4H0YB

Crystal structure of nad+-ia(e380s)-actin complex
Total Genus 127
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
127
sequence length
370
structure length
358
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Toxin/structural protein
source organism Clostridium perfringens
publication title Arginine ADP-ribosylation mechanism based on structural snapshots of iota-toxin and actin complex
pubmed doi rcsb
molecule keywords Iota toxin component Ia
total genus 127
structure length 358
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-09-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4h0yB01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4h0yB02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 4h0yB03
1JCGA 4B1XB 2CH6A 4BR9A 2A6AA 5KPZA 3C0BA 4BRCA 4CZKA 4EAHD 1T44A 3QBWA 1EQYA 1GLEG 2H3GX 4BC4A 5BN8A 2P9NB 3CJCA 1S22A 5BR9A 5EX5A 5EXWA 3ULEA 1ATRA 1KXPA 4BR5A 2E8AA 3O5BA 4PL7A 2E1YA 3LDOA 5AZJA 1DEJA 3HZ6A 1BG3A 1TYQA 3BUZB 2ZF5O 4CZLA 4CZJA 3GE1A 4HWIA 5BPLA 1NGHA 4GNIA 3AAPA 5CE3A 1X3NA 4IWVA 2Q97A 1GLJO 3QFPA 4A2AA 4LC9B 5F1XA 1MDUB 4DCHA 1QQOA 4M7YA 1SZ2A 2YHYA 5AFUH 5AQSA 1YUWA 5AQNA 3EZWA 3H6EA 5JLFA 5E84A 4FWNA 3A5MC 4PKHA 2YJFA 2A42A 1J6ZA 3GDQA 4MO4A 3VGMA 4L3QA 4CBUA 4H0PA 3ID8A 2V7YA 3FFKB 1V4SA 3KHYA 1E4FT 5I9EB 3AARA 4CZHA 2Q31A 1QQNA 4FWPA 3U4LA 4Z94A 5E26A 5BN9A 4XEIA 3ZX3A 4BR2A 2Q2RA 1QHAA 2GELA 4JNEA 2ZGYA 3M1FA 3D7EO 2D0PA 3D2FB 4BRPA 1HKBA 2A3ZA 4E1JA 2Q0UA 3ZETB 1Y64A 1NBWA 3C7NB 2QWMA 1DKGD 2GWJA 1MWKA 2PBDA 1NGEA 1WOQA 4BC3A 1T6DA 4CD1A 4H0TB 3VEZA 3FZHA 3VEOA 4BQZA 3ZX0A 4BC2A 3O1WA 2QWNA 4CZMA 3MDQA 4CI6A 1D4XA 3LM9A 2E2OA 3D2FA 5F0XA 3I33A 4WQ5A 5AQIA 3ZETA 3O4WA 2BUPA 3SMPA 2NLXA 3C7NA 3FR0A 1QZ6A 4H0YB 5AQQA 3OHRA 4CZIA 2F9WA 2QWRA 3VGKA 3VETA 1HLUA 3VEYA 1C0FA 4QS7A 1NGGA 3EKUA 3LL3A 4BRFA 4YDUC 3MN7A 4JD2B 4PKGA 3O08A 3MN5A 2GTDA 5BRDA 4FOEA 4B1YB 2P9KB 4XH1A 4FPAA 3R8EA 1RFQA 3LDLA 3L6QA 2ASMA 2I7NA 3AY9A 1QQMA 3W0LA 5ADXA 3L0QA 4H0OA 2D0OA 4JD2A 5AQXA 4WQ5C 1JCFA 1H1VA 2IVPA 3UB5A 5AQFA 3SK3A 4H0VB 