4H0YB

Crystal structure of nad+-ia(e380s)-actin complex
Total Genus 127
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
127
sequence length
370
structure length
358
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Arginine ADP-ribosylation mechanism based on structural snapshots of iota-toxin and actin complex
pubmed doi rcsb
molecule keywords Iota toxin component Ia
molecule tags Toxin/structural protein
source organism Clostridium perfringens
total genus 127
structure length 358
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-09-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4h0yB01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4h0yB02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 4h0yB03
1HPMA 2P9UA 3WXIA 2I7PA 2V7YA 3TPQA 4BR9A 1IG8A 2A40A 1WOQA 5AQLA 1ATNA 2FXUA 1V4SA 1BDGA 1C0FA 2E1YA 3D7EO 4RWTA 2VYPA 3LM9A 3VF2A 4BRIA 1BOTO 4XH5A 5AQWA 4NO7A 4L3QA 2GWJA 3H3OB 2GTDA 5AQPA 1NWKA 3J8AA 4B1UB 1NGEA 3D2FB 5BREA 5AQGA 4BQZA 5F2RA 4BQLA 1QQNA 5KPZA 1E4GT 3QDKA 1E4FT 4GY2B 1XQSC 5F0XA 2Q97A 4C23A 2D1KA 2QW9A 5AR0A 5JLHA 4I6MB 1GLEG 1RGIA 1LOTB 5BPNA 3HM8A 2ZF5O 1YVNA 4BRCA 2ZGYA 4XEIA 3MK6A 3MN9A 4PKIA 4H5WA 3U8XA 1Z05A 4JAXA 4H0PA 2IVPA 4AM7A 3CJ7A 3UKUB 1DEJA 4WYBA 3CETA 3U4LA 4BG9A 4BVOA 1U2VB 3R8EA 2P9SB 1HKCA 2P9PA 2ASOA 2P9PB 4WQ5C 4JD2B 2A42A 4EHUA 3FLCO 4B9QA 3VEWA 3I8BA 1KAYA 5AZJA 4MLHA 3EZWA 4CZEA 1S3XA 4H5VA 2VWBA 4H5TA 4PKHA 2VCPA 3KVGA 3IDHA 2E2NA 1RDWX 5KQ8A 1NGDA 4WQ5A 1U6ZA 3GBTA 3D2EB 4FL9A 3QFPA 3ENOA 2E20A 4MO5A 1MWKA 4QS8A 4Y0WA 4XH1A 3SMPA 1ZC6A 5BPLA 4MO4A 5ELZA 4BROA 3JXUA 4FOEA 4O8KA 2NRHA 2BUPA 1QQOA 4EHTA 3DXMB 1RFQA 3SK3A 3A8YA 2QXLA 2A41A 5ADXA 3TU5A 1WUAA 3WUHA 1V4TA 3ATUA 2UYTA 3WEEA 2IIRA 4B1ZA 1MWMA 5AQKA 2F9TA 1BWFO 3G25A 4HWIA 5AQSA 5E26A 4K42A 2AA4A 1ATRA 3VGMA 1QZ5A 3QMLA 5EVZA 2NLXA 4K25A 1QQMA 4H5RA 2Q36A 2CH6A 3WT0A 2OANA 2E8AA 2QWMA 3CJCA 5E84A 5F1XA 4A2AA 4CD3A 4FWQA 2P9UB 5LY3A 3M1FA 2P9IA 3L0QA 1R59O 2DPNA 3RSEA 1HKBA 3WQUA 1T6CA 2FF6A 4BRLA 4AM6A 3VEOA 3HTVA 3EL2A 3FZLA 1KXPA 