4EFHA

Acanthamoeba actin complex with spir domain d
Total Genus 127
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
127
sequence length
370
structure length
364
Chain Sequence
VQALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHTGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMHTAASSSALEKSYELPDGQVITIGNERFRAPEALFQPSFLGMESAGIHETTYNSIMKCDVDIRKDLYGNVVLSGGTTMFPGIADRMQKELTALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKEEYDESGPSIVHRKC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Multiple Forms of Spire-Actin Complexes and their Functional Consequences.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Actin-1
molecule tags Contractile protein/transport protein
source organism Drosophila melanogaster
total genus 127
structure length 364
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-03-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4efhA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4efhA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 4efhA03
4AM7A 4EHUA 5AZIA 1GLAG 2ZGZA 4DHYA 2QWNA 1YUWA 4EFHA 4EIAA 5BRDA 4PL7A 5BREA 1QZ5A 2GELA 2KHOA 4O5FA 1V4TA 1ZC6A 3MN5A 3L0QA 3UKUA 3WXKA 3VESA 3VEVA 1TUYA 4PKIA 3D2FA 3W3DA 2E88A 1LCUA 4H0TB 3H45C 5AQQA 5BPLA 1MWKA 1NGDA 4WQ4A 1J6ZA 3O6WA 3VEXA 5AQNA 2P9UB 1JCFA 5AZJA 4XH4A 3L6QA 3LDPA 4PL8A 1TUUA 1DEJA 4FSVA 3HSCA 3EL2A 3EZWA 1HKBA 4L3QA 3SK3A 1NWKA 2YHYA 2IVPA 3LM9A 1Z6RA 5EVZA 4H0XB 5AQOA 3CI5A 4K25A 4GY2B 3VF4A 2HF3A 5BN9A 2GWKA 3VENA 3ZX0A 3U9DA 3O5BA 4BRNA 3CJBA 1MA9B 2P9UA 4H03B 4PKHA 1BOTO 3EO3A 4BR9A 3O08A 4BRFA 4MLEA 3ATVA 3VPZA 3ZETA 3P4IA 4GNIA 3ENHA 4CZEA 3MCPA 5EXWA 2HF4A 1V4SA 2W40A 4A2AA 3QB0A 3M6GA 4B1ZA 4K42A 2GUPA 3H6EA 5LJVA 3FGUA 3CJ7A 5AQSA 3MN9A 1X9JA 4BR4A 1NM1A 3VF6A 3FZMA 1BG3A 3H1QA 2ASMA 4QS7A 2QWPA 2NZTA 3BF3A 2IIRA 3DXMB 3VEYA 3HM8A 4BC3A 3JS6A 4J8FA 4JD2B 1U6ZA 3I8BA 4BRKA 5KPRA 2P9LA 4NB4A 5B8HA 1T44A 4FO0A 3WUHA 2E1YA 3EN9A 1X3MA 3A0IX 5AQKA 2P9SB 4FWMA 5AQZA 4YDUC 2UYTA 3O80A 3CQXA 3IFRA 5BR9A 3CJ1A 1GLCG 3B8AX 4YDUA 3FE1A 4BC5A 5KQ8A 1KXPA 4JHDA 4LC9B 2W41A 1C0GA 1SZ2A 1MDUB 3CQYA 3OHRA 3QDKA 1P8ZA 