4CZEA

C. crescentus mreb, double filament, empty
Total Genus 97
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
97
sequence length
324
structure length
321
Chain Sequence
SNDIAIDLGTANTLIYQKGKGIVLNEPSVVALRNVGGRKVVHAVGIEAKQMLGRTPGHMEAIRPMRDGVIADFEVAEEMIKYFIRKVHNRKGFVNPKVIVCVPSGATAVERRAINDSCLNAGARRVGLIDEPMAAAIGAGLPIHEPTGSMVVDIGGGTTEVAVLSLSGIVYSRSVRVGGDKMDEAIISYMRRHHNLLIGETTAERIKKEIGTARAPEGLSIDVKGRDLMQGVPREVRISEKQAADALAEPVGQIVEAVKVALEATPPELASDIADKGIMLTGGGALLRGLDAEIRDHTGLPVTVADDPLSCVALGCGKVLE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Bacterial Actin Mreb Forms Antiparallel Double Filaments.
pubmed doi rcsb
molecule keywords ROD SHAPE-DETERMINING PROTEIN MREB
molecule tags Structural protein
source organism Caulobacter vibrioides
total genus 97
structure length 321
sequence length 324
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-04-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF06723 MreB_Mbl MreB/Mbl protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4czeA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4czeA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 4czeA03
1YAGA 2E20A 3O1BA 1V4TA 2BUPA 4H03B 2PAVA 1SQKA 1BOTO 2E2OA 4CI6A 3HBTA 2W40A 3DJCA 1IG8A 3IMXA 4BC4A 5B8HA 5F2RA 3VEVA 5KQ8A 3VEZA 1GLLO 4L3QA 1HKBA 2FSKA 2QW9A 4ISFA 4BR5A 4HTLA 1QZ5A 2V51B 2P9SA 4I6MA 4DHYA 4WQ5C 4WQ5A 4H0PA 3UE5A 4CZIA 5KPTA 3SLCA 3TU5A 4CZKA 2A6AA 2QWQA 3ULEA 3MDQA 2Q0UA 4DCHA 2NLXA 3L0QA 1K8KA 3MN9A 3WEEB 4BRPA 5E26A 3ZX0A 4BQZA 3AARA 4FWKA 1U2VA 1NGJA 2YHXA 1XQSC 4CZLA 2P9LB 1MA9B 4CD1A 1ZC6A 1GLEG 1GLAG 3HZ6A 5AQNA 5LY3A 4I6MB 2FSNA 4BR9A 3ATUA 1JCFA 4HWIA 4PKHA 4BRKA 3KHYA 1TYQA 4BRLA 1MWMA 4EFHA 2PBDA 1IJJA 4PKIA 3FLCO 2HOEA 4FWQA 2A40A 3CJCA 3ZX2A 1NGBA 4FO0A 4H0YB 3VEXA 2VWBA 4CZGA 4DB3A 3BF3A 4CZMA 5AFUH 4BRAA 5BN8A 1LOTB 3CHWA 5AQIA 3M1FA 3CJAA 3EL2A 5AQWA 3D2FA 5FPMA 1NGAA 4FWSA 2I7NA 5JICA 1NGFA 3GL1A 5AQYA 4BRDA 2VCPA 3GDQA 1Y64A 4JNEA 5AQTA 5AQLA 1P8ZA 1X3NA 2E2NA 3MN7A 1X9JA 1HUXA 1QQOA 4IO8A 3H3OB 2Q1NA 1D4XA 2P9PA 1NGDA 2P9IA 1MDUB 4MLEA 4A61A 4A2BA 4FWOA 4IZ9A 3D2FB 2HF3A 4H0OA 1LCUA 3DXKA 4O5FA 5AFUA 3FR0A 2D0PA 