4H0TB

Crystal structure of ia-adpr-actin complex
Total Genus 125
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
125
sequence length
370
structure length
358
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Arginine ADP-ribosylation mechanism based on structural snapshots of iota-toxin and actin complex
pubmed doi rcsb
molecule keywords Iota toxin component Ia
molecule tags Toxin/structural protein
source organism Clostridium perfringens
total genus 125
structure length 358
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-09-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4h0tB01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4h0tB02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 4h0tB03
4BRIA 5KPRA 4J8FA 1Z05A 3ULEA 2CH6A 3LM9A 4BRFA 1MWMA 4CD1A 3WQTA 3ZX3A 1U2VB 4H0OA 3VGMA 4BRLA 3MCPA 3O4WA 1SQKA 4H0YB 4CZIA 3CJ7A 3MMVA 1ATRA 2QWPA 5ELZA 1GLAG 2A5XA 3LDPA 1G99A 5KQ8A 4F9OA 2IVPA 3LDQA 3GL1A 5EVZA 2YJFA 1C0FA 3CERA 4B1WB 3R6MA 1D4XA 2FSNA 3ATVA 3W0LA 4EFHA 5F0XA 4CZMA 2YCHA 3VOVA 2Q1NA 2P9KB 2FSKA 3O1BA 3C0BA 2HF4A 4BC2A 4QS7A 2A40A 2IVOA 2P9NA 3LDLA 1ZC6A 4CJ7A 4LC9B 3DWLA 4NO7A 3DXMA 5AQVA 3MN5A 3SJHA 4MLHA 3CJ1A 3FR0A 2HF3A 1NGFA 4EHUA 2ASOA 5FPNA 5B8HA 4EHTA 2YHWA 1NGHA 2E2NA 1XC3A 3EKSA 2P9SA 3UE5A 1NGAA 3QFPA 2V7ZA 1U6ZA 1MDUB 3AAQA 4IJAA 3VEWA 4XH1A 1NGBA 1TYQA 2QM1A 3HSCA 3VF4A 1HLUA 3FZKA 3VGKA 5BN8A 1S3XA 3ULEB 4H03B 3BP8A 3DJCA 3O08A 4BRPA 1CZAN 4H5VA 1WOQA 1X3MA 1NLVA 4DQ8A 2FSJA 2E8AA 3CHWA 3BF1A 3M6GA 4ISEA 4CI6A 3LM2A 2BUPA 3SMSA 1E4GT 5AQXA 4BC5A 5ADXA 4C23A 4IXCA 2PAVA 4BC4A 3O5BA 3CJ9A 4B9QA 1IJJA 4K41A 3EO3A 1SZ2A 5I9EB 3WUHA 5E26A 4IJNA 3U9DA 4WQ5C 3ZEUA 3R8EA 4DHYA 2V7YA 3UKUA 4B1ZA 5ADXH 2P9NB 4WQ5A 1GLFO 2E2QA 3H1QA 2FLOA 2P9UA 3DXMB 2ZWHA 2E2OA 4RWTA 4FWOA 4BR9A 1JCEA 1HUXA 1YUWA 4JAXA 2A41A 2D1KA 1NBWA 1MA9B 1NMDA 4XH4A 3A0IX 2P9SB 1T44A 2A42A 3BF3A 3EL2A 3FGUA 4IWVA 4BVPA 5BRDA 3IMXA 2W41A 2CGLA 5BRHA 1GLLO 1QZ5A 1TYQB 3GE1A 3CJCA 4BG8A 2F9WA 3VF2A 4BR0A 4FO0A 2ASPA 4CZHA 4BQLA 4AM7A 4ISFA 1HKGA 