4EAHD

Crystal structure of the formin homology 2 domain of fmnl3 bound to actin
Total Genus 104
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
104
sequence length
368
structure length
356
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title FMNL3 FH2-actin structure gives insight into formin-mediated actin nucleation and elongation.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
molecule tags Protein binding
source organism Mus musculus
total genus 104
structure length 356
sequence length 368
chains with identical sequence F, G, H
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-03-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
D PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4eahD01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4eahD02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 4eahD03
2F9TA 3O8MA 2P9UA 4MLHA 1ATNA 1NGCA 1NGFA 4H0OA 2KHOA 1TUYA 3VETA 2BUPA 1NM1A 3LL3A 3VGKA 2W41A 3MK6A 3L6QA 1HPMA 4QS7A 5CE3A 3WT0A 4EHTA 3CETA 4I6MB 3HTVA 3IUCA 2E2NA 2HMPA 5BR9A 4FWMA 4M7XA 1JCFA 3CQYA 1WOQA 4FPAA 3D2FB 1Y64A 3CJ1A 4IWVA 4JHDA 3HM8A 3A5MC 1NGEA 5JMVA 2P9IB 1D4XA 1ZC6A 2FXUA 2QWOA 3IDHA 4BREA 2A41A 3AAQA 3ZX3A 3JXUA 1K8KB 1ESVA 4EFHA 1XC3A 5FPMA 4Y0WA 4FO0A 2HF4A 3O08A 4DB3A 3AAPA 3DXMB 2FSKA 3DAWA 1QZ6A 5AQMA 4BQZA 1R59O 1DGKN 3VEWA 4A2AA 4CZIA 4BRFA 1JCGA 4B1YB 4EAHD 1XUPO 2QM1A 3U8XA 3A5NC 1HJOA 3IMXA 2P9KB 4BC4A 3QB0A 3H46O 3ATVA 3M3ZA 1NGIA 5AQVA 4BC2A 3U9ZA 1HLUA 1V4SA 4IJNA 3ULEB 3VF4A 4CJ7A 1SZ2A 1RGIA 1S3XA 3ZX2A 5EOYA 5AR0A 4FWSA 1ZBSA 3TU5A 2GWKA 5AFUA 3A8YA 2P9PB 1ZXOA 3GOIA 1NGBA 1GLEG 4CZHA 2H3GX 3J8AA 1NLVA 4CBWA 5BRHA 4JN4A 2J4RA 2P9NA 3M1FA 3CJ7A 2YJFA 4H03B 2DPNA 1QQNA 1WUAA 4B1XB 1X3MA 2D4WA 2ASMA 3GDQA 4BG9A 4B1WB 3WXIA 1JCEA 5AQZA 2I7PA 5F2RA 2P9LA 2OANA 3C7NB 3SLCA 2ASPA 1TYQA 3LDOA 3MN7A 3FR0A 4AM7A 3VESA 1BOTO 1HX1A 3L0QA 3OHRA 2CGJA 2QXLA 2Q0RA 1BDGA 3BF3A 4H0VB 1QZ5A 2Q97A 3CJBA 3WXKA 5AQTA 5AQSA 3EO3A 1X3NA 5KQ8A 4ISEA 3DXKB 1LOTB 3VPZA 5FPEA 4H0XB 3ZX0A 2E1YA 3QDKA 4F9OA 3KHYA 1CZAN 4GY2B 5KPRA 3KZBA 4H0YB 