4H03B

Crystal structure of nad+-ia-actin complex
Total Genus 122
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
122
sequence length
370
structure length
357
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Arginine ADP-ribosylation mechanism based on structural snapshots of iota-toxin and actin complex
pubmed doi rcsb
molecule tags Toxin/structural protein
source organism Clostridium perfringens
molecule keywords Iota toxin component Ia
total genus 122
structure length 357
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-09-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4h03B01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4h03B02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 4h03B03
4H5WA 4CBWA 2D4WA 2Q0RA 5AQQA 1NM1A 2HF3A 3QICA 5BPMA 2GWJA 5F0XA 4WQ4C 1J6ZA 4MLEA 2P9LB 5ADXA 3D2FB 4QS9A 1X9JA 2P9PB 3MN6A 4FWQA 4FOEA 3WT0A 3LM9A 5BPNA 3EKUA 1P8ZA 2A3ZA 3DXKB 4YDUA 3A0IX 1QZ6A 4CZFA 1IG8A 3BP8A 1NMDA 5AFUA 3HSCA 5KPZA 3RSEB 1BA0A 4K25A 1RDWX 1BOTO 4WQ5C 5AZIB 1MWMA 1GLAG 3VEYA 5E84A 2HOEA 1YUWA 1C0GA 1GLBG 3AAPA 5F2RA 3WXIA 4CI6A 3O1BA 2F9WA 4I6MB 2KHOA 1HJOA 2BUPA 1YAGA 2YHYA 4BC3A 5AQIA 1T6CA 3DJCA 3CJ1A 3CQYA 3EZWA 4HWIA 3AAQA 4BRHA 2F9TA 4BRDA 2P9KB 1BO5O 1MA9B 2ASMA 5AZJB 2FSKA 5FPMA 3QB0A 3VOVA 5JICA 3U9ZA 1S3XA 2P9PA 4BRIA 2I7NA 4H5NA 3ZEUA 3G25A 3MCPA 3ID8A 5FPEA 4B1UB 3VF6A 1GLLO 4H0VB 1TUYA 1T6DA 3UKUB 4DQ8A 3LDQA 2BTFA 5KQDA 4FOIA 3A5MC 4BC4A 5BRDA 2E1ZA 3BUZB 5AQFA 4WYBA 2YHXA 5F1XA 2E2QA 3L0QA 3WXKA 3I33A 1Y64A 1GLFO 4I6MA 2CGLA 4LC9B 2Q31A 3A8YA 3QBWA 3A5NC 4PL8A 3VF4A 3MK6A 2HF4A 1RGIA 4FWSA 3ZX0A 4M7YA 5LJVA 2E2PA 4CZIA 4E1JA 1NGCA 3U9DA 3BF1A 4JAXA 2D0PA 4ISEA 2A42A 3FLCO 2CH5A 1KXPA 5BN9A 4ISFA 2IIRA 2ZGZA 3U4LA 5AQZA 3UKUA 1NGFA 1G99A 3FZMA 3VGKA 2I7PA 2YHWA 3UKRA 2YJEA 4B1XB 4A2BA 5FPDA 4H0OA 4NO7A 1WUAA 1GLJO 3TU5A 5BR9A 1QZ5A 4PL7A 3H1QA 3SJHA 5BRHA 4O8KA 4XH1A 5KPTA 5AQNA 5JMVA 3M6GA 2DPNA 4BG9A 4J8FA 1XQSC 3ZETA 2GTDA 3DWLA 1BU6O 3GG4A 2FF6A 2AA4A 1ESVA 1NWKA 2ZGYA 3GOIA 3HI0A 4FPBA 1E4FT 2NRHA 