3RSEB

Structural and biochemical characterization of two binding sites for nucleation promoting factor wasp-vca on arp2/3 complex
Total Genus 52
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
52
sequence length
196
structure length
196
Chain Sequence
GVVVDSGDGVTHICPVYEGFSLPHLTRRLDIAGRDITRYLIKLLLLRGYAFNHSADFETVRMIKEKLCYVGYNIEQEQKLALETTVLVESYTLPDGRIIKVGGERFEAPEALFQPHLINVEGVGVAELLFNTIQAADIDTRSEFYKHIVLSGGSTMYPGLPSRLERELKQLYLERVLKGDVEKLSKFKIRIEDPPR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Structural protein
molecule keywords Actin-related protein 3
publication title Structural and biochemical characterization of two binding sites for nucleation-promoting factor WASp-VCA on Arp2/3 complex.
pubmed doi rcsb
source organism Bos taurus
total genus 52
structure length 196
sequence length 196
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-05-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3rseB01
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3rseB02
1H1VA 1NGIA 1HUXA 1T6CA 2FF6A 4A62A 4FWNA 1Y64A 4BR5A 3AARA 4FL9A 1NGEA 3BEXA 3KZBA 4I6MB 4WYBA 4JHDB 4BRPA 4IXCA 2Q97A 4BR0A 3QB0A 1MWKA 1NGAA 5AR0A 5TKYA 4BGBA 3CQXA 4XH5A 4JN4A 3LL3A 1EQYA 3EO3A 5AQVA 4BRHA 2IVNA 3GDQA 1YUWA 1HPMA 5KPRA 1XUPO 4BRQA 1YVNA 2H3GX 5AQTA 2QM1A 3ZEUB 3QDKA 4FWPA 4MO5A 5I9EB 4BROA 1S22A 4DB3A 3CI5A 1BWFO 1Z05A 3AY9A 4BQZA 5AQIA 4BR9A 4H5RA 1BOTO 1E4GT 2NRHA 2QWOA 4BQLA 2VWBA 3A5LC 4FWOA 2HOEA 4FSVA 1ATNA 4A61A 3HTVA 3U9DA 1ZXOA 4RWTA 2E2QA 3S41A 4CBWA 4CZJA 3ZETA 2QWQA 1WOQA 1OKJA 4ISEA 4CD3A 3LM9A 3QBXA 3UKUB 3M1FA 1GLFO 1ATRA 3F9MA 1J6ZA 1SZ2A 1ZC6A 2YCHA 4BG8A 4BG9A 4EAHD 2FXUA 1C0FA 2F9WA 2QWMA 3DXMB 2GELA 4H0XB 4ISFA 3MN5A 5AQZA 3CJCA 4CBUA 3IFRA 1GLBG 3TU5A 4M63C 3FFKB 5F0XA 1NM1A 2ASOA 2AA4A 1QQNA 3ENHA 2GWKA 3U8XA 4NO7A 4BRNA 3AAPA 4B1YB 2D0PA 3ATVA 4BRAA 1HKBA 3CQYA 3ZX0A 4Z94A 3W0LA 1RFQA 4KBOA 1IJJA 1T44A 