3WEEB

Structure of the full-length yeast arp7-arp9 heterodimer
Total Genus 113
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
113
sequence length
465
structure length
409
Chain Sequence
NRKVVIHNGSHRTVAGFSNVELPQIIPSSYIKRTDEGGEAEFIFGTYNMIDAAAEKRNGDEVYTLVDSQGLPYNWDALEMQWRYLYDTQLKVSPEELPLVITMPATNGKPDMAILERYYELAFDKLNVPVFQIVIEPLAIALSMGKSSAFVIDIGASGCNVTPIIDGIVVKNAVVRSKFGGDFLDFQVHERLAPLIKEKRSTDVWYEASTWIQQFKSTMLQVSEKDLFELERYYKEQADIYAKQQTGSPNNPLVQKKNFLFKPLNKTLTLDLKEYQFAEYLFKPQLISDKFSPEDGLGPLMAKSVKKAGASINSMKANTSSPEQVYSLLLTNVIITGSTSLIEGMEQRIIKELSIRFPQYKLTTFANQVMMDRKIQGWLGALTMANLPSWSLGKWYSKEDYETLKRDRK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transcription regulator
molecule keywords Actin-like protein ARP9
publication title Structure of the full-length yeast Arp7-Arp9 heterodimer
doi rcsb
source organism Saccharomyces cerevisiae
total genus 113
structure length 409
sequence length 465
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-07-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3weeB01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3weeB02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3weeB03
2AP1A 4CJ7A 1TYQB 2ASPA 3MN5A 3GDQA 1NGBA 2IVPA 3KZBA 3WXIA 4PL7A 2ASOA 4E1JA 3FR0A 3U9ZA 2HMPA 1QZ6A 4RTFD 2QWMA 4BQZA 2H3GX 1SZ2A 4B1ZA 4BC3A 4BRIA 5FPEA 1MWKA 3O1WA 2E1YA 2D1KA 2E1ZA 3P4IA 5AQJA 5AQQA 3CIPA 3IDHA 3TU5A 4CZHA 4H5NA 2P9LB 3QBWA 4H5TA 4WQ4A 4CZIA 3W0LA 5BREA 1E4GT 4H03B 2QWPA 2FSKA 3R9PA 1MWMA 3FE1A 3WEEA 1WUAA 1SQKA 3U4LA 3CQXA 4BR9A 1JCEA 4H5WA 2WUSA 3VF4A 3J8AA 3WQTA 4FPBA 2P9UA 2YHWA 1GLFO 2YJFA 1X3MA 4FL9A 4FPAA 4Y0WA 2V51B 4EHTA 4ISEA 2AA4A 2VCPA 2D0OA 3I8BA 1HKCA 4IJNA 3VF2A 2GWJA 1BA0A 3CJ7A 3VPZA 3HTVA 2HF4A 3KHYA 1ESVA 1V4TA 4H5VA 2VYPA 4PKGA 2ITMA 3WEEB 4Z94A 4B9QA 4FWSA 3L6QA 3MN9A 3H46O 3DWLA 5AQHA 4LC9B 3CJ9A 2A3ZA 1KAYA 5CE3A 3EN9A 4BR4A 2OANA 4MLEA 5AZJA 3VERA 3ENHA 4FWLA 4CD1A 1KXPA 1NLVA 3LDLA 3QBXA 3OHRA 3O80A 4RCHA 2E2PA 3ZX2A 2I7PA 4BRHA 2NLXA 4YDUC 4JAXA 5AQWA 3SLCA 3O5BA 3O8MA 4H0PA 4BREA 1DKGD 3UB5A 2FF3B 1OKJA 1DGKN 3MDQA 4CBWA 3QICA 1HX1A 1QQMA 4DCHA 1JCGA 4MLHA 2P9IB 5FPNA 3O08A 5ADXH 5BPMA 2P9NA 