4H0XB

Crystal structure of nad+-ia(e380a)-actin complex
Total Genus 121
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
121
sequence length
370
structure length
358
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Arginine ADP-ribosylation mechanism based on structural snapshots of iota-toxin and actin complex
pubmed doi rcsb
molecule keywords Iota toxin component Ia
molecule tags Toxin/structural protein
source organism Clostridium perfringens
total genus 121
structure length 358
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-09-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4h0xB01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4h0xB02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 4h0xB03
1J6ZA 2E2PA 3ZX3A 2VYPA 5AQKA 1NGGA 2P9SB 3IFRA 3ZETB 1Q18A 4IWVA 2E2NA 3S41A 4EFHA 5AZIB 2YI1A 5AQPA 4CZHA 4HTLA 3QBWA 5AQIA 1BA1A 2KHOA 1P8ZA 1RDWX 3ZX0A 4B1UB 4BRDA 3BF3A 3QBXA 5F1XA 4FO0A 1NGEA 1QZ6A 2VCPA 3G25A 5BPMA 2I7NA 2Q97A 2FF3B 5BN8A 2HF4A 3AAPA 2A6AA 1K8KA 3A5MC 3U4LA 3WT0A 1Z6RA 4BQLA 4BR2A 4BR0A 5JLFA 4BC5A 5LY3A 1S3XA 3FZHA 3UB5A 1SQKA 4WQ4C 1U2VA 2E8AA 1GLLO 1T6DA 4WYBA 1JCFA 2W40A 5FPNA 1GLCG 5BRHA 2CH5A 3MMVA 1DEJA 3FZMA 4PKHA 3O8MA 2P9IA 1NLVA 3C0BA 4IZ9A 4K43A 4FSVA 2P9LB 2QWOA 2V52B 1ATNA 5BREA 2PAVA 5EX5A 3U9DA 3H1VX 4FWNA 3WUHA 4BC4A 5JLHA 1GLJO 1ZXOA 1DGKN 2ZGYA 4A62A 1LCUA 4BR9A 2E20A 1BO5O 2P9IB 3WQUA 3A5OC 3ID8A 2ASOA 2VWBA 3CIPA 5AQRA 2QWPA 4A2AA 4WQ5A 1HKBA 3MK6A 3CJ9A 3M1FA 4GY2B 4CZFA 1YAGA 4XH1A 1KAXA 3VESA 4BG8A 2P9KA 2QWRA 2E88A 3H3NO 1C0GA 3H46O 1G99A 3BF1A 5AQOA 3P4IA 3L4IA 4FWOA 3WXLA 2DPNA 3H1QA 4QS9A 4BRNA 3SK3A 1T6CA 2Q31A 1NGDA 1V4TA 2P9KB 1NWKA 4BRPA 4RTFD 2YHYA 4ISFA 2V7YA 1SAZA 3CJ7A 5AQGA 3FZFA 4B1ZA 3EL2A 4H0VB 4CZEA 3VF2A 3WQTA 1T44A 2ASPA 3SMSA 3VEOA 1GLDG 4H0OA 3GE1A 3DXMA 4B1WB 3CETA 2D1KA 2Q0RA 3BUZB 4QS8A 3DJCA 4EHUA 4BRIA 4BROA 4BRKA 3VERA 1CZAN 5AQYA 1NGCA 1TUYA 1HKCA 1IJJA 3IMXA 4CI6A 2P9PB 3WXKA 1BA0A 1U6ZA 1NGJA 2J4RA 2AP1A 3A5LC 3SJHA 2E1YA 2YJFA 4FOEA 3MN9A 4YDUC 4BC3A 4BRHA 