3U4LA

Cryocooled bovine profilin:actin crystal structure to 2.4 a
Total Genus 102
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
102
sequence length
370
structure length
353
Chain Sequence
AALVVDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGDSYVGDEAQSKRGIKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMDSGDGVTHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMESCGIHETTFNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Structural protein
molecule keywords Actin, cytoplasmic 1
publication title Structural basis for profilin-mediated actin nucleotide exchange.
pubmed doi rcsb
total genus 102
structure length 353
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-10-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3u4lA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3u4lA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3u4lA03
1HX1A 4HTLA 1HPMA 5E84A 5LY3A 4BVPA 3O1BA 4BC4A 4B1WB 4CZJA 3H1VX 2QM1A 3ENOA 4E1JA 4JHDA 4K43A 2P9UB 3JS6A 3QFUA 4BGAA 3S41A 5EVZA 3M6GA 2NZTA 4ISEA 3VETA 4AM6A 3HM8A 3A0IX 4XEIA 4CD1A 3ID8A 3CJ7A 2I7PA 1NM1A 4JD2B 1K8KA 4WYBA 1K8KB 4CI6A 3CJBA 5FPNA 5EXWA 2J4RA 2ZF5O 1JCEA 2VCPA 2F9WA 2FF3B 3VENA 2IVNA 4FOEA 4K25A 4RTFD 3AY9A 4BR9A 1MWMA 3VGKA 3RSEA 1TUYA 3RSEB 4FWSA 5AQMA 2KHOA 2CH5A 3VEZA 4CBWA 2FSJA 5KPRA 3L6QA 5AQTA 3O8MA 1BU6O 3O6WA 1S3XA 4H0YB 4H5TA 2E20A 4BR0A 3CQXA 4YDUC 3MN6A 3CQYA 3MK6A 3SJHA 1C0FA 4M7XA 2FSNA 2QWPA 3EKSA 3GBTA 4MO4A 5E26A 5AQWA 5KQDA 4MLHA 3L4IA 5EOYA 4BRKA 3IDHA 1QZ6A 1HJOA 3DJCA 1ZC6A 1QQNA 1KAXA 3SMPA 2QWOA 3D2EB 3UKUB 2EWSA 4FWRA 5AQUA 5AQXA 2H3GX 2AA4A 1LOTB 4BRGA 5KQ8A 3MDQA 1Z6RA 3UKRB 5BRDA 2CH6A 2FXUA 2V7YA 4CZHA 3H3NO 2ASMA 2Q97A 4FWQA 3G25A 4H0XB 4BRMA 3O4WA 3CHWA 3WUHA 3EL2A 1MA9B 4EAHD 3KVGA 4ISGA 4JNEA 4A2BA 3CI5A 2QW9A 5ELZA 2V51B 3FR0A 4FO0A 2GTDA 1SAZA 3GDQA 3LM9A 2A42A 3EN9A 3R6MA 5AQSA 3CIPA 5BRHA 3MN7A 3ZX0A 3ZEUB 3JXUA 3BF3A 3LDQA 5FPMA 3KZBA 1RDWX 5AZIB 4A62A 2P9SA 3HSCA 4DQ8A 2P9SB 4FWNA 1OKJA 4CJ7A 1QQOA 1DGKN 2ASPA 2HOEA 2D0OA 2YCHA 3WXIA 5BN8A 5LJVA 3QDKA 1GLBG 3TPQA 5CE3A 