3WEEA

Structure of the full-length yeast arp7-arp9 heterodimer
Total Genus 111
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
111
sequence length
462
structure length
425
Chain Sequence
QDSILIIYPRSQTTLVQFGLNEETFTVPELEIPTQIYRTTRQDGSYTYHSTNKDNKAELIKPIQNGEIIDISAFTQFLRLIFVSILSDRSNIPLLLITHHSWSQSDLEIITQYVFESLEINNLIQLPASLAATYSMISLQNCIIDVGTHHTDIIPIVDYAQLDHLVSSIPMGGQSINDSLKKLLPQWDDDQIESLKKSPIFEVLSDDAKKLSSFDFGDEGTLNVAEIITSGRNVKNSDLEFNTFWDEKGNEIKVGKQRFQGNNLIKNISNRVGLTLDNIDDINKAKAVWENIIIVGGTTSISGFKEALLGQLLKDHLIIEPEEEKSKREEEAKSVLPAATKKKSKFMTNSTAFVPTIEYVQPTVIKLAKYPDYFPEWKKSGYSEIIFLGAQIVSKQIFTHPKDTFYITREKYNMKGPAALWDVQF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transcription regulator
molecule keywords Actin-like protein ARP9
publication title Structure of the full-length yeast Arp7-Arp9 heterodimer
doi rcsb
source organism Saccharomyces cerevisiae
total genus 111
structure length 425
sequence length 462
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-07-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3weeA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3weeA01
3.90.640.60 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3weeA03
1JCEA 3JS6A 4PKGA 2QWRA 4JHDA 4CZLA 3TU5A 5B8HA 1RGIA 4I6MA 1ESVA 3O1BA 2Q0RA 2YCHA 1EQYA 3LDPA 3LDOA 4CZKA 5AQGA 1WOQA 3IUCA 2IVPA 1ZC6A 3ID8A 3L4IA 5EXWA 3VEZA 1WUAA 3KZBA 2NZTA 3W3DA 4ISGA 3C7NA 3ZX0A 4CD1A 1GLAG 1YUWA 4CBWA 1QHAA 5ADXH 1JCGA 2NLXA 3A0IX 3EZWA 4O8KA 3VENA 3DXKA 3IMXA 1HJOA 4BRNA 3J8AA 3VOVA 4BRHA 4B1VA 2BUPA 3M1FA 3HBTA 2E88A 1GLJO 1D4XA 3A5OC 4YDUC 4EHUA 3VGMA 4BC5A 2P9PB 4JAXA 2HF4A 2VYPA 3VF4A 3UKRA 1NGCA 3L0QA 3KHYA 1NGGA 3DJCA 3HI0A 4B1UB 5F1XA 1MDUB 3MN7A 3TPQA 4FWNA 3I33A 4B1YB 5BRHA 5AQUA 3CJBA 2QWPA 2P9IA 3ZX2A 4CZEA 2KHOA 2E2QA 2QW9A 3L6QA 3EKSA 3MMVA 3SJHA 4BG8A 2I7PA 3CI5A 1JCFA 3LDLA 3VGKA 2ASPA 3D2EA 4BR0A 4PL8A 1T6DA 1TYQA 4PKHA 3U8XA 5AZIB 4BRIA 1GLLO 1HX1A 4FWLA 4WQ5C 3EN9A 3GG4A 2D1KA 5E84A 5AQIA 4CZIA 1U6ZA 2YHYA 4QS7A 4JNEA 1BA0A 2CGLA 4CZMA 4XH1A 4FOIA 1NWKA 4IO8A 3GBTA 3U4LA 5JMVA 4CZFA 4B1WB 4RCHA 2P9UA 2ZWHA 3MN9A 4GNIA 4YDUA 5E26A 3I8BA 4BQLA 2A6AA 2ZGZA 5AQPA 5BN9A 5EY4A 