4CBXA

Crystal structure of plasmodium berghei actin ii
Total Genus 115
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
115
sequence length
369
structure length
358
Chain Sequence
SIALVVDNGSGMVKSGLAGDDAPKCVFPSIIGIPKECYVGDEAQNKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWRHTFFNELRVSPEEHPVLLTEAPLNPKTNREKMTQIMFESFDVPAMYVSIQAILSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHTVPIYEGYVLPHAINRTDMAGRDLTYYMMKLFTERGYTFTTTAEREIVRDIKEKLCYIALDYDEELKKSEERTEEVEEMYELPDGNLITVGSERFRCPEALFNPSLIGRECPGLHITAYQSIMKCDIDIRKELYNNIVLSGGTTMYNYIGERLTNEMTSLAPPSMKIKVIAPPERKYSVWIGGSILSSLSTFQKMWITKEEYDESGPSIVHR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural Differences Explain Diverse Functions of Plasmodium Actins.
pubmed doi rcsb
molecule keywords ACTIN-2
molecule tags Motor protein
source organism Plasmodium berghei
total genus 115
structure length 358
sequence length 369
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-10-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4cbxA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4cbxA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 4cbxA03
2NLXA 4J8FA 1S3XA 4PL8A 5AQXA 4EAHD 4PL7A 2QW9A 3RSEB 5BPLA 1H1VA 4CD3A 3CJBA 4PKIA 3CQYA 4BRLA 1T44A 2UYTA 3ZX2A 2A40A 2V7YA 1RGIA 2QM1A 4H0PA 3DWLA 1GLLO 5AQTA 2P9UB 2FSJA 3A0IX 4JHDB 3SLCA 1D4XA 3WEEA 2P9PB 1NGCA 1HKCA 4FWKA 1LCUA 3H3NO 1NGEA 4JD2A 4RCHA 5ELZA 3FR0A 2P9NB 4PKGA 3ULEA 3GG4A 4A2BA 4DB3A 2Q97A 3DXMB 5EX5A 5I9EB 3QDKA 4FO0A 3U9DA 4JAXA 2E88A 2FF6A 4BG8A 4ISEA 4EHUA 4BC3A 4ISGA 3A5OC 4JNEA 4FSVA 2IVPA 2E8AA 3O8MA 5F1XA 2YCHA 3OHRA 3D2EA 4ISFA 1BWFO 5AQIA 1EQYA 3UKUA 3QFPA 5AZIA 1HKGA 5AQMA 4CZGA 1YXQA 4BRQA 3VOVA 4DCHA 1RDWX 3VEYA 3D2FB 3FZHA 1JCEA 4BREA 2A41A 5AQHA 3FLCO 3IMXA 4BR7A 4RWTA 4NB4A 3QBXA 3CIPA 5JLFA 1HLUA 4O5FA 2PAVA 1LOTB 3IUCA 4PKHA 5AQJA 1TYQA 3BUZB 5AQKA 5EOYA 5AQFA 3FZMA 3IFRA 2ZF5O 3BF3A 3IDHA 4WYBA 2D1KA 5AQNA 5KPZA 4H5TA 4BQLA 4CZMA 4CZEA 3VETA 4BC2A 4WQ5C 3FGUA 3MN7A 3VGLA 2QWRA 1DGKN 3GL1A 3VPZA 4BGBA 4CZLA 1X9JA 1WOQA 3QBWA 2GELA 4CJ7A 3VF6A 5KPTA 1MDUB 4BR4A 3HBTA 3DXKB 2E1YA 1NGJA 4DHYA 3FE1A 3ZETA 4CBWA 4L3QA 