4B1YB 1EQYA 1X3NA 4BC2A 1MWKA 3HBTA 4BRLA 3H1QA 1HKGA 1YAGA 3MN9A 4BG9A 3O08A 1TUUA 3SLCA 5F0XA 4CBXA 4FPAA 1NGGA 5AQLA 4H5NA 3U8XA 1Y64A 4PKHA 3U9DA 3VGMA 1IJJA 4JHDB 2V7ZA 1ATSA 2E1YA 5BPNA 2D1KA 1D4XA 2V52B 3WXJA 3LDPA 3WEEA 1NLVA 3WEEB 1WUAA 4BROA 1KAYA 3HTVA 5JLHA 2W41A 4PL7A 3L0QA 3BEXA 4BR7A 1Z05A 3QMLA 4BR2A 1E4FT 1X3MA 3AARA 5AQNA 5LJWA 3VEOA 4QS8A 2ZGYA 3I8BA 2IVOA 4H0PA 5AQHA 2Q31A 5BRFA 3OHRA 3EO3A 4FWLA 1ZXOA 4BRCA 4QS9A 1XQSC 2A5XA 4B9QA 2FSKA 1NGEA 2FLOA 4H5RA 3DXKA 4BGBA 3FZMA 2ITMA 3DXKB 4IJNA 2Q36A 1JCFA 2BTFA 2QWNA 4B1XB 5I9EB 2IVPA 3ZX2A 2UYTA 4BRFA 3W0LA 3LDOA 4O8KA 3C7NA 2P9KA 3ZX3A 3IUCA 1BO5O 3C7NB 2P9KB 4BRDA 3J8AA 4C23A 1NGFA 1V4SA 4B1VA 1GLDG 2QWLA 1GLAG 3CETA 5BPMA 3IMXA 3I33A 5ADXA 3W3DA 1QQMA 3KHYA 1YUWA 3H3OB 1NBWA 3M1FA 1HUXA 4XH4A 1YVNA 5BR9A 1J6ZA 5AQVA 4BR5A 3U4LA 2BUPA 2YHWA 3QBXA 5EY4A 4BG8A 4WQ4A 2AP1A 1HKCA 1U2VA 1ATRA 4CZKA 1NGHA 1U2VB 3QB0A 4MLEA 4BREA 3HZ6A 4B1UB 5AQZA 1NGCA 2I7NA 1ATNA 4NO7A 3A5OC 5AQJA 5KPTA 3H46O 3IFRA 3U9ZA 4BQLA 3VF6A 3VEYA 3H45C 4LC9B 1GLFO 2F9TA 3HI0A 4EFHA 4H0VB 3D7EO 5BN9A 3LL3A 4BRNA 2QWQA 2A41A 1BG3A 2NLXA 2E88A 3WQTA 5KPZA 4A61A 4CZLA 2D0PA 1U6ZA 3ZETA 2P9LA 2A3ZA 2P9LB 2CGKA 2CGJA 3R8EA 4IZ9A 2HMPA 2WUSA 2YHYA 2HF4A 1GLJO 3GL1A 3SMSA 1T6CA 1GLLO 3D2FA 4BR4A 3D2FB 2QXLA 3ENHA 5AFUA 3WXKA 3UE5A 2E2QA 1H1VA 1C0GA 4XH5A 5AQPA 3WT0A 1BWFO 1HKBA 2ASOA 3LDNA 5EX5A 4BVOA 3GG4A 4FWPA 5JLFA 4B1ZA 1T6DA 1S22A 3A5MC 3ATUA 2ZGZA 4WQ5A 4CD3A 5BREA 5F1XA 4FPBA 1JCGA 4DHYA 4DCHA 5AQOA 2E1ZA 1P8ZA 1T44A 2IIRA 2W40A 1NGAA 4KBOA 4FWKA 2YHXA 1NGJA 2YJFA 3A5LC 1XC3A 1LCUA 4AM7A 5AQGA 5F2RA 2A6AA 4IO8A 3FZFA 4DB3A 3ULEA 3BP8A 3M3ZA 4IJAA 1TYQA 4CZIA 4MO5A 3R9PA 4BQZA 1QHAA 4F9OA 4I6MA 4M63C 2Q0UA 4I6MB 2E2NA 2E2PA 4H5WA 1RGIA 4BC5A 1X9JA 1MDUB 3FLCO 4PKIA 3EKUA 4QS7A 3VF4A 4A2AA 3VEVA 3DAWA 2P9UA 4EHUA 3WXLA 4RCHA 4NB4A 1BA1A 5JICA 4BC3A 3FFKB 4IWVA 4Z94A 1E4GT 3BF1A 2CGLA 5FPEA 3VEWA 1BUPA 4JD2A 3O5BA 2FF6A 3MN5A 1Q18A 4H5VA 5FPDA 5ADXH 4Y0WA 4JAXA 1NGBA 3VOVA 2P9IA 4BRPA 2P9IB 3AAQA 1HLUA 5TKYA 5AQRA 3ATVA 1DEJA 4CBUA 2GUPA 3UB5A 1XUPO 2GWJA 