3U9ZA

Crystal structure between actin and a protein construct containing the first beta-thymosin domain of drosophila ciboulot (residues 2-58) with the three mutations n26d/q27k/d28s
Total Genus 119
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
119
sequence length
366
structure length
357
Chain Sequence
TALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Contractile protein, protein binding
molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
publication title How a single residue in individual beta-thymosin/WH2 domains controls their functions in actin assembly
pubmed doi rcsb
source organism Drosophila melanogaster
total genus 119
structure length 357
sequence length 366
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-10-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3u9zA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3u9zA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3u9zA03
5JMVA 2FF6A 3KHYA 5ELZA 3DXMA 5AZJB 5AQLA 4BROA 1BOTO 1NLVA 2P9UA 3CIPA 3ENHA 3A5NC 4BVPA 1NGAA 1X3NA 3KZBA 4QS7A 1S3XA 4EIAA 5BREA 1MWMA 3BEXA 2QWOA 1CZAN 2Q0RA 2D0OA 3VEVA 1D4XA 2PAVA 3SK3A 1S22A 2I7NA 5ADXA 4XH1A 4BRQA 3CERA 2YHWA 2Q31A 4H0YB 5AQPA 5JLFA 3MDQA 4BRFA 1Y64A 1QQNA 4A2BA 3MN7A 1U2VA 3FR0A 5AQYA 4B9QA 1GLBG 3MK6A 1Q18A 3SMPA 3B8AX 3U4LA 4BG8A 3WQTA 1NGJA 4H5WA 3WEEB 3FE1A 5AQVA 1Z6RA 4MO5A 4F9OA 1TYQA 3QFUA 5BPLA 1QHAA 2P9NA 4KBOA 3ZETA 3O6WA 3LDNA 4BRKA 4BRCA 3ATUA 2QWLA 5AQFA 4FWKA 4PKHA 2QXLA 1YAGA 3GG4A 3A8YA 1XC3A 2GTDA 1HX1A 5BR9A 4FPBA 1ESVA 1NGFA 4H5TA 4CD1A 5TKYA 5I9EB 1K8KB 3MN6A 4DCHA 4MLHA 2IVPA 2KHOA 4HTLA 4BRIA 3L6QA 4BRDA 3BP8A 5EOYA 3VF6A 3UE5A 3FZMA 5AQRA 3DXKA 4JHDA 2E1ZA 4BRMA 4H0VB 3HTVA 1LCUA 2P9SA 5AFUH 1YVNA 4ISGA 1RGIA 2V51B 4A2AA 2NRHA 4CZLA 3VEOA 2P9KB 4JNEA 4BR9A 3WXLA 5FPNA 2IVOA 3VGLA 5KQ8A 4DQ8A 4K25A 2E2QA 4I6MB 1MA9B 3LDQA 2P9UB 5AQOA 3O8MA 3EL2A 4B1VA 5E84A 3FGUA 3SMSA 4QS8A 2CH6A 2Q1NA 5E26A 4FO0A 3EKUA 3P4IA 3BF3A 1NMDA 5AQMA 4FWOA 4BR4A 1GLJO 5AQTA 3QBWA 1V4SA 2QWQA 3QMLA 5EXWA 2ASMA 2A5XA 2WUSA 1YUWA 3D2EA 3IMXA 3FLCO 3QBXA 2VYPA 2ZGZA 4RCHA 