5AQJA 1GLCG 2QWNA 1BUPA 3GE1A 4JN4A 4BRNA 2IVNA 3A5LC 1MWKA 1Z05A 3FZKA 5LJWA 1SAZA 4L3QA 2QWPA 3SMPA 3ZEUB 3WEEA 1HKGA 1QHAA 2YI1A 1NGBA 3HM8A 4F9OA 4BR7A 5B8HA 1IJJA 1NGEA 3FE1A 1SQKA 4QS8A 1NGAA 4GY2B 3VERA 3ULEA 2H3GX 1BWFO 3L4IA 2E8AA 1DKGD 3MMVA 3UE5A 1K8KA 2A40A 3LDPA 3DAWA 4PKIA 2IVOA 1Z6RA 4BRGA 3EN9A 4IO8A 3U8XA 4PKGA 4H5RA 1X3NA 3OHRA 4WQ4A 1QQNA 4BRMA 3O5BA 4CBXA 5AQHA 5AQRA 4BR5A 1HUXA 3GBTA 3CQXA 3QFPA 3QMLA 1V4SA 4BR9A 5KQ8A 2P9IA 4BC2A 3CHWA 2VYPA 4NB4A 1ZXOA 2UYTA 1ATNA 2QWMA 3IDHA 1E4GT 1HKCA 3P4IA 2ITMA 4CZMA 5AQTA 4XH5A 1ATRA 3GL1A 1XUPO 3IUCA 4EFHA 4BC5A 1NLVA 4QS7A 1BG3A 3O08A 4FWKA 4M7XA 4WQ5A 2V52B 3C7NA 3IMXA 4MLHA 2YJFA 4A2AA 1CZAN 1TUUA 3M3ZA 1ZC6A 3LDLA 1JCFA 2W41A 4CZHA 5FPNA 1T44A 4DHYA 2P9SA 3UKRB 4BRKA 2HMPA 3LDNA 3ENHA 2E2OA 3W0LA 4H5VA 1SZ2A 1OKJA 3F9MA 3VGLA 4C23A 4AM6A 3O1WA 3LDOA 1X3MA 3VEWA 1H1VA 4RCHA 3WXJA 4BQLA 3ZETB 4FWPA 3HZ6A 2ASOA 3MN9A 5AQVA 1NGHA 2CH6A 3A5OC 4JHDA 4AM7A 1NGIA 3D7EO 2QWOA 1BA1A 2QW9A 1U2VA 2CGKA 2YCHA 3CJAA 3HBTA 5AQMA 1HKBA 4EIAA 1S22A 3GDQA 4ISGA 1GLEG 2PAVA 5AQWA 4MO5A 2VCPA 2P9UB 3WEEB 1ATSA 2QM1A 3O8MA 5AQPA 5AQOA 4EHUA 4K43A 4BR4A 4H03B 5JLFA 2FF3B 4JNEA 4IJAA 4IJNA 1LCUA 2GELA 4CZGA 3VETA 3ULEB 2ZWHA 2Q97A 3H45C 4FWMA 4K41A 3AARA 3SLCA 5JLHA 3DXMA 2ASPA 4FWLA 1K8KB 4BGBA 4BROA 3EKSA 4BRQA 4RWTA 3CETA 3D2EA 5ADXH 3EL2A 3VEXA 1NGGA 5BRFA 4GNIA 1DGKN 1XC3A 3C0BA 4JD2B 4CZJA 4FO0A 3BEXA 2GWKA 3AY9A 3VPZA 2E2NA 3R8EA 2P9IB 1EQYA 4HTLA 3UB5A 1R59O 2CGJA 3CJ9A 4M63C 3H6EA 4BR0A 3W3DA 4Y0WA 2QXLA 4YDUC 2GEMA 2P9UA 4Z94A 3H3NO 2A6AA 2D0OA 2PBDA 3CJCA 3ATVA 1KAXA 1KAYA 3C7NB 3IFRA 2ZF5O 4DB3A 2J4RA 3VENA 1GLDG 4EAHD 3QBXA 1NGDA 1NBWA 2P9SB 4BGAA 1HX1A 5AQLA 3MDQA 4FWNA 3EO3A 4BQZA 5AR0A 4B1YB 1YVNA 3MN7A 3WUHA 4A62A 3O80A 3J8AA 4XH4A 4CZEA 4JD2A 4IZ9A 4FWOA 2VWBA 4IWVA 5I9EB 3CERA 3R6MA 1Q18A 2NZTA 2Q1NA 3LM2A 3LL3A 3FR0A 2D1KA 5BPLA 3ENOA 5EOYA 1U6ZA 5EY4A 3FFKB 4CD3A 3CI5A 4BRAA 3BF3A 3ZX3A 4JHDB 4CZLA 2GUPA 4H5TA 5E26A 1TYQB 4BG8A 1U2VB 4CJ7A 4BR2A 5AQSA 1QQMA 3M1FA 3TPQA 2Q36A 1WOQA 5CE3A 2E1YA 