3SJHA

Crystal structure of a chimera containing the n-terminal domain (residues 8-29) of drosophila ciboulot and the c-terminal domain (residues 18-44) of bovine thymosin-beta4, bound to g-actin-atp-latrunculin a
Total Genus 120
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
120
sequence length
366
structure length
357
Chain Sequence
TALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Contractile protein, protein binding
molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
publication title How a single residue in individual beta-thymosin/WH2 domains controls their functions in actin assembly
pubmed doi rcsb
source organism Drosophila melanogaster
total genus 120
structure length 357
sequence length 366
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-06-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3sjhA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3sjhA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3sjhA03
4PL7A 4CZKA 1GLFO 3FR0A 3DXKA 3H3OB 1X3NA 5AZJB 2CGLA 2P9SA 3I33A 4AM7A 1KAZA 2EWSA 4FL9A 4FWKA 5B8HA 4HWIA 4BVPA 3ZX0A 2KHOA 3SMPA 3DXKB 2GELA 3ZX2A 2P9SB 2DPNA 3HBTA 2E2OA 4F9OA 4RWTA 1GLAG 5AQOA 4JNEA 4CZJA 1HUXA 5EY4A 2D1KA 5BPLA 2A3ZA 1KXPA 3C0BA 3M1FA 3VEXA 4CZGA 1KAYA 5BPMA 1NWKA 2FSJA 5E84A 5FPEA 5I9EB 1BA0A 4BRFA 1TYQA 4Z94A 1SAZA 4CZMA 5LJWA 4PKIA 5AQSA 3GG4A 3WEEA 3L4IA 3CJ9A 1TYQB 1T6CA 1YXQA 2ASOA 2IVPA 2E2PA 2QM1A 3FZMA 3WEEB 4CD1A 1GLCG 1Q18A 1NBWA 4WQ4C 1NGHA 1HJOA 2I7NA 4HTLA 3KZBA 1IJJA 4CD3A 1X3MA 2QWNA 3AAQA 5F1XA 3KHYA 4BQLA 4BR5A 3M3ZA 2GWJA 1NGFA 2AA4A 3CJAA 4BRGA 4BRMA 4IJNA 1Y64A 3M6GA 2E8AA 3G25A 3ATVA 4BREA 4BVOA 4BRAA 1ATNA 3D2FA 2YI1A 5F2RA 5FPDA 3AY9A 3QBWA 1E4GT 3RSEA 1C0GA 2CGJA 4FPBA 2IVNA 1NGEA 4FWMA 1U6ZA 4MO5A 4FSVA 3QBXA 1C0FA 3SLCA 3D2FB 2W41A 3WXKA 1QZ6A 3RSEB 5ADXA 1E4FT 5EX5A 4EHUA 1BWFO 1QQNA 5AQYA 3S41A 5AQQA 3EO3A 1NGCA 1SZ2A 3U9ZA 3O1WA 4BROA 3AAPA 2IVOA 3QFUA 3MCPA 4JHDA 2ZWHA 4B1VA 1GLBG 1DEJA 4B9QA 2FLOA 3BUZB 3O6WA 3FZFA 3EKSA 4QS7A 2CGKA 2Q36A 4CZIA 4YDUA 1MA9B 1EQYA 4H03B 5BREA 3ULEA 3O4WA 5EOYA 1NLVA 3IMXA 4BRDA 5BN9A 