4CZIA

C. crescentus mreb, single filament, empty
Total Genus 99

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
99
sequence length
326
structure length
316
Chain Sequence
ISNDIAIDLGTANTLIYQKGKGIVLNEPSVVALRNKVVHAVGIEAKQMLGRTPGHMEAIRPMRDGVIADFEVAEEMIKYFIRKVHNRKGSGNPKVIVCVPSTAVERRAINDSCLNAGARRVGLIDEPMAAAIGAGLPIHEPTGSMVVDIGGGTTEVAVLSLSGIVYSRSVRVGGDKMDEAIISYMRRHHNLLIGETTAERIKKEIGTARAPGLSIDVKGRDLMQGVPREVRISEKQAADALAEPVGQIVEAVKVALEATPPELASDIADKGIMLTGGGALLRGLDAEIRDHTGLPVTVADDPLSCVALGCGKVLEH

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
EMPTYTI1 (18-21)3H1 (58-60)S1 (13-17)TII1 (26-29)AH1 (82-96)S18 (314-316)TIV2 (41-48)S3 (30-36)TI2 (54-57)TIV4 (53-56)AH4 (188-203)S5 (49-53)TI'2 (174-177)S6 (68-71)TII2 (60-63)TI4 (65-68)S7 (74-75)TIV7 (79-82)O1 (154-156)TI5 (98-101)TI7 (164-167)AH2 (117-129)S9 (106-111)TVIII1 (132-135)S10 (134-139)AH3 (140-148)AH6 (252-276)TI6 (151-154)S12 (168-174)S11 (158-163)S13 (177-184)S15 (232-239)AH5 (209-219)AH7 (279-288)S17 (290-293)S16 (245-251)TI9 (240-243)TII3 (299-302)AH8 (302-310)S2 (21-26)S4 (39-42)TIV6 (74-77)S8 (78-79)O2 (184-186)S14 (205-206)TI8 (239-242)TIV8 (129-132)3H2 (295-298)Updating...
connected with : NaN
molecule tags Structural protein
source organism Caulobacter vibrioides
publication title Bacterial Actin Mreb Forms Antiparallel Double Filaments.
pubmed doi rcsb
molecule keywords ROD SHAPE-DETERMINING PROTEIN MREB
total genus 99
structure length 316
sequence length 326
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-04-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF06723 MreB_Mbl MreB/Mbl protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4cziA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4cziA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 4cziA03
