3MN9A

Structures of actin-bound wh2 domains of spire and the implication for filament nucleation
Total Genus 119
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
119
sequence length
371
structure length
360
Chain Sequence
VAALVVDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVSHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTEEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELKDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMEACGIHETTYNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Contractile protein/protein binding
molecule keywords Actin-5C
publication title Structures of actin-bound Wiskott-Aldrich syndrome protein homology 2 (WH2) domains of Spire and the implication for filament nucleation.
pubmed doi rcsb
source organism Drosophila melanogaster
total genus 119
structure length 360
sequence length 371
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-04-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3mn9A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3mn9A02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3mn9A03
3WEEA 2J4RA 2VYPA 3JXUA 4BRCA 3GDQA 1U6ZA 3EN9A 2HMPA 3HM8A 4B1VA 3GL1A 4B1XB 3UKUA 3R9PA 2P9IA 4A61A 3ULEA 5AQXA 5KQ8A 2VWBA 1SAZA 4BRNA 5BN8A 4MO5A 3FZKA 1KAYA 3I33A 3MDQA 1BDGA 4K41A 5E26A 1LOTB 4K25A 3O6WA 5AZJB 1KAZA 1RGIA 1ZBSA 4CZIA 1EQYA 1HKGA 5F2RA 1QQMA 2Q0UA 3FGUA 2F9TA 4H5NA 4GNIA 4EHUA 5BR9A 3W0LA 3CQYA 3ENOA 3WXKA 4WQ5A 2FLOA 2A41A 3BF1A 2FF6A 3CETA 4H0VB 3VERA 4H5TA 3SK3A 3BP8A 5LY3A 3A5OC 3B8AX 4I6MA 4JD2A 4FOEA 1XUPO 4QS9A 2A6AA 5FPMA 1WUAA 4EIAA 5BRFA 4CD3A 3M1FA 5AZIA 4DHYA 3MMVA 3VEZA 2P9LB 3A5MC 3VEVA 5F0XA 4BRGA 2E88A 1GLAG 2E8AA 4CZEA 4FWPA 1Z05A 3CHWA 2P9NA 3HI0A 4L3QA 3ATUA 4B9QA 3VF6A 3FFKB 2YJFA 1ESVA 3FZMA 1T44A 1BG3A 1QHAA 2IVNA 5TKYA 4GY2B 3DJCA 2QWMA 4YDUA 3CIPA 3MK6A 5JLHA 3R8EA 2ZGZA 5JMVA 4WQ4A 1BOTO 2NRHA 3DXKB 1X3MA 3ZX3A 1KAXA 3W3DA 