4H03B

Crystal structure of nad+-ia-actin complex
Total Genus 122
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
122
sequence length
370
structure length
357
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Arginine ADP-ribosylation mechanism based on structural snapshots of iota-toxin and actin complex
pubmed doi rcsb
molecule keywords Iota toxin component Ia
molecule tags Toxin/structural protein
source organism Clostridium perfringens
total genus 122
structure length 357
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-09-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4h03B01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4h03B02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 4h03B03
2FXUA 3ATUA 2BUPA 4IZ9A 3SJHA 1NGGA 4YDUA 3EKUA 3UKRB 3VF2A 3A8YA 2P9KB 2P9LB 2QWPA 5LY3A 3DJCA 1NGJA 4QS7A 1X3MA 4JHDB 2BTFA 1NGHA 1ATSA 2IVPA 3SLCA 3HSCA 4B1WB 3R9PA 1J6ZA 3A5LC 2D1KA 3CQXA 3KVGA 4DQ8A 3G25A 2QWMA 3WQTA 3W3DA 3MN9A 5AQQA 3VGKA 4C23A 4I6MA 3SMPA 2V52B 4BGAA 2A5XA 5TKYA 3ZX3A 2Q2RA 3WEEB 4B1YB 4NB4A 4B1XB 4JAXA 4NO7A 4BVOA 2A40A 2CGKA 2AA4A 2P9SB 3O8MA 4Y0WA 1NGCA 1V4SA 1SAZA 1MWKA 3I33A 4IJNA 1NMDA 4H0TB 5FPEA 3C7NB 1K8KB 1T6DA 2FF6A 1R59O 2V7ZA 5EX5A 5LJWA 5F2RA 2P9PA 2Q0RA 3WXKA 4FPAA 1CZAN 4FWNA 5AQIA 3U9DA 1BA1A 2GWJA 5JLHA 3EO3A 4YDUC 1QQMA 2QXLA 2I7PA 1ATRA 1NGAA 2Q1NA 2ZGYA 4H0PA 4BVPA 1E4GT 2VCPA 4BR0A 4CBWA 2HMPA 1TYQA 4CZJA 2A6AA 3KZBA 3HM8A 3GOIA 3TU5A 1U2VB 5ADXA 5AQMA 3QMLA 1YUWA 3FE1A 2A41A 1GLFO 3CI5A 3DXKB 1S22A 2V7YA 2HF3A 4CZFA 2ITMA 3SK3A 3CJ7A 3ZETB 1XC3A 3L6QA 5EXWA 5F1XA 1EQYA 4BROA 2E2PA 1BDGA 4BREA 3UKUA 4BRPA 4O8KA 4FWSA 3ENOA 5FPNA 3MCPA 4FL9A 3C0BA 3H45C 2ASOA 5AQWA 4JN4A 4LC9B 1RGIA 5BRFA 3AY9A 3AAQA 4BRIA 3WQUA 3DXMB 1SZ2A 3P4IA 3D2FA 3EKSA 3WUHA 2ZWHA 4BG9A 1S3XA 2YCHA 2P9NB 1LOTB 3EZWA 3O1BA 4FOIA 1D4XA 1HJOA 1RDWX 5AQTA 5BREA 4BRNA 2Q36A 3H1VX 1H1VA 3CJ1A 4H03B 4FWMA 4CZIA 1WUAA 2QWQA 2FSJA 1TUUA 3ENHA 5AQUA 3UKRA 3MN7A 2E2QA 2P9KA 3AARA 4FO0A 4K25A 1BUPA 4A62A 1GLEG 4MO4A 5JMVA 2E2NA 2P9LA 