4H0YB

Crystal structure of nad+-ia(e380s)-actin complex
Total Genus 127
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
127
sequence length
370
structure length
358
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Arginine ADP-ribosylation mechanism based on structural snapshots of iota-toxin and actin complex
pubmed doi rcsb
molecule keywords Iota toxin component Ia
molecule tags Toxin/structural protein
source organism Clostridium perfringens
total genus 127
structure length 358
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-09-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4h0yB01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4h0yB02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 4h0yB03
5BPLA 3LM9A 4CZMA 3J8AA 3ZETB 4DB3A 3FZHA 3KVGA 2E20A 3ULEB 2HF4A 3TU5A 2Q97A 4QS8A 2ASOA 3R8EA 2YHYA 1JCEA 2A41A 3SMPA 2QXLA 3LM2A 3OHRA 1G99A 5EX5A 5TKYA 2CGKA 4H0VB 2CGLA 2V52B 4JNEA 4WQ4A 1DEJA 4BQLA 4EHTA 3I8BA 3FZKA 3GOIA 4PKIA 4JAXA 2ZGYA 4YDUC 4BRMA 3RSEB 3GE1A 4FWPA 4BR9A 4K43A 1D4XA 2P9PB 3CERA 3MN7A 2IVNA 5E84A 3UKRA 4IO8A 5JICA 3BEXA 4M63C 4EIAA 5AQOA 2D0PA 3O8MA 5BN9A 2AA4A 3QBWA 5AFUH 1Z6RA 2YJEA 2A6AA 3ATVA 4M7XA 5FPEA 5AQGA 4FWNA 4BRIA 1ATSA 5CE3A 4O8KA 1NGGA 1HUXA 4DQ8A 4H0TB 4O5FA 5B8HA 3C7NA 3H3NO 1T44A 4KBOA 5F2RA 5AFUA 1QZ6A 3GG4A 3M3ZA 2IIRA 2A40A 3VEWA 4FWQA 5ADXH 1MDUB 4FOIA 2V51B 4HTLA 1IJJA 4XEIA 1BOTO 5EOYA 4B1XB 2P9KA 2E2NA 3HTVA 4JHDA 5AZIA 3WXLA 1TUYA 4FSVA 2Q0RA 3QBXA 1KAYA 3A8YA 5JLHA 2CH5A 3AAQA 3UKRB 2W40A 3I33A 3A5OC 4FPBA 5ADXA 3GL1A 2ASPA 1HJOA 2NZTA 4GY2B 3VERA 2W41A 3ZEUA 1ZBSA 3F9MA 4FPAA 2Q2RA 4BRGA 4CZKA 4H03B 1E4FT 3AAPA 1NGIA 1BUPA 4FOEA 4HWIA 4B1YB 4BRFA 3CJ7A 4BC5A 4H5RA 3L6QA 1J6ZA 1K8KA 3JS6A 2FF6A 3U9DA 4BRQA 4CZJA 3C7NB 3LDOA 4FO0A 1YVNA 1Z05A 4BC3A 2GTDA 2HOEA 2ZGZA 2QWRA 3CJBA 3M1FA 4CD3A 2A3ZA 4FWLA 4CJ7A 2QWNA 1S3XA 3MN9A 1RFQA 3VETA 2P9KB 4JHDB 5AZIB 1NGFA 4AM6A 2F9WA 2HF3A 2EWSA 3EL2A 1YXQA 5AQVA 1C0GA 3VEXA 4PL8A 5AQRA 4BRPA 1IG8A 3DXMA 4BVPA 1QZ5A 5AQNA 3CJ1A 4F9OA 4CBUA 4BGBA 