2A42A 2W40A 2WUSA 3HI0A 1S3XA 2NLXA 1HLUA 3ID8A 3MMVA 2KHOA 1U2VB 2A6AA 3ZEUA 5AQXA 3UKRB 3DWLA 5KQDA 3O80A 5AZIA 5JMVA 1BDGA 3FZHA 3DXKB 3EL2A 1ESVA 3RSEA 4DCHA 5AQKA 4FOEA 4XH4A 4K25A 4QS7A 5E26A 3L0QA 4EHUA 2CH6A 4EIAA 5AQGA 4BRFA 4BR4A 3GOIA 1NLVA 2P9SA 5JLHA 4FOIA 2QWNA 1NGBA 5BRFA 3HM8A 3UKUA 2ASPA 1GLCG 3H1QA 3ULEA 3VENA 1QHAA 4QS9A 5AQUA 3H3NO 2ZGZA 3A0IX 3H46O 2A3ZA 4HTLA 2I7NA 3C7NA 4A2BA 1E4FT 1ZBSA 3DXMA 3H1VX 5LY3A 1SAZA 2CH5A 2V7ZA 2CGKA 4MLHA 3QICA 3SMSA 3FZFA 4GY2B 2P9NA 4ISGA 3QFPA 2ZF5O 3BF1A 4CZLA 1TUUA 1X9JA 4BC2A 4MO4A 3VERA 4E1JA 5F2RA 1X3NA 3QFUA 4FWLA 5FPDA 5AQNA 2P9LB 2V7YA 3O8MA 2P9KB 2D1KA 4CZHA 4PKHA 1NGHA 4JNEA 2HMPA 4C23A 4DHYA 3DXKA 2V51B 4IZ9A 5AZJB 5AQJA 5AQRA 3W3DA 4BVPA 3VESA 2BUPA 2P9UA 2W41A 2E8AA 3O1BA 2FF3B 4AM7A 5AQSA 4H0PA 4B1VA 2YHXA 4JAXA 1D4XA 3EKSA 4H03B 1WUAA 2D4WA 4YDUC 3JXUA 4F9OA 4JD2A 4M7XA 1KXPA 4B1ZA 1NGJA 1KAXA 2A41A 3JS6A 3OHRA 4H0TB 1GLJO 1BO5O 3LDPA 4H5NA 4IO8A 3J8AA 4PKGA 5AQOA 4DQ8A 4H0VB 4RCHA 3GG4A 5AFUA 3QBWA 2VYPA 5AQYA 1TYQB 1GLEG 5JLFA 1QZ6A 4CZKA 2P9PB 3VF6A 3CJAA 1K8KA 5ELZA 4YDUA 2V52B 5KPZA 2J4RA 3IUCA 2P9IB 3O1WA 1DKGD 4CZGA 4I6MA 5FPEA 4QS8A 2CGJA 4BR7A 2FSNA 3I8BA 5F1XA 3TPQA 1XC3A 2HF3A 1MDUB 3CETA 4JHDA 1HKCA 4XEIA 3H3OB 1NBWA 4FWMA 4RTFD 3DJCA 4J8FA 3CHWA 2HF4A 4H5VA 3O08A 5FPNA 4B1XB 3FZKA 3FZMA 2GWJA 3VF4A 3KVGA 2E2NA 2NZTA 1GLLO 3FLCO 2FSJA 3P4IA 3VEXA 2I7PA 4BRCA 3LM2A 4PKIA 3D2FB 4CBXA 3GE1A 4BC3A 1DGKN 4IWVA 5AQQA 1QQMA 3FZLA 3L4IA 1DEJA 3SJHA 1NGGA 4IJNA 3WT0A 3M6GA 4CZMA 4FWSA 2Q0UA 4CI6A 3ATUA 2CGLA 2IIRA 2P9PA 1V4TA 2GTDA 4FWRA 3EN9A 3BP8A 2GEMA 3H45C 3MK6A 3O4WA 4WQ5C 4IJAA 5ADXA 1TUYA 4FPAA 3L6QA 1HX1A 5EXWA 1GLAG 4PL8A 5AQLA 4CD1A 3BF3A 2IVPA 3U9ZA 3C0BA 3A5OC 2D0OA 2PAVA 2ITMA 3CERA 5AFUH 3WQUA 4BR2A 2Q0RA 1QZ5A 2E88A 2QXLA 4NB4A 3HSCA 4BRMA 4FO0A 3VGMA 4BGAA 1Q18A 5EOYA 4BC4A 1BU6O 2Q31A 5FPMA 1CZAN 4H5WA 1MA9B 2FLOA 2GUPA 5EX5A 