4CZIA 5AQFA 1GLFO 4CD1A 3EZWA 4NB4A 1GLBG 4FPAA 4PL8A 3IUCA 1BG3A 1YVNA 4RCHA 3KHYA 1GLAG 3VGLA 3QICA 1TUUA 3ZEUA 3ENHA 4M63C 2NRHA 4NO7A 5AZJA 4H0XB 3C7NB 1XC3A 3CJ1A 4BVPA 1HX1A 1LOTB 3ULEA 2Q36A 5EOYA 1E4FT 3H3OB 3MN5A 3AARA 1HPMA 5FPMA 3O4WA 1HUXA 4O5FA 2OANA 3L0QA 1KXPA 1H1VA 4FWLA 3ULEB 3GBTA 1NBWA 3W3DA 3VF6A 2GEMA 3O1WA 4FPBA 5B8HA 3MN6A 5FPEA 5AQNA 3GL1A 1K8KB 5ELZA 5FPDA 3R8EA 1NGIA 3WEEA 4FL9A 4H5VA 1U2VB 2H3GX 2AA4A 4B1XB 5JICA 1MWKA 2FXUA 4BGAA 3U8XA 1TYQA 3H6EA 3O80A 1GLEG 4BRGA 2FSKA 3D7EO 4FWMA 3VENA 5EY4A 4F9OA 3IDHA 2FSNA 4K42A 3RSEA 1WUAA 4I6MA 4DCHA 5BR9A 4IO8A 3WEEB 1IG8A 3EKSA 2WUSA 3OHRA 4WQ5C 2QW9A 3EN9A 1S22A 3DWLA 2F9TA 4FWSA 4I6MB 3UKRA 4BQZA 4B9QA 4XH5A 3CI5A 2HMPA 2YJEA 1ZBSA 1BWFO 1E4GT 2A5XA 2QM1A 4M7XA 2IVPA 2BUPA 2V7ZA 1XQSC 2QWMA 3VGMA 2ITMA 5KQ8A 4JHDA 1BDGA 3F9MA 3GG4A 3LDNA 2ZGZA 2EWSA 3J8AA 3DXKA 4H0YB 4CZGA 1X3MA 3KZBA 5ADXH 5AQLA 4BRLA 2D0PA 3EO3A 3VEYA 4A61A 1MA9B 2GWJA 3O6WA 5TKYA 2CGJA 5LJWA 3FZLA 4H5TA 4BR4A 3FLCO 5AR0A 5BRFA 2QWNA 3BEXA 4M7YA 4KBOA 2A42A 3L6QA 4Y0WA 5E84A 4ISGA 1NGFA 3FR0A 1Y64A 3KVGA 1JCGA 2ZF5O 3DXMB 4MO5A 5E26A 4CBWA 4EAHD 1RGIA 3GOIA 1ATRA 3CERA 3SMPA 1NMDA 4DHYA 2W41A 3I8BA 3LM9A 5LJVA 4CZJA 1Z05A 5BRDA 2FF6A 4FWPA 3FZKA 3U9ZA 2P9UA 4H5WA 1ESVA 4K41A 3CJBA 3UKUA 2GTDA 3VEZA 2F9WA 3QFUA 4BREA 4BRMA 4JD2A 5F2RA 2NZTA 2Q1NA 5BPNA 2FLOA 4JAXA 4BRCA 4B1VA 2IIRA 1KAZA 3VOVA 2P9UB 3QB0A 4AM7A 1QQOA 2QXLA 5AQZA 3O1BA 3MDQA 4JD2B 2UYTA 2P9SA 3VF4A 3ZETA 4PL7A 1MDUB 3ATVA 3O08A 3ZEUB 5ADXA 4DQ8A 4CBUA 5JMVA 2A41A 5EXWA 5AZJB 3HI0A 1HJOA 4BRFA 1BUPA 2FSJA 4XH4A 4BR7A 3HM8A 4J8FA 3TU5A 4BVOA 2V51B 3ENOA 4L3QA 4HWIA 4FOIA 2GELA 5EVZA 3TPQA 1C0FA 3HSCA 4XEIA 5BPLA 4CD3A 4BC2A 1YUWA 1OKJA 4E1JA 1DKGD 2A40A 3EKUA 3LM2A 4MO4A 4RWTA 4H0TB 1HKGA 1ATSA 3LL3A 1SZ2A 2YHXA 5AFUH 3MCPA 4LC9B 1X3NA 3A5NC 4CBXA 2P9LA 4WQ4A 5AQVA 3ZX2A 4H03B 4BGBA 2D0OA 3LDQA 3LDPA 5CE3A 3UE5A 3DAWA 4CZKA 1HLUA 3R6MA 1MWMA 3GDQA 4AM6A 2NLXA 4BG9A 1TYQB 2YCHA 3CJCA 5I9EB 1RFQA 5F0XA 2IVOA 3BP8A 3CJAA 4BRAA 4BR5A 3RSEB 2P9NA 2CGKA 3AAQA 