4H0TB

Crystal structure of ia-adpr-actin complex
Total Genus 125
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
125
sequence length
370
structure length
358
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Arginine ADP-ribosylation mechanism based on structural snapshots of iota-toxin and actin complex
pubmed doi rcsb
molecule keywords Iota toxin component Ia
molecule tags Toxin/structural protein
source organism Clostridium perfringens
total genus 125
structure length 358
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-09-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4h0tB01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4h0tB02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 4h0tB03
2QWLA 3FZKA 2P9SA 4YDUC 5AQMA 4BVPA 2YI1A 3GDQA 3IDHA 3WT0A 4WYBA 2QXLA 4ISGA 5I9EB 1NGFA 2QW9A 5AQFA 1MA9B 1V4SA 1ZXOA 4DCHA 4F9OA 1IG8A 1RFQA 1S22A 4A2BA 3VPZA 2V52B 3DXKB 1NWKA 5FPNA 3ENHA 2HMPA 2E8AA 2IVNA 1MDUB 3WXKA 1BA1A 5EY4A 3LDOA 3W3DA 2HOEA 3SK3A 2HF4A 4BRNA 1QQOA 2A6AA 2A5XA 4BREA 2NLXA 1S3XA 2BUPA 1HLUA 4CBUA 1BOTO 2VWBA 5AZJA 2NRHA 1QZ5A 3ATUA 2D4WA 5AQNA 4H0OA 1JCEA 2WUSA 3LM2A 4BRDA 4GY2B 2KHOA 3KHYA 4BQZA 4BG8A 3GE1A 1BU6O 2V51B 1YUWA 4BR9A 2IVPA 4LC9B 1XUPO 5KPTA 4WQ5C 1Z05A 3UB5A 4FPAA 2FSKA 5F0XA 5AZIA 3CERA 2CH6A 4BRIA 5BRFA 3UKRA 4BRLA 3DAWA 5AR0A 1U2VB 3KVGA 2A42A 5EVZA 5CE3A 4FWLA 5FPEA 4B1VA 5JICA 2DPNA 3HI0A 4CZJA 1H1VA 1YVNA 3ZX2A 4FSVA 3D2FA 4I6MB 2P9UB 3GOIA 2YHYA 3QFPA 3LDNA 2ASMA 3I8BA 5AQIA 4PL7A 3U8XA 3M3ZA 4CZMA 2CGLA 3A5MC 1RGIA 4MLHA 1NLVA 1ATNA 4H5RA 3HBTA 4B1ZA 4BR2A 5BRDA 1HKCA 2D1KA 4DHYA 2P9PA 5AQPA 3LL3A 1YXQA 4YDUA 3IUCA 3C0BA 3C7NA 3QBXA 3G25A 3O8MA 2FLOA 4CD3A 4GNIA 1XC3A 1QQMA 2PAVA 3JS6A 3O80A 1TYQA 1GLJO 3FE1A 2P9LA 3WEEB 3AY9A 3LDLA 1X9JA 4FWPA 2ITMA 4MLEA 4J8FA 3W0LA 3ZX0A 4C23A 1NGJA 1TUYA 3SJHA 4PKHA 4BGAA 3L0QA 4H0VB 5ADXH 2I7NA 3RSEA 5AQOA 1KAZA 1QHAA 4BRQA 4NO7A 1BUPA 3VEVA 4H0TB 4K41A 5AQKA 2D0PA 1HPMA 4BR7A 3FR0A 2FF6A 3VF4A 5BPMA 1NGDA 2HF3A 2W40A 1ZC6A 4H5NA 1E4GT 1TUUA 1MWMA 4JHDB 