4CZLA

C. crescentus mreb, monomeric, adp
Total Genus 100

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
100
sequence length
339
structure length
333
Chain Sequence
ISNDIAIDLGTANTLIYQKGKGIVLNEPSVVALRNVGGRKVVHAVGIEAKQMLMEAIRPMRDGVIADFEVAEEMIKYFIRKVHNRKGSGNPKVIVCVPSGATAVERRAINDSCLNAGARRVGLIDEPMAAAIGAGLPIHEPTGSMVVDIGGGTTEVAVLSLSGIVYSRSVRVGGDKMDEAIISYMRRHHNLLIGETTAERIKKEIGTARAPADGEGLSIDVKGRDLMQGVPREVRISEKQAADALAEPVGQIVEAVKVALEATPPELADDIADKGIMLTGGGALLRGLDAEIRDHTGLPVTVADDPLSCVALGCGKVLEHPKWMKGVLESTLA
5010015020025030030025020015010050
020406080100Genus Matrix

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
EMPTYTI1 (18-21)S1 (13-17)TIV8 (317-320)AH2 (82-96)S5 (47-53)TII1 (26-29)TVIII1 (79-82)S3 (30-36)TIV2 (43-46)AH1 (54-61)S4 (39-44)TI3 (74-77)TI'2 (174-177)TVIII2 (102-105)TI2 (72-75)TI5 (112-115)TI4 (98-101)AH3 (117-130)S7 (106-111)S8 (134-139)TVIII3 (132-135)S9 (158-163)AH4 (140-148)TIV7 (278-281)TIV3 (151-154)AH10 (322-333)S10 (168-174)AH5 (188-203)S13 (232-239)TIV4 (225-228)TVIII5 (221-224)AH6 (209-219)TIV5 (227-230)AH8 (281-288)TIV6 (240-243)TI7 (239-242)S14 (245-251)TII2 (299-302)3H1 (295-298)AH9 (302-310)S16 (314-316)S2 (21-26)S6 (69-71)TI6 (164-167)S11 (177-184)S12 (205-206)AH7 (252-276)S15 (290-293)Updating...
connected with : NaN
molecule tags Structural protein
source organism Caulobacter vibrioides
publication title Bacterial Actin Mreb Forms Antiparallel Double Filaments.
pubmed doi rcsb
molecule keywords ROD SHAPE-DETERMINING PROTEIN MREB
total genus 100
structure length 333
sequence length 339
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-04-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF06723 MreB_Mbl MreB/Mbl protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4czlA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4czlA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 4czlA03