4BR9A 1C0GA 1YXQA 3MDQA 4HWIA 3QBWA 2YHXA 4BC4A 4FL9A 3FZLA 3O80A 5AFUA 4FPAA 4BC3A 5BREA 1GLDG 2P9LB 4FWOA 2Q36A 4BRMA 3ULEA 4EFHA 2FLOA 2PBDA 1Y64A 1QZ6A 2A5XA 3FZMA 1KAZA 4FWMA 1GLBG 1HKGA 4IJAA 4JHDB 2HMPA 4FSVA 3ZETA 3WEEA 1ZBSA 5AQKA 4I6MB 2HF3A 4BRPA 4H03B 2CH6A 3CQXA 3O4WA 1BO5O 1E4GT 3FGUA 2GEMA 1TUYA 1NGBA 1U2VA 3H1VX 1IG8A 1BU6O 4WQ5A 3IFRA 3VEXA 1MA9B 2FF3B 3C7NB 2FF6A 1S22A 4BGAA 3H46O 3B8AX 3FZHA 3BF3A 3MCPA 3DXKB 5AR0A 3CQYA 3FZFA 3FR0A 2QXLA 4H5TA 3ZEUA 2EWSA 3CJ9A 2V52B 1SAZA 4M7XA 4AM6A 1T6CA 1KAXA 4ISEA 2QWMA 1NGHA 4H5VA 3H3NO 5AQRA 3BF1A 3UKRB 4JN4A 2P9KA 3LM9A 4JD2A 1HPMA 2ASOA 3U9ZA 3R8EA 4QS8A 5TKYA 3ENHA 2D4WA 3R9PA 4BRKA 5AQXA 4XH5A 1NM1A 1P8ZA 4RWTA 4FOEA 2P9IB 3RSEA 2IVNA 1K8KA 5AQMA 2NRHA 2OANA 3JXUA 4ISFA 3VPZA 1XUPO 1C0FA 2A40A 3WXJA 3D2EB 2ASMA 2J4RA 4WQ4C 2WUSA 3DXMA 1NGEA 4FPBA 1TYQB 2QWQA 2Q97A 1NGAA 4DB3A 4DHYA 2AP1A 4DQ8A 1ATNA 3O6WA 3VGLA 2QWLA 3DWLA 4FWPA 4NB4A 5FPMA 4A61A 1R59O 3H6EA 3D2FA 3SK3A 4BR4A 1NGJA 3CETA 4BRLA 2P9UB 2D0PA 3VF6A 5AQZA 5KPZA 1T44A 3QDKA 4BRCA 4K41A 3SMSA 5BRFA 5I9EB 4BR7A 3WQTA 4Z94A 2FXUA 2W40A 3EKUA 3HM8A 1YAGA 3QBXA 1ZXOA 2FSJA 3VETA 1XC3A 4K42A 4H0OA 1X3MA 5LJVA 4IJNA 5BPMA 5KPTA 3H1QA 2AA4A 2PAVA 3CERA 3UKUA 2V51B 3ULEB 2E1YA 4QS9A 2H3GX 4H0PA 4BRGA 4BG9A 2GWJA 4HTLA 5JLHA 4A2BA 3WQUA 5BRDA 4BGBA 5JLFA 3ZETB 3WEEB 1BDGA 4BRQA 3VESA 4MO5A 3QFUA 1G99A 2YI1A 3U9DA 3WXLA 4A2AA 5AZJA 1ATSA 4WQ4A 1U2VB 3HZ6A 1NGIA 5LY3A 3QICA 3WUHA 4IWVA 2QM1A 2VWBA 3S41A 3CJ7A 1BUPA 2CH5A 1BOTO 1E4FT 3GL1A 1GLEG 4XEIA 5BN8A 1MWKA 2GUPA 2Q1NA 1LCUA 4M7YA 4H5NA 5AQJA 3ZEUB 4E1JA 5LJWA 3MK6A 3VEWA 4B1XB 4BC2A 3AARA 4EIAA 1Q18A 2E2OA 3WT0A 4A62A 1OKJA 3QMLA 5ADXA 3FFKB 2F9WA 3OHRA 2P9KB 4JD2B 5BPLA 3HSCA 5AQTA 2P9NA 5ELZA 3KVGA 2YJFA 2E8AA 4BRFA 2P9SA 1H1VA 2W41A 5AFUH 3MN5A 1QQMA 3H3OB 3M3ZA 4WYBA 4H0XB 5AQHA 4DCHA 3A8YA 3RSEB 3C0BA 4CZJA 5EX5A 4CJ7A 4K25A 1BWFO 4MLHA 4H0YB 4KBOA 5EOYA 5AQLA 1K8KB 2QWOA 5AQWA 4L3QA 4CI6A 4IZ9A 3ATUA 4MLEA 1QQOA 3WXKA 4CBXA 1GLCG 2HOEA 3DXMB 2E2NA 4H0VB 4H0TB 4CZGA 3HTVA 2D0OA 3CJ1A 4F9OA 2Q2RA 2ZF5O 5AQSA 1KAYA 3A5LC 3LM2A 4FO0A 4CD3A 2CGJA 3WXIA 2UYTA 3D2FB 3VEYA 3DAWA 5BPNA 1V4SA 2V7YA 