4CZFA

C. crescentus mreb, single filament, adp
Total Genus 105

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
105
sequence length
337
structure length
329
Chain Sequence
ISNDIAIDLGTANTLIYQKGKGIVLNEPSVVALRNKVVHAVGIEAKQMLGRTPGHMEAIRPMRDGVIADFEVAEEMIKYFIRKVHNRKGSGNPKVIVCVPSGATAVERRAINDSCLNAGARRVGLIDEPMAAAIGAGLPIHEPTGSMVVDIGGGTTEVAVLSLSGIVYSRSVRVGGDKMDEAIISYMRRHHNLLIGETTAERIKKEIGTARAPGLSIDVKGRDLMQGVPREVRISEKQAADALAEPVGQIVEAVKVALEATPPELASDIADKGIMLTGGGALLRGLDAEIRDHTGLPVTVADDPLSCVALGCGKVLEHPKWMKGVLEST
5010015020025030030025020015010050
020406080100Genus Matrix

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
EMPTYTI1 (18-21)AH1 (55-60)TII1 (26-29)AH2 (82-96)TIV7 (317-320)TIV2 (41-48)S3 (30-36)O1 (36-38)AH5 (188-203)TII2 (60-63)S11 (177-184)S6 (68-71)TII3 (65-68)S7 (106-111)AH3 (117-130)TI2 (72-75)TVIII1 (79-82)TIV5 (75-78)TI4 (98-101)TI5 (112-115)S8 (134-139)AH7 (252-275)AH8 (279-288)TI6 (151-154)TIV6 (173-176)S10 (168-174)AH6 (209-219)S15 (290-293)S13 (232-239)TI9 (240-243)S14 (245-251)3H1 (295-298)TII4 (299-302)AH9 (302-310)S16 (314-316)AH10 (322-333)TI10 (319-322)S1 (13-17)S2 (21-26)S4 (39-42)S5 (49-53)TI3 (74-77)TVIII2 (132-135)AH4 (140-148)TI7 (164-167)S9 (158-163)S12 (205-206)TI8 (239-242)Updating...
connected with : NaN
molecule tags Structural protein
source organism Caulobacter vibrioides
publication title Bacterial Actin Mreb Forms Antiparallel Double Filaments.
pubmed doi rcsb
molecule keywords ROD SHAPE-DETERMINING PROTEIN MREB
total genus 105
structure length 329
sequence length 337
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-04-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF06723 MreB_Mbl MreB/Mbl protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4czfA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4czfA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 4czfA03
