4H0XB

Crystal structure of nad+-ia(e380a)-actin complex
Total Genus 121
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
121
sequence length
370
structure length
358
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Arginine ADP-ribosylation mechanism based on structural snapshots of iota-toxin and actin complex
pubmed doi rcsb
molecule keywords Iota toxin component Ia
molecule tags Toxin/structural protein
source organism Clostridium perfringens
total genus 121
structure length 358
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-09-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4h0xB01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4h0xB02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 4h0xB03
4IZ9A 3H46O 2E2OA 5AQKA 4LC9B 3WXIA 4BRGA 3WT0A 4BR7A 3WEEB 1S3XA 3ZEUA 2A42A 4FOEA 3HI0A 4BRMA 1QZ6A 2P9KB 5AQUA 5BN8A 4NB4A 3GG4A 1E4GT 2D4WA 2A40A 3TU5A 1Z6RA 1LOTB 1JCEA 5AFUH 3CHWA 2QWNA 3MDQA 1ESVA 4WQ5C 1HUXA 3ATUA 1X3MA 1XQSC 3EKUA 4QS8A 2FSNA 4XH1A 4B1VA 1SAZA 3DXKA 4CBWA 2QWRA 3VF6A 4CZGA 3L6QA 4BRNA 3UE5A 3QBWA 4MLEA 4BRPA 2ASMA 1U2VA 3EN9A 3IUCA 5LJWA 1BWFO 1ZC6A 3AAQA 5F2RA 1V4SA 2VYPA 2YJFA 3VEWA 4ISGA 3UKUB 3ULEB 3D2FA 4BRAA 5AQTA 1GLJO 4HTLA 1BO5O 2CH5A 4RTFD 5AQPA 5FPMA 2IVPA 3FLCO 4XH4A 4B1XB 2E2NA 1T6DA 1GLAG 4CJ7A 3CJCA 3I8BA 4M63C 2D0OA 4EFHA 3HBTA 4BVPA 1BA1A 2PAVA 4H5WA 4I6MA 3VEYA 3CJ1A 3GDQA 1KAZA 3IFRA 3CQYA 5BRDA 1NGBA 2YI1A 5FPDA 1C0FA 3WXKA 2YHYA 3W3DA 4CZIA 1H1VA 2CH6A 4H0OA 3VENA 2D1KA 3VF4A 2Q0RA 3QBXA 2P9NA 1MA9B 5AR0A 4CBUA 5JLFA 1QZ5A 4PL7A 5EX5A 4H0YB 1QHAA 5AQOA 4BQZA 2FF6A 3BF1A 1IJJA 4BR2A 1NGEA 1NGCA 3R6MA 1X9JA 1S22A 1NGFA 4FWSA 2V52B 4H0TB 2FLOA 4QS7A 4BR4A 3J8AA 2FSJA 4A2AA 2AA4A 4PL8A 4DHYA 4Y0WA 5BRFA 1XUPO 4B1YB 2ZF5O 3A5NC 3EL2A 2ZGZA 5EY4A 1ZXOA 2A41A 1NWKA 1ZBSA 5FPEA 4H0VB 1DGKN 3ENOA 3BF3A 1MDUB 3FZHA 5AQMA 3P4IA 3DXMB 2V7YA 3MN9A 2Q36A 4L3QA 3U9DA 2GUPA 4M7YA 1QQNA 4BGBA 2P9PA 3HSCA 2ZWHA 3AARA 3WEEA 4CZEA 3A5OC 4H0XB 3H1QA 5AQXA 5KPTA 4EIAA 4CZKA 4CZHA 2P9KA 2D0PA 3LDPA 3VF2A 4BVOA 