4CZIA

C. crescentus mreb, single filament, empty
Total Genus 99
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
99
sequence length
326
structure length
316
Chain Sequence
ISNDIAIDLGTANTLIYQKGKGIVLNEPSVVALRNKVVHAVGIEAKQMLGRTPGHMEAIRPMRDGVIADFEVAEEMIKYFIRKVHNRKGSGNPKVIVCVPSTAVERRAINDSCLNAGARRVGLIDEPMAAAIGAGLPIHEPTGSMVVDIGGGTTEVAVLSLSGIVYSRSVRVGGDKMDEAIISYMRRHHNLLIGETTAERIKKEIGTARAPGLSIDVKGRDLMQGVPREVRISEKQAADALAEPVGQIVEAVKVALEATPPELASDIADKGIMLTGGGALLRGLDAEIRDHTGLPVTVADDPLSCVALGCGKVLEH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Structural protein
source organism Caulobacter vibrioides
publication title Bacterial Actin Mreb Forms Antiparallel Double Filaments.
pubmed doi rcsb
molecule keywords ROD SHAPE-DETERMINING PROTEIN MREB
total genus 99
structure length 316
sequence length 326
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-04-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF06723 MreB_Mbl MreB/Mbl protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4cziA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4cziA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 4cziA03
2P9IB 3W0LA 4BRKA 3O1WA 4LC9B 4BC3A 4BR7A 2DPNA 3DXKA 3SLCA 1BDGA 1HLUA 1HJOA 1P8ZA 4QS9A 1BA1A 3UKRA 3L0QA 5FPDA 2P9LB 1BWFO 2E8AA 3CI5A 4FWSA 1RGIA 2FSJA 3BP8A 2P9PB 5FPEA 5AQOA 1X9JA 1NBWA 1NWKA 2AA4A 1LCUA 2E2NA 2D0PA 2D4WA 3LDNA 4BG9A 1J6ZA 4E1JA 2YI1A 1SQKA 3ZX0A 3DXMB 4MLHA 2PBDA 3BEXA 4H0VB 1Z6RA 3MK6A 3RSEA 1V4SA 3VF4A 2IIRA 5EXWA 2I7PA 5AQVA 1Q18A 3CJ1A 3IMXA 3MN9A 2J4RA 4J8FA 3VEXA 4JD2A 1BUPA 4KBOA 1TUUA 3P4IA 1NGHA 1JCFA 4H03B 5AQLA 1U2VA 4YDUC 5EX5A 2QWQA 4H5VA 3FZLA 3QFUA 1Z05A 4BRGA 1K8KB 3UB5A 4B1YB 3CIPA 4JHDB 2CGJA 2P9KA 3ULEA 3EN9A 4YDUA 5AQMA 4B1WB 1NGEA 3HSCA 2ASMA 2GWJA 5B8HA 3IDHA 3VETA 2HF3A 4WQ4A 4ISGA 3CETA 1GLDG 4HTLA 2Q1NA 2ASOA 5F1XA 2P9IA 3IFRA 2V51B 3CERA 1T44A 4BROA 4BC4A 4JAXA 3W3DA 4XH5A 3FLCO 3ATVA 3BF1A 