4H0VB

Crystal structure of nad+-ia(e378s)-actin complex
Total Genus 124
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
124
sequence length
370
structure length
355
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Arginine ADP-ribosylation mechanism based on structural snapshots of iota-toxin and actin complex
pubmed doi rcsb
molecule keywords Iota toxin component Ia
molecule tags Toxin/structural protein
source organism Clostridium perfringens
total genus 124
structure length 355
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-09-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4h0vB01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4h0vB02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 4h0vB03
4FOIA 5EOYA 5JMVA 3FZMA 2Q0UA 2FLOA 2E2NA 2P9UB 5ADXH 2BTFA 2QWLA 4MO5A 1C0FA 3J8AA 3ENHA 4Y0WA 5BN8A 3MK6A 4BGAA 3D2EA 1QZ6A 3SK3A 4BC4A 1BDGA 4CD3A 1WOQA 4BROA 3R9PA 1QQOA 2J4RA 3HI0A 4CZFA 3CI5A 2P9NB 1NGJA 1NWKA 3CIPA 4FWKA 2V7YA 5FPEA 1HUXA 1S3XA 5LJVA 5AQZA 4MLHA 2FXUA 2DPNA 2GUPA 4O8KA 4BR4A 3VETA 4BR0A 4WYBA 1RGIA 4H0OA 4JD2A 3C0BA 2IVNA 4H0YB 4BR2A 5BN9A 1GLDG 3HZ6A 2Q97A 2ASPA 2ZF5O 1EQYA 4IWVA 1T44A 3FZLA 3H1VX 1GLCG 3EKSA 4BRNA 3FZFA 3D2EB 3O08A 1MWMA 1ZC6A 3EL2A 4FL9A 4JAXA 4BRMA 2E20A 3KVGA 2W40A 4BRIA 1P8ZA 3QBXA 3RSEA 3VEOA 4XH4A 2H3GX 3MN6A 1HKGA 3CJBA 3CQYA 3L4IA 4LC9B 1ZXOA 2WUSA 1KAZA 1XC3A 3QICA 5CE3A 4B1YB 1IG8A 5AQMA 1GLJO 4BR9A 3C7NA 2NLXA 2V7ZA 3H45C 4BVPA 3LL3A 3QMLA 1BO5O 4JD2B 3VPZA 4BC5A 4I6MB 4BRPA 2D4WA 4BC3A 2D1KA 1NGAA 2HF4A 4CZEA 1GLLO 2FSJA 5AQFA 3VERA 2VWBA 5LY3A 3DWLA 4BR7A 5AZJA 1NLVA 2I7NA 5JICA 1U2VA 4DB3A 1JCFA 3VEZA 4CBWA 3BEXA 3FFKB 4FWQA 3O6WA 3FZHA 2E2PA 4AM7A 3RSEB 4FSVA 3S41A 3WEEB 2P9LA 5AQQA 4WQ5C 3LDPA 3LDOA 1U6ZA 2A6AA 4M7XA 4ISGA 4EHUA 5AQRA 3VF2A 1ZBSA 1YUWA 3C7NB 4PKHA 4CBUA 2QXLA 2A5XA 1NGHA 3IDHA 3WXIA 3GDQA 4FWNA 4IJNA 5B8HA 4H0VB 3VEVA 1GLAG 4BQZA 2FSKA 4B1VA 3VGLA 4FOEA 4FO0A 4E1JA 2YJFA 5AZJB 5E84A 4CZKA 1S22A 1U2VB 2QWRA 2ZGYA 1T6CA 3BF3A 4K25A 5AQVA 5BPMA 4JNEA 2A41A 3ATUA 