4FWSA 4CZLA 3VERA 3J8AA 2D0OA 1GLFO 1KAZA 3SMSA 2A3ZA 3UKRA 3A5NC 4C23A 5BPNA 4LC9B 2IVOA 4AM7A 2A42A 3CJ1A 3QFPA 1XQSC 3MN6A 4JN4A 4H0YB 2HF4A 2F9TA 2I7NA 3MMVA 2A5XA 4GNIA 3VETA 2HF3A 4BC4A 1HKCA 3HZ6A 1GLEG 5AQTA 2Q2RA 1CZAN 3MN9A 4HTLA 3OHRA 2YHWA 1GLAG 2V52B 3BF3A 1SZ2A 2H3GX 3A0IX 1KAXA 2ITMA 2PAVA 4A2AA 1QQNA 1NBWA 5AQIA 4JD2A 3FGUA 3ATVA 3IFRA 3LL3A 2P9UA 3EO3A 4IWVA 4EFHA 4QS7A 2P9PA 3JS6A 3MN5A 4FWPA 3ZEUB 3L4IA 1GLDG 3WXKA 4XH1A 3KZBA 3D7EO 3ATUA 4BQZA 2Q31A 3HBTA 4BG8A 3MDQA 3D2FB 1OKJA 3QFUA 3SLCA 3EKUA 3HM8A 3B8AX 2ASOA 1JCFA 5LY3A 2NZTA 5BREA 1S3XA 5ELZA 2Q0UA 4H5RA 1NM1A 4FWQA 4FWRA 4WYBA 3RSEA 3O1BA 3ZEUA 3EN9A 4BREA 5F1XA 4BQLA 3ULEB 5LJVA 1NGIA 3A5MC 1TYQA 2ZWHA 5EXWA 4BRGA 5JICA 3H46O 3DXKA 4H0OA 3A5LC 2P9NB 4BGBA 5KPTA 4K42A 3MN7A 3H3NO 4H5WA 2QWNA 2QWLA 4BRCA 1ZC6A 2VWBA 3AY9A 1ESVA 1JCGA 3FR0A 1J6ZA 1NMDA 1D4XA 4FL9A 1HJOA 3BP8A 4FOEA 5EOYA 3A8YA 1Y64A 2Q36A 4RTFD 3WEEB 4K41A 2P9SB 3WXIA 3ULEA 4ISGA 4CD3A 3CJBA 1BA1A 5ADXH 4FWMA 4EHUA 2A40A 5AQJA 3LM9A 2P9NA 1BO5O 2W41A 4XH4A 1MDUB 3VPZA 4B1YB 2V7ZA 3VEWA 5F2RA 2D4WA 4CZIA 4CZEA 1MWMA 3QBXA 3QICA 2KHOA 3WEEA 1T44A 2GWJA 1K8KB 2P9SA 3VGLA 1NGGA 3O4WA 3I33A 2Q97A 4FPBA 4NO7A 1RFQA 4JNEA 3ENOA 3L0QA 4BRHA 5KQDA 4WQ4A 2HOEA 4IXCA 5KQ8A 4BRIA 3ZX0A 1E4FT 3O8MA 3BEXA 4M7YA 4BR7A 2E2QA 4BR5A 1HKGA 1QQMA 1K8KA 1E4GT 1GLCG 1P8ZA 3DXMB 1LOTB 3GDQA 3D2EB 5AQNA 3VESA 4CBUA 4K43A 3FFKB 4PKHA 2YJFA 1SAZA 4WQ4C 2GEMA 3QBWA 4CZJA 3CQXA 5AQYA 4BRQA 5BN8A 5AQWA 4JD2B 3EL2A 4H5NA 2P9UB 4H5VA 3H1QA 3GOIA 1BU6O 1BG3A 1QZ5A 3DXMA 5KPRA 2P9KB 2E1YA 3W3DA 2P9PB 3D2EA 3GG4A 3VF6A 3ZETB 4BR0A 4XH5A 5EX5A 3LDQA 5BN9A 3FZMA 3FZFA 1S22A 3U9DA 4B1VA 4A61A 2GWKA 1TUUA 3ZX2A 3EKSA 2QM1A 1BDGA 1LCUA 4BGAA 1DGKN 4PL8A 3VGMA 2GELA 3CJAA 2E20A 3SJHA 3RSEB 3LM2A 5FPNA 1ATSA 2P9KA 2NLXA 1G99A 4H0XB 3ZETA 3HI0A 1RDWX 