4EFHA

Acanthamoeba actin complex with spir domain d
Total Genus 127
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
127
sequence length
370
structure length
364
Chain Sequence
VQALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHTGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMHTAASSSALEKSYELPDGQVITIGNERFRAPEALFQPSFLGMESAGIHETTYNSIMKCDVDIRKDLYGNVVLSGGTTMFPGIADRMQKELTALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKEEYDESGPSIVHRKC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Contractile protein/transport protein
source organism Drosophila melanogaster
publication title Multiple Forms of Spire-Actin Complexes and their Functional Consequences.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Actin-1
total genus 127
structure length 364
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-03-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4efhA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4efhA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 4efhA03
4HWIA 4FPBA 1KAXA 1HKBA 2CGKA 4GY2B 4BR5A 4JHDB 1HKCA 1NGHA 2E88A 4O8KA 4FWPA 4AM7A 1NGDA 1HKGA 1YVNA 3MN6A 3R8EA 2P9NA 3VGMA 4BRLA 3ENOA 4BRNA 3UB5A 5KPZA 2WUSA 2F9TA 1GLFO 3ZEUB 1MWKA 3VF4A 3FZFA 4FWMA 1NBWA 3QFPA 3IUCA 4K42A 1S22A 3R6MA 2CH5A 1R59O 3ULEA 3FZKA 3LDQA 2QW9A 3R9PA 4RTFD 3O1BA 2P9PB 2VWBA 2VYPA 5F0XA 2QWNA 4F9OA 2P9LB 4QS8A 3D2FA 3DJCA 5FPNA 1E4FT 5FPMA 2HOEA 3I8BA 3WXJA 3H3OB 4EHTA 1RFQA 4I6MB 4YDUA 1T6CA 3AARA 3ID8A 2BUPA 3O80A 1SQKA 3RSEA 1DGKN 2A42A 2QWOA 4B1UB 1LCUA 4IXCA 4CJ7A 5AFUH 5AZIB 3LDPA 2CH6A 3ZEUA 4BR9A 2DPNA 5EX5A 4CI6A 3MMVA 1ZXOA 5AQFA 3BEXA 5LJVA 5BPMA 4IWVA 4H5NA 5EY4A 3WT0A 1J6ZA 1WUAA 3IFRA 4JD2A 5AFUA 3O4WA 1OKJA 2Q36A 3AY9A 2AA4A 4BROA 4CZHA 1U6ZA 2YHYA 3CJCA 4B1YB 4FWNA 3LDOA 2ITMA 4CZMA 3C7NA 2P9IB 5AQRA 3SLCA 3A5LC 2P9KB 2YHXA 3G25A 3QMLA 1MWMA 1K8KB 3FR0A 1HUXA 4IJAA 2GELA 3AAQA 3QBWA 