5EOYA 4I6MB 5ADXH 5B8HA 2GTDA 2Q97A 2Q31A 2YHWA 4FWRA 4K41A 3U4LA 2P9NA 2QWOA 2ZWHA 3VF2A 1X3MA 3WXKA 2E2OA 2W40A 1BOTO 1KAXA 1GLEG 3R6MA 5AQRA 4BRMA 4BRGA 1TYQB 3OHRA 2DPNA 3DAWA 3P4IA 3GG4A 4C23A 2P9NB 5AQGA 2CGLA 3UE5A 4H5RA 3H45C 3AAQA 4FWNA 2FLOA 4LC9B 2YI1A 1S3XA 1R59O 3ENHA 1GLAG 1QQMA 1S22A 1MWMA 3FZMA 3A0IX 3CJBA 1JCFA 2Q2RA 4K25A 3O5BA 4ISEA 3WUHA 5AQYA 4WQ5C 2QWRA 5AQUA 4A62A 3VENA 4B1UB 4FWMA 3IMXA 3LM9A 3G25A 3LL3A 3H46O 2A5XA 1U6ZA 3FZKA 4B9QA 1NMDA 3CJ9A 2CGKA 3UB5A 3LM2A 3M6GA 3W0LA 3WXLA 3B8AX 4BRFA 4FWOA 4BR5A 1T6DA 4FL9A 4XH1A 2QWPA 2Q0UA 1RDWX 3HI0A 5AFUH 5BN8A 3LDOA 3AY9A 5AQJA 4BRCA 3O1BA 4BVPA 1U2VA 3LDLA 3ATUA 3ZX0A 4XEIA 4MO5A 1NGBA 1GLBG 2A41A 2YCHA 3CI5A 1NBWA 3CIPA 4BC3A 4BRQA 3IDHA 2YHYA 2IIRA 3ZETA 4JHDB 2GUPA 4CZKA 5BRHA 3A5LC 1D4XA 4BR9A 3ZEUA 1GLLO 2CGJA 2IVPA 3ULEB 4BROA 2QXLA 1X9JA 1SAZA 2E1YA 2IVOA 5AQQA 1NM1A 5E26A 1XQSC 3D2EB 1HUXA 2AA4A 4CZFA 5BPMA 3FR0A 3WQUA 2HF4A 4FO0A 3JXUA 4BGAA 3WEEA 3FZLA 3W3DA 3DXMB 3MK6A 3BP8A 1E4GT 2CH5A 3H1VX 3L6QA 2E20A 3C0BA 4FOIA 1GLCG 3UKUA 3LDPA 3RSEA 2I7PA 1BA0A 3VETA 4CZLA 4RTFD 4J8FA 1BA1A 1KXPA 2V7YA 1YAGA 2P9IA 5AQKA 3MN9A 4JD2A 2V51B 3UKUB 4EHUA 5KPTA 4I6MA 3HM8A 4A61A 3QDKA 2GEMA 2FXUA 1NGDA 3KZBA 4CZIA 3VF4A 2F9WA 2ZGYA 4CZJA 1IJJA 4H0XB 1T44A 3QICA 1ZBSA 2E2NA 2UYTA 1TYQA 1NGEA 2Q0RA 1NGGA 2FF6A 1JCEA 1QHAA 4B1WB 5CE3A 1BG3A 2P9LB 4BGBA 2P9UB 3UKRB 4EHTA 5KPZA 1XUPO 3CJ1A 4PKGA 1T6CA 3CERA 1HKCA 3VGLA 4ISGA 5FPMA 4PL8A 4IJNA 4DQ8A 3D7EO 2IVNA 2P9SB 2HOEA 4WYBA 4B1ZA 3VEVA 3SJHA 5JLFA 3EL2A 2E1ZA 2YHXA 1V4TA 5AR0A 1OKJA 1E4FT 4HTLA 4RWTA 3VESA 4XH5A 1BDGA 2F9TA 4H5VA 3VPZA 5AZJB 1ZC6A 3VEYA 3VEOA 4FPAA 4AM7A 1ATNA 2EWSA 4H0OA 4K42A 4L3QA 3M1FA 3KVGA 3VERA 4PKIA 4YDUC 1KAYA 5EVZA 5F1XA 3VEWA 4JNEA 4BR2A 3GE1A 2D1KA 2ASOA 3WQTA 3WXJA 5BPNA 3VEZA 4CZHA 2A40A 5AQOA 5EX5A 3KHYA 4CZGA 4JHDA 1P8ZA 4CZMA 4BRLA 3A5NC 3EN9A 4B1YB 4CZEA 5BR9A 4NO7A 2E88A 5AQZA 1JCGA 3ULEA 1RFQA 1RGIA 3O4WA 3U8XA 5KQDA 1YXQA 2VYPA 5EXWA 5AQMA 2OANA 4FPBA 3GBTA 3VF6A 2QWMA 1NWKA 1MDUB 2BUPA 3D2EA 4IJAA 5F2RA 2QW9A 4FWQA 3SK3A 4H5WA 5BREA 3WXIA 2P9KB 1LOTB 3HTVA 4BRNA 4QS7A 3U9ZA 3HBTA 1GLFO 4EFHA 1DGKN 5KQ8A 1C0GA 4NB4A 4CBXA 3DXMA 3TU5A 3D2FB 1KAZA 4M63C 2V52B 3CHWA 4CD3A 1YVNA 1NGJA 4CI6A 4CBUA 