4GY2B 4AM7A 2Q0UA 3BP8A 4BR5A 2GTDA 1HKBA 1NMDA 3SMPA 4H5RA 3VEOA 1RDWX 2A41A 3GOIA 3A5NC 2VCPA 1X3NA 3ATVA 5JICA 3F9MA 2FSKA 4BVOA 3G25A 3VEVA 1HKCA 4LC9B 1NLVA 5FPEA 4CBUA 4IXCA 4MO4A 4BREA 3FLCO 1ATRA 4BRAA 3O8MA 2F9TA 3UKUB 1DEJA 3P4IA 4PL7A 3CIPA 4J8FA 4O5FA 1XQSC 1HLUA 2CGKA 1TUUA 2P9PA 3CJCA 2QWNA 1LOTB 4XH4A 1Z05A 3FE1A 4Y0WA 2YHWA 3ZX3A 3A5MC 2BTFA 2Q31A 3BEXA 5AZJB 2E2PA 5AQOA 5BR9A 1Z6RA 3M6GA 1DKGD 1MWMA 4FWQA 2E1ZA 2GWKA 4BROA 4H5WA 3VF2A 3W0LA 4BR2A 2IVOA 3AY9A 3MN6A 1SQKA 1SZ2A 4EHTA 3LL3A 5AQVA 4C23A 3O08A 4M63C 2DPNA 1RFQA 4B1ZA 1V4TA 4K43A 2E20A 2FSNA 4BQZA 4FWKA 1YVNA 3UE5A 2ITMA 3LDQA 1NGDA 1NBWA 2ZGYA 5AQFA 5F2RA 3CHWA 5FPDA 5FPNA 1X9JA 2I7NA 5AZIA 3AAQA 4CZHA 2YJEA 4B9QA 5AQQA 1KXPA 3FZKA 5KQDA 5AQYA 3R6MA 3D7EO 3AAPA 2P9NB 2A3ZA 3CJAA 1QZ5A 3QB0A 1BA1A 4NO7A 2P9SB 5F0XA 5KQ8A 4FWRA 5KPRA 2V7ZA 3H45C 3VERA 1CZAN 3QFPA 1J6ZA 3O5BA 1BG3A 4EAHD 3EO3A 3IDHA 1IJJA 2GELA 1DGKN 3GDQA 4RTFD 1NGFA 4BVPA 3BUZB 4FWSA 5CE3A 2A42A 1QQNA 1HUXA 3ENOA 3GE1A 2P9LA 1GLFO 3O1WA 3EL2A 4BRDA 1S3XA 5AQNA 3LDNA 3SLCA 5EVZA 4PKIA 3UB5A 2IIRA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4PKGA 1GOAA 2HBJA 3PIOL 1UA0A 4Z4FA 4M3XA 4DQQA 5B8HA 3ZT0A 1SUQA 1LWEA 5EXWA 3VA3A 5KRSA 1WUAA 2ZD1A 3RMDA 1ASVA 3ZX0A 1RILA 1YUWA 2WFBA 2O8EB 3IMXA 1RTIA 4BRNA 1RT4A 3VOVA 3L2QA 4BRHA 3IG1A 3HBTA 1L3UA 5C10A 1FKPA 1QE1A 3VGMA 4BC5A 4B9VA 3AVBA 4HUGA 4JAXA 3UKRA 5CHIA 1NGCA 2D0CA 1NK8A 2KZMA 3G6EN 2HHHK 3PLAA 4EZ6A 5FRNA 4DU3A 3PO5A 4DV2K 3CJBA 3I56N 3CCRN 3ZX2A 4G9ZA 2KHOA 1DT9A 3L6QA 3EKSA 3SQ0A 4CGDA 3LDLA 1JCFA 3D2EA 5HRRA 3MWTA 2O8DA 1BCOA 1TYQA 2XY6A 3RMBA 3GG4A 2D1KA 4QS7A 3SCXA 4JNEA 2CGLA 4NLCA 4XH1A 2ZE2A 4FOIA 1ZBHA 4CZFA 4B1WB 3RTVA 4DQPA 5E26A 3ZT2A 2A6AA 2ZGZA 5EY4A 4IG0A 3AVJA 2HSTA 1I3AA 3K9JA 4E7LA 1W7AA 1HYSA 3RMAA 4FL9A 5HROA 1EWRA 2WTUA 2D5RA 4HUFA 1A5WA 2ITGA 3OJSA 4C8KA 4FPAA 4BRMA 2VWJA 3ULEA 4NYNA 1KC8O 2FBTA 3U3GA 1HKGA 3E9PA 4JHDB 3ZETA 1VSLA 4CJSA 3K5MA 3S3MA 4JKBA 3G4SN 2HF3A 1BCMA 2RN2A 1RBUA 1QSSA 3CQXA 3O4WA 1VRUA 4CIEA 4DR7K 1VQNN 2Z1GA 4JKFA 2G8KA 1NKEA 3LAKA 3IFRA 3VEXA 1MA9B 3SUPA 2FF6A 1M1KO 3DMJA 3CQYA 2B6AA 3ZEUA 3OYGA 4B3SK 4M3UA 3QIPA 