3MN6A 4BRLA 3VERA 2ASOA 4A61A 4M63C 1BG3A 3RSEB 3U4LA 1NGDA 2GWJA 3CJCA 4WQ5A 1QQOA 4IJAA 5AQKA 2QWNA 3HZ6A 4BR4A 4FOIA 2P9IA 2E2QA 2D1KA 3WEEB 3O5BA 3VEYA 5BRFA 4XH1A 2CH5A 2GEMA 3A0IX 4H5TA 2ITMA 3ZETB 3I8BA 2CGKA 4QS9A 1EQYA 2AP1A 5AQUA 3SMPA 4BRDA 3MN5A 3QBXA 3HSCA 5EY4A 4WQ4A 5AQWA 2HOEA 4CD3A 2GUPA 3DXMA 4YDUA 5F1XA 2Q2RA 3UE5A 4CBXA 4CZJA 1RDWX 4H5NA 4BRIA 2VYPA 4CZMA 4RCHA 3FGUA 2QWPA 4NO7A 3A5LC 5LJWA 3G25A 4B1UB 2QWQA 3VEZA 4BGBA 1XQSC 1IJJA 3KVGA 3D2EB 4BR5A 3EKSA 4BC5A 1E4GT 4GNIA 1KXPA 2QW9A 5AQRA 1IG8A 4H0PA 2QWLA 4CI6A 2P9SA 3FLCO 4C23A 4DHYA 4E1JA 5JLFA 4O8KA 4K43A 2W40A 5KQDA 5BN8A 4H0TB 5AQHA 1U2VA 3BUZB 4MLEA 2E8AA 4K41A 5ELZA 3LM2A 5E26A 2A5XA 1Q18A 4FWNA 4CZGA 2FLOA 5I9EB 4EIAA 1SQKA 3ID8A 3AARA 5AZIA 5AQPA 2CGLA 5AQYA 5ADXH 2QWRA 3AY9A 3MDQA 3LDPA 2FF3B 3R6MA 3CHWA 1NGGA 4JHDB 4BRCA 2IIRA 1HUXA 2ZGYA 4KBOA 4HWIA 3UB5A 5AZJA 1GLLO 5B8HA 4WYBA 3B8AX 4FPBA 2E88A 5LY3A 4PKIA 4CZLA 4O5FA 4L3QA 1RFQA 1DKGD 3ZEUB 2GTDA 4FOEA 3W3DA 3UKUA 1C0FA 1HKCA 5JLHA 3O6WA 1KAZA 2A40A 5AQNA 1GLJO 5AQGA 2V7ZA 1KAYA 4JD2A 4MO5A 5AQLA 3S41A 1Z6RA 2NLXA 1NGAA 2V7YA 1E4FT 1Z05A 2E20A 4FWPA 2CH6A 3RSEA 2FF6A 4BG8A 5KPZA 2ZF5O 4BROA 3HI0A 3VGLA 5KPTA 1GLDG 1X9JA 3WEEA 4BR7A 3VOVA 1DEJA 3O1BA 4XEIA 2AA4A 3BEXA 4H5WA 1S22A 3BP8A 4DCHA 2V52B 1MDUB 5AQOA 4FL9A 3ZETA 4FWQA 2WUSA 3H6EA 2NRHA 3ATUA 3QFPA 2BTFA 3FZLA 3CQXA 4QS8A 4K25A 2Q0UA 2UYTA 4I6MA 4CZKA 1YVNA 3CJ9A 3VENA 5BPNA 2F9WA 2PBDA 4FWRA 1MA9B 2IVPA 4BRKA 3CJAA 1GLCG 1KAXA 3F9MA 3D2FA 3WUHA 2P9NB 1ATRA 3FZHA 4WQ5C 3ENOA 1BU6O 1BWFO 1NWKA 3O4WA 1G99A 4FWLA 2I7NA 3TPQA 2FSJA 3FFKB 2YCHA 4B1VA 1K8KA 2YHYA 3D2EA 4FWOA 3LDQA 4PL8A 3VEOA 1T6CA 4EHUA 2P9LB 1T6DA 4ISGA 4CBUA 1TYQB 2E1ZA 2NZTA 5EVZA 1YUWA 1GLFO 4WQ4C 3WQUA 3FE1A 2GELA 4JNEA 4YDUC 3UKRB 1P8ZA 3A5OC 3L4IA 2Q31A 1OKJA 2V51B 1BO5O 4FWKA 3GL1A 3VGMA 3W0LA 2P9KA 3SK3A 1QQMA 4CZEA 3MN9A 1ATSA 3SMSA 4XH4A 2QWMA 3ULEA 5BRDA 5LJVA 5ADXA 3O80A 3CI5A 3QBWA 3CIPA 4JAXA 3H3NO 3JS6A 3GG4A 2P9UB 5BREA 3QMLA 3CERA 4CZFA 4BRAA 3DWLA 4AM6A 2P9PA 3DJCA 4RTFD 1C0GA 3ENHA 3VF6A 3H45C 5TKYA 1TUUA 