3UKRB

Crystal structure of bos taurus arp2/3 complex with bound inhibitor ck-666
Total Genus 54
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
54
sequence length
193
structure length
193
Chain Sequence
GVVVDSGDGVTHICPVYEGFSLPHLTRRLDIAGRDITRYLIKLLLLRGYAFNHSADFETVRMIKEKLCYVGYNIEQEQKLALETTVLVESYTLPDGRIIKVGGERFEAPEALFQPHLINVEGVGVAELLFNTIQAADIDTRSEFYKHIVLSGGSTMYPGLPSRLERELKQLYLERVLKGDVEKLSKFKIRIED
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Structural protein
publication title Structural characterization and computer-aided optimization of a small-molecule inhibitor of the Arp2/3 complex, a key regulator of the actin cytoskeleton.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Actin-related protein 3
total genus 54
structure length 193
sequence length 193
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-11-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3ukrB01
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3ukrB02
1E4FT 1J6ZA 2V51B 4K43A 1CZAN 4EHUA 4BRGA 5BRHA 4E1JA 1Y64A 3SJHA 5FPMA 3EZWA 3WXKA 3AAQA 1TYQA 3VEYA 3ZX0A 5F2RA 1EQYA 2GWKA 1NGIA 1X3MA 2BUPA 4H03B 4L3QA 4CZMA 4FSVA 5AQRA 3ZEUB 1LOTB 1GLFO 2QWQA 3IFRA 4IZ9A 4JAXA 4BRKA 3LDOA 3L4IA 4FWOA 3JS6A 1S22A 2CH5A 2E2NA 2Q1NA 1XQSC 1MWMA 4M63C 5AR0A 2ASPA 2UYTA 4FWKA 5AQUA 4PKGA 1DGKN 5AQIA 3QBXA 3B8AX 3D7EO 4F9OA 3U9ZA 4BGBA 4YDUC 1KAYA 4BC5A 4A62A 4FOEA 4QS8A 4B1VA 1RFQA 5AQWA 4ISFA 4A61A 4BR5A 2E2PA 1BWFO 4WQ5A 1YVNA 1SQKA 2ZF5O 3O08A 3LM2A 3IUCA 4PKHA 5JLFA 5F0XA 5AQJA 3QFPA 4FL9A 3L6QA 3LDNA 5FPNA 2QW9A 3ZX2A 2QWPA 2ASMA 4BVPA 3M1FA 2E88A 3WUHA 3DXMB 3LDQA 4CBXA 3MN7A 2P9KB 2HF3A 1BUPA 2A41A 5ADXA 3GOIA 3VGMA 4M7XA 3VEXA 4BQLA 1MWKA 3O6WA 3ZEUA 4FWRA 1NGJA 1U2VA 1T44A 3FLCO 3QMLA 3A5MC 3VF4A 3FZKA 4Y0WA 4WQ5C 4H5WA 2NRHA 4FWMA 3BP8A 1K8KA 5BPMA 4H0VB 3HZ6A 2E2QA 1KAZA 4O5FA 2AA4A 4K25A 2YJFA 3LDLA 4B1ZA 3QB0A 2A42A 3VEWA 4BROA 3H3NO 4FOIA 1JCGA 1BA0A 2Q0RA 2GWJA 4JHDA 4BRHA 3CJAA 2P9PB 2EWSA 2P9NA 2A6AA 3MN5A 4B1WB 3BF3A 3ULEB 3FFKB 3JXUA 4EHTA 2HF4A 3FZMA 3W0LA 4QS7A 4CBWA 2FSJA 3S41A 3R8EA 3GL1A 5AQTA 3DXMA 1ATSA 3O5BA 