3H46O 1RFQA 4FPBA 5AQKA 2P9NB 2YI1A 3EO3A 2IIRA 1DGKN 3W3DA 3VENA 3QFPA 3ENHA 2ZWHA 5AQFA 3ZETB 2A5XA 4BQLA 3VETA 5F1XA 4RWTA 1OKJA 2P9PB 2D1KA 2YJEA 3FE1A 4E1JA 1WUAA 2ASMA 4K42A 1DEJA 1BWFO 1YXQA 4EHUA 1ATRA 2CGKA 4B1WB 4GY2B 4ISGA 1TUYA 2ZF5O 1J6ZA 1HPMA 2IVOA 3CJ9A 3SK3A 1RGIA 2V7YA 3DAWA 1SAZA 3AY9A 4FWMA 5AQXA 3EN9A 4H0XB 4ISEA 4BRCA 2QWRA 3WXKA 3FGUA 1NWKA 4FWRA 1KXPA 3W0LA 4Y0WA 1BA1A 5EOYA 3TPQA 3BP8A 2E1YA 3U8XA 3FZMA 4BVPA 2V7ZA 3B8AX 3U4LA 3VEOA 4FWLA 4A2AA 4BR4A 3MN6A 3H1QA 4LC9B 4XH4A 3WEEA 3CJ7A 2Q0RA 1NGCA 3MN5A 3O8MA 3VEWA 4H5TA 2P9LA 4BRFA 5AZIB 2CH6A 1C0FA 3LM2A 4BG9A 2D4WA 4IJNA 1T6CA 1NGEA 4CBXA 4H5WA 2A42A 5EVZA 5LJWA 3R9PA 4CZJA 5JMVA 4BROA 2GWJA 3WQTA 4BC3A 1EQYA 3J8AA 4BC5A 5LJVA 1ATSA 2GUPA 2GEMA 4B1YB 5BRDA 4MO4A 4FL9A 3M6GA 3WQUA 4K43A 3H6EA 2FLOA 2EWSA 4BR2A 1BDGA 3UKRB 3L6QA 1MWKA 1RDWX 2A3ZA 2QWLA 3SJHA 1JCGA 2AA4A 3JXUA 3EKUA 2Q36A 1GLFO 3VGMA 5ADXH 4AM6A 3QBWA 4BRGA 3QICA 1S3XA 4RCHA 2P9UB 3FZFA 5BREA 1HKGA 2Q31A 2IVNA 3O1WA 3GG4A 4MO5A 5AQPA 5AR0A 4FOIA 5CE3A 3D2EB 1ATNA 1BG3A 1GLCG 3CI5A 4PL8A 4WYBA 1XC3A 2AP1A 2P9NA 4GNIA 3EKSA 4B1VA 2I7PA 3I33A 1QHAA 3HTVA 1E4FT 5ELZA 3LL3A 3ZETA 4JN4A 5AQQA 4RTFD 4JHDB 5AQVA 1NGHA 2YCHA 3O4WA 3ZX3A 1GLDG 5ADXA 5I9EB 3A5LC 3MMVA 5KQDA 3S41A 3DXMB 2QWPA 3RSEA 4XH1A 1C0GA 1NGGA 4H0VB 5FPNA 1BU6O 3QB0A 3H3NO 1U6ZA 2BTFA 3WXLA 5FPDA 3FZKA 3ATVA 4QS9A 5JLHA 4QS7A 3HM8A 2YJFA 3DWLA 1HJOA 1KAZA 3WT0A 2HF4A 3JS6A 3IDHA 4EIAA 4KBOA 2Q97A 1QQMA 1NMDA 3VPZA 1TUUA 2H3GX 5BPNA 4AM7A 3L4IA 1NM1A 2ITMA 3LDQA 3OHRA 2FXUA 3SMPA 2FF6A 1SZ2A 4CD3A 3QFUA 3RSEB 3MCPA 4PKGA 4BR7A 5AZIA 2F9TA 3VGLA 5KPZA 1X3MA 1S22A 3QMLA 5AQHA 4NO7A 3LDOA 2P9KA 3ZEUA 5JLFA 1BA0A 4JAXA 5AQJA 2ASPA 5BPLA 5AQUA 1ESVA 4BRNA 4O8KA 5BRHA 2E2PA 4BRQA 5EXWA 3CQYA 5F0XA 3EZWA 5AZJB 3A5MC 3A5OC 4H5VA 4K25A 3VF4A 3WXIA 2E88A 4M63C 1KAYA 4JD2B 3UKRA 2P9KB 3ZEUB 5TKYA 3GOIA 4B1UB 4BGAA 1HKCA 3UKUB 4WQ4C 4WQ4A 5KPRA 4BRMA 3A8YA 3C7NB 1ZBSA 4CJ7A 2P9UA 5EX5A 4FWPA 3HSCA 3A0IX 5EY4A 4BRHA 1QQNA 3QBXA 1YVNA 4CZFA 3O80A 3O6WA 3WUHA 2ASOA 1V4SA 3VGKA 3D2EA 4IWVA 2D0OA 2NZTA 3ENOA 4XEIA 4XH5A 2QWNA 5E84A 4BRIA 2ZGYA 4BG8A 4NB4A 5AQOA 3AAQA 