3U9DA

Crystal structure of a chimera containing the n-terminal domain (residues 8-24) of drosophila ciboulot and the c-terminal domain (residues 13-44) of bovine thymosin-beta4, bound to g-actin-atp
Total Genus 107
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
107
sequence length
366
structure length
357
Chain Sequence
TALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Contractile protein, protein binding
molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
publication title How a single residue in individual beta-thymosin/WH2 domains controls their functions in actin assembly.
pubmed doi rcsb
source organism Drosophila melanogaster
total genus 107
structure length 357
sequence length 366
chains with identical sequence C
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-10-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3u9dA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3u9dA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3u9dA03
3UE5A 2VWBA 2NRHA 4BR5A 3MN6A 4CJ7A 1NBWA 2J4RA 5FPEA 2Q2RA 3D2FB 2HF3A 2YI1A 3R9PA 5BPLA 1HKGA 4EHUA 4H0VB 1NGDA 5AQTA 1CZAN 1BDGA 4JHDB 2FXUA 1S3XA 4H0OA 2D0OA 2E8AA 3FGUA 3QBWA 1ZC6A 4CZGA 2FF3B 1Z6RA 4QS9A 4DCHA 5AQFA 1NGCA 3GOIA 4H5RA 4BRHA 2E88A 2HMPA 4K41A 3IFRA 2CH5A 1GLLO 3M3ZA 5KQDA 4FL9A 2V7YA 4BRFA 3EN9A 1D4XA 3QDKA 3CETA 3DAWA 3SMSA 2H3GX 5EX5A 1JCGA 2NLXA 4WQ4C 3H3OB 2FF6A 2QWOA 5BPMA 3ATVA 5AQJA 5AQQA 3FZKA 3ZETA 3IMXA 2BUPA 3WXLA 1OKJA 4FWLA 3ZEUB 3MK6A 5ADXH 4H03B 2Q1NA 2V51B 3BF3A 4B1UB 4BVPA 4MLHA 2W40A 1RDWX 2P9NA 5KPZA 5AQSA 2NZTA 5BN8A 5JLHA 4B1VA 4BQLA 4CZHA 2A5XA 1TYQA 4H5VA 3HM8A 1GLDG 3O4WA 5AQXA 1ATNA 4PKGA 1BA1A 4FWMA 2ZF5O 1ZBSA 3H46O 3M6GA 5AQMA 3O5BA 3FFKB 4EAHD 2P9LA 4H0TB 3SLCA 2P9UA 1HPMA 1HKCA 1NGIA 2QWRA 3ENHA 3J8AA 3CQXA 5BPNA 2CGLA 1NGAA 1KXPA 4A2BA 5AZIB 3JXUA 1Y64A 3VPZA 3EKUA 2KHOA 3EL2A 3VENA 3CJBA 3EKSA 3P4IA 3I33A 4J8FA 3MDQA 3GDQA 3U9DA 1BG3A 5AQHA 3ZX2A 1DEJA 3UKUA 4CZFA 1KAZA 4K25A 1TYQB 4BGBA 5FPDA 4JD2A 1DKGD 4QS7A 2E2PA 3UB5A 4BREA 4DQ8A 5F1XA 3FLCO 3O6WA 1IJJA 1U2VB 2QWMA 2V52B 4L3QA 4AM7A 2A6AA 1NMDA 