5TKYA 4H5TA 3FR0A 1KAXA 3TPQA 3UKUB 2BTFA 1BA0A 4FOIA 2A6AA 2H3GX 3AY9A 1GLJO 5AQJA 3U9ZA 3M6GA 4CZLA 2P9SB 4BQZA 5CE3A 4RCHA 4H0YB 4CZIA 4BR2A 3IUCA 2HMPA 3EKUA 4F9OA 3D7EO 3VOVA 1NGJA 3JS6A 4B1UB 3QMLA 1BG3A 3DXMA 4H5RA 4BRNA 4PKGA 4IJNA 1MA9B 2ZGZA 2GWKA 2A5XA 1KAZA 1NMDA 2ZF5O 4BR5A 3CJBA 4BC2A 3D2FB 3J8AA 4MO5A 3F9MA 4JNEA 4FPAA 5AQTA 5BRHA 3GBTA 1T6DA 5ADXA 4CI6A 5KPZA 1NGFA 2Q0UA 2E88A 5KQDA 2E2PA 1QQNA 3KHYA 1YVNA 4NO7A 3CQYA 5AQYA 1D4XA 4K41A 3WT0A 3ZEUA 1Y64A 3A0IX 1TYQA 3VGLA 1E4FT 3ENHA 3LM9A 1QZ5A 3MMVA 4GNIA 1S22A 3U8XA 2QWLA 4CZGA 5AFUA 3FZKA 1HKGA 2GUPA 2OANA 4CD1A 4AM7A 3CJ9A 1ATNA 3GL1A 3FZFA 5AQWA 2CGLA 2VWBA 4FWNA 3B8AX 1QQOA 4A2AA 3VGKA 1S3XA 2CGKA 1CZAN 3VERA 1ATSA 3VEOA 3G25A 3MN7A 3D2EB 5E26A 4QS8A 4DHYA 3MCPA 5KPRA 2QW9A 3A5LC 3WEEB 4CZHA 2P9UA 4IJAA 4WYBA 1SAZA 1MWKA 3WUHA 2P9NB 4FL9A 3C0BA 3VEZA 4I6MB 1BOTO 5AFUH 3EZWA 3O5BA 3C7NA 3EKSA 3SK3A 1G99A 3A5MC 3A5NC 3WXKA 2CH5A 2YHYA 3HM8A 3H1QA 2QWNA 3CJCA 4H0OA 3LM2A 2BUPA 1BU6O 3KVGA 4ISFA 1HPMA 3KZBA 5EY4A 4A61A 4H5NA 5JMVA 1NGCA 5E84A 1LOTB 3I8BA 1IJJA 4MO4A 1RDWX 4FSVA 4WQ5C 2V7ZA 3WXIA 1MWMA 3L4IA 4JN4A 2Q97A 5AQQA 2QXLA 5AZJB 2QWOA 3WQUA 2F9WA 3M1FA 2EWSA 4WQ5A 4BREA 4BRQA 2VCPA 5KQ8A 2IVNA 4Z94A 3R8EA 4FPBA 4FWOA 2HF4A 4M63C 1NGAA 4BRFA 1OKJA 3QB0A 5EOYA 2P9LA 1XQSC 3S41A 3LDLA 3MDQA 1YUWA 3FZMA 4XH4A 1X3NA 2P9PA 1KAYA 1C0GA 3WXLA 4BVOA 1KXPA 3HBTA 3VF6A 3JXUA 3UKRB 2ZWHA 3LDOA 1ZC6A 4IZ9A 3QBWA 2QM1A 1ZBSA 1C0FA 4DCHA 2ITMA 1GLLO 2NZTA 1NGIA 4CZEA 4AM6A 2NRHA 3H3OB 4FWQA 2HOEA 3QFPA 1JCEA 3CJ7A 3H1VX 5AQKA 5AQGA 4BRHA 3RSEB 4CD3A 3VGMA 4BR9A 4CZMA 1T6CA 1TUYA 3CJAA 3FGUA 3OHRA 5AQFA 3GE1A 4L3QA 3AAQA 5AQHA 4H0PA 4JD2B 4B1VA 1K8KA 4PKHA 3DAWA 4CZJA 4JHDA 4M7XA 1MDUB 3ZX3A 1U2VB 4BRAA 4BVPA 2E2OA 4CJ7A 2GEMA 3HZ6A 1GLFO 5LY3A 4FWRA 2KHOA 2V7YA 4CBUA 3WXJA 4BRLA 3ATUA 5BREA 5AQIA 4PKIA 2QWPA 3SMPA 2P9KB 3ULEB 1DKGD 3QICA 4MLEA 5AZJA 3LDQA 3WQTA 3VPZA 3VEVA 4FWKA 3R6MA 