1GLEG 1U6ZA 4JAXA 2ITMA 3FFKB 5BN8A 2P9PA 3ENOA 5AQGA 1U2VB 3CQYA 4Y0WA 4BREA 4CZMA 2GWJA 1GLAG 4LC9B 2D1KA 2YCHA 1T6CA 2E2NA 3VGKA 4BRHA 1NGBA 4CZJA 4IJNA 1G99A 3VETA 1NGIA 3BF1A 1T6DA 1T44A 4BR0A 1NGEA 1BU6O 5KQDA 3H46O 1KAYA 2DPNA 3JXUA 1BUPA 2HF4A 4CJ7A 2P9IA 2A42A 3GOIA 3LM2A 1BWFO 4YDUC 3ZEUA 3CJ9A 2FSKA 2HMPA 1NBWA 1WUAA 2NLXA 3IFRA 4H0PA 4FOIA 4CZEA 3TU5A 3UKRA 5F1XA 3LM9A 4RTFD 3HM8A 1H1VA 3AAPA 3W3DA 3WXJA 2ZWHA 1JCGA 1GLCG 3ATVA 2YI1A 4K43A 3KVGA 3EKSA 3MMVA 3C0BA 3DWLA 4H03B 3VEZA 2GELA 3HZ6A 5AZIA 3D2FB 5EY4A 3VEYA 4IJAA 5JICA 1KAZA 1SQKA 1ATSA 1IG8A 2P9LA 4CZFA 1HKBA 4BRLA 3F9MA 3AARA 2GEMA 3JS6A 2QWNA 3MCPA 2P9SB 3CI5A 3ULEB 3ID8A 4FWMA 4B1ZA 3CJCA 2QWRA 3LDPA 3QDKA 1GLLO 3H1VX 2I7PA 2FSJA 4DB3A 5BPNA 1RFQA 2GUPA 5KPTA 2E1YA 2E2OA 3SJHA 2AA4A 4K41A 2A41A 2NZTA 5JLHA 4C23A 3WQUA 1DKGD 5AQZA 2Q0UA 4NO7A 4YDUA 5AQQA 2A40A 3MN9A 5AQWA 2HOEA 4FL9A 5AFUA 3O4WA 1NM1A 2V7YA 4EAHD 4RWTA 1BA0A 3WUHA 2J4RA 3CJ7A 3HI0A 4H0OA 4WYBA 3VGMA 1EQYA 4IWVA 1KAXA 5BRDA 4A61A 1GLFO 5KPZA 1NGGA 4A62A 1QQOA 3DXMB 4CZGA 4BG9A 5FPDA 4H5RA 4EHTA 3O08A 4O8KA 1QQMA 4B1UB 4FWSA 3AY9A 4M7YA 3VOVA 5F2RA 3RSEA 3CHWA 3VERA 4PKIA 5F0XA 2VCPA 3VEXA 3S41A 3U8XA 4MLEA 4BRGA 3VPZA 5AQJA 3ZEUB 2CGLA 5AQHA 3U9ZA 3A5OC 3ZX2A 1NWKA 4IXCA 5AQXA 3EZWA 1V4TA 4FOEA 3DJCA 2V7ZA 3C7NA 3G25A 3VF2A 1C0GA 4BGBA 1HPMA 5LJVA 5LY3A 3O1WA 3TPQA 3W0LA 3AAQA 3QFPA 4BR5A 1XUPO 3H45C 4FWPA 3J8AA 1JCFA 3H3OB 3WXIA 4J8FA 2AP1A 1SZ2A 4JN4A 3FZFA 3ZX3A 3UKUA 4CZHA 2UYTA 4JD2A 4BQLA 1TYQB 2P9LB 4BRPA 4CBUA 2P9NB 3VESA 4M7XA 2CH5A 2F9WA 3ZETB 5AR0A 1BA1A 2QM1A 1E4FT 3ZX0A 1QZ6A 4BRNA 1Z05A 2CGKA 1TUYA 3EN9A 1NGHA 2BUPA 4FSVA 2P9KA 3I33A 5BRHA 4FWQA 3LL3A 1HUXA 3O5BA 4I6MA 4WQ5C 2E20A 4MO4A 3FZKA 3IDHA 2Q36A 2V52B 4WQ4C 4PL8A 1NGDA 3HSCA 2FSNA 1ZC6A 4BC4A 4BRAA 4CZIA 3M1FA 2YHYA 4CBWA 1J6ZA 3A0IX 4ISEA 4E1JA 1HKGA 4H0XB 4K42A 3WXKA 4IZ9A 3IUCA 4H5NA 1GLDG 4O5FA 2YHXA 3VENA 2ASPA 1WOQA 2IVNA 3HBTA 4AM6A 1RDWX 4CZKA 3DXKB 4JHDB 5BRFA 1HKCA 3VF4A 3OHRA 3GL1A 4H0TB 2QWPA 4BC5A 1BDGA 2H3GX 4HWIA 4BGAA 1MDUB 5ADXH 2E2PA 2D4WA 3I8BA 4BVOA 2E8AA 2IIRA 3GE1A 3CJBA 