3UE5A

Ecp-cleaved actin in complex with spir domain d
Total Genus 121
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
121
sequence length
371
structure length
364
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Contractile protein/transport protein
molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
publication title Multiple Forms of Spire-Actin Complexes and their Functional Consequences.
pubmed doi rcsb
source organism Drosophila melanogaster
total genus 121
structure length 364
sequence length 371
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-10-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3ue5A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3ue5A02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3ue5A03
4DCHA 1BA1A 4BC2A 1ZBSA 4FL9A 4H5VA 4RTFD 1GLJO 4PKHA 4FPBA 5KPTA 3VESA 3EN9A 1HPMA 2E2NA 4ISEA 4J8FA 5AQQA 3ZX2A 3TU5A 3L0QA 3R9PA 5B8HA 3VF2A 3QMLA 3WXKA 3L4IA 2IVPA 3B8AX 1YAGA 4IZ9A 4GNIA 4FOIA 5BPNA 4BRNA 4H0PA 1NGCA 2HF4A 3VGKA 4BGAA 3HTVA 5JICA 2J4RA 5LJWA 4H0YB 3ATVA 4CBXA 4BC3A 5KPZA 2WUSA 3FZFA 3LDNA 5AQFA 3GBTA 3EZWA 3ENHA 3QICA 1HJOA 4PKIA 3CJCA 1NMDA 3WXIA 2QWPA 2YJEA 2D4WA 1ATNA 5F2RA 1BDGA 4QS8A 2QWNA 5AQPA 4NB4A 3FR0A 3FFKB 5AQIA 3D7EO 4CZEA 1RFQA 3W3DA 1NLVA 1MWKA 3FZKA 3ZETB 3UKUB 4FWRA 1E4FT 3VGMA 3LDLA 3GL1A 4I6MA 1YVNA 2IIRA 3BEXA 1Z6RA 5AQMA 5BPLA 3LDQA 2V7YA 2ZGZA 5AQUA 1NGEA 4B1ZA 4BRIA 4PKGA 1ESVA 2IVOA 4WQ5C 3DXKB 4M7YA 4JD2B 1DKGD 4JAXA 2QWMA 3EKSA 4B1VA 1BA0A 3MN9A 2OANA 3QFUA 1BUPA 4CZLA 3HM8A 4WYBA 3D2EB 4H0VB 4B1YB 4WQ5A 4BVOA 2YHXA 5AQNA 2KHOA 2P9UA 1NM1A 4BR2A 1QZ6A 3CJBA 5AZIB 4WQ4A 3ENOA 2A6AA 4BRKA 1DGKN 1WUAA 3ZETA 5AFUH 2AP1A 4IJNA 2F9WA 3OHRA 3S41A 2D0OA 3CJAA 2E1ZA 2P9NB 4ISFA 5FPDA 4H5RA 5AZJA 2A5XA 4BRHA 4K42A 2FF6A 4BC4A 3IDHA 3VETA 3MN6A 2CH6A 3VEOA 1HLUA 3ZX0A 5AQOA 3QB0A 4BR4A 2ASPA 1GLFO 4CBUA 5TKYA 2Q36A 2ZWHA 3CERA 4JNEA 2P9PA 3P4IA 3U4LA 3CJ9A 1NBWA 3QBXA 3BF3A 4H5TA 3DAWA 5I9EB 3A5OC 4FWOA 2GTDA 3LM2A 4FWLA 4YDUC 4H0OA 3CQXA 5KPRA 3RSEA 4BRCA 3M1FA 5JMVA 1J6ZA 4BRLA 