2A41A 4H5NA 4BC5A 3CIPA 4BRKA 3H3NO 4BR7A 4H5WA 3RSEB 1BA0A 4BR4A 2P9KA 3WUHA 1NLVA 2FSJA 2J4RA 5KPRA 4RCHA 2F9TA 1YXQA 3EO3A 2FXUA 1NGBA 3QDKA 4A61A 1HKCA 4CZEA 5ELZA 1C0GA 3CJBA 1WUAA 1TUYA 4IXCA 1HJOA 2E1ZA 2GUPA 1LOTB 3BEXA 3HM8A 4AM7A 4BRAA 4H5RA 2P9IB 3RSEA 4IJAA 4BVOA 3R6MA 4FL9A 3FLCO 2V51B 1NGAA 1Z6RA 3FE1A 3TU5A 2IIRA 3IDHA 3B8AX 3ZX2A 5AFUA 3QMLA 2QWPA 1RDWX 2E88A 1HKGA 5AQKA 1ZBSA 4GY2B 1GLAG 2HOEA 3CJAA 4NO7A 1BOTO 2P9IA 1MWMA 5BRHA 4MLEA 3H45C 1KAXA 3I8BA 4BRHA 4DB3A 5FPMA 2GEMA 3H3OB 4A2BA 3W3DA 2VWBA 3A0IX 5BRFA 4BRNA 4Y0WA 3UE5A 4CD3A 3O8MA 3VEXA 4A62A 3LM2A 2ASPA 1ESVA 5AQJA 3FZMA 1Z05A 1GLLO 3CJ7A 4FWSA 1GLCG 2ZWHA 3GL1A 1P8ZA 3A8YA 3QB0A 4CBWA 2FF3B 1V4TA 5AQUA 2P9PA 4H0XB 3WXJA 1NM1A 2FF6A 2A40A 4B1ZA 4FOIA 3CERA 4MLHA 2E20A 3WQUA 5LY3A 3SJHA 4KBOA 1NGDA 3KZBA 4YDUA 3SLCA 3HTVA 4BGAA 4JN4A 2FLOA 1YVNA 4FWQA 3F9MA 4EHTA 3ENOA 3EL2A 3IFRA 1IG8A 3QBXA 4FWOA 3LDNA 2YHXA 1E4GT 2E2NA 1G99A 3CI5A 2CGJA 4PL8A 4I6MB 3EKSA 4ISGA 3GOIA 1XQSC 3SMSA 4MO5A 5AQOA 2Q1NA 1NWKA 1X9JA 2VYPA 1ATSA 1JCEA 3GG4A 5FPNA 3DXMB 5FPEA 1NGJA 3VF4A 2W41A 1KAZA 1S3XA 2P9UB 2ASOA 4JAXA 3WEEB 2DPNA 1RGIA 4IJNA 2YI1A 1SAZA 2E2PA 4DQ8A 4FSVA 2I7PA 4CZFA 2QWOA 4I6MA 4WQ4A 2YHWA 5AQGA 1LCUA 3L4IA 3CQXA 2CH5A 5LJWA 3VERA 3DXMA 4QS8A 4CZGA 3FGUA 4EFHA 2P9UA 4BVPA 5JLHA 1GLFO 3BF3A 3QFUA 4BRDA 3WEEA 3CETA 3UKRB 5AQYA 3LDPA 3CJ9A 1NMDA 2QWQA 2QXLA 2P9LB 4CJ7A 5AQZA 2ZGZA 4M63C 2CGKA 5B8HA 5EOYA 3VENA 5F2RA 4H03B 1BU6O 4O8KA 5LJVA 4F9OA 5BPMA 3VF2A 1IJJA 4WQ4C 3UKRA 4JHDB 1TUUA 1XC3A 3DAWA 2UYTA 4IZ9A 1NGFA 2P9LA 4K25A 2AA4A 4BRGA 5ADXH 4CBXA 3S41A 1K8KA 4ISFA 2NZTA 3ATUA 2YJEA 3UKUB 5AQWA 2Q0RA 2ITMA 3MMVA 1BUPA 4H5TA 3FZLA 4BRMA 4K42A 4JHDA 1X3MA 3GBTA 3MN9A 3U8XA 4EIAA 4BRIA 1NGIA 3G25A 2NRHA 4FPBA 5BREA 4EHUA 2W40A 4FWKA 4C23A 1BDGA 2P9PB 4BGBA 3DJCA 4FWMA 1SQKA 3P4IA 3LDQA 2HF4A 2FSNA 2QW9A 3MN6A 3HI0A 3UKUA 3H1VX 3A5LC 3VPZA 3WXIA 1U6ZA 4BRQA 3A5NC 2P9NA 3R9PA 2WUSA 1XUPO 2BTFA 3IMXA 2AP1A 2P9SB 4BQLA 5AQLA 4BG8A 1U2VB 4RWTA 3WXLA 1BWFO 4XH5A 3FZFA 1KAYA 2FSKA 3CHWA 2QWLA 