3AGRA 1BIZA 1SKRA 1W2BM 4DR5K 3HO1A 3V9ZA 2Z1JA 1NJXA 4YHHK 3AVFA 1S1XA 4HHTA 3IS9A 2QK9A 1Q81O 1HPMA 3U9ZA 5LMNK 4YOTA 1NJIO 2OCEA 4QS8A 3P38A 1YF5L 4FXDA 1NM1A 4DR6K 4C8MA 1OH5A 4DS4A 1RT7A 5C24A 5C12A 1ASUA 3RSEA 2HMIA 3PY8A 4M42A 2HHQA 4JKHA 1K8KA 3CFRA 4DR1K 2HHIA 2A40A 2I5JA 4CCHA 2J4RA 4WQ4C 3EY1A 3HP6A 4EZ9A 4IKFA 3PSIA 2AP1A 4DQ8A 1ATNA 3O6WA 1E3MA 4FVMA 4NB4A 5FPMA 3H6EA 3D2FA 1VK0A 4AHCA 5I42A 4BRLA 1J5EK 1HNZK 2P9UB 3HOSA 3T3FA 1SL2A 4DFKA 5KPZA 4ELVA 4K41A 4CEQA 3ZT1A 1X9SA 5BRFA 3MX2A 2NRZA 4BR7A 3T1HK 2W40A 3AA5X 3KK1A 1NK4A 3DLKA 4NCGA 3OYLA 1JXEA 4IJNA 1CXQA 3KJVA 1FW6A 2PYJA 1YJ9N 3S5TA 3UKUA 2PAVA 3CERA 4QS9A 2NRTA 4BE2A 4H0PA 4OJRA 3VA0A 2Z1IA 2GWJA 4I2QA 1GOCA 4BGBA 1C1AA 2EHGA 3AVKA 3AVMA 5JLFA 4MO5A 4CK3A 3SQ4A 3CCMN 1VQ4N 3VQPA 5LL6Z 4Q0BA 4E7JA 1U48A 4CE9A 3LAMA 3KKRA 1ATSA 4FCYA 2VG5A 4M41A 3WUHA 4IWVA 2WOMA 2VWBA 3S41A 3OTOK 3S3OA 1ZBFA 1E4FT 2YKMA 3NHGA 5BN8A 4LY7A 2GUIA 5M1KA 2FC0A 4B1XB 4FK0A 2E6LA 1Q18A 3OS2A 3CQ8A 3SUOA 3L2RA 1FJGK 1NK9A 4BE1A 1EXQA 4DG1A 2W6KA 1NMNA 1TK0A 2YJFA 1ILYA 1JLEA 3DOKA 3MN5A 4HUEA 3KIOA 3H3OB 3ALYA 1HRHA 2ZJRL 3OYBA 4CJPA 3O9UA 4CJ7A 1WSEA 4KBOA 5AQLA 1W9HA 5AQWA 1BI4A 3QEXA 3HT3A 4FLUA 1Y97A 4O55A 1DLOA 1JLGA 4CBXA 3J7YP 3AVLA 3DXMB 4H0VB 1YTAA 3J81O 1JXBA 1KVAA 3HRGA 4F9OA 4AHUA 4MDBA 4ELUA 3CYGA 5AQSA 4FO0A 1LW2A 4FLZA 2CGJA 4DTRA 4E3SA 2FBVA 2UYTA 3VEYA 3SPYA 2G8VA 3DAWA 1OVQA 2BGGA 4B8AB 3BP8A 3QEWA 2GTDA 1HKBA 3VEOA 4H5RA 3ZCMA 3T19A 3I8DA 1RT1A 1NU0A 1N32K 2UXCK 4LFCK 2FSKA 3G25A 4R79A 4E72A 2O8BB 4LC9B 4FM2A 1NLVA 5GIPA 4MO4A 4BREA 3TSQA 4BRAA 2RF2A 1XNQK 2F9TA 1HNWK 3QNNA 4PL7A 3CIPA 3CYMA 3KK2A 1RBVA 4DS5A 2P9PA 3CJCA 4KKOA 3SAFA 1IKVA 5GAGP 3A5MC 4PHTX 1WAFA 5AZJB 1RT6A 2E2PA 4F2SA 5BR9A 4FJIA 4FJMA 4B9TA 4WFBL 4CF2A 4BROA 3AY9A 2G8WA 3MN6A 4I9QA 3F2KA 4KB0A 5FRMA 3HVRA 2PY5A 3O08A 2DPNA 1V4TA 5AJ3K 1X1PA 3TTCA 3NH0A 4KH5A 5M1OA 3VQBA 1WBDA 4JI1K 4KTWA 5AQFA 5F2RA 4KI4A 4WF9L 5GAEP 3AAQA 1KRPA 4K8ZA 1O1WA 2XHBA 3I55N 2JWKA 3FZKA 3R6MA 3D7EO 3VMFB 2UUCK 1G15A 2IGIA 2VQEK 4NO7A 1D5AA 4IEIA 1JLQA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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