5AQJA 3C0BA 1HKBA 3EKSA 4FWMA 2E88A 2NLXA 4BC4A 3ZETB 5AQGA 3VEVA 4JN4A 4YDUC 2E2QA 3HZ6A 3L0QA 5BREA 3SLCA 3ATVA 5KPRA 2QWLA 2ASOA 4K42A 5AQHA 3SJHA 3U8XA 2QWOA 1U6ZA 4BR0A 4NO7A 2J4RA 2P9PB 2FF3B 3FFKB 3KZBA 3WQTA 4FWQA 3MCPA 4IXCA 3CI5A 1GLCG 4BC5A 2E1YA 4O5FA 5ELZA 5TKYA 2F9WA 4AM6A 4IWVA 1NBWA 4DCHA 2P9LB 5KPZA 1TYQB 3UKUA 3ULEA 4FL9A 1E4FT 2VCPA 4B1UB 4C23A 1HKGA 2KHOA 3O5BA 1V4TA 3AY9A 1WOQA 2V7ZA 3H3NO 4MLHA 2W41A 1X3NA 3OHRA 4Z94A 1GLBG 1HKCA 4CD1A 4M7XA 3LL3A 3UB5A 1ATNA 3QFPA 4FWKA 5B8HA 3F9MA 3H6EA 3VERA 2DPNA 3CQXA 5JLHA 3L4IA 3QFUA 4FWNA 3VPZA 4EAHD 1BG3A 4PKIA 4IJNA 5LY3A 3O08A 3VGMA 3FE1A 4BR5A 5AQIA 3MN6A 4GNIA 3O8MA 1KAYA 1RGIA 5BPMA 4CD3A 3BUZB 4A2BA 1NGAA 1Y64A 3LM2A 1WUAA 5EXWA 3LDOA 4CZFA 5AZJA 1GLDG 2QM1A 5AQNA 5E26A 4BRFA 4FWPA 4CZJA 1BU6O 2QWQA 3FZFA 3UKRB 1BDGA 4BROA 1TUYA 1J6ZA 3GE1A 5CE3A 3TPQA 3BEXA 3H45C 2EWSA 5AQSA 1BOTO 5EOYA 2QW9A 3VGKA 4FPBA 1C0GA 2A5XA 1R59O 2Q31A 4O8KA 3CJ7A 1HPMA 2BTFA 5AZJB 4E1JA 3B8AX 4FOIA 3W0LA 5FPNA 3GOIA 1XC3A 3VEXA 1YVNA 1T44A 2AP1A 1RDWX 3KHYA 3CJ9A 3DXMA 3O1WA 1CZAN 1ATRA 4JNEA 4CI6A 2W40A 2P9IB 3IMXA 4BRLA 3O1BA 1GLEG 4ISEA 3GL1A 2I7PA 4BQLA 3CETA 5AQRA 4WQ4A 4BRKA 3ZETA 1Z05A 2ASPA 4EHTA 4FSVA 2GELA 2VWBA 3A0IX 3VETA 3O4WA 4DQ8A 3DWLA 4IJAA 3RSEB 4IO8A 3SMSA 2YJEA 4BRQA 3M1FA 3O80A 5LJVA 1YAGA 4FWRA 1BUPA 1KAXA 4JHDA 3SK3A 4CZMA 1JCGA 2GWKA 3DAWA 2F9TA 2P9LA 5JICA 1TYQA 4A62A 2CGKA 3BP8A 3A8YA 3D7EO 5AQVA 2E8AA 2YHXA 2UYTA 1YXQA 1IG8A 3VOVA 4JHDB 4PKGA 2QWPA 3KVGA 2ITMA 2IIRA 3U4LA 4RWTA 5BPLA 3MN5A 5AQLA 5KQDA 4RCHA 3VESA 4BREA 1HLUA 4PKHA 4WQ5A 1DKGD 4K25A 2A3ZA 2QWMA 1NGIA 1RFQA 2GWJA 3EZWA 3VEZA 3WQUA 4H03B 4F9OA 1KXPA 3R8EA 3GBTA 2IVNA 2I7NA 3O6WA 1GLLO 1HJOA 1MWKA 3FR0A 3H3OB 4MO4A 2Q97A 3D2EB 3CJAA 4XEIA 2FXUA 2QXLA 3CIPA 1MWMA 1G99A 2P9SA 3UKRA 3R9PA 5ADXA 4H5TA 4WYBA 2HMPA 3HTVA 1NGJA 4XH5A 3ZX3A 2YHWA 1P8ZA 1SZ2A 3FZLA 5AQQA 4DB3A 2HOEA 3QDKA 4FWLA 1NMDA 3WXLA 3ZEUB 4JAXA 3M6GA 2E20A 2H3GX 3CJBA 1TUUA 1OKJA 5BPNA 1K8KA 1GLFO 3ZX0A 4BC2A 2CGJA 2P9SB 3QMLA 4KBOA 2HF3A 3FZMA 4K43A 1ATSA 