1JCEA 2AP1A 1BA0A 4BR9A 5AQFA 2WUSA 3LDPA 3GBTA 3R6MA 1TYQB 3G25A 3QB0A 4RCHA 4M7XA 3FZHA 5AQLA 4JAXA 3DXKB 3CJ9A 3H45C 1H1VA 2ZGYA 5CE3A 1NGFA 4IZ9A 4B1UB 5AFUA 5E84A 2V51B 2F9WA 4BR2A 3SMPA 5TKYA 1X3NA 4F9OA 4Y0WA 4CZKA 3TU5A 3CJCA 1BOTO 4FOIA 2P9LA 2FSKA 1ZBSA 4B1ZA 1BUPA 2QW9A 2ZGZA 4QS8A 3GL1A 5AQHA 4DB3A 3O5BA 4Z94A 3O1WA 3EZWA 1C0GA 1DKGD 2BUPA 3IUCA 4CZFA 3BF1A 2FF6A 3H3OB 1NGHA 5JMVA 4CBXA 2FF3B 3UB5A 1NGJA 3ZX3A 1NGBA 4BROA 2UYTA 3U9ZA 5I9EB 5B8HA 5BRDA 4BVOA 4CBWA 4CD1A 1NWKA 1YAGA 3U4LA 2E2NA 4YDUC 5JLHA 3GE1A 1ATNA 2PBDA 4BRLA 4FPAA 2ASMA 3WUHA 2E8AA 1YXQA 1BWFO 4IO8A 2YJEA 5AZJB 3A5OC 3O08A 3WQTA 1Z6RA 2QWRA 1WUAA 1IJJA 3P4IA 1SQKA 1U6ZA 3UKUA 2GUPA 1ATRA 3H6EA 2ZF5O 4BC5A 2E88A 1RGIA 4BC2A 1HPMA 4BRPA 3R8EA 1X9JA 2GTDA 3FLCO 1KAYA 4FWNA 5AR0A 5E26A 2IVPA 3CERA 1QQOA 4H0VB 2VYPA 3HSCA 5AQKA 5AZJA 1KXPA 4NB4A 4BRDA 2DPNA 3KVGA 2VCPA 4K25A 4FSVA 4B9QA 3F9MA 5FPEA 1IG8A 2BTFA 3BUZB 2QWPA 4WQ5C 3AAPA 4BRMA 3U8XA 2QWOA 5JLFA 1GLJO 3ENHA 1R59O 5FPDA 1DEJA 4CJ7A 5AQSA 1QZ6A 4MLHA 4BC3A 5AQVA 4CZMA 3FE1A 4BR4A 2ASPA 3IDHA 3W0LA 4PL7A 3VEYA 4GY2B 3KHYA 1T6CA 1V4SA 4MO4A 4MO5A 3DAWA 1XC3A 2CGKA 2FSJA 2HMPA 3VEXA 1YUWA 1NGCA 1HX1A 2P9IB 4PKGA 1C0FA 3WXLA 4H5TA 1U2VB 3MK6A 1QHAA 4FWOA 3LDLA 3TPQA 4ISEA 3AARA 4CZHA 3HTVA 2A41A 3LDOA 5F0XA 2NRHA 3VGKA 4A62A 4KBOA 4B1WB 2J4RA 2W40A 3ID8A 2P9LB 4H03B 1XUPO 5AFUH 2P9IA 4XEIA 1ZXOA 3UE5A 2YCHA 4BRKA 3DJCA 5AZIB 4EIAA 3LDNA 3R9PA 1U2VA 3VENA 1NGDA 5BR9A 3VF4A 3I8BA 5FPMA 1HKBA 5LJWA 2D0PA 3M1FA 4FO0A 4E1JA 4I6MB 1GLLO 3O80A 5BPMA 2YHYA 1MWKA 4HWIA 5AQQA 4EAHD 4IJAA 4EHTA 1NGAA 3DWLA 3C0BA 1T6DA 5AQPA 4RWTA 5EVZA 4CZGA 3QMLA 1NGEA 3C7NB 3H1VX 5AZIA 4BRFA 2E2PA 4H0TB 5AQGA 3MCPA 1Q18A 4YDUA 4FWLA 5AQXA 3CQYA 4MLEA 2CH5A 2V7YA 3AAQA 4I6MA 4AM6A 1Z05A 2FLOA 4BRNA 3UKUB 1GLBG 3CETA 2CH6A 3CIPA 3D2FA 4L3QA 4FWKA 4J8FA 4H0PA 4PKIA 2YHXA 2AA4A 2A6AA 