4K25A 3LDPA 1X3MA 1GLBG 1IG8A 3UKUA 4C23A 4EFHA 3FZHA 1HKBA 2QWRA 5ADXH 5JLHA 4DQ8A 3VESA 1NM1A 3BF3A 2P9SA 1DGKN 4RTFD 3MN6A 4H0XB 4BRIA 3HI0A 1NGBA 1YAGA 5F2RA 1GLEG 4A2BA 5LJVA 5I9EB 3H6EA 5FPMA 3GG4A 4FWLA 5EVZA 5BR9A 1R59O 5BRFA 4Y0WA 3MN5A 3VEYA 2Q0RA 1ATRA 3H46O 1YXQA 2AP1A 5BPNA 3D2FA 3UE5A 1QQMA 4NB4A 2FXUA 2E20A 4H5WA 4CZKA 5AQRA 2ZGYA 4BQLA 3O80A 3SMSA 4EIAA 1V4TA 3O8MA 3ENOA 3EO3A 4IXCA 4FOEA 1EQYA 2A41A 5AQPA 2NLXA 4BC5A 5F0XA 2D0OA 2YJEA 4K42A 2PAVA 2E2QA 1SZ2A 2W40A 1ESVA 4EAHD 4IO8A 3CQXA 2Q2RA 3H3NO 5BRDA 3U4LA 2V52B 5AZIB 2A3ZA 2YHWA 2GELA 2WUSA 2D1KA 4B1ZA 4CBXA 4BGBA 3O6WA 3M3ZA 5AQNA 5BPLA 5AQXA 4WQ4C 3QBXA 5AQZA 4BRDA 3ZEUB 3ZETB 1TYQB 1BO5O 4ISEA 2CH6A 1RFQA 5AQUA 2I7NA 4FWPA 2Q36A 2YHXA 3QDKA 4A62A 3A8YA 4QS7A 4BG8A 5LJWA 2E1ZA 1NGDA 2F9TA 3AAPA 1E4GT 3ZX2A 2W41A 2FF3B 3D2EA 5BN8A 3R9PA 3DXKB 3FE1A 4XH1A 5JICA 5AQSA 1DEJA 3H45C 4CZFA 4BR0A 3WEEA 4B9QA 4O5FA 1HX1A 2FSNA 2Q31A 3DWLA 2VYPA 3ID8A 2YJFA 1GLCG 2IVOA 2P9NA 4H0TB 4HWIA 2E1YA 1HUXA 4I6MA 1JCGA 2FSKA 5KPTA 4BRPA 4B1XB 5AR0A 4CBWA 1NGGA 3GDQA 2P9UB 2A42A 5JLFA 4XEIA 4FWMA 1HKCA 3O08A 2QWMA 1WOQA 3FFKB 2IVPA 3C7NB 1QZ6A 3HTVA 1XUPO 4PL8A 1WUAA 1XC3A 2UYTA 3VEWA 3GOIA 4IWVA 2FF6A 5BN9A 4PL7A 3A5OC 4EHUA 2GTDA 1QHAA 3BUZB 4K43A 4RWTA 1U6ZA 3L6QA 3VF2A 3DJCA 3O1BA 2A40A 2YCHA 3EL2A 5AZIA 5BPMA 1NLVA 3O4WA 4O8KA 4BGAA 4DB3A 1H1VA 2FLOA 4BRMA 5ELZA 2ASPA 4BR4A 4BRCA 4FO0A 3TU5A 3VENA 3SJHA 1ZXOA 1GLAG 3ZETA 3LL3A 4EHTA 3AARA 4GY2B 4M7YA 5FPNA 3I33A 3U9DA 3CHWA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2P9IB 2YHBA 3CYMA 4GVMA 2F96A 1C1CA 1RT1A 3CCVN 2LSNA 3PX0A 1BDGA 2A1SA 2W42A 2O8DB 3UKRA 3THWB 2FBYA 1TK5A 4FWSA 1D8YA 1RGIA 4O0JA 3C6TA 1IKYA 2P9PB 2WFBA 1HR0K 2VG5A 4CJPA 2GX9A 3F73A 4OKJA 4KV8A 2YI1A 1ASWA 5E41A 4FZYA 3LZJA 3I8DA 2QXFA 1W9HA 3VQ8A 4GKKK 3S9HA 2PZSA 1HQEA 1UOCA 4C8MA 4J8FA 3IMXA 2QKKA 3TAFA 2Z1HA 4FJLA 3P4IA 1NGHA 4H03B 4YDUC 4N76A 1O1WA 3J81O 