1NM1A 1LCUA 2Q0RA 1GLJO 1RDWX 3O8MA 2E1YA 2E1ZA 4DB3A 3ZEUA 5AQRA 5KPTA 4BG9A 3BEXA 3JXUA 3ULEB 3CI5A 3H1VX 4CI6A 3EZWA 1IG8A 2VWBA 3VGLA 1J6ZA 4EHTA 2UYTA 2WUSA 4LC9B 4FPAA 3ZEUB 2GEMA 2Q0UA 5AQGA 2AP1A 5ELZA 1ZC6A 3VEVA 5BRHA 3BF3A 4FWRA 4QS9A 4PKHA 4H5WA 3P4IA 2QWMA 4B1UB 4B1WB 3FZLA 1T44A 3QDKA 2YHWA 3ZETA 5KPRA 2ZGYA 1GLEG 2FF6A 4IO8A 4WQ5A 5FPMA 3QICA 4FO0A 3SK3A 2ZGZA 4PKGA 4XEIA 4ISGA 5AQWA 4C23A 1QHAA 3ZETB 5F0XA 2QXLA 2E20A 4FWNA 4JN4A 3DAWA 1MDUB 3ATUA 3GOIA 1QQOA 3MDQA 2P9UA 3UKRA 4MLEA 2HMPA 3WQUA 4J8FA 2P9NA 3QFPA 1OKJA 4H0XB 1NGGA 1DGKN 2P9PA 3MN9A 2P9UB 2A6AA 2E2NA 3UKRB 2HOEA 3CQXA 2P9NB 3HZ6A 4M7YA 3VGMA 1GLLO 3SMSA 1SQKA 3O5BA 3U4LA 4BRCA 2A42A 1BG3A 2D0OA 4FWSA 5JMVA 2P9PB 3R9PA 1ZXOA 3MN5A 4CBXA 5AQMA 5BRDA 3CJCA 4H0PA 5AQFA 3CIPA 4BRKA 2GWKA 2YHXA 3D2EA 1HKCA 4CZFA 1BA1A 5AQJA 1BDGA 3A5LC 4IZ9A 1JCFA 2YHYA 3EN9A 2PBDA 2QWPA 4RTFD 5AQTA 3MMVA 4K43A 3D2EB 2D0PA 2Q2RA 3O1BA 4FOIA 1CZAN 5E26A 3TPQA 5AQLA 4QS8A 3H46O 4DHYA 3CERA 4BC4A 3EKUA 4RCHA 3CHWA 3HSCA 5JLHA 3QMLA 3GL1A 2OANA 3A5MC 3WT0A 1XQSC 4BRNA 4M7XA 3HTVA 2E2QA 5AQHA 2A40A 3EL2A 1GLDG 3KVGA 4EFHA 4AM6A 4CZHA 2HF4A 4B1YB 3LDQA 3LM9A 3VGKA 2H3GX 4YDUC 4CZLA 1ATRA 3CJ7A 3ENHA 4BR4A 4CZEA 4FWQA 4K42A 3LL3A 3WXIA 3LDLA 2QWQA 4BGBA 3LM2A 4FWPA 5AZIA 3TU5A 2GTDA 4CJ7A 1YVNA 5AQNA 4NO7A 5AQUA 1Z05A 2QWRA 5AFUH 4DQ8A 3BP8A 4JD2A 5LJVA 1JCGA 4BR0A 1RGIA 2V52B 1X9JA 1Z6RA 2P9IA 1S3XA 3IFRA 5AZIB 5BN8A 5KPZA 5AQXA 3VEWA 1MWMA 1NGAA 3GBTA 3VENA 4DCHA 4JD2B 3FFKB 2P9IB 2PAVA 3UE5A 4ISFA 3DXMA 3B8AX 4H0OA 3J8AA 4BR7A 3H1QA 1ESVA 3WXLA 2YCHA 4O5FA 1YAGA 3FLCO 5AQKA 3A5NC 3ENOA 2A5XA 2D4WA 5AR0A 5KQ8A 3IDHA 3DXMB 4WQ5C 4A61A 3HM8A 2CH6A 3CJ1A 4B1ZA 4BR2A 2YJEA 4A2AA 1S22A 1NGIA 2VYPA 2ZF5O 3MN6A 3JS6A 2J4RA 2HF3A 4K41A 4WYBA 4H0TB 4JAXA 3FZKA 1WUAA 1V4TA 1NGDA 1WOQA 1V4SA 3U8XA 3WUHA 2Q1NA 4ISEA 4BC5A 3L0QA 4BRIA 5LY3A 4BG8A 5AQIA 3WXJA 2ASMA 2NLXA 1NGBA 3VESA 5AQPA 2FXUA 3FZHA 4H0VB 1P8ZA 2I7PA 3OHRA 1XC3A 4BRLA 2YJFA 4BGAA 1G99A 2F9TA 4EIAA 5KQDA 3WQTA 3VETA 1MWKA 3LDOA 5CE3A 4Y0WA 4BRHA 2QWOA 2Q31A 4FWLA 2V7ZA 4BC3A 3CJBA 1YUWA 1TUYA 3O08A 4IWVA 