3TPQA

Crystal structure of wild-type mal rpel domain in complex with five g-actins
Total Genus 120
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
120
sequence length
371
structure length
346
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVVGDEAQSKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Contractile protein/transcription
molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
publication title Sensing actin dynamics: structural basis for G-actin-sensitive nuclear import of MAL
pubmed doi rcsb
source organism Mus musculus
total genus 120
structure length 346
sequence length 371
chains with identical sequence B, C, D, E
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-09-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3tpqA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3tpqA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3tpqA03
1XUPO 2E2QA 2NZTA 4IO8A 2ITMA 4BRKA 5BPMA 1ESVA 3ATVA 4HTLA 4FPBA 4FSVA 4BRPA 3R9PA 2AA4A 2NRHA 1ZXOA 2VCPA 4K43A 5TKYA 3RSEB 4BQLA 5BR9A 2HMPA 5JLFA 2GWKA 2V52B 4H0YB 4GY2B 5AZIA 3OHRA 4BRQA 3WXKA 2QW9A 2FF3B 4FOIA 2FF6A 4MLHA 4NB4A 3KVGA 3D2FA 4BC2A 3VENA 1GLEG 3O8MA 4CZJA 2WUSA 4I6MB 2A6AA 5E84A 5AQVA 3BF3A 3FFKB 5AQYA 4B1VA 2P9NA 2P9LB 4ISEA 5LJWA 3M3ZA 3VGMA 4IXCA 4K41A 3HI0A 1NGJA 4BG9A 1K8KA 4J8FA 2F9TA 4AM7A 1KAYA 1Z6RA 1TYQB 3WXJA 1NGEA 4Z94A 1BWFO 1LOTB 5BRFA 2W40A 3I33A 3L0QA 4BRCA 1SQKA 3DXMB 4QS8A 3FE1A 3MN9A 3G25A 1HX1A 4BG8A 1GLFO 4BRDA 4H5NA 2Q31A 3A5OC 4O5FA 3WQUA 4H0XB 2YJFA 2P9KB 3QFPA 4K25A 3FZKA 1IJJA 4BR4A 4O8KA 3ZX0A 2V51B 5AQNA 3VGLA 3A5MC 4FL9A 5AQSA 1EQYA 1C0FA 4FWLA 2DPNA 5AZIB 1KAZA 4H5RA 5AQFA 3KZBA 2A3ZA 3CIPA 4JD2A 4DCHA 3KHYA 2I7PA 2YHWA 3ENOA 4BRHA 3GDQA 1BG3A 1QQNA 2P9NB 2QWLA 2QWMA 1C0GA 4H5VA 4PKHA 3UKRA 1NMDA 4FWQA 4CZGA 5AQOA 1JCFA 3GE1A 4H0VB 1ZC6A 3GBTA 4JHDB 4BRFA 1BO5O 3U8XA 5AQTA 3VEWA 5FPMA 4LC9B 3C7NA 3SMSA 3JXUA 3O08A 1X3NA 5AQRA 4BC3A 3A5NC 3MMVA 4CBWA 3MCPA 5BRDA 1RDWX 3FZLA 3RSEA 1LCUA 4BRIA 3AAQA 3IDHA 1DGKN 4BC4A 3IFRA 1JCGA 1QZ6A 1U6ZA 3FZMA 3ULEA 4A2BA 5AQHA 3VF4A 3VPZA 1HUXA 