5AQSA 4A2BA 3HI0A 1T6CA 3H45C 3U9DA 4CBWA 4BRAA 3U8XA 2E1YA 2HF3A 3SJHA 5KQ8A 4BG9A 1HUXA 3C7NB 3LDPA 4YDUA 1QQMA 4CZFA 4EHTA 4Z94A 4BG8A 1TYQB 2ASOA 5CE3A 5ELZA 1R59O 1KAZA 5FPNA 5BR9A 3VEVA 3O1BA 3WQUA 3MMVA 3SMSA 4AM6A 1U2VA 3KVGA 1BWFO 2A42A 2ZF5O 4MO4A 2FSKA 5BRDA 1HKBA 4XH4A 2BTFA 4LC9B 2Q2RA 1S3XA 3UKRB 4B1XB 1ATRA 3R6MA 4H0TB 2QWQA 4MLHA 4MLEA 4BQLA 1BOTO 3A5LC 4CZMA 1XQSC 1C0FA 2FLOA 5AQHA 1OKJA 1RDWX 4RCHA 3IUCA 5BREA 3O8MA 3FGUA 2QXLA 1LOTB 1NGFA 1RGIA 2FF3B 2P9SA 3EL2A 1KAXA 1K8KA 1Y64A 4IXCA 4A61A 1HX1A 3I8BA 4HTLA 1E4GT 3KHYA 4H0XB 3SK3A 1MA9B 3WEEB 2CGLA 4QS9A 4M7XA 1LCUA 3ULEB 4JHDB 4BREA 4BR5A 3BUZB 2UYTA 3MN5A 3VOVA 2QM1A 1IG8A 4CZGA 4XEIA 2A3ZA 2P9KB 2QWRA 5FPMA 1SQKA 3A0IX 2NLXA 1H1VA 4K43A 4CJ7A 3EO3A 3FZMA 3M6GA 4WQ4C 2I7PA 4K25A 1GLDG 3VEZA 3D2FB 1GLEG 3MN7A 4B1UB 4Y0WA 4RWTA 4BRQA 4BRMA 1QQNA 3VENA 1T6DA 2YHYA 3GOIA 3A5NC 5AR0A 5BRHA 5F0XA 1NGHA 3LM9A 4CD1A 2EWSA 1D4XA 3DXMB 5AQWA 5BN9A 3MCPA 3MK6A 3UKUA 4AM7A 3W0LA 2E2QA 4FOEA 4FWKA 3GE1A 2P9LB 3WUHA 2HOEA 3UB5A 1T44A 3ID8A 1NWKA 5ADXH 3VEWA 2E2PA 1CZAN 4BROA 3L6QA 3FZHA 2QWOA 3H3OB 5LY3A 2IVNA 3DWLA 4B9QA 4F9OA 3DXKA 4JD2A 2P9IB 3DJCA 2PAVA 1GLCG 4BR9A 3TPQA 4BR0A 3AY9A 4PL8A 5AFUA 5JLHA 2GEMA 3VPZA 3D2EA 3IMXA 4FSVA 3SMPA 5F1XA 3O6WA 3ZX3A 1IJJA 3GG4A 4CI6A 2CH5A 3IFRA 5AZIA 4BRDA 1BU6O 2W41A 5EXWA 5E84A 1P8ZA 3CQYA 3G25A 5AQRA 1BG3A 4DQ8A 3WXLA 4FO0A 2P9NA 3QBWA 3VEXA 2YI1A 2Q1NA 3AAPA 3F9MA 4BC5A 3O4WA 4O5FA 4IJAA 1QZ5A 2Q31A 1ZC6A 3H3NO 3MDQA 2ITMA 5AQKA 3BP8A 3R8EA 1JCEA 2V7ZA 2VYPA 3O5BA 3BF1A 4K41A 3CI5A 1DEJA 3HZ6A 4XH5A 5FPEA 3CJ7A 3H1QA 1QHAA 4BGBA 4IO8A 4XH1A 4L3QA 2VWBA 4HWIA 4CD3A 1EQYA 2GUPA 2YJFA 2NRHA 2PBDA 4I6MB 2E88A 4FWMA 4ISGA 4NO7A 3U9ZA 2Q0RA 3O80A 4H5NA 1MWMA 2I7NA 4BRFA 1C0GA 1ZXOA 3QDKA 3VERA 4CZJA 4IWVA 5BRFA 2Q0UA 5AQZA 1QQOA 1YUWA 5AQGA 1TUYA 3WQTA 1V4SA 5JLFA 4O8KA 3C7NA 3I33A 4EHUA 2H3GX 4BRGA 1X3NA 1MDUB 1TYQA 3HBTA 4KBOA 4A2AA 4EFHA 2BUPA 3SLCA 3H1VX 4PL7A 3EKUA 1U6ZA 2P9UB 4BRPA 2NZTA 2FSJA 2E8AA 1GLBG 2D1KA 3O1WA 3VF4A 4CZKA 2YCHA 3UKRA 2ASMA 2FXUA 4GY2B 