4K41A 4MO4A 4ISFA 1K8KA 2BUPA 1U2VA 4H0VB 2VCPA 4H5TA 1YAGA 3QFUA 4H5WA 5AQWA 1LOTB 4BQZA 3WQTA 5BRFA 2P9NB 3WXLA 3QICA 2GEMA 1T6DA 4KBOA 3LDOA 1G99A 2QWQA 5BRHA 2FSNA 5AQFA 3BP8A 2OANA 4RTFD 3MDQA 1NLVA 3GOIA 3ZEUB 3DJCA 3FZHA 3MMVA 2FXUA 1E4GT 2QXLA 5AR0A 1ESVA 1HKGA 3ENOA 4I6MA 3R8EA 5LJWA 3EKSA 3RSEB 4CI6A 2ZGYA 3VGKA 2HMPA 4FWKA 3H3OB 4E1JA 1NGCA 2QWRA 2ASPA 1NGFA 4CJ7A 2P9IA 3FZFA 4BRPA 3HBTA 4HTLA 4FWOA 4XH1A 3GBTA 1QQNA 4CZJA 3IMXA 3SJHA 2BTFA 4MO5A 4BRMA 2E1ZA 1OKJA 3U9ZA 3DWLA 3RSEA 5AQLA 3HZ6A 2YI1A 3CERA 2Q0UA 4WQ4C 5JLHA 5E26A 1BDGA 3O1WA 5EOYA 3UKRA 2FSJA 2Q1NA 3A8YA 1RFQA 4BG8A 1NGHA 1GLDG 2NLXA 2F9WA 3CJ9A 5AFUH 1Y64A 1GLEG 5KPTA 2E2QA 4BQLA 2PBDA 2E2PA 1XC3A 1KAXA 1YXQA 3DAWA 5AQXA 4B1XB 3R9PA 5AQHA 2ITMA 4QS8A 1SQKA 1H1VA 4BVOA 3WEEB 4EAHD 4IO8A 4FPBA 3BUZB 3EKUA 3TU5A 3D7EO 3ZX3A 5BPMA 4FWSA 1NGJA 4FWRA 2A42A 4IWVA 3QMLA 4FWQA 5AQMA 1BUPA 2D1KA 2FF6A 1ZXOA 3ULEB 5AQRA 3R6MA 4BRQA 2V52B 2E2OA 2ZF5O 3FLCO 3M3ZA 5KQDA 4BROA 2I7PA 1EQYA 3O8MA 2HOEA 1WOQA 4Z94A 2YHWA 4BRDA 2PAVA 2NRHA 1S22A 5AQPA 4BRLA 1KAYA 2Q31A 3LDQA 3WQUA 3UB5A 2I7NA 1GLFO 1RGIA 3WXJA 3ULEA 4Y0WA 3SMSA 4CZKA 2P9PB 5AQVA 4IJAA 3VGLA 1XUPO 3KHYA 2GWJA 1YVNA 1QHAA 2AP1A 5AQIA 1HJOA 5E84A 2VYPA 3MN6A 4BREA 2QM1A 4CZFA 2CGKA 4IZ9A 4CZHA 2D0OA 2E20A 3ATUA 5FPNA 4FOEA 2CH5A 1HX1A 3FZLA 3MK6A 2A41A 3FFKB 5ADXH 1BO5O 1GLJO 1MWMA 3DXMA 3UE5A 3CIPA 3VF2A 4JD2A 2Q2RA 5JMVA 4CBUA 4AM6A 1CZAN 4MLHA 5KPZA 4K43A 4HWIA 3H3NO 4B1WB 2P9SA 2QW9A 4BRCA 2V7ZA 4IXCA 2AA4A 4ISEA 2IVOA 2Q36A 5JLFA 1NBWA 1ATSA 4JNEA 5ELZA 3U8XA 4BGAA 1TYQB 3BEXA 3GG4A 1BWFO 2D4WA 3VGMA 1ATNA 3A5OC 2E2NA 2P9NA 3AAPA 1Q18A 3CJAA 1NMDA 3C7NB 4M63C 5AFUA 3ZEUA 3LDLA 2P9KB 3A5MC 5AQGA 5TKYA 3WT0A 5AQUA 4BVPA 1BU6O 1D4XA 1HUXA 3QFPA 2FLOA 4RWTA 3UKUB 4JAXA 3SMPA 4B9QA 2GTDA 4JN4A 3D2FB 4BRHA 3S41A 1C0FA 2F9TA 3CHWA 1KAZA 1HPMA 4FWPA 5F0XA 3H46O 1NGIA 3MN7A 5AZJB 4C23A 3C7NA 2P9KA 2V51B 5FPDA 2WUSA 1NGGA 3A5LC 4H5RA 3BF1A 3DXKB 3J8AA 4BR0A 2YJFA 2YJEA 2ASOA 1RDWX 4XH5A 4CZLA 5I9EB 4H5NA 2QWMA 4QS9A 4XEIA 3GL1A 3KZBA 3VERA 4H5VA 2YCHA 4CZMA 4IJNA 3GE1A 3VETA 3SLCA 4CD3A 3H1VX 3WEEA 4A2BA 