2QWRA 5AQGA 4BVPA 4FPAA 3CIPA 4BRPA 3JS6A 2AP1A 4IXCA 4K42A 4RTFD 1MDUB 2QWQA 1D4XA 3B8AX 2FSJA 2P9LA 2A5XA 2A41A 3D2FA 1DEJA 4B9QA 3WQTA 3DXMB 3H3OB 5AQXA 1YXQA 2WUSA 4BREA 5ELZA 5AQYA 3D2EB 2QWLA 3DXKA 4B1VA 2E20A 1V4TA 3FZHA 3I8BA 3ZX2A 4B1ZA 3SK3A 3FZLA 1QQOA 3FGUA 4BRFA 3RSEA 2Q2RA 4B1WB 5AZIA 4PKHA 4CZKA 4FSVA 5LY3A 1TYQA 5BN8A 3FZFA 4H0PA 3L6QA 4FWRA 3VESA 4EHTA 1LOTB 2IVPA 4BRCA 3R9PA 3VEVA 2Q0UA 4CD1A 2V7ZA 5EVZA 4KBOA 1ZBSA 2P9NB 4DCHA 1HLUA 2FXUA 4FL9A 2V51B 3MN5A 4H0XB 1HPMA 2P9KA 3VEOA 5AZJA 3O4WA 2V7YA 3KHYA 3S41A 1RFQA 3H46O 3QFUA 4O5FA 4A61A 2FSNA 4BRLA 3JXUA 5KPRA 4CBUA 5EX5A 2EWSA 3VF2A 4H0YB 5AQKA 1JCGA 1BDGA 4XEIA 3WQUA 2OANA 5TKYA 4BVOA 1C0FA 3QDKA 4H0TB 3ATUA 3O6WA 3H1VX 5EXWA 2FLOA 3CJBA 5AFUH 5AQUA 3HTVA 3KVGA 3KZBA 3VGMA 4MO4A 3CJ7A 3VEZA 2NLXA 1JCEA 3SMSA 1NGJA 2P9NA 1KAZA 3WXLA 2E88A 5BREA 2W40A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1VQNN 4CF1A 3OVNA 2Q0RA 1NM1A 2GWJA 2G8VA 5F0XA 4WQ4C 1J6ZA 4MLEA 1TKXA 1BCMA 2FBYA 5ADXA 1WSIA 2VQEK 1T7PA 3E9LA 2P9PB 4FWQA 4FOEA 5JS2A 5BPNA 3K5NA 3VTIA 1P8ZA 1A5VA 3TAEA 2QKKA 2P5GA 3THXA 3ZT2A 1SKRA 5HOOA 2RKIA 4G1QA 5KPZA 3RSEB 3VQ4A 4JS5A 1NU0A 5AZIB 1Q82O 1GLAG 4OKJA 1TGOA 3ASMA 2FBXA 1GLBG 1L3VA 2QEXN 1QS4A 4KH5A 4B08A 3LZJA 2C1GA 4BC3A 1SUQA 4I2QA 5AQIA 1T6CA 3NCIA 2F9TA 1RDDA 3SV3A 3D6RA 2UU9K 4Y1DA 3CF5L 4BECA 5FPMA 3Q7BA 5JICA 2HB5A 2P9PA 1KVCA 1TKZA 4BRIA 4H8KA 1Q86O 3G25A 5T7BA 3MXIA 4DR7K 2YV0X 2AJQA 3VF6A 1NK0A 2XHBA 3QIOA 4DFPA 2BTFA 4FOIA 5BRDA 3BUZB 5AQFA 1LWCA 5F1XA 3CC4N 3QEPA 1GLFO 3QLHA 4RW6A 4V19S 2VG7A 2PY5A 1N33K 3WNHA 2XRIA 3C6HA 4LC9B 3A8YA 3QBWA 2C1IA 3DLLL 3WXMB 1LWEA 3HO1A 4OGEA 1RDUA 1XNQK 4CFDA 2HNYA 3V4IA 4M3XA 4DU3A 4FWSA 1GOAA 4M7YA 5LJVA 4CZIA 4FJLA 1NGCA 3NE6A 4JAXA 3HXMA 4GMJB 1TKDA 5KI6A 2ZGZA 1QSLA 5M1NA 3FZMA 3CM5A 4CEFA 2YJEA 3SV4A 2IGIA 4B1XB 1HYVA 1Y97A 4A2BA 4XJXA 5BR9A 4PL7A 4FW1A 1QVGM 4RW4A 3SJHA 3DLGA 4AQYK 1NJYA 3M8QA 4JI8K 3E9PA 1C0MA 1XQSC 2QTDA 1C1CA 4B8AB 2XY8A 4YORA 3DWLA 4JKCA 4CEEA 3AVCA 2FF6A 4EZ6A 2O8CB 1ESVA 4GKJK 4N5SA 4FPBA 