4QS9A 1G99A 1TUYA 2GWKA 5FPEA 5AZJA 1NGCA 1NM1A 1RDWX 4CZFA 4C23A 3FLCO 4HTLA 3HZ6A 4ISFA 4FWLA 5AQXA 4E1JA 4GNIA 2ZF5O 3EKSA 5EVZA 5LY3A 4H5RA 3U9ZA 4RCHA 1E4GT 3VGLA 3A5OC 2A3ZA 3O5BA 4FWOA 2P9NB 4Y0WA 3W3DA 1QHAA 4BC5A 4BR0A 2A40A 3CQYA 1ZC6A 2ASOA 4NO7A 3HI0A 4BRKA 3U8XA 4BRPA 3CIPA 1HLUA 5ELZA 2YI1A 2GWJA 2E8AA 2P9IA 3CJAA 3FE1A 1IJJA 1NLVA 2NRHA 5AQVA 4MO4A 3A8YA 3ULEB 3VERA 4FWRA 5BPLA 1JCGA 1XUPO 2IVPA 3FZMA 1BWFO 1X9JA 3HTVA 1NGJA 2BTFA 4WYBA 4FWKA 1NGIA 2ZWHA 3CERA 4NB4A 4PL7A 2FLOA 2E1ZA 2Q1NA 1BOTO 2J4RA 3BF3A 3UKRA 3O8MA 5BN9A 3U9DA 4M7YA 2FSJA 3RSEB 4H0PA 3WUHA 4CZLA 5F2RA 1NGEA 4BC2A 1SZ2A 3CHWA 4CBWA 3M1FA 2D0PA 3CETA 2V51B 1T6DA 4PKGA 3TU5A 3HM8A 2HF3A 5LJWA 2A5XA 3H46O 4ISGA 2P9SA 1BO5O 1KAZA 2E2OA 4JD2B 2F9WA 4M7XA 3S41A 4A2BA 3HSCA 4FOEA 1GLCG 4A62A 1SAZA 1ESVA 2E2PA 3C7NB 3QFUA 2UYTA 1CZAN 1EQYA 1Y64A 4YDUC 5KPRA 2Q2RA 1V4TA 3QB0A 3H1VX 3CI5A 5KQDA 3IMXA 4K43A 3UE5A 5AZJB 3SMPA 2NZTA 4XH4A 1GLAG 3H45C 2E1YA 3IDHA 4IJNA 1ZBSA 1P8ZA 3KVGA 4QS7A 3CJ9A 1S3XA 2ZGYA 3QBXA 4H5VA 3VOVA 5JLHA 2QWRA 3GE1A 1ATNA 3KZBA 4EHUA 5AQYA 4BC4A 4J8FA 3L6QA 4BRHA 3JS6A 4JAXA 2AP1A 3LDNA 4B9QA 5EXWA 1BA0A 4CBUA 5BN8A 4H0OA 4FOIA 1MA9B 2OANA 2I7PA 5JMVA 1Z05A 4CZGA 4FO0A 1YAGA 1QQOA 2ASMA 4WQ4C 3HBTA 1QQMA 3VEOA 3ZETA 5BREA 3M3ZA 4DQ8A 1GLEG 1MDUB 1H1VA 5BRHA 3WXKA 3SMSA 3ZX3A 4KBOA 5AQTA 3U4LA 1HJOA 3SK3A 2PBDA 4BVOA 3A5NC 3O1WA 4MO5A 3GL1A 3UKRB 1U2VA 1IG8A 5AQJA 1BA1A 2Q31A 2FF3B 5AQZA 4BQLA 3H3NO 3FZHA 4BG8A 1Q18A 1X3MA 1HPMA 1GLBG 3WXIA 4DHYA 4ISEA 2FF6A 2CGLA 2P9UA 2VCPA 1D4XA 2HF4A 3DXKA 5BRFA 3EO3A 4RWTA 2A41A 4BRCA 4XH1A 2P9SB 4CZEA 3AAPA 5BPNA 2FSKA 2QXLA 3EN9A 2QWLA 3BF1A 4BGBA 3LM2A 5B8HA 3BP8A 3FGUA 1NGGA 4H0TB 2YHWA 5E26A 4CZJA 4Z94A 2GUPA 4B1WB 3WQTA 3DAWA 4H5TA 4B1VA 4PKHA 4JN4A 1YUWA 3D2EB 5AQUA 4BVPA 2ASPA 3VEWA 3LL3A 1DEJA 3EL2A 3VESA 2HMPA 4CBXA 4BR2A 1XQSC 3MDQA 3QICA 3VEZA 2IVNA 3ATUA 4FSVA 4M63C 3VEXA 