3KVGA 3LDNA 3ZETB 2DPNA 3M1FA 3DXKA 3CJCA 2J4RA 4CBXA 3FZKA 3AY9A 1XQSC 3I33A 1QQMA 3U4LA 2FF3B 4DQ8A 2QWOA 3ID8A 1NGBA 5EY4A 3TPQA 4CD1A 1S3XA 1IJJA 2V7YA 1BA1A 2YHXA 2CH6A 2D0PA 3AARA 3O1BA 1WUAA 4BR2A 4BC2A 2CGJA 2A3ZA 4M7YA 3VEWA 5ADXA 2A6AA 5FPMA 3LM2A 4H0PA 5EX5A 3QBWA 4H0OA 2P9LB 1JCGA 5LY3A 3FR0A 3HI0A 4BGBA 4WQ5C 3D2EB 2Q0RA 1T6CA 3L4IA 4CZGA 1ATRA 4O8KA 1JCEA 2P9PA 5FPEA 5JICA 4WQ5A 4B1UB 1NGEA 4WYBA 2Q97A 3QBXA 3LL3A 2A40A 4BRAA 3IDHA 4FWNA 2FSKA 4BG9A 1DGKN 4FPAA 3C0BA 3GDQA 4H0YB 1GLBG 2ZWHA 3HTVA 4JHDB 1SAZA 1BA0A 1ZBSA 4A62A 4BRIA 3D2EA 5F1XA 3VOVA 4DCHA 1K8KB 4M7XA 4BR7A 1U2VB 3VEOA 1HKCA 1Z05A 4FWLA 4F9OA 3AAQA 4CZIA 1IG8A 1DKGD 3ZX2A 2CGLA 5CE3A 1NGAA 5AQYA 4B1YB 4ISGA 4I6MB 4BRGA 4EHTA 4FOIA 4NO7A 4DB3A 4BC4A 4PKGA 4B1VA 3O4WA 4CBWA 1QZ6A 3A5NC 4FL9A 2EWSA 5BPNA 1X3NA 2P9IB 1GLLO 2A5XA 3F9MA 3W0LA 3G25A 5AZIB 3JXUA 1QQOA 4BR5A 2QWLA 2E8AA 2H3GX 5F2RA 1R59O 2IVNA 1TYQA 2VWBA 5AQTA 4A61A 4RCHA 1HLUA 3IUCA 3UKRB 5AQJA 3WXIA 5BN8A 3VEZA 1E4FT 3CETA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4AM7A 1YTUA 4EFHA 3SV3A 1VQ7N 4FLYA 4JKBA 2GELA 1OVQA 3DOLA 1L3UA 3CYMA 2KHOA 4O5FA 1V4TA 1BGXT 1C1AA 4E7HA 2WOMA 3VEVA 3IRXA 3SQ0A 1HYSA 4PKIA 3QINA 4EZ9A 2E88A 1LCUA 5AQQA 5M1FA 1KC8O 1LWEA 4KHPK 1J6ZA 4O0IA 1RCHA 2A1SA 2NRVA 1DTTA 1DEJA 3SQ1A 5GAHP 4JI5K 2R7YA 4FK4A 4YOWA 4W5NA 3EZWA 1HKBA 3LP3A 4L3QA 3SK3A 1NWKA 4DF8A 2IVPA 3AA3A 1BL3A 5EVZA 2GWKA 5SZTA 3ZX0A 2F7TA 3VQCA 3U9DA 4BRNA 1VQ5N 4LF6K 1BOTO 3EO3A 1ZBIA 2QA4N 2YKNA 5C0YA 4ILJA 4OKJA 3TSPA 1NK8A 3DYAA 3MCPA 4CF9A 4CGIA 1VK0A 1I39A 4I9LA 2YHBA 1TKDA 3I0SA 1V4SA 4WE1A 1N34K 4A2AA 4K42A 4YOVA 2GUPA 3MN9A 1X9JA 4BR4A 3OYNA 3CCVN 1BG3A 5JENA 3AVCA 2IAJA 4DTOA 4DQQA 2NZTA 2HHSA 2IIRA 1C0TA 4CEDA 4DV1K 4J8FA 1NJYA 3OYAA 4NB4A 1BI4B 4K8ZA 5B8HA 3LWMA 1VQKN 2E1YA 3EN9A 1X3MA 2KKZA 3V9SA 2VG5A 4KHNA 4FWMA 4BDZA 5E41A 3ZSXA 4AHSA 3OYJA 1NU0A 5M1NA 2RE2A 2G8IA 4YDUA 1I94K 5KQ8A 4OX9K 3P31A 4EZ6A 2W41A 4F3OA 2C1GA 2HW3A 1K8KA 1Y97A 4H5WA 3QFUA 3VQQA 3E9OA 1LOTB 4ILGB 3AVLA 2OPPA 2P9NB 4KBOA 1G99A 3BP8A 1VSKA 1NLVA 3ZEUB 1VQON 2QXLA 3TAMA 1ESVA 3NH2A 4I6MA 5LJWA 2IDOA 