4LF8K 5AQJA 2QWNA 1BUPA 4TSXA 5JVHL 4IFYA 1QE1A 2QWPA 3PX4A 3SMPA 1DTTA 1NGBA 3KWGA 4F9OA 1IJJA 2D0CA 1NGAA 3VERA 1ITGA 1BWFO 2E8AA 1DKGD 1U48A 4PY5A 1VSJA 5EU7A 3DAWA 2X6NA 4PKIA 4GV3A 4JI7K 1X3NA 4CGGA 1VQLN 4CJQA 3O5BA 3PSFA 4DFKA 1FJGK 4CBXA 5AQHA 1W0HA 5AQRA 1IBLK 3OYLA 4FJ5A 1RT6A 3CQXA 1V4SA 2P9IA 4BC2A 4M3TA 1R0AA 3THWA 1SL1A 3GL1A 1XUPO 1L3SA 1UAXA 1W9HA 1NLVA 1S1TA 4IKFA 3CCSN 1KFDA 4QS7A 3LP1A 4O8UA 1ZBLA 2HHQA 2RF2A 1LW2A 4WQ5A 3C7NA 3DOLA 3IMXA 3VQDA 4OPJA 4KTQA 1CZAN 4JKGB 3B6OA 4CGFA 3TTDA 2HMPA 1ZBIA 3OS1A 3QESA 3G0ZA 3TARA 4LH4A 4C23A 1U45A 3CG7A 3LAMA 4HTUA 4KH6A 4F4KA 2HVIA 1XMOK 1X3MA 4YOYA 1T8EA 4KHNA 3WXJA 3ZETB 4WFAL 3AVIA 4JK9A 3HZ6A 3DI6A 2ASOA 1IO2A 5AQVA 4LH5A 5CHIA 2CH6A 3NF8A 1HJRA 4JHDA 1ASUA 4CHNA 1JJ2M 2QW9A 2VGNA 4FLTA 1HQUA 1W97L 5C42A 3TANA 1GLEG 4ZTFA 1A5XA 2E6MA 4I9QA 1RCHA 4H4MA 3QEWA 1JLGA 3O8MA 3OYJA 4BR4A 3TSPA 4H03B 5JLFA 2O4GA 1S6QA 3E1YA 2NRVA 4EZ9A 1G15A 1LCUA 3O9TA 3PX6A 4CZGA 2Q97A 3H45C 2OZMA 3VMFB 3LPUA 4HUGA 4BROA 1M90O 1N6QA 4CGJA 2FC0A 5ADXH 3EL2A 5BRFA 4FJHA 4CF0A 3O4QA 2HSTA 3BEXA 5M1QA 4ILHA 2GWKA 2E2NA 2O8BA 3R8EA 4WFBL 1EQYA 4HTLA 3KK3A 1R59O 4M63C 3J80O 2OPQA 3G6EN 4DV0K 1HNZK 2IAJA 4JI6K 2G8HA 1KTQA 1NKEA 4MDAA 2RE2A 2PBDA 1KAYA 3ZSQA 3HYFA 3L3UA 3HPHA 1TAQA 2J4RA 3VENA 1GLDG 4OLBA 1NGDA 2P9SB 2QI2A 4NLCA 3MDQA 4FWNA 4B1YB 4OVLA 2B4JA 4J2DA 4A62A 1L5UA 4XH4A 1O13A 4O5BA 2O8DA 2D0AA 4IZ9A 3HVTA 5I9EB 1Q18A 2NZTA 5AJ3K 4DSJA 1IG9A 4OX9K 1TK5A 4DUYK 3FFKB 3OS0A 3L2WA 4BRAA 1L3TA 3ZX3A 4ELUA 2VG6A 1NK8A 2GUPA 5HRRA 4H5TA 1TYQB 5HRPA 2QKBA 3VQAA 4ZTJA 1YJ9N 4ELTA 4CCHA 3HVRA 4FJIA 2E1YA 5HP1A 4B3MK 4BVPA 4J2EA 2RN2A 4DWIA 2F8SA 3JS6A 2AP1A 4JKEA 4JRQA 1D4XA 3V1OA 3CCEN 4FLXA 3U3YA 4IG3A 3CFOA 2A41A 3MEEA 1HNVA 2UUCK 4O0JA 5C0YA 3NH2A 4OPHA 4E1MA 1FKPA 2JGUA 1CZ9A 3OJUA 4KB1A 5M1OA 3DXKA 2QWLA 3ZSVA 3CYMA 3FZHA 3ZX2A 1HR0K 3L8BA 3FZLA 3ALYA 3CQ8A 3SUPA 3UIQA 3TAQA 4B1WB 1TYQA 4Z0UA 2F7TA 5M1PA 3L6QA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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