2Q0UA 3CI5A 4WQ5A 5AQHA 1LOTB 3H1QA 2CGJA 2E1ZA 5KQ8A 4IXCA 5BRHA 4EIAA 4CBWA 3H46O 2FSJA 2W41A 3MCPA 1P8ZA 3ZEUA 2OANA 4DQ8A 2AA4A 4BRCA 2VYPA 2YCHA 3D2EB 1T6DA 4E1JA 2E88A 2GWKA 1GLDG 5ADXA 3FGUA 3MN5A 3B8AX 2GELA 2FF3B 4BGBA 2Q36A 3QBWA 3QDKA 4PKGA 5BN8A 4HWIA 4PKIA 3VGKA 4RWTA 2QWNA 4CZEA 3FZHA 2Q1NA 2Q2RA 3VF2A 3O08A 1BA0A 2UYTA 5EX5A 4KBOA 1GLBG 4HTLA 3R6MA 2EWSA 2H3GX 1HJOA 2A41A 3LDQA 5AQTA 3WQUA 1NGAA 4JNEA 4AM6A 2A3ZA 3CJBA 1JCGA 3CJ9A 3FZMA 5LJVA 4CZHA 3I33A 3GBTA 4CZGA 5F1XA 1T44A 2ASPA 1QQNA 2NZTA 4BC5A 3VEXA 3EZWA 1HUXA 4B9QA 2GTDA 1NGCA 3U9DA 3R8EA 3DXMA 4BG9A 1U2VA 1C0GA 1Z6RA 3L6QA 3EKUA 3VGMA 1JCFA 1NGIA 3GL1A 2P9NB 3GG4A 1HKBA 3FZFA 2E1YA 1BG3A 3F9MA 3LM9A 3WUHA 1EQYA 1OKJA 4I6MA 3MDQA 3U4LA 2P9UA 1XQSC 3AAQA 1NGHA 4BC2A 4EAHD 3CJCA 1NBWA 2P9KB 4EHTA 3U9ZA 4Z94A 1SQKA 3BUZB 3UKRB 3HZ6A 2ZGZA 5BR9A 4H5VA 3P4IA 1HKGA 2YHWA 3O1WA 4CBXA 1K8KB 1GLCG 2BTFA 2QM1A 4A61A 4BRGA 4ISEA 3O1BA 3D2FB 4PL8A 4FWKA 2ZF5O 1J6ZA 2YHXA 2IVOA 3FZLA 3CJ7A 2I7PA 3MK6A 4JN4A 4JD2B 1HX1A 2F9WA 2QWQA 3ZETB 4BR5A 3FLCO 3EKSA 4FO0A 3WEEA 1E4FT 4XH4A 3JXUA 4Y0WA 5AQWA 4K43A 3DJCA 1WOQA 4FOIA 4XEIA 5AQGA 5BN9A 4AM7A 3C7NB 3A5OC 4BR0A 3D7EO 1KXPA 3WXIA 3UKUB 1NGEA 1ZBSA 3TPQA 3OHRA 1WUAA 1LCUA 2YJFA 4NB4A 3VEZA 2E2PA 3CIPA 1NGBA 4DB3A 4CZIA 3FFKB 1BWFO 3EL2A 4RCHA 3CJAA 4CZFA 2FXUA 1ESVA 4JHDA 5KPRA 2PBDA 4EHUA 1GLLO 3HM8A 4IJAA 4QS8A 5AQVA 5LJWA 3BF3A 4BRPA 1NM1A 4WQ4C 4BRAA 4BVOA 4BRHA 4BC3A 2P9IB 3DXKA 1ATRA 1SAZA 3ULEB 3BF1A 1DEJA 2F9TA 2P9SB 3D2EA 3TU5A 4FWRA 4FL9A 5E26A 3SLCA 1QZ6A 5AQZA 2E20A 2ZWHA 2IIRA 4IZ9A 2E2QA 1D4XA 3KZBA 2QWMA 1BO5O 4IO8A 1NGGA 5EOYA 3H3NO 4FWNA 1KAXA 3ZEUB 4H03B 2GUPA 1ATSA 5F2RA 1NMDA 4O8KA 4M63C 4H0PA 4FOEA 3BP8A 1C0FA 2QWOA 3HTVA 4K42A 3R9PA 2Q0RA 4ISFA 5AQUA 2VCPA 5KQDA 1CZAN 1KAYA 3QICA 3VESA 2E2NA 3MN6A 5AZJB 5JLHA 2QWRA 3SMSA 4XH1A 4B1WB 2CH5A 4H0XB 5KPZA 2V7YA 4B1XB 3QB0A 4B1UB 3QMLA 3M6GA 4QS9A 3LDPA 5AQRA 3WQTA 4BRFA 4FWOA 3VEWA 2P9NA 1Y64A 1YAGA 5ELZA 5TKYA 1X3NA 4XH5A 3A0IX 4K25A 4IWVA 4EFHA 5AZIB 3BEXA 3VENA 3WXJA 1T6CA 3QFUA 