4H5VA 2H3GX 3VEOA 4ISFA 5ADXH 3CJCA 4JN4A 4BVOA 4M7XA 3ZX0A 3D7EO 3MN5A 3S41A 3KHYA 5BRDA 3QFPA 1ATSA 2Q36A 1BA1A 1IG8A 3BF3A 1YXQA 2FSJA 4DQ8A 1HPMA 1S3XA 2P9LA 2P9UA 4FPBA 5BREA 1SQKA 4B1UB 4RCHA 2CH6A 3IDHA 4J8FA 3L6QA 4FWOA 1GLEG 3ZEUA 1E4GT 3UB5A 2KHOA 4BR0A 2P9KB 3EO3A 4BRDA 4CI6A 3O8MA 4QS8A 4XEIA 2P9SA 5F1XA 2GWKA 4CZMA 5BRHA 4WYBA 3CERA 4F9OA 4PKIA 3CI5A 1JCEA 1C0GA 1NGEA 3ID8A 2I7NA 3BUZB 2P9PB 5AQLA 2FSNA 5I9EB 2D1KA 4IZ9A 2BUPA 3TU5A 4A2BA 5AQUA 1BO5O 3LL3A 3VETA 4CBXA 1ZXOA 4BRAA 2OANA 5KPZA 3VEWA 3HTVA 5AQFA 3EZWA 4BRHA 5BPLA 4I6MB 4JD2B 3LM2A 4BRPA 2GTDA 3C7NB 1NGAA 3O1BA 2A3ZA 1BA0A 1OKJA 3HSCA 5AZIB 3LDOA 4XH4A 2E1ZA 4FL9A 3FZFA 4CBWA 3VESA 3QFUA 2FSKA 5AQWA 2P9NB 2QM1A 2P9KA 4IXCA 3VOVA 1DKGD 1YAGA 1NGGA 5EY4A 4RWTA 4BVPA 2QWQA 4EHTA 3AAQA 4H0TB 4Z94A 5AQPA 4BR5A 2GELA 1NGJA 3TPQA 4EAHD 4BR4A 1ATRA 2P9PA 3KVGA 3H1VX 2IVPA 3EKUA 2E2OA 1HX1A 3MN6A 4LC9B 1G99A 2GEMA 4BC4A 3IMXA 2W41A 3H1QA 5AQIA 2A5XA 4M63C 4MLHA 4PL7A 1BWFO 5AFUH 1HLUA 2NZTA 3CJ1A 3ZETA 3A8YA 3C7NA 4H5WA 4IWVA 3WXJA 2P9UB 1BUPA 1ZC6A 3D2FA 3DXMB 4FWSA 5AQHA 3WQUA 4BRMA 4BQZA 1H1VA 3LDQA 1ATNA 2QWRA 3CJ9A 5AQNA 3ZEUB 1TUYA 1NMDA 4K42A 4CZKA 2BTFA 3VGMA 5JLFA 3CJAA 3KZBA 3OHRA 3QDKA 5AQGA 3O1WA 3RSEB 2P9SB 2Q2RA 1QQOA 1NGIA 2PBDA 1V4TA 2YCHA 1TYQA 2CGKA 4BRIA 4FSVA 3SMPA 3VF4A 3I8BA 4AM7A 2A42A 1CZAN 4XH1A 3VF2A 1MDUB 1NGHA 2YHWA 1NLVA 3VGKA 4MLEA 2Q0RA 3H6EA 4RTFD 1NGFA 3A5LC 3WUHA 2E20A 5AQRA 5EX5A 1NGCA 3R6MA 3IFRA 4QS7A 3DXMA 4BC5A 1GLLO 1X9JA 3JS6A 3LDNA 2ITMA 4FPAA 5ELZA 4JAXA 5AQQA 4FWQA 2F9WA 3O5BA 2QXLA 3RSEA 4IJAA 1RDWX 4WQ5C 5E84A 4B1YB 2D4WA 5AQKA 4B1ZA 4BREA 5AQVA 2CGLA 2QWNA 2HOEA 1T6CA 4IO8A 4IJNA 3GG4A 3CQXA 4CZFA 1TUUA 1NWKA 5LJVA 1HUXA 4BG9A 1RFQA 1YUWA 1X3NA 1MWMA 1P8ZA 1XQSC 4AM6A 2QWPA 3AAPA 2V7YA 3LDPA 3O4WA 2Q1NA 4C23A 1E4FT 3C0BA 4FWMA 3VEYA 2E2QA 3FE1A 4A62A 3G25A 1QZ6A 4FWNA 3ZETB 3CJ7A 2ZF5O 4H03B 5BPNA 3D2FB 3A0IX 1XC3A 2E2NA 