4CD1A 3ZEUA 3C0BA 2PAVA 5BPLA 2YI1A 3LDNA 2EWSA 4BGAA 2Q1NA 2E2OA 2YJEA 3U9DA 4BRHA 1GLBG 2A42A 2ZWHA 4BQLA 5BPMA 4LC9B 3FZMA 4A62A 2HF3A 4HTLA 1V4TA 1GLAG 1BA1A 5JICA 2A6AA 1NGHA 4IO8A 3C7NA 3FZFA 5EXWA 1H1VA 5AQFA 4BRQA 3QICA 5F0XA 2YHXA 2A3ZA 2IVOA 4J8FA 1YXQA 3VEVA 4RWTA 4Z94A 1MWMA 4MO4A 5AQJA 3H1VX 5AQXA 5AQQA 3DXKA 1BUPA 1NMDA 2P9SB 1BA0A 2FSNA 3GBTA 3R9PA 1QHAA 3WQTA 1LCUA 3GE1A 3HBTA 4M7YA 1HKBA 4DQ8A 4BRMA 3EKUA 3H1QA 1MWKA 3P4IA 3QFUA 4K42A 1U2VB 3EN9A 4BRPA 3H3OB 4NB4A 2YHWA 1U6ZA 2VWBA 3M6GA 2ZGZA 5AQIA 3O1WA 4BRNA 3SJHA 5AZIB 1YAGA 3VF2A 3D7EO 5FPNA 4A2BA 4BR0A 2IVNA 3MCPA 3I33A 4PL7A 3LM9A 4BR9A 4PKGA 5AZJB 3WXLA 2D0OA 4BR2A 2E2PA 5AFUH 1J6ZA 4FSVA 3FZKA 5EX5A 4B1ZA 3BF1A 3EL2A 4IZ9A 4H5VA 4H5RA 4PKHA 3UKRA 3UKUB 2Q36A 3EZWA 3MMVA 3WXJA 4B9QA 4ISFA 4XH5A 1SAZA 1T44A 4BVPA 3R8EA 4JD2B 4BRGA 4IXCA 5FPDA 4BVOA 5E84A 4BC3A 5BN9A 1HKGA 1NBWA 3VEXA 2D0PA 3LDLA 1NGJA 2VCPA 3IFRA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2NUBA 1JL2A 3U6FA 1NGCA 3O3HA 4DSFA 1NGFA 4H0OA 3CCVN 4FJGA 2PFUA 1S1WA 5DK5A 4DMNA 4DTJA 3VQDA 4CIEA 4CFBA 4DQIA 3CETA 1T7PA 1KFDA 5HLFA 1KQSM 4JKHA 1IBLK 4JKBA 4DV0K 5BR9A 4M7XA 2A1SA 1JCFA 3CQYA 3S3NA 1P90A 4DTSA 1WOQA 1W9HA 2XY8A 3D2FB 1Y64A 1C0TA 4IWVA 3T7ZA 3BZCA 3HM8A 1NGEA 1XMOK 1D4XA 4GKJK 3NF7A 4FLVA 1VSIA 3V9UA 3NF9A 3CD6N 3OW2M 1K8KB 1CXUA 5GAHP 4J2EA 4Y0WA 1CZ9A 1QVFM 3AAPA 4ILJA 1NK8A 2O8EB 4BQZA 1R59O 1DGKN 3VEWA 4CZIA 4FXDA 4NYNA 2HB5A 3L2UA 3K5OA 4O4GA 1B9FA 4DFKA 2HVHA 4LH5A 3SYZA 5KRSA 3E9OA 3TAQA 3QIPA 3LP0A 5AQVA 3I8DA 3CCMN 5JS2A 1FJGK 1V4SA 4IJNA 4FJKA 1TL3A 1SZ2A 4CJTA 1RGIA 3OYFA 3DLEA 5CY4A 3EYZA 4AILC 2YNGA 1ZBSA 3NGYA 3OBYA 4IDKA 3HOTA 3O9RA 1NJYA 5KGWA 1B92A 3AA5X 3ENBA 1VQNN 1NGBA 4JKAA 5GAGP 4RW8A 4CJ5A 1BGXT 1B9DA 4DR4K 2P9NA 2W00A 1J54A 3M1FA 3VN5A 2DPNA 1D9DA 3GDQA 3NMUA 3CYMA 1WSIA 2HSTA 4BG9A 2I7PA 1WSGA 4CJVA 3THXA 1RBRA 5C2FA 1QTMA 4FVMA 1ITGA 3C7NB 3SLCA 4JKDA 2F8TA 2UXDK 1BOTO 5DM7L 2CGJA 1QZ5A 2Q97A 3WXKA 3HPHA 1X3NA 3O9SA 5KQ8A 4KHWA 1BL3A 5FPEA 1TKXA 4H0XB 3ZX0A 3QEXA 3ZT3A 3KHYA 4OGEA 5KPRA 3KZBA 1JXEA 4BRLA 4CHZA 