3WEEB

Structure of the full-length yeast arp7-arp9 heterodimer
Total Genus 113
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
113
sequence length
465
structure length
409
Chain Sequence
NRKVVIHNGSHRTVAGFSNVELPQIIPSSYIKRTDEGGEAEFIFGTYNMIDAAAEKRNGDEVYTLVDSQGLPYNWDALEMQWRYLYDTQLKVSPEELPLVITMPATNGKPDMAILERYYELAFDKLNVPVFQIVIEPLAIALSMGKSSAFVIDIGASGCNVTPIIDGIVVKNAVVRSKFGGDFLDFQVHERLAPLIKEKRSTDVWYEASTWIQQFKSTMLQVSEKDLFELERYYKEQADIYAKQQTGSPNNPLVQKKNFLFKPLNKTLTLDLKEYQFAEYLFKPQLISDKFSPEDGLGPLMAKSVKKAGASINSMKANTSSPEQVYSLLLTNVIITGSTSLIEGMEQRIIKELSIRFPQYKLTTFANQVMMDRKIQGWLGALTMANLPSWSLGKWYSKEDYETLKRDRK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transcription regulator
molecule keywords Actin-like protein ARP9
publication title Structure of the full-length yeast Arp7-Arp9 heterodimer
doi rcsb
source organism Saccharomyces cerevisiae
total genus 113
structure length 409
sequence length 465
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-07-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3weeB01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3weeB02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3weeB03
1HPMA 2QWOA 1C0GA 2A3ZA 1XUPO 3IMXA 1SAZA 1HKCA 3LDPA 5EOYA 3ULEB 1X3NA 4LC9B 3G25A 3BF3A 4BG8A 2V51B 3DXMB 2YHXA 2Q31A 1H1VA 3D2FA 3KZBA 4K41A 5AZJB 1NMDA 3L0QA 1SZ2A 3CJAA 3H46O 3L4IA 4ISFA 4JD2A 1S22A 2ZF5O 4BRAA 2E2NA 3R8EA 4Y0WA 1Y64A 1EQYA 3JXUA 3LDNA 4CZGA 2D0PA 4B1WB 3ZX2A 4FOIA 1YVNA 3ATUA 3EN9A 4XEIA 4H0XB 1U2VA 4CZEA 2D0OA 4FWPA 5EXWA 4CBXA 1T44A 1NGGA 2FXUA 1NWKA 3A8YA 2ZGZA 1DEJA 1LOTB 2FSNA 4AM6A 5ADXA 3LDOA 3FZLA 1QQOA 4EIAA 4CZMA 3QBXA 3O4WA 4CZKA 3FR0A 3B8AX 3UKUA 4IWVA 3W0LA 1YXQA 3HM8A 2FSKA 3H3OB 3M3ZA 4IZ9A 3EL2A 2CGLA 1J6ZA 3AAQA 4DCHA 3ZX3A 3H1VX 1BWFO 3VEYA 4FO0A 