5AQKA 3L0QA 5AQIA 3CQXA 1YXQA 5AZJA 3R6MA 1R59O 4PL7A 4BC2A 1DGKN 5FPEA 3RSEB 1KXPA 4AM7A 5LJWA 4H5VA 2GWKA 2VWBA 3L4IA 5KPRA 1BG3A 5EVZA 4FWRA 3CETA 1TUUA 1LOTB 1X9JA 1ZXOA 3C7NB 2Q97A 4CI6A 4NB4A 3D2EB 4BQZA 2YJEA 3FZLA 4FPAA 4BR7A 2FF3B 4WQ5A 2P9PB 4WQ4A 1SAZA 3O1BA 4CBXA 3MN5A 3BUZB 3R9PA 4GY2B 4BR2A 2ASOA 1HJOA 3EO3A 2YJFA 2ZGYA 3D7EO 5EX5A 2F9TA 2ZF5O 3CJ1A 2HF3A 2Q2RA 4L3QA 3UKUB 4Z94A 3WEEA 3WT0A 4FWNA 4JD2B 4B1XB 3D2FA 1ZBSA 1C0FA 4EFHA 4XEIA 3UB5A 1ATRA 5CE3A 4B1YB 2A3ZA 2W40A 1X3MA 3LDOA 4XH5A 1JCEA 5BN9A 1MWKA 2P9IB 3O80A 2EWSA 1DEJA 2E88A 4DHYA 3H3NO 3ULEA 5BPMA 2BTFA 3QICA 4CD3A 4B1WB 3FZHA 4QS9A 3H6EA 1E4GT 2FLOA 5AQNA 3UKRB 3M3ZA 1QZ5A 3GDQA 3U9DA 2W41A 3R8EA 5FPMA 3LDLA 1HLUA 1K8KA 4EHUA 3A5LC 5AQSA 3DAWA 2CGJA 1IJJA 3H1QA 3QB0A 5AZIB 1NGCA 1OKJA 3VEWA 3M6GA 1BO5O 2A6AA 3A5MC 1P8ZA 4PKGA 4BC3A 5B8HA 2FXUA 2PBDA 2QW9A 2QWMA 3GBTA 4ISFA 5AQUA 4M63C 1ATNA 4IO8A 2OANA 1XQSC 4XH4A 3SLCA 2D0PA 4GNIA 4FWLA 3CJAA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1SL1A 2FF6A 3KHYA 4FM0A 5AZJB 5AQLA 4JI6K 3AVAA 1NLVA 3P5JA 3CC7N 3ENHA 3OS1A 3I0SA 5DK5A 3LZIA 4DSJA 1X3NA 2ZJQL 2G8IA 3ZSQA 4WF9L 4EIAA 5JS1A 4YOUA 4HUFA 4QOZB 4DV6K 1S6QA 3TWHA 2D0OA 1RTIA 5ADXA 4BRQA 2W42A 2YHWA 2Q31A 4IOCL 4KPYA 2RHKA 1N34K 2ETJA 3OYKA 5C2DA 3ENBA 3FR0A 2OA8A 3S3MA 1GLBG 3MK6A 1Q18A 3B8AX 3R1XA 3U4LA 1SL2A 2ZJRL 1OH8A 4MO5A 3WNFA 2P9NA 3K5MA 4E7LA 3O6WA 4KKOA 3CFPA 3ATUA 2QWLA 2YHBA 3CC4N 3TAMA 4FWKA 2HVIA 2VG7A 2QXLA 1YJWN 3LZJA 5LL6Z 3HVRA 4DV7K 2FBXA 4DQRA 3ZSWA 1RBUA 4RG8A 5SZTA 4M3XA 4G9ZA 3SV4A 4CGIA 4U7BA 2XY5A 3N4QA 2ZQBA 2YNIA 1U49A 2EHGA 2WFBA 3VQPA 3C6UA 4O0IA 1WSFA 4HTLA 2D5RA 3AVKA 3QESA 2NNWA 1GOCA 2GUIA 5EOYA 2HVHA 3VF6A 5AQRA 4DR5K 3NBPA 5JVGL 3VQ5A 3TTCA 3F5TA 3BY5A 1VQ9N 5AFUH 1CXUA 1U04A 2NRRA 3AGRA 3MXIA 4K25A 2E2QA 3LDQA 1ZBUA 3O8MA 3EL2A 3LWMA 3QNNA 1N33K 1GOAA 3NGIA 3ZSOA 1VQ6N 3EKUA 3L2UA 4GW6A 5AQMA 3QEXA 3S9HA 3AVBA 4BR4A 5D3GA 3A2FA 1IBMK 1GLJO 5KGWA 3QMLA 2ASMA 1RT1A 2A5XA 5CZ1A 1XMOK 3IMXA 3R3LA 1QTMA 3AO5A 1JLFA 3OVNA 3O9QA 1IBKK 1HRHA 4JAXA 2P9PA 4E7KA 1U2VB 4BREA 4CZMA 2NUBA 4KI6A 