2CGLA 2ZWHA 2P9KA 5FPDA 3FE1A 3KVGA 4CD1A 2D0OA 2D4WA 5AQFA 5AZJB 3BEXA 3AAPA 3ID8A 4BC3A 4FWSA 2PAVA 2OANA 3UKRB 4CI6A 4BR2A 1BA1A 3C0BA 1NGGA 3WEEB 1KXPA 4BC2A 3HTVA 2Q2RA 2A40A 4H0PA 3IDHA 4H5RA 4Z94A 5AQMA 1QHAA 3CI5A 4M7YA 2WUSA 1BG3A 1NM1A 4H0YB 4ISGA 4NB4A 1C0GA 1NMDA 1E4GT 4BRDA 4BQZA 3A5OC 2YHXA 3MK6A 3CJ9A 1ATRA 3UKUA 2PBDA 3J8AA 4PL8A 4AM6A 5KQDA 2E1YA 1IJJA 3LDPA 3RSEB 4IWVA 3WQUA 2V52B 1NLVA 2P9PA 1HKGA 3WT0A 4JNEA 3ULEA 5AQXA 1QZ6A 3ZX3A 5AQPA 1T6DA 3M6GA 3A5NC 2F9WA 5AQHA 5BRFA 1BOTO 4C23A 3MDQA 1NGEA 3CQYA 3VERA 3QFUA 5TKYA 2W40A 3ZETB 1YUWA 1R59O 5AZJA 3CJ7A 3UKRA 3KHYA 4H0TB 2DPNA 1GLEG 4HTLA 1YAGA 1TUYA 4WQ4C 4XH4A 3VENA 3BF1A 1P8ZA 4O8KA 2ZGZA 3U4LA 5EOYA 3SMSA 1ATNA 3H45C 4I6MA 4BRCA 4GY2B 4J8FA 1QQOA 4BRNA 2IVOA 4FWLA 3GG4A 5AQQA 4BRAA 3O8MA 1WOQA 2FF3B 4H5NA 4FPAA 1HJOA 3VOVA 3MMVA 3D2EB 4JD2B 1NBWA 1GLJO 5JLHA 1SZ2A 4WYBA 4RWTA 2P9UB 4EFHA 1GLBG 1LCUA 1ZC6A 3H1VX 2V7ZA 3HM8A 5JMVA 4GNIA 1MDUB 1H1VA 3AARA 4CJ7A 1IG8A 2E2OA 2D0PA 1GLLO 4DB3A 1V4TA 2E8AA 1HPMA 1NWKA 5CE3A 3QBWA 2AP1A 1QQNA 3FGUA 3TU5A 2Q97A 3TPQA 3DAWA 5BPLA 3VEOA 3M3ZA 3CJ1A 2FF6A 3ZETA 2BTFA 3MCPA 4CZLA 2J4RA 5AFUH 2CGJA 5LJWA 1TUUA 2KHOA 3DXKB 4BGAA 2E1ZA 3G25A 1DEJA 4IJNA 4BVOA 5EY4A 3I8BA 4RCHA 4A2BA 3FZLA 4BR4A 4FPBA 4BRMA 1HX1A 2ASOA 4DQ8A 5BR9A 4CZKA 4BR9A 1TYQB 1T6CA 5KPZA 4BRLA 5ELZA 2QM1A 4BG9A 4JD2A 3EKSA 3H3OB 4KBOA 2Q36A 1BU6O 5EX5A 4RTFD 4CD3A 3C7NB 1NGAA 4QS9A 1NGDA 1S3XA 3P4IA 3VEVA 3BUZB 4BRFA 4A2AA 4EAHD 3VPZA 3O80A 3DJCA 2QWLA 5BRDA 4PL7A 3HBTA 2I7PA 3U8XA 2YI1A 4IO8A 5E26A 2ZGYA 4BREA 1ESVA 3UE5A 1OKJA 1HUXA 1U6ZA 3LM9A 4CZIA 4CBUA 2IVPA 4IXCA 4XH5A 4CZJA 5AQGA 5BN9A 4NO7A 2GUPA 5EVZA 3CHWA 4WQ4A 1BDGA 2NLXA 1JCEA 4DCHA 5AQSA 3DXKA 3A0IX 2P9IB 4B1YB 5AQVA 5BN8A 3VF6A 4HWIA 1QZ5A 2FSKA 3GDQA 4MLEA 3OHRA 1KAXA 2IIRA 3SK3A 2QWMA 4K41A 5JICA 3VGKA 5KPRA 3F9MA 2P9SB 3A5LC 1ZBSA 4H0XB 2FXUA 3CERA 5AQYA 2GTDA 4MO4A 2I7NA 1U2VB 2CGKA 3AY9A 3EN9A 3QICA 3SMPA 5AFUA 5BPNA 3R9PA 3VEZA 3C7NA 2FSNA 3WEEA 2E20A 5AQZA 2QWOA 5AQLA 4BR7A 3EL2A 1K8KB 3UB5A 1BO5O 3ATUA 2VCPA 1XC3A 3WXIA 3A8YA 4XEIA 4DHYA 3DWLA 1YXQA 2NZTA 