4CZIA

C. crescentus mreb, single filament, empty
Total Genus 99
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
99
sequence length
326
structure length
316
Chain Sequence
ISNDIAIDLGTANTLIYQKGKGIVLNEPSVVALRNKVVHAVGIEAKQMLGRTPGHMEAIRPMRDGVIADFEVAEEMIKYFIRKVHNRKGSGNPKVIVCVPSTAVERRAINDSCLNAGARRVGLIDEPMAAAIGAGLPIHEPTGSMVVDIGGGTTEVAVLSLSGIVYSRSVRVGGDKMDEAIISYMRRHHNLLIGETTAERIKKEIGTARAPGLSIDVKGRDLMQGVPREVRISEKQAADALAEPVGQIVEAVKVALEATPPELASDIADKGIMLTGGGALLRGLDAEIRDHTGLPVTVADDPLSCVALGCGKVLEH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
EMPTYTI1 (18-21)3H1 (58-60)S1 (13-17)TII1 (26-29)AH1 (82-96)S18 (314-316)TIV2 (41-48)S3 (30-36)TI2 (54-57)TIV4 (53-56)AH4 (188-203)S5 (49-53)TI'2 (174-177)S6 (68-71)TII2 (60-63)TI4 (65-68)S7 (74-75)TIV7 (79-82)O1 (154-156)TI5 (98-101)TI7 (164-167)AH2 (117-129)S9 (106-111)TVIII1 (132-135)S10 (134-139)AH3 (140-148)AH6 (252-276)TI6 (151-154)S12 (168-174)S11 (158-163)S13 (177-184)S15 (232-239)AH5 (209-219)AH7 (279-288)S17 (290-293)S16 (245-251)TI9 (240-243)TII3 (299-302)AH8 (302-310)S2 (21-26)S4 (39-42)TIV6 (74-77)S8 (78-79)O2 (184-186)S14 (205-206)TI8 (239-242)TIV8 (129-132)3H2 (295-298)Updating...
connected with : NaN
molecule tags Structural protein
source organism Caulobacter vibrioides
publication title Bacterial Actin Mreb Forms Antiparallel Double Filaments.
pubmed doi rcsb
molecule keywords ROD SHAPE-DETERMINING PROTEIN MREB
total genus 99
structure length 316
sequence length 326
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-04-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF06723 MreB_Mbl MreB/Mbl protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4cziA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4cziA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 4cziA03