1DEJA 2Q31A 2FF3B 4BROA 4BRQA 5ADXA 3H3NO 1Q18A 4CZHA 1KXPA 1K8KB 1HJOA 2QWLA 2Q97A 3HBTA 1QZ5A 4WQ4C 3MN9A 3GOIA 1JCFA 2HF4A 3D2EB 5AQMA 3VPZA 1TYQB 2ZGYA 5CE3A 4PL8A 1Z6RA 4CJ7A 3HZ6A 1NM1A 2AA4A 4FWKA 4K43A 4CZJA 3M3ZA 1MWKA 4DB3A 4EFHA 4A2AA 5AQJA 5AQSA 2UYTA 1U2VB 2ASMA 4Y0WA 4BR9A 3P4IA 4FO0A 1D4XA 2V7ZA 3SMSA 2V51B 3FZHA 2ASPA 2DPNA 2V52B 3U8XA 5KQDA 3IUCA 5AQYA 4BR7A 4ISGA 2VCPA 3M6GA 4CBUA 1R59O 4BR2A 3FZLA 4BRLA 5AR0A 5EVZA 3QBXA 1K8KA 3U9ZA 3L4IA 3VGLA 5AQZA 5KPRA 3QMLA 1WOQA 2D0OA 3MN7A 4JHDB 4E1JA 5AQTA 1SZ2A 4CD1A 1S22A 3D2EA 5KPTA 2NLXA 3H46O 4BRKA 4FWLA 2FXUA 1DGKN 4FOIA 4JNEA 4CZGA 5FPNA 3EKSA 4CZLA 4FWRA 3LM9A 3QB0A 4ISEA 1LCUA 1MA9B 1NGBA 2QWOA 1J6ZA 2YHXA 2D0PA 4BRFA 4MO4A 3BEXA 3WT0A 3UKRB 2AP1A 1U2VA 4PKHA 2ASOA 3QICA 2E2PA 4M7YA 5AZJA 1HKBA 4BC3A 3U4LA 4NO7A 3O08A 5FPDA 2IIRA 3LDLA 5JICA 1T6DA 2A40A 3FR0A 1GLDG 3ATVA 4PKGA 5AQOA 4HTLA 3O80A 2HF3A 4H0PA 4JHDA 4H0YB 4H0XB 4BGAA 1NBWA 4H5RA 5AFUA 1YVNA 5LJWA 3ENHA 1Y64A 5FPEA 3VENA 3WEEB 2QW9A 4BG8A 5BPMA 2I7PA 2E1YA 1GLBG 3SJHA 3VEXA 3H45C 1V4SA 5B8HA 5EXWA 1QQNA 1GLFO 3MCPA 4XH5A 3UKUB 1C0FA 2GUPA 2P9IB 3GE1A 3H3OB 4O8KA 3J8AA 3L0QA 4NB4A 1BU6O 3ULEB 3ZX2A 3A5NC 3QBWA 3WQTA 3AY9A 1HKCA 1IJJA 3UKRA 4BGBA 4DCHA 2IVOA 3UE5A 2W40A 3CJBA 2PAVA 4H0OA 4HWIA 3FLCO 1JCGA 2CH5A 2CGJA 2YJEA 3WXIA 3GBTA 4KBOA 3WXLA 4B1WB 3DWLA 2WUSA 3DAWA 3DXKA 1GLJO 4YDUC 3SLCA 3EL2A 3AARA 2YI1A 3F9MA 5BN9A 2EWSA 4BQLA 3U9DA 4BC2A 1NGDA 1GLCG 5EOYA 4O5FA 2GWJA 2ZWHA 2YHYA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2BANA 3O9TA 3MXIA 1NU0A 3EN9A 2VQEK 2HMPA 1YI2N 1KTQA 3C6UA 4B1VA 1VSFA 3DLLL 3R9PA 4A61A 3D0PA 3C6HA 5KQ8A 3TSPA 3FZKA 1KAYA 3MDQA 4M3RA 5TKWA 5AZJB 4CZIA 3FGUA 4H5NA 4GNIA 4LF4K 4DFMA 3QEPA 4JI1K 3KWGA 4CF1A 4CF9A 3CQYA 1T05A 3ENOA 2HHVA 1XHXA 4WQ5A 5LL6Z 3OA9A 3BF1A 2IOCA 2FF6A 3CETA 3ZSYA 5LY3A 2JLEA 4BE2A 3A5OC 3B8AX 4CK2A 4DG1A 4I6MA 2IDOA 1RDCA 2KZZA 2A6AA 4FVUA 1U04A 