4I6MA 2QWNA 3L4IA 5AQJA 3EO3A 3VEYA 3L6QA 1GLBG 1RGIA 4M7YA 2E2NA 4BVOA 4JD2B 2GUPA 3ZX2A 4CZEA 3O1BA 4IWVA 3BUZB 3LL3A 3WUHA 3MDQA 2ASPA 4BGAA 1ZBSA 3HSCA 3A8YA 3CJAA 3DXMA 3BEXA 3UKRB 1QQMA 4PL8A 3VOVA 4FWNA 1X3MA 4DHYA 4JAXA 5CE3A 3W3DA 3DXKB 2P9KA 5KPTA 2HF3A 2IVOA 2P9IA 1XQSC 2BUPA 3C7NB 1KXPA 3AARA 4EHUA 3SMPA 2V7YA 2D0OA 4EHTA 3VETA 4BREA 1GLJO 1V4TA 4FWKA 2P9PB 3ZEUB 2CGKA 3DAWA 3ULEB 2GELA 4BQZA 3H45C 2VWBA 2D4WA 1DKGD 2QWPA 2NLXA 3SJHA 1ATNA 3MN6A 1MA9B 3JS6A 3LDLA 5AQXA 1R59O 2QWRA 2GWJA 2I7NA 4BR0A 2YHYA 4ISFA 4JHDA 4H03B 3BF1A 2PBDA 4M7XA 4XH4A 2QWOA 3R8EA 1P8ZA 3CQXA 4MO4A 4KBOA 5KPZA 2AP1A 3AY9A 2FSNA 5AFUA 3MN7A 1YUWA 1WOQA 2E2OA 4HWIA 5AQWA 3J8AA 1QHAA 5ELZA 2P9IB 2V7ZA 3QBXA 1IG8A 5AQMA 1BUPA 2IVPA 4CZHA 3ATUA 4CBUA 5JLHA 2Q36A 2YI1A 3H3OB 2QWQA 1GLCG 2EWSA 2E2PA 3BP8A 3CI5A 5ADXH 4FPAA 4WYBA 2P9SA 2IVNA 1OKJA 4FWSA 1NWKA 4WQ4A 5B8HA 2Q1NA 5EOYA 4XH5A 3VEZA 4WQ4C 1ATRA 1NBWA 3O4WA 4FWRA 3CJBA 1E4FT 3FR0A 4YDUA 2YCHA 1NGBA 4CZFA 4XH1A 1T6DA 2ZGYA 3DXKA 3DJCA 3H46O 5BN9A 2ZF5O 4B1XB 2ASMA 4Y0WA 4YDUC 2E1YA 4C23A 5AQLA 3QMLA 2Q97A 4GNIA 2P9UB 1Q18A 1YAGA 4CZMA 2A5XA 3UB5A 1HJOA 3D2EA 5F2RA 4CZKA 1NGDA 3FZHA 2IIRA 2P9PA 1JCEA 1G99A 3H3NO 3HTVA 4RTFD 3ZEUA 4CZLA 3CJ9A 4IJAA 1SAZA 3CHWA 4B1YB 5ADXA 4H5TA 4MLEA 4RCHA 3VGKA 4EAHD 1J6ZA 3LDNA 2FSJA 5EVZA 3FLCO 1NGCA 1T44A 3VF6A 1GLLO 1MWKA 1YXQA 2ZGZA 5F1XA 3B8AX 1BU6O 4NO7A 3A0IX 2Q0UA 4CJ7A 1E4GT 2P9SB 2A41A 3R6MA 5KQDA 5LJVA 3MK6A 5AQGA 3O5BA 4FWPA 5AQUA 4H5WA 4CD3A 5KQ8A 1HLUA 4DB3A 4JN4A 4BRLA 1QZ5A 3ENHA 1HKBA 4IZ9A 2FXUA 1MWMA 3CQYA 4CBXA 4CZIA 3GL1A 1TUUA 5AFUH 3S41A 4BGBA 4DQ8A 4EFHA 2E20A 5BPLA 3CJCA 4ISGA 1H1VA 2E1ZA 3EKSA 5E26A 2W41A 3SK3A 3EN9A 4H0PA 3D2EB 3EKUA 5KPRA 3VEVA 3ZX3A 1RFQA 3HZ6A 3LDQA 4K42A 4EIAA 5FPDA 3UKUB 2OANA 2A40A 4BRNA 4BRGA 4BR9A 1U2VB 2Q0RA 1GLDG 4JNEA 3CJ1A 1T6CA 3QBWA 4RWTA 2Q2RA 1HKGA 1V4SA 3VESA 1MDUB 4PKGA 4FWOA 4BVPA 4PL7A 5AQQA 5FPNA 3WEEA 3H1QA 3H1VX 3QICA 2P9UA 5JICA 2GEMA 3I8BA 3QB0A 2H3GX 3ZETB 2ZWHA 3EL2A 3CJ7A 4AM6A 1BA1A 3F9MA 3FGUA 1XC3A 2CH5A 1NGFA 1SZ2A 2QXLA 2VYPA 5AQIA 2F9WA 4WQ5A 