2E8AA 4MLHA 2KHOA 3WXJA 4B1ZA 2GELA 1Q18A 3VF2A 3GE1A 4BGBA 4CZHA 5AQMA 2E2QA 3HI0A 2DPNA 4JHDA 4B9QA 3VESA 1XUPO 4EAHD 3IUCA 4H5RA 2QWOA 3KVGA 4H5NA 3O5BA 2GTDA 3CIPA 2P9SB 3GBTA 3U9DA 4A62A 3CJ1A 5AQRA 1CZAN 3DXMA 2CGLA 4M7YA 5AQZA 3VF6A 3UB5A 1ZXOA 2CH5A 4BVOA 3VERA 3G25A 3VEYA 1Z05A 3ULEB 1KAXA 3R8EA 3CJBA 2QM1A 1HLUA 3BF1A 1K8KB 3FFKB 2J4RA 4BC2A 3LDLA 1R59O 4QS8A 2UYTA 2A41A 1U2VB 3FZHA 1NBWA 4B1XB 3SMSA 1JCEA 2F9WA 3LDPA 3D7EO 1GLBG 1WOQA 3R6MA 2W41A 3P4IA 4CBWA 4PL7A 2YHWA 1BUPA 1TYQB 5AQGA 2HMPA 2Q2RA 1QZ6A 2E1ZA 1YUWA 1NLVA 3I8BA 4FOEA 4CZEA 3M3ZA 3IFRA 4YDUC 4YDUA 2YHYA 3O08A 3MK6A 1Z6RA 3U9ZA 5BN9A 3AAPA 4DQ8A 4FSVA 4BREA 1DKGD 1G99A 4K41A 3H1VX 4H0TB 2QXLA 3LDNA 5AZJA 2GWKA 2QWMA 4CBUA 4BR0A 4Z94A 4C23A 5BRFA 3CETA 2WUSA 2FF3B 2IVPA 2V52B 4JD2A 3A5NC 4F9OA 2ZGZA 4FWNA 3ID8A 1NGIA 3VOVA 2P9IB 5BPMA 1HX1A 2FSJA 4IXCA 3C0BA 4M7XA 4EHTA 3CERA 5FPEA 1GLJO 1T44A 4IJAA 3UKUA 4FPAA 3F9MA 5BR9A 2NRHA 3LM9A 4J8FA 3C7NA 3DXKB 3KZBA 3FZLA 2VYPA 2OANA 3H45C 1H1VA 1T6DA 3BEXA 2CGJA 3BUZB 1E4GT 1BO5O 3CQXA 5AQSA 3QDKA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1YAGA 2W00A 3LAKA 1V4TA 3QNOA 1LAWA 3HM9A 3THWB 2BUPA 1WNSA 1BOTO 2E2OA 4FXDA 3TWHA 3PSFA 3HBTA 3L2RA 1IG8A 3AVJA 3O3GA 4BWJA 4KHYA 5IT9O 3EEQA 3NHGA 1FKOA 2P9SA 5I42A 5J2NA 4NLBA 4DHYA 2E6LA 3UE5A 4CZIA 2VQEK 4M3TA 4E7JA 3T1YK 3SLCA 3VA0A 1EWRA 4DLEA 1I3AA 4CVNE 4FJ5A 2QWQA 3MDQA 2Q0UA 3JAMO 3L0QA 4LY7A 3HPHA 3MN9A 4BRPA 3ZX0A 5C42A 3RRGA 3PIPL 1U2VA 1NGJA 2JWLA 2B4JA 3KWIA 3NGZA 3CC4N 1DTTA 1I94K 3AVIA 3THXA 2FSNA 2GUIA 4EZ6A 3ATUA 4CHZA 2QKKA 1YJ9N 3EE9A 3AVGA 4JKEA 1MWMA 5C2FA 4PKIA 4KPYA 4FWQA 3TTCA 3CJCA 4H0YB 4DB3A 1KSPA 2NRWA 5AFUH 4BRAA 3R1XA 5E41A 5AQIA 4O0IA 5CYQA 4IFVA 3VMFB 1VSMA 2I7NA 4DV6K 5JVHL 3ALYA 3S9HA 1NGFA 3GL1A 3VQ7A 3GDQA 1Y64A 1F21A 1X3NA 2IC3A 3OW2M 3AVMA 5GINA 1T7PA 4JI0K 3D6RA 5SZTA 1VQKN 1D5AA 4FK2A 2NRZA 2P9PA 1NGDA 1MDUB 3MXIA 4MLEA 3D2FB 2HF3A 4H0OA 1Q9YA 4O5FA 4JI1K 3QIOA 4GV6A 1CLQA 1RFQA 4FPBA 4KTZA 3KK1A 1YVUA 3QEPA 1DGKN 3SUPA 3ENHA 2ZWHA 2A5XA 4JI8K 4M3YA 3V1RA 5CY4A 4E1JA 1WUAA 1U49A 4OX9K 3CFOA 4OGEA 2PYJA 1ATRA 3VQDA 2CGKA 2OPRA 1NNEA 3QNNA 4Z4HA 