3ID8A 1HJOA 1TUUA 5EX5A 2P9KA 4B1ZA 1X3MA 2P9LB 1GLFO 3GBTA 1DKGD 3H6EA 4JN4A 1DGKN 4CJ7A 2CH5A 2GEMA 4B1WB 4DQ8A 1SQKA 2QWQA 1NGBA 3AAQA 3O1WA 1NGEA 1BUPA 5KPRA 4FWSA 4BRLA 4HTLA 3CERA 3TU5A 3MN9A 3A5MC 5AQPA 1QHAA 1NGDA 4H0TB 2NZTA 4BC2A 4K41A 3ZETB 1TYQA 3B8AX 4FWPA 3DJCA 4BR5A 5EY4A 3W0LA 2A3ZA 5AQIA 4CZIA 4BVOA 5E26A 2YHYA 3I33A 3O1BA 1C0GA 4YDUC 3VOVA 3WXJA 3ZX2A 3GL1A 2IIRA 2ITMA 4EFHA 4QS8A 1D4XA 3SMSA 2HF3A 2FF3B 2V52B 3U9DA 1NGCA 2AA4A 1X9JA 4H0XB 1YXQA 4A2AA 1SAZA 4M63C 4K42A 3MN7A 4FWRA 2QWMA 2PBDA 4AM6A 4J8FA 3I8BA 4H03B 2CGLA 3DXKA 3AARA 4FPAA 2F9WA 5FPNA 1HPMA 3ZX0A 2VYPA 1ESVA 2E8AA 2UYTA 4CZMA 4CZJA 3O80A 3SMPA 3ULEA 1MWKA 1SZ2A 3A0IX 3H3NO 1YVNA 3MMVA 4BRKA 2IVOA 2KHOA 1TYQB 4PL8A 2EWSA 3VEYA 3ZEUA 3QBWA 4QS7A 3CJ1A 3P4IA 2E2QA 2CH6A 4IO8A 4M7YA 1JCEA 4B1XB 5ELZA 5AQWA 4Z94A 1BA1A 5BRHA 5AQOA 3FE1A 4F9OA 2AP1A 4XEIA 4CZLA 4C23A 4IXCA 1HX1A 3LM9A 2ZGZA 2E1YA 3HBTA 5AQXA 3O8MA 1Q18A 3D7EO 4WQ5A 1Y64A 4GY2B 5F0XA 2ZWHA 3DXKB 3R6MA 4CZHA 1R59O 3LDLA 3IMXA 3H46O 2YI1A 4XH1A 1HKCA 1KAYA 5BPLA 5AQLA 4ISFA 4IZ9A 3ULEB 3WXKA 3UKUA 4JHDA 3UE5A 4WQ4C 4XH5A 3QDKA 3ZEUB 3DXMA 5F2RA 2QW9A 2A40A 3CETA 4K43A 4H5NA 1HLUA 1BU6O 3W3DA 2ASOA 2HOEA 2OANA 3CJAA 3QFUA 3MCPA 3WUHA 4NB4A 3U4LA 5AQYA 3ENOA 3UKRA 3BF1A 3UB5A 1QZ5A 4A2BA 3ATVA 3FGUA 1V4TA 4DHYA 2CGJA 1IJJA 4BG9A 3VEWA 4KBOA 3AAPA 5EXWA 3HTVA 4BQLA 3WXLA 3A5LC 1BA0A 3HM8A 3FLCO 3QB0A 1BG3A 4NO7A 1T6DA 3GOIA 3VENA 5AR0A 3FZKA 2P9NA 1QQMA 4FWOA 3O5BA 5AQTA 3WQTA 3WQUA 1ATRA 3KHYA 3UKUB 4PKGA 4JHDB 5AQJA 5BRDA 3M6GA 3VGKA 1JCGA 1X3NA 3CQXA 3DXMB 5AQUA 3FR0A 4RWTA 2Q31A 1NGIA 3VGMA 5BREA 4A61A 3U8XA 1WUAA 5AFUA 4HWIA 2QWOA 3F9MA 1YAGA 3LM2A 4CZGA 4QS9A 5KPZA 3CJCA 4YDUA 2Q0RA 2E2OA 1LCUA 3UKRB 5FPDA 1QQNA 2BUPA 1V4SA 5BPNA 4EAHD 1BOTO 2QWNA 2ASMA 5AZIA 4BGBA 4PL7A 5AQSA 3L0QA 4B1UB 3A5OC 3GE1A 1XQSC 1KAXA 1HKBA 2P9KB 2Q36A 3BP8A 1ATNA 2D0PA 4H5TA 3D2FA 1GLEG 4CBXA 5AQKA 3M3ZA 1NGFA 2F9TA 2CGKA 3H1QA 4EHTA 1TUYA 1GLBG 3VESA 4O5FA 4H5VA 4I6MA 2I7PA 3O4WA 3R8EA 4GNIA 3DAWA 5AFUH 5FPMA 2P9SA 1E4FT 2FF6A 3U9ZA 