2P9KA 1RDWX 3M1FA 3J8AA 2ASOA 2A40A 1DKGD 3CETA 3DXMB 4CD1A 3MN7A 2AP1A 3A5LC 3MN9A 4L3QA 3L4IA 3HSCA 1K8KA 3A8YA 3O4WA 3SMPA 4BC4A 2D0OA 3VGLA 3ATVA 4M7YA 2J4RA 3VERA 4QS7A 4BRMA 3VOVA 3H6EA 1X3MA 2FSNA 4RTFD 2QWPA 2E2OA 3EN9A 5BREA 4JD2A 1GLFO 3ENOA 4WQ4A 3ZETA 4H5WA 3IMXA 4FWMA 5AQLA 3H1VX 4MO5A 5AFUH 3CJ1A 3O6WA 2GWJA 4H5TA 5EXWA 3VETA 2Q31A 2P9PB 2YJEA 4CJ7A 5BPLA 3ID8A 4A62A 4B1YB 1DGKN 1V4TA 5BPNA 3IFRA 1Q18A 3UKUA 3VEOA 4JAXA 5FPMA 3EO3A 1SZ2A 2CGKA 4CZKA 5FPDA 1MWKA 3UE5A 3VF6A 4CI6A 1TYQB 5JLFA 2P9LB 3A5NC 3VEYA 1R59O 4BROA 5B8HA 5JMVA 4H0YB 2ZGYA 1G99A 1U6ZA 5AQYA 1BDGA 1GLEG 5E84A 4CZLA 3O5BA 4FPBA 4A2AA 3DWLA 4O5FA 4BQLA 5AQJA 4FWQA 3ZX3A 2GEMA 3H3OB 3H45C 5AQXA 3RSEB 3WXLA 4BRKA 3CQXA 3AARA 5AQSA 3S41A 3MMVA 4FWSA 5AFUA 1IJJA 5AQQA 3CQYA 2Q97A 3AAPA 4M7XA 5LY3A 3CHWA 4BR4A 2V7ZA 2P9IA 3ULEA 4IJNA 4MO4A 1GLAG
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4NLCA 1SKWA 5AQMA 4DR3K 3OYDA 4WYBA 5EU7A 4ISGA 5I9EB 1RTIA 3AVAA 3PY8A 3IRXA 1NGFA 2QW9A 3E9OA 1MA9B 4ICLA 4CJ4A 3CF5L 1J53A 1IG8A 3SCXA 4A2BA 3VPZA 4OPJA 3DXKB 3NH1A 4LF9K 3WXKA 1MDUB 2E6MA 5EY4A 4CF0A 3W3DA 4FK2A 3SK3A 2HF4A 5C2FA 4Z4GA 1QQOA 3EYZA 4B3OA 3NF7A 1N8RO 1NOYA 3AVLA 3DOKA 2VWBA 5AZJA 3LP0A 3TAQA 2D4WA 4H0OA 4NCBA 5MLCQ 2KHOA 2HB5A 4IOXA 3NCIA 4LC9B 1XUPO 4WQ5C 3PSIA 3UB5A 2HNZA 3DRPA 3CERA 3AO5A 3PX4A 4CE9A 3ZT0A 1P90A 5BRFA 4FW2A 4DTJA 1O1WA 3N4QA 4Q5VA 3DAWA 4AILC 5AR0A 3PO5A 1XI1A 5EVZA 5CE3A 3T1YK 2YNHA 5KRSA 3WNEA 4FJ5A 3NVKA 2O8DB 1H1VA 3ZX2A 3D2FA 2Z1GA 3AVMA 3O9RA 4BEBA 2YHYA 3F9KA 4GVEA 2ASMA 2OTLN 4AHTA 5AQIA 4PL7A 3WNFA 2CGLA 2WOMA 4EZ9A 1RGIA 4CJSA 4MLHA 4FZYA 2AJQA 3QEVA 4B1ZA 4BR2A 4NCGA 1ILYA 3PV8A 1YTAA 1RBVA 1DT9A 3LL3A 3C0BA 4B9UA 4M45A 4OPAA 3O8MA 1KC8O 2FLOA 4Y1CA 1F21A 1N33K 3OYAA 1S1WA 3K9KA 4G1QA 3FE1A 1K73O 2P9LA 4JI3K 3OYLA 3CQ8A 1X9JA 2ITMA 4MLEA 4J8FA 2PFUA 3ZX0A 4MFBA 3L2RA 2HVIA 3OS2A 4FJKA 3S3MA 4BGAA 4OGCA 1QHTA 1RBTA 5GIPA 1OH5A 1KFSA 2PY5A 4M3UA 3QESA 1IH7A 1N34K 4NO7A 3TAPA 4RW8A 1S5JA 1HPMA 4BR7A 4CJFA 2UUBK 3FR0A 2KZZA 3VF4A 3E1YA 4H5NA 