2E2OA 5AQLA 4BC3A 2FF3B 3GBTA 5AQZA 4ISEA 4CZKA 4DHYA 2P9LB 2ZF5O 2FLOA 4A2AA 4H5NA 3MK6A 1Z6RA 5AQPA 4BR5A 3A5NC 3WEEA 3SJHA 2YI1A 2YHWA 5AQMA 1BO5O 1HLUA 3WT0A 4WQ5A 3VPZA 4H03B 3VEVA 3H1QA 4CZIA 2YHYA 1EQYA 4EFHA 3IMXA 3ZX3A 2D0OA 3LDLA 2QWLA 3H3OB 2YCHA 4FPAA 4XEIA 5AQJA 2I7NA 1ATSA 1V4TA 2FSNA 3QICA 4PKHA 1RDWX 3U9DA 4H5RA 3FGUA 1J6ZA 4BRMA 1LCUA 1K8KA 1JCGA 2ASPA 3DXMA 2OANA 3ID8A 4KBOA 5E26A 5E84A 2P9SA 3UKRB 2BTFA 3AAQA 4H0PA 2CGLA 3R9PA 4BRDA 2CGJA 3HZ6A 1BWFO 3I8BA 4M7XA 3EZWA 3ULEA 2QW9A 1BA0A 5EVZA 1C0GA 3G25A 4WQ4C 1QZ5A 3GDQA 1DGKN 2GEMA 1TUYA 1GLLO 3KHYA 3VGLA 4XH1A 2A40A 3EL2A 5JLFA 4B1YB 3UE5A 4BRHA 4BREA 3HTVA 4JNEA 4BR0A 4CBUA 5KQDA 5EY4A 3LDPA 4CZJA 1NLVA 3FE1A 1HX1A 2V7ZA 1QHAA 1U2VB 3BUZB 4DQ8A 2VCPA 3U8XA 4YDUC 5AQKA 4HTLA 4IWVA 1ATNA 2P9PB 1NGEA 4MLHA 3O1BA 4A62A 1BA1A 3GG4A 4BVOA 2P9LA 1YAGA 2QWRA 4I6MA 4BC5A 4GY2B 5BPLA 3GL1A 4IXCA 3CJ1A 3FZLA 1JCFA 1WOQA 2AA4A 4H0VB 3FFKB 3FR0A 1NGGA 1Q18A 1GLJO 1MWMA 4WQ5C 3O4WA 2ASOA 3C7NB 4WYBA 3DXMB 5AQFA 3CQXA 3EO3A 2E1YA 2HF4A 4BR7A 2W41A 1ZC6A 2Q97A 1GLAG 5LJWA 3MN6A 3ZETB 4CBWA 2HOEA 3BP8A 1GLCG 3H1VX 3O80A 4XH4A 5AQGA 1SQKA 1X9JA 3U9ZA 5I9EB 1T6DA 1ESVA 3L0QA 3S41A 4H0XB 3D2EB 5AQHA 4MO5A 4XH5A 3SK3A 5BR9A 3DXKB 3H46O 2E2QA 4BRNA 4H0YB 3ENOA 4NO7A 5BPMA 2E8AA 4QS7A 4K43A 3MMVA 3SLCA 3JS6A 1ZXOA 3O08A 3U4LA 4FPBA 2VWBA 2NRHA 2IIRA 4B9QA 1NGHA 2YHXA 4H0TB 2YJFA 1TUUA 4BRLA 2A6AA 1U2VA 3WQTA 4QS8A 4FWOA 3A5LC 4I6MB 1H1VA 4BRGA 4ISFA 2P9PA 3AARA 3VEYA 1X3MA 3L4IA 5KQ8A 4JN4A 2Q0RA 3WXIA 5AQTA 5F2RA 3VEOA 1ZBSA 1MDUB 4IJAA 2EWSA 1Z05A 1HJOA 2V52B 3C7NA 5AZIA 4O8KA 2E20A 1GLBG 4MLEA 4CZFA 2I7PA 2QWNA 5AQVA 3O6WA 2D0PA 3AY9A 4BR9A 1QQNA 5AZJA 3ZETA 1NBWA 5LJVA 4FOEA 3CI5A 3VEXA 3KVGA 3VEWA 1BG3A 3ZX2A 5FPMA 3A0IX 4EHTA 1Y64A 3D2EA 2E1ZA 3WQUA 2KHOA 2A3ZA 2ZWHA 5CE3A 5EXWA 3VGMA 1T6CA 4CZMA 3DXKA 2IVPA 3MN9A 4LC9B 1GLFO 2QWPA 1YUWA 4ISGA 4B1ZA 