3O9SA 4JS4A 1SV5A 2UXBK 1BIZA 1K8KB 1TKTA 4ID1A 4B1YB 4LF4K 3CIPA 4DTPA 2P9KA 3ULEA 4YDUA 1TL1A 5B8HA 3VETA 1T05A 2DFEA 1GLDG 2VWKA 4HTLA 5GIOA 3HPGA 4DKWA 2A1RA 2ASOA 2G8UA 3THXA 3R1XA 4B9SA 3E9PA 4C8OA 3FLCO 4CJUA 1HJRA 1VQLN 3HO1A 5TKYA 3THYA 1QQCA 2HNYA 1VAZA 2OPRA 3AY9A 1B92A 3DLRA 4CW7B 3M6GA 4CZLA 4G1QA 4RCHA 4H0YB 5GINA 3D7EO 3VOVA 3T19A 4JRQA 3JS6A 2P51A 1BG3A 3DXMA 5HL7L 3ZT4A 1KAZA 4MO5A 4FLVA 4BE0A 2ZQBA 1N32K 4FPAA 3NBPA 3EZ5A 5BRHA 4JS5A 2O8FA 4DTMA 1IG9A 1RT2A 4CI6A 4M3TA 1S6QA 1NK9A 3R3LA 1C0TA 2DTUA 1YVNA 4NO7A 3CQYA 1VQ4N 1Y64A 3A0IX 3LWMA 1YF5L 2HBLA 1KVBA 3WNHA 3QEWA 5AFUA 4X66K 1HNWK 4DR1K 1HNXK 2WBNA 4DQRA 1HKGA 4CJTA 2QA4N 5JENA 4CHOA 3M8RA 1J9AA 3J7AP 1ATNA 4JI8K 3RRGA 4E7JA 1FJGK 4X62K 3HYFA 4CCHA 1F21A 2B4JA 4CJVA 4IDHA 2CGKA 1CZAN 3VERA 1KCFA 1Q7YO 1ATSA 3G25A 4O5BA 3MN7A 3A2FA 3D2EB 5E26A 5KPRA 4IFVA 1EXQA 4CHNA 1HQUA 3A5LC 3WEEB 4CZHA 4JKHA 1XNRK 2UUAK 3AA4A 2KFNA 1U04A 4FL9A 5BR8K 4DU1A 3C0BA 5KRSA 2JLEA 3WXMB 4CJ5A 4H4OA 4AF1A 2UU9K 5AFUH 3ZLJA 2OZMA 3EZWA 3O5BA 1QSLA 3EKSA 4AHVA 3SK3A 1G99A 4CEOA 4AQYK 4YOUA 4DSKA 1S1TA 3KVGA 4LF9K 4JKAA 1HPMA 5CYMA 5JMVA 3OTOK 5E84A 5LMUK 3I8BA 2ZE2A 4DV1K 2E4LA 4MO4A 3L2WA 4J2EA 3U3GA 4FSVA 3OBWA 3DLKA 1D9DA 4IOCL 4OO1J 1NG9A 1KLNA 3AVIA 4BEBA 3ZSWA 4Z4IA 3SPYA 1FK9A 3DLBA 3HJFA 3K5MA 4B9VA 2YNHA 3WQUA 2EWSA 3AVFA 5KQ8A 3PO5A 4JKGB 4OKEA 3K0SA 2XY8A 3T1YK 1ZBLA 5C25A 4DF4A 4CEDA 4FWOA 1DTTA 1RDDA 2ZJPL 1U48A 1OKJA 1EO1A 3QB0A 5FRNA 4DSIA 2P5GA 3OYGA 2P9PA 1FKPA 1KAYA 4YOTA 1ASUA 3WXLA 3HBTA 4CHQA 1BIUA 4CJ3A 3OYAA 2NRWA 4IZ9A 3M8PA 1XMQK 2QM1A 1ZBSA 1UAXA 3AA3A 2NZTA 1W97L 3NGYA 4QOZB 3PUFA 4DV0K 1TKZA 3P1GA 1WNSA 5M1PA 1VQ5N 4E7IA 4GW6A 3S3NA 1OVQA 5AQKA 4CD3A 2NRVA 1EX4A 3K9JA 1VQMN 3VTIA 3V9XA 1T6CA 1W0HA 3CJAA 5AQFA 1LV5A 3GE1A 4FM0A 3AA2A 4YY3K 4CGIA 4RG8A 1K8KA 3HVTA 2B6AA 2ZJQL 2VG6A 4PWDA 3HZ6A 3AVHA 3NGIA 4H4MA 5LY3A 5FDLA 4L8RB 1DLOA 2FBXA 3WXJA 5CY4A 1JL2A 4B8CA 