1ATRA 1CZAN 4O5FA 3GG4A 3EKUA 4K43A 2V52B 3I8BA 3M3ZA 3HZ6A 3VGLA 4BRKA 4CD3A 3CJBA 3LDNA 4E1JA 4QS9A 4HTLA 4JNEA 4BRNA 1GLDG 3MDQA 3U4LA 4MO4A 4H0PA 4CBUA 4BRFA 4H0TB 1BOTO 4ISFA 4HWIA 5E26A 3VEYA 4H5RA 3MN9A 2FF3B 3D7EO 3I33A 3VETA 3AY9A 4GY2B 4B1ZA 3WQTA 3FE1A 2QXLA 1IJJA 4M7YA 3U8XA 4CZLA 3BP8A 5JMVA 1NGFA 2CGLA 1XUPO 2IIRA 4IJAA 4BR0A 2A42A 4CZFA 2E2NA 4B1WB 4FL9A 3DAWA 3H3NO 1HJOA 5AQFA 3O80A 3WXKA 3BF3A 4B1YB 2P9PA 1NGDA 5LJWA 2IVNA 2WUSA 2E2QA 3CJ9A 4BROA 1SQKA 3ENOA 3LDOA 5BRFA 1T44A 4BVPA 4DB3A 4FO0A 4BRHA 1KAYA 3D2FA 3C7NB 3R9PA 1NWKA 1T6DA 4CZIA 3VEOA 4EIAA 4K41A 2NZTA 1NGHA 2GEMA 3C7NA 3QB0A 1XC3A 4WQ4C 5JICA 1MWKA 3ULEB 3IDHA 4FWOA 1NGIA 4H5VA 2BTFA 4K25A 2CH5A 3CJAA 3GBTA 1ATSA 4FWLA 5AQZA 1NGBA 3O4WA 3U9DA 4BR7A 2Q36A 1YVNA 3HBTA 2V51B 3ATVA 1TYQB 4BRAA 1LCUA 3H46O 3CETA 3O1BA 2E8AA 4H5NA 4BRMA 1Q18A 4B1VA 4CJ7A 3GOIA 4BC5A 2HF4A 3VEWA 3CJCA 5AQHA 3W0LA 3MN5A 2YHYA 4EAHD 3GDQA 3ZX0A 1KXPA 4PKGA 4XH4A 5AQTA 1QZ6A 3QICA 3HSCA 4H0OA 4CZJA 2QWPA 2CGJA 4B1UB 4CZEA 4BRGA 4BGBA 3UE5A 2QWRA 1KAXA 3ZETA 4BC2A 1YXQA 1TUYA 3SJHA 4BGAA 2CH6A 3WT0A 1BA0A 4FWNA 1NMDA 2OANA 3A0IX 3WQUA 4H0VB 4JHDA 4EFHA 5KQ8A 3O5BA 1QQMA 1MDUB 1QHAA 1QQOA 3P4IA 3VOVA 2IVPA 1GLLO 2GWKA 1GLFO 1MA9B 3UKUA 3O6WA 2Q97A 5AQKA 3BUZB 4IZ9A 4PKIA 3S41A 5AQWA 3R8EA 4NB4A 5EX5A 3WXJA 4FWMA 1GLAG 3HTVA 2ZGYA 4M7XA 5AQYA 2W41A 3SMSA 3ZX2A 4FPBA 3GL1A 1HKGA 5FPMA 4QS7A 2AP1A 3A5MC 4RCHA 3CHWA 4CI6A 1P8ZA 5KPRA 3KHYA 3QBWA 1ZXOA 3VEVA 1E4FT 3MN6A 3CIPA 4IJNA 2YJFA 4RWTA 1ZBSA 5AQIA 4O8KA 3DXKB 2QWNA 1U6ZA 1R59O 5BPNA 2J4RA 5AZJB 3DXKA 4BVOA 1ATNA 1Z6RA 2VCPA 5AZJA 2YHWA 3VERA 1E4GT 1S3XA 3EO3A 1YUWA 3M6GA 5BN9A 3KZBA 1NGCA 4M63C 5KQDA 2Q0UA 5AQQA 1WOQA 2P9IB 4BRLA 2P9PB 3FGUA 2P9IA 1HKBA 1XQSC 3D2EB 3SMPA 2FSKA 2YI1A 4BC3A 5BR9A 3MK6A 5AFUA 3L4IA 3D2EA 2QWMA 3MCPA 3W3DA 4FWRA 2FXUA 3FZFA 2FSNA 5EOYA 3D2FB 3KVGA 3DJCA 2GWJA 2QWQA 4MLEA 