3U8XA

Crystal structure of a chimera containing the n-terminal domain (residues 8-29) of drosophila ciboulot and the c-terminal domain (residues 18-44) of bovine thymosin-beta4, bound to g-actin-atp
Total Genus 112
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
112
sequence length
366
structure length
357
Chain Sequence
TALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Contractile protein, protein binding
molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
publication title How a single residue in individual beta-thymosin/WH2 domains controls their functions in actin assembly
pubmed doi rcsb
source organism Drosophila melanogaster
total genus 112
structure length 357
sequence length 366
chains with identical sequence C
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-10-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3u8xA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3u8xA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3u8xA03
4CZJA 2NRHA 3R6MA 2FXUA 4CZEA 3EKSA 3R8EA 3FZHA 2IVNA 1JCEA 4JHDB 2DPNA 5AQUA 4CD3A 3VPZA 2Q1NA 1T6CA 3LDLA 2P9SA 2ZF5O 3L0QA 3FZFA 4H5NA 3ENHA 4BR0A 4FPAA 3H3OB 4CZLA 4H5TA 1T44A 2FLOA 1J6ZA 4K41A 3WEEB 2QXLA 2A3ZA 3EZWA 1X9JA 1OKJA 2YCHA 3EL2A 1C0GA 3MN5A 5LY3A 1H1VA 4H5WA 3TPQA 4BRPA 5KQDA 5AQHA 2CGLA 4CZKA 3WXJA 5KQ8A 2Q2RA 5AQIA 3CJ1A 4FSVA 2QWMA 1X3NA 3D2FB 4BRLA 5JLFA 1HKGA 4B1VA 4WQ5C 5ADXA 1C0FA 4FWOA 5AQYA 2OANA 3FFKB 3CQYA 2P9PA 4BR5A 1SAZA 3ATVA 4M63C 3AARA 3DXKB 3HBTA 5ELZA 4WQ5A 5AQJA 2V7ZA 3BP8A 2P9KA 4CI6A 2IVPA 2I7PA 5JMVA 5BN9A 3VETA 5BR9A 5AQMA 2P9IB 5EX5A 5AQRA 3B8AX 4WQ4C 3P4IA 4O5FA 4CZGA 5BRDA 4BRGA 3JS6A 5AR0A 2YJFA 4KBOA 4BR2A 1BA1A 4FWMA 3L4IA 3O5BA 5B8HA 2P9NB 1DGKN 3JXUA 2CH5A 3O80A 4FWLA 1ATNA 3O8MA 2GUPA 2V51B 3A0IX 3H45C 4BR7A 3UE5A 4NB4A 5AZJA 1BU6O 2E2QA 3CJ7A 4IZ9A 4NO7A 3D7EO 1NGIA 1NGJA 2HF3A 2CGKA 4CZFA 3IUCA 5AQSA 2IIRA 2GWKA 1E4FT 4BREA 3GBTA 4J8FA 4ISGA 4BG9A 3MN7A 2P9UB 3W3DA 2ZWHA 2V52B 3QB0A 1U2VA 4GNIA 4H0PA 2YHXA 3SJHA 3VEVA 5BN8A 4BC5A 4FWQA 4H5VA 2E1YA 2NLXA 1NLVA 5E84A 3ENOA 4BRNA 3WXLA 5JLHA 1V4TA 3SLCA 1X3MA 