4RTFD 2AP1A 5KQDA 2A5XA 5AQUA 4B1YB 3ZX2A 4BRKA 3GL1A 2CH5A 3VGKA 3UB5A 1GLBG 5AQOA 2BTFA 1K8KA 4YDUC 4BRNA 2YJEA 3QBWA 5FPNA 1BUPA 3VENA 3MDQA 4BGAA 1NGBA 2HF4A 5LJWA 5ADXH 3A5OC 1NBWA 1HKGA 3OHRA 1GLFO 3GOIA 4ISFA 5AZIA 3SLCA 2PBDA 1G99A 4YDUA 5AZIB 5AQFA 3U9DA 2HOEA 2CGJA 3M3ZA 3ZX0A 3QFUA 4CD1A 3FE1A 3VOVA 4DHYA 3DXKA 1KAZA 3GE1A 3P4IA 1X3MA 5KPTA 3UE5A 3A5MC 1C0GA 2ASMA 3C0BA 2YI1A 5AFUA 4BR4A 4BRAA 1ESVA 1H1VA 1BA0A 3QB0A 2P9NA 3O8MA 3GDQA 4K41A 3HZ6A 2QWQA 3O4WA 3CQYA 1NGJA 1J6ZA 3EKUA 3VF4A 2GWKA 1NGIA 4BC5A 2KHOA 2GELA 2Q0RA 4CZKA 1D4XA 1HX1A 3BF1A 4BRQA 3AAQA 2YHWA 2QWOA 3A5LC 2P9LA 3HBTA 3EKSA 3ATVA 3HI0A 4CZIA 3AAPA 4HTLA 1NMDA 1ZXOA 1P8ZA 1EQYA 1TUUA 4Z94A 4BRMA 5AZJB 2ZGZA 5AQZA 4JHDA 3IUCA 3M6GA 4BREA 4PL7A 4JHDB 4QS9A 2E88A 4CBUA 3LDLA 3F9MA 4IJAA 2NZTA 3QICA 2Q2RA 5BN8A 3ENHA 3C7NA 5FPDA 3BUZB 5I9EB 1X3NA 4BR7A 3O6WA 5AFUH 3VERA 2HF3A 4M7YA 1BO5O 2D0OA 3VEZA 3ZETA 2P9KA 4FO0A 5BRDA 4M63C 2GEMA 3H6EA 5AQXA 2I7NA 4E1JA 2GUPA 3SMSA 3ULEA 1S22A 1YUWA 2F9WA 3A5NC 5EY4A 5CE3A 1KAXA 1XUPO 2WUSA 3FZMA 4BRFA 2FSKA 5FPEA 4DCHA 1NGFA 1LCUA 3WEEB 3ZEUA 2A6AA 3EN9A 5EX5A 4FSVA 2QWNA 3FZHA 3MN7A 1NGCA 3AARA 1NGHA 3LDPA 2E1ZA 3DJCA 4BR2A 3VF6A 4ISGA 1MA9B 4BVPA 3H1VX 4FWSA 1Z6RA 4IXCA 4H5NA 5KPRA 4FWLA 1QZ6A 4EIAA 1BG3A 1Q18A 4H03B 5BPMA 2YHYA 4M7XA 1SZ2A 3R9PA 4J8FA 5EOYA 3MN5A 3WXKA 2P9IB 3RSEB 5JICA 3CERA 4FOIA 3VEXA 1QHAA 3VETA 2E2OA 2V52B 3UKRA 3O80A 3H1QA 2FLOA 1GLAG 4CZFA 5BN9A 5AQRA 3VGLA 4B1XB 1IJJA 1TUYA 3CJAA 3H3NO 2FF3B 4CZJA 3FZKA 5TKYA 4H0VB 4ISEA 1K8KB 1MDUB 2HMPA 4WQ4C 1TYQA 2E2PA 2A3ZA 3FFKB 1TYQB 3SJHA 4JNEA 1NGGA 3H45C 1T44A 1HUXA 2V51B 4PL8A 3I33A 3LL3A 4B1WB 4DQ8A 3W3DA 3QBXA 4WQ4A 3DWLA 3CQXA 3FZFA 3DXKB 5EXWA 1CZAN 3D2FA 2FSJA 3FGUA 3BF3A 4JN4A 4EFHA 2QWPA 3LM2A 3S41A 1X9JA 4XH4A 4A61A 3WXJA 2Q1NA 3MCPA 3LDQA 2V7ZA 3VESA 2P9NB 4BR0A 2QWRA 4FWOA 4CZHA 3BEXA 5AQQA 4H0XB 4I6MA 1GLJO 5AQHA 4B1VA 2QM1A 1NLVA 2E2QA 4RCHA 3AY9A 4K43A 3VEYA 1XC3A 4FPAA 2CGLA 2ASPA 3KHYA 2YHXA 1SQKA 4H0YB 2P9LB 4A2BA 3KZBA 4FWMA 3U9ZA 3B8AX 5BRFA 1T6DA 3L6QA 