4EHUA 3FZFA 5BRHA 1JCEA 2P9UB 2QM1A 3MN5A 2D4WA 3CHWA 5JLHA 3HSCA 2ASMA 3IUCA 3M1FA 1V4SA 3D2FB 4CI6A 4BRKA 4BC4A 3QBWA 4JAXA 2QWQA 3QMLA 2Q2RA 1ATRA 4K42A 3QBXA 3B8AX 3D7EO 1T44A 2D1KA 3WXLA 1RFQA 3C0BA 3BEXA 1NWKA 3LL3A 1E4FT 2UYTA 3VEZA 4IO8A 1SAZA 4Y0WA 3CJ9A 5AZIB 4E1JA 1NM1A 4Z94A 2Q36A 2GWKA 1KAXA 3DJCA 4BROA 1S3XA 1BUPA 1BOTO 3CETA 4PKIA 4BR2A 4CZEA 4BRIA 1IJJA 3H6EA 5EX5A 4BGAA 2Q0UA 3L6QA 5AZJB 4F9OA 5KPZA 2PBDA 3LDQA 4JHDB 1YXQA 1NGJA 3UB5A 1KAYA 3A5MC 1HKBA 2FF6A 5AQRA 1R59O 3HM8A 2YJEA 2A42A 3MDQA 3TU5A 5F1XA 4B1XB 3LDNA 1RGIA 3CJBA 2BUPA 5AFUA 3VF4A 2FXUA 3M3ZA 1S22A 2A5XA 1GLDG 4RCHA 2HF3A 3W3DA 4IJNA 5BN8A 3VF2A 1NGDA 1X3NA 2P9NB 3A8YA 4FWSA 5BPNA 1IG8A 1OKJA 3MN7A 5AQQA 2P9UA 3CERA 2NZTA 2IVOA 2CH6A 1E4GT 3ATUA 4A2BA 2F9WA 1HKCA 3BF3A 1DKGD 1C0FA 3BF1A 4AM6A 3D2FA 3WXJA 3ZEUB 1NMDA 2ITMA 2PAVA 4BC2A 3F9MA 3DAWA 5BREA 3VF6A 4CZLA 1TYQB 3HBTA 5AQYA 4BGBA 4C23A 5KPRA 4BRFA 3SMSA 3WUHA 3CQYA 4GNIA 4JD2B 4BRCA 2QWMA 4L3QA 4FOIA 4A61A 5AQSA 5F0XA 1XQSC 5JICA 4FO0A 5BN9A 2P9IB 2GTDA 3GOIA 1P8ZA 3UKUB 3VGKA 1QQMA 3H45C 3VESA 3P4IA 1WUAA 5AQIA 2E2NA 4MO4A 4AM7A 4JHDA 5FPEA 4FSVA 2WUSA 2ZGYA 4IZ9A 4BG8A 1U6ZA 3KZBA 4BRQA 3LDOA 4FWKA 3W0LA 5EOYA 3RSEB 1BU6O 1NGCA 3DWLA 3ZX0A 5AFUH 2J4RA 3IDHA 3O8MA 3GE1A 2P9KB 2IVNA 3FLCO 4FWLA 3QFPA 3FZMA 4M7YA 3VENA 2V7YA 5AQNA 1D4XA 2FSKA 3EN9A 5ADXA 4CD1A 4RTFD 4EIAA 1YVNA 3CJAA 2P9NA 4BG9A 1QQOA 3JXUA 3ATVA 1HPMA 4RWTA 3AAPA 3QB0A 3CJCA 1XC3A 4FL9A 1NGBA 4DCHA 3IFRA 4PL8A 2GELA 4BR4A 4BVPA 4J8FA 5FPDA 1NGAA 1NGIA 1BDGA 2F9TA 4FWMA 3ZEUA 1SZ2A 5AQWA 4FWQA 5LY3A 5JMVA 3FZKA 2QWOA 2E88A 3A5OC 4BQZA 1TYQA 3O5BA 3M6GA 4H5VA 3WEEB 3H3NO 2QXLA 2V51B 3SMPA 4M63C 5TKYA 2DPNA 3I33A 4K25A 4CZGA 3QFUA 4CJ7A 2W40A 5KPTA 5AQOA 4EAHD 3LM9A 4JD2A 4HWIA 4K41A 4PKGA 4B1VA 4B1WB 1DEJA 5FPNA 3TPQA 2A41A 2P9IA 3VETA 2AP1A 1XUPO 4FWRA 3OHRA 