4PKIA 5BRFA 2YHWA 1BWFO 2NRHA 4BG8A 3HSCA 2IVPA 3BUZB 3EZWA 4H0PA 1CZAN 3VF6A 3MDQA 2P9IA 4EIAA 2A42A 5AZIB 1ATSA 3VEXA 4MO4A 3SLCA 4DCHA 5F1XA 3EKUA 5LJWA 3ZX3A 4BRHA 2QWPA 5AQHA 5KPTA 1LOTB 1K8KA 3MN5A 1KXPA 1RFQA 3WEEA 4BRFA 4RCHA 2E1ZA 4A62A 4BRDA 2GELA 4B9QA 3D2FB 4CI6A 2VCPA 3IUCA 2YHXA 5AQNA 1XUPO 4WQ4A 3A8YA 1G99A 4MLEA 2GWJA 5AQGA 3QFPA 3CJ9A 4H5RA 4RTFD 1DEJA 4IJAA 2YCHA 1Z05A 3TPQA 4BRCA 1NGGA 3VF4A 2P9SB 4BRGA 2PAVA 5KQDA 2HMPA 3G25A 2P9PA 4BREA 1RDWX 2W41A 2E88A 5ADXA 3KZBA 3H3OB 2P9IB 3WT0A 4FWLA 3CHWA 1NM1A 4CD1A 2P9UA 2GTDA 3EN9A 1MDUB 5I9EB 3M1FA 1K8KB 5JLFA 2QM1A 1NMDA 3LDNA 1OKJA 1Z6RA 2YJEA 5TKYA 2Q2RA 1E4GT 1H1VA 3EO3A 3SJHA 3A5NC 4L3QA 5EVZA 4FPBA 3CJ7A 3LDQA 4BRAA 2V51B 3IFRA 3JXUA 5KQ8A 4FWMA 3OHRA 4BRQA 2FSNA 3JS6A 1MA9B 5BR9A 2D0OA 3ZETA 2Q1NA 2P9PB 1NBWA 2GWKA 1J6ZA 4ISEA 3AY9A 3L6QA 4H5WA 3GG4A 5JLHA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2JWLA 5EOYA 3FZMA 5FDLA 3CC4N 1OH7A 4MO5A 1WAJA 1KCFA 5DM6L 3CCSN 1XHXA 3U3YA 2Z1GA 3IG1A 3OYGA 1IBLK 2RN2A 1WSGA 5C12A 5DM7L 1QZ6A 3SUPA 5FLXO 3SK3A 3E66A 3QEVA 1S9EA 2G8UA 4B3MK 1L3SA 3HI0A 1QE1A 2YNIA 1NWKA 4OGCA 2GX9A 4F3OA 5LJVA 3C6UA 4KH4A 4ILHA 2DPNA 4E1NA 4EZ6A 3KK1A 4BR4A 4WYBA 4H0OA 2QEXN 4KTWA 4FJIA 3AA2A 2W42A 3AO2A 3C0BA 3SQ0A 3HZ6A 1NMNA 3NVMA 4B9TA 2D0AA 2ASPA 1OH5A 2JLEA 4IWVA 4BY9C 1BISA 1T44A 5LMNK 4KHUA 2ZQBA 4NXNK 5GAGP 3O9SA 4YOVA 3O08A 1MWMA 3F9KA 2D0CA 4WF9L 1NOYA 1B9DA 3V9SA 4C8OA 4B3SK 2BH1A 1VQ9N 3AV9A 3RSEA 1HRHA 1YITN 3AGKA 1ZXOA 4LSNA 4HUFA 3D45A 4B1YB 1GOBA 1GLJO 1TAQA 1VQ5N 3C7NA 2NLXA 3HVTA 4E7HA 4F4KA 3LL3A 2XY7A 4BRPA 4KTZA 5C2FA 4I9QA 2W00A 1K6YA 2HF4A 1SUQA 4I7FA 5KGWA 4CZEA 3KLFA 4FJKA 1UAXA 1WSHA 3DLEA 1SL1A 2E5LK 4G9ZA 3AO1A 1QSLA 2G8FA 3KWGA 1FK9A 1RBTA 3BEXA 3FFKB 1IG9A 4KO0A 5LL6Z 3FZHA 2E2PA 4DTUA 4CJEA 4M7XA 4ISGA 4DR5K 2NRWA 4EHUA 4RW7A 1XI1A 4CEAA 4CBUA 4I2QA 4DFPA 1NKEA 4LF8K 2O4GA 2DY4A 3G4SN 3GDQA 4FWNA 4MDAA 1T7PA 4IJNA 1JLEA 4M42A 5EU7A 1LWFA 3VGLA 4E1JA 1HJRA 1XNRK 4LFBK 4CZKA 4DQIA 1T6CA 3ZYYX 1WSFA 2WBNA 3THYA 2QK9A 3SZ2A 4FJHA 3ATUA 