3A5OC 4XH4A 3M6GA 5AZIB 4WYBA 1R59O 3EN9A 3JS6A 4B9QA 4BREA 5AQTA 3VGLA 1HUXA 2YCHA 5BPNA 5AQVA 4AM6A 4K41A 5AQHA 2P9SA 3J8AA 5FPDA 4FO0A 3U9DA 4B1WB 3BF1A 1U2VA 3HSCA 4IO8A 4J8FA 5EVZA 3VOVA 5AZIA 3O1BA 2D1KA 1QZ5A 2EWSA 3U9ZA 3WXKA 3AAQA 3BP8A 1HPMA 3CJ1A 3D2EB 3KVGA 2HMPA 4RTFD 4HTLA 3DWLA 4NB4A 1CZAN 5KPTA 1DGKN 2A5XA 3TPQA 3ENHA 3M3ZA 1ZC6A 3VEVA 5AQPA 4B1VA 3O80A 4FWLA 5AQMA 1OKJA 2E2QA 5KQ8A 2OANA 2Q36A 1HX1A 3FZKA 4H5VA 5AQRA 3VEWA 3CQYA 3HBTA 4ISEA 3D2EA 3ATVA 3H46O 4O5FA 4BRLA 5EY4A 3WT0A 3ZEUB 4BG9A 3WQTA 2V7ZA 4M7XA 1NGCA 1T6CA 3H1QA 3IUCA 3DXKB 4FWRA 1GLBG 1ATNA 1K8KB 4BROA 5JMVA 2KHOA 3VESA 4PKIA 2PAVA 2IVOA 3MCPA 2IVNA 3VF6A 1GLDG 2D4WA 5JICA 2VCPA 3ZEUA 2CGLA 5TKYA 1BO5O 1BA1A 4QS9A 3O6WA 3MK6A 3ULEB 1ZXOA 2HF3A 3DXKA 3JXUA 1YAGA 4K43A 5AZJB 1MA9B 4B1UB 5KQDA 1TYQB 2V52B 5AR0A 4BR0A 4DHYA 3QICA 2QM1A 2GWKA 1Q18A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5GAGP 5C15A 3C0BA 1RCHA 1JJ2M 3P1GA 1GLEG 4YOVA 4BC4A 3NGZA 1NNEA 5EX5A 3N4PA 3TR8A 4NYFA 4BR5A 1Z25A 2E8AA 3O5BA 2F96A 4CW7B 4AQYK 1DEJA 1BG3A 3OYEA 2ZF5O 4CZJA 4YORA 1RTDA 2HHQA 3RRGA 1X3NA 2OPPA 5C2FA 4YOWA 2O8DA 3QFPA 5F1XA 1KCFA 5DMRA 3TAEA 2NRWA 4M7YA 1RBSA 2PYLA 2B6AA 4DR7K 5CR4A 4PKHA 3SQ4A 2A42A 3GDQA 4CF1A 2AJQA 4CBUA 4LH5A 4CFAA 4WE1A 1VQON 5I9EB 3S3OA 4DR6K 3DMJA 4CE9A 4LY7A 3LALA 3T1YK 3VMFB 3ZX3A 4CFBA 4DR4K 4JNEA 2C1IA 2A1RA 3M1FA 2D0PA 1KLMA 1HKBA 2HBKA 4E72A 1TAQA 1NBWA 3OBYA 4O4GA 2QWMA 1DKGD 4W5QA 1WOQA 3J7YP 4LFBK 4FZXC 4BQZA 3DOKA 3VTHA 3ZX0A 1DLOA 4KHYA 3OYHA 3OYJA 1T8EA 1D4XA 2NRXA 1ZBIA 4CEFA 3O4WA 2BUPA 1VQPN 2GX9A 2IOCA 5AQQA 4A57A 3MXIA 1NMNA 1NGGA 2QI2A 4B3TK 4BRFA 4V19S 4JD2B 4DV5K 3QEXA 3NCIA 4CHZA 3O08A 3MN5A 1QTMA 4LFAK 4NYNA 4U67L 3LDLA 1WSGA 4X64K 2WTUA 2ZJRL 3HYFA 1R0AA 4FM1A 1QQMA 3W0LA 3L0QA 1BCOA 1SUQA 2D0OA 5AQXA 3UB5A 5AQFA 3NF7A 2A41A 4CIEA 3O9UA 3WUHA 1KFSA 3CCUN 2JLEA 3OTOK 5A2QO 1J53A 2FBVA 4RCHA 1S72N 2F9TA 4K8ZA 4CZEA 3UIQA 4KTQA 1BGXT 1N8RO 5M1QA 3MCAB 4JI0K 1WUAA 1YI2N 3HM8A 2HW3A 4AM7A 4BRAA 4NLCA 3LAKA 4YOTA 4Z4EA 3L4QA 4BDPA 3V81A 