1Z05A 3O08A 1NGDA 3H6EA 2YHWA 2GELA 3JXUA 3CIPA 1NGJA 2AA4A 2D0PA 5AQJA 4EIAA 3HSCA 3ZEUB 4FWPA 3UE5A 1X9JA 5AZJB 5LJVA 3FZLA 2F9TA 4FWSA 5BPMA 5AQTA 3CETA 1XC3A 5EX5A 3VEYA 4DB3A 1GLLO 2E20A 3WEEA 3KZBA 1NGBA 5EY4A 1G99A 2E2OA 3A8YA 5EVZA 3VGLA 2P9PB 3ULEA 4JHDA 4B1WB 3CHWA 3CJ1A 1SAZA 2HMPA 4E1JA 4QS7A 2P9KA 2ZGYA 4H03B 3FLCO 3RSEB 4CZHA 1TUUA 4EAHD 5KQDA 1NGAA 2V51B 4C23A 1WOQA 3D2FA 2A41A 3FE1A 4BQZA 2DPNA 1KAYA 1YXQA 2FSNA 3JS6A 3ZEUA 1BO5O 1X3MA 2GWKA 2CGKA 4M63C 4DHYA 2GWJA 1JCFA 2A40A 4MO5A 5AQLA 1NGIA 3DXMA 1HKGA 2CGJA 1KXPA 4FWNA 1U2VB 5BN8A 5ADXA 3LL3A 1S22A 4FPAA 3H46O 1SZ2A 5E26A 1NGGA 1XUPO 5AQYA 2P9LA 2Q97A 3GDQA 3M3ZA 3QFPA 4JN4A 3LDOA 3C0BA 3VF6A 2V52B 4BR7A 4FWQA 1JCGA 5AQVA 3AAQA 1GLAG 4H5WA 2VCPA 1ATSA 2QW9A 2QWLA 1V4TA 3AARA 1HKCA 2P9SB 3WXJA 4BVPA 2W40A 1Q18A 3J8AA 2P9IA 3ATUA 5AQXA 1K8KB 4A62A 5EOYA 3WT0A 4CZIA 3A5MC
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4DCHA 1KVCA 1ZBSA 4BE2A 5KPTA 4AHVA 1ZBHA 4KI6A 3L0QA 5HLFA 5GAHP 4JKDA 3ZSZA 2O8EB 4FJMA 4ID1A 2EX3A 5BPNA 4H0PA 1RDBA 1VAZA 3HTVA 3ZSRA 5JICA 1UAXA 4H0YB 4CEOA 3LDNA 3E9PA 3SPYA 3QICA 4JKGA 2P5GA 2YJEA 5DM7L 2QWNA 3FR0A 3FFKB 5AQIA 1RT4A 4CJKA 4CEEA 1MWKA 3FZKA 3ZETB 1ZYQA 3KD5E 3GL1A 3OYHA 3SBTA 2IIRA 4EZ9A 3BEXA 1BL3A 4X66K 4AHRA 4WFAL 2V7YA 4FK0A 3AA5X 3VQ6A 1UA0A 4CJUA 1NK5A 4BEBA 5CZ2A 1JXBA 4WQ5C 2KW4A 1DLOA 4N56A 4NLBA 1DKGD 2ATQA 1NU0A 3PY8A 1M1KO 1HNIA 1SUQA 1JLGA 1BA0A 4RW7A 2QA4N 1C0MA 3QFUA 4CZLA 4WYBA 1YJWN 4B1YB 3T69A 4BVOA 2YHXA 3R3LA 5AQNA 2KHOA 3KKRA 3CCSN 1QSSA 4DG1A 2A6AA 4BRKA 1RNHA 1FXXA 1KTQA 2D0BA 2AP1A 4A5BA 4IJNA 2F9WA 4HTUA 3AGKA 5TKWA 4YHHK 2E1ZA 2IAJA 1VQ6N 2KZMA 4FLZA 4K8ZA 5AZJA 2ZM6K 3KLEA 4DV5K 4HHTA 3MEEA 4B9UA 2FBTA 3VETA 1CLQA 4F3OA 3HOTA 3IKMA 1VQPN 4V19S 3VTHA 1WBDA 1S1VA 2JGUA 4CBUA 1NJXA 2Q36A 1N33K 4E7IA 3SQ1A 3P4IA 3U4LA 3FFIA 1A5WA 4CJQA 5I9EB 3OYJA 4FWLA 2UXBK 3RWUA 3HPHA 5C25A 3VN5A 4KHYA 4CGHA 4IDHA 3M1FA 4GV9A 4CBWA 1O1WA 3AVGA 3AO5A 4M3UA 4U67L 4EHTA 4Z4GA 1O13A 4Z94A 4C1NI 1TL1A 1TYQB 5ELZA 5FPNA 3V9WA 5BR9A 2E6MA 4XIUA 4CCHA 