4B1XB 3WEEB 3VENA 1V4SA 1KAYA 4WQ5A 2D4WA 5EOYA 3D7EO 3FFKB 3KHYA 1HX1A 3W0LA 4EAHD 2V7ZA 4A2AA 5BRDA 3VETA 2D1KA 5E84A 3GDQA 3BUZB 3UKUB 1TUUA 4PL8A 5ADXA 2FXUA 3CJ7A 4BG9A 1NGBA 4H0XB 5KQ8A 2GTDA 4BRMA 4FL9A 2IVOA 5AQMA 2CGJA 2E2QA 1NMDA 2D0OA 3D2EA 1BUPA 4FWQA 3ZETB 4IO8A 4BRIA 3MN7A 4BRQA 5AQHA 4BR7A 2Q0RA 3CJ1A 1DKGD 3OHRA 3JXUA 5AQOA 3TPQA 4EFHA 1BDGA 3EZWA 2W40A 3F9MA 4XH5A 1QZ5A 4K41A 4O5FA 4H0VB 3L0QA 4K25A 4FPAA 1Z6RA 3WEEA 5AQQA 2I7NA 1YXQA 1U2VB 5AQLA 3A0IX 3WXLA 2Q97A 2YCHA 5CE3A 1LOTB 5AQPA 5F1XA 3M6GA 2NLXA 5AQNA 1TYQB 3GBTA 2P9UB 4BC3A 3VEVA 1GLJO 3DXKB 2YJFA 4JHDA 4CD3A 1ATSA 3ZX0A 4BRGA 3UKUA 3QDKA 2EWSA 5I9EB 3MN5A 5BR9A 3CJBA 5AQSA 4PKIA 2V52B 4BGAA 3J8AA 1X3NA 1KXPA 4H03B 2QM1A 4IZ9A 3ATVA 4BREA 1NGAA 2QWQA 4JNEA 3LDLA 3VF6A 1QZ6A 1RGIA 4DB3A 4BQZA 5AQWA 4FWSA 3WQUA 3MN9A 4CD1A 2W41A 4BRDA 4MLHA 4BR4A 3VGKA 2QWMA 1BG3A 4H0YB 4A61A 2QWPA 3LM9A 3DWLA 2P9PA 4L3QA 1GLDG 5AR0A 1NWKA 2P9LA 5JICA 1TYQA 5TKYA 4XEIA 1JCFA 5FPDA 2YJEA 3L4IA 2GEMA 2KHOA 3DXMB 4BRFA 4WQ4A 3H1QA 4I6MA 3O6WA 4DCHA 3CQXA 1T44A 2E20A 4CZKA 2IIRA 2V7YA 1JCEA 3MK6A 2E2NA 5AZIA 1NGFA 1WOQA 3GOIA 3O08A 5JLFA 4B1ZA 4LC9B 3ENHA 4AM6A 2Q0UA 1XC3A 3P4IA 4H5WA 3VF2A 2ZGZA 3FZLA 4EIAA 5AQKA 1QQNA 3H6EA 3A5MC 4WQ5C 1C0GA 3MCPA 4MLEA 2H3GX 5AQIA 3VEYA 4CZIA 2P9KA 1C0FA 2A6AA 2FSNA 3B8AX 3C0BA 3ZX2A 1K8KA 3EKUA 5KPTA 3I33A 1BU6O 3GG4A 1ATRA 3SJHA 4BRAA 5ADXH 5AQGA 3DXMA 3D2FB 3VPZA 2PAVA 1GLLO
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1Y97A 4HWIA 1KAXA 1HKBA 4BR5A 4GY2B 4JHDB 2FBVA 1HKCA 4CF9A 1JLBA 4O8KA 3V9XA 1YITN 3ITHA 1HKGA 1YVNA 4E0DA 4B3RK 3RVCA 1SS6A 4YOVA 4BRLA 3LP0A 3KD5E 3SV3A 3ENOA 1XHXA 4CF0A 3DRPA 1MWKA 5JVHL 2XY7A 4CHZA 3VF4A 3KKSA 1QVGM 2ATQA 1QVFM 3O4QA 5IWAK 4RW6A 3FZKA 1KLNA 3OYCA 2QW9A 4CW7B 1Q9YA 4JS4A 2P9PB 3DI6A 1RTDA 4PY5A 3CCJN 3NF6A 1NK9A 2OPRA 1HJRA 4I6MB 2QK9A 4FZYA 3RMDA 4E89A 3ID8A 4LSNA 2BUPA 2A42A 5DM6L 