1YUWA 2BUPA 3G25A 1NLVA 3I33A 4ISFA 3DXKB 3LM9A 2YCHA 3EO3A 5AQWA 1U2VB 3CERA 3HM8A 5AZIA 4BGAA 2P9IA 4FPAA 4EHUA 4K41A 2OANA 3JS6A 1K8KB 3H1VX 1NGHA 4CBXA 4BRCA 3D2FB 5I9EB 3ENHA 4JD2A 3RSEA 2V51B 4B1ZA 3LDNA 4BRIA 4A61A 3FZKA 1NGGA 1DEJA 3DJCA 3FGUA 3LDLA 1QQOA 2ZGYA 3C7NA 5AZIB 3ZX2A 4QS9A 4BG9A 5AQZA 2E1ZA 2GTDA 3A5LC 5F0XA 2Q2RA 1T6CA 3SMPA 4BRDA 5JMVA 4I6MB 5ADXH 5BRHA 5AFUA 2P9UA 4H5NA 4J8FA 4HWIA 4BR9A 2HF4A 2Q0UA 2Q1NA 3LDQA 4JD2B 2IVOA 3VGLA 5F1XA 4MO5A 3S41A 5KQ8A 1EQYA 5BR9A 4H0PA 3QB0A 3WUHA 1NGDA 3QICA 4GY2B 3C7NB 2NRHA 2P9NB 1SQKA 4FO0A 4BRHA 4BC3A 2PBDA 5EVZA 4H5VA 4AM7A 3MMVA 2A6AA 4BG8A 2NZTA 4WQ4C 2P9UB 3WXJA 3VEOA 1Q18A 4H5RA 4YDUA 4B1WB 1D4XA 1NM1A 3MN7A 5E84A 2E2PA 1JCFA 2FSKA 1QQMA 2GEMA 4FWOA 4CZLA 5AQFA 5BN9A 2WUSA 3AAPA 1LCUA 5AQYA 3D2EA 1HX1A 3JXUA 3U9ZA 3A5MC 1BA0A 2CGLA 3MK6A 3M3ZA 3ID8A 3IDHA 4B9QA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2BANA 3SUNA 4FLTA 4DTSA 4FJMA 4LC9B 4BRGA 2O4IA 3SPYA 4ELTA 3MECA 4CJEA 3RMCA 4C8LA 4CIEA 1QZ6A 5SZTA 4KRFA 3N4PA 3GG4A 2D4WA 4CJTA 2VWJA 2HBMA 1VQON 5C24A 4YOVA 1JCEA 1VSFA 3V9SA 1YI2N 4WQ5C 1NOYA 1W2BM 1XQSC 4YY3K 4QOZB 4B1VA 4M41A 2E5LK 4BRNA 3CC2N 1S9GA 1HYZA 3EN9A 1JXEA 1BWFO 1Q9YA 3AAQA 4FJ5A 2IOCA 1ASUA 1CZBA 2VYPA 1Y97A 3UKUB 3ULEB 4GKKK 2CH5A 4RTFD 3TI0A 1ILYA 4KHUA 3DLKA 3OW2M 2E2NA 1T6DA 1GLAG 4B3SK 3I8BA 3HBTA 1IO2A 3R1XA 1RTHA 4NCBA 1BL3A 1BA1A 2PAVA 3VEYA 1VSDA 4JKGA 1TAUA 3IFRA 5BRDA 2YI1A 3W3DA 4CZIA 3CPEA 3T7ZA 2JGUA 1YJWN 2Q0RA 3QBXA 5DMRA 5AR0A 3TTCA 4CBUA 2E6MA 5KRTA 2G8WA 4IKFA 5EX5A 4H0YB 4HVJA 3BF1A 4OPJA 1X9JA 1C0MA 1OVYA 1BCOA 5HOOA 1T8EA 1UWBA 4M3TA 4FLWA 4LH4A 3V81A 2FLOA 3T19A 2FSJA 2NUBA 4KHNA 3AVMA 3QEWA 4FVUA 3PX4A 3CCSN 2ZGZA 1ZXOA 1ZBSA 2ZJRL 3I8DA 4E1NA 1MDUB 1WN7A 4AF1A 4O44A 4DQRA 4Z4EA 3CC7N 4L3QA 3U9DA 1SL1A 3C6HA 1KTQA 3WNEA 3WEEA 3AARA 5J2NA 4B3MK 4DTJA 5AQXA 3CCRN 3WNGA 2P9KA 1TK8A 3LDPA 4BVOA 1QTMA 1SL0A 1BQNA 1RT4A 2NLXA 4IBNA 3I0SA 3VQ4A 1Q86O 3VTHA 3D45A 5AQGA 2D5RA 4YDUC 3HZ6A 4IEIA 5C12A 2OA8A 4G9ZA 4M3UA 4K42A 4FJIA 5HRPA 4DV0K 4Z4IA 1OVQA 