2ASOA 4BE7B 4DV7K 4M63C 3P39A 3THVA 1HNZK 1BG3A 4CGJA 5FLXO 1NGDA 3K58A 4KHNA 4IFVA 1HJRA 3BGRA 3O9QA 2O8CA 1OVYA 1YJWN 2C1GA 4CEBA 1JLCA 2I5JA 3A0IX 4QS9A 2AP1A 1WAFA 2FC0A 1NOYA 3NVMA 4HUFA 5AQWA 2HOEA 3AVJA 4KH5A 2GUPA 3DXMA 4YDUA 5F1XA 2KLAA 3PUFA 3BDPA 4H5NA 1YHQN 1N5YA 3LZIA 1RTIA 4JKGB 3KK2A 2OZMA 4FJ5A 2ATQA 1EWRA 2EHGA 4JEPA 4B1UB 3LZJA 4BGBA 4CERA 3HT3A 3OJSA 1TK8A 1IJJA 3KVGA 3D2EB 1VSLA 2XY6A 4BR5A 4BC5A 2E5LK 4IDHA 2WBNA 4DV4K 3DLGA 2P9SA 5JLFA 2IGIA 1L3TA 4HCBA 2W40A 3RMCA 4C8NA 5BN8A 4E7LA 4CF9A 1SL1A 5KTQA 1U2VA 5FRMA 2UXBK 3BUZB 3SQ0A 1OVQA 5ELZA 1RDBA 5E26A 4NXMK 5I9EB 3AARA 3VQ4A 2CGLA 5AQYA 2Z1IA 3MEDA 3EE9A 4ZTJA 3ZSQA 2QWRA 1HYSA 2FF3B 3R6MA 2OTJN 4BRCA 4RW7A 1HYVA 2ZGYA 3HPOA 2XHBA 3CFPA 1GLLO 1UA0A 3ZSYA 4DR2K 3B8AX 2E88A 5LY3A 4PKIA 4CZLA 1ASVA 1U04A 2OPRA 4LSNA 3LDSA 3W3DA 1C0FA 3O6WA 4FK4A 1SKWA 5AQNA 4FK0A 5AQGA 2V7ZA 3OS0A 1Q86O 4CGDA 5JENA 1GOAA 4BDZA 3ASMA 1E4FT 4JI0K 1SKRA 3VQCA 3V1OA 4B08A 2YV0X 4BROA 2GBZA 3VGLA 4E7HA 3WEEA 4BR7A 3VOVA 3CG7A 1XWLA 4H5WA 1L5UA 1S22A 3BP8A 4DCHA 2V52B 3DRRA 3AVAA 1S1UA 2WUSA 1C1CA 2BTFA 4OPJA 3THYA 4A5BA 2UYTA 3VENA 2F96A 3R1XA 2YKNA 1Q9XA 1KLNA 1GLCG 5HBMA 4JS4A 1WSJA 3RR8A 4DV1K 2DFHA 2P9NB 3OYMA 1LAWA 3K5NA 4LFAK 1RTDA 3G4SN 2W6LA 1NWKA 2P5OA 3LWLA 3LANA 3RR7A 4YNQA 4KB1A 4DV6K 4FJ9A 3O4NA 4FWOA 3THXB 1DTQA 4G1QA 3TSPA 4EHUA 4N47A 4B3SK 1TVRA 4CVNE 4GV6A 4NXNK 3WQUA 1IO2A 4YDUC 3UKRB 1OH6A 1K6YA 2Q31A 3N4PA 3NAEA 4FWKA 4ICLA 1W97L 4CFDA 3SK3A 3T1YK 1QQMA 3OYCA 3TSQA 4KPYA 4XH4A 2YNHA 3L3UA 3Q7CA 2O8BA 3AVMA 3O80A 1YITN 4R5PA 4JAXA 4W5NA 4CHPA 1D5AA 4IOAL 4DSLA 4O55A 4Z0UA 4BRAA 3LP2A 2P9PA 4AM6A 4FYDA 3QETA 2O8CB 4FLYA 3VF6A 4FZYA 5TKYA 2X6SA 3WNGA 5GAEP 4YY3K 3LDNA 2EWSA 4BGAA 4BACA 2ZWHA 1RT2A 3J7AP 2KW4A 4PHTX 2PY5A 4LC9B 4JI2K 2HF3A 1BA1A 2A6AA 5C25A 4WFNL 1F21A 4J2BA 3CCLN 3O4QA 4IG3A 4QOZB 3LALA 2P5GA 3QICA 2NRXA 4DFMA 1C0UA 2A3ZA 5D3GA 4YOUA 2JWLA 4CF1A 4WFBL 1RTJA 5AQXA 3DXKA 3NBPA 4AHCA 1BUPA 3AO4A 1KCFA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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