4QS8A 3ATUA 4FWSA 2HOEA 4DB3A 3C7NB 3WUHA 3W0LA 5LJVA 3LM2A 3VERA 4EHUA 1GLEG 3A5OC 3C0BA 4WYBA 1WUAA 1MDUB 4CZHA 4Y0WA 5F2RA 4XEIA 5AQFA 1KAZA 4B1YB 3MN9A 3H1VX 4A62A 3VF2A 4LC9B 1MA9B 2ASPA 2V7YA 5AZIB 4RWTA 1GLAG 4A61A 5AQKA 3R9PA 2KHOA 3IDHA 4CBWA 4I6MB 3CERA 3D2EB 4B1XB 5AFUH 2E2OA 3CJ9A 4MO4A 4JHDA 1QZ6A 3L6QA 3QFPA 4I6MA 3A5NC 1SZ2A 2F9WA 2QW9A 3RSEB 1QQMA 3O1BA 2YI1A 1WOQA 2VWBA 5BPMA 1GLCG 5AQOA 3LDQA 1S22A 3LDOA 4BRQA 3WEEA 1JCFA 2VCPA 2QWRA 3CQXA 4BQLA 2A42A 5AQPA 4BRMA 2W41A 1U6ZA 3FE1A 4M7XA 5AQLA 4ISFA 2E88A 3CI5A 3M3ZA 4RTFD 2I7NA 3ZEUB 3D2FA 4FWPA 2P9LB 3FR0A 1KAYA 3BF3A 3A5LC 4PKGA 4B1UB 3U9ZA 2P9LA 4H0YB 4BRCA 3AY9A 3AAQA 4BRHA 3DXKA 2CH6A 3GG4A 3CJBA 3VEYA 2HF4A 3VENA 1G99A 3IMXA 5F0XA 1ESVA 2P9IA 3LDPA 2J4RA 4PL8A 4A2BA 3HSCA 1TYQB 4CJ7A 5FPDA 1MWMA 2A6AA 3FZLA 1NM1A 4L3QA 5BRHA 5FPNA 2GTDA 3MMVA 2ASMA 4GY2B 4K43A 1NGAA 1MWKA 2HMPA 4EAHD 1BA0A 4H0TB 4CZMA 3HTVA 2P9NA 3QICA 3VOVA 2Q36A 1CZAN 1D4XA 3G25A 3O6WA 4IXCA 3WT0A 3EO3A 1IG8A 1BUPA 4BC4A 1P8ZA 3WXIA 2D4WA 3QFUA 3BEXA 3DXMB 2QWNA 3WQUA 2Q0UA 1JCGA 1BWFO 3H46O 1TUYA 2FSKA 1XQSC 2QWLA 2QWPA 2A40A 5EVZA 2PAVA 4AM7A 3CJCA 4BQZA 3BUZB 4EFHA 1T6DA 3QBWA 3MCPA 1IJJA 4BRFA 3KZBA 3ZX0A 2P9UA 4CZIA 1BOTO 1QQNA 1EQYA 1GLBG 4EHTA 2YHWA 5AQVA 5AQWA 2EWSA 4H0OA 5EOYA 4H0VB 5AQTA 3QMLA 2E2PA 3UKRB 1HJOA 2GWJA 4BGBA 1S3XA 5KPRA 3C7NA 4JAXA 1HPMA 4BRKA 1YUWA 4YDUC 4CBUA 1ATRA 1RGIA 5AQQA 3WXKA 3DAWA 3ZETB 2YHYA 3CETA 2AP1A 3AAPA 3BF1A 5AQXA 3GL1A 4YDUA 1ZXOA 3GOIA 5AZIA 5AFUA 1QZ5A 3HI0A 1K8KB 3SMPA 1BO5O 1BG3A 2BTFA 3FZKA 4M7YA 3ULEB 2E1ZA 2UYTA 1KXPA 5EXWA 3TU5A 3D2EA 4FL9A 5TKYA 1Q18A 2QWQA 1DKGD 3LL3A 1NGDA 1V4SA 3RSEA 4QS9A 3VEWA 5BRFA 4MO5A 2A5XA 2FSNA 1HKBA 2E8AA 3VEZA 2AA4A 3UB5A 3LDNA 4HWIA 2P9SB 1NGBA 3EKUA 4XH5A 4H03B 5E26A 4PL7A 1QQOA 3EN9A 3DWLA 2H3GX 1Z05A 1R59O 1DEJA 4IWVA 4XH1A 3HZ6A 2FF3B 2ZGYA 3I8BA 3MDQA 3QDKA 5LJWA 2WUSA 4H0XB 3VF6A 1GLJO 1NGGA 4AM6A 1BDGA 4H5RA 3ZEUA 3GE1A 4DHYA 4FO0A 4C23A 3OHRA 4EIAA 4K42A 4BG8A 2D0OA 4PKIA 1HX1A 2IVOA 2VYPA 5F1XA 1SQKA 4MLHA 3VEXA 2YJEA 3FGUA 4IJNA 4JD2B 3VESA 2GELA 4IJAA 2P9PB 4K25A 2PBDA 1NBWA 4BC3A 