1YAGA 5AQLA 4IXCA 3ZEUB 5KQ8A 1TUUA 4BRAA 5LJVA 3MN6A 2QW9A 4H5VA 4EFHA 4WQ5A 4B1UB 4QS9A 1ZC6A 3L0QA 3QFPA 5JLFA 5AQQA 1MWMA 5AQPA 2P9LA 1DKGD 1ATRA 1K8KB 3CJCA 4K25A 3CQXA 2ITMA 2ZWHA 1NGCA 5AQKA 2DPNA 3WXJA 1JCFA 1BA1A 2E2OA 3BUZB 5EVZA 4A2BA 3VF4A 2P9IA 1DGKN 1C0FA 4BROA 4H0XB 4BREA 2P9NA 3U8XA 5AQIA 3FZFA 1NGHA 4JD2A 4B1VA 1OKJA 4WQ4C 3QB0A 4CZLA 1NMDA 3VEOA 3JXUA 2FSNA 4IWVA 4DHYA 1LOTB 2WUSA 3DXMB 5AQYA 1R59O 5F1XA 5BREA 1NM1A 3HSCA 3DXKA 3ZX0A 1QQMA 5BPNA 5AZJA 3MN5A 1SZ2A 2E1YA 4ISGA 2NRHA 4H0YB 3DJCA 4FL9A 4ISEA 3H3OB 2P9LB 4M7YA 4J8FA 1ESVA 3GBTA 3FGUA 1WOQA 1EQYA 2FF3B 5BRHA 3VF6A 5BPMA 3P4IA 2CGJA 1U6ZA 3FZLA 2P9IB 1GLAG 3W0LA 4BVOA 3BF3A 4BR4A 1NGAA 5AQZA 4FWMA 4IJNA 3HZ6A 2P9NB 4PKGA 4CI6A 1HLUA 4FWRA 3WXKA 4JD2B 1GLEG 5AR0A 4IJAA 1QHAA 5FPMA 3UB5A 3CJ9A 3LDQA 3CETA 3FE1A 5E26A 3VF2A 2KHOA 3VEVA 1GLJO 1NWKA 3SMSA 4B1WB 1SAZA 1X3NA 3IUCA 3AY9A 5BR9A 3DXKB 1GLDG 2I7PA 2NLXA 3CI5A 5AZJB 3AARA 3SK3A 3FZMA 4XH1A 2Q31A 4I6MA 3D7EO 1GLFO 5FPNA 4CD1A 4BR2A 1Q18A 4NO7A 5AQTA 1E4GT 3O80A 2D1KA 3IDHA 2QWMA 4BR5A 2FSKA 3IMXA 4RTFD 3O1WA 3WQTA 3A0IX 2PBDA 3L4IA 2YJFA 3IFRA 1GLBG 4CZFA 1H1VA 3LDLA 3DWLA 5LJWA 4L3QA 2F9TA 1MA9B 3ZETA 1BU6O 4H0PA 3MK6A 3LDPA 3SJHA 4MO5A 2Q0UA 5LY3A 4BR0A 1BG3A 4BRDA 5AQHA 4BRHA 4Z94A 4NB4A 3CHWA 5I9EB 2P9SA 1BA0A 4BC4A 3MDQA 1TYQA 3A5NC 4CBWA 3H1QA 3ENOA 1JCGA 4BQZA 3HM8A 4I6MB 1HKGA 5ELZA 3EO3A 3O08A 3W3DA 2IVOA 2VCPA 1KAXA 2FXUA 3KHYA 2A5XA 4A62A 1BO5O 4GNIA 4WQ5C 2Q1NA 2V7YA 2ZF5O 1HPMA 1GLCG 2AP1A 4CBXA 1HKCA 2YHXA 4K41A 3VESA 5BN8A 5KQDA 4MLEA 3A5MC 4CZHA 4EHUA 2GWJA 2FSJA 1LCUA 4BC2A 4DCHA 4FWSA 2YCHA 2UYTA 3HI0A 4BR7A 2V7ZA 3D2FA 3HBTA 2OANA 2VWBA 3WT0A 2QM1A 3LL3A 2QWQA 2GEMA 4YDUA 5KPZA 1XQSC 2J4RA 2P9SB 4JN4A 3R9PA 1S22A 2IVPA 4IZ9A 1TYQB 2E8AA 3O1BA 2YI1A 3UE5A 2Q36A 1RGIA 4H5TA 1NGEA 3G25A 1KAZA 3WXIA 4ISFA 1HX1A 2QWPA 4FWKA 1RDWX 4BRNA 4CZGA 3C0BA 3FR0A 3KZBA 3CJAA 2D0OA 5AQWA 1WUAA 3H45C 3UKUA 1XC3A 5KPTA 3MCPA 3VGMA 2I7NA 2FLOA 4K42A 3WQUA 1NGJA 2YHWA 1ATNA 3WEEA 4BG9A 2GELA 2HMPA 3EZWA 1U2VA 2E2PA 3H6EA 2BTFA 