4H5RA 4B1YB 1U6ZA 5BPLA 4AM6A 4FWOA 5AZJB 3SK3A 5BRFA 3M1FA 1BOTO 1XQSC 4BG8A 3ZEUA 3QFUA 2ZWHA 4WQ4C 2E2NA 3VEOA 4MO4A 4PL8A 3HBTA 3UKRB 3R6MA 1BUPA 3CERA 3VEZA 4CBUA 4IJAA 1MA9B 2D4WA 2QWQA 3VENA 5KQ8A 4FOEA 5BPNA 1U2VA 5B8HA 4BC5A 4M63C 1YXQA 4O8KA 1HJOA 3M6GA 4EFHA 5LJVA 3FZLA 3GE1A 3ZEUB 3QB0A 4H0YB 3VOVA 3CJAA 4GNIA 5BN8A 2FSNA 2VWBA 5AQRA 4BR5A 1KAZA 3HI0A 3BUZB 5F1XA 2BUPA 4H0OA 3GL1A 4FOIA 2P9LA 3AY9A 2I7NA 2GEMA 5JLHA 4BRDA 2PAVA 3VEVA 2GUPA 3O6WA 1GLDG 2YJEA 3MMVA 4JD2B 2YHYA 4K25A 2E88A 2ASMA 3EKSA 3G25A 2P9SB 1GLLO 3GBTA 3LDQA 3UKUB 1YAGA 5AQVA 3HM8A 3ULEA 2CGJA 3MN7A 4FWKA 4IWVA 3O1BA 2P9PA 2GWKA 1JCFA 2HOEA 4JHDB 3GOIA 2Q2RA 5BRDA 1C0FA 5AFUH 2QWOA 4BRKA 1NGEA 4FO0A 4DB3A 1T6DA 3A5MC 3WUHA 5AQTA 4K43A 1ZXOA 3IUCA 3BF3A 4KBOA 4HTLA 3LDOA 3UE5A 3AAQA 4H0XB 3ULEB 3WT0A 1X3NA 5BRHA 2P9PB 1H1VA 3A8YA 1EQYA 3D7EO 1GLEG 3CJCA 3A0IX 3L4IA 4WQ5A 2ZF5O 2Q36A 3VETA 4XH4A 5EX5A 3VESA 1SAZA 5AZIB 3H3OB 1QZ5A 4BRNA 3DXKB 3LDPA 4C23A 4BROA 5KPZA 1GLBG 4BGBA 3VGMA 4IZ9A 5ELZA 3EKUA 5F2RA 1X9JA 5AQYA 3VGLA 4BG9A 2P9IA 3D2FB 3DXMA 2E20A 4DHYA 3VEWA 1NGJA 2W41A 3TPQA 2YCHA 2QWLA 3ZX0A 2BTFA 4K42A 3JS6A 3ATVA 5EVZA 1D4XA 4XH1A 4CI6A 1BU6O 3ATUA 3BEXA 2ZGYA 4M7YA 1ATRA 5EXWA 3UKRA 3AARA 5AQPA 5BN9A 1GLJO 3H6EA 3EO3A 3HZ6A 1Z6RA 1BWFO 4I6MB 4B1VA 2V7YA 3H45C 4XH5A 1NWKA 1J6ZA 2F9WA 1CZAN 1IG8A 2D0PA 3MN6A 1QQNA 3DXMB 4BVOA 1GLAG 4EAHD 3A5NC 4IXCA 3C7NB 1BA1A 2EWSA 5AQLA 1NGHA 5E26A 3EL2A 5E84A 2GTDA 4EIAA 3MK6A 3MCPA 4BRCA 5AQFA 4H0TB 5KPTA 4BR0A 4A2AA 4CZMA 2FXUA 2E2QA 4BRGA 1C0GA 3ZX3A 5BR9A 4CZFA 4A62A 4B1UB 5KPRA 2QXLA 1BO5O 5AQNA 4O5FA 1QQOA 3S41A 4WYBA 1HUXA 5EOYA 2Q0UA 1ZBSA 3VGKA 2GELA 5AQOA 4A2BA 4JD2A 2ZGZA 2E2OA 3VEXA 3B8AX 2P9SA 3UKUA 3AAPA 2DPNA 3KVGA 3QFPA 4MO5A 5FPMA 2HF3A 3GG4A 4CBXA 4JHDA 5FPDA 3FLCO 2KHOA 4GY2B 3CI5A 5EY4A 3D2EB 3SMSA 2V52B 1TUYA 2QW9A 3IFRA 1V4SA 1K8KB 2CGKA 4IO8A 1HLUA 4PKHA 3FZHA 2Q97A 2YI1A 3FZKA 5LY3A 4CZGA 4BQLA 4J8FA 3WQUA 4ISFA 2YHXA 3U8XA 1E4FT 2FSJA 1HKBA 3BF1A 3ZETB 2Q1NA 1KAXA 2E8AA 2IVNA 3H1VX 4YDUA 4BR2A 3SMPA 3LM9A 4JN4A 2NZTA 4BRLA 1QHAA 1ATNA 1YVNA 4PKIA 3A5LC 5AZIA 5AQZA 3DXKA 3LL3A 2QWRA 1MDUB 3EZWA 2J4RA 