4K42A 1ZBSA 4BRQA 4FWMA 3B8AX 3QBWA 4PKGA 4YDUA 1CZAN 2Q2RA 2QWRA 4JN4A 1NGIA 3SK3A 2VYPA 1NWKA 4K41A 5AQQA 1SZ2A 2NRHA 5AQFA 4CZGA 3VGLA 4CZMA 2D4WA 1YXQA 3A8YA 1V4TA 3FGUA 2E2OA 3LDLA 5AQYA 3GE1A 1KXPA 4GY2B 3CJ9A 2OANA 2YI1A 3DXMA 4IXCA 3DXMB 3CERA 1KAZA 3FE1A 5AQKA 3D2EA 3UKUA 1NGDA 4ISFA 3H6EA 5AR0A 4BRHA 4L3QA 4H0TB 4BRIA 3A5NC 1ESVA 4M7YA 3P4IA 4WQ4C 1DKGD 3C0BA 4BRAA 3UKRA 3VESA 4RWTA 4GNIA 3CJ1A 1NMDA 2HF3A 1BOTO 4H0OA 3GOIA 3MCPA 2P9PA 3CJCA 2P9PB 5JMVA 4FSVA 5AFUH 4EIAA 3EZWA 2QWMA 5BPLA 3O80A 2GELA 3F9MA 1QZ5A 4J8FA 3ZETB 1SQKA 2DPNA 4FWOA 4CZEA 3FZHA 3DWLA 3TU5A 3FZLA 2A40A 4PL8A 2Q0RA 2VWBA 1BDGA 3AAPA 3BUZB 2GEMA 4EHTA 3MMVA 3WQUA 3QFPA 2PAVA 4O5FA 3ZEUA 2Q1NA 5AZIA 1WOQA 4H03B 2YJEA 4XH1A 1RFQA 4FOIA 3O1WA 1GLEG 3VF2A 2E8AA 3CJAA 3FZKA 3VEXA 5AZJA 5AZJB 2ZWHA 5B8HA 3QICA 3LM2A 2GWKA 3VERA 4HWIA 1R59O 2PBDA 4WQ5C 1G99A 4CZFA 5AQIA 1BA0A 3VPZA 2P9NA 4FL9A 3ULEB 2P9NB 1GLCG 1IG8A 1TYQB
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4O0IA 4DR1K 3C95A 5HLFA 5LY3A 1G15A 1HQUA 4B1WB 3DRPA 4B3RK 4K43A 1ASWA 4BGAA 4K0KK 3RTVA 2HHUA 4C8KA 3HK2A 4JI2K 4N56A 2W42A 3BDPA 3S3NA 4ISEA 3MX5A 2RPIA 3OYBA 3TR8A 2Z1JA 4GW6A 4IFYA 2Y1JA 1YHQN 1K8KA 5FRMA 1VQ5N 4IOAL 1K8KB 3CJBA 2HNYA 5EXWA 3NF7A 4JS4A 2J4RA 4C1NI 4E7IA 2F9WA 3VENA 2OPRA 2VGNA 3AY9A 2OZSA 1MWMA 2E6LA 1NK9A 3RSEA 1BGXT 3RSEB 2KHOA 1WAFA 3VQ4A 2FSJA 4KTZA 2HVIA 3KWGA 1W7AA 1S3XA 2QXFA 4U67L 2HNZA 3CQXA 3MK6A 4I2QA 4MLHA 1C1AA 1C1BA 5EOYA 4BRKA 4CF2A 1N36K 4LF9K 1QQNA 3AO3A 1SS6A 4FWRA 4NLCA 5AQUA 5FLXO 5KQ8A 4XIUA 1OVYA 1RT5A 1YT3A 4EP4A 2V7YA 4KREA 3H3NO 4B3MK 2ASMA 2FBTA 4KTWA 4FK2A 1T05A 1KTQA 3CFRA 5M1KA 3QEPA 1REVA 4B3OA 1EETA 1K8AO 3KVGA 4ISGA 4DWIA 4H4MA 2QK9A 1RBUA 1VAZA 3CI5A 2QW9A 3EE8A 3L2VA 2GBZA 3FR0A 4FO0A 4B9VA 3V4IA 3CMEN 4O5BA 4CFBA 2A42A 1WSIA 3EN9A 4FCYA 5BRHA 3CIPA 3MN7A 3ZX0A 4F8RA 4A62A 2P9SA 3VQ9A 2P9SB 5LMNK 4YOYA 2D0BA 4CJ7A 3LALA 1VQNN 2D0OA 3OYNA 3LDSA 1BQNA 2VG6A 4KHWA 3WXIA 1GLBG 4QOZB 4CIGA 5M1FA 1VQLN 1N32K 1EQYA 4LSNA 4CHOA 3V81A 3CMAN 4BRLA 1EWQA 1NK0A 4M3UA 4JYAK 1YAGA 3O08A 1TUUA 5AQLA 1NGGA 