2FSJA 5AR0A 5AQUA 1CZAN 3UKUA 2Q1NA 3LM2A 2ZGZA 1K8KB 3EKSA 4CBXA 2P9SB 4H0OA 3MCPA 2HMPA 2E2PA 3CJ7A 2CH5A 4QS9A 3CIPA 1GLEG 3ENHA 2GUPA 4WQ4A 4DB3A 3ULEB 1KXPA 2H3GX 3RSEA 5BRDA 4FWNA 3UKRA 4NB4A 4H5TA 3VOVA 4BQLA 1LOTB 2P9KA 5ADXH 3EKUA 2VYPA 4FWPA 5AQXA 2NLXA 3WXKA 3R6MA 3O1WA 5B8HA 1QZ6A 4BRPA 1G99A 5ELZA 1HUXA 2GWJA 4PL7A 4YDUA 5BRFA 4BRAA 2CGKA 1MWKA 3R8EA 1KAZA 1NGFA 2Q31A 4H5WA 3HI0A 4CZHA 4O5FA 3VERA 1MA9B 3J8AA 3FZHA 4CD3A 4B1UB 3QDKA 1HKGA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3PV8A 2E2OA 4DV0K 1C0MA 4F3OA 3V81A 3F73A 4CZKA 2FLOA 4A2AA 4CFBA 1S72N 4H5NA 3LP0A 5AQPA 4BR5A 2B6AA 1RTIA 4KI6A 2E5LK 4Y1CA 2YHWA 4M42A 4YOXA 1QE1A 1I94K 4CZIA 5FDLA 1EQYA 4B9MA 1S1VA 3ZX3A 2HHXA 3KD5E 2D0OA 1NK7A 4NYNA 3LDLA 3KKSA 3H3OB 2YCHA 3OJSA 4BEBA 1D9FA 1WLJA 3HVTA 4PKHA 4DV7K 1JJ2M 3P83D 3K5OA 1J6ZA 4BRMA 4JKHA 5E26A 1JCGA 3DXMA 4KBOA 4BECA 2P9SA 2CGLA 3LZIA 2CGJA 3SYZA 1D5AA 3OS0A 4M7XA 1VSHA 3EZWA 3CC7N 4CGFA 4JRQA 1C0GA 2Z1HA 1GOBA 3M5RA 1QZ5A 3ZT4A 1GLLO 3KHYA 1TK5A 3AVAA 3VGLA 1JLFA 2A40A 1SV5A 3L4QA 4OPJA 5JLFA 3OYIA 4HCCA 3AVNA 3P5JA 4JI4K 4BREA 4CBUA 2IC3A 3LDPA 1X1PA 3RRGA 2OYQA 3MWTA 5LMUK 4A5BA 3WNEA 2VCPA 1JL1A 4OX9K 2G8HA 4KHUA 5CZ1A 4IWVA 4A62A 3O1BA 4OKKA 3GG4A 3H08A 2OPPA 2HHQA 4AHUA 4AHTA 4FXDA 3CD6N 1UA0A 3THXB 1EX4A 3FZLA 3U3GA 4Z4FA 3CCVN 4B3MK 3KLIA 2AA4A 3FR0A 4DUYK 4WQ5C 1Y97A 3O4WA 3ID6A 1LAVA 4ILHA 5AQFA 4CK3A 3THVA 4DG1A 2HF4A 4BR7A 4DR2K 3BZKA 3ZT2A 2QEXN 4W5RA 4CBWA 1TL3A 3U9ZA 2HNZA 1JLCA 1VAZA 4DFPA 4H0XB 5J1EA 5AQHA 1YITN 5DM6L 4CIGA 3PY8A 4BRNA 1N33K 2F96A 4FM2A 3ENOA 3SUOA 1O13A 4M3WA 4NO7A 4CJPA 1HYVA 3RMBA 3U4LA 3VQDA 5H1SQ 2YX6A 3V9XA 2G8IA 1B9DA 4DQQA 4C8OA 1GOCA 2W6KA 2A1SA 2YJFA 3AVJA 3M8SA 4I6MB 3SQ1A 1H1VA 2HBLA 4ISFA 3VEYA 4LSNA 5SZTA 2QTDA 4KH4A 1YJNN 2VG7A 4DMNA 4CECA 3OYMA 3V9SA 3TR8A 2IDOA 1ZBSA 1MDUB 3OA9A 1TVRA 3NH2A 