3WEEA

Structure of the full-length yeast arp7-arp9 heterodimer
Total Genus 111
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
111
sequence length
462
structure length
425
Chain Sequence
QDSILIIYPRSQTTLVQFGLNEETFTVPELEIPTQIYRTTRQDGSYTYHSTNKDNKAELIKPIQNGEIIDISAFTQFLRLIFVSILSDRSNIPLLLITHHSWSQSDLEIITQYVFESLEINNLIQLPASLAATYSMISLQNCIIDVGTHHTDIIPIVDYAQLDHLVSSIPMGGQSINDSLKKLLPQWDDDQIESLKKSPIFEVLSDDAKKLSSFDFGDEGTLNVAEIITSGRNVKNSDLEFNTFWDEKGNEIKVGKQRFQGNNLIKNISNRVGLTLDNIDDINKAKAVWENIIIVGGTTSISGFKEALLGQLLKDHLIIEPEEEKSKREEEAKSVLPAATKKKSKFMTNSTAFVPTIEYVQPTVIKLAKYPDYFPEWKKSGYSEIIFLGAQIVSKQIFTHPKDTFYITREKYNMKGPAALWDVQF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transcription regulator
molecule keywords Actin-like protein ARP9
publication title Structure of the full-length yeast Arp7-Arp9 heterodimer
doi rcsb
source organism Saccharomyces cerevisiae
total genus 111
structure length 425
sequence length 462
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-07-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3weeA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3weeA01
3.90.640.60 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3weeA03
1E4FT 4FWRA 2PAVA 5AFUA 3D2FA 4FO0A 4E1JA 1ZBSA 3G25A 2QM1A 2IVOA 1HUXA 3C0BA 3HZ6A 1QQOA 3DXKB 3H3OB 3W3DA 2AA4A 2W40A 1DGKN 4A61A 1GLJO 4BR9A 4BVPA 3U9DA 3WEEA 2QXLA 3CHWA 3GG4A 2GWKA 1NMDA 4H0VB 1H1VA 4IO8A 2V51B 3H46O 2OANA 5FPMA 4EFHA 3BF1A 1YAGA 3KZBA 3QB0A 2GWJA 3ENHA 2QWMA 4FWNA 3P4IA 3HTVA 2ZGZA 3M3ZA 1BUPA 4BC2A 5BPMA 5ADXA 5FPDA 2ZGYA 3FE1A 1WOQA 3H45C 4CBXA 1Y64A 5AQHA 2ASPA 3VENA 1NGBA 4CZEA 3QDKA 3U9ZA 3DAWA 2UYTA 3GBTA 3U8XA 4CZHA 3QFUA 3CJ7A 4BRIA 2V7ZA 2CH6A 1DKGD 3QMLA 2YHYA 3L0QA 2P9LA 4H0YB 4ISFA 2GELA 4PL7A 2P9SA 5AQFA 5BPNA 1G99A 5JLFA 4QS8A 3H6EA 3JS6A 4BRLA 4BG8A 4L3QA 4WQ5A 3QICA 1Q18A 4QS9A 1HKBA 4O8KA 4CI6A 4DHYA 3LDOA 3VEYA 3VF6A 2P9LB 2WUSA 2A42A 1C0FA 4BR7A 1IJJA 1P8ZA 1S3XA 1KAZA 2Q2RA 3VEVA 4FOIA 2ZF5O 1NGDA 4AM6A 1TYQA 4B1ZA 1HLUA 3IUCA 1NGJA 1R59O 2V7YA 4JD2A 5AQRA 3VEOA 2A5XA 3RSEA 1ATRA 1QZ5A 3HI0A 3WQUA 2YI1A 3R6MA 4H0XB 3VGLA 3ZX0A 4IJNA 4XEIA 5EY4A 1C0GA 1KXPA 2YHWA 3BEXA 4EHUA 