1SQKA 3ATUA 4LC9B 4A61A 2D1KA 3W0LA 3A5LC 2E1YA 4CBUA 2YHYA 3H6EA 1QQMA 3C7NB 4Y0WA 5AQLA 3HTVA 4FWQA 4FPBA 1E4GT 4B1YB 2WUSA 4QS8A 5EOYA 5LJVA 2QWQA 3HSCA 1HLUA 2CGKA 4B1WB 3R8EA 4JN4A 1IG8A 4XEIA 1T44A 3MCPA 4CZIA 3HZ6A 2BTFA 2FSJA 2ZGZA 1GLAG 5CE3A 4IJNA 4BRMA 3H1QA 3VGKA 5AQGA 3QB0A 2P9PB 3BUZB 3I8BA 2YHXA 3MN5A 4B1ZA 3VF2A 4CBXA 5JMVA 2QW9A 2HF4A 1YAGA 3QFUA 2PAVA 2E2NA 5JICA 4XH1A 2CGJA 4FWRA 5ADXA 1XQSC 1C0FA 2FLOA 2QM1A 2V7ZA 4CD3A 4YDUA 4FWNA 4FWKA 2P9KA 3VESA 2PBDA 3UKRB 3OHRA 2IVNA 4NO7A 3WEEB 1K8KA 3DXMA 3GE1A 4CZMA 2CH6A 3EO3A 5AFUH 4JNEA 4H0YB 4BG8A 3VOVA 2A3ZA 5BRHA 5AQPA 1TUYA 2UYTA 3VEWA 4H5WA 4B1XB 2F9TA 3CIPA 3WT0A 1RFQA 3S41A 4BRPA 3VEYA 3FZFA 2Q0UA 2QWNA 3KZBA 5AQUA 4BRLA 1R59O 2GWJA 3IUCA 4BG9A 4CZLA 3DJCA 5AQWA 4BR9A 1HX1A 2HOEA 1G99A 4I6MA 1QHAA 2YJEA 1X3MA 3AAPA 3L4IA 4NB4A 3LM2A 5BRFA 4WQ5C 2D4WA 1NGGA 1T6CA 4XH4A 3D2EA 4PL8A 4CBWA 2AA4A 4BR7A 4F9OA 1DGKN 3DXMB 2E1ZA 4H0XB 1J6ZA 4BRAA 3O08A 4E1JA 1T6DA 5FPMA 1BOTO 1RGIA 3LDQA 1BU6O 1C0GA 3BP8A 3QFPA 3VGMA 3ZETB 4H0PA 3CJAA 2YCHA 3CHWA 4BC2A 4B9QA 1YVNA 4BC3A 4FO0A 4RCHA 4IWVA 5AQZA 5LJWA 3ID8A 4WQ4A 3VETA 4BRQA 4BROA 5BREA 1HKBA 2A41A 2A42A 5F0XA 4BR4A 3VEZA 3MN7A 4IO8A 4BRDA 5AZJA 1X3NA 4GNIA 2P9NB 3DXKA 5ELZA 4O8KA 3O1BA 4K42A 4FOEA 4BRNA 4BQZA 4FWSA 4BR2A 2ITMA 4PKHA 3JS6A 2IVPA 3KHYA 3ULEA 3CQYA 3SK3A 1QQOA 1U6ZA 2GWKA 5AQIA 2E2OA 5AQVA 2YJFA 1GLJO 3C0BA 3L6QA 4K43A 3WXJA 3GBTA 3LL3A 4CZJA 4RWTA 3GG4A 2QWLA 2ASOA 1ATSA 1TUUA 2FSKA 3VEOA 1YUWA 3GL1A 2A40A 2ASPA 2P9LB 3WXKA 1MWKA 2P9UB 1WOQA 3ENOA 3FZMA 3LM9A 3IDHA 2ASMA 3TPQA 4M7XA 3SJHA 1GLBG 1NGEA 3WQUA 3D2FA 4IJAA 4PKIA 4FWOA 1HUXA 5AZJB 1NGFA 1SZ2A 1JCFA 3B8AX 4CD1A 1MA9B 4ISFA 3BF1A 4PL7A 4O5FA 3UKUB 4IZ9A 3VF4A 3FE1A 5BRDA 4MO5A 3L0QA 4JD2B 5KPRA 1LOTB 2QXLA 3HBTA 4CZEA 4BRKA 1X9JA 1KAYA 2P9SA 3DWLA 5BR9A 4CI6A 1NM1A 4M63C 4DHYA 4RTFD 5JLFA 4IXCA 2IIRA 3AARA 1MDUB 3CERA 2Q97A 1H1VA 1E4FT 5FPNA 1QZ5A 1ESVA 4MLEA 3H1VX 5AQOA 1BUPA 5E84A 2FSNA 5KQ8A 4Z94A 1NLVA 3MN9A 2F9WA 4JAXA 3A5NC 3VGLA 2ZGYA 4ISGA 4EFHA 5TKYA 2GEMA 1Q18A 5KPTA 3ZEUA 3O8MA 3WQTA 2E20A 5EVZA 3MMVA 3QICA 3U8XA 2W41A 1S22A 