2A41A 2VCPA 2NRHA 4B1XB 3VEZA 3W3DA 1QZ5A 4IJAA 3C7NA 4I6MA 4BRPA 4E1JA 2V7YA 3FGUA 1ATSA 2V51B 2W40A 3GDQA 1U2VA 2QWLA 4H5NA 3C7NB 4I6MB 2BTFA 2FSKA 4XH4A 4A62A 4MO4A 3VERA 3VF2A 5JICA 4M63C 4BC2A 3CQYA 2GUPA 3R6MA 3ZX3A 4KBOA 3VPZA 1U2VB 3VF4A 4BR9A 3H3NO 4O8KA 4L3QA 5TKYA 3O80A 3L6QA 5BR9A 5JLFA 4BQZA 1HX1A 2FF3B 1XUPO 3I8BA 3ID8A 4FOEA 4GY2B 1H1VA 5AQZA 2E88A 3DJCA 4PL8A 4WQ4A 4A2BA 3VEOA 1BOTO 1BO5O 1HKGA 1HPMA 2QW9A 3DWLA 1RFQA 5ADXH 1HLUA 2F9WA 1LOTB 1T6DA 4XH1A 5EVZA 1DKGD 3W0LA 3CETA 3H45C 4IXCA 4K25A 3H6EA 4NB4A 4H0YB 2P9KA 4XH5A 3A5OC 4H5TA 4H5VA 4CBWA 3MK6A 4H5RA 1ZBSA 3A8YA 3F9MA 3VOVA 1BU6O 4MLHA 2BUPA 1D4XA 3D7EO 2CH5A 1R59O 2ITMA 2P9KB 3IUCA 5EXWA 3UKUA 5AQVA 2ASPA 5AFUA 3UB5A 3U9DA 1KAXA 3QB0A 2P9LA 5FPNA 1HKBA 3UKUB 3VF6A 3R8EA 3VEYA 1K8KA 1NGJA 2FSNA 4JHDB 2IIRA 3AARA 3LDPA 4CBUA 2P9LB 2Q97A 3LDNA 3MN7A 1BUPA 1QQMA 1K8KB 3BF1A 5BRFA 5BPNA 1NMDA 4FWOA 4BRQA 3FE1A 3GE1A 3HI0A 3SJHA 4EAHD 1JCEA 5AZJA 2NZTA 1TUUA 4GNIA 3A0IX
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4PL7A 4BECA 4CZKA 4PHTX 4M3TA 1RDUA 3FR0A 2HNZA 3O9SA 3H3OB 1KAZA 2EWSA 4B9SA 1TK5A 3R3LA 4BE1A 3I0SA 4PA1A 3E01A 3VA0A 3SPZA 3SMPA 3NDKA 4YNQA 3ZX2A 3AO3A 2ZQBA 5HP1A 4DV5K 3SV4A 4KB1A 2ATQA 2E2OA 4F9OA 4RWTA 5SWMA 4JNEA 1HUXA 3ZT1A 3KLFA 4CZGA 3AGKA 1KAYA 1WB9A 4PY5A 1NMNA 4BE7B 5FPEA 5I9EB 1BA0A 3IRXA 1NJXA 3CCVN 3TTDA 1SAZA 4CZMA 3V4IA 5AQSA 1R0AA 3CJ9A 3E1YA 3TAFA 3K9JA 4FLWA 1S1WA 3S9HA 4B9MA 5CYMA 2QM1A 3FZMA 4FJNA 3PX0A 2KKZA 3ZYYX 1ASUA 3KZBA 1HYSA 4HUGA 3AAQA 3ZSWA 1CZ9A 4BQLA 3EE8A 1BIZA 2GWJA 1IKWA 3SBTA 1NGFA 3ZCMA 2JLEA 3ISNC 3VQ5A 2UXBK 1NU0A 3NGZA 3DM2A 2E8AA 3AV9A 3ATVA 4CJKA 4DTNA 4AHSA 4CGGA 3RSEA 1C0GA 1EO1A 3V1RA 4FWMA 1U6ZA 4JKHA 4MO5A 4BDZA 3QBXA 5FRMA 3KTQA 3OYHA 4GV9A 1W97L 1QZ6A 1VSFA 3RSEB 4DFJA 1OH6A 1XHZA 4OX9K 4DQQA 3CFPA 5AQYA 3S41A 3B6PA 1NGCA 1SZ2A 1VQKN 2Y1JA 4I9LA 2B6AA 3QFUA 4JKBA 4EZ6A 4CHPA 3ZSQA 3AO5A 5M1NA 1C1CA 2OZSA 1TV6A 4JKGA 3K59A 3BGRA 1RT4A 3FZFA 4FXDA 3EKSA 3K5LA 2HNDA 4YDUA 1T8EA 1MA9B 5BREA 4JKGB 3ULEA 3ZT4A 1NLVA 4BRDA 1LCUA 2Q0RA 3V1OA 1RDWX 2G8IA 3TWHA 2E1YA 4CIFA 3C65A 5AQRA 