2E2OA 3ZEUA 2YJEA 4A2AA 5AQSA 1HX1A 3ENHA 1IG8A 4JN4A 3VEZA 1Y64A 3LDLA 4JD2B 3TU5A 3VGMA 4BQLA 4EHUA 5AQPA 1RGIA 3BF1A 3MN7A 4IO8A 1JCEA 4JD2A 4DCHA 2YCHA 1NGJA 2Q2RA 5AQNA 1DKGD 4CD1A 1D4XA 3UKRA 4WQ5A 1BO5O 4BREA 4PL7A 1H1VA 5B8HA 2QWLA 5AQVA 1ESVA 1G99A 4FOEA 1NGEA 3VEXA 4BRDA 5KPTA 3H45C 3JXUA 2GUPA 3DXMB 2KHOA 3TPQA 1BG3A 3LM2A 3RSEB 5BREA 3DXMA 1JCFA 3RSEA 2ZGZA 4BR5A 4H03B 2CGKA 3WUHA 4H0YB 3FR0A 3ZX3A 5LY3A 2A5XA 2AA4A 2ASPA 3C0BA 3QFUA 4F9OA 3FZMA 3ZETB 5EY4A 3VPZA 2FSJA 1TUUA 3IMXA 1GLCG 4ISEA 2EWSA 3O1WA 2V7YA 2VWBA 3A8YA 2I7NA 2HMPA 3QMLA 4JHDB 2D0OA 4BR2A 3O8MA 4Y0WA 3QFPA 2QW9A 2ZWHA 3VENA 3SLCA 3UKUB 5ADXH 5AQGA 2P9UB 2FF6A 3LM9A 4YDUA 3H6EA 2P9UA 3IUCA 1JCGA 4CBWA 2E2PA 1U2VA 2ASMA 1KAZA 2DPNA 2F9TA 3VF6A 4FWSA 4CZHA 2W40A 5LJVA 2P9LB 5ADXA 4B9QA 1HUXA 2P9LA 2GELA 3R6MA 3FLCO 4I6MB 3WXIA 4BRQA 2P9SA 1NGAA 3HM8A 2A3ZA 3G25A 3FZHA 1V4SA 4I6MA 5BPMA 5FPEA 3AARA 1C0FA 3QBXA 5KPZA 4BR9A 3CJ7A 1OKJA 1S22A 4PKHA 1NM1A 2ZF5O 1ZC6A 4BR4A 1BWFO 1SZ2A 1HKCA 2Q1NA 2VYPA 5FPNA 2Q0RA 2GTDA 4KBOA 3EZWA 2D1KA 3M1FA 1BUPA 1T6CA 2HOEA 4Z94A 4IWVA 1V4TA 4J8FA 2QM1A 1NLVA 5AFUH 1MWMA 2ASOA 5EVZA 1Z05A 3CQYA 5ELZA 2NLXA 4MLHA 4BC4A 4A61A 1C0GA 4NO7A 5AQMA 3ZEUB 1BU6O 2I7PA 3WEEB 5CE3A 2P9NB 4PL8A 3FZLA 5AZIB 5F0XA 3WEEA 3J8AA 2P9NA 5AZIA 5AQJA 2Q31A 1QZ5A 2E88A 3WXLA 1DEJA 1WUAA 4XEIA 5JLHA 2V7ZA 2F9WA 2D4WA 3AAQA 4CZKA 5BRHA 1SAZA 4K42A 4WQ5C 2E20A 3AAPA 3UKRB 4DQ8A 5BRDA 2HF3A 4FSVA 2IVOA 1GLEG 1LOTB 4XH1A 5EXWA 3OHRA 4H5WA 5F1XA 1QQNA 5AQRA 1NBWA 4QS8A 4EHTA 4WYBA 3H1VX 4A62A 3A5NC 2BUPA 4WQ4A 1RDWX 3ULEA 2D0PA 3FFKB 4IXCA 2NRHA 4BRPA 3F9MA 4CBXA 2ITMA 4FWQA 4AM7A 1BA1A 3SK3A 4GNIA 4FWKA 1RFQA 1X3NA 2YHXA 3L6QA 5AQLA 5I9EB 1EQYA 2FLOA 1TYQA 3BEXA 1HLUA 2H3GX 3VF2A 3JS6A 3LDPA 4BG8A 1GLJO 4AM6A 5BPLA 4FPAA 3FZKA 2E1YA 4MO5A 3A5LC 4BQZA 1HPMA 3GE1A 2P9KB 5TKYA 4H5TA 3UB5A 