3C7NA 3M6GA 2CGJA 2IVNA 3CHWA 4IJNA 5BRFA 2QWMA 4BG9A 3SK3A 2QXLA 5AQZA 2FSNA 3FZLA 4DHYA 4JHDB 3CJ7A 1V4TA 1NLVA 4B1XB 5ADXA 4O8KA 4WQ5A 4BRAA 3VF2A 3WT0A 4DCHA 2Q0RA 1EQYA 2YI1A 5KPZA 3M3ZA 3L6QA 5BPLA 3VEVA 1YVNA 3FZKA 5EY4A 2CGLA 2E1ZA 1HUXA 3QDKA 2E2OA 5AQOA 2FXUA 2I7PA 3UKRB 4DQ8A 5AQUA 3IMXA 2EWSA 4QS9A 3JXUA 4BVPA 2Q1NA 2QWQA 4A2BA 1TUYA 4JHDA 1HLUA 2D1KA 2IIRA 2OANA 3CI5A 3O6WA 4ISFA 4M63C 1MA9B 5AQMA 5AQRA 3VEOA 3WQUA 3VOVA 4CI6A 3S41A 1X3MA 4O5FA 3WXJA 3VEZA 1WOQA 5BRHA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4CF2A 4FWSA 4CZLA 3NMUA 1Q8IA 4CJQA 2D0OA 1T7PA 3B6OA 2RKIA 2O8DA 4Z4EA 3SMSA 5CZ2A 2FBYA 3TR8A 2IVOA 3L3VA 4CJWA 4JN4A 1D8YA 3M5RA 1UOCA 2F9TA 1YVUA 3MEDA 1ZBFA 1XHXA 3B6PA 3CCQN 2E5LK 3QETA 2G8HA 2GV9A 3HPOA 2XY6A 3HZ6A 5AQTA 1ASVA 4LF6K 3L2VA 1W9HA 4RW8A 3CFPA 2V52B 1SZ2A 2H3GX 3DLLL 3THWA 2ETJA 2ITMA 1QQNA 4ELVA 4CHQA 4JD2A 3FGUA 3IFRA 3AVAA 5DK5A 4FVUA 4DV0K 4PY5A 2WFBA 4EFHA 3ZEUB 3MN5A 1JLFA 2PYJA 3KZBA 3ATUA 4BQZA 5SWMA 1K73O 3ZYYX 3LANA 1K6YA 4KV8A 1OKJA 1VSHA 1SV5A 3AVFA 4DFPA 2D0CA 5CR4A 4O0IA 4JKGB 2HNDA 1HNWK 1RBVA 2HMIA 1VQ6N 4DTSA 1YHQN 1NM1A 4IG0A 1NK4A 4RW6A 1RNHA 3EN9A 4BREA 1FJGK 5CY4A 3MXIA 4Z4GA 5JICA 4FXDA 3R3LA 3QNOA 3SBTA 1DTTA 2WBNA 3DXKA 3OYHA 1TL3A 3A5LC 2P9NB 4A59A 3H3NO 2PY5A 2IS3A 1X1PA 3J7ZO 3T3FA 3QESA 2KTQA 1JCGA 3CCRN 3M8QA 4FL9A 4FOEA 1X9MA 4A5BA 1ITGA 1NMNA 5EOYA 3WNGA 4CGJA 2BH1A 3K5NA 3S9HA 1U49A 4RTFD 1HNXK 1I94K 2OPPA 3LZJA 3F5TA 1YJ9N 4IKFA 4B9SA 4WE1A 2PFUA 4FWMA 3L3UA 3KD5E 5IWAK 3NHGA 4DV6K 4O4GA 4KHQA 1TK0A 2V7ZA 2HBJA 4CJEA 3CM5A 1YJWN 3TABA 3DYAA 4FJLA 3D6RA 4DTJA 1T44A 3KWGA 3O3HA 2P9SA 3MECA 3VGLA 2HHSA 4Z4HA 3PY8A 3OYIA 2GUIA 4DSJA 3ZT2A 3JSMA 3EY1A 1YF5L 2Q97A 3OS2A 1RFQA 4I2QA 1RBRA 5DMRA 1YIJN 3G10A 5KQDA 4GVEA 3SJJA 4F3OA 2HOEA 4DWIA 4BRIA 1E4FT 3SI6A 3CYGA 1UWBA 2E2QA 4BE0A 5GADP 4IO9L 5AQNA 3AVLA 2UUCK 