4H0XB

Crystal structure of nad+-ia(e380a)-actin complex
Total Genus 121
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
121
sequence length
370
structure length
358
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Arginine ADP-ribosylation mechanism based on structural snapshots of iota-toxin and actin complex
pubmed doi rcsb
molecule keywords Iota toxin component Ia
molecule tags Toxin/structural protein
source organism Clostridium perfringens
total genus 121
structure length 358
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-09-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4h0xB01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4h0xB02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 4h0xB03
5F2RA 5LJVA 1D4XA 3CJ7A 2Q0UA 5EXWA 4J8FA 4WQ4A 3VGMA 3FZHA 4H0YB 2H3GX 3FZFA 4YDUC 1T44A 3DXMB 2YHWA 2IVNA 3W3DA 2CGJA 2A3ZA 3AARA 4BROA 4BRCA 1RGIA 4BGBA 3AAPA 5TKYA 4CBUA 4M7XA 3O5BA 3G25A 2P9KB 1QZ6A 2VYPA 3R6MA 4BRAA 5JICA 5KPTA 3FE1A 4JN4A 2FF3B 3I33A 4FWSA 3CJBA 1KAYA 5BREA 4A2AA 1C0FA 2P9NA 5KQ8A 1BA0A 2UYTA 1QZ5A 3VF6A 4H5TA 1HJOA 3O8MA 4BGAA 5EX5A 2ASMA 3U9ZA 1NWKA 4BVOA 2A40A 3L4IA 3O6WA 4QS9A 4YDUA 3UKRA 3GG4A 4F9OA 2QW9A 3D7EO 1C0GA 4IO8A 1LOTB 3HSCA 4PL8A 2Q2RA 3H3OB 3KVGA 3HBTA 4LC9B 5AQVA 3H6EA 2E2PA 3MN9A 3ENOA 4ISEA 4JHDB 3SMPA 5KPZA 4MLHA 4HTLA 5BPNA 2V7ZA 3M6GA 5AQXA 2W40A 3BF3A 3WXKA 1R59O 2VCPA 2ASPA 1S22A 1X3NA 1GLAG 2BUPA 3H3NO 3P4IA 3ZEUB 4I6MA 4IWVA 3WT0A 1QQMA 4MO4A 1TYQB 4CZFA 1WUAA 3I8BA 2FSJA 4BC2A 1HUXA 1X3MA 2E88A 2P9LB 2YJFA 3DXKA 5CE3A 1YXQA 3CJAA 4Z94A 1S3XA 4ISGA 2P9UA 3FGUA 4M63C 2E20A 5AQIA 4FWLA 4CZKA 4FSVA 4XEIA 3EO3A 2GUPA 3ULEB 1TUUA 1Z05A 4FOEA 4JNEA 4QS8A 4BG9A 2FF6A 1TUYA 2ZWHA 1CZAN 1NGEA 3TU5A 3D2FB 3RSEB 1BU6O 4IJAA 4BR7A 3CJ9A 1MWMA 5AZIB 4BC4A 3W0LA 3GOIA 5AQRA 3O08A 2VWBA 5AQPA 5AQQA 4BR9A 4CJ7A 4PKHA 