3QFUA 3WEEA 2KHOA 4EAHD 3GE1A 5AQIA 3FFKB 1P8ZA 1BA1A 4K25A 4A61A 2GTDA 2D4WA 5FPEA 3D2EA 3DXKB 4F9OA 5KPRA 5AQRA 2ITMA 1BO5O 3MDQA 3VEXA 4BC2A 4BROA 3D7EO 3QB0A 2P9LB 4B1VA 3WQTA 1TUYA 5AR0A 5KQDA 4RWTA 3WXKA 4BG9A 1GLCG 1T6CA 2OANA 2Q36A 1NGEA 1JCEA 2BTFA 2I7NA 2CGJA 2EWSA 3ULEA 1BOTO 2Q2RA 2YJEA 3ZEUB 2P9UB 5EVZA 2YI1A 4BRHA 4BR2A 3VEWA 5AZJA 1QZ5A 3VGKA 2HF3A 4BRLA 3EKUA 2J4RA 4JAXA 4ISEA 4FWRA 3O5BA 2IVNA 5BPMA 2ASOA 3TU5A 4CD1A 4CBWA 3FLCO 1GLLO 3CERA 3J8AA 2WUSA 1V4SA 3FZMA 4FSVA 1V4TA 5AFUA 3SMSA 5ADXH 1MA9B 5F1XA 3M1FA 3U4LA 3O8MA 5AQUA 3ID8A 4H5WA 2GUPA 3H6EA 5F2RA 2VWBA 3S41A 4BRMA 1E4FT 1U6ZA 3MN9A 2QWQA 5E84A 4XH5A 3FZHA 4MLHA 5LJWA 4IJNA 1MWMA 3RSEB 2P9PB 4L3QA 3LDQA 2CH6A 3C7NB 3CJ9A 5BN8A 4JHDB 1OKJA 3VOVA 2E2QA 4FWLA 5AQOA 2BUPA 5LJVA 1IJJA 2NLXA 2A5XA 3A5NC 3WXLA 4H0VB 4KBOA 5KPZA 3CIPA 1CZAN 2FLOA 3DAWA 4BRQA 3VF2A 3W3DA 4FOEA 5TKYA 1QHAA 3BEXA 3UE5A 2HF4A 4CZIA 4BR9A 2QWLA 1NGCA 1BU6O 4RTFD 1GLJO 2A41A 4FWQA 3MK6A 4O8KA 4H5NA 3WXJA 1KAZA 2GWKA 3SJHA 3LM2A 4PKHA 3O1BA 4BRPA 5BRHA 1ZBSA 2P9SB 4RCHA 1Q18A 3CJ7A 2VYPA 3EKSA 5EX5A 2NRHA 1GLEG 1QZ6A 4CD3A 2E8AA 5AQSA 3BP8A 4A62A 4K42A 3MN5A 4BGBA 5BR9A 3QICA 2P9KB 3GBTA 3I33A 5FPMA 5FPDA 5AZIB 1GLBG 2QWNA 4BRGA 4J8FA 1HKBA 5AQQA 5BRFA 5BPNA 4B9QA 2E1ZA 1NGHA 3ZEUA 4HWIA 4XH1A 1NLVA 1NGDA 3R9PA 3QMLA 3VEZA 3CI5A 3MN7A 4CZLA 4E1JA 2YHYA 4BR7A 1HLUA 5BRDA 5KPTA 2FF3B 3WXIA 2GELA 3AARA 3ZETB 4MLEA 4FWNA 1JCFA 2YJFA 2P9NB 3VPZA 5LY3A 5BPLA 5KQ8A 4BRDA 4M7YA 3VEVA 3VETA 5AQNA 5F0XA 1NGFA 3BF1A 4FWKA 4BQZA 2DPNA 3I8BA 4IO8A 2QW9A 3EO3A 2ZGYA 4FPBA 3SMPA 3OHRA 4BRNA 3D2FB 2QXLA 2P9PA 3RSEA 3VEOA 4B1ZA 1R59O 3A5LC 4QS9A 5AQPA 4BC5A 3L6QA 2IIRA 1S3XA 5JICA 1ATSA 3VGMA 4FWMA 4QS8A 4FWSA 2A40A 3DXMA 4BR5A 4QS7A 4BRIA 1Z05A 4BR4A 3P4IA 4BVOA 1U2VB 4CZJA 