4WQ5A 3A5MC 1U2VA 3I33A 1NGDA 3UKRA 2F9TA 5BN9A 3O5BA 3WXKA 1LOTB 4PL7A 3ZETB 3FE1A 5BR9A 4H0OA 3LDNA 1BUPA 4FWQA 1ATSA 5LJVA 3VETA 4GNIA 2EWSA 2E20A 3B8AX 3D7EO 4EFHA 2Q36A 3FR0A 2YJFA 3ZX3A 2BTFA 2FSKA 4O5FA 1HKGA 2Q2RA 3VOVA 1MWMA 2QW9A 3AAQA 4B9QA 4BRDA 4L3QA 1NGCA 1U6ZA 3KHYA 3BUZB 3VEOA 2AP1A 1T6DA 4AM6A 5BRHA 3WXIA 4EHTA 4HWIA 1G99A 1XQSC 1LCUA 3R9PA 2IVOA 4BC5A 5CE3A 1NGFA 2E2PA 1IG8A 1YXQA 3VF2A 2QWLA 3WXLA 5B8HA 3HBTA 3G25A 4B1WB 3WUHA 3FGUA 5AZIB 2E1ZA 2P9LA 3SK3A 4LC9B 3D2EB 1V4SA 3MN6A 4K42A 3RSEB 1RDWX 2P9KA 2QWPA 5EY4A 4BVOA 1C0GA 1KAYA 1Z6RA 5ADXH 4CZFA 3WEEB 3VGKA 1JCFA 2ASMA 5KQ8A 1X3MA 5AQPA 5AZJA 3CIPA 2DPNA 2P9SB 2YJEA 5AQFA 5BPLA 5LJWA 2VCPA 3ULEB 2YHWA 3EKUA 3VEVA 2A5XA 1P8ZA 3A5NC 4BRGA 2OANA 3C7NB 3ZX2A 4BRKA 2YHYA 3ENOA 1NMDA 3IMXA 3LDLA 3LDQA 4MLEA 2P9NB 2E2OA 4K43A 1KAZA 3MCPA 4CJ7A 2Q1NA 5BN8A 5AQHA 1BG3A 4A2AA 3VEWA 4BRIA 4B1UB 3HZ6A 3MN9A 4O8KA 3IDHA 3R6MA 3UE5A 1RGIA 4M7YA 3CJ1A 3QMLA 3MN7A 4H0YB 4BRLA 1TYQA 1QQOA 2QWRA 2YI1A 3R8EA 3VPZA 4CZEA 5E84A 4WQ4C 3WXJA 2UYTA 3D2EA 3M3ZA 2P9IA 2ZWHA 3A8YA 1BA1A 4FPBA 3CJ7A 4XH1A 5AQWA 4H5TA 3VEYA 2P9UB 3LDOA 3EZWA 1SQKA 3WEEA 1YAGA 3O6WA 2ZGYA 3DAWA 1GLDG 5KPTA 3U4LA 1JCEA 3GBTA 4JD2B 4Y0WA 3H6EA 5BRDA 5JICA 3CJBA 5AQMA 3MDQA 5BPMA 1NWKA 4WQ4A 3VEZA 5BPNA 4FWKA 3VGLA 3WQTA 2E1YA 1JCGA 3CJ9A 3SMPA 3GL1A 4CZIA 3D2FA 5BREA 4BREA 1HJOA 3UB5A 1BA0A 3SLCA 4K41A 5EVZA 2A40A 2PBDA 1K8KB 1R59O
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2FF6A 4HHTA 4KHYA 4A62A 4BACA 1MU2A 1S1TA 4FL9A 3JYTA 1NGEA 3BEXA 4AHCA 4YFUA 3AO5A 5HROA 5HRNA 4DFJA 2Q97A 3LPTA 1RT1A 1NGAA 1WSHA 3DI6A 5TKYA 4DF4A 4JKEA 3AA5X 4M3ZA 1VSFA 1EQYA 5IWAK 2Y1JA 3I55N 3OBYA 4KO0A 2IVNA 3GDQA 3S3NA 1XMOK 2NUBA 1Q86O 4FK4A 2H3GX 5AQTA 3ZEUB 2PY5A 4GKJK 3CCUN 3SQ0A 1HJRA 3CI5A 1Z05A 5AQIA 3ZSZA 4CK2A 5H1SQ 4FWOA 1ZBFA 1ATNA 4A61A 1WSIA 5TKWA 4O0IA 1IBKK 2X6NA 4RWTA 3V9SA 3QEPA 4OX9K 3B6PA 