5I9EB 2P9IA 4C23A 3QMLA 3CJCA 3U4LA 3VEVA 2P9SB 1YXQA 4XH5A 1QZ6A 3LDNA 2GUPA 3KVGA 3AY9A 1V4SA 5AQNA 1LCUA 4EIAA 3SMPA 3QBXA 3CJ9A 3D7EO 2Q31A 4DB3A 3A8YA 2P9KB 3CJ1A 1BWFO 1EQYA 4M7YA 1KAXA 3EZWA 3LDLA 4FOIA 4ISEA 5B8HA 2E2QA 2EWSA 3W3DA 3VF6A 1K8KB 4CZKA 2YHWA 4BRIA 5AQRA 3ZX0A 1NGBA 3O80A 5AZIA 2OANA 3O1WA 4FWPA 2P9IB 5AQKA 3H45C 1HJOA 4GY2B 2I7NA 1GLCG 3TU5A 4FPAA 3U9ZA 1JCEA 1P8ZA 4I6MB 3FZHA 4H5NA 5EY4A 1NGJA 3CJ7A 3RSEA 4BRGA 5LY3A 3A5MC 3HI0A 3F9MA 4KBOA 4BR0A 1BO5O 5BN9A 3D2EB 1QQNA 1U2VA 4H5TA 4MO4A 2AP1A 4A62A 3VERA 3LDPA 3VEXA 1WUAA 4WYBA 3WUHA 4WQ5A 3C7NA 3AAQA 1ZXOA 3G25A 4EHTA 4HTLA 4AM6A 2DPNA 1SAZA 2D0PA 4A2AA 1GLEG 4FSVA 3A5OC 3ZX3A 5F2RA 2I7PA 1NGHA 2VCPA 3A0IX 3WXIA 1XC3A 2Q36A 2ZWHA 2P9PA 3R6MA 5E26A 3BEXA 3H3NO 1ATRA 3RSEB 4BC4A 4BGAA 2GTDA 5AFUA 4YDUC 3FR0A 5AQYA 3DXKB 1XUPO 4HWIA 2GELA 1Z05A 4BRCA 3M1FA 2QWPA 3FZLA 4JHDA 3ULEB 1NWKA 2VYPA 5AR0A 1BA0A 5EXWA 4BC5A 3CI5A 3LDOA 3UKRA 2IVOA 4BVOA 1V4TA 1MWMA 1GLFO 2Q0RA 3WEEA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3AVHA 4JKGB 3AA5X 5C10A 4BR5A 4ID5A 3SZ2A 4DSIA 4ELTA 4C8MA 4CK2A 1BHLA 4JI6K 4CEDA 2IDOA 1SL1A 5CY4A 2PYJA 3NDKA 1CZBA 1NBWA 3VQAA 1Q9YA 4DMNA 3MAQA 5CYQA 3D2FB 3BDPA 2P5OA 1S1UA 2HHVA 4EHUA 4CIFA 4DFMA 3G6EN 4H0VB 4ELUA 1S3XA 2E8AA 1KD1O 4DR2K 1WSFA 3CPEA 3FGUA 5HP1A 4E1NA 4DSJA 2HW3A 3QBWA 4QS9A 3CC4N 3MECA 3EZ5A 4LF6K 2HMPA 4GVEA 5C15A 2CH5A 4FL9A 3THXB 3NMUA 4ZTJA 3QDKA 3SMSA 2HBKA 1TK8A 4O8UA 3EEQA 2OTJN 3ATVA 4W5TA 5AQQA 1SL2A 1NKBA 1UWBA 3WNFA 4DV0K 4DG1A 4FWLA 3T69A 3SV4A 1D8YA 3SQ0A 3ZEUB 5ADXH 2V51B 4FM0A 1L5UA 4B1UB 3VQCA 4YOXA 3LP1A 2DTUA 4DR6K 2NZTA 5J2PA 1RDAA 2FC0A 4B1VA 3TI0A 1OH7A 4IEEA 1YJWN 4H5VA 3HM8A 1W0HA 5M1FA 1RT1A 1GLDG 4O44A 1B9DA 1TK5A 4PKGA 4CVNE 1WSGA 4M45A 5AQMA 2OPQA 2JWKA 3FFKB 4WCEL 1NGIA 3ZSRA 3ENHA 3J8AA 4CF8A 3NVMA 1KXPA 2HSTA 4MQ3A 4OPKA 1Y64A 1ZBHA 3VENA 4NCAA 3CJBA 2D0BA 3IAYA 1VHXA 2NRTA 1LW0A 1BG3A 3V9ZA 3KIOA 3ZX2A 3UKUA 3OYMA 2XY7A 1TYQB 5T7BA 4QS7A 4DU4A 4DQ8A 1BI4A 3QIPA 2GX9A 3O6WA 2A6AA 2E6LA 1NMDA 1SQKA 3W0LA 3A5LC 4CEFA 1VQ8N 2YHYA 4E7HA 5AQLA 1NK6A 3HTVA 4FWQA 2F96A 4B1YB 