4QS7A 3ID8A 5AQNA 3UKUA 4O5FA 4NB4A 4CBWA 3GG4A 4PKGA 4FPBA 1YAGA 4IWVA 1U2VA 1BA1A 4IJNA 2P9SA 4H0OA 4LC9B 2EWSA 3CIPA 4DB3A 2D0PA 3CJ1A 1HJOA 4FWKA 4A62A 3IFRA 4F9OA 3L4IA 4JD2A 3JS6A 5AQMA 1BU6O 1GLLO 3A0IX 3C7NB 5FPMA 4GNIA 3WQTA 1GLCG 3CJ9A 1GLDG 2ITMA 4BRDA 2PAVA 2Q0UA 3O5BA 4FWNA 2P9KB 3ZETB 3ZX3A 4BGBA 5BRHA 3D2EA 1DGKN 2ZWHA 4BC4A 2J4RA 1YXQA 5AQVA 2D4WA 5B8HA 4CJ7A 5BR9A 4FWPA 3R6MA 3ULEB 1JCGA 3LDNA 4KBOA 2IVOA 3DAWA 1SAZA 4BRPA 3EO3A 2W41A 2W40A 5LJVA 1NGAA 2CGKA 3CHWA 4CZMA 3W0LA 5AQJA 3ZEUB 2Q31A 3O1BA 4BR5A 2QWLA 1NM1A 4FWRA 3O08A 5JLFA 4BC3A 3MMVA 3BP8A 3DXMA 4MLEA 1ZBSA 1ATSA 1OKJA 2YJFA 3CJBA 3LDOA 4IZ9A 5AQYA 4BRGA 2H3GX 3FR0A 4BC2A 1JCFA 4EAHD 2YCHA 3VPZA 4CZLA 4BRHA 3HSCA 4H0TB 3CI5A 5AQTA 3IMXA 1HLUA 1DKGD 1Y64A 4CZGA 5JMVA 4BG8A 3WXLA 1JCEA 2FSNA 3O1WA 5AQIA 4CI6A 3H46O 2IVNA 3UKRB 3VEVA 4IO8A 3MN6A 4CBXA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3WXIA 1VQ7N 4FJJA 1JLBA 3JAMO 4OPKA 3QETA 4B9SA 4BR9A 4DQRA 1NK9A 2A40A 1NK6A 5H1SQ 3NBPA 3KIOA 1HMVA 4YOWA 1QVFM 4PA1A 4RWTA 2HHTA 4M3YA 2DTUA 3LM9A 1C6VA 1BOTO 1K73O 4L3QA 4O8UA 1IH7A 3H3OB 1OH7A 3QO9A 1Q81O 2WTUA 1VQLN 1VHXA 3AA2A 3NAEA 3DI6A 4JRQA 3T7ZA 5KPZA 1QSLA 3QDKA 5F0XA 3AVBA 3FFIA 2C1IA 5AR0A 2QW9A 1GLEG 4AHVA 3DOLA 4W5TA 1LOTB 3CXCM 1NJYA 5CY4A 5BPNA 2G8VA 2O8EB 4CEBA 1TKZA 3G71N 1YVNA 4BRCA 4XEIA 4PKIA 3CG7A 3E66A 3U8XA 4YOUA 4LFCK 4JAXA 1RDDA 4Z4HA 1RILA 4CJ5A 1FJGK 1DEJA 1WSEA 1ZBFA 3V81A 2O8CA 3U4LA 3AVFA 4OPHA 4YOVA 3R8EA 3VQCA 1XNQK 3K57A 4R79A 4B3TK 4DV0K 1KAYA 5AZJA 3UIQA 4CZEA 4DV6K 4H5TA 4PKHA 2VCPA 2G8IA 3HPOA 3VQ5A 1J53A 2E2NA 1RDWX 1L5UA 5KQ8A 5JS1A 4Z4IA 5HLFA 3QFPA 2EHGA 1VSEA 4OX9K 4XH1A 3SMPA 5M1PA 1ZC6A 3OYEA 5FROA 4CVNE 1JLEA 4DF4A 3C94A 4DKWA 4YFUA 3HOSA 4AH9A 1HYZA 2RKIA 4JK9A 1JKHA 1ZYQA 4OKEA 2ITGA 1QQOA 3HXMA 3DXMB 1L3TA 2IAJA 3SK3A 5C2FA 2A41A 4AF1A 3TU5A 5ADXA 4N41A 4CEAA 3WUHA 1V4TA 3MCAB 3SBGA 3PIOL 4AHTA 3HP6A 5AQKA 3NH0A 1BWFO 3G25A 1KD1O 3PO5A 3HM9A 1QZ5A 3MEEA 2GUIA 1QQMA 5FLXO 3AVNA 4H5RA 4FW2A 1QTMA 2P1JA 2OANA 4FJLA 1BQMA 1ITGA 4CFAA 4DUYK 