2OPSA 3MMVA 3VEVA 3A5MC 1RILA 4XJXA 2E88A 1KFDA 3R1XA 3LDSA 4CZEA 3THWA 3CHWA 5IT9O 3V81A 3VQ4A 4C8KA 4FJKA 3OYHA 4ELTA 3FFKB 3B6OA 4KRFA 3CMEN 3LP3A 3HXMA 4GY2B 3P38A 4JI7K 4W5NA 4YDUA 3LP2A 1XHZA 4DQIA 4JRPA 2WONA 4WQ4A 4LF6K 2GBZA 4N47A 1KAXA 3M8SA 2HHQA 3W3DA 3NGIA 1G15A 5ADXH 4JN4A 1HR0K 1XNQK 2F8SA 4M7XA 4EP5A 3ZX0A 3MN5A 3S41A 4IO9L 3KHYA 4RW9A 1ATSA 2Q36A 4HTUA 1K9MO 3BF3A 2RE2A 1WBBA 2VG6A 1HPMA 3HOTA 4FPBA 2QTDA 2YNFA 4DV3K 4PA1A 1LWCA 4NLCA 2G8HA 1HPZA 3ZEUA 3UB5A 4YOYA 3QINA 4DV6K 4GVMA 3EO3A 4CI6A 3S9HA 2P9SA 5DM7L 4O5BA 4CZMA 3OY9A 4G9ZA 1YF5L 4GKKK 4F9OA 3CCQN 1HNXK 2W00A 1JXEA 1JCEA 2O8CA 2I7NA 4B3RK 5AQLA 2BUPA 3NHGA 4LF7K 3LZJA 1BO5O 4AHRA 2XY6A 4BRAA 5KPZA 3HTVA 3MWPA 3CPEA 4DQQA 1VHXA 1Z26A 2GTDA 3VQ7A 4BRPA 3O1BA 4JKBA 4DF8A 3HSCA 3NVMA 5AZIB 4FJJA 4OGCA 4XH4A 3THVA 4CBWA 5GAHP 3DLRA 3LAKA 2FSKA 1C1AA 1WSFA 3KLFA 2HBKA 3OYIA 1RTDA 4CIEA 1NGGA 5EY4A 3AAQA 4FLVA 1Z25A 4W5OA 1RNHA 1RDDA 3QESA 1BL3A 4CHZA 4CJLA 1W9HA 3ID6A 1ATRA 1DLOA 2E2OA 3MN6A 1UA1A 1EWRA 1NNEA 3CM5A 1VQKN 3SZ2A 5AQIA 4CJKA 1WSHA 1HLUA 1C1BA 2NZTA 3C7NA 4ID1A 4H5WA 2VGNA 3HP6A 4OPHA 3K9KA 5AQHA 4CK3A 3WQUA 4BRMA 4HCBA 2QWRA 5J2PA 2BTFA 3ZSRA 3DLKA 4CHPA 5FRNA 4JKFA 4RW7A 4CESA 2F8TA 4BE1A 2PBDA 2YCHA 1VSHA 3OYMA 1KD1O 1IV0A 1JL2A 4FYDA 5LMUK 4FSVA 4KB1A 1BCOA 4BECA 4AM7A 4PWDA 2O8BA 4KPYA 4V19S 1CZAN 4XH1A 1MDUB 4B9TA 3NBPA 1NLVA 4J2AA 4O4GA 4DV4K 1IH7A 3AVBA 4H8KA 3C94A 1S6QA 3CFOA 4RTFD 1KSPA 3TTDA 3WUHA 3ZSWA 1YHQN 3SQ4A 2ATQA 3E9PA 5EX5A 3IFRA 1VQ7N 4BC5A 3JS6A 2OTLN 3SV4A 2PYJA 3QO9A 5ELZA 3TARA 4OLBA 3ISNC 3RSEA 1BQNA 1S1WA 1I3AA 4ZTFA 4BREA 5AQVA 1TKZA 4B9MA 4KFBA 3GG4A 2XY5A 1HMVA 1HUXA 3RWUA 1RFQA 1XQSC 3ZT4A 4F3OA 3O4WA 4C23A 4CGGA 4LD0A 4B3SK 4YNQA 4FCYA 4A62A 3DRSA 3AO3A 4JK9A 3NAEA 3KK3A 1VQPN 4M3XA 1ILYA 3CJ7A 3VMFB 4H03B 1VQ6N 3D2FB 1YIJN 3NH2A 3SQ2A 4B3TK 4BRQA 4HUEA 3H3NO 3RTVA 1KXPA 1K8KB 1HJOA 1QZ5A 2JWKA 3MN9A 4KHQA 3LAMA 5C15A 1J53A 