4I9LA 1XMQK 3NVKA 4KB0A 4MO4A 2FSKA 5BRDA 4KPYA 4LC9B 4B9VA 1SL1A 4DS4A 2O8FB 5J2MA 4OPHA 4BQLA 4CK2A 1QQCA 3IUCA 3FGUA 1RT1A 1LOTB 2QKBA 1NGFA 1RGIA 2FF3B 2P9SA 4KI4A 1K8KA 1Y64A 4IXCA 4NCBA 1HX1A 3RMCA 5GAGP 1RBUA 2OPPA 1S6QA 3QLHA 3PO5A 4M7XA 1LCUA 4JK9A 3R1XA 1JLCA 4BREA 4FVUA 4BR5A 1I3AA 2UYTA 1BISA 4CZGA 1TV6A 1SQKA 2NRTA 4AHCA 3A0IX 4K43A 3M6GA 3VQDA 3T1AA 5I42A 2JLEA 5A2QO 3NF8A 4DSEA 4K25A 1RBVA 4JKEA 3VEZA 3V6DA 3EE9A 3MN7A 3TAMA 2VQFK 4IBNA 1VQ8N 5JS1A 3MX5A 5H1SQ 4OPJA 1RDCA 3ZLJA 4I7FA 3IS9A 2VQEK 3A5NC 1XHZA 5F0XA 3DRPA 5C2DA 2XHBA 3DXMB 2Z1IA 4J2DA 5BN9A 5CYQA 3CF5L 4LSLA 4CF0A 2OCEA 1ZBFA 1X1PA 3V1RA 2HHUA 2P9LB 1YTAA 2HOEA 4ICLA 4DFPA 4O44A 4NLCA 3OTOK 1T44A 3EZ5A 2OYQA 4BWMA 2P5OA 3L6QA 3FZHA 2QWOA 2C1GA 4B9QA 4F9OA 2O8CB 3DXKA 2P9IB 4QAGA 2B6AA 4FYDA 2NRZA 4FJKA 2PAVA 3NH0A 3O4QA 3TPQA 3AY9A 1KD1O 1X9SA 3D2EA 3IMXA 2HHWA 5CR4A 4CI6A 3D45A 2B4JA 2CH5A 2KZZA 4BRDA 3WXMB 3THYA 3MX2A 3BDPA 3OBYA 3S3MA 4FLTA 2BE2A 2DY4A 1KLMA 4M3WA 1HPZA 3AAPA 3E66A 4BC5A 3O4WA 3LAKA 2YNHA 1QZ5A 1ZC6A 2WOMA 4B9LA 3NGYA 4AH9A 3O3HA 3AVAA 3VQCA 2IGIA 1U49A 5FPEA 3M8PA 1QHAA 5HRRA 4CJ4A 4HWIA 4CD3A 2YJFA 3AO1A 3DRRA 1N5YA 3LP2A 4JYAK 1Y97A 2Q0RA 2OA8A 4H5NA 3NVMA 3Q7BA 3CFRA 4FCYA 5KTQA 4CIFA 4BRFA 3VERA 3O9UA 3TI0A 4E72A 3NGZA 1JLAA 2O8DB 2Q0UA 5AQZA 4AQYK 2OPRA 5AQGA 1V4SA 1OVQA 3LP0A 3C7NA 4DTUA 4NXNK 4KBOA 2HVIA 3E9LA 2BUPA 5GINA 4CIEA 2QEXN 1D8YA 3U3GA 1N36K 3J7AP 1QS4A 4DF8A 2QKKA 4CEZA 1KVBA 2KTQA 2P9UB 2NZTA 3ITHA 3PIOL 1GLBG 3VF4A 5AJ3K 4F2SA 4YOUA 3IG1A 3TAEA 5KGXA 3LP1A 1NGDA 4W5QA 1NGJA 2AA4A 2GV9A 3CXCM 1WSEA 3ZEUB 4FWPA 1J9AA 3L2VA 5LJVA 2F9TA 3SJJA 5AQTA 4IOCL 2YHBA 2Z1GA 1KSPA 1GLLO 5JS2A 1KQSM 3SV4A 3BZKA 3A8YA 3BGRA 1IKXA 2FBXA 3ULEA 4JHDA 3P5JA 4DFKA 2HHSA 1RTJA 3CHWA 2HMPA 3LP3A 4CJ5A 2KFZA 3ZT2A 4JV5K 2DTUA 2HHHK 3RSEB 4CZHA 3ALYA 2V51B 3QERA 3D2FA 4WCEL 3TSUA 4BQZA 3K59A 3JS6A 3CYMA 2GWKA 3L2WA 4JI6K 1JCFA 2A40A 4DFMA 3DLKA 3ZSXA 3OS1A 1FKOA 1WAFA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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