3FFKB 4IXCA 2E2QA 2Q2RA 3FE1A 4DB3A 2CGLA 2GUPA 2HOEA 3JXUA 3M6GA 3HZ6A 3O5BA 5AQQA 5KPRA 4CJ7A 3VEVA 4PKIA 2QWLA 1QZ5A 3CQXA 4FWKA 1YXQA 4GNIA 5AQWA 1NGAA 2P9NB 3UKRB 5AQHA 3M3ZA 3HTVA 4JNEA 3A0IX 4FWQA 5KPTA 3D2EA 3VEXA 2Q0UA 1KAYA 3HBTA 3QFPA 1XUPO 4IJNA 4H5RA 3AY9A 3MN7A 5AQMA 2QWQA 1QQMA 1ZC6A 4JHDB 4B1YB 3QDKA 3DXKB 1V4SA 4O8KA 1X9JA 1BU6O 2E1ZA 2E2OA 3D2EB 2IVNA 5AFUA 5AQUA 3WXIA 4JN4A 4PKGA 2CH6A 3FGUA 3VGKA 1QHAA 3VPZA 3CQYA 3JS6A 3R9PA 3VEWA 3D2FA 4BRQA 1NGHA 1JCEA 5AQXA 4ISEA 2D4WA 2BTFA 5AQSA 5KPZA 1BOTO 2ZWHA 3CHWA 2P9PA 2HF3A 1R59O 2GWKA 1WOQA 1QQNA 4EHTA 3H45C 4H5NA 3D2FB 4QS7A 4CZLA 4CZMA 2A3ZA 2I7PA 3VETA 1NGBA 5AQTA 4Z94A 3I33A 3W0LA 1EQYA 3A8YA 4EIAA 4K25A 3QMLA 1NM1A 3LDLA 4MLEA 5BN9A 3UKUB 4YDUA 3WXJA 4FWRA 2ASMA 4A2BA 2PBDA 4MLHA 2YHWA 3C7NA 4H0PA 3SLCA 3ATUA 4C23A 5AZIA 5KQDA 4IJAA 1D4XA 3B8AX 3LDOA 5AQJA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3NH0A 3THYB 2VYPA 2P9SB 2F4VK 3NBPA 1L5UA 2UXBK 2KFNA 5AQPA 4CZHA 4HTLA 4E72A 2X78A 1BA1A 3ZX0A 4C8LA 4PWDA 4E7HA 3G25A 1QZ6A 1XHXA 3TSUA 4A5AA 5BN8A 4DKWA 3OYLA 2HF4A 4JS5A 2UU9K 1K8KA 1RDDA 1SKWA 3RR7A 3WT0A 1Z6RA 4CFAA 5JLFA 5LY3A 1SQKA 4LD0A 1FXXA 4WYBA 3QEPA 1JCFA 1D9FA 1NJXA 4OKJA 4PKHA 1QTMA 1HNVA 3C0BA 4FSVA 1U04A 1S9GA 3L8BA 1D9DA 1FKOA 3SAHA 3OS2A 4JI7K 5CZ1A 3H1VX 4BC4A 1QSLA 1N34K 2C1GA 1GLJO 3WXMB 3O9RA 4E7JA 4F3OA 3V1QA 3OYHA 3PO4A 1NOZA 3CIPA 3OYIA 3AA3A 3M5RA 1S5JA 3VQ8A 3MK6A 5BR8K 4CZFA 1L3SA 1YAGA 5CR4A 3H46O 1J9AA 2QKKA 2HHIA 5E41A 1M1KO 2YX6A 2QA4N 5SWMA 3L4IA 4FWOA 4FCYA 3HO1A 3BY5A 5IT9O 4YFUA 1VQ6N 1HR0K 1NGDA 1V4TA 1UAXA 1NWKA 1KTQA 2G8VA 4FK2A 3OYDA 5AQGA 3FZFA 3PX0A 1VQLN 4CK2A 3VA0A 1NK0A 4FK4A 5AJ3K 4BE2A 4H8KA 4ILGB 2W6LA 1GLDG 4AHSA 3DXMA 3NH2A 2RKIA 2Q0RA 2WONA 3BUZB 2OPSA 4B9TA 4QS8A 4CW7B 4EHUA 1YT3A 1NJZA 4BRIA 3KK1A 3LWMA 4W5NA 4C1NK 4BRKA 1HNWK 4RW9A 1CZAN 3OS1A 4E19A 1TUYA 1HKCA 3UIQA 1JJ2M 2WC9A 1VQ4N 4CESA 4CECA 4JI4K 3CYMA 1KLMA 1U6ZA 1LAVA 3LALA 4NCGA 2AP1A 4HTUA 3SJHA 2Z1GA 4BRHA 1KVBA 4BC3A 1EWQA 3EZWA 4NB4A 1GLBG 2D0CA 4I2PA 1ZYQA 1GOAA 4FLYA 