2HBKA 2J4RA 1VSJA 3FFKB 4FWQA 3MCPA 4IXCA 5M1OA 5DM7L 1GLCG 1W97L 3KWIA 2F9WA 4AM6A 1NBWA 1S6QA 1T03A 2O4GA 4CHOA 1LW0A 4JI3K 4JI0K 1E4FT 4DSEA 4G1QA 1ITGA 4C23A 2KHOA 3AVCA 1VQ7N 1XWLA 4Z4GA 4DFMA 3AY9A 1ASWA 2W41A 3CQ8A 3OYMA 2YNHA 1X3NA 4EP4A 3NMUA 5CR4A 1Q7YO 3QEIA 1EWRA 4FWKA 5B8HA 1TAQA 3KLFA 3H6EA 4A59A 5JLHA 4ZHRA 1BG3A 4C8NA 1JLQA 4IDKA 4PKIA 3P5JA 4LF8K 4JEPA 3B6PA 3VGMA 3FE1A 4BR5A 4CEQA 3RMDA 1YIJN 3O8MA 1ZYQA 5KGWA 4W5RA 4A2BA 3VQBA 3HK2A 1M1KO 1WUAA 4DF4A 5LL6Z 1GLDG 3LANA 2VG5A 1N32K 2O8CB 1BU6O 3KJVA 3ZYYX 5CYMA 3P31A 3T1YK 2UXCK 1EO1A 2OYQA 1ASVA 1L5UA 4O4GA 4CF2A 5HRNA 4ID1A 5AQSA 4H4OA 3CMAN 4DSIA 1C0GA 2G8UA 4B9TA 2W42A 3W0LA 4CCHA 4JI5K 4CJRA 3CF5L 2XY5A 3ZLJA 4UY8O 4W5NA 2HHIA 2RE2A 2VQFK 1TGOA 2OZMA 4BE2A 2HMIA 3DXMA 3TAEA 3BZCA 1WBBA 1HNIA 3G4SN 3SAGA 4JNEA 4CI6A 1EETA 2B5JA 4J2EA 2P9IB 4BRLA 3O1BA 4KTQA 4ISEA 5DK5A 3GL1A 3E9PA 2I7PA 3CETA 3MEGA 5AQRA 5E41A 4DV2K 1KLNA 2VWBA 4ELUA 3VETA 3O4WA 4DV7K 3LZIA 4BRQA 1TVRA 3LAMA 1CZ9A 5TKWA 5LJVA 4JHDA 4CZMA 3DAWA 1TYQA 1KSPA 2C1IA 3BP8A 4BY9C 2ITGA 3TSQA 3VQPA 3HJFA 2E4LA 2BDPA 2Y1IA 1XMOK 5CY4A 3VOVA 3K9KA 3K59A 1QSSA 3T1HK 2B4JA 2IIRA 4DFPA 3M5RA 3TR8A 2FBYA 4KHWA 2GBZA 5AQLA 2X78A 4DR3K 4BREA 1N34K 4BACA 1HLUA 2HB5A 4C1NI 4WQ5A 1IKYA 4E7KA 4OX9K 4KKOA 3THYB 3EZWA 4CK1A 1QSYA 4H03B 3SUOA 1D9FA 4LF4K 1QE1A 3K5NA 3DM2A 4XJXA 1X9MA 4DFJA 4E7JA 4RW9A 1VRUA 1GLLO 4FJ7A 4DS5A 4O55A 3CJAA 4E3SA 1IBMK 1RDUA 3CIPA 1MWMA 2P9SA 3UKRA 5ADXA 4WYBA 2QA4N 1S1WA 4AHTA 3JYTA 4WFNL 2YHWA 5HP1A 4A5AA 4FWLA 1NMDA 3WXLA 4I9LA 4RW8A 3M6GA 3SAFA 3OVNA 5JENA 4X62K 3CJBA 1OKJA 4IDHA 3O4NA 4ICLA 3ZT1A 4BC2A 3CYMA 4CJ3A 1ATSA 1YUWA 3PIPL 3RMBA 4HTUA 4JKEA 3OYJA 4CK3A 3CERA 4DWIA 3AVAA 3KLIA 4DV3K 2P51A 4EHUA 4K41A 2ZJQL 4LF5K 3JS6A 1K8KB 3E1YA 1NGHA 1NKBA 4BRCA 3L3VA 3NGIA 1BIUA 4QCLA 3OYEA 4JD2A 3OYNA 5FROA 1VQMN 3MWTA 4BRIA 1NGGA 2DFHA 3LDLA 2ZD1A 3HSTB 2ZGYA 3C7NA 5AZIB 5HRSA 4BG9A 5AQZA 4IO9L 5F0XA 2Q2RA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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