1ZXOA 3M6GA 3R8EA 4BRPA 4JN4A 5BRFA 3O1WA 2P9KA 1K8KB 2QWLA 1NLVA 4BRMA 5B8HA 3KVGA 5BREA 3SMSA 4CBUA 5BN9A 2AA4A 3BP8A 3MN9A 1Y64A 3VGKA 2HF4A 4CI6A 2H3GX 4BR2A 5AQVA 4XH5A 3R9PA 3I8BA 3MK6A 3H46O 3UKRA 2Q0UA 3ZX3A 1KAYA 3DJCA 4B1WB 5BPNA 3MMVA 1RFQA 5AQGA 3EKSA 2V51B 3SK3A 4BC4A 3VERA 3WXIA 3A8YA 4H5RA 3VEWA 5JMVA 5BPMA 3QMLA 1NGIA 4BC5A 4GY2B 1V4TA 2W41A 3CJ9A 2VYPA 4QS9A 2P9LA 1JCFA 2HMPA 2QXLA 3WQTA 3ZX0A 4H0YB 3ULEB 5FPNA 2A42A 4M63C 4LC9B 4BVPA 3ID8A 1HX1A 4BRHA 5AQWA 1ESVA 3HZ6A 2IVNA 4BRIA 2F9TA 3HSCA 2FLOA 1IG8A 4FWOA 3O08A 3MN6A 4O8KA 4BROA 2ASPA 3GBTA 4CBXA 3ATVA 3L6QA 4BRAA 1U2VA 2YHXA 4QS8A 4AM7A 5AZJA 4F9OA 3UKUB 4B1ZA 1X3NA 3I33A 5KQDA 3W0LA 2ZGYA 3C7NA 1MWMA 1BDGA 2YJEA 1E4FT 3ATUA 4A2AA 2Q0RA 2VWBA 3LDOA 4BRNA 2J4RA 4GNIA 4BVOA 2FXUA 5AQQA 4FWPA 1GLDG 2QWNA 5AQOA 1YAGA 2VCPA 5FPMA 1GLEG 3H6EA 3EKUA 1E4GT 4FOIA 1IJJA 5JLHA 5KPRA 1KAZA 4JHDA 1ATRA 4K43A 3U4LA 4M7YA 3LDPA 3M1FA 2P9PA 1NGGA 1HUXA 5KQ8A 5ADXA 3F9MA 2IVOA 2YHYA 3HTVA 2ZWHA 4FWRA 4NO7A 1CZAN 2P9NA 4BR9A 3C0BA 5BRDA 5JICA 5E84A 1JCGA 3U8XA 4WQ5A 2PBDA 5ADXH 3LM2A 3P4IA 2P9IB 2CGKA 3L0QA 2FSKA 3B8AX 3D7EO 3MDQA 3ZETB 3MN5A 4XEIA 4MO5A 4BR0A 3VEXA 2E1ZA 3O4WA 4FWNA 5BRHA 3H1VX 4MLEA 4H0TB 1T6CA 2E20A 3H1QA 4FWMA 3FZFA 1MA9B 3TU5A 3AY9A 4H5NA 4CD1A 4H5WA 2A6AA 5AR0A 3DAWA 1NGDA 1S22A 3UKRB 1Q18A 2E2NA 4I6MB 3W3DA 1Z6RA 3QFUA 4WQ4C 5AQLA 4H0VB 4B9QA 4H03B 1BO5O 1ZBSA 2CH5A 2GWKA 3UE5A 4BRCA 4BQZA 2A3ZA 3BEXA 5CE3A 3LM9A 3A5NC 1BA0A 4M7XA 3WXKA 1NM1A 2QWOA 4XH4A 3U9ZA 2P9SA 3CETA 4MLHA 1KXPA 3WXLA 2FSNA 2ASOA 3FZLA 3LL3A 5BR9A 1J6ZA 3VEVA 1YUWA 1NGFA 2AP1A 2E2OA 3O6WA 5LY3A 5AQYA 4EFHA 2GTDA 3WEEB 4IXCA 5TKYA 4DQ8A 4CZFA 4CZHA 3CJAA 4IZ9A 4BRFA 2D0PA 4QS7A 4Z94A 2BTFA 3GE1A 1KAXA 4HWIA 4JD2B 4MO4A 4AM6A 3VEZA 5FPDA 1GLCG 1U2VB 4Y0WA 1NMDA 3HM8A 5AQPA 4YDUC 1TUUA 5AZJB 4H0OA 3SMPA 3VF4A 3ZEUA 1P8ZA 2BUPA 4A62A 1QQMA 2ZGZA 4IO8A 3C7NB 1C0GA 3CJ7A 4FPAA 4FL9A 4FPBA 4XH1A 4BR5A 5EVZA 3MCPA 1BOTO 1SAZA 4BRDA 3D2EB 3FFKB 3AARA 5AQSA 3WT0A 1R59O 3VENA 5AQRA 3VESA 2HOEA 5AZIB 3AAQA 4B1XB 1BUPA 4FWLA 2ASMA 2Q36A 5F2RA 2E2QA 2A5XA 2QWPA 3G25A 2Q2RA 3UB5A 3LDNA 4HTLA 3RSEA 3GOIA 3CERA 4K42A 