2I7PA 5BREA 4A61A 1IG8A 5FPEA 4JD2A 3A8YA 1BUPA 3TU5A 3VENA 4CZLA 1YVNA 3TPQA 3IUCA 4BR4A 4XH5A 3MDQA 2ASMA 4M7YA 2D4WA 4H0VB 3O6WA 3SK3A 4CBUA 3VERA 2E2PA 4FWSA 4MO4A 2GWJA 4BRKA 3QMLA 2QWLA 4H0PA 4K42A 5FPMA 1YAGA 4H0TB 4B1YB 3QB0A 4BC3A 3O80A 4JN4A 3DAWA 1T6CA 3WXIA 1HKCA 2QWQA 4HWIA 3FZFA 4PKGA 2J4RA 2F9TA 2GUPA 2HMPA 3GOIA 4MO5A 3ZEUB 4M63C 2GWKA 3UKUB 2VCPA 4FWPA 2CH5A 2Q2RA 1KAXA 2P9LA 5TKYA 1GLEG 2P9UB 4DB3A 3ENOA 4L3QA 2AP1A 2P9PB 5AQNA 4E1JA 2V52B 1HKBA 5AQPA 3KHYA 2NRHA 2KHOA 1Y64A 2UYTA 5AQQA 3FFKB 3OHRA 2YJEA 1LOTB 3AAPA 3I8BA 4CZKA 1X3NA 5AQIA 5CE3A 3H45C 3FLCO 2EWSA 3VF6A 4BRCA 4CZJA 4BGAA 5AQGA 5AQZA 3RSEA 1P8ZA 5E84A 1NGCA 1RFQA 4HTLA 5KQDA 2NLXA 1YXQA 5AZIB 3ATUA 1ATNA 2FXUA 4BQZA 4IO8A 3WEEA 1BA1A 1BWFO 3ID8A 3SLCA 5AQKA 4CBWA 3QBWA 4GNIA 1LCUA 4K25A 4BRMA 4JD2B 1S22A 3QICA 3A5OC 3H6EA 5AQRA 3A5NC 4WYBA 3ZETA 1WUAA 4I6MA 4B1UB 1JCGA 3H46O 3BEXA 4QS9A 3O1WA 2FF6A 1BO5O 3VEOA 5F2RA 3WQUA 4BRDA 4FWQA 5AQLA 1K8KA 1DEJA 5BN9A 2VWBA 2I7NA 2W40A 3G25A 4CZEA 5JLHA 3BUZB 5AR0A 3LDOA 3B8AX 3FE1A 3GG4A 4O8KA 4A62A 3QBXA 2OANA 3AY9A 4DCHA 1NM1A 4BRGA 3LDNA 4ISGA 3JS6A 5EXWA 3MN7A 5AQYA 3WXLA 1GLJO 1X9JA 1MWKA 2P9PA 3CJAA 3LL3A 3ZX0A 4BGBA 5JLFA 2P9LB 2GELA 5LJVA 2NZTA 3CQYA 1BDGA 3VEXA 1NGEA 3D2FA 4BROA 2WUSA 4A2BA 3HBTA 1JCFA 4FOIA 4O5FA 3U8XA 4KBOA 2H3GX 4H5RA 4BVOA 1NGGA 1OKJA 2VYPA 1BOTO 2BTFA 2PBDA 3M3ZA 5AZIA 3RSEB 3VPZA 2Q36A 1BA0A 2E88A 1QZ6A 3KZBA 4GY2B 5BRFA 2E20A 2Q31A 3GDQA 3H1VX 3VEVA 5AQOA 1C0GA 3IFRA 1KAZA 3HM8A 3IDHA 3WEEB 1J6ZA 3L4IA 2Q97A 4Y0WA 1V4TA 3UKRA 2ZF5O 1RGIA 2QWOA 1HX1A 5BR9A 1QQNA 3ZETB 4I6MB 5KPTA 4Z94A 2CGKA 4FL9A 4JHDA 5FPDA 2D0OA 5AFUH 3KVGA 4RTFD 3VGLA 4BR2A 2P9IA 2E1ZA 1XQSC 2A3ZA 3CJBA 3VETA 3EKUA 4H0XB 3P4IA 1K8KB 1BG3A 4B1VA 3GBTA 1DKGD 5AQMA 4BR7A 2DPNA 3J8AA 5LJWA 4CBXA 4BRHA 1T6DA 2ITMA 1GLCG 5F1XA 3VEZA 2ZGYA 4PKHA 1TUUA 3D2EA 2IVNA 2HOEA 3DXKA 3ZX2A 2Q0UA 3U9ZA 1QHAA 3HI0A 4IZ9A 1NGJA 2D0PA 4NB4A 3MN6A 2ZGZA 4FPBA 3D2FB 2A6AA 3FZHA 5AQJA 1TUYA 5AQWA 3CIPA 3CI5A 4FSVA 4AM6A 1KXPA 3L6QA 4FPAA 3VESA 3U4LA 2Q0RA 