5J2NA 2HMPA 1Z25A 1VRUA 3H3OB 4FWKA 3OYDA 1HNIA 4CJ7A 4PWDA 4CHQA 5GINA 3HBTA 4DR4K 2IGIA 4KTWA 2HBJA 4OLBA 3GBTA 4JEPA 2BTFA 2FBVA 3RSEA 3HZ6A 2WC9A 5DM6L 4JS4A 3K5LA 3OY9A 3UKRA 4KFBA 4DTJA 4CJ4A 4EP5A 1GLEG 4CVNE 4FJ5A 3DAWA 4H4OA 4QS8A 1ZBFA 5KRTA 1SQKA 4BVOA 2OPRA 4IO8A 4CE9A 3K5MA 2Y1IA 2O8BB 3QEPA 2HVHA 2Y1JA 5BPMA 3TANA 1RTIA 3AVBA 2A42A 4IWVA 4FWQA 4KHUA 1BUPA 5D3GA 4E7JA 1NJXA 3BDPA 2V52B 2HHVA 3HPGA 4W5RA 3KK3A 3FLCO 1RT1A 5KQDA 2I7PA 4JI2K 1WOQA 4Z94A 1YI2N 2AJQA 3SNNA 3TTDA 2PAVA 1HQEA 2NRHA 3CF5L 1S22A 1SS6A 3CM5A 4BRLA 3ITHA 3UB5A 5M1KA 2I7NA 2W42A 5SWMA 1RT7A 3SMSA 1NOYA 4J2EA 4IJAA 4GV9A 3VGLA 4B3RK 3KHYA 2GWJA 3HOSA 1YVNA 1QVGM 4H4MA 5E84A 4FM0A 3KK2A 4KI4A 5HP1A 1VQ6N 2ZJPL 1FKPA 4Z4HA 3L3VA 2HNZA 3VQEA 2D0OA 2E20A 3NCIA 4UY8O 5FPNA 4NXMK 4FOEA 4Z0UA 3PO5A 4IOAL 2CH5A 1HX1A 3J80O 5HROA 4WCEL 3FZLA 2O4IA 5ADXH 4DLGA 1QVFM 2O8DA 1JLEA 1I3AA 4Q5VA 5JMVA 4MLHA 3QEVA 3THYA 3CC2N 1VSDA 4K43A 3QETA 3HT3A 2Q3SA 3OA9A 1KFDA 2QW9A 5GAEP 3CFOA 2IOCA 1KQSM 2AA4A 4ISEA 2Q36A 3OBYA 4H8KA 3AVNA 3TAGA 1NBWA 1ATSA 1HQUA 3AO2A 4JNEA 2F8SA 4R79A 3V9XA 2G8UA 4GVEA 1BWFO 2D4WA 3EY1A 1JLFA 4E7LA 1JL1A 2UUAK 4FK2A 3A5OC 4KB1A 1VRTA 3QIPA 2P9KB 3A5MC 4MQ3A 3WT0A 4BVPA 1BU6O 1D4XA 2FLOA 1JLGA 4RWTA 4CJKA 4C1NK 4CFBA 1LAVA 4CIEA 4JI7K 3G4SN 1ITGA 3JSMA 5FRMA 4FWPA 5F0XA 4YNQA 3H46O 4FJGA 1QTMA 3V1QA 3E1YA 2JLEA 3C7NA 3NHGA 4AHCA 2V51B 4PUOA 1NGGA 3A5LC 4IG0A 4CERA 5FROA 3NH0A 4MDBA 4BR0A 2YJEA 2ASOA 1NK0A 4K0KK 2HHXA 2P51A 4XH5A 4CZLA 1M1KO 3CQ8A 2QWMA 4QS9A 1QSSA 2ZQBA 2NRZA 4XEIA 2O8FB 3VERA 1D9DA 3ZT2A 2YCHA 4F2SA 1KVAA 3GE1A 2HHIA 3SLCA 3LZIA 2GUIA 4X66K 3RTVA 1YJNN 4KH6A 1X9WA 3CYGA 3I55N 4WFNL 3F2KA 4OKEA 1T03A 3ISNC 3AY9A 4BE2A 3I33A 3VA0A 2P5GA 4E72A 4CGFA 1GOCA 3TPQA 4DV0K 3SAHA 2V7YA 2CH6A 2BGGA 1TAUA 4BY9C 4BR2A 4BC2A 2CGJA 2KQ2A 2X6NA 4DV3K 3NFAA 4JKAA 5FPMA 3OBWA 3TARA 4H0OA 3HI0A 3KK7A 3AVFA 5GIOA 2Q0RA 4CZGA 1ATRA 4HTUA 2P9PA 4M3ZA 3OJSA 4Z4GA 4WQ5A 1N6QA 3DLBA 2KFZA 3LL3A 3TAPA 2FSKA 1SUQA 4BG9A 1C0UA 3C0BA 3GDQA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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