2QWOA 1K73O 4O8UA 1RT4A 3HPHA 5C2FA 4DSIA 2B4JA 5EY4A 2IDOA 2Q36A 3AY9A 2AA4A 4IFEA 4CZHA 4CJRA 3SUPA 3MXIA 3LDOA 3PIOL 3ZT2A 3LPUA 3V9ZA 4W5QA 4CIEA 4RW7A 4FJ9A 2E4LA 4B8CA 4JI8K 3G25A 4AF1A 1VQNN 5GAEP 3EZ5A 4EP5A 2Z1IA 3CQ8A 4GV6A 2X78A 3TTFA 2Y1JA 1SKSA 4ILGB 4JI7K 1RBRA 5EVZA 3ENBA 4RCHA 2KW4A 2R7YA 3VGLA 4CHQA 3O5BA 2O8EB 4FWOA 4DR1K 4DR3K 4Y0WA 3W3DA 2HHWA 4ELUA 4BR0A 4FLUA 1DT9A 3HI0A 3TABA 1VK0A 4HHTA 3BZCA 4DQSA 2YI1A 4W5RA 1JL2A 1IKVA 4YFUA 1J5OA 2HHSA 1NLVA 2NRHA 4KHSA 1S9GA 4JK9A 3IKMA 3OYIA 1BWFO 1X9JA 3HTVA 4DUYK 4CJVA 2E6MA 5GAGP 2ZWHA 3J7ZO 3NGIA 1HR0K 4EP4A 2Q1NA 3MWTA 4WFBL 1BOTO 3KLHA 4M3YA 2J4RA 3BF3A 2C1IA 2OZSA 3CC7N 5BN9A 3R3LA 2C1GA 3RSEB 3AO3A 3G71N 4CZLA 5F2RA 4BC2A 1SZ2A 3CHWA 3J7YP 3M1FA 1QTMA 2AJQA 3P39A 1GOCA 2G8FA 1Q82O 1FXXA 1L3SA 1BO5O 1KAZA 1ASWA 1W97L 2E2OA 3OYBA 1YTUA 2F9WA 4FJ8A 2EHGA 2HHVA 3LZJA 2HBLA 1N34K 1DTQA 1S1XA 3C7NB 3L8BA 1KSPA 3N4PA 5C24A 1DLOA 1Y64A 4YDUC 2B6AA 1RT7A 2Q2RA 3ZSVA 3C6AA 1KRPA 1W9HA 3H1VX 3DM2A 1VSEA 5KTQA 3IMXA 1J5EK 4YOUA 5AZJB 2YX6A 4O0IA 2BANA 3I55N 5T7BA 3QIOA 2A1RA 3LALA 3NDKA 2ZGYA 4H5VA 1VQPN 1L3UA 2QWRA 2X6SA 1U49A 4DV5K 2ZQBA 3AO5A 4BRHA 3K9KA 2FC0A 3PV8A 5GAHP 5C0YA 1FK9A 3LDNA 4DQPA 3PSFA 5I3UA 1Z26A 1ILYA 5LL6Z 1MA9B 2OANA 5JMVA 3O9QA 4M3RA 2F4VK 1RTJA 3H08A 4FJ5A 4FO0A 1NJWA 1QQOA 1HNZK 5GINA 1CLQA 3L3VA 1QQMA 3VEOA 3ZETA 4OPAA 4BE2A 3M3ZA 4DQ8A 4ZTFA 1H1VA 3WXKA 3ZX3A 4KBOA 4JRPA 2FBTA 4KB0A 4MDAA 1S72N 4JKAA 1Q7YO 4MO5A 1SKWA 1TK0A 2Q3SA 3GL1A 1REVA 3QLHA 5AQJA 1LWEA 4CF2A 4EZ9A 1Q18A 3CM6A 3SI6A 3RR7A 2P9UA 4DQRA 3EEQA 2WONA 3K59A 3OW2M 2A41A 4AHVA 2O8CA 2P9SB 4CZEA 2FSKA 2QXLA 1C1BA 3FGUA 3DRSA 2YHAA 2YHWA 4CJ3A 4Z94A 3TR8A 3S5TA 4KH6A 4H5TA 4CK1A 4PKHA 4DR7K 4FVMA 1YUWA 3VEWA 3OS1A 3VESA 3SQ4A 3KK2A 3S3OA 4BR2A 3ZYYX 3P83D 1T05A 1IV0A 2IVNA 4WE1A 3MEEA 3WEEB 2W6LA 3VENA 3NMUA 4O55A 2HNYA 3VTHA 4YOTA 5EOYA 3D7EO 2DFFA 3AO4A 3FFKB 3KK3A 3KHYA 