4BR0A 4H03B 3VGKA 1BO5O 2D0OA 1XC3A 3BEXA 1H1VA 2QM1A 4IXCA 2E8AA 3ATVA 1SZ2A 1WOQA 2ZF5O 3FZFA 4H0TB 1QQOA 1V4SA 3CJCA 1DKGD 4BRKA 1YUWA 4DB3A 1GLJO 3BF3A 4FWSA 5KPRA 4BG9A 1IG8A 3HSCA 1QZ6A 2FF3B 1K8KB 4H5TA 4GY2B 4DHYA 4IO8A 3ID8A 3VEXA 3SLCA 4BG8A 4FWPA 1HKGA 2ASPA 2P9LA 2I7NA 2P9UA 1ATRA 3MN6A 3ENOA 3UKRA 1Z6RA 4BC5A 3BUZB 3LDQA 4QS9A 1SQKA 3FFKB 5EY4A 4WQ5A 5AQNA 1LCUA 2P9SA 2GWJA 4FOEA 5AQHA 3CQXA 4BQZA 2QWNA 2E2QA 3C7NB 2NRHA 5AQVA 5AQWA 3FGUA 3CJAA 5AQLA 2KHOA 3QBXA 4H5NA 3DXKB 5JLHA 3VGMA 4F9OA 5TKYA 4A2AA 4WQ4C 3QBWA 1HX1A 1BUPA 3WT0A 5AZIB 1EQYA 4M7YA 4MLEA 4H0PA 2P9PB 5AZJA 3H3NO 2YJFA 2HMPA 3FE1A 3U9DA 4RCHA 4BR7A 4AM6A 2E2PA 3H3OB 5JMVA 5LJVA 4BREA 4O5FA 4B1VA 3MMVA 2QWQA 4H0VB 1MA9B 3L0QA 3A5OC 3A8YA 5AQFA 4BQLA 2BTFA 3R9PA 4JAXA 4BC4A 2A42A 4QS8A 3AAPA 3R8EA 1DEJA 4BRHA 2J4RA 3CQYA 5AQSA 3A5MC 3M3ZA 2NZTA 3O08A 4ISFA 1QQNA 3GOIA 5AQTA 4B1XB 3LDNA 4EAHD 2WUSA 5F0XA 5LJWA 5FPNA 2ITMA 3CJ7A 4CBWA 1GLDG 4FSVA 2FSJA 4O8KA 3I8BA 1NGCA 1BU6O 1TUYA 4IWVA 3MDQA 1Y64A 2P9KA 1NGIA 4XH4A 3VOVA 2ASMA 4BVOA 2A6AA 1HLUA 5BN9A 3QB0A 4E1JA 5ADXA 5AQPA 1X3NA 3D2FA 3QFPA 3MCPA 4PL7A 1ESVA 3EKSA 5BPLA 4JN4A 2W41A 3AARA 2GELA 5JICA 3J8AA 3L4IA 2H3GX 4FWLA 3TPQA 1MWKA 3QMLA 4A2BA 3JS6A 3EKUA 5AQIA 1C0FA 3IFRA 1J6ZA 1HJOA 3F9MA 2V7ZA 5BRFA 3H1QA 4BC2A 5FPDA 2PBDA 3O80A 3SMSA 4BRPA 3EO3A 3EZWA 1U2VB 4H0YB 4BR4A 2Q36A 2FSKA 4M7XA 4CD1A 3I33A 4MLHA 3FZHA 2D4WA 3DJCA 3O1WA 1NGAA 3QFUA 1NGFA 2YJEA 4PKHA 5AQXA 4BRIA 1CZAN 1NGHA 2ZGZA 3ZETB 3IUCA 2FSNA 2NLXA 1K8KA 1HKBA 1QZ5A 4EIAA 3ZEUB 5FPEA 3SMPA 4HWIA 2A3ZA 1WUAA 1HPMA 1BWFO 1Z05A 4MO4A 5BRDA 3BF1A 3S41A 5I9EB 2VCPA 3O6WA 4WQ4A 1NLVA 3DWLA 4K43A 3ZX2A 1ATSA 5LY3A 2QWLA 3FLCO 1TUUA 5ELZA 4FWKA 2Q1NA 2HF3A 2PAVA 3HZ6A 3O8MA 2AP1A 3C7NA 4KBOA 3CETA 3MN7A 3GDQA 3GL1A 3WEEB 5E84A 1Q18A 3H6EA 4GNIA 3ZX3A 4CJ7A 5AFUA 3MN5A 4BRAA 2D0PA 4DCHA 2CH6A 3DXKA 1ZXOA 3RSEB 4YDUA 4BRDA 1G99A 5AZIA 4Y0WA 2P9IB 2GWKA 4IZ9A 4JD2B 2P9PA 4Z94A 2VWBA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5EOYA 3NGIA 1VQLN 3HM9A 5ADXH 2Q97A 3U4LA 2P9NA 1NKEA 4DQRA 2E2OA 4N41A 