3J8AA 1WUAA 3HM8A 5AZIA 4AM7A 4FOEA 1TYQB 2D4WA 3CI5A 2VWBA 2P9NA 5FPEA 5AQKA 4BVOA 3A5MC 2AP1A 4M7XA 3F9MA 3M6GA 4H5RA 4FWMA 3RSEB 4BR2A 3ULEB 2P9IB 2P9UA 2D0PA 3H1VX 4CBUA 3VF2A 5BR9A 3CERA 5EVZA 4IXCA 5AQWA 4CD1A 5JLHA 1KAYA 3SMPA 4FWOA 2A40A 2E88A 4A62A 5BRHA 5AQVA 2Q1NA 2GEMA 3A5OC 1HPMA 2E20A 2P9NB 4PKGA 1SQKA 2YJEA 3DXKA 1QZ6A 3LDPA 2QWOA 5AQQA 2HF4A 1SZ2A 1DEJA 1GLDG 4BC4A 3CIPA 4CZMA 5KPZA 4BRPA 3VETA 2GTDA 3ZX3A 2P9UB 2FF3B 3LDNA 3VGKA 1Z05A 4Z94A 5JICA 3S41A 1BA1A 1HJOA 2NRHA 2FSKA 2P9PB 3ATUA 3D2EB 3EO3A 3TU5A 5CE3A 4MO5A 5BRFA 3ENOA 3I8BA 4A2BA 3SJHA 3VEWA 5KPTA 3WXIA 2D0OA 1U2VA 4BC5A 2Q0RA 4Y0WA 4BRAA 5E84A 2V52B 2IVNA 4ISGA 3QBWA 2BUPA 3O1BA 1GLAG 3ZETB 1CZAN 1GLLO 4FWPA 3UKRA 4H0PA 3IFRA 4RWTA 3H3NO 3EN9A 4H5NA 1YUWA 1U2VB 2BTFA 1BWFO 4M63C 1NLVA 4CZLA 5AR0A 4H5TA 2FLOA 2YCHA 3JXUA 1D4XA 3O1WA 3LDLA 3A0IX 1BG3A 5AQOA 3WXKA 2F9TA 2KHOA 3UKRB 2GUPA 4PKHA 2HMPA 3HSCA 3AAQA 4B1YB 4FPBA 3A5NC 3EKSA 1KAXA 4FWQA 3AARA 5AQTA 4H0TB 4LC9B 3WXLA 1NGFA 1MA9B 4BR0A 5AQMA 1T6CA 2F9WA 3CQYA 1T44A 3GDQA 3R8EA 4EIAA 5LY3A 4WQ4C 3EZWA 1GLEG 4XH5A 4CZFA 1NGIA 3LM9A 5F0XA 1NGEA 3CJBA 1LCUA 4H5WA 4DB3A 2A6AA 5BN9A 4MLEA 1JCEA 1EQYA 1ESVA 4FSVA 1NGHA 3FZMA 4NO7A 4FWLA 4CD3A 1NGAA 1ZC6A 4ISEA 4CZGA 3CJCA 1JCFA 1X3MA 3L6QA 4CZKA 1E4GT 1X3NA 2ASMA 4JN4A 1NGCA 3O4WA 5TKYA 2NLXA 2E2QA 3WUHA 3ULEA 3DJCA 4XH1A 2P9IA 1SAZA 1QHAA 3MDQA 3B8AX 3IDHA 4K41A 4H5VA 3O6WA 2E1ZA 4DQ8A 3UKUB 2CGKA 5EXWA 2ZWHA 5F2RA 4BR4A 5KPRA 5BRDA 3DWLA 5AQPA 3FFKB 4IJAA 4DCHA 1ZXOA 1ATSA 3FZFA 3MN6A 3VESA 4BR5A 4EHTA 1K8KB 2FSJA 3CJ9A 3UE5A 3VEZA 5AFUH 4CJ7A 1JCGA 1HX1A 1TUYA 2P9PA 3O5BA 1MWMA 1BDGA 3D2EA 3ZEUA 3MN9A 2E8AA 3A8YA 4J8FA 3SK3A 4CZJA 1J6ZA 2ITMA 3TPQA 3WT0A 4BREA 4H0OA 2ASOA 4GNIA 5EX5A 1X9JA 2D1KA 3MN5A 3SMSA 3CJ1A 3DXMB 4BROA 2HOEA 4QS7A 3ZETA 2VCPA 2FF6A 2QWPA 3ZEUB 1MWKA 3WXJA 4BRMA 3VGMA 1TUUA 4JHDB 3C7NB 1QQMA 3D7EO 4BRCA 1IG8A 5LJVA 4BRKA 4KBOA 3VF4A 4BRDA 5AZJB 2E2OA 4I6MB 5ADXH 3FZHA 2A41A 3MK6A 4O5FA 4YDUC 1HKCA 2J4RA 5AQGA 4WQ4A 2Q31A 3QBXA 4K25A 3FZKA 5AQLA 1RFQA 2E2PA 2FSNA 4BRQA 3O80A 1NM1A 2YJFA 1LOTB 3AY9A 3I33A 2IVPA 4H03B 3AAPA 4RTFD 1GLFO 5EOYA 1HKGA 1BO5O 1RGIA 5JMVA 