QA 4RW8A 4BY9C 2O4IA 2HHWA 3A5OC 4CCHA 1WBDA 3GBTA 4BREA 2X74A 1SKWA 3H6EA 5FLXO 3LZIA 2JGUA 1HQEA 3VQBA 4RW9A 3CXCM 5AQMA 3C65A 4CHPA 2NRRA 2E1YA 1Y97A 1KSPA 3M8PA 1RDWX 3QB0A 1RT5A 3KK2A 2I5JA 4KB0A 5EVZA 4FL9A 1W0HA 3O4QA 2WTUA 4Y1CA 2B5JA 1BU6O 1RDDA 2D0AA 1WN7A 3L4QA 4DLEA 4AHVA 1SAZA 5JVHL 3AGRA 2HHHK 3LDLA 1JCGA 5F2RA 2P9LA 1NK8A 2YHWA 2YX6A 2KTQA 3WXJA 4CEZA 1O1WA 3K9JA 4BRKA 1FKPA 4Q5VA 1EQYA 5FPDA 3H3NO 1ASUA 4A57A 1RBSA 4CF8A 4FWQA 4BQLA 5KTQA 3TAQA 4CZHA 1B92A 1N33K 3DLLL 3O08A 3LM2A 3WT0A 3P39A 4IKFA 2G8VA 4IFYA 3CM5A 1BIZA 1YUWA 5HRSA 3A5LC 2VWBA 5C12A 1SKRA 3LPUA 3S9HA 4A5BA 3MWPA 3PX0A 1HUXA 5C2FA 3WQUA 3QNOA 1XMQK 3J8AA 1ATNA 2ZE2A 3LL3A 3LP0A 2HVIA 4BE2A 3CHWA 4DR5K 1HNVA 4F4KA 1CZBA 1OKJA 2E8AA 4FK0A 1VQ4N 2OTLN 4Z4GA 1WBBA 3HJFA 4YOTA 4DTSA 3DRRA 5LL6Z 4H0OA 2UXDK 1IV0A 2IVOA 5SWMA 1KRPA 3V9WA 3M6GA 3SNNA 3NF9A 4OLAA 4M45A 4M7YA 1JCFA 5M1NA 4DF8A 1GLJO 1C0MA 4CEQA 2QKKA 1WUAA 3O3HA 3MX5A 4BRNA 1S72N 3TSUA 5BR8K 2F9TA 3OTOK 1UOCA 1YAGA 3H46O 4H5VA 4PL7A 2W00A 2HBKA 3IS9A 3SCXA 4M3XA 5EY4A 4JI1K 4H8KA 5FPEA 4WQ4A 1FW6A 1ZXOA 2HNYA 2YNGA 3UKUB 5B8HA 3TAMA 1JLAA 3SJJA 5DM6L 3VQ5A 3SYZA 4DR3K 2CGKA 3LAKA 4KPYA 2ATQA 4DQQA 5AQHA 4BEBA 1EX4A 4FWRA 3D6RA 3RWUA 3G6EN 4B1WB 3AO1A 4FW1A 1U47A 2A1SA 1S6PA 1L3UA 4FZYA 3VQEA 4FJIA 1TK5A 5C0YA 1VQNN 4E7LA 3H08A 4F8RA 4B3OA 3LDNA 3WNEA 3PO4A 4KI6A 2D0BA 4WQ4C 1ZYQA 4JKCA 1VQ6N 4DHYA 2KFZA 3WXIA 2RN2A 3BY5A 3OYLA 1HMVA 4FWNA 4AHTA 4Y0WA 2FF6A 4BGBA 1S9EA 2DFHA 1C1AA 2FSKA 3QEWA 1NGEA 3L6QA 1VQ7N 3TI0A 4CJPA 3O4WA 1EWRA 3OA9A 3R6MA 4YHHK 4MO4A 3I0SA 1K8AO 1S1UA 3OYAA 4X66K 5AQGA 4OX9K 4WFBL 2O8DA 3L4IA 4H5WA 2GEMA 4OKKA 3QEXA 2A6AA 1NKEA 3RR8A 1BHLA 3QEPA 3CD6N 3KJVA 1RT6A 3E66A 1WAJA 5CZ1A 4KHPK 5K14A 1NK0A 4CGJA 3MECA 4O44A 3TAGA 1N32K 4X62K 1VSKA 3ISNC 3V1OA 1S1WA 4Z4IA 4B9QA 4H5RA 4LFAK 3LDQA 2UU9K 5FROA 1EETA 2P1JA 4WQ5A 4I9LA 3LPTA 2O8DB 4UY8O 5LJWA 2LSNA 2FBTA 4XIUA 3BZCA 3IKMA 4NXMK 3HXMA 5C10A 1Q9YA 1VQLN 5C24A 4CGIA 2I7PA 3HSCA 4FJGA 1BG3A 2C1IA 4XJXA 1N5YA 4M3WA 3SQ2A 3KKSA 4BVOA 1KLNA 5AQWA 2RPIA 1CZ9A 1OVQA 3ZSRA 3CJ9A 3K9KA 4R5PA 3AO3A 3VETA 4Z4EA 3VGLA 4FVUA 4IXCA 3S3NA 1IKYA 4WQ5C 3VF4A 3RMBA 3DM2A 4IFEA 3VQ4A 5BPMA 1Q86O 1WSIA 1DTQA 1YJWN 3KK7A 4LSNA 4FPAA 3V81A 1T44A 1HKGA 5CYMA 3QDKA 4DFMA 3K57A 3PV8A 2O4GA 2EWSA 1Q82O 4DQPA 1C0GA 4XH4A 3MMVA 3ALYA 4QAGA 5AZJB 3THXB 1X9MA 4GW6A 3ZX2A 4O0JA 1NGBA 2F96A 4CGHA 3LDSA 3T69A 4I6MA 4B1XB 3HP6A 2F7TA 2AP1A 1YJ9N 5M1FA 3TARA 4X65K 3QERA 4CIEA 4BRAA 1NJZA 2XY6A 5E84A 1I3AA 1S3XA 3AVFA 1JXBA 1JCEA 4DR4K 3BUZB 1YTUA 1TYQA 3OYNA 4BC2A 3ULEA 3AVJA 3WXKA 3TTCA 5EU7A 4PWDA 2DFFA 4CJUA 3CJ7A 4B9TA 3HPOA 5M1OA 1YIJN 1G15A 1ZBUA 4K41A 3QO9A 4FJ7A 4BDYA 2E20A 4B8CA 1T3VA 3OW2M 4JRQA 2OPQA 4IZ9A 4CK2A 4CI6A 2NRWA 3P83D 2WONA 1KC8O 3R1XA 3ZSZA 1TYQB 2HHXA 1HJOA 3T1YK 3AVAA 3NMUA 3C6HA 3DRSA 3ULDA 3NDKA 1ZBIA 2QM1A 3KLHA 3CMEN 4FJNA 3EKSA 2FXUA 1KVCA 3AAPA 1ASVA 3AA2A 5HL7L 1SL2A 3CCQN 3HOTA 3HT3A 3DXKA 3LM9A 5AFUH 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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