2YI1A 3UE5A 3D2EB 1XQSC 2W41A 4BC4A 3ZEUB 3LDPA 4GNIA 4CZEA 3AAPA 3QDKA 1G99A 1YXQA 3LDOA 4CZKA 3O6WA 3QBWA 2D4WA 2Q31A 4EHUA 4BRGA 3IFRA 1NLVA 5AQNA 2E1YA 3LM9A 3A5MC 3VEYA 4H5WA 2W40A 1HKBA 5AQSA 2P9UB 1RFQA 1DGKN 3LDQA 2V51B 5E84A 2Q97A 2QW9A 3L0QA 2VYPA 1XUPO 3KHYA 5AZIA 3VEWA 3W0LA 4BR2A 4H0XB 1BG3A 1Z05A 3HZ6A 4PKHA 2YHXA 1E4FT 4FOEA 1KAXA 4PL8A 4BRHA 2NRHA 4CZGA 2IVOA 2P9SA 2ASPA 3IMXA 3LM2A 4JD2A 4J8FA 4FWPA 3VEVA 1BWFO 3C7NA 1HKGA 4FSVA 4ISEA 4AM7A 2QM1A 1ZXOA 4IWVA 4HWIA 3O1WA 5KPRA 4BC5A 4BC3A 4F9OA 2E2OA 3MMVA 5BPMA 3CQYA 1NGIA 3GDQA 4CI6A 4EAHD 3VENA 4RWTA 3U9ZA 4BRDA 5AFUH 2VWBA 4MLEA 3A5OC 4ISGA 5B8HA 3DWLA 4MO5A 3TPQA 3U4LA 3L4IA 1V4TA 3M1FA 4CBUA 4HTLA 2ZF5O 3WXLA 4IO8A 5JICA 4CJ7A 1JCFA 1U2VA 4H0YB 2KHOA 4H5VA 3UB5A 3DXKA 1X3NA 3FZHA 5AQLA 3A0IX 4L3QA 4B1ZA 3ZETA 2WUSA 5KPZA 4WQ5A 3F9MA 4BRFA 4FWRA 3GL1A 3VEOA 5BPLA 5BRDA 2CGLA 4KBOA 3O80A 3SMSA 4FWOA 2P9PB 1HPMA 4EFHA 3R8EA 3ULEA 3R6MA 5AQYA 1QQOA 5AFUA 2CH5A 3FZKA 3I8BA 4AM6A 3H1QA 3FZMA 1P8ZA 3HI0A 5BN9A 1HLUA 5AQHA 2GELA 3O08A 1SQKA 1TYQB 2UYTA 2ASMA 3BEXA 1DEJA 3WT0A 1ESVA 4ISFA 4JNEA 2P9NA 4GY2B 3IDHA 3VPZA 3D7EO 1U6ZA 3ZX2A 4BRMA 4CD1A 5AZJB 3BUZB 2GUPA 2YHWA 5KQDA 4BC2A 1QZ6A 4H5RA 5ELZA 3CETA 1MWMA 3DAWA 5I9EB 1BU6O 3VOVA 1HUXA 3CJAA 2D0OA 2EWSA 3JXUA 4CZLA 3D2EA 2GTDA 1JCEA 3EL2A 3CJBA 3J8AA 2QWNA 4CBXA 4A2AA 2P9IB 1KAZA 3M3ZA 4CZHA 3MN5A 2HF4A 4K41A 1T6CA 2FF3B 4BRCA 2NZTA 2DPNA 5BR9A 1NWKA 1MDUB 4JHDA 2QWOA 4H0VB 1OKJA 4BR7A 3OHRA 2CGJA 4BR4A 1X9JA 5AQRA 2P9UA 3CJCA 3FR0A 3RSEB 5AQPA 4M63C 5BN8A 5F0XA 1YAGA 3CHWA 4WQ5C 3O4WA 5CE3A 4BGBA 4BR9A 3S41A 2AP1A 3VEZA 3FLCO 4QS9A 4XEIA 4BQZA 1YVNA 4BG8A 4BRQA 2GWKA 4B1VA 4DHYA 3JS6A 1GLCG 5AQXA 3O5BA 2E1ZA 4CD3A 2A3ZA 1GLBG 3HTVA 2E88A 2E20A 3WEEA 1GLLO 2QWRA 4XH1A 5FPMA 1C0GA 2YJFA 4DCHA 1GLDG 1NGDA 2HOEA 3MK6A 3QFUA 4M7XA 4PL7A 4FPBA 2NLXA 3WXIA 2GEMA 5E26A 2OANA 5BPNA 3EN9A 3VF4A 1K8KA 1DKGD 4PKGA 2J4RA 4E1JA 4WYBA 4K42A 5EOYA 4BRLA 4WQ4C 2D0PA 2IIRA 4BQLA 2FLOA 3ATVA 3FFKB 4FWQA 2Q0UA 4H5NA 5AQKA 3VERA 1KAYA 1WOQA 2CH6A 5AZIB 1Z6RA 