2IVPA 3GE1A 5AFUA 3QFUA 4K43A 4H5WA 5AZJB 4K25A 3GDQA 4BRQA 2Q97A 4H5NA 5BR9A 1BO5O 3LM2A 3M3ZA 3SMSA 3HM8A 3VGLA 2CGKA 1BDGA 2GWKA 2QXLA 2V51B 1T6DA 4O8KA 4FO0A 1NLVA 4CD3A 5EVZA 4BRMA 3MN7A 4L3QA 3A8YA 5BRFA 4B9QA 2YCHA 1BA1A 4BC3A 2HMPA 5AQOA 1U6ZA 2P9SB 2HF3A 2GELA 1NGBA 3H46O 3EL2A 5JMVA 3MN5A 5BPLA 4FPBA 4FWNA 3H1VX 1YVNA 2Q1NA 2QWQA 5FPEA 3HI0A 1SQKA 4H0PA 3UKRB 1GLEG 2NZTA 1MWKA 5AR0A 4CZIA 3IDHA 3VGKA 4KBOA 1XC3A 4BRPA 4HWIA 3CQYA 3C7NB 3VF2A 3VENA 1DEJA 2E2OA 4DCHA 4H5VA 5E26A 4BVPA 4BRGA 1ATSA 1ATRA 3VPZA 2D0OA 3H45C 3WXIA 5F1XA 3HZ6A 3GL1A 4JAXA 1GLDG 2P9IA 4RCHA 1Q18A 4GNIA 1ZC6A 3HTVA 3LL3A 4PKGA 1WOQA 1K8KB 4BRIA 2QWRA 4FWQA 5AQGA 2ASOA 3FFKB 3WUHA 5AQFA 3ATVA 3MK6A 1JCGA 4IJNA 3QICA 2OANA 2ZGZA 4BRFA 5EY4A 1GLFO 4NO7A 3WQUA 3LDPA 4XH5A 3CHWA 4EFHA 2I7PA 1EQYA 2V7YA 1X9JA 4MO5A 5ADXA 3KHYA 5AQMA 4K41A 4A61A 4CZJA 3AY9A 4BR5A 3OHRA 5E84A 3CJ1A 3U4LA 4BRDA 2WUSA 5AQJA 3WEEA 4B1XB 4CZLA 3UKUA 3AAQA 4H5RA 4QS7A 2P9PA 4B1WB 1HKGA 5BRHA 5FPMA 3QBWA 4BREA 4CI6A 2ITMA 2PAVA 3DXMA 3A5LC 3BEXA 5BN8A 3ENHA 3DAWA 1GLCG 5AQUA 4BR4A 1LCUA 1J6ZA 1JCFA 2IIRA 2QWMA 3U9DA 1Z6RA 3VEVA 1ATNA 4O5FA 2PBDA 5AQZA 4PKIA 4BQLA 3A0IX 1NGDA 4WYBA 1RDWX 2Q36A 3ZX2A 2E1YA 5FPDA 2E2QA 2CH6A 5I9EB 3ZETB 4Y0WA 2GWJA 4RTFD 1BWFO 3WXLA 1U2VB 2ZGYA 4CZEA 1NGHA 4H03B 1ZXOA 4JD2B 1YAGA 1DGKN 4EIAA 4FWPA 3J8AA 3A5OC 3IMXA 1GLBG 3O1WA 3EKUA 3VEYA 3QMLA 1IG8A 1QHAA 2DPNA 5JLFA 1XUPO 2QM1A 1KAZA 3FLCO 3C0BA 4AM6A 1NGIA 2YHXA 1BOTO 3CI5A 3BF1A 5BN9A 3S41A 3D2EA 2NLXA 4JHDA 5KQDA 4BR0A 3R9PA 5AQNA 3ZEUA 1NGAA 3R8EA 3KZBA 4C23A 2P9NB 2YI1A 3VOVA 3WXJA 5AQKA 3UB5A 1IJJA 1TYQA 4CZHA 3B8AX 4A62A 2P9LA 1GLJO 1YUWA 1ESVA 3EN9A 1HKBA 5LY3A 3VERA 3WQTA 1NGJA 3LDQA 3ULEA 4BRKA 2YJEA 2A5XA 3LM9A 5JLHA 3CERA 3D2FA 3RSEA 5AQWA 2A6AA 5AZIA 1BUPA 4B1VA 4H0OA 1NMDA 4XH4A 3VF4A 1JCEA 1MA9B 1HPMA 4IZ9A 3IFRA 5AZJA 1HLUA 