3ID8A 5EX5A 4DSIA 2P9KA 3NHGA 5HRPA 1KQSM 1X3MA 3PY8A 4I9LA 1Q8IA 3VQPA 3WNGA 5HL7L 3G71N 4OPHA 1BL3A 2GEMA 1W97L 4FLYA 1IKVA 4B1WB 3V9XA 1BUPA 1Q9YA 4PWDA 3NF6A 2E4LA 3PV8A 4DU3A 1X9MA 3I56N 1D9FA 2G8KA 1ASWA 3A5MC 3OS1A 1VSLA 2YKMA 5LMUK 1T8EA 1K8AO 4HHTA 2C1IA 3B8AX 3O9UA 5EY4A 3ZT2A 3W0LA 5HLFA 2F8TA 4CZIA 2ZJPL 3ITHA 4CEFA 1C0TA 2XO7A 2HHUA 2YHYA 3AVHA 4YDUC 3VOVA 4DQSA 3QIOA 3VTIA 4DUZK 2IIRA 4FLXA 2HHWA 1RT7A 3SMSA 3K9KA 3K9JA 1ZYQA 5CR4A 3VN5A 5HOOA 2WC9A 4K42A 2NNWA 1CLQA 1VQON 2EHGA 2PBDA 3QERA 3AARA 2O8DA 3LPTA 2X74A 3OYNA 3ZSYA 2VYPA 2E8AA 3TAPA 3O80A 4FM1A 4DG1A 1MWKA 2QKBA 3A0IX 4PL8A 4Z4EA 1M90O 1EO1A 1JCEA 1CZBA 4JI2K 3I8DA 5ELZA 2PY5A 3FE1A 1RT4A 3LWMA 4CZLA 4JI5K 1YIJN 1EXQA 3LM9A 4CEOA 4CJ5A 3HBTA 5AQXA 3QINA 3MAQA 1Y64A 5F0XA 5M1FA 2ZWHA 3ZSQA 4CK1A 3SUOA 4IFEA 1U47A 3TAQA 3IMXA 2YI1A 1HKCA 4JS5A 4FJ9A 2GBZA 3ULEB 3P1GA 4C1NI 3UKUA 1ASVA 3LP0A 4WQ4C 3QDKA 3LALA 3CCMN 1LWEA 4B9UA 5J2MA 4H5NA 1HLUA 3W3DA 4NYNA 4Z4GA 4IOAL 3VMFB 1QVFM 4C8LA 4FJ8A 1YT3A 3OYJA 4GW6A 4CHNA 1C6VA 3UB5A 1QZ5A 4A2BA 3C6AA 4C8KA 3FGUA 3SUQA 4LF4K 1D5AA 4B9VA 1ZBUA 3J7AP 3WXLA 2O8EB 1Z25A 1ITGA 4NO7A 2P5OA 2O4IA 3GOIA 5AR0A 1CXQA 3FZKA 1EKEA 1WBBA 5AQTA 3WQUA 2B5JA 1ATRA 3LZJA 3KK3A 4JHDB 4N56A 3QEXA 3TANA 3M6GA 1JCGA 2KFNA 1J53A 1X3NA 3CQXA 3FR0A 4RWTA 4JKHA 3U8XA 1KRPA 2YNHA 3HXMA 3LM2A 4CZGA 4HTUA 5KPZA 4ICLA 4BE1A 3DI6A 3UKRB 3K5LA 3KKRA 4W5RA 1IKYA 4EAHD 1YHQN 4DF4A 5AQSA 3L0QA 3A5OC 4KREA 1XQSC 2P9KB 4Q5VA 5KI6A 1KLNA 4H5TA 4C1NK 4CBXA 2X6SA 3M3ZA 5AQKA 3PIPL 2UUCK 1NKBA 4PQUA 4B3TK 2CGKA 3H1QA 1TUYA 3O3FA 3NMUA 2O8BB 4O5FA 4H5VA 3H08A 4H8KA 3O4WA 4X64K 2YKNA 5AFUH 2FBTA 1XHZA 2D5RA 1RNHA 4BG8A 1MU2A 4CEEA 3BUZB 4DV3K 3SQ1A 5HROA 4RW8A 4AF1A 2WONA 2PZSA 4MO4A 5LJWA 3EKUA 3DLLL 3ZX3A 2QWPA 4LH5A 5AQHA 1VSJA 4CF1A 3OYAA 1KXPA 1RFQA 2E1ZA 3IS9A 4A62A 3ENBA 2GELA 1RDDA 2JGUA 3IUCA 3L3UA 1G99A 4BE7B 4CHQA 3J81O 2RE2A 4DV6K 4IOCL 4IJAA 1NJWA 1Z05A 3LP2A 4BRCA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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