3TU5A

Actin complex with gelsolin segment 1 fused to cobl segment
Total Genus 110
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
110
sequence length
370
structure length
370
Chain Sequence
ETTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Structural protein/actin-binding protein
molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
publication title Structural States and dynamics of the d-loop in actin.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 110
structure length 370
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-09-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 3tu5A02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3tu5A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3tu5A03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3tu5A04
5AQUA 1NM1A 2D0PA 4XEIA 4JD2A 3OHRA 5JICA 4JAXA 2Q1NA 3UKUB 3UKRA 2NRHA 3LDLA 3VESA 3KHYA 4FPBA 3VEZA 1ATRA 4B1VA 2E2QA 5LY3A 4Z94A 3D2FB 2QWRA 4FWSA 3U8XA 1V4TA 3M1FA 1IG8A 4H0TB 2P9SA 3WQUA 3VEVA 3VF4A 4F9OA 2Q0UA 1RFQA 2AP1A 2YJFA 3R8EA 4WYBA 2YI1A 4BROA 1D4XA 4K43A 2P9UB 1CZAN 3MMVA 3CJ7A 2W41A 3CJAA 2IVOA 4K41A 2OANA 4FO0A 4MO4A 3VERA 4XH5A 3FLCO 1Z6RA 3LM9A 4GY2B 2QWOA 5FPNA 3VGMA 1X3NA 4PKIA 3U9ZA 3BP8A 2QWMA 2VCPA 4BR2A 4RCHA 2Q36A 5EXWA 2P9IB 4JN4A 3CJCA 2FLOA 3ENHA 4FWRA 1E4FT 4CBWA 1ATSA 3FR0A 3ZEUB 5BPNA 1HKCA 2IVPA 4B1YB 3ULEA 2P9LA 1KAZA 4EFHA 1R59O 4JHDB 2ASPA 5EY4A 1GLJO 2D4WA 5AQGA 2A3ZA 5AQNA 1GLFO 4A62A 4BRAA 4KBOA 3FE1A 1GLLO 3BF1A 3BF3A 4FWLA 3VEYA 3HM8A 4BC4A 2PBDA 3DXMB 3IDHA 2QM1A 4EHTA 3SK3A 2V7ZA 3VETA 2P9PB 4BG8A 4FWPA 1MWKA 3LL3A 1QQNA 5AQMA 3IFRA 3D7EO 3WEEB 3O1WA 2CGKA 4E1JA 4RTFD 5AQFA 4EAHD 3O1BA 4A2AA 3O6WA 4O8KA 3H3OB 4WQ4C 3U9DA 3WQTA 3CETA 5AFUA 3DXKA 1HPMA 1NGFA 4PKHA 4ISFA 3EZWA 3QFPA 4BC5A 4B9QA 3DWLA 4DHYA 1ZXOA 2A6AA 3HZ6A 4H5WA 4YDUC 1ATNA 1XQSC 3C7NB 4DCHA 3FZKA 1S3XA 5AR0A 1NGAA 3P4IA 1DEJA 4C23A 4BG9A 4BRHA 5AQLA 3SLCA 3JXUA 3VENA 1GLDG 2P9KB 4FWQA 4ISEA 3A5NC 2QW9A 4FOEA 4CZHA 3QFUA 1YAGA 3GG4A 1TUUA 1ESVA 3CERA 3ID8A 1K8KB 2P9NB 3S41A 3SJHA 