3CETA 4I6MB 1H1VA 3EKSA 4AM7A 4FPAA 4FWOA 3CJCA 2BTFA 3U8XA 1SZ2A 3DXKB 4CZMA 2P9UB 3VESA 3LDOA 3VEWA 3ATUA 3CQXA 4DQ8A 3QFPA 3H1QA 5B8HA 3O80A 3MDQA 5AQLA 2P9SA 1V4TA 4E1JA 3O1BA 2E2NA 2NRHA 3JS6A 1E4GT 1GLLO 3GBTA 2V52B 3VETA 3ZX0A 3MMVA 3LDLA 3M1FA 2AA4A 1XQSC 4CBXA 4WQ5C 3DWLA 2ZF5O 5AFUH 3JXUA 1NGFA 4MLEA 3SK3A 4BG8A 2Q0RA 1NBWA 3C7NA 2QWPA 3QDKA 3O4WA 3ZX3A 4B1ZA 2F9WA 2Q31A 2P9KA 3SLCA 3D2EB 4A2BA 2E8AA 4EAHD 4FWKA 1P8ZA 1NGGA 3L6QA 3F9MA 1ZBSA 4XH1A 3VEZA 4NB4A 1K8KA 5KPRA 4M7YA 5ELZA 2D4WA 3A5NC 2QWLA 2FSNA 3FZMA 3IUCA 1OKJA 3QB0A 4FWRA 4BRNA 1E4FT 2HF4A 2CH5A 2KHOA 3MN6A 4BR2A 4WQ5A 4BC5A 2QWOA 4BQZA 4B1UB 1NGCA 1KAXA 2QWNA 2GEMA 2A42A 5AQTA 4FOIA 5AQYA 2D0PA 3A5MC 4H0TB 5BRDA 2FLOA 4ISFA 3BP8A 4BRHA 4CZGA 1G99A 2A41A 2IVOA 1V4SA 3QBXA 5AQHA 5F0XA 2P9IB 1QQNA 2W41A 2AP1A 2FXUA 5FPNA 1NM1A 3FZKA 4WQ4C 3FR0A 4B1YB 4DB3A 4DHYA 3MCPA 4EHUA 3EZWA 4H0XB 2F9TA 4IXCA 5EOYA 5BPMA 5AQSA 3VEXA 1RFQA 1SAZA 3BUZB 2J4RA 3L0QA 4CBWA 1BG3A 2D1KA 1DKGD 2GTDA 4CD1A 1QQOA 3DJCA 4K42A 2HOEA 1HX1A 1HKCA 4FWMA 3SJHA 3FZLA 4EHTA 5ADXH 5LJWA 4RWTA 3LDNA 1T6CA 2FSKA 4H0VB 3UE5A 3CIPA 2I7NA 4GY2B 2EWSA 3ZETA 4PL7A 2CGLA 1Y64A 3TPQA 2YHYA 3WEEB 1U2VA 3UKUB 2E1ZA 4FL9A 2P9PB 1MDUB 3ID8A 3VEOA 4JD2A 1KXPA 4BRLA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1EKEA 5LJVA 5EXWA 4H0YB 3KK1A 4DTUA 1Q81O 2OCEA 4BRCA 4RG8A 5JVHL 1DT9A 5TKYA 1TKTA 3I56N 4XJXA 1Y97A 3G71N 1HRHA 2HW3A 4HVJA 2EHGA 3DI6A 3SQ1A 3J7AP 1C0FA 1WLJA 4CEQA 5MLCQ 4H8KA 3KLIA 4JRQA 3O8MA 4LD0A 1REVA 3MX5A 3LZJA 3U3GA 1NWKA 4DQIA 2A40A 3CMAN 1SS6A 3G6EN 3SQ4A 2QW9A 4DQQA 1X1PA 5FDLA 1NNEA 1J9AA 3AO4A 1EP4A 4IFYA 1N8RO 1YJNN 1LOTB 2QA4N 1VQ8N 4DSIA 3OA9A 4PL8A 3THYA 4E7KA 4E7IA 4OVLA 3HBTA 4M3WA 3SUQA 3SV4A 3AO2A 4FVMA 2OYQA 3P39A 3SMPA 4W5QA 5KPZA 3MXJA 1RBRA 1Q8IA 3LWLA 2ASPA 1S22A 1X3NA 3ZEUB 3D45A 4F4KA 1TL1A 3OY9A 4CZFA 