2PZSA 3D6RA 2XO7A 5A2QO 5BRDA 2D1KA 1W7AA 3VQAA 4M3ZA 3QIPA 4N56A 2O8FA 5ADXA 4AQYK 3AVGA 2UUCK 1NGBA 3LPTA 5KQ8A 1WLJA 4NYFA 1TGOA 3HM9A 3QEIA 4B08A 3PY8A 1CXQA 3OHRA 3TSQA 4CGIA 1NJZA 5AQOA 3TPQA 3DRRA 4EFHA 4XH5A 2W40A 1S6QA 4FPAA 1Z6RA 4CEZA 3B6OA 3WEEA 5AQQA 1VHXA 4KH5A 1XMQK 3WXLA 4CJSA 5CY4A 4O0JA 4UY8O 4JV5K 2HNDA 5F1XA 1NG9A 3M6GA 4KI6A 1GOBA 2HBJA 1K8AO 1TYQB 2KZMA 3F5TA 3GBTA 5HBMA 3VEVA 4CJPA 2YJFA 4LF5K 1RDAA 2EWSA 2RE2A 4KHWA 3DOLA 3MX5A 1RNHA 5KRSA 3DMJA 1L3VA 2FBXA 4PKIA 5M1PA 4DF8A 2V52B 4UQGA 4HCCA 4B9TA 3J8AA 1O13A 2IOCA 2QM1A 4H03B 4IZ9A 4BREA 4CGJA 4JNEA 4LSLA 3LDLA 3K2PA 4FWSA 1BIUA 1EETA 4CGHA 1SL2A 4BRDA 3I0SA 4FM2A 4JI2K 2YNGA 2QWPA 3LM9A 3AVMA 4PHTX 1HQEA 2NRXA 1NWKA 5JICA 1TYQA 5TKYA 4HCBA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 3K5L A;  5CE3 A;  1IKW A;  1A5V A;  1KD1 O;  3QNO A;  5AQN A;  4BDP A;  2BE2 A;  1EWR A;  3DXK B;  3CFR A;  1NJY A;  5J2M A;  4FJX A;  4LY7 A;  5I9E B;  5BR9 A;  1UWB A;  2HW3 A;  1W2B M;  3AVB A;  4BGA A;  2JGU A;  4HTU A;  3AVL A;  4NLB A;  2RF2 A;  2QWQ A;  4FLT A;  3OYM A;  1QZ6 A;  4BQZ A;  5AQW A;  3WQU A;  1SL1 A;  4LFB K;  2W41 A;  4MLH A;  4A5A A;  4FW1 A;  3VGK A;  2QWM A;  1VSL A;  3L2W A;  4A61 A;  3E1Y A;  4L3Q A;  2YKM A;  3ZSQ A;  1ZBU A;  5AR0 A;  3N4Q A;  3OYG A;  2P9L A;  4GKK K;  1JCF A;  5FPD A;  4WQ4 A;  3H1Q A;  4DTJ A;  1TKZ A;  2HHT A;  3C6T A;  4DCH A;  1T44 A;  4YOW A;  4CZK A;  2IIR A;  3LWM A;  4FW2 A;  2E2N A;  1WOQ A;  3GOI A;  3O08 A;  4LC9 B;  4AM6 A;  3WNE A;  1XC3 A;  2OYQ A;  2ZM6 K;  3AVN A;  3VF2 A;  3VTI A;  2ZGZ A;  1LAW A;  3ZCM A;  1QQN A;  4N41 A;  4WQ5 C;  4M3T A;  1FKO A;  1W0H A;  5AQI A;  4CGF A;  1E3M A;  1Q81 O;  2A6A A;  1K8K A;  3EKU A;  5KPT A;  2XHB A;  3SJH A;  4MQ3 A;  2P5G A;  4W5O A;  1S6P A;  2UXB K; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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