2BTFA 4BR9A 4H5TA 4H5RA 2YHYA 4FWOA 4CZIA 2BUPA 3RSEA 1BA1A 1JCGA 3ZX0A 4B1WB 1QQOA 4BRFA 4WQ4A 5E84A 2EWSA 4H5NA 4K42A 3LDQA 4XH4A 4BQZA 4CI6A 5BPMA 4H0YB 3A5MC 3W0LA 4IJNA 3TPQA 1NMDA 3A0IX 4BC3A 4BR5A 1QZ6A 5AQXA 5KPZA 1HLUA 4QS8A 3VF6A 4CJ7A 5BPLA 2CGLA 3QMLA 1MA9B 4FPAA 3AAPA 1Z05A 3M3ZA 3AY9A 4MLHA 5ADXH 4AM6A 1T6DA 2D1KA 1C0GA 4A61A 2P9LB 3EL2A 1YXQA 3TU5A 2ZWHA 1NBWA 3FZMA 2WUSA 1J6ZA 2QWPA 4I6MA 3WXLA 3SMSA 3KVGA 1LOTB 2CGJA 2Q31A 4HTLA 4CZLA 5KQDA 1GLEG 3VGKA 4CBUA 1Q18A 3ZETA 2FF6A 4GNIA 1GLAG 4BR7A 5BR9A 1NGHA 3CIPA 4CD3A 4BGAA 2E2NA 2IVNA 3GOIA 1NWKA 3LDPA 5CE3A 3CI5A 1NGJA 3MN5A 2V52B 2YHWA 1NGEA 4BRMA 4M7YA 4FWMA 1U2VA 3J8AA 1XUPO 3L0QA 1HX1A 4J8FA 1TYQA 2QWNA 3H45C 2ITMA 1BU6O 3VPZA 4WQ5A 3L4IA 1IJJA 3O8MA 4EHUA 2GWKA 5AQOA 3BUZB 5F0XA 2E2PA 2F9TA 2W40A 1KAYA 5I9EB 4CZKA 3IUCA 1NGGA 3VF2A 3KZBA 2H3GX 3UKUA 5BRFA 3I33A 4JNEA 5KPRA 5AQZA 1ZBSA 3D2FA 2PAVA 3R6MA 3WXJA 1X3MA 4BRPA 4CZJA 1HKBA 3JS6A 3D2EB 3CJ1A 3ZX3A 4A2BA 5AQTA 1LCUA 2I7NA 5AZJB 5F1XA 2QXLA 3CHWA 4FOIA 3CJBA 1WOQA 2P9UA 3A5OC 4BRLA 5AZIB 2ZF5O 3BEXA 3CQYA 4JD2B 3GL1A 1NGIA 4Y0WA 1NLVA 3EO3A 4BRCA 4BR0A 3H1QA 3UKRB 5AQPA 5TKYA 3A8YA 2GEMA 5E26A 1RDWX 2GELA 4CZEA 3QB0A 2FSKA 4MO5A 3DAWA 5AQHA 3VEWA 3WXKA 1DGKN 5AQRA 3WXIA 2VYPA 3HI0A 2P9IA 2P9SB 4BRDA 5AQQA 3HBTA 4BVOA 2GWJA 3VGLA 1EQYA 5BN8A 4H0XB 4JHDA 3ATVA 2HMPA 3VEXA 2Q97A 3QBWA 5AQSA 3ENOA 3QBXA 2NLXA 4BRGA 4BRIA 2A40A 1BG3A 3DXMA 1BA0A 2D0OA 5FPEA 2E20A 5BRDA 2P9PA 2HF4A 1C0FA 1XC3A 5ADXA 3B8AX 3FZHA 1ZC6A 4FL9A 3WEEA 2ZGYA 4XH1A 3FFKB 3VOVA 1JCEA 1YUWA 2FXUA 4WQ5C 3DJCA 3H3NO 3ULEB 3GE1A 2HOEA 2FSJA 3VEOA 1BDGA 2CH6A 2Q2RA 2UYTA 3C7NA 3CQXA 2E88A 2YCHA 2V7YA 4BREA 5BREA 4PL7A 1SZ2A 1KAXA 2A41A 3EN9A 2P9KA 3O5BA 2NZTA 3I8BA 5EVZA 2FSNA 3WT0A 1YVNA 3EKUA 2CH5A 3UB5A 5B8HA 4M7XA 2F9WA 4BVPA 5KQ8A 4IWVA 5KPTA 1K8KA 2P9NA 4BRNA 3MN6A 3DXKB 3G25A 5LJVA 3LDNA 3LM2A 3H6EA 3MCPA 4PL8A 1X9JA 4EIAA 2E8AA 5JLHA 2ASMA 4B1UB 5AQJA 1NGBA 2I7PA 3F9MA 2YJEA 3CJ9A 2QWLA 1HUXA 2ASOA 1KXPA 1HJOA 4QS9A 5AQYA 2KHOA 3FZFA 4IZ9A 5EX5A 4H0OA 1NGDA 4FSVA 3HSCA 3A5LC 