3FZLA 3D2FB 4FPAA 4JAXA 4BC3A 1GLCG 1XUPO 3MN7A 4BGAA 3ID8A 3VEXA 2QWRA 2Q36A 2DPNA 4RCHA 1V4SA 2CH5A 5BPLA 4MO4A 2EWSA 5ELZA 3WEEB 3MMVA 3O08A 2QW9A 3CQXA 4IWVA 5AQUA 5F1XA 2E2NA 3HBTA 3CJAA 1QQNA 1S22A 3VPZA 4BRGA 4CBWA 4B1XB 1XQSC 4BRFA 3GL1A 3ZX2A 5KQ8A 4NB4A 5AQIA 4B1VA 1BU6O 3UKUA 4A2AA 3M1FA 1BOTO 5AQNA 2CGLA 4BGBA 3BF3A 5AQYA 3IMXA 1NWKA 3GOIA 4BRNA 3MCPA 3O8MA 3EKUA 3FGUA 3GE1A 3UB5A 1MDUB 5KQDA 2VYPA 4B1UB 4GY2B 2I7NA 1NGGA 3BUZB 2NZTA 2CGJA 1V4TA 1K8KA 1T6DA 2H3GX 2HF3A 3OHRA 4IZ9A 4K42A 4BQZA 3VOVA 5AQSA 5FPNA 4HTLA 2P9SB 2YHXA 4WYBA 3QFPA 4FWKA 2P9KA 5BREA 3R9PA 4FWSA 1ATNA 4EAHD 4BRHA 3SLCA 5E26A 2QWLA 4F9OA 4MLHA 2FXUA 5I9EB 3L4IA 1NBWA 4YDUA 4BQLA 3DXMA 2A3ZA 5AQJA 3ATVA 2E1YA 2Q97A 4HWIA 4PL8A 4M7YA 1BA0A 4CZIA 2QWNA 3A5LC 3WQTA 2P9KB 5B8HA 3KHYA 1XC3A 4BG9A 4JHDA 3C7NA 3LL3A 4PKIA 3U4LA 1Z6RA 4JD2B 1GLBG 5AQZA 1U6ZA 3CETA 2PBDA 4B9QA 5AZJA 4I6MA 3BP8A 4JNEA 4WQ5C 4C23A 1RDWX 5LJWA 2Q0UA 3LM2A 1YVNA 3FLCO 3FR0A 2I7PA 4K43A 3VERA 5AZIB 2QWQA 3KVGA 4FL9A 4B1WB 3LDQA 3H1QA 2IIRA 3W0LA 5BN8A 4XH4A 5AQXA 1YXQA 2W41A 3EL2A 1OKJA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2HBMA 1DT9A 1KQSM 3D2FA 4AHUA 1RBUA 4E1JA 3G25A 1HUXA 2YKMA 3HZ6A 1Q86O 1QQOA 3TAPA 4I2QA 1GLJO 4BVPA 4CF0A 1J9AA 4CESA 1ZBLA 3CHWA 3VQDA 3ZSOA 1H1VA 2V51B 4W5OA 3SQ1A 3P38A 1HQEA 4B3RK 2VGNA 5HRSA 1N32K 2QWMA 4FWNA 3HTVA 4BDZA 4BC2A 4FW2A 2WOMA 1Y64A 3DYAA 4JV5K 4DTSA 4B3SK 1UA0A 3QDKA 3GBTA 1WBBA 1HNVA 1Z25A 1EX4A 4W5NA 4RW8A 2V7ZA 3G71N 4JYAK 3QMLA 2YHYA 1HJRA 1GOBA 3KK3A 5AQFA 2VQFK 1EXQA 4AILC 3RMDA 1K6YA 4JK7A 3S3MA 1OH7A 3ZLJA 1L3VA 4BG8A 4DQIA 4F4KA 4L3QA 1RDBA 1TGOA 3QICA 4WQ5A 1LAVA 4ID5A 4CEFA 1WSFA 1HKBA 3PX6A 3VF6A 4BR7A 1IJJA 4LH5A 1KAZA 1IO2A 2Q2RA 3ZSWA 3VEVA 4FOIA 1QVFM 3K0SA 1KVAA 3MCAB 1TYQA 5C25A 2RPIA 4NYNA 3BDPA 2QK9A 3RSEA 4E3SA 1BIZA 1QZ5A 4DTNA 3L4QA 4DWIA 1LAWA 1ITGA 3QO9A 4H0XB 1KVCA 4IJNA 3E1YA 4WFNL 3VTHA 1WUAA 5AZIA 3OVNA 1J54A 4O0IA 1XHZA 2DTUA 2VWBA 5FPEA 3SPZA 3U3GA 3HP6A 4A5BA 4LFAK 4FWMA 2Z1HA 4CBUA 5EVZA 3SMPA 3EY1A 3TTCA 2GEMA 1HPMA 3C65A 2IC3A 5M1QA 1Y97A 5AQQA 1GLDG 3QEXA 4YY3K 4JRQA 4BRPA 3VETA 3ZX3A 4LF4K 3AA5X 3TI0A 3K58A 1TK5A 3LPUA 