4CF9A 3VA0A 3RRGA 3AV9A 3UKUB 1VQON 1GLFO 5J1EA 3F9MA 1ZC6A 4BG9A 1Q9XA 3HXMA 1C0FA 4O44A 5J2PA 4JI1K 1T7PA 3DXMB 2GELA 4ISFA 1VSMA 5A2QO 5E41A 3OW2M 4G9ZA 1GLBG 2FBXA 4AHUA 2VGMA 3FFKB 2OA8A 2ASOA 4DR4K 1Q82O 4ILGB 3U8XA 2WFBA 4BRNA 3V9XA 1C6VA 4H4OA 3ATVA 1N36K 4OO1J 4Z94A 4BEBA 3BDPA 2HHTA 3HK2A 1RFQA 1ILYA 1IJJA 1T44A 2A42A 3HI0A 2WUSA 4BRPA 4JI2K 1HLUA 4CECA 1ASUA 2GUIA 1RBRA 3D45A 4GV3A 5CY4A 4DCHA 3SYZA 1BI4A 4TSXA 2Y1IA 4K25A 4QS7A 1XI1A 4DG1A 4E7IA 3IAYA 3OYGA 4X65K 5DK5A 3SPYA 3GOIA 1WBBA 1VSKA 3HM8A 4E19A 4CF2A 4QOZB 2G8HA 3VENA 3DLKA 1U4BA 4QS9A 2X6SA 4DSEA 3KK7A 2HVIA 1BISA 4E3SA 2D0BA 3QESA 3C7NA 1IBMK 1GOAA 2D0AA 2XY6A 4CJSA 4YY3K 1K9MO 4NCGA 2FBTA 2V7ZA 4C8OA 2CGKA 3OY9A 4FZXC 4HUEA 5T7BA 1X9JA 1IH7A 3QNNA 2NRTA 1SV5A 4FW1A 3QFUA 5AQNA 4WCEL 2KW4A 3CG7A 2D1KA 3TWHA 4JNEA 3SUQA 2HMPA 3PIPL 4C23A 3PLAA 3K5MA 4KI6A 1JLFA 1OVQA 5AQJA 4CK1A 4CEBA 3VESA 1VRUA 5I3UA 4WE1A 4CJUA 3O1BA 1QSYA 4IFYA 4DFPA 4NCBA 2OPRA 2YHXA 3TABA 1UA0A 4H03B 1CLQA 5DMRA 4KV8A 3ZSWA 5HLFA 4M7XA 1IKVA 3NFAA 4C8MA 4CIEA 1HMVA 3RTVA 1VQ5N 1W7AA 3T19A 3I8DA 1BIUA 1C0TA 1ASVA 3NCIA 1XHXA 4PUOA 2VYPA 3C65A 1YI2N 3BGRA 1N34K 1QZ6A 4CZKA 5FROA 4GVEA 3KIOA 2VQEK 3SUOA 3HRGA 4FM1A 1TAUA 4C8LA 2HSTA 3TAEA 4I9QA 4FJLA 3ID6A 3IUCA 3TAPA 1LAWA 1HYZA 5FRMA 4BR7A 3O3GA 1XC3A 2HF3A 3MECA 4KI4A 3NH1A 1BIZA 4FWMA 1NOYA 4RTFD 4J8FA 2HF4A 3ZSOA 3O08A 4Y1CA 1TK8A 3FZKA 3VF4A 5J2MA 4I9LA 1F21A 1GLLO 2FSJA 3P4IA 1RBSA 4JKBA 2VQFK 4FLZA 4FLVA 3MX5A 3QLHA 4FK2A 4NYNA 3JSMA 4CBXA 4CHPA 1LW2A 4IWVA 4GV6A 4Q5VA 3PIOL 4IJNA 3WT0A 1RT2A 3M6GA 3TI0A 3K5LA 4E7KA 4CI6A 4IFEA 1NOZA 3U3GA 1X9MA 2IIRA 2HNYA 2O8DB 4DV3K 2G8WA 1WNSA 3H45C 5C2DA 3MK6A 3O4WA 1WN7A 1K73O 1HX1A 3O4QA 4A5AA 1GLAG 1YVUA 4CE9A 4CD1A 3CCMN 3P1GA 1Q81O 3KK2A 3CERA 2KFNA 1J9AA 1QZ5A 1DT9A 3HSCA 2KQ2A 4BRMA 4FO0A 4CJ3A 4BGAA 3OYEA 4IOXA 4YOUA 4CJKA 1KVBA 2B4JA 4OPAA 2Q31A 1CZAN 4FJXA 1MA9B 1CZBA 