4E89A 3U8XA 4YOVA 2G8KA 4JV5K 3U9DA 5M1OA 3OYLA 5D3GA 2V7ZA 3AVIA 1UAXA 3BGRA 1D9FA 4KHSA 4UQGA 5BPNA 1D4XA 4DFPA 3WEEA 4FZZA 1D9DA 3WEEB 4DTOA 4BROA 5K14A 3HRGA 1KAYA 1Z26A 4KPYA 5JLHA 5C42A 3R3LA 2UU9K 4CEQA 4AHRA 3CC2N 1Z05A 1Q86O 4AHUA 4F2RA 1X3MA 3KK7A 4LSLA 1ZBIA 4FWLA 1C0UA 1ZXOA 3QEXA 5I3UA 4H4OA 4B9QA 1XI1A 2FSKA 1LWCA 3DXKA 4BGBA 2E6MA 4CJ3A 3DXKB 5HP1A 3S5TA 2Q36A 1A5XA 3LANA 1RILA 1HYZA 4B1XB 2DFHA 2UYTA 1YI2N 4O8KA 3ZX3A 2P9KA 4A57A 3IUCA 2P9KB 4KRFA 2GV9A 3T7ZA 3E9PA 4DSIA 3KHYA 1T3VA 5BR8K 1WBDA 1NBWA 1UA1A 4HVJA 4XH4A 4NYFA 1YVNA 1BI4A 1WSGA 5BR9A 3L2WA 1LW0A 4CEDA 4DFMA 4FLTA 1XMOK 4FJ9A 4M42A 2NRTA 2YHWA 3E66A 3HM9A 4KHUA 4ID1A 4RW8A 2FBVA 2JWKA 4WQ4A 3VQ6A 2G8HA 1HKCA 4GKKK 1ATRA 1UWBA 4Z4GA 3HZ6A 3SQ4A 3VQPA 1TK5A 4BACA 4YOTA 5KPTA 3IFRA 4IO9L 4CF8A 1DT9A 3U9ZA 3P39A 3VF6A 3VEYA 3ZYYX 3HI0A 4H0VB 1P90A 4Y1DA 3HOSA 4N76A 4DF4A 4BDZA 1OVQA 4B9MA 5GAHP 3WQTA 2E88A 1T7PA 3QEWA 2D0PA 1U6ZA 1WLJA 3KKRA 2CGJA 4FJLA 2HB5A 2WUSA 1S9GA 3ZSYA 4FJIA 3AA5X 4MFBA 2O4IA 3WXKA 3UE5A 4XH5A 1C0GA 4CF1A 3M8QA 3VQ8A 3L4QA 3LDNA 3VTIA 2QTDA 2UXDK 2F8SA 4B1ZA 4JKAA 1RT4A 1W0HA 4DLEA 4E19A 5BREA 2X6SA 2AJQA 4DCHA 2YHAA 3S9HA 1LWEA 3NH2A 1ZBHA 1T44A 4DTJA 4BEBA 4AM7A 4IO8A 2DFEA 1CZ9A 3FZFA 3LAMA 4DB3A 4F2SA 3KD1E 3SZ2A 4CZIA 3THYA 1S72N 1RT6A 2Q0UA 1CZBA 4BC5A 4LFAK 3EKUA 4CHNA 3DAWA 1A5WA 1W9HA 3M8PA 3OBWA 4CJTA 4RCHA 4NB4A 5HRSA 1BA1A 3ZSWA 1TK0A 1WNSA 5GAGP 2F4VK 3L3VA 3DLHA 4X66K 1NG9A 4H8KA 4X65K 5FPEA 4PHTX 4PWDA 1QTMA 4B3TK 3MN5A 4KI4A 4O8UA 3CCVN 4H5VA 1C1CA 1RTIA 5CZ2A 2QI2A 5GAEP 3EY1A 1NGBA 3QLHA 4FJNA 4AF1A 2HBKA 4KHYA 5TKYA 4CJPA 3UB5A 3KLEA 3DLEA 4K42A 3K0SA 1RBRA 1VQKN 1RDBA 3ID6A 3D0PA 4PKGA 4YDUA 1CZAN 3KD5E 1NU0A 2Q2RA 2QWRA 5C10A 4JN4A 3SK3A 2VYPA 1NWKA 1SZ2A 4M41A 4CZMA 2VGMA 3SPZA 2QKKA 3A8YA 1LW2A 5CYMA 4LF6K 4ICLA 3CCEN 4LF4K 1WN7A 3K2PA 2Z1IA 3GE1A 4GY2B 4E7HA 4CE9A 5HRNA 3DXMA 3KWIA 4IXCA 3DXMB 3CERA 3V9UA 2VQFK 3PX4A 3OYGA 4BRHA 4L3QA 4H0TB 4BRIA 2OTJN 3P4IA 4WQ4C 5I42A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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