4E1JA 2D4WA 2QWOA 1ZXOA 2PAVA 3D2FB 5AQXA 5JMVA 2CH6A 3VENA 3M6GA 3TPQA 1Y64A 5EY4A 1NBWA 4C23A 1QQOA 1NGBA 3MMVA 3VEYA 3VEZA 3H46O 3CIPA 5BRDA 4QS7A 3ZX3A 2A42A 3QDKA 4H5WA 1KXPA 2VYPA 4MLHA 4BRCA 4CZIA 4EAHD 4B9QA 3B8AX 1X9JA 4A2AA 3U4LA 5EXWA 3D2EA 1GLLO 1YUWA 4XH5A 4RWTA 4H5NA 4B1ZA 1V4TA 1T6CA 1V4SA 5AQFA 3R6MA 3VPZA 2E88A 4FWOA 3S41A 2P9UA 3UKUB 5FPDA 3QFUA 4WYBA 4BRLA 5BRFA 2E2QA 2GWKA 4H0OA 3QMLA 4MO4A 4CZEA 3SLCA 3WUHA 4RCHA 5AQSA 1SQKA 4XH4A 1HKBA 3QICA 2H3GX 3WEEB 1BDGA 5KPRA 2BUPA 3VGKA 1U2VB 3BP8A 3ID8A 3H1VX 1MWKA 3ULEA 1NGDA 3CQYA 3U9ZA 1QQNA 1NLVA 1P8ZA 3ENHA 3GDQA 1BWFO 3EN9A 2E1ZA 3LDNA 1T6DA 3FLCO 4AM7A 4BGAA 3DAWA 4PKHA 3ZX2A 2GUPA 2ASMA 3VOVA 5F0XA 4A61A 4PL7A 3VGLA 3O4WA 3FFKB 3BF1A 1CZAN 3O5BA 2QWLA 3D2EB 3RSEA 5AQUA 4BG8A 5AQMA 3A5LC 2P9PA 5AQJA 3EKUA 3ATUA 2P9UB 3O6WA 4Y0WA 1XUPO 4BRKA 3EKSA 4LC9B 1X3MA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1QHTA 3J7YP 3OYAA 1KVAA 4DTJA 3SV3A 2DY4A 5BPLA 3J8AA 1NJIO 3ZETB 2VG5A 3KVGA 3AVKA 2HF4A 1EXQA 4O5BA 4Z0UA 3T7ZA 3TU5A 1WSGA 2C1IA 2YHYA 4F8RA 3SMPA 4IOAL 2QXLA 3SUNA 1G99A 2O8EA 5TKYA 2VQFK 2CGKA 2CGLA 4FJXA 3AA2A 4B9SA 1BIZA 3AVCA 5GAHP 1T05A 2O4GA 4BQLA 1YITN 1IBKK 2OTJN 4CGDA 3LP1A 1VHXA 4YDUC 2KQ2A 2HHXA 3NF8A 3UKRA 2KW4A 4CFBA 5JICA 4IFVA 1UOCA 2GX9A 2D0BA 4DSIA 2R7YA 4DUYK 3TAPA 4B3TK 5AFUH 2B4JA 3ATVA 4M7XA 2RN2A 3WNGA 4CF0A 4KKOA 3LWLA 1SUQA 1HUXA 4JYAK 3R3LA 3L4QA 4H0TB 4JI5K 3C7NA 1JL2A 2XY6A 3ISNC 1KC8O 1S1VA 4KBOA 5F2RA 1CXUA 3GG4A 4FWQA 1MDUB 4FOIA 1VSFA 1T03A 2DFHA 2HVHA 5CYMA 1IJJA 2HNDA 1BOTO 1KRPA 3J81O 4B8CA 4CJPA 4JHDA 4JEPA 3CCSN 4NCAA 1TUYA 2XY5A 3A8YA 2CH5A 3VQBA 4YY3K 4DV5K 3I33A 4R5PA 3O9TA 2IGIA 4JK9A 1SL2A 3VERA 3PV8A 3ZEUA 1L3TA 1RTJA 4CGHA 4CZKA 1E4FT 3LDSA 1NGIA 1D5AA 1S6QA 4FOEA 4WF9L 3NBPA 2KFZA 4H5RA 4CJVA 1J6ZA 3PSFA 2X74A 4FXDA 3JS6A 3T1YK 2UUAK 4KHUA 3LDOA 4X64K 1YVNA 1Z05A 1OH8A 5FRMA 4JI3K 4BC3A 2IDOA 3OYDA 3CMEN 4Q5VA 3M1FA 4CD3A 2A3ZA 4LD0A 3OYFA 1EETA 1HJRA 5C2DA 3T1HK 3OYNA 3MN9A 3CC2N 5AZIB 4W5QA 4GV3A 2HF3A 3VA3A 4FJNA 3C94A 3VEXA 3TSUA 2YKNA 