2VG6A 1WSFA 2FSJA 4BC2A 2P9LB 2E88A 3DXKA 3PO5A 1CXUA 5GAHP 4W5TA 1KVCA 4CZKA 4XEIA 4GKKK 3I0SA 3ULEB 3OBYA 1TUUA 1Z05A 3CMEN 3HPGA 3PO4A 1CZAN 1LW0A 3F5TA 4CHNA 3RSEB 1BU6O 4BR7A 1NG9A 3CJ9A 5AZIB 4WE1A 3OS0A 3GOIA 3AVHA 3O08A 2UUBK 2VWBA 4BR9A 4CK2A 4RW6A 4CJ7A 4PKHA 1EWRA 5AFUA 3AVGA 4YFUA 1KSPA 2DFEA 1HMVA 3ZSXA 1K73O 4DV1K 5I42A 2CGKA 1RCHA 1NOZA 1T6DA 3ZLJA 4LF4K 2DFHA 1TAQA 2G8HA 1BISA 5EVZA 3AGKA 1FXXA 4PWDA 2BANA 3MN7A 3NVMA 2KZZA 3HM9A 4B9QA 3IS9A 1QSYA 3KLFA 2O8EA 3EY1A 3T7ZA 1U6ZA 2HF3A 1BQMA 1L3SA 3EL2A 5BPLA 1XHZA 4ILHA 1RDDA 5C12A 1CLQA 4CJQA 4NLCA 4CJTA 2Q1NA 4ELUA 2NZTA 1MWKA 1S9GA 3E1YA 3P1GA 3ZT0A 4K0KK 3C7NB 3VF2A 3VENA 4DFJA 4DSJA 5M1FA 1J5OA 1ATRA 1ATSA 2F8SA 1GLDG 2P9IA 1Z25A 4MFBA 1Q18A 4CEOA 1IKXA 4PKGA 4RW7A 5AQFA 3ATVA 1S1WA 4OPAA 2QTDA 2ZGZA 4BRFA 1BIZA 3VQDA 1JXEA 3OS2A 3O9QA 4JI1K 1GLFO 4DSFA 2B5JA 4EFHA 2I7PA 1JLGA 3OYBA 1EQYA 2V7YA 2IDOA 5ADXA 4BR5A 5E84A 1GOCA 4ILGB 4HUGA 1A5WA 2VGNA 4BRDA 2WUSA 3CC2N 4R79A 3AO3A 1BI4B 4B1XB 2D0BA 4IKFA 3KKSA 3AVCA 3UKUA 4QS7A 2P9PA 2IOCA 4WF9L 4AHCA 3LWMA 1Q7YO 4FJMA 1M1KO 3B6PA 3DXMA 3CCLN 5BN8A 5C24A 4MQ3A 3U9DA 4O5FA 4YOVA 4OGEA 4WYBA 1VSDA 3O4QA 5DM6L 1NJXA 1KLMA 3QEVA 3OYDA 2YV0X 4JI0K 3NH1A 5I9EB 5E41A 2GWJA 4CJWA 3DLRA 3CFPA 3I0RA 3F73A 4M42A 2ZGYA 2VWKA 2VG7A 4CZEA 1NGHA 3ZSYA 1W2BM 4YORA 4H03B 2O8DA 2QI2A 1DGKN 5HRRA 4EIAA 3J8AA 4OGCA 3A5OC 3ZCMA 3L3UA 3AVFA 4C8LA 3HSTB 4GVEA 5J1EA 1IG8A 1QHAA 4Z4IA 5JLFA 3OYJA 1KAZA 1VQNN 4MDAA 4DUZK 1WAJA 4BY9C 4CIEA 4QAGA 4JHDA 4DFMA 1HYSA 1KFDA 1NGAA 3V1QA 3BY5A 3DLKA 2P9NB 1G15A 1BIUA 3AVBA 3UB5A 1IJJA 5H1SQ 3B8AX 3K9KA 4A62A 1RT3A 2WBNA 3TAEA 1B92A 5K14A 2OTLN 4JS5A 1RBSA 1HKBA 3OYEA 1VQ4N 4B3TK 3SQ0A 3R3LA 3O9TA 3VERA 3LDQA 1JJ2M 4JLHA 1K8AO 1C0TA 3C6UA 3NAEA 5J2MA 2FBXA 4A59A 1QHTA 4I7FA 4XH4A 2O8CA 2G8KA 4DV4K 4B9TA 1HLUA 2BE2A 2LSNA 3AVIA 4ELVA 3SUNA 3LP2A 