1TUYA 4FOEA 3MN5A 2KHOA 2E8AA 3WT0A 5BPNA 1NLVA 3WXIA 3P4IA 5BREA 4IJNA 4WQ5C 2QM1A 3LM2A 5AQKA 3IUCA 5AZJA 1HPMA 5EX5A 2CGLA 3LDOA 1KAXA 3DWLA 3QFUA 5FPEA 4BRAA 4CI6A 4BR2A 4L3QA 5BN8A 3WXLA 3HBTA 1X9JA 2YHXA 5EY4A 5BRHA 4H0TB 4BRMA 3TU5A 4BC5A 4XEIA 3VEXA 2D0PA 4B1ZA 1ATSA 1WUAA 1CZAN 3O6WA 2HOEA 4FO0A 3WEEB 4B9QA 3D2FB 4BROA 3H6EA 1HKCA 1S3XA 3GOIA 3QDKA 4QS9A 3D7EO 2A42A 1YVNA 3CERA 2FLOA 4A62A 4M63C 3UKUA 3FZFA 1K8KB 5AR0A 5I9EB 3LM9A 3U9DA 4MO5A 1U2VA 5EXWA 3CETA 1BOTO 4B1WB 2CGJA 4A2AA 4F9OA 5F0XA 2HF4A 1GLAG 3U9ZA 5AZJB 3WQTA 1QQOA 1Y64A 2J4RA 2BTFA 5AQZA 2GTDA 1NGGA 2CH6A 3EZWA 3W0LA 1NGHA 4FWMA 4CD1A 3A5LC 3VF2A 2D1KA 5AQPA 1DEJA 1BDGA 1S22A 3ID8A 3LDPA 3O1WA 4A61A 4BR5A 3IMXA 3AAPA 3ZETA 1NGAA 2PAVA 3HM8A 3TPQA 3VEOA 2ASOA 3U4LA 2P9LA 3C0BA 2FSKA 3GG4A 3UE5A 4QS7A 4BR7A 3VERA 1NM1A 4PKIA 1TYQA 2E88A 3SLCA 4B1UB 4E1JA 5JMVA 1BA0A 5LY3A 3O80A 4H0OA 1NGIA 2YJEA 1Z05A 3M6GA 2UYTA 3M1FA 1D4XA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3MEDA 4CJ5A 3H08A 3AVHA 2WC9A 2ITMA 3OYEA 3ATVA 4HTLA 1NKBA 3E66A 4FSVA 3MECA 2VCPA 4CERA 5BR9A 3PY8A 3P31A 5AZIA 4BRQA 3THYB 1RCHA 3RRHA 2QW9A 2HNDA 1U48A 3KVGA 3SJJA 3CFRA 3VENA 2P5GA 3O8MA 4DTMA 4J2DA 4JKCA 1KRPA 2OA8A 2A6AA 3SV4A 3FFKB 3V1RA 4B1VA 4CF2A 2P9LB 3LDSA 5LJWA 3VGMA 4CEOA 3R3LA 4Y1CA 1K8KA 4J8FA 3QERA 2AJQA 3IRXA 1SL0A 2NRVA 1Z6RA 3D45A 1LOTB 4FYDA 3I33A 3U3YA 3SI6A 4BRCA 3CCEN 4KHYA 3NBPA 4AHSA 1GLFO 4QOZB 2Q31A 4GV3A 1KVCA 3A5OC 4KKOA 4O5FA 4H0XB 4K0KK 3QFPA 1WSIA 4KFBA 4ILHA 3NFAA 4FM0A 4JI4K 3I56N 4W5NA 1W97L 2RF2A 4WFBL 3DRPA 4N76A 3VGLA 4FLXA 2P51A 2XO7A 1K73O 1KAZA 3VMFB 4FJKA 1DTQA 2A3ZA 3CIPA 2HHSA 3AVJA 1BIUA 4B3MK 4L8RB 1S1TA 3IG1A 3LP2A 3HL8A 1MU2A 3ENOA 2P9NB 2QWMA 4CJQA 3RTVA 3QNOA 1BISA 2Z1HA 3GE1A 3K59A 2YKMA 1LAWA 3CFOA 2XY8A 2G8UA 4PY5A 3TWHA 4DTUA 1RTIA 4I7FA 1R0AA 2WONA 4LC9B 1JL1A 3LWMA 3U3GA 3EZ5A 5AQRA 4DTRA 3LP3A 1JLQA 4DG1A 4O0IA 4CJPA 3FZMA 4AHCA 4RW8A 2QXFA 5KGXA 1YJWN 1G15A 3THWB 2QWNA 3L4IA 1GLBG 4JD2B 3OJUA 3HVTA 4DQQA 3SZ2A 3ASMA 3F73A 3LWLA 4GKJK 3K9JA 4OO1J 1KFSA 4DLGA 4JI1K 3K5OA 1VQON 3V9SA 1T05A 