3AVBA 3QEVA 1BQMA 2V52B 1EP4A 4CEEA 4O8KA 2XY7A 1RBVA 2G8FA 4Z4HA 4FLXA 4CZFA 1XNQK 2I7PA 2OTLN 4E0DA 4AHVA 2D0PA 3AY9A 4BR9A 1WN7A 1UA1A 1SKSA 3TSUA 3NBPA 3NMUA 3MWPA 3CI5A 1VSEA 1KQSM 3KD1E 1BG3A 5FPMA 4CJSA 1NJXA 4M3UA 4AHSA 3OS2A 2E1ZA 5CE3A 1VQ4N 5KGWA 1RT6A 1QQCA 3MN9A 1GLFO 3VTHA 4KFBA 2QKBA 3FZFA 4DTRA 3HOSA 2QM1A 4DV6K 4FZYA 4G1QA 4FK4A 1VSDA 3HSCA 2BGGA 3IUCA 1NK6A 1I3AA 1V4SA 2E6MA 4CGIA 4CJRA 1U04A 1KSPA 4ILJA 3B8AX 2F8TA 3HYFA 2O8FB 3MEGA 4FVUA 1RFQA 3AVCA 1N6QA 1X9SA 1C1CA 1ZBHA 1E4FT 2UYTA 5M1OA 1LAWA 3CJ9A 5DK5A 4E1JA 3LAMA 5GAGP 3VA0A 2GWKA 1KAXA 4BROA 4PKIA 4A5AA 3NH1A 3IS9A 4N47A 4DF8A 3DRRA 4F9OA 4AILC 3V4IA 3L6QA 5AZJB 3I0RA 4FVMA 4AF1A 1SL0A 3C6AA 5HRRA 3A5MC 5AQRA 3AGKA 4BY9C 4I2PA 3OYEA 3ZSXA 3LDNA 4MDBA 4W5QA 3VF4A 3K0SA 2FXUA 3M3ZA 4FJ5A 1IKWA 4WCEL 2PFUA 1KVBA 1N32K 1X3NA 1Q7YO 3HP9A 3D0PA 4FWSA 5BPNA 5AQQA 3T1AA 2KFNA 2EHGA 4FJLA 1FKPA 4CFDA 4A2BA 3ZSOA 3BF3A 1DKGD 1BQNA 1VRUA 2Z1JA 3WXJA 2ITMA 4E89A 2LSNA 3DAWA 4CHOA 4CZLA 1CZBA 1J9AA 2C1GA 1CXUA 3HBTA 4KREA 5CYQA 4JKCA 5KPRA 5C15A 2YNFA 4YOYA 4JI8K 1LWFA 1F21A 1B92A 4K0KK 4I9QA 2XHBA 4DFJA 2GTDA 3GOIA 3UKUB 1VQKN 2ZJRL 2HNYA 4CFCA 4AH9A 4I7FA 4MO4A 5GIOA 5FPEA 2WUSA 2ZGYA 1U6ZA 4BRQA 4C8KA 1EWQA 3LP2A 3AO4A 1NU0A 2KZZA 1BU6O 1NGCA 3DWLA 5AFUH 3OYAA 3O8MA 2P9KB 3AA2A 4TSXA 4XIUA 3SQ0A 5M1PA 4W5NA 4R79A 4RTFD 3KKRA 4HCBA 4B3RK 1WBDA 5KRTA 3AO1A 3CJAA 4FLVA 1HNZK 3QEIA 4DQIA 3ATVA 4KHPK 4CEQA 3CCMN 1HPMA 4RWTA 3QB0A 3NAEA 4GMJB 3NGYA 4FL9A 3K57A 4BR4A 4E7KA 3L3UA 4FJGA 2R7YA 1BDGA 3CCQN 4E7HA 3QESA 4KHYA 1GOAA 2KFZA 3D6RA 2D5RA 4JI1K 3A5OC 4N41A 4BQZA 1JLQA 3P31A 4DTOA 4FJ9A 2QXLA 3QIOA 5I42A 4IDHA 5TKYA 5CR4A 5C0YA 4FJXA 2IAJA 3LP1A 5AQOA 1SUQA 1CXQA 4HWIA 3O9TA 4R5PA 1U4BA 5KGXA 4PY5A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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