3CJCA 4CJ4A 3HYFA 2BTFA 4AHSA 3U8XA 1KTQA 3OYIA 3SBTA 4CZMA 5IWAK 4HCCA 2B6AA 4JKGB 2Y1JA 2D0AA 2HNYA 5B8HA 3MDQA 4B3SK 3DLHA 2G8IA 4N56A 2O8DB 3HRGA 2F7TA 3GBTA 4E19A 5HLFA 4FJNA 1UWBA 4L8RB 3CM6A 4G9ZA 4DQRA 1J53A 4FJIA 3JXUA 4U7BA 1SUQA 4BG8A 1SV5A 3ENBA 3QDKA 1T3VA 3OYFA 3VN5A 3S3OA 2F9WA 2Q31A 2P9KA 3SLCA 3M5RA 1VHXA 4FWKA 1P8ZA 3F9MA 4IOXA 3VEZA 3ZSVA 3HPOA 1K8KA 3NH0A 4M7YA 3M8QA 4JI5K 1VQ9N 3DLEA 3TABA 4JI8K 4FWRA 1OH7A 1E4FT 1VSJA 5FROA 4OLAA 2CH5A 5EU7A 4BR2A 5M1QA 2RF2A 2QWOA 4BQZA 1KRPA 2GEMA 2FC0A 4JK7A 4CFBA 3M8PA 5LMNK 3MEGA 5AQTA 4FOIA 3LALA 3K2PA 3O4NA 3L4QA 1IKWA 5BRDA 2FLOA 2HSTA 1FKPA 4BRHA 1G99A 5AQHA 1TK0A 3QEPA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 2QM1 A;  4KRE A;  3PSF A;  1IBK K;  3C0B A;  4AM6 A;  2YHX A;  3VTH A;  4BWM A;  3DOL A;  4C1N K;  4Y1C A;  2NLX A;  4YOU A;  4V19 S;  3TAG A;  4CK3 A;  4FM0 A;  4BDP A;  2YNF A;  1VQP N;  3R9P A;  2P51 A;  3AVJ A;  1B9F A;  4OKJ A;  2PY5 A;  3R8E A;  1TYQ A;  4N76 A;  3KLG A;  4RW8 A;  3HP6 A;  5JS2 A;  1JLC A;  1TAU A;  4BE0 A;  1YUW A;  3K5M A;  3UIQ A;  3QIP A;  5LY3 A;  3MEE A;  5HP1 A;  4KPY A;  5DM7 L;  4LSL A;  1DTT A;  3E9P A;  4IEE A;  4CJR A;  4Z4G A;  2WTU A;  3V4I A;  2A5X A;  3QNN A;  1VQL N;  4LF8 K;  3O9S A;  3CER A;  3OVN A;  3WNE A;  2A6A A;  4H0O A;  2ATQ A;  3RRH A;  4EZ9 A;  1X9S A;  1HPM A;  3LZI A;  1XWL A;  3QLH A;  2W00 A;  3L2W A;  3D6R A;  3EKS A;  5SZT A;  5C0Y A;  1S1V A;  4EP5 A;  4K8X A;  3EE9 A;  1FW6 A;  4CGJ A;  2P9U B;  3VES A;  3P31 A;  3ATU A;  4UQG A;  4DQ8 A;  3K57 A;  4JKF A;  4BEB A;  3K58 A;  1WSI A;  2P9S A;  1KVA A;  3P38 A;  3KTQ A;  4E1J A;  4A5B A;  3O1B A;  3PIO L;  2NRH A;  1E4G T;  1GLL O;  3ZX0 A;  3LDL A;  2AA4 A;  3ZSZ A;  1KQS M;  3BGR A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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