4FWKA 2CGJA 1Z6RA 3WXJA 1NWKA 4CD3A 3HZ6A 3C7NA 3H3OB 2V51B 1V4SA 5AQHA 4YDUC 4BR5A 1ZXOA 4CZGA 4RCHA 4PL8A 2YHYA 5BPNA 3FZMA 4YDUA 5AZJA 3JXUA 1E4FT 2QWRA 5AQUA 1KAYA 3UKRB 3EN9A 3MN9A 4B1XB 4PKIA 1GLBG 1U2VA 5BPMA 2AA4A 5LY3A 3A5MC 2GTDA 4JHDB 2QWNA 4BRAA 5EX5A 3D7EO 2P9IB 3H3NO 5BPLA 2YI1A 3M1FA 4BREA 2E1YA 1NGIA 3ENHA 5EY4A 3WXKA 4FWLA 4QS8A 5KPZA 3S41A 4FWMA 4MLEA 2IIRA 4BRQA 1EQYA 3F9MA 2GEMA 2QWMA 2YHXA 3W3DA 4CZFA 1R59O 5EOYA 3I33A 4FWRA 1HPMA 3FZLA 1HJOA 4H5NA 4H5WA 3D2EB 3WT0A 1RDWX 5JICA 1H1VA 2P9KA 3DXKB 3MK6A 4A2AA 1BU6O 3CETA 4WQ4C 3HTVA 1ATSA 2QW9A 3L0QA 1GLDG 3O8MA 4M7XA 4EIAA 1XUPO 4XEIA 5AQTA 3UB5A 4WQ4A 3R9PA 3VEYA 3A5LC 1QQMA 3CQXA 1ZBSA 4BG9A 4H5TA 5AQSA 4BRNA 4K43A 3C7NB 4FWNA 4EAHD 1DGKN 1ESVA 3QDKA 5AFUA 4PL7A 4FOEA 2FF3B 5AQFA 1SAZA 5JMVA 1QQOA 3QFUA 3AARA 1Q18A 4JNEA 3EZWA 5AZJB 3SMPA 1NGDA 2QXLA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1RT1A 3K5NA 1LWFA 5KPRA 1Z05A 1JL2A 4BRFA 1P90A 4OVLA 3WQTA 3ZX3A 3DI6A 3VGMA 4F2RA 4J2EA 3O4WA 3SJJA 4CK2A 5K14A 2QWPA 3T69A 1RBVA 5KQ8A 1C6VA 1VQ8N 2YJFA 1ASVA 2OPRA 3C95A 4B1WB 3R6MA 3K59A 3CMAN 3OBYA 4CZMA 1VSKA 4O55A 2ZJRL 4E0DA 3C0BA 5DM7L 1BL3A 4KKOA 2A40A 3LDLA 4CJLA 5C2FA 4FW1A 3M8RA 1SKSA 1VHXA 3CJ1A 2OZMA 1NGFA 2QA4N 1N34K 5JVGL 4EHTA 4X65K 3ZSVA 4DWIA 4JI7K 2FBTA 1U6ZA 1MDUB 4DSJA 4CECA 4IJAA 1TL1A 3KD5E 3KK2A 3VF4A 4FLUA 4F8RA 4E1MA 4CHYA 3NVKA 3VGKA 4H03B 3PX6A 3BZCA 3O4QA 3O3HA 1O1WA 1FK9A 1NMNA 3NE6A 4LF4K 2O8BA 4DV5K 4UY8O 3CPWM 3THWA 4DQ8A 4LH4A 1RTIA 3VQEA 3QEPA 1K73O 3CHWA 3AVFA 4ISEA 3HPGA 2XY7A 4JKGA 5C24A 3SMSA 1JL1A 3NH1A 4WFBL 4BC5A 1NKBA 4FK4A 4DQSA 2XY6A 3AA3A 4FJHA 1JLFA 1IJJA 4K41A 1RNHA 4ZHRA 4KTZA 5I9EB 1VQ6N 1T3VA 3U9DA 2Z1GA 1W97L 4WQ5C 3SBTA 3KLGA 5ADXH 3ZSQA 4KRFA 3O3GA 3KIOA 3E9PA 4FJMA 3VQ4A 4RWTA 1JCEA 1OH6A 4JAXA 3CC4N 2X78A 1MA9B 4DV2K 4E7HA 1T44A 3SQ4A 1VSMA 1BI4A 2YHBA 4RG8A 2W41A 2CGLA 3F2KA 1NK6A 1GLLO 3J81O 3L3VA 4KPYA 4V19S 4CZHA 4C8NA 4AM7A 2VGNA 1W7AA 1Z26A 5BREA 2O8BB 1LAVA 3K57A 1IG8A 1VQ4N 3A8YA 3VENA 3RRGA 3SUOA 3MAQA 3VQCA 5JVHL 1X1PA 