5LL6Z 3SMPA 3LP2A 3O3FA 2JWLA 2FBTA 4FJ5A 1IKWA 4BY9C 3VPZA 5J2NA 5FLXO 4DR6K 3LDPA 1JXEA 2KFZA 1GLBG 3RMDA 4IO9L 4Z0UA 1HKBA 2QWRA 3HPHA 5ADXH 4DQ8A 4K8XA 1KC8O 2KW4A 4BRIA 1NGBA 1NNEA 1GLEG 4JI6K 4JK8A 4A5BA 1LWFA 1L3TA 5FPMA 3GG4A 3T1HK 5EVZA 4CIFA 2W6KA 4B9NA 4NLBA 5CHIA 3H46O 4IEEA 1IBLK 2RHKA 3D45A 4IKFA 3UE5A 1QQMA 2E20A 4H5WA 1VQ9N 1I3AA 5HRRA 4O8UA 1NJXA 3T69A 2Z1JA 3O8MA 3ENOA 3MEDA 4AHUA 5F0XA 1RBRA 2NLXA 2KQ2A 2YJEA 4K42A 1R0AA 3KIOA 1SZ2A 3DYAA 4X65K 4FJ8A 2O4IA 3T1AA 3U4LA 2YHWA 1GOAA 4ELVA 2WUSA 4Q0BA 4CBXA 1BI4B 3O6WA 3M3ZA 5AQZA 4WQ4C 3J7ZO 4N41A 3C95A 4CERA 4I2PA 3L2UA 1ILYA 1OH7A 1J5EK 4RW9A 5AQUA 1RFQA 4FWPA 4IFYA 4A62A 3B6PA 4CJRA 3HOSA 5TKWA 3NAEA 4BG8A 5LJWA 1BHLA 1XWLA 1B9DA 4DV6K 1E4GT 2FF3B 3D2EA 5BN8A 1TGOA 2OYQA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 3QBX A;  4BRD A;  2X74 A;  1SL0 A;  3UIQ A;  4ISE A;  4J2D A;  4JK7 A;  2I7N A;  1SL1 A;  1EP4 A;  2Q36 A;  3QDK A;  1JL1 A;  3A8Y A;  1RTH A;  2GBZ A;  4DG1 A;  1KRP A;  4QS7 A;  4KHP K;  1NGD A;  5KGW A;  5M1K A;  3AAP A;  4ZTJ A;  3O3G A;  4DS4 A;  2PFU A;  5C2F A;  3MXM A;  3D0P A;  3MAQ A;  1GOC A;  1ASV A;  4M45 A;  1DEJ A;  3AA5 X;  4CZF A;  4B9Q A;  4K0K K;  3LAM A;  1M90 O;  2FSN A;  2IS3 A;  3DWL A;  2P9N A;  3VQP A;  3P5J A;  2FSK A;  5KPT A;  5AR0 A;  5CR4 A;  1JLA A;  3GDQ A;  3SI6 A;  1VQP N;  3DRP A;  1RDB A;  4NXN K;  3LAN A;  2IVP A;  1TV6 A;  1WBD A;  3VQC A;  3QER A;  1S5J A;  4B9M A;  1XC3 A;  3MX5 A;  3TI0 A;  3O3H A;  2UXD K;  3AO1 A;  3E9L A;  4EP4 A;  1U6Z A;  3L6Q A;  4E1N A;  4ZHR A;  4OPK A;  3DJC A;  3EL2 A;  1M1K O;  3O4W A;  4O8K A;  4CFD A;  1OH8 A;  1JLC A;  2FLO A;  2Z1I A;  1T03 A;  4NLC A;  4Q5V A;  1RNH A;  4FVU A;  4BR4 A;  4DR5 K;  1GLA G;  4YFU A;  5HRO A;  5FPN A;  3CPW M;  3ZYY X;  3I33 A;  3CC2 N;  3U9D A;  4XIU A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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