4IXCA 3LDOA 4IJAA 2FF3B 3ZX2A 5AQVA 3R9PA 3M6GA 4NB4A 4B1XB 1QHAA 3HTVA 4CZFA 3RSEB 1RGIA 3MN7A 3GDQA 4BQLA 3QDKA 5AQKA 4AM7A 1BWFO 3MN9A 1MDUB 2IIRA 3FGUA 4BGBA 2HF3A 3O80A 2V51B 3UE5A 3H1VX 3QICA 5FPDA 3IMXA 1BUPA 3MK6A 4FWNA 5LJWA 4QS7A 1TUYA 3H46O 2ZGZA 4CZMA 4NO7A 5ELZA 5AQWA 1P8ZA 1T6CA 1E4GT 2Q0RA 1H1VA 5BRHA 1NGCA 4RWTA 2E2OA 4O5FA 1SAZA 3AAQA 1DKGD 4HWIA 5AFUH 2GTDA 4I6MB 3C0BA 5EOYA 4BRKA 4DB3A 5AQIA 3U4LA 3ZEUA 3GBTA 3MDQA 2YHXA 3ZETB 2AA4A 1Y64A 2QWQA 4FWKA 4L3QA 5FPMA 4BRQA 4MLEA 4DQ8A 3SMPA 5JLFA 2GUPA 1HKGA 2J4RA 3O4WA 4K25A 1QQMA 2A42A 3O08A 4B1ZA 1S22A 1U6ZA 4BC2A 4BR4A 3FZLA 2E1YA 4IO8A 2A5XA 1WUAA 1G99A 1MWMA 4PKGA 4CBXA 4H5VA 1BOTO 2E1ZA 5F2RA 3W3DA 4H0PA 3EKSA 4CZGA 1U2VB 3ATUA 1TYQB 4H03B 4M63C 5BN9A 2VWBA 4H0VB 4LC9B 1QZ5A 1GLCG 3L6QA 3D2EA 5JMVA 1SQKA 1BO5O 5AZJA 1GLBG 1V4SA 2DPNA 1OKJA 3WUHA 4CD1A 3AARA 1JCFA 4YDUA 1T44A 4ISGA 5AZIA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3LP1A 5AQUA 4JD2A 3V81A 4HTUA 3UKRA 4CHOA 4FPBA 4PY5A 3VEZA 4Q0BA 5LY3A 2E2QA 1C1AA 1VQ6N 3JSMA 1FKOA 1IG8A 2P9SA 2RKIA 3WQUA 3VF4A 1C1BA 1RFQA 1RDCA 3I0SA 2B4JA 4WYBA 2HBJA 1D4XA 4LSLA 3E9LA 1CZAN 3AGRA 3MMVA 2ZE2A 4FK4A 4MO4A 3L2VA 4YHHK 3FLCO 1TGOA 1Z6RA 3B6OA 3LM9A 5FROA 4B9NA 1FKPA 5FDLA 1X3NA 1JLBA 4FZZA 1EO1A 2Q36A 4CJEA 2P9IB 4E7IA 5J2QA 2FLOA 3CCEN 4L8RB 1HKCA 4FK0A 1KAZA 4KHWA 4EFHA 3CXCM 3QEIA 1GLJO 4GV9A 1GLFO 3FE1A 4HCBA 1VQLN 3VEYA 4CJWA 4YOXA 4CJ4A 4EHTA 2QM1A 1ASWA 3VETA 1MWKA 3LL3A 1QQNA 5EU7A 2GBZA 3KWGA 2FBXA 3WEEB 3KK2A 4ID5A 4E1MA 2C1GA 5AQFA 3CMAN 1XHZA 3U9DA 4WQ4C 3TAPA 4CERA 1YTUA 3QIOA 4C8MA 5CHIA 4F8RA 4BC5A 2XHBA 1TK5A 3DWLA 2Q3SA 4BE0A 1ZXOA 4G9ZA 4HCCA 3N4QA 3FZKA 1NGAA 4FLTA 1XI1A 4C23A 3THWA 4F2RA 4BRHA 1TKXA 2BE2A 5HBMA 3OYHA 3AA3A 4CJLA 3A5NC 3HP9A 3J7YP 1YAGA 3NF9A 3VQPA 3S41A 4IDKA 1IV0A 2BTFA 4W5NA 4OKKA 2E6MA 2YHYA 2Z1HA 1WLJA 3RSEA 2F8SA 2X78A 4B1WB 1A5WA 4KTQA 1LV5A 3LDQA 3KWIA 4CI6A 4BQZA 5BPMA 3A5MC 4E7HA 4IJNA 4JK8A 2HHWA 3E1YA 4FJXA 5KGWA 3LZJA 1S72N 4B3OA 4C8OA 1RCHA 2CGLA 3MEGA 1MA9B 2AJQA 4FPAA 2NRXA 1X9SA 3SJJA 2W00A 4TSXA 