3I56N 4DR5K 3MEGA 2D0AA 4FLVA 3L2UA 3CD6N 2IVOA 1NJYA 4LF6K 2IDOA 3SK3A 1RGIA 2BGGA 3NF9A 4BACA 4LFCK 2W6LA 5AQXA 3AVFA 4KHSA 3DMJA 4ISEA 4ID1A 4DS5A 4HTUA 2BE2A 4I9QA 2E6MA 2I5JA 1IO2A 3V9ZA 2JGUA 3BP8A 2V7ZA 1KVCA 2NRRA 4CHYA 3ENBA 2PYLA 3AA5X 4A2AA 1EO1A 4DTNA 3MN6A 4LC9B 5M1OA 3WEEA 3CCMN 1VSDA 2Q0RA 4FJXA 3AGRA 3VA3A 2KZZA 2BDPA 4H5TA 4NXNK 2P9LA 4BRFA 3CXCM 2ATQA 2KTQA 1HNZK 4FW2A 4I7FA 4CEBA 1NGEA 3ASMA 1KD1O 4DSJA 5HL7L 1SL0A 4JI2K 3P31A 4CZJA 1SL1A 4KHWA 2GWJA 3CCVN 4B3MK 3J8AA 4BC5A 5LJVA 3IAYA 4M45A 2GUPA 2GEMA 5BRDA 4MO4A 2O4GA 3VQ5A 4HUGA 1NK6A 3SAHA 3OYHA 3WQUA 1W97L 5C25A 4JKHA 3H6EA 3AVAA 4KO0A 5BR8K 4OJRA 3NH0A 1BDGA 5KRSA 1MWKA 1RDWX 1VQ4N 4BE7B 3AV9A 3VQBA 1VHXA 1JCGA 2Q36A 4OGCA 4Y1DA 5GADP 2XY7A 1WSJA 3QICA 1HYZA 3O1WA 3GG4A 5AR0A 3MEEA 4FW1A 3E1YA 2HHIA 3WNGA 4GW6A 4PL8A 3U3YA 4ILGB 3DLKA 1X9WA 2O8EB 4DLGA 4GNIA 4B1VA 1KQSM 1QHAA 4CW7B 4FJMA 1BI4B 1WSFA 3O9TA 5ELZA 1L3VA 1LWEA 3NCIA 4NCBA 3G10A 3KKRA 4JKGB 4RTFD 4JHDB 4DKWA 5AQVA 2EX3A 3ZX3A 2P5GA 1GLDG 1J9AA 3ITHA 3QO9A 1SL2A 1KFDA 3AVLA 2O8BA 3DXMB 3RSEA 4XH1A 4DQRA 3TAGA 4H0VB 4OLBA 1BU6O 1IKWA 4BY9C 1U6ZA 1S1UA 2HBMA 5FPDA 3FZKA 4KRFA 3HM8A 1YTAA 3HOSA 3BDPA 3TAPA 2RN2A 4CJWA 4EIAA 2WTUA 4JKDA 3AA2A 3VPZA 2ZD1A 5BPNA 3V4IA 1K9MO 5DM6L 3SMPA 4PQUA 2FF6A 1SZ2A 3QFUA 1YTUA 4JS4A 1WSGA 3VGLA 2F9TA 4CGJA 3J81O 1S22A 5AQHA 2P9KA 3ZEUA 1HYSA 1T05A 4AHSA 2HHTA 1BHLA 4B3SK 4ELTA 1QHTA 2ASPA 2OTJN 5AQUA 3O4QA 1BQMA 5CR4A 3ZT3A 3IS9A 4BRNA 2YV0X 2E2PA 3CQYA 2HHVA 5F0XA 1LW2A 5AZJB 3AA4A 4RW4A 3E9LA 3L2QA 3HJFA 2HNDA 4DSFA 4DTSA 3CM5A 1UAXA 3GOIA 3OTOK 1M90O 4BGAA 3PX4A 4WQ4C 4WQ4A 1L5UA 3AO3A 4B3RK 2F7TA 4AQYK 3BZKA 4FWPA 2VWKA 1NKCA 1QQNA 3Q7CA 2B5JA 1YVNA 3PX6A 3WNEA 2IGIA 1V4SA 2LSNA 4IWVA 2D0OA 2NZTA 4N5SA 4NCGA 4XH5A 2ZGYA 2BANA 3MXJA 3AAQA 4E7IA 3SCXA 5FROA 3OYDA 1SS6A 4B1ZA 1NU0A 1Q18A 3VF2A 3GE1A 3KLHA 4WFBL 3V9UA 3THVA 1D9DA 1ITGA 3N4PA 3IUCA 4AH9A 5M1QA 2OA8A 2GTDA 3GBTA 3NBPA 4TSXA 3U9DA 4Z0UA 4B8CA 3CJ1A 5AQRA 1CZAN 2CGLA 3PX0A 4GKJK 3VF6A 1QSLA 3P1GA 2PZSA 4CJ3A 4H8KA 3OYCA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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