3VGKA 1NGIA 3OBYA 1T44A 4MQ3A 4BR0A 4CGHA 1RTDA 4YORA 1YIJN 5KQDA 3V9UA 2DPNA 5A2QO 4JKCA 4YNQA 4IEEA 2P9IA 3MWTA 4KI4A 2WONA 4CVNE 4DFMA 3SJJA 4H0PA 4FOIA 4CHZA 1TKTA 3HM8A 4E3SA 1TKDA 1WAFA 4AF1A 1I39A 3VMFB 3C0BA 4CF1A 2QA4N 4X64K 1RT7A 4F4KA 3LPUA 4CE9A 3HZ6A 4DU3A 1NU0A 2OTJN 5EY4A 3THYA 2P9LA 4BRLA 1O13A 4KREA 2NRWA 3AARA 1HYZA 2A1RA 4O0JA 3JS6A 5CHIA 3MCPA 2G8WA 3DLGA 4B1ZA 1JLBA 4CEFA 4JI0K 3CJCA 4AHRA 4CECA 2QWRA 4E19A 3KK7A 3OS0A 1S1XA 2B5JA 1BGXT 2Z1IA 3IRXA 3QDKA 5BPNA 2FSJA 4DB3A 2GUPA 3IKMA 3MEEA 3T69A 4AHCA 4DS5A 1NK9A 4OVLA 2YNHA 3J80O 3AA3A 4CJPA 2KLAA 2NZTA 1KD1O 1JL1A 5JLHA 4R5PA 4KHPK 3MCAB 4MFBA 4XJXA 1VK0A 3VQQA 3NGZA 1X9WA 3IG1A 1NM1A 1RBTA 3F2KA 1QQCA 3WUHA 2O8DB 3CJ7A 3SBGA 3HI0A 3LPTA 2OCEA 5BRDA 1EQYA 3OYAA 1KAXA 1HPZA 1I3AA 1NGGA 1FXXA 1VQPN 1QQOA 4CZGA 4BG9A 5M1OA 1NJZA 3TSQA 4B1UB 1QS4A 3BGRA 3VTIA 3AY9A 4C8NA 1WSEA 4M7YA 3RSEA 1N5YA 1BL3A 5GIPA 3KIOA 3G71N 2XY7A 1XHZA 3S41A 4CGJA 1L5UA 2CGLA 1NWKA 3EZWA 1V4TA 1ZBIA 1YITN 4WE1A 3PY8A 1HPMA 4FJ7A 5LY3A 3T19A 3O1WA 4I2PA 4WCEL 3AAQA 3QFPA 3AVMA 3ZSXA 2IOCA 3J8AA 1KRPA 3DLBA 4B9MA 1Z26A 3AVLA 3WXIA 4ICLA 3TANA 4CZHA 2VGMA 4JD2A 3NVKA 4I2QA 2P9NB 1LW2A 4M7XA 4OO1J 2Y1JA 3HP6A 1UA0A 3QNOA 1TGOA 4M3WA 3D45A 4B3TK 1XNQK 1NGHA 5TKWA 4FSVA 4L8RB 4I9LA 3LL3A 3TAPA 4CEAA 4EZ6A 3MX2A 1VQ7N 3FZKA 3SQ0A 3AVJA 5IWAK 4BC4A 1OH7A 1ASWA 4BRAA 2FSNA 2P51A 4DKWA 2YHYA 1J6ZA 4M42A 4K42A 3WXKA 4EP4A 3IUCA 1VQMN 1GLDG 3V1OA 4AHUA 2YHXA 1WB9A 4AM6A 2BH1A 2ZD1A 1EWQA 3H08A 3QETA 1KFSA 4W5OA 4JI7K 4DTUA 3GL1A 3CPWM 1BDGA 3LAMA 4HWIA 1MDUB 2E2PA 2D4WA 3I8BA 4IFYA 5CYMA 3OYFA 1RT3A 1JLAA 2IIRA 2VWJA 5AQKA 5AZJA 1RBRA 4PL7A 3PUFA 4BC2A 4FJIA 5LJWA 3ZT3A 3L4IA 5EU7A 1T03A 4LFBK 1ZXOA 4HUEA 4NB4A 4E7JA 2HNZA 1QE1A 3VQBA 4CJWA 4DS4A 2FF3B 4JK9A 3B6OA 4WQ5A 2RKIA 2P9PB 1BHLA 4N5SA 3B6PA 4KFBA 1B92A 3IS9A 1VSJA 3ZT1A 2HF3A 2JWLA 3UKUB 4Z94A 4JKEA 3WT0A 4FWNA 3D2FA 1ZBSA 1C0FA 1ATRA 4B9TA 1N32K 2NRZA 4DG1A 3TR8A 2QKBA 5BN9A 4GMJB 4CGDA 2P9IB 3V1RA 3BDPA 2E88A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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