3S41A 2A1SA 3CXCM 4NYFA 3F73A 3ATUA 1W7AA 3TU5A 5CE3A 2X6SA 3CC2N 4JS4A 3OTOK 5KPTA 4CCHA 4KB0A 4HCCA 4BRAA 3G0ZA 3LWMA 3L2QA 3E9LA 3QBWA 3LZIA 1T8EA 1B92A 1CZAN 1GLLO 1RBTA 1HRHA 3DOKA 1VQ5N 2P51A 3B6PA 4RWTA 2F96A 1YUWA 1U2VB 1RTDA 1BWFO 1NLVA 4LF5K 3O1WA 3LDLA 4DS4A 1RDCA 1HQUA 1UWBA 1S9EA 3KKRA 4BWJA 3WXKA 4WCEL 3AA4A 4JKHA 4KI6A 3OYMA 3TSPA 1OH8A 2HHXA 3HSCA 3KD1E 2RHKA 1BCOA 1S1VA 3RWUA 2OPSA 4LSNA 4ZTFA 3G10A 1JL2A 5AQTA 4HUFA 4PUOA 4Z0UA 3V4IA 1NGFA 1MA9B 3QIPA 4BACA 3GDQA 2X6NA 4EIAA 1K9MO 4DSLA 2B4JA 4WQ4C 5E41A 3IAYA 3OYCA 1HNWK 5DM7L 4H5WA 2KZZA 3DLEA 4M42A 4A59A 3NCIA 1EQYA 2HBKA 4AQYK 1NGHA 3FZMA 4FJGA 4B9UA 3IS9A 1JLAA 4CZGA 4FJLA 1X3MA 3NF8A 1E4GT 1W97L 4K8XA 5KGWA 1NGCA 5TKYA 2QTDA 1NK6A 3KTQA 4DV2K 4CJEA 1KSPA 1OVQA 1SAZA 1IV0A 1VQ6N 3IDHA 3SQ4A 4Q0BA 2E1ZA 3UKUB 3SAFA 1EETA 1DLOA 2ZWHA 4PHTX 2WTUA 2DY4A 3LAMA 1CXQA 4IJAA 1ZXOA 3G4SN 3CF5L 4DR4K 1NK8A 3MN6A 3ITHA 4LFBK 1K8KB 3E9OA 4CGFA 1JCGA 3VQ6A 1MWMA 4RW6A 1BDGA 3O9UA 3A8YA 2YNFA 1B9FA 4CGDA 4FJIA 3BGRA 1OVYA 4BREA 3HPHA 2ASOA 2W42A 3MN5A 4IFYA 3CJ1A 4FK0A 2HOEA 4QS7A 2WC9A 1XMOK 1XMQK 4IFEA 2ZM6K 3WXJA 4BRMA 3VGMA 1JXBA 1FXXA 1BHLA 1TUUA 4JHDB 4IEEA 4CE9A 1RDDA 1TVRA 4KBOA 2F7TA 3MK6A 1VQ8N 4O5FA 1C0TA 3HYFA 4YDUC 4OO1J 4JKFA 4MDBA 5AQGA 1KD1O 4GKKK 2XO7A 4GVEA 4CJUA 3OYDA 2Q31A 4N5SA 4K25A 3J7ZO 3AVNA 3L8BA 3AVAA 3I56N 1ZBHA 4ZHRA 1LOTB 3WNGA 4V19S 2HHQA 5HRNA 4E1MA 1RT3A 1TKTA 2ITGA 3RR8A 1HKGA 1RGIA 5GAEP 4DU4A 4DQPA 3V1QA 5JMVA 3F2KA 2D5RA 4CEOA 5DMRA 1VAZA 4C8OA 4E0DA 5LMUK 4FLTA 3QEIA 4CEQA 3O4QA 2QWRA 4RCHA 3NGZA 2CH5A 5I42A 4RG8A 3THVA 4I7FA 3ULDA 4F2SA 1NK0A 2QW9A 5AQUA 5F1XA 1JLFA 3HP9A 3JAMO 1RT1A 4YOUA 2G8VA 4B1XB 1S6PA 1XQSC 4E7LA 2HHHK 4B9NA 3UKUA 3K2PA 4BGBA 4UQGA 4BROA 4BE1A 3GOIA 3HOSA 4JI3K 3KKSA 1L5UA 4E7IA 4QAGA 5KQDA 4B1UB 3I8DA 3OYKA 2D0CA 2I7NA 1ASUA 2DFFA 2KLAA 4KHSA 2NZTA 2YNGA 5KRSA 1K8KA 1CXUA 4FZYA 5AQSA 5FPNA 4JKBA 2IDOA 4KI4A 4GV6A 4FWKA 3AVKA 4KREA 4FWSA 1FKOA 3DLGA 4F3OA 4BRHA 4KTZA 3SLCA 1HR0K 4F9OA 4RW9A 4KPYA 5I9EB 4J2BA 4G1QA 3L2UA 3CCJN 4Z4EA 2E1YA 2Q97A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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