4JKBA 3QICA 1TUUA 3AO2A 4O0JA 4KHQA 5H1SQ 4M63C 1Z26A 4CJUA 4H0XB 4B3TK 4IOCL 3V9WA 3CJ1A 5M1NA 4IDKA 3CM5A 3OY9A 4DWIA 5EOYA 1HJRA 2DFEA 1E4FT 5LMUK 1QSYA 1HPMA 3O4WA 4K8ZA 5FLXO 3K0SA 4O5FA 4BEBA 1QE1A 1H1VA 5KTQA 4Z4CA 4E89A 1NBWA 4O8UA 3SAGA 4OPAA 5B8HA 3QETA 3MN6A 4JYAK 5FPEA 1XNRK 1RDUA 1SL2A 3WEEA 3S3NA 3KTQA 4CJ5A 1NKBA 4CK1A 5GIPA 1N5YA 4FJLA 3U8XA 3M8PA 2VGMA 3TTCA 3D7EO 1JL2A 4F9OA 2FSNA 2VWJA 4O5BA 3TANA 4RW6A 3KLGA 3DLEA 1NK7A 3WEEB 1N32K 2D0BA 3RMBA 3KLEA 4DSLA 4DR5K 4ZHRA 3DWLA 3KWIA 1QVGM 2BDPA 3N4PA 2F9TA 4BQZA 3EZ5A 4M3TA 4W5RA 1RCHA 3MWTA 2F8SA 2HSTA 2HMPA 1ZBSA 3CPEA 2XY7A 3HPHA 4M7XA 4MDAA 2IVPA 3M8QA 1X1PA 4CJ3A 3DLHA 3SNNA 3F9MA 4HUFA 3OYMA 1VAZA 4HHTA 2LSNA 1U49A 3CCMN 4LSNA 1X3MA 4JKFA 4HUEA 3F5TA 2UUCK 1FW6A 1MA9B 2GWJA 2CGJA 3FZLA 3RMDA 5AR0A 5BRFA 3THVA 3BEXA 4M7YA 4KBOA 3L6QA 1DTTA 1REVA 4ELTA 1NGFA 3IRXA 5E26A 4ICLA 1TKXA 4EAHD 4CJLA 4HCCA 4DHYA 1N36K 1Z05A 2FF6A 3OYFA 2P9UA 4H5WA 1W97L 4K41A 3UKUA 2GTDA 1CXQA 1K9MO 2G8KA 3NFAA 4RW7A 5BPNA 4XIUA 1T7PA 3CCVN 4JRPA 4AHRA 3DRRA 4KHNA 3J7AP 2P9UB 5HROA 3VN5A 2QXLA 4FVMA 4NCAA 1GOCA 4W5QA 1MDUB 5ADXA 4FLTA 4CBUA 1W2BM 3F2KA 4BE0A 1Q81O 4QAGA 5GAEP 3HPOA 4XH4A 1ITGA 2UXDK 1RT2A 4KH6A 4L3QA 4FOIA 3PUFA 3K5NA 4K8XA 4OKKA 1Q9YA 3G0ZA 1YITN 4IFVA 3K9KA 4FYDA 1JLQA 1IKXA 1BI4A 1TK5A 4K0KK 2WBNA 2DY4A 2HVIA 3VQ5A 1NK8A 2G8WA 4H0TB 2WFBA 3A5NC 2P9LA 2PFUA 5AQVA 3ZT0A 3ZX2A 2E4LA 4AHTA 3E1YA 3NCIA 4GV3A 4B8CA 1RBVA 5A2QO 3GDQA 4AM6A 2HMIA 2RN2A 4BG9A 3CJCA 3OBWA 5I9EB 1VQPN 3ASMA 4BRAA 4BR5A 1VQKN 4BDZA 4B3MK 2O8DA 4IXCA 2QXFA 2VQEK 3HVTA 4IBNA 3KK3A 2O8CA 4OGEA 3FE1A 4I7FA 3KJVA 4YORA 5KPRA 2BANA 1YJWN 2B6AA 1BISA 3CFOA 2O8DB 1RBSA 1IBMK 2F96A 2QI2A 4ILJA 2D5RA 3OJSA 2KTQA 4M3YA 4FWQA 4KV8A 5KPTA 4BE1A 4IFEA 1NG9A 2F7TA 2Q0UA 1KAYA 5M1OA 3QFPA 4H5RA 3ZT1A 4DV3K 1N8RO 3KK2A 1YF5L 3E66A 1ZC6A 5LL6Z 4DSIA 4PHTX 3CCEN 4KAZA 1WNSA 3AO5A 2HBJA 5GAHP 5AFUA 3O3HA 4CIEA 3EE9A 3LANA 4E1MA 1HYZA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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