4CZJA 3VEOA 5EY4A 4B1VA 4KBOA 1GLJO 2V52B 2NZTA 1BG3A 3JS6A 2YHWA 4K41A 4EIAA 1TYQB 5F0XA 1BU6O 1XQSC 1NWKA 2CGJA 2E2PA 1QQNA 1T6DA 2D4WA 2P9UA 4FWQA 2Q31A 1X3MA 3BF1A 1QZ6A 2CH6A 3EL2A 3CJCA 3QB0A 1MWKA 2FF3B 3TPQA 3H45C 1G99A 4BG9A 2GEMA 3S41A 3A5LC 3J8AA 2V7ZA 3VGMA 3ENHA 3DXMA 2ITMA 4BRGA 3KZBA 1HKBA 4FOEA 3AAPA 1DKGD 2GWJA 4RTFD 2HF3A 5E26A 3HI0A 3R6MA 2WUSA 2CGLA 4CZKA 5AQZA 2P9KB 2YI1A 1YVNA 4BGAA 1ZC6A 2OANA 2YJFA 1ATNA 2QWMA 2Q1NA 4WQ4A 4A61A 1HPMA 2I7PA 4IJAA 4IJNA 1XC3A 3A5MC 4C23A 2GUPA 1OKJA 5AQUA 4EHTA 5AFUA 5LJWA 3WUHA 5EXWA 3D2FA 4H0XB 2P9SB 2F9WA 1DEJA 3EN9A 2I7NA 3ENOA 1XUPO 3EO3A 3KHYA 5AFUH 4B1UB 5LJVA 4IWVA 2KHOA 1Z05A 1C0FA 3O80A 2QWQA 1V4SA 4H5VA 3WQUA 2W40A 2P9IA 1SZ2A 3H3OB 4K25A 2P9LB 3O1BA 1NBWA 4E1JA 1NGHA 3LDLA 3CHWA 1WUAA 3GDQA 3EZWA 5BN8A 3CQXA 4BRKA 3ZEUB 1QZ5A 1HJOA 1BA1A 2IIRA 3VF2A 3FZKA 3LDQA 1TUYA 1U6ZA 2DPNA 3L4IA 3O5BA 4FWSA 1ATSA 3CJ1A 3DXKA 4YDUA 1GLBG 3QICA 4B1YB 3SJHA 3WXJA 1GLFO 3JXUA 3CI5A 4I6MA 1QQOA 2NRHA 1NGBA 1K8KA 1NGAA 1QHAA 4CZIA 3M3ZA 2EWSA 1GLAG 1SQKA 5FPEA 2D0OA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4YOXA 4PL8A 3CXCM 2I5JA 1JLAA 1VQ9N 2QW9A 1TKDA 5C24A 1JLBA 4HCCA 4PKIA 3CQYA 5C2DA 1T44A 1VSKA 2KFNA 1ILYA 4DQPA 4JKDA 4GW6A 3BZCA 5DM7L 1W2BM 1NGCA 4FWKA 3PX4A 3T19A 1LCUA 4OKEA 3H3NO 1NGEA 2HNYA 1RBTA 3FR0A 1EWRA 1NU0A 3AVCA 4JI6K 1LW0A 4JAXA 3EE8A 4IOXA 4WF9L 2A1RA 4JKFA 1Q82O 4YNQA 4JI5K 4J2EA 4FJKA 4CJ4A 3OHRA 1CLQA 4OPAA 3AA4A 3SUQA 3VQCA 4CGJA 4AHRA 1HKGA 4FXDA 4CEOA 1YXQA 2QEXN 1C0TA 3DOKA 1JXEA 3VEYA 2R7YA 5C2FA 3DM2A 3HL8A 1TK8A 3V1RA 4LFBK 3CCUN 1ASWA 3S3OA 3L3VA 3RMCA 3RRGA 3CIPA 5JLFA 4AHSA 3IUCA 2GUIA 1A5XA 2G8FA 3ULDA 1RDUA 3FZMA 5M1FA 4WYBA 3O9SA 4JRQA 1KVAA 1KCFA 1YITN 3HOTA 3QO9A 3OVNA 3JYTA 4BGBA 3GL1A 4GKKK 1K6YA 3BZKA 3RMBA 3VF6A 1HYSA 4BR4A 5HP1A 1HYVA 4B9SA 3ALYA 1NGJA 3FE1A 3O3HA 3QETA 4I9QA 4CBWA 2RE2A 5BRFA 4FVMA 3HM9A 3SI6A 1HJRA 2Y1IA 1NLVA 5J2QA 5BREA 3TSQA 1IV0A 1BQNA 3J80O 4DF8A 3ZT3A 2E5LK 1Q8IA 4JKGB 4OO1J 1J9AA 1TAQA 4FJIA 1NOYA 2Y1JA 2H3GX 5AQVA 4IEIA 3F5TA 3MK6A 3H46O 3UKRA 1S72N 2BGGA 4DFPA 3ZX3A 5HOOA 3D0PA 4B1WB 4FM0A 2YV0X 1YJ9N 5BPNA 1I94K 2V51B 2GV9A 