1S1VA 5AQMA 1YTAA 4F3TA 4OO1J 1Z6RA 4CJ7A 2BH1A 2FBXA 4JI3K 2WBNA 3LP1A 5GIPA 4CJQA 4FXDA 2WTUA 4YOTA 1SL1A 2G8IA 2O8DA 4CZJA 4K8XA 1J5OA 4A2AA 5JS1A 3NMUA 5AQSA 4JK7A 4Y0WA 1D4XA 1LAVA 2V7ZA 4IFYA 4Y1DA 2V51B 3FZHA 1IBLK 4CERA 4NXNK 5KQDA 2NRTA 3B6PA 4ISGA 2P5OA 3AO2A 4Q5VA 2O8FB 3C6AA 1N6QA 3LZIA 4X62K 3RRHA 1VQNN 2FBYA 3MEEA 2D0OA 4KH6A 3J80O 4QAGA 3H08A 1WLJA 1S22A 3O9RA 4QOZB 4FWLA 1DGKN 5HOOA 3LANA 4JNEA 3EKSA 1S1XA 3TSUA 3CCSN 1S72N 2YHXA 4JK8A 1Y97A 4JV5K 4BRFA 4B3OA 3IAYA 3BEXA 1BQMA 1S9GA 3PSFA 2AP1A 4DSJA 2E2PA 2HHTA 1HJRA 1HKBA 3U4LA 4B3MK 3OYEA 3LDLA 3NF6A 1ZYQA 3V4IA 2BDPA 1HRHA 5KRTA 4PKGA 3ATVA 4DS4A 4H4OA 1VRUA 2HF3A 3CQ8A 4KHSA 4E3SA 2G8WA 4JHDA 1GOCA 1YT3A 3ZT3A 5C12A 1D8YA 1IKYA 2QW9A 4BG8A 3G4SN 1HYSA 1GLBG 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 3TAG A;  1VQ9 N;  1J6Z A;  2D0P A;  2QXF A;  4MO4 A;  3CYM A;  3AGR A;  1VSD A;  4PKH A;  2G8V A;  3RRG A;  2HBJ A;  4LFB K;  4CHO A;  1TK8 A;  4JI6 K;  4HVJ A;  2DFH A;  5CY4 A;  4KHP K;  5FPD A;  2IIR A;  4QCL A;  4YOV A;  4FJG A;  2NNW A;  3L4Q A;  4CGJ A;  3FR0 A;  3L2Q A;  2JGU A;  4HTL A;  3O80 A;  1NOY A;  4H0P A;  3E01 A;  4FVM A;  4DR5 K;  3OYC A;  1IBM K;  1NBW A;  4H5R A;  2R7Y A;  4YOX A;  4DTR A;  3L2U A;  4Q0B A;  1CXU A;  2O8E A;  3WEE B;  1C0T A;  2W6L A;  5BPM A;  1U45 A;  1V4S A;  1QQN A;  1JLG A;  4CHY A;  4XH5 A;  1C0F A;  1FW6 A;  4NB4 A;  4LSL A;  4FJ5 A;  3QBW A;  3WQT A;  3O9U A;  4M3Z A;  4BEB A;  1IJJ A;  1HKC A;  1U4B A;  2ZQB A;  3KLH A;  3MWT A;  3TR8 A;  4ELU A;  1VQM N;  4BGB A;  2A1R A;  4CVN E;  1W97 L;  4DR6 K;  3UE5 A;  4H0O A;  3ZSV A;  4HWI A;  3FLC O;  2ZE2 A;  1JCG A;  5M1N A;  3SUN A;  4DV0 K;  3DWL A;  4B9U A;  2WUS A;  4CFA A;  1HNZ K;  1GLJ O;  3SLC A;  3F9M A;  2EWS A;  5GAD P;  3U9D A;  4FM1 A;  4O5F A;  2GWJ A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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