2Q0UA 4XH1A 4B1XB 1GLAG 4H5VA 1HKCA 2YJEA 3D2FB 5AZIB 3KZBA 4BRIA 4JHDB 5B8HA 2P9NB 3VF2A 3H46O 3RSEA 2D1KA 4B9QA 2GELA 2QWNA 2P9IA 4CZEA 2YCHA 2ITMA 2YHYA 2VYPA 3CJCA 4MLHA 4BRQA 3L0QA 3U9DA 2P9SA 1NGHA 5EXWA 1V4SA 3FR0A 1HKBA 3HI0A 1X9JA 1G99A 3ATVA 2H3GX 5FPEA 3ENHA 2YHWA 5I9EB 3CETA 3MN6A 3I33A 5AQOA 1Q18A 1X3NA 1SAZA 4K42A 3EO3A 3WXJA 3VETA 2QXLA 2P9LB 1MA9B 3LL3A 1WUAA 2Q31A 4BR0A 4CZHA 1GLCG 5AQNA 2HMPA 1DKGD 1NGBA 4JN4A 5LY3A 1XUPO 4EIAA 3UKUB 1JCFA 3VESA 5F1XA 3FZHA 1ZXOA 2IVNA 3H1QA 1NGFA 5LJVA 1HLUA 3D2FA 3D2EA 4AM7A 1NGCA 4ISEA 5AZIA 4BC4A 4FWPA 1GLDG 4B1UB 5KQ8A 3H6EA 4PKIA 2FLOA 5E84A 1Z05A 3ENOA 3EKUA 3HSCA 4IJAA 2P9UA 3CJBA 3CQXA 4FWNA 3O1WA 3SLCA 2F9TA 4FO0A 3R6MA 4LC9B 3GBTA 3W3DA 2QWRA 3MN9A 2GEMA 5AQKA 3QDKA 2W41A 3CIPA 3VGLA 2A5XA 4H5TA 3WQTA 2CH6A 2HOEA 3IMXA 3GE1A 3FZFA 4CZFA 3O4WA 1D4XA 4H0OA 1RGIA 5ADXH 1QQMA 1RDWX 4MO5A 4BRPA 2VWBA 2A3ZA 1C0FA 4BG8A 4FWQA 4CZGA 3WXLA 3O1BA 2V7YA 5BREA 1Z6RA 4YDUA 4I6MB 5KPTA 2P9LA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1NK0A 3IKMA 3LPUA 3TWHA 3U3GA 4C8KA 1O1WA 5FPMA 4Z4CA 4FJ9A 3MEDA 1UOCA 3C95A 3KD5E 2HW3A 2GWKA 3HM9A 3THYB 1X3MA 3DMJA 4CZMA 3NHGA 4J2BA 5AQRA 4GMJB 1LOTB 1GLFO 2QWQA 4WE1A 4JKFA 3JS6A 3RRHA 1C1AA 1S22A 4IG0A 4E1NA 2E2NA 4DU4A 4DSJA 4Z4HA 4M63C 5AR0A 4CHOA 4PKGA 3QBXA 3U9ZA 3LPTA 1XC9A 4FOEA 4QS8A 4FLXA 1RTIA 3SV4A 3IS9A 4PHTX 4E7IA 3LANA 2QI2A 3P83D 4FK4A 2O8DA 4WQ5A 1WLJA 4JV5K 4X62K 2QW9A 1ITGA 2ASMA 3RMCA 4B9SA 3L2RA 5LL6Z 1SL0A 1I94K 2P9KB 4YY3K 3ULDA 2WC9A 2WBNA 3GOIA 3THWA 1NJXA 3RRGA 3DLKA 3O6WA 3MEGA 3CCUN 4FWRA 2HHUA 1NGJA 1U2VA 3VF4A 3AA3A 4UQGA 3QIPA 4Y0WA 3OJUA 4M3XA 4IOCL 2UUCK 3D45A 5C10A 4OO1J 1J54A 2HBLA 4FWMA 4B3SK 3CF5L 5FRMA 1XHXA 4FJIA 2E2QA 4O5FA 2AA4A 4DTJA 3G6EN 4B9UA 4B1ZA 4BROA 3KLIA 1ASVA 1C1BA 4B8AB 4CJSA 1JCGA 2D0BA 5C2FA 2P9PB 3CJAA 2EWSA 2P9NA 3MN5A 4B1WB 5GAEP 3EZ5A 3FFKB 3CPEA 3O3FA 3FZMA 1D9DA 4QS7A 4CBWA 3NGIA 1NK5A 3S41A 1SKRA 3GL1A 1ATSA 4JK7A 5CYMA 4M42A 1EXQA 3R3LA 1IKYA 2D0OA 3SPZA 5AQFA 1YITN 2KW4A 3AAPA 3ID8A 4LF6K 4DV7K 4BR2A 1NGGA 3WEEB 4A5BA 2W6LA 3LWLA 4BC2A 1J53A 3K5MA 3JSMA 1EKEA 