4PL8A 4FWNA 3E9LA 5CE3A 5DM6L 1WSJA 1KC8O 1S1UA 3AVAA 2HF3A 1NOYA 3AARA 4EHUA 3TANA 4A59A 2D0OA 3CFPA 3QEVA 4HUEA 1VHXA 1GLJO 1V4TA 2P9PB 1ZYQA 3DAWA 3ULEB 1REVA 4CEAA 2ETJA 4DSFA 2VWBA 3OY9A 2NLXA 4DMNA 3NAEA 3JS6A 4PHTX 3LDLA 3J80O 2I7NA 4BR0A 2BE2A 5AJ3K 4A57A 4H03B 1RT7A 2PBDA 3BF1A 4ILJA 4M7XA 4XH4A 3CQXA 4E0DA 1S1VA 4EZ6A 5AFUA 2YHAA 1ZBIA 2YV0X 4OJRA 1JLBA 3WXMB 2E2OA 2O8BA 3EE9A 1C0MA 3HXMA 2FBYA 4CEBA 3DM2A 1N32K 4CZHA 3VQ7A 1RBSA 4NLBA 2RN2A 1HQUA 3NHGA 3C6UA 1IO2A 2YI1A 3H3OB 4N41A 3OYCA 3SCXA 4LF6K 2VWKA 1GLCG 4FJ8A 2O8CB 4FPAA 4CGGA 2IVNA 2X6SA 4FM2A 1OKJA 1XHZA 4Q5VA 3S3MA 2OTJN 4FLVA 4H4MA 5EOYA 5C0YA 1D5AA 3CJBA 1S6QA 1JXEA 4IOAL 4E7KA 4AHVA 3DXKA 4LF4K 3DJCA 2F96A 5C10A 4FJXA 2ZF5O 3SUQA 2ASMA 2ZJRL 2F4VK 5AQLA 1Q81O 4CHOA 4YY3K 3QEPA 4KHSA 4K8XA 5F2RA 1RTDA 1NGDA 2HVIA 4QCLA 4B1YB 4AHUA 3N4QA 3DYAA 2FSJA 3RWUA 4I2QA 1IKWA 5EVZA 3FLCO 1IKXA 3CM6A 4KRFA 4CJ7A 4JKEA 5KQDA 1KVBA 4IEEA 3L4QA 4CD3A 5KQ8A 3O3GA 4CHPA 5E41A 1W2BM 1HKBA 3CQ8A 4JK7A 2NRTA 4DFMA 1IBKK 3BZCA 4FLWA 5BPLA 1KTQA 4CIEA 1CLQA 3CJCA 2E1ZA 5E26A 4HCCA 3SK3A 4H0PA 3K57A 4OVLA 5KPRA 4BDPA 3HZ6A 1VSFA 2OANA 1EKEA 1C0TA 4E89A 2G8IA 4BRGA 5J2NA 4DSLA 4BR9A 2Q0RA 1N6QA 3OBYA 3CMEN 1DLOA 4X62K 3RMAA 4M3RA 1YT3A 1MDUB 4BVPA 4PL7A 3V9WA 5M1KA 2PZSA 2P1JA 3OYIA 3O9UA 3QB0A 3EL2A 4AM6A 4JLHA 2R7YA 4E1NA 1XC3A 1NGFA 5AQIA 4CGJA 4A5AA 1ZBLA 4C1NK 2E8AA 4CJUA 4OPJA 3M8SA 3WXIA 4DKWA 2HBKA 4DQPA 3KD5E 2DFEA 4ICLA 1HPMA 5EX5A 2W6KA 3V1OA 4JKAA 3O9RA 4CJVA 4CW7B 4FZZA 3SNNA 1X9MA 3LAMA 4BRAA 3ZSZA 4PWDA 2KQ2A 3LP1A 4BR2A 1F21A 4CJLA 5BN8A 1RT1A 4CEDA 2IS3A 1JLFA 4KTZA 2D5RA 4H0TB 2EHGA 5C2DA 4BC5A 1N36K 3SPZA 3AO5A 1ATSA 3O6WA 2HOEA 4KH6A 3WEEB 4CECA 4CE9A 2QA4N 4F4KA 1SL2A 2RPIA 4M3WA 3NGIA 4ZTJA 1BCOA 3NE6A 4OKKA 1NKEA 4F3TA 4GV9A 2A42A 3VQBA 1YVNA 4M42A 4A62A 2IDOA 2OPPA 1K8KB 4IFEA 3MX2A 5AR0A 2BH1A 1RBUA 1WSFA 5EXWA 4IO9L 5DK5A 3AVNA 3IAYA 2CGJA 4A2AA 2HF4A 3HT3A 3U9ZA 5AZJB 4JKHA 4QAGA 2UUCK 2BTFA 4OGCA 4DF8A 5AQZA 1DTTA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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