5BR8K 2G8IA 4BVOA 4KHUA 3R6MA 4FVUA 1YITN 1NK5A 4DMNA 1NK4A 3G6EN 3ZT1A 2E6MA 4CGHA 4DSEA 2YNIA 2IIRA 3E1YA 4HCCA 2W42A 3ZX2A 1T7PA 3BDPA 3SJJA 2VWJA 4AHTA 3KD5E 1ZBSA 4GY2B 5KI6A 1YJ9N 4A5AA 1BOTO 2P9IA 1MWMA 4HUEA 3SQ1A 1OH6A 4IFYA 4BRHA 4DB3A 3OYDA 2VWBA 1SL2A 2O8EA 4BRNA 2ZM6K 4CGFA 2X6SA 3O8MA 4A62A 2ASPA 4DWIA 5AQJA 4QAGA 1GLCG 3GL1A 1P8ZA 3A8YA 4DQIA 4CIGA 1TGOA 4KH6A 4F4KA 1NM1A 1S9GA 1WSJA 1VSFA 3DOLA 3K9JA 3O3FA 5LY3A 4FLZA 3L2RA 4ILHA 1SKSA 4KBOA 3P5JA 1NGDA 3SLCA 2D0AA 3SQ2A 1IBMK 4H4MA 3DLLL 3S3NA 1NK0A 4GW6A 3QBXA 3VQAA 3THVA 4B8AB 1RT5A 2CGJA 1L5UA 1EWRA 4I6MB 3SMSA 1TL1A 1NJZA 4F3TA 1NWKA 2O8BA 1MU2A 1ATSA 2VYPA 2UUBK 2IS3A 2F7TA 4BE1A 4E3SA 4Z4IA 4C1NI 2ASOA 2XY7A 2ZJQL 2PYJA 3WEEB 1FW6A 1BQMA 3OJSA 2RPIA 2OZSA 2HNZA 4DQ8A 1A5XA 4FJ7A 4CZFA 4WQ4A 3DRRA 4FM0A 5FRMA 5AQGA 3AO2A 1N32K 5HP1A 3MAQA 5LJWA 5GADP 5E41A 3M5RA 4RW4A 3WNGA 2C1GA 4JYAK 4EFHA 2UUAK 3D45A 2Z1HA 3KLGA 1HR0K 3CJ9A 3HPOA 1RTIA 3Q7BA 1QSSA 2P9LB 4CJ7A 1A5VA 2W00A 2ZGZA 3AO4A 2ITGA 5EOYA 4KHQA 3ZYYX 1TK5A 4KB0A 4OKKA 1D9DA 5HBMA 1IKYA 3EYZA 3HM9A 1OVYA 1EKEA 4DFJA 4LFCK 4CEOA 3LP3A 4IZ9A 5IWAK 4DU1A 2AA4A 5M1FA 5ADXH 4CHYA 4CBXA 1K8KA 4CF2A 1N36K 4W5TA 2O8FA 4HVJA 2I5JA 4Z4CA 3ID6A 1YTAA 3MMVA 1RT1A 3PV8A 3CCEN 3M8SA 1HNZK 3DLHA 4YOYA 1NK9A 4LF7K 3U8XA 4BRIA 4DR2K 5FDLA 1NGIA 2NRHA 4FWKA 4KKOA 1XI1A 3BZCA 3DJCA 3SUOA 3MN6A 3UKUA 2B4JA 3A2FA 4C8OA 2JWKA 3AVGA 3PIOL 3KK3A 2HMIA 1HPZA 1XUPO 4DFMA 2BTFA 2WC9A 5AQLA 1U2VB 3NH0A 5KGWA 1BWFO 1TV6A 3HOSA 3CHWA 3E66A 4XH4A 3M6GA 4WYBA 1QS4A 3EN9A 2O8BB 3VQ5A 4BREA 3K5LA 2YCHA 4B3SK 4M45A 1VQ9N 3SBTA 4CGDA 3O9RA 2OPSA 4Z4FA 1C0TA 1VQMN 4FO0A 3BF1A 3HSCA 4DV0K 4YFUA 5H1SQ 3OW2M 2X6NA 2HHWA 3SAHA 5AZIA 4B9NA 4U7BA 3AVAA 3U9ZA 3AAQA 4CFDA 4DF4A 3D2EB 4M3RA 4YY3K 1S1XA 3KVGA 2DTUA 2HMPA 4RTFD 2O8CB 4CESA 3QNNA 2W6KA 3VQCA 3NFAA 3NE6A 4B1VA 3O80A 1Q82O 4FWLA 3VQEA 2E2QA 3TAFA 2OANA 4X65K 1HX1A 5AQRA 1YF5L 4B9VA 3HBTA 4BDYA 4DTMA 4EZ9A 3H46O 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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