3M3ZA 3I0RA 4YFUA 3P83D 1C0GA 3TTCA 1J9AA 4YOVA 3KJVA 1IKVA 1BL3A 4M3RA 1ZBHA 4J2AA 3WXLA 3SMSA 4HTLA 3S3NA 5KQDA 3VGKA 4CEOA 3QO9A 4GNIA 4DU3A 3CIPA 4CD3A 3V1OA 2IVNA 5CE3A 2HHIA 4ZTFA 3WNGA 2X6NA 4FLYA 4CFAA 5C25A 4DV4K 2YHWA 1VRTA 4FLZA 1WSEA 1YI2N 4BRMA 3CM5A 2O8FB 3L0QA 4J8FA 3KK1A 4CEZA 2XRIA 2QWNA 4CJFA 2ITMA 3VPZA 3RR8A 4MDAA 4WQ5A 3AVMA 3VQ6A 1IJJA 4XIUA 4LFAK 1GOBA 4EHUA 5AQOA 5F0XA 4J2EA 2EHGA 2UUCK 1S1WA 1KAYA 3SV4A 4IOCL 2NUBA 2VWKA 3IUCA 4FJKA 4CJPA 3KZBA 5SWMA 1T7PA 5JS2A 3UKUA 4NXMK 3ZSYA 4CHNA 4JI8K 4JNEA 5AQZA 1ZBSA 3MXJA 4DR1K 3D2FA 4KFBA 3LWLA 2PZSA 3NF8A 3WXJA 1X3MA 4CZJA 2KLAA 2HNZA 3ZX3A 3RRHA 5AQTA 3TABA 1TK8A 2I7NA 5AZJB 3CPWM 4UY8O 3QINA 2KTQA 3CJBA 3VQDA 2QKBA 2P9UA 3EY1A 4I2PA 4BRLA 1JLQA 3V9WA 5AZIB 3HPOA 3HK2A 3CQYA 4JD2B 4Y0WA 3ASMA 3PIPL 1U48A 4CHQA 3UKRB 5E26A 4JV5K 5CYMA 2GELA 4CZEA 2W42A 3SPZA 4MO5A 3DAWA 5J1EA 1DGKN 3WXIA 4CCHA 1G15A 2VGNA 3HI0A 1XMQK 2P9SB 1WBBA 4DLEA 3VGLA 5BN8A 5HRRA 4H0XB 4CIGA 3AGKA 3THVA 2E4LA 3IKMA 3QESA 4JKEA 4GV3A 3R3LA 2W6LA 1BG3A 4BRIA 4HHTA 4LF7K 3DXMA 1F21A 1LWCA 3THXA 2HF4A 1C0FA 1XC3A 3J81O 4Y1CA 2HHQA 3DMJA 3FFKB 1JCEA 3DJCA 1QHTA 3J80O 4DTSA 3O9QA 1C6VA 2Q2RA 3RMAA 3CFRA 4KHSA 3C7NA 3ZSVA 1NJXA 2E88A 2V7YA 3E9OA 4BREA 4JLHA 3O5BA 2P9KA 2F8TA 3P38A 2NZTA 1RDUA 4C8LA 5HL7L 4DR6K 1KRPA 3EKUA 2JWLA 1RILA 2F9WA 4BVPA 2ATQA 1K8KA 4ZHRA 3G25A 4CJTA 4BE7B 1RT6A 2DFEA 2IS3A 4PL8A 2B5JA 3RRGA 4B1UB 1T05A 1K8AO 3CJ9A 2QWLA 1HUXA 2ASOA 3THWB 4DQSA 1HNVA 1I94K 1HJOA 4GV6A 1RDDA 4QS9A 2KFNA 1GOAA 2KHOA 2IDOA 3CYMA 5EX5A 4OPJA 1J53A 3HSCA 1NKEA 4CJSA 4CHPA 4J2BA 3KTQA 3KKSA 3QETA 3K5OA 3AO4A 1K73O 4OJRA 2ETJA 3LP2A 4PHTX 3M6GA 4FM1A 4JKGB 3HTVA 3RSEB 3OYKA 2P1JA 3MN7A 4RW6A 3SQ2A 1L5UA 3DM2A 5AQKA 4AM7A 1LW2A 1NK0A 1RTIA 1VQNN 1IKWA 1XHXA 4CGGA 4KHPK 4FJ7A 3CCLN 3F73A 3O80A 1CZ9A 2V51B 4KTZA 3OA9A 3UE5A 3IMXA 1BUPA 5J2NA 4DV2K 4QS7A 3H46O 4IBNA 4NO7A 5AQWA 4DTOA 2Q0RA 1K6YA 4Z4IA 2LSNA 4OPKA 3AAQA 1DKGD 1SL0A 4HWIA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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