3WXIA 2KFZA 2HBMA 5JMVA 1OH7A 3VQ4A 4DLGA 2VYPA 4QS9A 4JK8A 4CHNA 2P9LA 4B9VA 3ULEB 5GAGP 4JI0K 4F8RA 1GOCA 3AVFA 4CIEA 2AJQA 1ESVA 4HCBA 4ELVA 3NGIA 2W6KA 3HSCA 4O8KA 3KLIA 4CFDA 1RCHA 2JWLA 3UKUB 4B1ZA 3LP2A 1RDDA 3C7NA 3OA9A 1RTDA 2YJEA 1E4FT 2Q0RA 4AF1A 1JJ2M 2X6SA 4BRNA 3OTOK 4CJSA 1RT1A 4GNIA 5C0YA 5GINA 2FXUA 5AQQA 1NK0A 4CK1A 2QWNA 4B9NA 1EO1A 5GIOA 3MEEA 3E66A 3M8SA 4DSFA 4DTPA 3HOSA 2ATQA 3NDKA 4OGEA 3H6EA 3EKUA 5KPRA 1KAZA 4K43A 3OYEA 4WFNL 2P9PA 1NGGA 4ILGB 4DFMA 3UIQA 2O8CB 2HB5A 3HTVA 2ZWHA 1S1XA 2XY6A 4NO7A 3EE9A 4MDAA 1VQON 3SCXA 2F96A 1QHTA 3LM2A 3P4IA 3O9QA 4IFYA 2PZSA 3D7EO 2JGUA 3G10A 3MN5A 1NKCA 2UXBK 5SZTA 4JI3K 5GAEP 3KK2A 4QAGA 4BR0A 4OLAA 3V9ZA 5HRRA 2PYJA 2DFHA 2E20A 3DLKA 4KTWA 4FWMA 1C1BA 5K14A 3D6RA 5HBMA 1MA9B 1K73O 4CJUA 1SV5A 4H5NA 3J7AP 5AR0A 3DAWA 1Q18A 4LH4A 4RW6A 2E2NA 1E3MA 3T69A 1Z6RA 4DSIA 2F8TA 4CGDA 4H03B 1SKWA 4H4MA 3D45A 4BEBA 2RF2A 3THXB 2GWKA 3UE5A 3TSUA 1QVGM 3I8DA 3NE6A 4FJHA 4B8AB 3MXJA 3CC4N 3MX5A 1QS4A 3U9ZA 4E7IA 3WXLA 4N5SA 1RT2A 4K8ZA 3VEVA 1VHXA 3O6WA 1NGFA 4JV5K 1XMOK 3WNGA 4CJLA 5JS1A 3KWGA 3ZLJA 3C6UA 4IXCA 3P83D 2D0PA 5C10A 3KLGA 3I56N 2KQ2A 4O8UA 3LZIA 1Q7YO 4DR3K 1GLCG 3RMAA 4AHCA 5AZJB 1NMDA 1TUUA 3ZEUA 4H0OA 4FK0A 1YF5L 2BUPA 3NH2A 2ZGZA 4JI8K 4FL9A 4DUZK 4FPBA 4AILC 1VQ6N 1VSMA 3AARA 4CESA 4FZYA 5AQSA 4GKJK 3VENA 1D5AA 3OBWA 3R3LA 5AZIB 3AAQA 4IDKA 1EP4A 2ASMA 3O3FA 2WFBA 1W9HA 3JSMA 3CPEA 3GOIA 4X62K 3DRRA 3N4PA 4M3TA 3QERA 5HL7L 5EY4A 1HR0K 1GLJO 3V4IA 2YHWA 5AJ3K 3QNNA 3ZT1A 5F0XA 4ICLA 1I3AA 2CGJA 1KQSM 4M41A 3ZCMA 1QQNA 2O8BA 2QI2A 3J7YP 2Q31A 1X3MA 3G6EN 1QZ6A 5JVGL 4CW7B 3CJCA 3QB0A 2OZMA 2FF3B 1G99A 2YHBA 3ZSYA 4FJ8A 3S41A 3KD5E 3KKSA 4IKFA 3ENHA 4NYFA 3THWB 3DXMA 4GV6A 3C6HA 3KZBA 2OZSA 3AAPA 2GWJA 4RTFD 1XHXA 3V1QA 1WSFA 2HF3A 4OPKA 4FW1A 3NBPA 4LFAK 4CZKA 3MCAB 5AQZA 2P9KB 1L3UA 4IFVA 5J2MA 4Q0BA 4FLUA 1ZC6A 2YJFA 1XI1A 4TSXA 2Q1NA 3OYJA 1HPMA 3HP6A 4IJAA 1XC3A 3A5MC 4FYDA 4DF4A 1OKJA 4EHTA 3LAMA 3RTVA 3LPUA 4ILHA 3LZJA 1IBKK 2F9WA 3VQQA 4FZZA 3RR7A 4B1UB 5LJVA 1XC9A 2QWQA 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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