2P9UB 3NFAA 4JI3K 2YNGA 3TAEA 4WCEL 3L2UA 3VEOA 4E1NA 3HTVA 3SPZA 1KXPA 5KQDA 2HSTA 1U45A 4M3TA 2A5XA 5AQUA 4B1YB 1IO2A 3UB5A 5AQOA 5J2PA 4BRNA 5FPNA 4BGAA 1KRPA 4H4OA 2ZM6K 4OLAA 2RN2A 4FLZA 3TAMA 3CC2N 3GOIA 3J7AP 3RVCA 4IO9L 2HVHA 1C0TA 4JI2K 2PBDA 1FKPA 1G99A 3HK2A 3L2QA 5C0YA 3M3ZA 4CFDA 4N47A 3FE1A 3DXKA 3TTFA 1C1CA 1WAFA 4FJIA 1C0GA 2ASMA 3LWMA 1FW6A 3SBTA 3IS9A 4KPYA 1K8AO 4DWIA 1ESVA 1IKWA 1TK5A 5KGXA 3O8MA 3GDQA 2KLAA 3CQYA 4IOCL 1NGJA 4JK7A 3B6OA 1KVCA 2GWKA 1HNWK 1D5AA 3S3OA 4CGIA 4CZKA 1U4BA 1HX1A 3ZSWA 2YNFA 2OPQA 3WNFA 3T1YK 3QEPA 1WN7A 5HP1A 5J1EA 3PV8A 4CZIA 4DFKA 1QQCA 4CEOA 4KHQA 3OBWA 4LSLA 1WLJA 4CJLA 4KHPK 4NCBA 2HW3A 3M8PA 4JHDA 4JEPA 3IUCA 4BE0A 3THWA 4JHDB 3AVHA 1T7PA 3F9MA 4IJAA 1S1XA 3C6UA 4BDYA 3QNNA 2OPPA 1NG9A 2PY5A 2HNZA 2Q2RA 5BN8A 3CCQN 3C7NA 3O3HA 1Q82O 4BR7A 3O6WA 2Z1HA 2HF3A 4M7YA 2D0OA 4KFBA 3LWLA 2NRTA 3NE6A 4B9VA 1VQMN 3MECA 2I7NA 5AQXA 4E1JA 3SMSA 3KK1A 3U6FA 4DSIA 2WUSA 1BQNA 3KWGA 1N8RO 3S9HA 2FSKA 3P31A 3I8DA 1OH6A 3WEEB 2A6AA 3I0SA 4B3SK 4JI4K 3HP9A 3MN7A 3P5JA 3TI0A 2E1ZA 3CCSN 3DJCA 4CJ3A 1MA9B 1U48A 4FWSA 4V19S 3VQPA 4B9MA 5KPRA 1BGXT 4FLVA 1L3VA 3TTDA 3ZSXA 1UWBA 1SZ2A 4CJEA 4DU1A 4J8FA 5C24A 3WXKA 4LY7A 3DLHA 2P9IB 3RSEB 3CERA 3ZT0A 4X65K 1L3UA 1I94K 3LANA 4FJMA 2V52B 4JK8A 1RDBA 3H1QA 2FLOA 4Z4CA 3OYCA 3DLKA 3KK7A 3VGLA 3H3NO 1TUYA 2FF3B 5K14A 4CZJA 1K8KB 4DSEA 4HCBA 4CF8A 1HJRA 2D5RA 2HMPA 1TYQA 3MWTA 3QEVA 1TYQB 1YTUA 4JNEA 1B9FA 4QAGA 2V51B 4DS4A 4IBNA 4B1WB 3LP2A 4DTNA 5I42A 3CQXA 4C1NI 3E1YA 3FZFA 2JLEA 1CZAN 4CJWA 4LF4K 4A61A 2F8TA 2Q1NA 2X6SA 3U3YA 3LDQA 2O8DB 1QHTA 1VAZA 3SV3A 2QWRA 3SUQA 3A2FA 4AHRA 4CFBA 1GLJO 1RT4A 1ILYA 1N36K 5AQHA 2KFNA 3AY9A 3VEYA 2YKMA 4AHUA 4BE7B 2P9LB 3O3GA 1JXEA 3U9ZA 3CPEA 5BRFA 4OJRA 4CBWA 4CF2A 3GG4A 3TSQA 4PKGA 1VSDA 4FPBA 1U2VA 3AVIA 4M42A 2P9SA 4LC9B 2EWSA 1RDAA 1HJOA 1DTTA 1K9MO 3OYHA 2UUCK 1N6QA 1NMNA 4GV3A 5FPMA 4GNIA 3J80O 4C8LA 3KLGA 3CJ9A 1GLDG 4BRDA 2XRIA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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