5AQRA 1WSFA 1TYQB 3OHRA 3TAEA 1RDUA 3DAWA 4CHPA 1REVA 1JXBA 3CFRA 3R1XA 2CGLA 4H5RA 4ILHA 1VSIA 2YI1A 4OPHA 4KH5A 1S3XA 1RT7A 5HRNA 3RMBA 2HVHA 4CGJA 4BACA 1GLAG 1QQMA 1S22A 4N47A 4HHTA 3OYHA 2Q2RA 2G8VA 4TSXA 2QWRA 5AQUA 4A62A 4B1UB 3S9HA 3SNNA 4FWMA 5HOOA 2E5LK 1JXEA 3D6RA 5GAHP 2A5XA 3FZKA 5KI6A 2BH1A 4I2PA 5LL6Z 4FWOA 4BR5A 1T6DA 3KWGA 4FL9A 5SZTA 4JRPA 2QWPA 1BISA 3HI0A 3OYCA 3OYEA 4OGEA 4BE2A 1CXQA 3NFAA 3LPTA 3SJJA 3CCQN 3RTVA 1QSYA 5AQJA 4BVPA 5C15A 4LSLA 1D5AA 1K8AO 3ATUA 2UU9K 4CF0A 1NGBA 4HUGA 1YTAA 2A41A 4YOYA 4BC3A 3V9UA 4PUOA 5BRHA 4BR9A 1LV5A 1GLLO 1HQEA 1SKRA 3ULEB 2QXLA 1SAZA 1BI4B 3HPOA 4DSJA 2D0BA 3DLEA 1N36K 3LAMA 3V1RA 3HVTA 3V4IA 3D2EB 3R3LA 1NJXA 3KK2A 1HUXA 3SUPA 3K9KA 3QETA 4JS5A 1S1WA 5D3GA 4G1QA 4FO0A 4FZXC 3JXUA 4JI6K 1LWEA 4FYDA 3M5RA 3FZLA 2OTJN 3MK6A 4Z4FA 4E7KA 5AJ3K 5C0YA 1RT4A 2I7PA 1BA0A 4CZLA 4E7IA 2ZJQL 1KXPA 2OPRA 1VRUA 2P9IA 5K14A 1S5JA 4JD2A 4CHNA 2UUCK 2OCEA 1Q9YA 1IV0A 4CE9A 3UKUB 1NOZA 4OLAA 4B9SA 4FCYA 2YV0X 4FW1A 1KVBA 4CEAA 3SPYA 4FJIA 4YOVA 4GKJK 1T44A 4F3TA 4JI5K 3IS9A 1XWLA 2D5RA 1TYQA 2Q0RA 1NGGA 4C8KA 1VSFA 2FF6A 1JCEA 1QHAA 4JV5K 5CE3A 1YJ9N 4EZ9A 2P9UB 1Z25A 1I3AA 3S3NA 2B5JA 3QEVA 3OYGA 1RTIA 3C6HA 3CJ1A 4PKGA 1T6CA 3CERA 1U45A 5FPMA 1NKCA 4IJNA 3V81A 3K57A 4WYBA 3OYIA 3TANA 4E1NA 1W0HA 3SJHA 4Y1CA 3HOTA 1V4TA 4X66K 4OKKA 3EE8A 4HTLA 2YNIA 1SL0A 2JWLA 1N34K 4J2AA 1N5YA 3VESA 2YNGA 4Z4GA 3JSMA 4XH5A 4H5VA 3NF9A 3VQAA 4NCAA 4OJRA 5JS2A 3VEYA 3G71N 1N32K 4L3QA 4K42A 2WOMA 4B8CA 3VERA 1KAYA 3VEWA 4JNEA 1LW2A 4PWDA 2HHIA 3ZT1A 4QOZB 4CHYA 1TVRA 1XMOK 4V19S 3D0PA 2DFHA 4NYNA 3NF8A 3HK2A 3SV3A 1P8ZA 3KK3A 2O4GA 3AO4A 4NO7A 5AQZA 1JCGA 1VQMN 3ULEA 3SUNA 3U8XA 2VYPA 3TAGA 1BI4A 5AQMA 3P1GA 1A5VA 3GBTA 3T19A 4J2DA 2E6LA 4HTUA 3U3YA 1NWKA 1XC9A 3OYLA 3D2EA 2QW9A 3HVRA 2E4LA 4GV3A 3TABA 1NU0A 4QS7A 1GLFO 3OJSA 4CJPA 4NB4A 4JKAA 4LF4K 3I8DA 1KRPA 3OTOK 1KAZA 2V52B 3CHWA 3KLIA 3V9ZA 4CI6A 3NGZA 5HRSA 3AVJA 4RG8A 1DT9A 3U6FA 5FRNA 1XC3A 4EP4A 4N5SA 1H1VA 2QM1A 2E8AA 3ATVA 4W5QA 4JKGB 3ZSXA 4H0TB 1WBBA 3CJCA 4A59A 4WFNL 3O9TA 3QEWA 3BF3A 5CHIA 3CPEA 