2ASOA 2A41A 4BROA 1ATSA 4JD2A 3VF4A 4FWNA 5ADXH 4BVPA 3CJAA 2FSJA 3O1WA 1HUXA 2P9KB 3QBXA 1ZBSA 1RFQA 4JNEA 4B1ZA 5BREA 3WQTA 1TYQA 3O08A 1XUPO 1HKCA 2QM1A 5KPZA 4BRAA 5AQNA 1NGEA 2GEMA 4B1WB 3FZMA 2FF6A 3U9DA 4FWRA 2ZGZA 3ZX2A 3VGLA 5AQGA 5BPNA 3MK6A 5FPMA 3SMSA 3VGMA 2F9TA 2Q0RA 3M6GA 3FLCO 1YXQA 4BRIA 4BR9A 4BGAA 2NZTA 1E4GT 3H1QA 4DQ8A 4WQ4A 4PKHA 1YAGA 1NGFA 1LOTB 1GLFO 1HLUA 2BUPA 4BC2A 4Z94A 3A5MC 5EY4A 3DXMA 1GLDG 3U8XA 4E1JA 4CD1A 5AZJB 2E2NA 3CHWA 2ITMA 1NGHA 3KVGA 1YVNA 1Z6RA 3O4WA 3F9MA 1NMDA 1RDWX 4QS7A 3IFRA 4O8KA 3UKUB 2QWOA 3H3NO 4FPBA 5BPLA 5FPEA 1GLLO 1TUUA 4MLEA 3M1FA 2W40A 1QHAA 3UKUA 4B9QA 4FWKA 4BR4A 5KPTA 3S41A 3I33A 1KAXA 1U2VB 3ZX3A 4XH4A 3H6EA 3VGKA 4BVOA 3A8YA 3MN6A 3CIPA 1Y64A 3UKRA 4IO8A 4RCHA 5AQZA 4FOEA 4A2AA 5I9EB 4DCHA 3DJCA 3J8AA 3GDQA 2CGJA 4FOIA 4JN4A 4BRDA 1XC3A 1NWKA 2D1KA 3VEOA 3ZETA 4F9OA 1NGCA 3KHYA 4CBXA 4HTLA 3ID8A 2Q97A 5JICA 3SK3A 4ISEA 2Q31A 1K8KA 3LM9A 3U4LA 3HM8A 1ZC6A 1LCUA 3ULEA 2E20A 5CE3A 2D0PA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4CZJA 3TR8A 4C1NK 2HBJA 3R8EA 3FZHA 2IVNA 5AQUA 4JHDB 4YOTA 4JKHA 4I2PA 1VSKA 3QEXA 3VQ7A 4C8LA 2P9SA 3FZFA 4H5NA 3CF5L 4Z4EA 2VWKA 2WFBA 1KFDA 5HLFA 4FW2A 2QXLA 3LP0A 1OKJA 3MN5A 1KCFA 4M3YA 4HCBA 3RRGA 2Z1IA 5LY3A 1KVBA 4CEFA 4JI1K 3OBYA 1YI2N 4CZKA 4FJ5A 1EWRA 3MX2A 4FSVA 2Z1HA 3WNHA 3LDSA 5JLFA 3QEVA 1TAUA 3THYA 4DTPA 1C0FA 3P39A 4DU4A 3QERA 4XJXA 2HBKA 2HHWA 2OPRA 3CQYA 2P9PA 3FFKB 4BR5A 2PYJA 3M8RA 3ATVA 3IKMA 2E6LA 4M63C 1REVA 2KKZA 5AQJA 5C12A 4JS5A 1YJWN 4CI6A 4CJUA 1NK8A 2X6SA 5AQRA 3B8AX 3P4IA 5CHIA 3ALYA 1ZBHA 1IBLK 2A1SA 4DFPA 1U45A 1EO1A 4BRGA 5C15A 2HHSA 4CGFA 1VQMN 1J9AA 3O5BA 5B8HA 1XMQK 3OYAA 1DGKN 1Q81O 4FLWA 1U4BA 3O8MA 2GUPA 3A0IX 4B9LA 1RDUA 4WF9L 5M1QA 5CYMA 2FBVA 2E2QA 3ZSRA 5M1PA 5CYQA 4OKJA 1B9FA 4E89A 1W2BM 2IIRA 2C1IA 3CC2N 2GWKA 3OBWA 1YF5L 4GVEA 3GBTA 4OKKA 3HP9A 3TI0A 3D45A 3SAHA 4X66K 4BG9A 2NRZA 3V1QA 2G8VA 4A5AA 2V52B 4M3TA 2HBMA 4E7JA 3SJHA 5BN8A 3T3FA 4FWQA 1LAWA 2E1YA 1RBSA 1NLVA 5H1SQ 2UU9K 4EP5A 1V4TA 3SLCA 1X3MA 3QIPA 4IEEA 3RTVA 2HHXA 2O8BA 1IO2A 4C8MA 3L2RA 2HOEA 4YHHK 4J2EA 1JXEA 