4I6MB 1K8KB 3HI0A 4BRFA 3UKRB 2E20A 1RDWX 1TYQB 2Q1NA 2HOEA 1NBWA 4H5VA 3CJCA 4BRKA 2YCHA 3O08A 2QWPA 2ASPA 3VGLA 3HTVA 5BREA 1LCUA 3SK3A 5AQJA 2P9SA 4IXCA 2I7PA 3CQYA 4M63C 5FPNA 2F9TA 4CJ7A 3IDHA 5AQZA 1BDGA 4Z94A 3JS6A 3CETA 1E4GT 2P9KA 3EZWA 1YAGA 5EY4A 1QQNA 4C23A 3M6GA 1SQKA 3MCPA 4WYBA 3WEEB 1Z6RA 5AQKA 4MO5A 4BQLA 1GLAG 3CJBA 5JLHA 2V7ZA 3LDLA 1ZXOA 5JLFA 4IJAA 4BC3A 4O5FA 3U9ZA 3F9MA 1IG8A 3ZETA 2QM1A 4BRCA 1TUUA 5AQLA 2P9NA 3GDQA 3HBTA 5E26A 3H1QA 1BUPA 3DWLA 1T6DA 2W41A 4M7XA 1ESVA 5B8HA 1ATRA 4CZFA 1X9JA 3UB5A 3WUHA 1D4XA 3IFRA 5AQMA 3DXKA 2E1YA 4WQ4A 3CJ1A 1NGAA 3HSCA 5CE3A 2P9LA 4PKGA 1KXPA 4PL7A 3ENOA 2FF6A 1X3MA 3LM9A 2GEMA 2YHWA 4EFHA 3IUCA 1MWKA 4NB4A 4CZHA 2P9IB 2Q97A 2P9UA 3C0BA 2W40A 4H0TB 2AA4A 1HX1A 4PKIA 4GY2B 4I6MA 1K8KA 3KHYA 1BA0A 4WQ5A 1HUXA 3FZKA 3HZ6A 3UKRA 5I9EB 2Q0RA 3ENHA 5AFUH 3VERA 4A2BA 1HJOA 1TYQA 4HTLA 2V52B 3MN6A 4BREA 3GOIA 1G99A 2HMPA 1NGIA 1NGBA 5AQYA 1RFQA 2CH5A 2CGKA 2FSJA 4H5TA 3AY9A 4BVPA 5AQHA 2E2PA 4NO7A 1JCGA 3FGUA 3CQXA 3FE1A 3VF4A 3VENA 3A5OC 1QQMA 4A2AA 3A5MC 3O6WA 5AQWA 2PAVA 5JMVA 1DKGD 2V7YA 2AP1A 4H0YB 1KAYA 4JNEA 3VF6A 4AM7A 1NGJA 2QWRA 4GNIA 4FPAA 1GLFO 4JD2B 3C7NA 5AQGA 3TPQA 2Q0UA 1C0FA 4H0OA 4JHDA 1XC3A 5ELZA 5AQFA 3QDKA 4YDUA 2NZTA 3QFPA 4JN4A 4FWOA 4WQ4C 3O80A 3H45C 1ZC6A 2QWMA 4CI6A 2A42A 1YUWA 2GWJA 4B1YB 4DQ8A 3BUZB 3WQUA 2D1KA 1MDUB 3AAPA 1KAXA 3VESA 3ZX0A 1XQSC 3DJCA 2IVPA 3KVGA 4B1UB 3CHWA 2E88A 3A0IX 4FL9A 3UKUB 2IVOA 3LL3A 4XH4A 4EHUA 3WT0A 4WQ5C 3MMVA 3SLCA 4H5RA 5AQXA 3GG4A 4BC4A 5AQVA 4CBUA 2PBDA 2ZWHA 4B1XB 1WUAA 5AZIA 3U8XA 3H3NO 1RGIA 4EHTA 3O1WA 2F9WA 2H3GX 3ATVA 1HKGA 4BR0A 4DHYA 1BG3A 2ASMA 3QBWA 4DB3A 2UYTA 1NM1A 2A6AA 3FZFA 2P9IA 2VCPA 1DGKN 5BN9A 3U9DA 4BGAA 4MO4A 1GLDG 5AQTA 3R6MA 3GL1A 3D2EB 1WOQA 4K43A 4H03B 4ISGA 1ATNA 