1TUUA 3SAHA 1TK5A 1VSEA 3D6RA 3ZT2A 1TVRA 4JKFA 3OYJA 4R5PA 2HSTA 1UWBA 1RDUA 3DLEA 4DS5A 4CJQA 4CIFA 4DR2K 3V6DA 4C8MA 5I3UA 3TSQA 4GV6A 3MECA 3BGRA 1P8ZA 4LF6K 2VYPA 4F8RA 2YV0X 1WSGA 1WSHA 1GLDG 2HBKA 5ADXA 4GVMA 1I94K 1YJ9N 2FF3B 4RWTA 2QEXN 3KWIA 3OYNA 3ZSXA 2GBZA 3DLHA 2Q1NA 3C6UA 4FK0A 4KBOA 4HTLA 2F7TA 4DS4A 1IG9A 1HJOA 3G0ZA 2UXCK 1I3AA 1LAVA 1NGAA 2A3ZA 2DTUA 4CZHA 4CZGA 4FXDA 1T44A 1RNHA 4IEIA 4JV5K 4BC5A 1ASUA 3RMDA 4B9LA 5C24A 3QLHA 1HYZA 1JXBA 1C0GA 4AHVA 4B08A 1Z6RA 5C12A 4DQSA 4E1MA 1T7PA 4NLBA 1OVQA 3O4NA 4I2PA 3M8QA 3MWPA 1WSIA 3WUHA 1YIJN 4I6MA 1RDDA 4E7KA 3MDQA 3JAMO 1XQSC 4CJUA 3HOSA 1NGHA 4EAHD 2E6LA 3U9ZA 1SQKA 2QXFA 4IOAL 3AA4A 2IAJA 2ZGZA 4H5VA 4EP5A 3V1OA 3K5LA 1HQEA 4W5TA 1L3SA 2YX6A 2XRIA 1EO1A 1K8KB 1Q8IA 1GLCG 2QM1A 3CFRA 4A61A 3OJUA 3K58A 4PL8A 2BDPA 1J6ZA 1LW2A 4YNQA 3CJ7A 5K14A 4JN4A 3MK6A 3ID6A 3KK2A 4YHHK 3FLCO 5KRTA 3WEEA 4E7HA 1W0HA 4DF8A 3EE8A 4IG0A 3HPOA 4DLGA 3Q7BA 4BE0A 4U7BA 4FOIA 4XEIA 5AQGA 4AM7A 3C7NB 4JI0K 3D7EO 3SV3A 1KXPA 5DM6L 4OKKA 3WXIA 3MAQA 4HVJA 4RG8A 3TPQA 3KD5E 3MXMA 4W5OA 1YVUA 3B6PA 1NGBA 3U3YA 1KFDA 3SQ1A 1NKCA 4CZFA 2ZJQL 1ESVA 1BI4B 3CFPA 2PBDA 4EHUA 4FLWA 4N5SA 3AVBA 5AQVA 3TARA 5LJWA 1VQNN 4DMNA 3NF6A 1SV5A 3OYFA 3VQBA 3V9SA 3CD6N 3DXKA 1TKXA 3ENBA 1A5XA 1OH7A 3D2EA 3TU5A 4ZHRA 3AA5X 3QEXA 1QZ6A 4BDYA 1GOBA 1EP4A 4PWDA 2B4JA 3CMEN 2E20A 2ZWHA 3D45A 4J2AA 5DM7L 1J9AA 3S5TA 2E2QA 2QWMA 3NGYA 4KHNA 1BO5O 2Q3SA 2P1JA 3BZKA 1RBUA 4FWNA 3AO1A 2OZMA 4H03B 4GV3A 4A5AA 5F2RA 2KW4A 1NMDA 3R1XA 1ZBFA 1C0FA 1Q9YA 4ISFA 5KQDA 3QICA 4NXMK 1W7AA 1WAJA 1D9DA 1TL1A 1T3VA 1WLJA 2HNDA 5AZJB 2WTUA 5I42A 4MDBA 4LSNA 4XH1A 5FDLA 2X74A 1RILA 5KPZA 5HOOA 4DV4K 2HHSA 3SUOA 4QS9A 4F3TA 3MXJA 5AQRA 3CPEA 1Y97A 2WONA 2KTQA 2O8DA 4JK7A 1J5OA 2OPQA 3BEXA 3VENA 1A5WA 4CW7B 3J8AA 2ASOA 2FBYA 5CYMA 1NMNA 2QI2A 1NOZA 1ZBLA 3A5LC 4L3QA 3L4IA 1CXUA 4OKJA 4BC4A 3ATVA 4V19S 3CC2N 4CJRA 4QS7A 4PUOA 4BDPA 4M41A 3VOVA 1VQ7N 2A1SA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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