2ZGZA 5AQGA 4PKIA 5BRHA 5AQOA 3CIPA 2PBDA 3CJ9A 4I6MB 1TUYA 1GLJO 3QB0A 4B1UB 3GBTA 4BRAA 4IXCA 5ADXH 4XH5A 4JD2B 5FPDA 2FSKA 2FSNA 1BA0A 1KXPA 4CZMA 1QZ5A 1MA9B 3ID8A 2F9TA 3QFPA 5KQ8A 3VGMA 2YJEA 3QBXA 1IG8A 4FWKA 5AQJA 4M7YA 1NGEA 3HBTA 3H3OB 3U8XA 3CERA 5AR0A 5KPTA 3VEXA 4H0OA 1T44A 2I7NA 3DXMA 4K43A 1NM1A 3H46O 4MLHA 3LDNA 3MDQA 3BP8A 4RCHA 4BR5A 2YHYA 5AZJA 1GLAG 2A42A 1Y64A 2IVNA 4IJAA 5EVZA 1QQNA 1BOTO 4EIAA 1JCGA 3WXJA 4DB3A 1NGFA 1ATNA 3IUCA 4H5TA 3H3NO 5AQFA 1LCUA 2F9WA 4QS8A 1Q18A 3FGUA 2PAVA 3LDLA 3FZFA 1QHAA 4WQ4A 3ULEB 4RTFD 4Z94A 2P9IA 1HKCA 1ZC6A 3UKUB 3A5NC 2QWLA 3GG4A 4EHTA 3ZEUA 3ZX0A 4O5FA 1IJJA 4XH4A 5AQVA 3GE1A 3FZLA 3MN6A 3BF1A 4A61A 1HX1A 3VGLA 3RSEA 2H3GX 2E8AA 5EY4A 1NBWA 3VF6A 1C0FA 3BF3A 3LL3A 3D2FB 4A2BA 4FWLA 3VETA 3QICA 4BRKA 3M6GA 3VESA 1ZBSA 1NGBA 5LJVA 1BO5O 3B8AX 3H6EA 4B9QA 5JLFA 5AQZA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2FXUA 1JXBA 3SJHA 3MWPA 4DF4A 2RHKA 3UKRB 2P9KB 4FJXA 3L2VA 4F3TA 3OY9A 2OYQA 3SPZA 3V9XA 4RG8A 1X3MA 4DV3K 3SLCA 1ATSA 1DLOA 1JL1A 4N47A 1RT1A 3NAEA 3KVGA 3SV3A 1IO2A 4YOTA 3G25A 4CEOA 5DM6L 3W3DA 4DKWA 4ID1A 3C95A 5AQQA 4C23A 4CJEA 1UAXA 1A5XA 2P51A 1VRUA 4CJQA 4OPAA 3HPOA 1NK9A 3L4QA 3U3GA 2RE2A 5LL6Z 3C6AA 4GMJB 4FM0A 2BDPA 4JI0K 3P1GA 3TAQA 1VQKN 3P83D 1SV5A 3T1AA 2P9SB 3BY5A 1NJYA 1B9DA 1SAZA 2UUAK 2BANA 3I33A 3AO4A 5M1OA 4H0TB 3OS0A 2XO7A 1YIJN 3LANA 5LJWA 5JS2A 4LF5K 3C6UA 3O3HA 4C8KA 4FWNA 5JLHA 4FJKA 1LW0A 2UUBK 4YDUC 2QXLA 1ATRA 4BWJA 3CYGA 4H0PA 4FJNA 3AVFA 4BVPA 3MECA 4CW7B 4BR0A 3P5JA 1EO1A 1K73O 5M1QA 4CEDA 3KZBA 3MAQA 4DR5K 3GOIA 3BDPA 3TU5A 1FKPA 1HYSA 3TAMA 1YUWA 2KFZA 4M3UA 3FE1A 4JRQA 2FBXA 1IBLK 3V6DA 1S22A 3J7YP 4DSFA 4CGJA 4AHCA 1X1PA 1YTAA 1ASWA 3CJ7A 1QSYA 4HTUA 1QE1A 5D3GA 1EQYA 1IBMK 1RTDA 3KTQA 2WTUA 1BDGA 1D5AA 4BREA 1BISA 4B3SK 1EWQA 1YJWN 5FPNA 4KPYA 5AQWA 4JN4A 3JAMO 3DXMB 3D2FA 2NRTA 3LZJA 2VG5A 3DYAA 2YCHA 1TL3A 2P9NB 4LF4K 3EZWA 1HJOA 3KWGA 4DV6K 4L8RB 4PWDA 4H03B 4CZIA 3K59A 1WUAA 3CCSN 2D0AA 5AQUA 4CECA 2KLAA 1HYVA 3ZSRA 2E2QA 3F2KA 3O9RA 4FO0A 3IKMA 