4PL8A 4H0PA 4YDUC 2E2OA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1HPMA 4OX9K 2QWOA 3DLLL 1SAZA 4B9SA 4PUOA 3AO5A 3LDPA 4IG0A 3Q7CA 4BG8A 3OYIA 1CXQA 1QS4A 2Q31A 3VTIA 3BDPA 2HHIA 3CFOA 3CJAA 4ISFA 4CF8A 3C6TA 4BRAA 2E2NA 1N36K 4JI6K 4FYDA 3O9QA 3ID6A 4JKAA 3C95A 3JXUA 2HHVA 4CZGA 2D0PA 4B1WB 2HHHK 2G8IA 5HRNA 4H0XB 3F5TA 3SJJA 4CZEA 1X9WA 1T05A 3KLIA 4FWPA 4CBXA 5M1FA 3S3NA 1T44A 2ZM6K 1DEJA 1UA1A 2FSNA 5ADXA 1IBMK 2HMIA 4M3TA 3LPUA 1D5AA 4CJRA 4F2SA 3O4WA 4I9LA 3FR0A 3VQPA 4CK1A 4BE7B 1BIUA 3UIQA 3TAMA 3M3ZA 4TSXA 2CGLA 1J6ZA 3D6RA 2W42A 3AAQA 4GKJK 2HHTA 5AQIA 5GIPA 1VQON 3DLKA 4NLCA 4FW2A 4CK2A 3TABA 5IWAK 4Q0BA 4FJHA 4KV8A 4A61A 2GTDA 3AVFA 3D45A 5FPEA 1HNZK 3HPHA 2WTUA 2ITMA 2PZSA 1BCOA 4IDHA 4BC2A 4CESA 4BROA 1HYSA 2DFHA 3QB0A 3IS9A 5AR0A 5KQDA 1L3SA 3WXKA 1NK4A 4CEDA 3ZSOA 4L8RB 2UXCK 2BTFA 5CZ2A 2ZJPL 2HHQA 3MAQA 4FLUA 1RDUA 1L3TA 3AA5X 1U45A 1FKPA 4CGHA 5M1QA 2P9UB 5HRRA 2HW3A 3IKMA 4HUFA 1QZ5A 3NH0A 4PQUA 3T1AA 3LZJA 2HSTA 1YVUA 1O13A 4FWRA 2RE2A 2ASOA 1B92A 3TU5A 3OA9A 3NGYA 2R7YA 1YJ9N 3CERA 3J8AA 1VQKN 1KFDA 4FSVA 3SMSA 4YY3K 3ID8A 4NYFA 3V1OA 1YI2N 3H6EA 3S41A 5A2QO 4DTSA 4MFBA 1F21A 3MN9A 5E84A 4XH5A 1CXUA 3RTVA 3B6OA 4IJNA 5I3UA 4IFYA 1FKOA 2P9PB 2Z1GA 3RSEB 4B9MA 3EZ5A 3L2VA 4DR6K 4XJXA 3KJVA 5DM6L 3CJ9A 3D0PA 4AQYK 1OKJA 1S72N 1IJJA 1QTMA 3E9LA 1BL3A 3A5NC 3WXLA 3DOLA 1CZAN 4B3OA 3DAWA 1IKXA 4FXDA 5TKYA 3SUQA 1M90O 1T8EA 4Z4IA 3AGKA 2QWLA 1NGCA 4JI1K 1XI1A 4JI2K 1GLJO 4FWQA 3QERA 1W0HA 1BISA 4H5NA 3THYA 4OLBA 3SQ4A 3G6EN 1FW6A 5SZTA 5BRHA 2ZE2A 4M3UA 1RTDA 4DV7K 3THWB 1Q18A 2VYPA 4CJFA 3BP8A 4E0DA 4K42A 4BGBA 3QINA 4CEQA 1XNRK 5FPMA 1DT9A 5KTQA 2QWNA 3NVKA 1IKVA 4FVMA 4DV5K 2Y1IA 4J8FA 1HKBA 4M3ZA 2RF2A 5BPNA 5HRSA 4HWIA 4XH1A 3SQ2A 1Q9XA 2UXDK 4B3MK 4QAGA 3R9PA 4A57A 1LV5A 