2Q0RA 1HKGA 1S3XA 2IIRA 2FLOA 1NGFA 3WXKA 3CJBA 4CZJA 3D2FA 3FZMA 3QDKA 4BC2A 5TKYA 4BRMA 5KQDA 4B1XB 2IVOA 3RSEA 1GLCG 1NGGA 5AQKA 4RWTA 1NBWA 3CJ1A 1NGIA 5JICA 2Q31A 1BG3A 3VF6A 5AQGA 3WXJA 4NO7A 1RFQA 3U9DA 3L0QA 4F9OA 1ZC6A 4I6MA 5AQMA 4QS7A 1IJJA 5JMVA 5ADXA 3C7NA 3DAWA 2CH6A 4QS8A 2UYTA 3R8EA 1YUWA 3RSEB 3A5OC 1NGAA 3DJCA 3HSCA 3QMLA 4FWNA 1NM1A 1XUPO 3SJHA 4BRPA 2PBDA 3JXUA 1NGDA 3CETA 5AQIA 5JLFA 3VEYA 5AQUA 3LM2A 1RGIA 4EHUA 4FWPA 2V7ZA 1NGCA 2CGLA 3M3ZA 1TUUA 1G99A 3H1QA 1S22A 2P9UB 1BDGA 4CD3A 4FWRA 2F9TA 2NRHA 1Y64A 2CH5A 4M7XA 3FGUA 4CZKA 4BRAA 1HPMA 3ENOA 4FWMA 3H3NO 3CHWA 4BVPA 4L3QA 3BP8A 1RDWX 1WOQA 4BRFA 2P9KA 3W3DA 4BRQA 4B1WB 3C0BA 4K41A 3FZFA 3D2EA 4FWQA 1K8KA 4HWIA 4XEIA 1NMDA 1P8ZA 4AM7A 4DQ8A 3FFKB 4WQ5C 4BC4A 4BR7A 5I9EB 5LJWA 4FSVA 2P9KB 5AQSA 3IMXA 2A5XA 3ZETA 1ATSA 4BGAA 3ID8A 1Z05A 4ISGA 2P9NB 1TYQA 1T6CA 1DEJA 1R59O 1LCUA 2A41A 2A40A 5AFUA 2QWNA 2A42A 1T44A 1Q18A 3LDNA 2W40A 3CQYA 4NB4A 3O4WA 3F9MA 2A6AA 2QM1A 5AQXA 3WXLA 4CZEA 1XC3A 4CZLA 2FF6A 4A61A 1U2VB 5F0XA 4H0VB 4JNEA 4QS9A 5AR0A 1LOTB 3I33A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2HVHA 1TYQB 3V1QA 1UA1A 3RRGA 1NGBA 3KZBA 3C6TA 3S3OA 2O4IA 2ASOA 4CF1A 1G15A 4E1JA 1TKTA 3JAMO 4CF8A 3L8BA 4RTFD 1DTQA 3KD1E 4BQZA 3ZT1A 4RW7A 4B1ZA 3K5NA 2D1KA 3CIPA 4AHUA 3HT3A 3MX2A 3QBWA 2IS3A 2ATQA 4CZIA 3W0LA 2JWKA 4DV2K 3HK2A 4IBNA 2FBTA 2FSKA 4KH4A 3R9PA 2WOMA 3KK2A 3FFIA 1HNVA 1MWMA 1W0HA 3FE1A 4JI3K 1SQKA 3O3HA 3BY5A 4LF4K 3T7ZA 2HNZA 1JCEA 1NJXA 4H5WA 2IGIA 1WSGA 4NYNA 2WUSA 1ZBHA 3VF4A 3EE8A 4FPBA 2P9UA 1IKXA 4FL9A 4EHTA 5HRPA 2BANA 4ISEA 2D0OA 1HKCA 1NJWA 3NH0A 2A1SA 3ZT3A 1EXQA 3IAYA 2HB5A 5K14A 4AILC 4PKGA 4H5VA 4Z94A 4DMNA 4B9QA 1WB9A 2R7YA 3MN9A 2HHQA 1XC9A 2UUBK 5AQHA 4DTSA 4PA1A 4C1NI 3ZSXA 1OH7A 5FDLA 5AZJA 3EE9A 3V9ZA 3AVNA 3IG1A 2P51A 3HPHA 4M3WA 3RMCA 3HXMA 1NLVA 1IBMK 2NUBA 3E1YA 3DRRA 4RCHA 3OYDA 4YDUC 3L4QA 3VMFB 4CVNE 3SLCA 2NRTA 3O8MA 4H0PA 3UB5A 1JLQA 4CBWA 4DU1A 4KH5A 4MDBA 1VQ8N 3DI6A 2E6MA 5GAEP 4PQUA 3QO9A 4U67L 1NK9A 1SS6A 4FYDA 3THYB 3M1FA 5KGWA 3M8PA 4WFNL 2WC9A 4JKEA 4WQ4C 4JYAK 4HCCA 3L2WA 4PL8A 4LH5A 3UKRB 1LV5A 4CEAA 3LP0A 3LANA 4YORA 3PX4A 3V9UA 