3QDKA 3H1QA 3HI0A 2P9KA 2PAVA 3U9ZA 1BDGA 3ATUA 4FOIA 4XH5A 2A6AA 3O08A 4YDUC 4JAXA 3LDQA 3CERA 4LC9B 3VF4A 1U2VB 3MMVA 3EL2A 1GLBG 1DGKN 1J6ZA 3CI5A 3A5OC 4L3QA 5JLFA 5AQOA 1YAGA 4ISGA 5BN8A 1K8KB 5AQUA 3CJ1A 3EN9A 1K8KA 1NGGA 2P9SB 2UYTA 4H0XB 3L0QA 2QWOA 4FWPA 3CQXA 2A40A 4C23A 2A41A 3IFRA 4BRIA 4CZGA 4CZMA 5E84A 2E1ZA 3EKSA 3VGKA 3ID8A 3B8AX 3DWLA 3LL3A 4B1XB 4A2BA 4DHYA 5AQXA 4BG9A 4RTFD 5AR0A 1X3MA 5FPDA 5F2RA 4BRCA 1X9JA 2PBDA 3VESA 3H3OB
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1ATRA 3VQPA 1T7PA 2V52B 4JI7K 3DLBA 4CEQA 3RRHA 3QNOA 3L2WA 2G8UA 3MXIA 3P31A 3LP3A 3NH0A 1B92A 4B3OA 3U4LA 4H0PA 5DM7L 3AVHA 1BOTO 1S6PA 3DOKA 3QERA 3D7EO 4FJMA 4HUFA 3VQ4A 2QXLA 4ELTA 1IJJA 4DU4A 1ZBIA 3SPYA 1J5EK 2IIRA 4IJAA 2E2NA 4DF4A 5M1NA 1TAQA 1K8AO 2IC3A 5AQFA 3LAKA 3PUFA 4NXNK 1VSHA 3OYGA 2ZM6K 5LJWA 4ELVA 3MEGA 3K58A 5BRFA 4RW6A 1IKWA 4BVPA 4DB3A 4PA1A 1NG9A 4KHPK 4Z4IA 4U67L 1NWKA 4K41A 1NGHA 2FBVA 4LF8K 2D0AA 1MWKA 3F73A 4DV2K 2A1SA 1NGIA 3T7ZA 4OO1J 4K25A 4DV0K 3CM5A 4FWLA 4BY9C 5AQZA 4WF9L 3O4WA 2G8IA 3WNGA 5CY4A 4JKCA 3ATVA 4BRAA 4DQRA 2HHQA 3TTCA 4JI0K 5KGWA 1ZBHA 2E8AA 4DSEA 4KHWA 1YTUA 4H5NA 4BRMA 3CCMN 3NDKA 2NRTA 3TTDA 4B1VA 4CJ7A 4BC5A 1T8EA 4JKGB 4O0JA 4NXMK 4KKOA 3ZSVA 4B8CA 4PKGA 2G8HA 2XO7A 4LFCK 3M8QA 5HBMA 1QZ6A 3LPTA 3HSCA 1SL0A 3T1YK 4CZJA 2QWPA 2CGJA 4AHCA 2ZJQL 4BRGA 1EXQA 1TVRA 2XY6A 3UE5A 2UUCK 4CIEA 2BDPA 1KVAA 4JYAK 3S3OA 4Y1DA 1YXQA 1T3VA 2CH6A 3WT0A 2OZMA 3L2VA 3ZSOA 1NMDA 4B3TK 4IG0A 4CHQA 3O4NA 4EFHA 4U7BA 4HCCA 3VN5A 4CJWA 1QQOA 1VQLN 4OPHA 2G8WA 1GLLO 2HHVA 1GLFO 4CGGA 1MA9B 3UKUA 4HCBA 4LD0A 1XHXA 3I8DA 3C65A 4IZ9A 2HBKA 3S41A 4WFBL 4KB0A 1REVA 1WN7A 5AQWA 3R8EA 4NB4A 3K5NA 1S1UA 3WXJA 4FWMA 4M7XA 5AQYA 2W41A 3E9LA 4DTSA 1HKGA 3O9QA 3V9XA 3HYFA 2AP1A 1EX4A 1QTMA 4E89A 4B9TA 3KHYA 4CHNA 1S1VA 3VEVA 3MCAB 2YJFA 3DXKB 4JK7A 4BDPA 2J4RA 