3MN7A 3TWHA 4CZLA 2Y1JA 1KSPA 1Q82O 5CR4A 1CZ9A 1HNIA 4OGEA 3SYZA 4ID5A 3SQ0A 2D0CA 4O0JA 3VPZA 4CJVA 4BRDA 4M7YA 2VG7A 3VEVA 4CECA 3U6FA 2HB5A 4IO8A 3EO3A 2ZGYA 4LSNA 3PIPL 3D2FB 3RSEA 2P9PA 3LZIA 1R59O 3A5LC 1OH7A 1YT3A 4Y1CA 4IG3A 1S5JA 3KWGA 1S3XA 1RNHA 1EETA 3E9PA 4BE1A 2ZJRL 4CF9A 3CPEA 4FWSA 4N41A 3MEGA 1KFSA 4NCGA 1U2VB 2G8UA 5J2MA 3ZT2A 2IS3A 3BGRA 4C8OA 1RDWX 1TYQB 4DV2K 2JLEA 4H5VA 4H8KA 3N4QA 3O08A 1JJ2M 1J9AA 1LCUA 3ZYYX 5AQJA 3THWA 3RMCA 3CQYA 1K6YA 1E3MA 4CJ7A 4Z94A 3JS6A 4CGDA 1E4GT 1KVCA 3EZWA 2GUIA 3SAFA 2VWKA 3R3LA 2O8DB 1SQKA 2D0BA 4DKWA 1Z6RA 3ULDA 1TK8A 3CJBA 3NAEA 1RT6A 4CEBA 5JLFA 4BC3A 4YOVA 4O5FA 4M41A 3ZLJA 1BGXT 3U9ZA 4JS5A 4JI7K 5HROA 1RBVA 3ZSZA 2D5RA 3KK7A 3HBTA 3AVLA 1RCHA 3OYJA 1NMNA 1TAQA 4M7XA 5LMNK 3MECA 4CZFA 5AJ3K 1N32K 2HBJA 3VTHA 3FFIA 3DXKA 4B8AB 3HSCA 3MX2A 5CE3A 2P9LA 4PKGA 4GMJB 3CCRN 4PL7A 4DR1K 2QK9A 4M42A 2GEMA 1OVQA 3PY8A 2BGGA 1BQNA 4B9LA 3EY1A 4NB4A 3LALA 2Q97A 4H0TB 3OYGA 3WNEA 2X74A 4PKIA 4JI3K 1NOZA 1BA0A 4KHNA 4WQ5A 1HUXA 4DSLA 5I9EB 4A2BA 1TYQA 3EE9A 4HTLA 4CHPA 2O4IA 1I3AA 3ASMA 1G99A 3S3OA 1NGIA 4UY8O 4E89A 3RVCA 2P5OA 3CQXA 3FE1A 3VENA 1N8RO 3A5MC 4IFVA 1J53A 5AQWA 3AVAA 1NOYA 1KAYA 4JNEA 1HRHA 2O8DA 5H1SQ 4AH9A 1C0FA 5AQFA 4YDUA 3NE6A 3V4IA 4CEEA 1KLMA 3QFPA 5GAHP 2G8FA 1OH8A 3K9JA 3H45C 1CLQA 1ZC6A 1XWLA 4Z4FA 3SPZA 3PV8A 4DQ8A 1MDUB 3HVRA 4A5AA 3VESA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 4OPA A;  4CCH A;  4WF9 L;  3OYF A;  4ICL A;  1LWC A;  4NYN A;  5DM7 L;  4MO5 A;  2G8W A;  5KGX A;  3LDL A;  4M3Y A;  1ZXO A;  3ZSQ A;  4IBN A;  3VQQ A;  3V9W A;  3ZET A;  2QM1 A;  3HPO A;  4CEA A;  3I8D A;  1ZBU A;  4DQI A;  4N47 A;  2DFF A;  2E6L A;  3BZK A;  3PO4 A;  5E26 A;  2W6L A;  3H1Q A;  3HPG A;  3NMU A;  1T6D A;  2W41 A;  3TAR A;  4DTU