1JLBA 3CCSN 3AVCA 4Z94A 2QKBA 2HHXA 1QHAA 2NNWA 5TKWA 3ALYA 1SV5A 1HNVA 1B9DA 3VMFB 1NMDA 4CEZA 3MEEA 4DSLA 1F21A 3A5OC 3KWGA 4JK9A 4CJKA 3CJ9A 1ATRA 5M1PA 3VQ4A 1SKSA 3CCEN 2PBDA 4AM6A 2YNGA 4FJLA 1S6PA 2ETJA 2V52B 4IDKA 5CY4A 1BI4A 4JNEA 3ULEA 1QSYA 3RMDA 4E7LA 5GIOA 5AQPA 3VQCA 1S1UA 3M6GA 3A5NC 2F9WA 1BOTO 3I0SA 3KK7A 3H08A 5TKYA 5I42A 3OW2M 1HNWK 2YNIA 3UKRA 4CEQA 3CQ8A 2P5OA 1N32K 4H0TB 3KD1E 2DPNA 5CZ1A 1TKTA 4HTLA 4E89A 2C1IA 1SL2A 4WQ4C 3HYFA 4XH4A 3BF1A 1P8ZA 1OH5A 2ZGZA 3H45C 3SQ2A 3OYGA 3O9QA 3MCAB 5AQQA 4BRAA 3OYEA 4H5NA 1S6QA 4M3YA 1KVAA 3D2EB 4JD2B 3QEPA 3S3OA 5JLHA 1RBTA 1SZ2A 4WYBA 1LCUA 1ZC6A 3NVKA 2YV0X 3NMUA 4IG3A 3HPOA 3ZSXA 4V19S 5GIPA 4CJ7A 2QA4N 3NF8A 1V4TA 1S9EA 1BQMA 1S1TA 3QBWA 3TPQA 3VQ8A 1JXBA 4DMNA 3DAWA 5BPLA 3DLRA 1VSLA 2YNFA 2R7YA 3MCPA 4JKDA 2J4RA 5AFUH 1KSPA 2CGJA 2KHOA 3DXKB 3NAEA 1OH6A 4KHYA 4HUFA 3TI0A 3AGRA 4M41A 5EY4A 3QEWA 2O8FA 3FZLA 4BR4A 1IG9A 4QOZB 3DOLA 4FPBA 1HX1A 4O8UA 3OY9A 2ASOA 4DQ8A 4IBNA 4CZKA 5ELZA 3ASMA 2QM1A 4ZTFA 1FK9A 2WONA 4BG9A 3EKSA 4KBOA 3L8BA 4JKAA 2O8BA 2Q36A 5EX5A 4CD3A 4DV6K 4O0IA 1NGDA 1S3XA 4BRFA 4Z4GA 3O80A 5C0YA 2B6AA 3DRRA 3DJCA 4OGEA 2QWLA 4PL7A 4K8ZA 4CJEA 1RT2A 1SUQA 3CG7A 3OYIA 5E26A 4G1QA 4AF1A 3TAFA 1ESVA 3LWMA 3VA3A 1NK4A 1VSEA 3TAMA 1I3AA 2Z1JA 4CZIA 3OYHA 4ELUA 4IXCA 2O8DB 3QIOA 4OX9K 4NO7A 4CEOA 1KLMA 5EVZA 3ZT2A 3ZSQA 1VQPN 4MDBA 1XMOK 5JVGL 1ZBLA 4RW8A 1TK0A 1QZ5A 1ZBIA 1T3VA 4MLEA 4DSIA 4FM2A 2OZSA 3TAPA 4DR4K 3HVTA 3VGKA 4OLAA 3A5LC 4CEAA 4RW6A 4B3OA 2FXUA 3CERA 5FROA 2Z1HA 1WSJA 3L2QA 4PY5A 4FM0A 1U2VB 3WNGA 5AQZA 1E3MA 2YHAA 4BWJA 4AHRA 2O8EB 4JKBA 4KO0A 5CZ2A 3UB5A 4A57A 2VCPA 3WXIA 4XEIA 4JI4K 2NZTA 2RE2A 4JI6K 4H5VA 2YJEA 4CJVA 3TAGA 1BL3A 4BRIA 1T05A 2P9NB 1VQNN 3ZT3A 3CM6A 3C94A 2Q3SA 2YCHA 3S3MA 1K9MO 1QQCA 5FDLA 2OTJN 1D9FA 4DTMA 3PUFA 3SI6A 3V1QA 4BRQA 3J7ZO 2XY7A 3K58A 1KVCA 4KREA 1V4SA 1K73O 3BGRA 3FR0A 1HKBA 4CESA 1YHQN 1NJZA 4JI5K 2IGIA 5FPEA 3CETA 4BACA 4IEIA 1Q9XA 4CEDA 1LW2A 3VETA 4CGJA 3VN5A 3NF9A 4M3WA 3SUQA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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