4JK7A 5BR8K 5KPRA 1KD1O 4BG9A 2VQFK 4FJGA 3OS2A 4H5TA 3VA3A 4F4KA 4FZZA 1J53A 4BG8A 1HKGA 4CF8A 2ASPA 2I7NA 2P9UA 2NRZA 3E01A 3TSUA 3ZSQA 1EWQA 4AHTA 3K58A 3FFKB 4W5OA 1NK7A 5EY4A 4KKOA 3SI6A 5AQNA 3SBTA 5AQHA 2PYLA 3NBPA 3ALYA 2G8IA 1VQ7N 3AV9A 3C7NB 1RT2A 1VSLA 5AQWA 3O4QA 2UXDK 3HRGA 4FJ5A 4IFYA 3CYGA 4HCBA 4FK0A 2UXBK 5JLHA 4C1NI 3JAMO 3QBWA 4NLBA 3VMFB 4CJKA 2VWKA 4C8OA 1DTQA 1RT1A 4AHUA 3AVGA 1IH7A 1TV6A 3QEPA 1K6YA 2W6LA 5KRSA 2WC9A 2HMPA 2QKBA 4NYFA 3AVFA 4BR7A 3G0ZA 1ZBFA 1VSEA 4OGCA 4DU3A 5LJVA 4B1VA 1Q9XA 4ZTFA 2UUAK 3PO5A 2QWQA 4FJ7A 1MA9B 1VQNN 3TR8A 5AQFA 4GVEA 4M3YA 3VQQA 4FJXA 1QVFM 4DV2K 2ZQBA 3SQ1A 1C0UA 4CJEA 3R8EA 4JI7K 2IGIA 3KLGA 3VQDA 1NMNA 2F96A 2NZTA 1NJIO 3EZ5A 1QQNA 3GOIA 2VG7A 5LJWA 1S72N 4OX9K 3NH0A 1HR0K 4FSVA 2RN2A 4O8KA 3I8BA 1TUYA 3ZSVA 1NGIA 4WFBL 1HLUA 1TL1A 3J7ZO 4FLWA 4E1JA 3KLEA 4DR6K 3L8BA 3LPUA 1KCFA 5JICA 3AO2A 4FWLA 3OVNA 4FJMA 4A2BA 4YOUA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 4CIF A;  1NGC A;  4CJU A;  4IKF A;  3MDQ A;  2P9K A;  3AA3 A;  4DF4 A;  4DFM A;  3DLH A;  3ZSR A;  4FJJ A;  3C94 A;  4O8U A;  3AA4 A;  3THV A;  1TKD A;  3QEX A;  4FK2 A;  5ADX A;  4CJ3 A;  2ZJR L;  1HYV A;  1RIL A;  4DR4 K;  2OPQ A;  1GOC A;  5BPL A;  4CJ5 A;  3KTQ A;  2GEL A;  3J8A A;  1KVC A;  2H3G X;  3MWT A;  3QML A;  3E9L A;  2KZM A;  5AQI A;  1C0F A;  1NK8 A;  3PV8 A;  4JI2 K;  1HJO A;  3AVL A;  4BC2 A;  4M3U A;  2PBD A;  4FJL A;  3EZW A;  3N4P A;  1HPZ A;  3P38 A;  4MLH A;  4KRE A;  3O1W A;  5AQX A;  2G8U A;  3VN5 A;  3IKM A;  4CJR A;  1YT3 A;  2FSN A;  2NLX A;  1QZ5 A;  4NCB A;  4FW2 A;  1WUA A;  1HPM A;  1NG9 A;  1TKT A;  1QTM A;  5CY4 A;  3O6W A;  3KD5 E;  3CCS N;  1ATS A;  3CC4 N;  2UXC K;  4U7B A;  2Q1N A;  5DK5 A;  3O8M A;  3SAH A;  4KBO A;  3MN7 A;  3VQC A;  2AJQ A;  3GDQ A;  4FLX A;  4X65 K;  3H6E A;  1Y97 A;  4EZ6 A;  3H08 A;  4YOX A;  2O8B A;  2A1S A;  1LWC A;  3LZI A;  2P9I B;  4JD2 B;  4O4G A;  3V1Q A;  4CIG A;  3SLC A;  1X9M A;  3F2K A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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