4OVLA 3ULEB 5AJ3K 3OYKA 4ICLA 4CI6A 2GV9A 2VWBA 2WC9A 1W0HA 4KH6A 2GEMA 3RRGA 5AQGA 2AP1A 5ELZA 1ZC6A 4CGHA 3FFIA 2HHXA 4DR1K 2G8KA 1Q8IA 1ITGA 3V9SA 1A5XA 2E5LK 3T19A 3TSPA 1NJZA 1OH8A 4LH4A 3HXMA 3S5TA 3QDKA 2YKNA 1RTDA 3ZETA 3G71N 2QXFA 1Q82O 2ZGYA 1GLEG 2OPRA 5M1PA 3WNGA 1BCMA 3KWGA 4DV1K 1YI2N 3QICA 2HHWA 3QESA 3SK3A 3KK7A 2G8VA 4DG1A 5FRNA 1QHAA 3ZETB 2AJQA 2QXLA 4CJRA 1NK9A 2Z1JA 4FWNA 3I8DA 1FXXA 1RT1A 3HPGA 1WBBA 3UKRA 4MLEA 4E7IA 2HMPA 3S3NA 1OKJA 4H0XB 4C8LA 3VMFB 3K57A 2ZJQL 4N47A 3UKRB 2HOEA 3HZ6A 4FWSA 1LWEA 3VTHA 1ZBUA 2PFUA 3SCXA 1IBKK 1HYVA 4FJGA 4N41A 3AA3A 4BRKA 3KK1A 2GWKA 3D2EA 1SKWA 4OGCA 3A5LC 2KTQA 3AVHA 4CJTA 3KD5E 4R5PA 4HCBA 3C6TA 4KTZA 3D2EB 2D0PA 1KVAA 2Q2RA 4ZTJA 5E26A 4NXNK 2Z1GA 4QS8A 1CLQA 1CXQA 3O9UA 4BWJA 4IDKA 4FJLA 3WNFA 3HSCA 4JI7K 3KIOA 5C15A 3QMLA 3DOLA 4G9ZA 1TKTA 2F4VK 1D5AA 2D5RA 4BRNA 2YNHA 3TTFA 3EEQA 3J80O 3KVGA 1O1WA 3LDQA 3VGKA 3CXCM 3SUNA 3ENHA 4BR4A 4HUEA 3T3FA 4CZEA 4DV6K 3TTCA 4FWQA 4JI3K 3LL3A 3WXIA 1YHQN 4FJHA 3CMAN 1ASVA 4NCAA 5C2FA 4CJ7A 1YVNA 4AHVA 4FM0A 4ILGB 2A1RA 1KQSM 3BP8A 5LJVA 1S6PA 2UU9K 2V52B 1Z6RA 1S3XA 3QNNA 4JS4A 3OY9A 2HHIA 4U7BA 4CERA 1M1KO 4FLYA 4M45A 4RW8A 3FFKB 4G1QA 2O8DA 3RMBA 2PAVA 4M42A 3F5TA 1M90O 4GMJB 3RR8A 1K73O 4DQPA 2YCHA 2DTUA 3FLCO 4JYAK 4LF8K 2O8DB 1Q81O 3HP6A 5AQKA 4FLTA 5M1KA 5KQ8A 3KK2A 5JMVA 4BR2A 1VQLN 1CZBA 4AH9A 3SAFA 2VYPA 3JS6A 2HF3A 4WYBA 3FZKA 1NGDA 3U8XA 4GW6A 1WAFA 2OPSA 3NH1A 3KK3A 4UY8O 5AQIA 1REVA 5AQPA 4AQYK 5HRSA 2IGIA 1RTHA 3NGYA 4CK1A 1P8ZA 4QAGA 4E7LA 4Q0BA 4BRLA 1K6YA 4E0DA 2YJFA 2F9TA 4EIAA 4DTOA 2LSNA 4FW2A 4DQIA 1L5UA 4HVJA 1NJIO 1HPZA 4BRHA 5HROA 3SNNA 1W9HA 2VGNA 3OYJA 1S9EA 4FWLA 4BC3A 2UXCK 1JLGA 4DTPA 1Q7YO 3O9QA 1QZ5A 1L3VA 4IJAA 4BRPA 1S1XA 5CZ1A 1WSIA 3H08A 3FGUA 4IFEA 1RNHA 4CECA 2W40A 2FC0A 2QWLA 1QVGM 1VRTA 1RDBA 1VQNN 4DMNA 2HHUA 1QS4A 4YOWA 1VSLA 4BC2A 2GUPA 3ZX3A 3ASMA 4KBOA 4A5AA 3VF4A 4L3QA 5TKYA 4MQ3A 1JXEA 1S72N 2HHHK 2WOMA 3ID8A 2O4IA 1H1VA 3DJCA 1U4BA 4DQRA 2OA8A 4B3SK 4A2BA 3OBYA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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