1ASUA 3VESA 3G0ZA 3DLKA 1HYVA 3FFKB 3SZ2A 1SAZA 4XJXA 3SPZA 3RWUA 3THWB 4DLEA 3HRGA 3V9ZA 1WSHA 3TSPA 1L3TA 4JD2B 2HNZA 4M3TA 2WONA 3P1GA 3NFAA 5AJ3K 4DV1K 1VSDA 3M8RA 1BG3A 4DF8A 3PO5A 5LMUK 2P9KB 3W3DA 3ZETB 4BR0A 4CJVA 2DFEA 4XH5A 1XC9A 3LDQA 3LP3A 5C10A 3NH0A 2O8CA 4YOVA 1Y97A 1JLQA 4N41A 2G8IA 3EKSA 2QM1A 4CF8A 3EE9A 5J2PA 4BGAA 4JKHA 4IOCL 1M90O 3OYEA 5FPNA 1RT4A 1JLCA 1RDWX 4DSEA 3TARA 1BA0A 4BR9A 1IG9A 2DTUA 3HPGA 3QB0A 2Y1IA 4JAXA 3DXKB 4CJSA 3SQ0A 3DLRA 3HVRA 3BGRA 3VQ6A 3SPYA 4B1UB 3V1QA 5AFUA 1RT1A 5E84A 2F9WA 4ZHRA 1EWRA 4CF0A 1SKRA 3KKSA 2A1SA 3AO2A 4F9OA 1VRUA 3ID6A 4I7FA 1W7AA 1BOTO 3L2QA 4AHTA 2XY5A 1S1TA 4GV9A 2F8TA 1UA0A 2ZGZA 4DB3A 4FW1A 3EZWA 1DKGD 4HUGA 2BUPA 3QINA 3SBGA 3NF8A 4DR3K 4B9UA 3UB5A 1NGJA 1QTMA 4BROA 2WTUA 3U9ZA 3QERA 4LFAK 5B8HA 3DRSA 2IDOA 3F73A 1FW6A 3OYLA 1I3AA 3GE1A 3T69A 4MDAA 3BZKA 3AO5A 4FPAA 4Z4CA 5M1PA 2ASMA 5HL7L 5AZJB 4HTUA 4NXMK 3LP0A 1KQSM 1SQKA 4JKEA 1HJRA 1U6ZA 3J7AP 1S9EA 3AA4A 3RR7A 4U7BA 2GUPA 3HK2A 2JLEA 1HMVA 2ZF5O 4YNQA 2VWJA 4E7HA 3BDPA 4BC5A 4M41A 3R8EA 3FLCO 5C25A 1VQPN 4E0DA 4HVJA 4JI5K 3NCIA 2D5RA 3CERA 4FK2A 1YI2N 3HSCA 3T7ZA 2QK9A 1KXPA 1N34K 2DPNA 4K25A 4FVMA 4B9VA 1BIUA 1XHZA 1REVA 3F9MA 5FPEA 2AJQA 1IG8A 2KZMA 3BUZB 4OKEA 1TVRA 4MFBA 1RT6A 4BRMA 2HSTA 4X64K 3DLGA 5FPDA 1DEJA 3DI6A 3SUQA 2RHKA 4CJ7A 5AQSA 4BWMA 1QZ6A 4B9TA 3ZSOA 1KVBA 4CZMA 3OS0A 3RRHA 4I9LA 4R5PA 4AILC 1ZBUA 3KHYA 1T6CA 4B3RK 1B9DA 4DS5A 4MO4A 5CYMA 3C94A 3CFRA 3P38A 3KTQA 4IEEA 3TTDA 1WSEA 2FSJA 3VEXA 1SL0A 1XMOK 3VQCA 1C0FA 2G8KA 1RT7A 1QHAA 3DLHA 3TPQA 4ISEA 3AARA 4CZHA 3HTVA 1IKWA 4CHPA 1TAQA 3PUFA 4X65K 3VGKA 4B1WB 3ALYA 4IFVA 2J4RA 4ICLA 3O9SA 4KRFA 4BRKA 5A2QO 4DQQA 2HHTA 3LDNA 3VENA 4FJIA 3OBWA 4FLWA 5FPMA 4JI6K 3M1FA 4I2PA 5LMNK 1IH7A 2KKZA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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