5DK5A 3MXIA 1QTMA 3VERA 1GLEG 4WYBA 4AHRA 1T05A 4Y0WA 1KAZA 4PY5A 4CIFA 5JS1A 1MA9B 3AVIA 4RWTA 1YT3A 5AQKA 3R9PA 4LY7A 4CBWA 3CERA 3NF9A 4U7BA 3RMCA 4B9SA 4LSNA 2QW9A 3RSEB 3O1BA 2KFNA 1QS4A 2W00A 4FJKA 5BPMA 4CVNE 5HBMA 3LDQA 2F8SA 2HW3A 4BRQA 3K57A 1I39A 3WEEA 3AV9A 4ZTFA 4JI0K 3CQXA 4BQLA 2A42A 5AQPA 4BRMA 4BWMA 2E4LA 1U6ZA 1S1XA 4M7XA 5AQLA 4JYAK 3E9LA 3CI5A 4CFBA 1VQ7N 2I7NA 3ZEUB 3D2FA 2KZMA 3FR0A 3TAFA 3FFIA 1JLGA 2P9LA 3AY9A 2HNYA 1BCOA 2PFUA 1EXQA 3IMXA 5F0XA 4O4GA 2YX6A 2P9IA 1G15A 1SKRA 3J81O 4KHYA 1TYQB 3O4NA 1MWMA 3N4PA 3ZSWA 4L8RB 3FZLA 1NM1A 5C10A 2GTDA 1VRTA 3M8PA 3SYZA 4K43A 1YTUA 4GV9A 3HTVA 1VQKN 5GADP 4CHPA 2Q36A 2QTDA 3E1YA 1HYSA 4FJMA 2FBTA 3G25A 1CXQA 3O6WA 4MQ3A 1TKTA 4AHSA 3OYHA 2JWKA 3EO3A 2BDPA 4G9ZA 3HSTB 3CXCM 4EP4A 1TGOA 1NNEA 3WQUA 4UY8O 1JCGA 1O13A 2FSKA 2QWLA 2A40A 3PSFA 3KLEA 3CJCA 3L4QA 4NXMK 1T6DA 3QBWA 1IBMK 3TTCA 4AH9A 4QCLA 1FJGK 3RR7A 1NJZA 4BACA 1JJ2M 3Q7CA 1YIJN 3SNNA 1BOTO 1QQNA 1EQYA 3ZT0A 4CF8A 5I42A 1HNIA 2HHVA 3R1XA 2YHWA 4XIUA 2YNIA 4FK0A 5AQWA 4DR2K 2UXBK 4H0VB 1LV5A 1SUQA 2UXCK 4IOCL 1DLOA 4JAXA 4IDKA 2OTJN 1SKWA 4A57A 3LP2A 1X9WA 4CBUA 4K8XA 4DSJA 1RGIA 1IKYA 4OKEA 3DAWA 5HRSA 3OS2A 1VQ9N 3BF1A 3U6FA 4DV0K 4CW7B 2RKIA 4HUGA 5SWMA 5M1KA 4AF1A 1ZXOA 1KSPA 3K9KA 1QZ5A 3HI0A 1K8KB 4WCEL 3SMPA 4K0KK 4CEOA 1BIZA 1U04A 2UYTA 5EXWA 3D2EA 4CEZA 3DOLA 1ZBIA 1W97L 1DKGD 3LAMA 4EZ6A 1NGDA 4CF9A 3SPYA 2G8WA 3AO5A 4FYDA 1HKBA 3VEZA 4YOWA 1K8AO 2AA4A 3O9UA 4JKCA 2P9SB 3TSUA 1LW0A 4XH5A 4IG0A 3ZLJA 1NJXA 3U3YA 5LMNK 3HO1A 5FRNA 1DEJA 4IWVA 4XH1A 4FVUA 1JXBA 1NJIO 3I8BA 3QDKA 3K5MA 4B08A 3ID6A 3UIQA 4DR5K 4AM6A 1VQ5N 4FO0A 4JI6K 4C23A 3OHRA 4V19S 4NYFA 1TAQA 1NK7A 2IVOA 1J53A 1N6QA 3THYB 1SQKA 3TARA 3VEXA 4JD2B 3VESA 3G4SN 2P9PB 4K25A 1SS6A 4E1NA 3KK1A 1D9DA 1A5XA 2PYLA 1NJWA 1ZBSA 1RFQA 4DQSA 4B1ZA 1T3VA 2QI2A 2QM1A 5GAGP 4DTMA 2EX3A 2FF6A 2I5JA 2ZGZA 1Q9XA 3VGLA 2YNHA 3RMBA 3M6GA 4BR9A 4PHTX 4BGAA 4ELTA 2NZTA 3H1QA 3LP3A 3HVTA 1LOTB 4FZZA 1A5WA 1S5JA 1HLUA 5EY4A 1GLDG 4JKBA 5FROA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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