4DR5K 5AQNA 4F9OA 4CBUA 3OYJA 3NH0A 4MDAA 1TUUA 5EU7A 3KK1A 3ZLJA 5LJVA 1U48A 3K5LA 1L3VA 2UUBK 4NYNA 1VSHA 4DTRA 4QS9A 3QEWA 3QFPA 4PY5A 5JLFA 3M8SA 5AQQA 5AQPA 4CF1A 1TKZA 4J2DA 4ID5A 4FK4A 2ZWHA 2DPNA 4GV9A 4H0XB 1C1CA 4DMNA 1DLOA 4N41A 1YF5L 5AQIA 1KLMA 4AHRA 1C1AA 3KK2A 4LH4A 2XO7A 3TTCA 2VWJA 2Y1JA 4O4GA 4FJHA 4DQQA 2FSNA 5KI6A 4FK2A 4JKBA 1LOTB 4NCGA 3QESA 4KAZA 1R59O 3V4IA 2PFUA 5BPNA 4ISGA 4BDYA 4C8NA 4FW2A 4FCYA 3AO1A 2BANA 3D6RA 4FL9A 1HNXK 4FW1A 4M7YA 4J8FA 3TSPA 3FGUA 2WFBA 3SQ2A 3ITHA 3LAKA 4LF5K 2I5JA 4N5SA 3NH2A 4GV6A 3CCRN 2P9IB 5I42A 1GLAG 3SUQA 1NGAA 5AQZA 2HHHK 4FWMA 1F21A 4CI6A 3THWA 1JJ2M 1GLEG 3CJ9A 3OJUA 1UA1A 4KB0A 3TAMA 3LDQA 3CETA 3DRPA 4CEBA 3VEVA 1GLJO 4H8KA 3QNNA 2IC3A 3IUCA 3OYBA 1ILYA 4DV7K 2I7PA 2NLXA 3TWHA 3CI5A 5C24A 3FZMA 1VQLN 5CZ2A 4C1NI 4CECA 4FM2A 5FPNA 4CK1A 4NO7A 3AVHA 3IDHA 3DYAA 2WOMA 3HPHA 2E6MA 3HT3A 3WQTA 4OLBA 5CR4A 3KJVA 1RDUA 3KD1E 4BE1A 3RWUA 3AVFA 2D5RA 5HRNA 4E7HA 3LDLA 5LJWA 4L3QA 4E7JA 3PX6A 1C0TA 1VSDA 4JKAA 5KGXA 1TK5A 3MK6A 2WTUA 1LAWA 1DTQA 2NRRA 4KI6A 5LY3A 4YORA 4R79A 2W6KA 3O3FA 3SQ1A 4DSJA 3CHWA 4HCBA 2P9SA 1BA0A 5C10A 3J7ZO 1TYQA 3VQCA 4FM1A 4IO9L 4C8MA 4YOVA 3HSTB 3ID6A 5GIOA 3H1QA 5FRNA 4M3ZA 1JCGA 4CE9A 1HKGA 5DM6L 2HBKA 2IVOA 2VCPA 1NOZA 2FXUA 4K8ZA 1VRUA 3SCXA 4CBXA 1NK7A 4K41A 4NLCA 2DFEA 3CF5L 2GV9A 1GOAA 4OPAA 4CZHA 2HBLA 1JLCA 3AVMA 2F7TA 1LCUA 4BC2A 2OPQA 3ZSYA 1LWEA 1SS6A 1BCMA 4CGFA 4BR7A 1S1TA 3D2FA 1BI4B 2OANA 2VWBA 2QM1A 4WFNL 3LL3A 4UQGA 3DLLL 1RBUA 4CEOA 3R9PA 3NAEA 1HNWK 2IVPA 1REVA 4HVJA 1D9FA 1KLNA 4AF1A 1K6YA 3SUPA 2Q36A 3VQ5A 1RNHA 4H5TA 1D9DA 2YNIA 2QA4N 2DFFA 2D0OA 3H45C 3LZJA 3M8QA 2ZJRL 2PYLA 1XC3A 3AVGA 1C0MA 4DR3K 2KLAA 1HNVA 1NG9A 1WBBA 4AHVA 4BEBA 3QNOA 3IS9A 3NGZA 4E1JA 2D4WA 2QWOA 4NCBA 5JMVA 2CH6A 3LANA 3TPQA 3AVNA 4CFCA 3QETA 3AVJA 5EY4A 3E9OA 4C23A 3M8PA 1NGBA 2P5GA 2HBMA 2QTDA 4M3XA 3CIPA 2EX3A 1N36K 2A42A 2FBXA 4CZIA 4JKGB 3B8AX 1IG9A 3DRRA 5EXWA 4CCHA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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