4XH5A 3MX2A 1FKOA 3VERA 4O8UA 4JKGB 4FWSA 1HJRA 4M41A 3IS9A 3AA2A 4K42A 5FPMA 1YAGA 3QB0A 3RMCA 3O80A 4HUFA 4JN4A 3DAWA 3WXIA 1RDCA 4RW8A 1C1BA 1HQUA 4FLZA 2YNHA 2J4RA 3S3NA 2F9TA 2GUPA 3A2FA 3OYNA 3L8BA 4JKFA 4GV6A 2VCPA 3I0SA 4FWPA 5SZTA 2Q2RA 1SL0A 4L3QA 1WSIA 3EE8A 2P9PB 3LPTA 1VSLA 4R5PA 5M1KA 4B9VA 2KHOA 3FFKB 3SUNA 4OKJA 2YJEA 1LOTB 2OTJN 4CZKA 1BI4B 3FLCO 4IFYA 4CZJA 1VQNN 2ZQBA 3PIOL 1YT3A 5E84A 1KCFA 1NGCA 1N6QA 4OLBA 4DU4A 1IG9A 4BQZA 2P5GA 3WEEA 3QNNA 1BWFO 3ID8A 3QBWA 3AVBA 5J2MA 5FRNA 1B92A 3SPZA 4CGFA 1JXBA 4I6MA 1JCGA 3MECA 4FJIA 4QS9A 4E19A 3O1WA 4JV5K 3VMFB 1BO5O 2VGMA 2IOCA 1TV6A 1BQMA 3WQUA 1KSPA 4Z4HA 3ZT2A 4IOAL 1T03A 1NJXA 4DV6K 2VWBA 4IG3A 1DTQA 3V9WA 1GOAA 3LDOA 1SL2A 2QKKA 3AVAA 4DCHA 3DLLL 2X6SA 3DM2A 2F7TA 1Q9YA 4ISGA 4PA1A 4U67L 2O4GA 4IBNA 3LALA 4KHUA 1Q8IA 5AQYA 4QAGA 1XNRK 3DYAA 1ASWA 2PY5A 2NZTA 2HBKA 3VEXA 1KVAA 4NCAA 4Z4IA 4DTMA 1S1XA 4BDYA 4M42A 1VQ9N 3MX5A 1TVRA 5A2QO 3V81A 4DG1A 4BVOA 4CJFA 3N4PA 4PQUA 4CFCA 3M3ZA 1BA0A 4LSLA 3KZBA 3VEVA 3GDQA 5AQOA 2G8KA 1C0GA 3HM8A 1YITN 4Q0BA 3IDHA 3WEEB 1J6ZA 1IO2A 3VQ5A 1HR0K 4KH5A 4Y0WA 1RILA 1RGIA 2QWOA 1HX1A 4DLEA 3VQQA 3EE9A 4I6MB 3VQDA 4CJQA 3O9QA 1T05A 4B8AB 3E66A 1NJZA 3CJBA 3E1YA 1LW2A 3JAMO 4H0XB 4M3WA 1BG3A 3NGIA 1XHZA 3GBTA 4H8KA 4CFDA 3J8AA 2ETJA 3J7ZO 2C1GA 4FJKA 3U3GA 4AHUA 1KQSM 4O4GA 2ZGYA 4AHSA 4CJVA 4YNQA 4DV0K 1NK7A 2HOEA 1JKHA 4HCBA 4OLAA 1S5JA 4NLBA 4ELVA 3DOLA 4YOUA 3KK1A 1NKEA 3C6HA 2VWKA 4FSVA 1KXPA 3C6UA 3RR7A 2QXFA 2UU9K 4M3XA 3DOKA 2E6MA 3L2UA 4CD3A 1ZYQA 3HZ6A 3DLHA 5GIOA 1TK5A 4DLGA 3JSMA 1V4SA 2ZJQL 3CMEN 3AVJA 3CC2N 3M8PA 4XIUA 2YHYA 3KKRA 4HVJA 4YDUA 5AZJA 1L3SA 1UAXA 5D3GA 1E4FT 3CFOA 1OH7A 2RN2A 1YJNN 4GKJK 3PX0A 4FYDA 3MN9A 4CHOA 5M1FA 1X9SA 4CEEA 2VQFK 1IBMK 4N41A 5BPMA 4CGJA 1VQPN 3G10A 4BRAA 3D7EO 3H3NO 3SPYA 4BREA 1IKXA 3QINA 2WFBA 4DR6K 3VQ8A 4ZTJA 3P38A 2IIRA 2O4IA 1TKTA 4BRQA 2GEMA 2QWMA 2YHXA 3W3DA 4DR2K 5CR4A 3CM5A 4JI0K 1SUQA 2DFFA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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