A;  4BWJ A;  3SCX A;  1X9J A;  4KI4 A;  5FLX O;  3M8S A;  2PFU A;  4KRF A;  3PSF A;  3CJ1 A;  1NK8 A;  4GKK K;  1KXP A;  2OPQ A;  3ENO A;  1NK6 A;  3KK2 A;  3QEW A;  4CEZ A;  1U47 A;  3HJF A;  4GV9 A;  4EFH A;  1UOC A;  3LPT A;  1RTJ A;  3ISN C;  4CZH A;  2P9I B;  4JKH A;  1KVA A;  3TAP A;  3C6U A;  2AA4 A;  2FBV A;  4LFA K;  4C8N A;  3O9U A;  2YNI A;  3CM5 A;  4JK9 A;  4DFP A;  4HUG A;  1K8K A;  3KHY A;  3TTD A;  4KHP K;  2AJQ A;  3FZK A;  1DLO A;  3QIP A;  3UKR A;  3DLG A;  3K5N A;  2V52 B;  3MN6 A;  3TI0 A;  4CW7 B;  4DLE A;  4LH4 A;  3PSI A;  2HMP A;  1NGB A;  2UU9 K;  2CGK A;  2FSJ A;  4RW7 A;  1VSK A;  3AY9 A;  4JKE A;  3VQC A;  3O3G A;  2E2P A;  3OYH A;  3FGU A;  1B9D A;  4FCY A;  3NBP A;  1QQM A;  2YX6 A;  4A2A A;  4C1N K;  4CGF A;  4DQP A;  3DRS A;  2RN2 A;  1TGO A;  3F9K A;  1C0U A;  2F8S A;  4FPA A;  4H0O A;  5ELZ A;  1XC3 A;  4FK0 A;  1HYV A;  3JAM O;  4KH5 A;  5CY4 A;  5J2Q A;  3TR8 A;  1RBR A;  1KC8 O;  1HJR A;  4B3R K;  3AV9 A;  4M3W A;  3AVB A;  3VQ6 A;  4CJW A;  2A42 A;  4E1M A;  3TTF A;  4B1Y B;  3WQU A;  2NRZ A;  2BE2 A;  4GW6 A;  1FK9 A;  3AAP A;  4J2B A;  3O3F A;  2QKK A;  3KVG A;  4B1U B;  1NJZ A;  3NF6 A;  4FJL A;  1ASW A;  4XH4 A;  2WON A;  3CMA N;  1LWF A;  1HNW K;  4BEC A;  3MED A;  4CJ3 A;  4BDP A;  2ZWH A;  4B1X B;  1WUA A;  3HM9 A;  2HBM A;  2EX3 A;  4EHT A;  4BR0 A;  1BG3 A;  2ASM A;  3QBW A;  1S6Q A;  2UYT A;  1NM1 A;  4F3T A;  4PWD A;  2P9I A;  2VCP A;  4DMN A;  3CC7 N;  4BGA A;  3V9Z A;  2VGN A;  4ELT A;  4JYA K;  3K9K A;  3AA2 A;  4LF9 K;  3CG7 A;  4DTR A;  3CCJ N;  4PL8 A;  4ISG A;  4RW6 A;  1EX4 A;  1HNV A;  3I56 N;  4QOZ B;  3MXM A;  4DFM A;  4KH4 A;  4JEP A;  4O4G A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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