1YJWN 1WAJA 5AZJA 2YHWA 3VERA 1YUWA 3AVJA 5BN9A 1XNRK 5C2FA 2Q0UA 5AQQA 3ZCMA 4DKWA 3EE8A 1WOQA 4C1NK 4M3WA 1L3SA 3AO3A 4OLAA 3SMPA 4CK2A 3L4IA 2QWMA 4K8ZA 2FSNA 3KVGA 2JGUA 2GWJA 3DJCA 3ZEUA 4BDZA 2YJEA 5AQSA 1YJ9N 1Y64A 3LDLA 4CEAA 3TU5A 4KH6A 5AQPA 3SI6A 1XNQK 1FXXA 3O3FA 4IO8A 1N8RO 2X6SA 3K5LA 1RDCA 4BE2A 4BWJA 4CD1A 1Q9XA 1RILA 5IWAK 4BREA 1RTHA 4DTUA 3QINA 1HYVA 3LP0A 1NGEA 2XY5A 3VEXA 4BRDA 3HOTA 3K9KA 3DXMB 2B5JA 4FM0A 4OVLA 3LM2A 3SQ4A 1JCFA 4RG8A 3CF5L 2HBJA 4W5NA 3L2UA 4BR5A 4YOTA 5J2QA 4H0YB 4E0DA 1C0TA 3ZX3A 3V9UA 3TAEA 5LY3A 2A5XA 2AA4A 4E7KA 3J80O 2B4JA 1IH7A 1VQKN 3DLGA 3K5OA 1TUUA 4DQPA 4C8OA 1GLCG 2O4GA 4DQQA 3PX0A 1ZBLA 5DK5A 2V7YA 3THWB 1IV0A 4IDHA 2HMPA 3QMLA 4KHSA 1EO1A 5E41A 3QFPA 3KLEA 3AVNA 2QXFA 4E7JA 5HRNA 2P5GA 2HHXA 3OS2A 3UKUB 5ADXH 4FLYA 3V9SA 2NRXA 3E9OA 1JCGA 1U2VA 3SQ1A 4FWSA 2W40A 3CFOA 5ADXA 3MAQA 4FCYA 4CJVA 4CGFA 4DSFA 3PO4A 3R1XA 4DV4K 4M3ZA 2O8BB 1NGAA 1OH6A 1M90O 3AARA 3HPHA 1C0FA 2P1JA 3CJ7A 1S22A 1RCHA 4PKHA 4JKBA 5A2QO 1ZC6A 1BWFO 3CYMA 5JENA 4YOXA 2Q1NA 3CG7A 4DTPA 5FDLA 3K59A 1T6CA 4AH9A 4BDYA 2WFBA 4JI4K 4A5BA 3O9RA 1V4TA 2QM1A 4DV3K 1OH7A 1YITN 1Z05A 2PFUA 2RHKA 3M5RA 2HVIA 4GKJK 4BC4A 4A61A 1KFDA 4FK0A 4PUOA 2UXDK 1C0GA 3LALA 1T05A 2YHAA 3ZEUB 4YOVA 4FJLA 2I7PA 5CE3A 4CFDA 2G8VA 5AZIB 3PIPL 5F0XA 2E5LK 4YFUA 1NKBA 2YKMA 1RT2A 4CFBA 3G6EN 3EEQA 3KLFA 1QS4A 2OCEA 4OJRA 3ZYYX 2ZE2A 1WUAA 1FKOA 2V7ZA 5BRHA 1SAZA 4K42A 4DQ8A 2YNGA 1ASVA 4FSVA 4YOYA 3MECA 4CEFA 4XH1A 3THXA 4LF4K 3OHRA 3LWLA 2Z1GA 4KPYA 4C8LA 4M42A 4DR3K 1NBWA 4WYBA 4FZZA 3Q7CA 3CPWM 1K6YA 1WSGA 1LWCA 3O3GA 3L4QA 4A62A 4KI4A 4JKAA 2D0PA 4BRPA 4LF5K 4N56A 3DRSA 3J7AP 3F5TA 1BA1A 4GV9A 1W0HA 2WTUA 3RRGA 1K9MO 3HP6A 1XI1A 3OYHA 1OVQA 5C42A 1X9SA 3FZKA 2F4VK 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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