2QWQA 3VENA 4JI4K 2HNDA 1YXQA 4O8KA 3ZT4A 3THWB 1HJOA 3CD6N 5LJVA 2UU9K 3FZLA 3S5TA 3CJAA 5BN8A 5T7BA 4TSXA 4BE1A 4IO9L 3VQ6A 1WBBA 5F1XA 3DLHA 4RG8A 4KHWA 4DV6K 5JLHA 4CF2A 2PAVA 3SJJA 1N6QA 4CJKA 4IFVA 1U47A 4OGEA 3O6WA 1GLDG 4IDKA 4W5NA 2EHGA 2DTUA 1OVQA 5JVHL 2E88A 4CJEA 3GBTA 3OJUA 3UKUB 5AQVA 3HM8A 4O4GA 3U3GA 2CGJA 4FWKA 4DSLA 3VQAA 2BDPA 2RKIA 3GOIA 2YHBA 3NGIA 4B3RK 4OPKA 4JK9A 4CHZA 4HVJA 1S1WA 3AVLA 1GOAA 3WXMB 1X9WA 1QE1A 2VWKA 1YTAA 4Z4EA 4M45A 3IUCA 3BF3A 4DR5K 3ULEB 2YNFA 1X3NA 2P9PB 4JI5K 1J5EK 1DLOA 3QINA 4FJ8A 3BDPA 1KLMA 3HL8A 1NJIO 1VQON 2ZM6K 2GV9A 3V1RA 4DR6K 3CYGA 3KLHA 1TK8A 1HNWK 3F2KA 4ZTFA 4I9LA 3BZKA 4WF9L 4BGBA 3VGMA 4DU4A 3RVCA 3DOLA 5JS1A 4BG9A 3DXMA 2E20A 3VEWA 3THYA 4CECA 4C8KA 4CJRA 2BTFA 1TKXA 4K42A 3CCEN 1D4XA 4A59A 1Z25A 3ATUA 4Z4HA 3UKRA 4FJIA 4CHYA 1KRPA 1JXEA 3SNNA 5AQPA 3H6EA 5M1NA 3EO3A 3HZ6A 1Z6RA 4KB1A 2VG7A 1J5OA 4DFPA 3H45C 4XH5A 1J6ZA 2OPRA 1IG8A 4E3SA 4W5TA 3THWA 2G8UA 3RRHA 4IXCA 3HP9A 3VQ4A 3KLFA 5AQLA 4GKJK 4KTWA 1S1UA 4Y1CA 3NH2A 3CCLN 4CK2A 3WNGA 4H0TB 2QTDA 2WTUA 4A2AA 4CZMA 2YKNA 4GV6A 2FXUA 1RT4A 1QVFM 5BR9A 2O8EA 1RDUA 1HPZA 5MLCQ 3PV8A 4B1UB 3WNFA 2QXLA 5AQNA 4CJPA 2HHTA 4OKJA 2Q0UA 1XNQK 2GELA 4LSNA 3KWIA 1WSEA 3VEXA 4DG1A 3B8AX 1NKBA 1T05A 3UKUA 4CJWA 4CE9A 3TSQA 1L3TA 4QOZB 5FPMA 4DF4A 5FPDA 4I7FA 3LAKA 3HO1A 2KHOA 3I0RA 5FROA 3CFRA 2PY5A 3D2EB 1VSJA 3O9RA 1RTDA 4KV8A 1TUYA 2QW9A 5M1FA 4KI6A 1K8KB 1RT7A 3S3MA 1U45A 5LY3A 3CFPA 1BCMA 3DLKA 4CZGA 3TI0A 4CIFA 2BE2A 2YHXA 3U8XA 3THVA 1E4FT 1JL1A 2FSJA 3ZETB 2RN2A 2OZMA 3T19A 2E8AA 2IVNA 1A5WA 4CJSA 3HYFA 3SMPA 2LSNA 5LMNK 3IKMA 3V9XA 3VTIA 3PIPL 4A5AA 4B9LA 5AQZA 3LL3A 3CYMA 2GX9A 2O8CB 1S3XA 3SUPA 2IIRA 4B9SA 4KTQA 4DV3K 3L3VA 2C1IA 3P83D 3HRGA 3TANA 3RSEA 1RNHA 4ZHRA 4NXNK 2OPPA 5FRNA 4JS4A 5CHIA 4GW6A 4NO7A 1BIZA 4Z4FA 4EP4A 4KRFA 4H4MA 4BDPA 2KFNA 5AQMA 3ZSOA 4JKFA 4B08A 1DTTA 4OO1J 3D0PA 4OGCA 2HBMA 3QIOA 2UYTA 2HHXA 1QTMA 4B9VA 4YY3K 1NM1A 4CFBA 1C0MA 1NGDA 5AQIA 3CPWM 4M3YA 4CJ4A 3VEYA 1ASVA 5AQUA 2V7ZA 3CG7A 1S1XA 4CERA 1S22A 1BDGA 1Q81O 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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