5EX5A 3F9KA 4WQ5A 4CIFA 1NGDA 4E7LA 1YTUA 3WNFA 3LP3A 3ZETB 3TSQA 3SZ2A 5C24A 3HVRA 1X9SA 3VETA 3DRPA 4GNIA 3D7EO 2IOCA 4EFHA 1QE1A 3FR0A 3OYFA 2OZSA 1ZBLA 2YJFA 3AVCA 5SZTA 2BTFA 4JKFA 3DLRA 5CHIA 4O5FA 5GAGP 4PWDA 4A5BA 1HYVA 3VQ6A 1U47A 4IEIA 3BUZB 3VEOA 2AP1A 1T6DA 1RT4A 2HBJA 1LCUA 3K9KA 1NGFA 1VQNN 3VF2A 3E9LA 2QWLA 3Q7CA 3RR8A 2IS3A 3G25A 4B1WB 1EXQA 4CEEA 4CJQA 3FGUA 5AZIB 2D5RA 2WONA 1IKXA 4K42A 3RSEB 3RVCA 2P9KA 5EY4A 1IG9A 1IKYA 2D0CA 3SI6A 1C0GA 1EKEA 3WEEB 1JCFA 4LSNA 3E01A 1YF5L 5KQ8A 3A2FA 3M8SA 4C1NI 5AQPA 5AZJA 3DLLL 3TAMA 3CIPA 2ZJQL 4ELUA 4Q0BA 5AQFA 4I2PA 3G0ZA 2OPSA 4BRGA 4AHVA 3ZT3A 2OANA 4M3RA 3KLFA 1RDAA 3ENOA 4EP5A 3IMXA 4CEQA 2HHXA 1KAZA 1RNHA 1HPZA 4G1QA 4A2AA 3SQ2A 4B1UB 2LSNA 4O8KA 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 4BWJ A;  3AVG A;  2DPN A;  2P9S B;  4LH5 A;  4JS5 A;  3IG1 A;  4KB1 A;  1P8Z A;  4JI8 K;  2HHI A;  4E7H A;  3ISN C;  1VSE A;  4CF8 A;  1JL1 A;  2UXC K;  1NMD A;  3LDQ A;  2YHB A;  1SL0 A;  3C6H A;  2E2O A;  4K43 A;  2Q1N A;  5BN8 A;  3VQB A;  2VG6 A;  1TKT A;  2ZJR L;  4BRI A;  1HNX K;  1OH5 A;  4I2Q A;  2O8E A;  2G8V A;  3C6A A;  2A1S A;  1QQC A;  3IDH A;  4DR1 K;  4FZY A;  4B9T A;  3L3U A;  1TYQ A;  2YI1 A;  3SPZ A;  3R8E A;  4HTU A;  3KD1 E;  2QXF A;  3L4Q A;  3CC4 N;  3THW B;  4FJ9 A;  3SAF A;  3L2V A;  3SNN A;  3R1X A;  5AQW A;  3LP1 A;  4JKG A;  3VEY A;  3LDO A;  4DS4 A;  4OKE A;  4F2S A;  1YAG A;  2NRX A;  3AVJ A;  1ZYQ A;  4CJF A;  3T3F A;  4Z4F A;  4B9N A;  3NGY A;  5KPT A;  1JCE A;  1SL1 A;  5HRS A;  4FJM A;  4JD2 B;  4KHQ A;  3LP0 A;  3CJB A;  3IS9 A;  2UUB K;  2HHU A;  4WQ4 A;  4KTW A;  3I0R A;  4FWK A;  5HOO A;  3S9H A;  1VSJ A;  4X64 K;  2F4V K;  3OYB A;  1JCG A;  3GL1 A;  4OPK A;  2UU9 K;  1L3S A;  2O8C B;  4K8Z A;  3PUF A;  5GIN A;  2PBD A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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