2WUSA 1ZYQA 5LJVA 3OY9A 3J7ZO 3HSCA 5H1SQ 4YOWA 1WAFA 3HXMA 1SV5A 4XEIA 4OPAA 2HMIA 1VQ6N 4FXDA 2O8BA 3H1QA 3S5TA 3I8BA 2QTDA 4IDKA 5C0YA 1QTMA 4DSFA 1ILYA 3TR8A 5JMVA 2QW9A 1CLQA 2YNIA 2PAVA 5CR4A 2E2NA 3ZSVA 2CGJA 2XY6A 3OYNA 1C0FA 4L8RB 3ALYA 1RT4A 4DSLA 1KC8O 4CD3A 4ELVA 2KKZA 1DT9A 1FK9A 3OYIA 4FWKA 3CG7A 1XMOK 4CJTA 4HTUA 4Z4GA 2O4GA 3WEEB 2RE2A 1K8KA 3DXMA 1Q81O 5K14A 5AFUH 4JNEA 3ZCMA 3CCSN 3VOVA 4CHQA 5BRHA 5AQPA 4DWIA 1SL0A 4H5WA 4DU3A 4RG8A 3AO3A 4CESA 3S41A 4FLWA 3S3MA 1T05A 4W5NA 1E3MA 3IUCA 4QCLA 2VGMA 2YKMA 1NU0A 3VQQA 1VSMA 2E5LK 3BZCA 3ZT4A 4B9UA 5BRFA 3HT3A 4RW8A 1KLNA 3DLRA 4XH4A 4B8CA 4F9OA 4PQUA 3V9UA 3VQ7A 2E1ZA 4N41A 3LANA 1FJGK 3CCMN 2XRIA 5D3GA 1YJNN 1K6YA 2VG7A 1BU6O 3J7AP 4CGDA 4QOZB 1C0GA 1KVAA 2WC9A 3ZETB 3CJAA 4JK8A 1NK0A 3QEPA 1X9MA 1WSJA 3LP3A 4LF5K 3ZYYX 4RCHA 5LJWA 3ZT3A 1JLBA 4X62K 4OPJA 4BROA 4XIUA 5BREA 5SZTA 3KWIA 3LWMA 4Y1CA 2A42A 2KZMA 2RF2A 1ASUA 4IO8A 3CM5A 5AZJA 3DXKA 3G10A 5ELZA 4CECA 5TKWA 2HBMA 2X74A 4BRNA 1JLCA 3OVNA 4GMJB 5GAGP 3KHYA 1L3UA 4ILGB 4ILHA 4E19A 3O3HA 3SK3A 3J7YP 3L6QA 4K43A 3GBTA 2ASOA 1FKPA 1TUUA 2O8CA 3GL1A 3PX0A 1A5XA 4DLGA 1ITGA 4ILJA 1WOQA 1C0TA 3CXCM 1J54A 4BE0A 3AVGA 3DMJA 3K2PA 2IGIA 4IJAA 5KGXA 3V1QA 4CJUA 2HHUA 1HUXA 1SZ2A 3B8AX 2HBJA 2O8EB 1XWLA 4IZ9A 1WSIA 4MO5A 4JD2B 4G1QA 1LOTB 3HBTA 1RNHA 5KRTA 3MEEA 1QSSA 1KQSM 2OYQA 1YJ9N 3KLGA 4Z4HA 1KVBA 1RT5A 3RWUA 4JS5A 2IIRA 3L2QA 2RHKA 1E4FT 2A1SA 4KKOA 3CFPA 4GVMA 1BUPA 5E84A 1KRPA 4OPHA 1IBKK 2X6SA 3DRSA 4JI0K 4E72A 1BQNA 2O8FA 4C8LA 4DR1K 5KPTA 4LF9K 4AF1A 3U8XA 2W41A 1S22A 5I9EB 1C1CA 3VEVA 1YXQA 2RN2A 2Y1IA 1QZ6A 3LDNA 3AY9A 5CZ2A 4I9LA 3DOLA 2YV0X 1Q9XA 4FLVA 2HHIA 2Q31A 3C94A 3A8YA 1RCHA 1S1WA 3Q7BA 2XY5A 3P5JA 1CXQA 3LPTA 2DFFA 3VF6A 4BACA 4C1NI 4E1MA 3DRRA 5IWAK 1BGXT 3PV8A 2PZSA 2OANA 5C25A 4O4GA 4FWPA 1JKHA 1O1WA 2P9IB 1VSLA 1HJOA 4PA1A 1EO1A 4HVJA 3TU5A 3OYJA 4MDAA 2BDPA 2Y1JA 3QLHA 3AA2A 3U6FA 3LAMA 4H5NA 3RVCA 5GINA 3LZJA 4DV5K 4BY9C 3A5MC 3HI0A 4M3RA 2IAJA 3T1AA 4CFCA 5GIPA 4FLYA 1J9AA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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