2X78A 5JMVA 2P9LA 5HLFA 1XQSC 4E19A 3ZEUB 1BCOA 4GNIA 3AAPA 3V9ZA 3THWB 4AHRA 1JXEA 4Z0UA 4CJ5A 4EHUA 4QAGA 2ATQA 5AQNA 2YNGA 3LM9A 2LSNA 3M5RA 3A5MC 3LALA 4H5WA 4JS5A 3RMBA 2VG7A 1DGKN 1SKSA 2QW9A 4DTJA 5M1PA 3OYJA 4Z4EA 3CCLN 4PKHA 1IKWA 1E4FT 1U4BA 3BZCA 4PL8A 4DV7K 1BI4A 3LPUA 4CHPA 2NRHA 2IVOA 4LF6K 2O8EB 2NRVA 4KH6A 2ASPA 3LM2A 1Q7YO 4JD2A 1LAVA 4J8FA 4FJLA 3THYB 4ID5A 3C7NA 1FKOA 4CIGA 4PY5A 4FSVA 4KHNA 4AM7A 1W7AA 1Q9YA 2O4GA 2JLEA 4BC5A 3SZ2A 3CQYA 3AO1A 2W00A 4CI6A 4FLVA 2FBTA 3U9ZA 1CXQA 4MO5A 4NCGA 3M1FA 1YTUA 1L3SA 4HTLA 4DLEA 4IO8A 2RN2A 4JKBA 5JICA 3QEXA 1U2VA 4H0YB 2F96A 4W5RA 3D0PA 1K9MO 4LFAK 1VHXA 2O8DA 3K0SA 1HRHA 5GAEP 4B1ZA 2O8FA 4CGFA 5J2PA 2W6LA 4CEFA 1BQMA 3F9MA 4B3TK 4R79A 3TAEA 1XHZA 4CK1A 3SMSA 1YVUA 2P9PB 5CYQA 4EFHA 1LWCA 1SS6A 1VQNN 5FROA 3FZKA 5CY4A 3QERA 5BN9A 3SYZA 1VSDA 5AQHA 3THVA 1TYQB 2UYTA 1RCHA 3ZT0A 4JI4K 4O0IA 1WSFA 1U6ZA 5C15A 3QEPA 4BRMA 3BUZB 4CFBA 3O3FA 2QK9A 3DOKA 4BC2A 3NGIA 3HP9A 3EYZA 3HPHA 4I9LA 4I2QA 3PSIA 3CETA 1MWMA 1T7PA 5I9EB 1U49A 1BU6O 3RMAA 2NRRA 4DTPA 4CFDA 2EWSA 3RR8A 1W2BM 4CBXA 4B3OA 3R3LA 4Z4FA 4O5BA 4DSIA 4OVLA 1T6CA 4HHTA 4JI2K 2QWOA 3V1RA 4CJ4A 2GBZA 1RT7A 4WFAL 3CJCA 2VWKA 3R1XA 4FJMA 5F0XA 1YAGA 4WQ5C 3DRRA 1N33K 3S41A 2DY4A 2AP1A 4M3RA 1ZBHA 1KVBA 1QTMA 4B8CA 4Z4CA 4DHYA 4C1NK 1U48A 4HUEA 3MX5A 5HRPA 3O5BA 2E1ZA 4CD3A 3NH1A 2A3ZA 2DFFA 3HTVA 4I2PA 1GLLO 3KK3A 3MK6A 4K8ZA 1CLQA 3WXIA 2NLXA 3K58A 1N34K 1Q82O 5GAHP 3EN9A 5I3UA 4FZZA 4PKGA 1VRTA 4WYBA 4K42A 1C0MA 4KH4A 1Q86O 3FFKB 1VSHA 4FWQA 2Q0UA 5JVHL 4DQRA 2OCEA 1KAYA 5AZIB 2ZGZA 3L3VA 3OJUA 2P5GA 4DFPA 5AQOA 3CPWM 4OPHA 1TUYA 1GLJO 3VTHA 1NJXA 4CIEA 4N56A 4FK2A 4DV0K 1I3AA 4KHPK 2D0BA 3CMEN 1GOBA 4WFBL 2FSKA 4DLGA 2AJQA 5FLXO 4JRPA 2G8VA 4DFJA 1NG9A 5LMNK 1LWFA 2O8BA 4GV9A 2F9TA 3QFPA 1XMOK 1XHXA 1IG8A 4FWKA 5AQJA 4JI7K 1OVQA 2YX6A 1NJWA 3DXMA 3OYAA 3V9WA 4LH4A 3TTCA 3SUOA 2YHYA 5AZJA 1GLAG 1ZBUA 3I0SA 3AA3A 4KO0A 2IVNA 4XJXA 5EVZA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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